单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551692
PMID:37577553
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研究论文 | 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 | 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 | 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 | 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 82 | 2024-08-04 |
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
2023-09-05, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad107
PMID:37384417
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研究论文 | 这篇文章探讨了PTEN基因杂合突变对不同细胞类型在人脑发育中的影响。 | 本研究通过不同供体的人类皮质类器官揭示了PTEN杂合突变对细胞类型特异性发育事件的影响。 | 研究的样本量和供体背景的多样性可能限制了结论的普适性。 | 探讨PTEN基因的杂合突变如何影响人类大脑发育中的不同细胞类型。 | 使用不同供体的人类皮质类器官作为研究对象。 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，空间转录组学 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 不同供体的人类皮质类器官 |
| 83 | 2024-08-05 |
Key Genetic Determinants Driving Esophageal Squamous Cell Carcinoma Initiation and Immune Evasion
2023-09, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.05.030
PMID:37257519
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研究论文 | 本研究揭示了TP53、CDKN2A和NOTCH1的缺失如何诱导食道肿瘤和免疫逃逸，促进食道鳞状细胞癌的发生 | 建立了32种基因工程食道类器官，并识别出驱动食道鳞状细胞癌启动的关键基因决定因素 | 本研究的局限性在于只涉及小鼠模型，是否适用于人类尚需进一步验证 | 探索食道鳞状细胞癌的启动机制和免疫逃逸的遗传决定因素 | 使用CRISPR/Cas9基因敲除技术靶向9个基因进行的食道类器官研究 | 数字病理学 | 食道癌 | CRISPR/Cas9 | 小鼠食道类器官 | 单细胞RNA测序 | 32个基因工程食道类器官 |
| 84 | 2024-08-05 |
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00329-9
PMID:37726321
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研究论文 | 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 | 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型，强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 | 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 | 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 | 成年斑马鱼的韧带组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA | 斑马鱼数目未具体提及 |
| 85 | 2024-08-05 |
Gene signature from cutaneous autoimmune diseases provides potential immunotherapy-relevant biomarkers in melanoma
2023-09-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42238-3
PMID:37700026
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研究论文 | 本研究探讨了自身免疫性皮肤病中T细胞基因特征在黑色素瘤免疫治疗中的应用潜力 | 提出了自身免疫性皮肤病的基因特征可以作为预测黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物 | 研究可能限制于特定类型的自身免疫性皮肤病，样本数量和多样性尚需进一步验证 | 探讨自身免疫性皮肤病的免疫细胞在黑色素瘤免疫治疗中的有效性 | 自身免疫性皮肤病（系统性红斑狼疮、特应性皮炎、银屑病）中的T细胞基因特征 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种自身免疫性皮肤病的样本，具体数量未在摘要中明确 |
| 86 | 2024-08-05 |
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad038
PMID:37492374
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研究论文 | 这篇文章通过整合基因组分析确定了follistatin作为头颈部鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体肿瘤网络的靶点 | 揭示了follistatin作为p63的直接转录靶标，并且其表达还受到EGFR信号的驱动 | 尚未详细阐明这些致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的具体机制 | 识别与头颈部鳞状细胞癌相关的p63肿瘤相关转录靶点 | 来自HNSCC患者的转录组数据以及代表性细胞系模型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 多个转录组数据集，具体样本数未提供 |
| 87 | 2024-08-05 |
Aerobic Exercise Alters the Melanoma Microenvironment and Modulates ERK5 S496 Phosphorylation
2023-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0465
PMID:37307577
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研究论文 | 本文展示了运动如何改变黑色素瘤微环境以及调节ERK5 S496磷酸化 | 揭示了运动导致的肿瘤微环境变化中的肿瘤特异性免疫反应差异以及ERK5信号通路的重要性 | 研究仅使用了小鼠模型，可能无法完全代表人类的反应 | 探讨运动如何影响黑色素瘤的微环境及其机制 | YUMMER 1.7 和 B16F10小鼠模型的黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | NA | 使用了YUMMER 1.7和B16F10小鼠模型 |
| 88 | 2024-08-04 |
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558911
PMID:37790561
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research paper | 本研究探讨了AML患者样本与T细胞相互作用对患者预后的影响及ICAM1的关键作用 | 揭示了与AML敏感性或抗性相关的转录程序，并发现ICAM1在T细胞介导的杀伤中扮演重要角色 | 研究可能未涵盖所有AML患者的异质性 | 探讨T细胞与急性髓性白血病之间的相互作用及其对患者预后的影响 | 急性髓性白血病患者样本及其与工程化CD4 T细胞的相互作用 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 多例AML患者样本及CD4 T细胞 |
| 89 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
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研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态，促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA |
| 90 | 2024-08-05 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.09.557001
PMID:37745469
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研究论文 | 本研究探讨了神经胶质瘤中对KIF11抑制剂的耐药性 | 首次使用多重谱系追踪条形码和单细胞RNA测序分析患者来源的神经胶质瘤细胞对药物耐药性的时间过程 | 研究主要集中在患者来源细胞的体外实验，临床转化的经历尚不明确 | 研究KIF11抑制剂在神经胶质瘤中的耐药机制 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 |
