单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-09-23 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 研究了VE-cadherin和Alk1在非内皮细胞中的作用，特别是在神经分支维持中的作用 | 发现VE-cadherin和Alk1不仅在内皮细胞中起作用，还在非内皮细胞中维持神经分支 | NA | 探讨VE-cadherin和Alk1在皮肤血管重塑和神经分支维持中的作用 | VE-cadherin阳性细胞和Alk1在皮肤中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠 |
| 82 | 2024-09-23 |
Notch and retinoic acid signals regulate macrophage formation from endocardium downstream of Nkx2-5
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41039-6
PMID:37669937
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研究论文 | 研究揭示了Nkx2-5下游的Notch和视黄酸信号在心肌内膜向巨噬细胞分化的调控网络 | 首次揭示了Nkx2-5/Notch/RA信号通路在心肌内膜向巨噬细胞分化中的关键作用 | NA | 探讨心肌内膜向巨噬细胞分化的分子机制 | 心肌内膜、巨噬细胞、Nkx2-5、Notch信号、视黄酸信号 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 83 | 2024-09-23 |
NF-κB subunits direct kinetically distinct transcriptional cascades in antigen receptor-activated B cells
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01561-7
PMID:37524800
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研究论文 | 研究了NF-κB家族中的Rel和RelA在B细胞受体激活后的基因表达调控中的不同功能 | 揭示了Rel和RelA在B细胞激活后基因表达调控中的不同动力学特征和功能对抗性 | NA | 探讨NF-κB家族成员在B细胞激活后的基因表达调控中的特异性功能 | Rel和RelA在B细胞中的基因表达调控功能 | NA | NA | 多组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 84 | 2024-09-14 |
ConSpaS: a contrastive learning framework for identifying spatial domains by integrating local and global similarities
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad395
PMID:37965808
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研究论文 | 本文提出了一种名为ConSpaS的新型节点表示学习框架，通过整合局部和全局相似性来精确解码空间域 | ConSpaS框架结合了图自编码器（GAE）和对比学习（CL），通过无增强机制构建全局正样本和半简单采样策略定义负样本，有效提高了空间域识别的准确性 | NA | 开发一种新的方法来提高空间转录组学中空间域识别的准确性 | 空间转录组学中的空间域 | 生物信息学 | NA | 对比学习（CL） | 图自编码器（GAE） | 基因表达数据 | 多种组织类型和技术平台 |
| 85 | 2024-09-14 |
Cardiac Pericytes Acquire a Fibrogenic Phenotype and Contribute to Vascular Maturation After Myocardial Infarction
2023-09-12, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究心肌梗死后心脏周细胞获得纤维化表型并参与血管成熟的过程 | 首次揭示了心肌梗死后周细胞在纤维化修复中的作用及其表型变化 | 周细胞特异性TGF-β受体2敲除对心肌纤维化重塑的影响不显著 | 探讨心肌梗死后周细胞的命运及其在心肌疾病中的作用 | 心脏周细胞及其在心肌梗死后的表型变化 | NA | 心血管疾病 | 聚合酶链反应阵列、单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用NG2Dsred;PDGFRαEGFP周细胞:成纤维细胞双报告小鼠和可诱导的NG2CreER小鼠进行研究 |
| 86 | 2024-09-10 |
SARS-CoV-2 niches in human placenta revealed by spatial transcriptomics
2023-09-08, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.06.003
PMID:37423216
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研究论文 | 研究利用空间转录组学揭示了SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境 | 首次利用空间转录组学技术生成高分辨率的胎盘转录图谱，揭示了SARS-CoV-2在胎盘微环境中的动态响应 | 样本量较小，仅包括少数健康对照和COVID-19感染者 | 探究SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境及其对胎盘功能的影响 | 人类胎盘中的SARS-CoV-2感染及其转录组变化 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组 | 13个胎盘样本，包括4个健康对照、4个无症状感染者和5个有症状感染者 |
| 87 | 2024-09-10 |
Durable alveolar engraftment of PSC-derived lung epithelial cells into immunocompetent mice
2023-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.016
PMID:37625412
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研究论文 | 本文研究了多能干细胞衍生的肺上皮细胞在免疫活性小鼠中的持久植入 | 首次实现了多能干细胞衍生的肺上皮祖细胞在免疫活性小鼠中的持久植入，并展示了其在肺损伤修复中的潜力 | NA | 探索多能干细胞衍生的肺上皮细胞在肺损伤修复中的应用 | 多能干细胞衍生的肺上皮祖细胞在免疫活性小鼠中的植入和成熟 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 88 | 2024-09-04 |
Single-cell RNA sequencing deciphers the mechanism of sepsis-induced liver injury and the therapeutic effects of artesunate
2023-Sep, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-023-01065-y
PMID:37041228
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脓毒症诱导的肝脏损伤机制及青蒿琥酯的治疗效果 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脓毒症对肝脏细胞的具体影响，并评估了青蒿琥酯的肝保护作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未进行临床试验验证 | 探讨脓毒症对肝脏的影响及青蒿琥酯的肝保护机制 | 小鼠肝脏在脓毒症感染后的细胞反应及青蒿琥酯的治疗效果 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 89 | 2024-09-01 |
Cell-intrinsic effects of clonal hematopoiesis in heart failure
2023-Sep, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00322-x
PMID:39196061
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研究论文 | 本文研究了克隆性造血（CHIP）在心力衰竭患者中的细胞内在效应 | 使用改进的单细胞测序流程（MutDetect-Seq）展示了DNMT3A突变型单核细胞、CD4+ T细胞和NK细胞的基因表达谱改变，并验证了突变型与野生型单核细胞和T细胞之间的旁分泌信号通路 | NA | 探讨CHIP在心力衰竭患者中的细胞内在效应及其对预后的影响 | 心力衰竭患者中的CHIP突变细胞 | NA | 心力衰竭 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 90 | 2024-08-31 |
Antigen-specific CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph node and blood following vaccination in humans
2023-Sep-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3304466/v1
PMID:37790414
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研究论文 | 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中刺突特异性CD4 T细胞的单细胞转录组学特征 | 本研究定义了新的克隆型，并使用基于深度学习的反向表位映射方法Trex来预测抗原特异性 | NA | 研究SARS-CoV-2感染和mRNA疫苗接种诱导的CD4 T细胞反应及其在保护性免疫中的作用 | 人类血液和引流淋巴结中的刺突特异性CD4 T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞转录组学 | 深度学习 | 转录组数据 | 多个刺突特异性CD4 T细胞克隆型 |
| 91 | 2024-08-27 |
Dual inhibition of glycolysis and glutaminolysis for synergistic therapy of rheumatoid arthritis
2023-09-20, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-023-03161-0
PMID:37730663
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研究论文 | 研究通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径，探讨其在类风湿性关节炎治疗中的协同作用 | 提出通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径作为治疗类风湿性关节炎的新方法 | NA | 探讨双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径在类风湿性关节炎治疗中的潜在协同作用 | 类风湿性关节炎中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | scRNA-seq, H1-核磁共振波谱 | NA | 细胞类型, 基因表达 | 涉及人类滑膜细胞和关节炎小鼠模型 |
| 92 | 2024-08-14 |
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3315017/v1
PMID:37790486
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临床试验 | 本文报道了一项针对淋巴浆细胞性淋巴瘤（LPL）患者的个性化新抗原疫苗的首次人体临床试验，旨在早期干预未治疗的患者 | 该研究首次在人体中测试了一种新型治疗性DNA异型新抗原疫苗，并观察到疫苗对肿瘤免疫微环境的积极影响 | 研究样本量较小，且未探讨与其他治疗策略的联合应用 | 评估个性化新抗原疫苗在未治疗淋巴浆细胞性淋巴瘤患者中的安全性和有效性 | 淋巴浆细胞性淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 9名患者 |
| 93 | 2024-08-10 |
Classic genetic and hormonal switches during fetal sex development and beyond
2023-Sep, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V
IF:0.8Q4
DOI:10.1515/medgen-2023-2036
PMID:38840820
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研究论文 | 本文探讨了人类胎儿性别发育过程中的关键遗传和激素开关，以及这些开关如何决定性腺性别确定和后续的生殖和体细胞性别表型的分化 | 文章指出传统的性别发育模型是不充分的，并介绍了在特定突变情况下，这些开关可能表现出不同的功能，导致基因功能和剂量的连续变化，酶活性，性激素水平和敏感性的变化，从而产生广泛的生物性别发育差异（DSD）和潜在的生殖和体细胞性别表型的多样性 | NA | 探讨人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关的作用 | 人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关 | NA | NA | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172658
PMID:37698937
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研究论文 | 研究分析了未接种疫苗的孕妇在孕期经历轻度或无症状COVID-19感染后，新生儿脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞组成变化 | 首次详细探讨了轻度或无症状孕妇COVID-19感染对新生儿免疫反应的影响，包括免疫细胞的重编程和功能状态的改变 | 研究主要集中在脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞分析，未涉及其他可能的影响因素 | 探讨孕妇轻度或无症状COVID-19感染对新生儿免疫系统的影响 | 未接种疫苗的孕妇及其新生儿 | NA | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，体外刺激试验 | NA | 细胞 | 多个新生儿的脐带血和绒毛膜绒毛样本 |
| 95 | 2024-08-05 |
A comprehensive assessment of hurdle and zero-inflated models for single cell RNA-sequencing analysis
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad272
PMID:37507115
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研究论文 | 本文全面评估了单细胞RNA测序分析中的障碍和零膨胀模型 | 提出了一个基于TensorFlow的Python包TensorZINB，解决了零膨胀负二项式模型的数值稳定性问题，并结合了混合模型来提高性能 | 未提及特定的局限性 | 提高单细胞RNA测序数据分析中的统计模型的准确性和计算速度 | 障碍和零膨胀模型的性能评估及其对单细胞RNA测序数据的应用 | 数字病理 | NA | RNA-seq | 零膨胀负二项式（ZINB）模型 | 文本 | 使用真实的单细胞RNA测序数据集进行评估 |
| 96 | 2024-08-04 |
Multi-omic approach identifies hypoxic tumor-associated myeloid cells that drive immunobiology of high-risk pediatric ependymoma
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107585
PMID:37694144
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研究论文 | 本研究识别了高风险儿童脊髓膜瘤中促免疫生物学的缺氧肿瘤相关髓系细胞 | 识别了八种不同的髓系衍生亚群，特别是缺氧髓系细胞，它们展示了髓系抑制细胞的特征 | 缺乏关于缺氧髓系细胞在其他肿瘤类型中的作用的研究 | 揭示脊髓膜瘤的免疫环境，以指导免疫治疗 | 高风险儿童脊髓膜瘤的免疫细胞环境和肿瘤亚型 | 数字病理学 | 脊髓膜瘤 | 单细胞测序（scRNAseq）、肿瘤基因表达去卷积、空间蛋白组学、单细胞细胞因子释放测定 | NA | 细胞数据 | 27个单细胞、299个肿瘤样本、54个空间蛋白组样本、12个单细胞细胞因子释放样本 |
| 97 | 2024-08-04 |
N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst
2023-Sep-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04955-w
PMID:37768430
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研究论文 | 本研究探讨了Nop2 mRNA的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的作用 | 首次揭示了NAT10介导的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠前植入期胚胎中对mRNA稳定性和翻译效率的重要性 | 研究主要集中在小鼠胚胎中，结果可能无法直接推广到其他哺乳动物 | 旨在了解N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的功能 | 小鼠早期胚胎，包括缺乏NAT10的小鼠胚胎 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序, RNA-seq, 乙酰化RNA免疫沉淀结合PCR(acRIP-PCR) | NA | NA | NA |
| 98 | 2024-08-05 |
Stem cell antigen-1+cell-derived fibroblasts are crucial for cardiac fibrosis during heart failure
2023-Sep-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04957-8
PMID:37740736
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研究论文 | 本研究探讨了干细胞抗原-1+细胞来源的成纤维细胞在心力衰竭中的关键作用 | 揭示了非骨髓来源的Sca1+细胞通过Wnt4-PDGFRα通路转化为成纤维细胞并促进心脏纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能在应用到人类时存在差异 | 探讨干细胞在心力衰竭中的作用及机制 | 小鼠和人类心脏中的干细胞抗原-1+细胞及其转化的成纤维细胞 | 数字病理学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠的非心肌细胞和人类心力衰竭患者的样本 |
| 99 | 2024-08-05 |
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3263412/v1
PMID:37790525
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研究论文 | 这篇文章探讨了通过造血干细胞移植来纠正Progranulin缺乏症的方法 | 提出了一种基于Busulfan和 PLX3397的高效条件处理方案，以增强微胶质细胞的再生 | 尚未提及该方法在临床应用中的具体限制 | 研究造血干细胞移植在CNS中替代微胶质细胞的能力 | 主要研究对象为骨髓来源的微胶质细胞及其在小鼠模型中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和高维CyTOF质谱细胞计数 | NA | 细胞 | 小鼠模型，具体样本大小未详细说明 |
| 100 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01218-y
PMID:37723590
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，探讨了肝细胞癌中新辅助cabozantinib和nivolumab的免疫疗法组合的肿瘤微环境 | 研究揭示了不同细胞信号网络在肝细胞癌肿瘤微环境中的异质性，并确定了抵抗和复发的独立机制 | 仅对少数患者进行了分析，且样本量有限，研究结果需要更大规模的数据验证 | 研究肝细胞癌患者对现代系统治疗的反应与肿瘤微环境的分子和细胞特征之间的关系 | 研究对象为接受新辅助cabozantinib和nivolumab治疗的晚期肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 15名患者的切除标本 |