| 91 | 2024-08-05 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
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研究论文 | 研究表明造血干细胞及祖细胞在小鼠模型中可以传递交叉保护性训练免疫 | 首次明确了感染如何重新编程造血干细胞以增强针对二次感染的先天免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全推及其他物种 | 探究感染对造血干细胞的训练免疫作用及其机制 | 主要研究了小鼠体内的造血干细胞和相关免疫细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型的研究，但具体样本量未说明 |
| 92 | 2024-08-04 |
Lung tumor-infiltrating Treg have divergent transcriptional profiles and function linked to checkpoint blockade response
2023-09-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg1487
PMID:37713507
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性调节性T细胞的转录组特征及其在免疫检查点阻断反应中的作用 | 发现了十种人类肿瘤浸润性调节性T细胞的亚群，并揭示了一种特定亚群在抑制PD-1阻断反应中的关键作用 | 研究主要集中在非小细胞肺癌，可能不适用于其他癌症类型 | 旨在理解调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 主要研究对免疫检查点阻断治疗反应的非小细胞肺癌患者中的调节性T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序/ T细胞受体测序 | NA | NA | 超过73,000个肿瘤浸润性T细胞 |
| 93 | 2024-08-05 |
Dendritic Cell Vaccination in Conjunction with a TLR Agonist Polarizes Interferon Immune Responses in Malignant Glioma Patients
2023-Sep-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3287211/v1
PMID:37790490
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研究论文 | 该研究探讨了自体肿瘤溶解物脉冲树突细胞疫苗联合TLR激动剂的免疫疗法在恶性胶质瘤患者中的应用 | 创新点在于首次展示了ATL-DC与TLR激动剂联合使用能够诱导肿瘤患者的干扰素免疫反应的差异 | 研究样本量较小，仅限于23名患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究ATL-DC疫苗与TLR激动剂的最佳组合，评估其对高等级胶质瘤患者的免疫反应影响 | 研究对象为新诊断或复发的WHO三级和四级恶性胶质瘤患者 | 数字病理 | 恶性胶质瘤 | bulk RNAseq和cyTOF分析 | NA | 基因表达数据 | 23名恶性胶质瘤患者 |
| 94 | 2024-08-05 |
Intratumoral Microbiota Composition Regulates Chemoimmunotherapy Response in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2593
PMID:37433041
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤内微生物组对食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗免疫治疗的反应的影响 | 该研究揭示了肿瘤内微生物组成可以预测新辅助化疗免疫治疗的治疗效果，且Streptococcus的丰富度与肿瘤微环境中CD8+ T细胞的浸润正相关 | 该研究可能缺乏大规模临床验证，且未探讨其他微生物对治疗反应的影响 | 研究肿瘤内微生物组对食管鳞状细胞癌患者化疗免疫治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本（肿瘤组织） | NA |
| 95 | 2024-08-05 |
Mammalian esophageal stratified tissue homeostasis is maintained distinctively by the epithelial pluripotent p63+Sox2+ and p63-Sox2+ cell populations
2023-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04952-z
PMID:37752383
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研究论文 | 研究了哺乳动物食管上皮组织的自我更新及其稳态调控机制 | 揭示了p63和Sox2依赖的细胞谱系在维持食管组织稳态中的独特作用 | 未能在食管鳞状细胞癌细胞系形成的类器官中检测到p63Sox2细胞群 | 探讨哺乳动物食管鳞状上皮组织的稳态以及相关的调控机制 | 通过建立大鼠食管类器官体外系统，研究食管上皮细胞群的特性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了大鼠食管类器官的多个细胞群 |
| 96 | 2024-08-04 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
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研究论文 | 本文提出了一种对小鼠肺部的单细胞RNA测序数据进行深入评估的协议 | 创新之处在于提供了一种综合分析健康与结核分枝杆菌感染小鼠肺淋巴细胞群体的详细步骤 | 未提及具体的局限性 | 研究目的在于分析不同条件下的小鼠肺淋巴细胞群体 | 研究对象为健康及结核分枝杆菌感染的小鼠肺淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 97 | 2024-08-04 |
Enrichment of carcinogen-driven "mitochondria-primed" human skin stem cells and their identification using single-cell analyses
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102545
PMID:37690024
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研究论文 | 该文描述了富集和鉴定“线粒体启动”的人类皮肤干细胞的协议 | 创新点在于提出了通过环境致癌物富集和表征线粒体启动的干细胞的新方法 | 该研究未提及样本规模和是否可推广应用于其他类型的干细胞 | 研究旨在富集和鉴定皮肤干细胞中的线粒体启动特性 | 研究对象为环境致癌物影响下的人类皮肤干细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学和单细胞显微镜分析 | NA | NA | 涉及环境致癌物2,3,7,8-四氯二苯并对二恶英的实验样本 |
| 98 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 |
| 99 | 2024-08-05 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白甲基转移酶SETDB2在腹主动脉瘤（AAA）发展中的作用 | 首次明确了SETDB2在巨噬细胞介导的蛋白酶活性调节中的关键角色，并提出其作为治疗AAA的新机制靶点 | 研究主要依赖于小鼠模型，临床应用的直接性需要进一步验证 | 研究巨噬细胞特异性表观遗传酶功能的变化及其对腹主动脉瘤发展的贡献 | 人类腹主动脉瘤组织样本及相关的小鼠模型 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 人类腹主动脉瘤组织样本及缺乏SETDB2的小鼠模型 |
| 100 | 2024-08-05 |
Illuminating the Terminal Nerve: Uncovering the Link between GnRH-1 and Olfactory Development
2023-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.31.555770
PMID:37693459
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研究论文 | 该研究揭示了GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的联系 | 首次发现Prokr2在终末神经元中的表达与GnRH-1神经元形成及迁徙的关键时期相关 | 研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨嗅觉系统与GnRH-1发育之间的机制联系 | 重点研究终末神经元及其在嗅觉发育中的作用 | 数字病理学 | Kallmann综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |