单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3296446/v1
PMID:37720050
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研究论文 | 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 | 提出了一种新的浆细胞过渡状态，促使功能性浆细胞前体的生成 | 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 | 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 | 研究抗原特异性的浆细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq+BCR-seq | NA | NA | NA |
| 82 | 2024-08-05 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.09.557001
PMID:37745469
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研究论文 | 本研究探讨了神经胶质瘤中对KIF11抑制剂的耐药性 | 首次使用多重谱系追踪条形码和单细胞RNA测序分析患者来源的神经胶质瘤细胞对药物耐药性的时间过程 | 研究主要集中在患者来源细胞的体外实验，临床转化的经历尚不明确 | 研究KIF11抑制剂在神经胶质瘤中的耐药机制 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 | 数字病理学 | 神经胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 患者来源的神经胶质瘤神经球 |
| 83 | 2024-08-05 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
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研究论文 | 研究表明造血干细胞及祖细胞在小鼠模型中可以传递交叉保护性训练免疫 | 首次明确了感染如何重新编程造血干细胞以增强针对二次感染的先天免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全推及其他物种 | 探究感染对造血干细胞的训练免疫作用及其机制 | 主要研究了小鼠体内的造血干细胞和相关免疫细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型的研究，但具体样本量未说明 |
| 84 | 2024-08-04 |
Lung tumor-infiltrating Treg have divergent transcriptional profiles and function linked to checkpoint blockade response
2023-09-15, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adg1487
PMID:37713507
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤浸润性调节性T细胞的转录组特征及其在免疫检查点阻断反应中的作用 | 发现了十种人类肿瘤浸润性调节性T细胞的亚群，并揭示了一种特定亚群在抑制PD-1阻断反应中的关键作用 | 研究主要集中在非小细胞肺癌，可能不适用于其他癌症类型 | 旨在理解调节性T细胞在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 主要研究对免疫检查点阻断治疗反应的非小细胞肺癌患者中的调节性T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序/ T细胞受体测序 | NA | NA | 超过73,000个肿瘤浸润性T细胞 |
| 85 | 2024-08-05 |
Dendritic Cell Vaccination in Conjunction with a TLR Agonist Polarizes Interferon Immune Responses in Malignant Glioma Patients
2023-Sep-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3287211/v1
PMID:37790490
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研究论文 | 该研究探讨了自体肿瘤溶解物脉冲树突细胞疫苗联合TLR激动剂的免疫疗法在恶性胶质瘤患者中的应用 | 创新点在于首次展示了ATL-DC与TLR激动剂联合使用能够诱导肿瘤患者的干扰素免疫反应的差异 | 研究样本量较小，仅限于23名患者，可能影响结果的普遍适用性 | 研究ATL-DC疫苗与TLR激动剂的最佳组合，评估其对高等级胶质瘤患者的免疫反应影响 | 研究对象为新诊断或复发的WHO三级和四级恶性胶质瘤患者 | 数字病理 | 恶性胶质瘤 | bulk RNAseq和cyTOF分析 | NA | 基因表达数据 | 23名恶性胶质瘤患者 |
| 86 | 2024-08-05 |
Intratumoral Microbiota Composition Regulates Chemoimmunotherapy Response in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2023-09-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2593
PMID:37433041
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤内微生物组对食管鳞状细胞癌患者接受新辅助化疗免疫治疗的反应的影响 | 该研究揭示了肿瘤内微生物组成可以预测新辅助化疗免疫治疗的治疗效果，且Streptococcus的丰富度与肿瘤微环境中CD8+ T细胞的浸润正相关 | 该研究可能缺乏大规模临床验证，且未探讨其他微生物对治疗反应的影响 | 研究肿瘤内微生物组对食管鳞状细胞癌患者化疗免疫治疗反应的影响 | 食管鳞状细胞癌患者及其肿瘤内微生物组 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本（肿瘤组织） | NA |
| 87 | 2024-08-05 |
Mammalian esophageal stratified tissue homeostasis is maintained distinctively by the epithelial pluripotent p63+Sox2+ and p63-Sox2+ cell populations
2023-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04952-z
PMID:37752383
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研究论文 | 研究了哺乳动物食管上皮组织的自我更新及其稳态调控机制 | 揭示了p63和Sox2依赖的细胞谱系在维持食管组织稳态中的独特作用 | 未能在食管鳞状细胞癌细胞系形成的类器官中检测到p63Sox2细胞群 | 探讨哺乳动物食管鳞状上皮组织的稳态以及相关的调控机制 | 通过建立大鼠食管类器官体外系统，研究食管上皮细胞群的特性 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用了大鼠食管类器官的多个细胞群 |
| 88 | 2024-08-04 |
Peripheral Blood Single-Cell Sequencing Uncovers Common and Specific Immune Aberrations in Fibrotic Lung Diseases
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.558301
PMID:37786685
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研究论文 | 本研究揭示了特发性肺纤维化和纤维性超敏性肺炎患者外周血中的共同及特异性免疫异常 | 使用前沿的单细胞分型技术识别了特发性肺纤维化和纤维性超敏性肺炎中的独特免疫机制 | 尚未明确外周血免疫异常的程度和共性 | 识别特发性肺纤维化及纤维性超敏性肺炎患者的免疫异常 | 特发性肺纤维化和纤维性超敏性肺炎患者及健康对照 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 83个样本中分析了327,990个细胞 |
| 89 | 2024-08-04 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
|
研究论文 | 本文提出了一种对小鼠肺部的单细胞RNA测序数据进行深入评估的协议 | 创新之处在于提供了一种综合分析健康与结核分枝杆菌感染小鼠肺淋巴细胞群体的详细步骤 | 未提及具体的局限性 | 研究目的在于分析不同条件下的小鼠肺淋巴细胞群体 | 研究对象为健康及结核分枝杆菌感染的小鼠肺淋巴细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 90 | 2024-08-04 |
Enrichment of carcinogen-driven "mitochondria-primed" human skin stem cells and their identification using single-cell analyses
2023-Sep-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102545
PMID:37690024
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研究论文 | 该文描述了富集和鉴定“线粒体启动”的人类皮肤干细胞的协议 | 创新点在于提出了通过环境致癌物富集和表征线粒体启动的干细胞的新方法 | 该研究未提及样本规模和是否可推广应用于其他类型的干细胞 | 研究旨在富集和鉴定皮肤干细胞中的线粒体启动特性 | 研究对象为环境致癌物影响下的人类皮肤干细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞转录组学和单细胞显微镜分析 | NA | NA | 涉及环境致癌物2,3,7,8-四氯二苯并对二恶英的实验样本 |
| 91 | 2024-08-05 |
PD-1 Mediated Regulation of Unique Activated CD8 + T Cells by NK Cells in the Submandibular Gland
2023-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.15.557930
PMID:37745414
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研究论文 | 本文研究了NK细胞如何通过PD-1/PD-L1轴在下颌下腺调控CD8 T细胞的稳态 | 发现PD-1缺乏小鼠的下颌下腺中存在独特的CD8 T细胞群，以及NK细胞在该部位的免疫调节作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏在人体中的验证 | 探讨NK细胞在下颌下腺对CD8 T细胞稳态的调控作用 | PD-1缺乏小鼠及NK细胞缺乏的小鼠模型 | 数字病理学 | 干燥综合症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 涉及PD-1缺乏和NK细胞缺乏的小鼠样本 |
| 92 | 2024-08-05 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究探讨了组蛋白甲基转移酶SETDB2在腹主动脉瘤（AAA）发展中的作用 | 首次明确了SETDB2在巨噬细胞介导的蛋白酶活性调节中的关键角色，并提出其作为治疗AAA的新机制靶点 | 研究主要依赖于小鼠模型，临床应用的直接性需要进一步验证 | 研究巨噬细胞特异性表观遗传酶功能的变化及其对腹主动脉瘤发展的贡献 | 人类腹主动脉瘤组织样本及相关的小鼠模型 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 组织样本 | 人类腹主动脉瘤组织样本及缺乏SETDB2的小鼠模型 |
| 93 | 2024-08-05 |
Illuminating the Terminal Nerve: Uncovering the Link between GnRH-1 and Olfactory Development
2023-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.31.555770
PMID:37693459
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研究论文 | 该研究揭示了GnRH-1神经元与嗅觉发育之间的联系 | 首次发现Prokr2在终末神经元中的表达与GnRH-1神经元形成及迁徙的关键时期相关 | 研究主要依赖于小鼠模型，可能不完全适用于人类 | 探讨嗅觉系统与GnRH-1发育之间的机制联系 | 重点研究终末神经元及其在嗅觉发育中的作用 | 数字病理学 | Kallmann综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 94 | 2024-08-07 |
scMultiGAN: cell-specific imputation for single-cell transcriptomes with multiple deep generative adversarial networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad384
PMID:37903416
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scMultiGAN的新型深度学习模型，用于单细胞转录组数据的插补，该模型利用多个协作生成对抗网络（GAN）实现细胞特异性插补 | scMultiGAN采用两阶段训练过程和多个GAN实现细胞特异性插补，与传统基于GAN的插补方法不同，后者基于随机噪声生成缺失值 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中缺失值插补的准确性 | 单细胞转录组数据中的缺失值 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 生成对抗网络（GAN） | 转录组数据 | NA |
| 95 | 2024-08-04 |
Clinical, morphologic and molecular heterogeneity of HPV-associated oropharyngeal cancer
2023-09, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02819-y
PMID:37666939
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综述 | 本综述探讨了HPV相关的口咽癌的临床、形态和分子异质性 | 提出了针对HPV+口咽鳞状细胞癌的不同亚型及其相关生物标志物的分类概念 | 缺乏对多中心临床试验结果的非劣性分析 | 识别与患者分层和个性化治疗相关的HPV+口咽鳞状细胞癌生物标志物 | HPV+口咽鳞状细胞癌的多样性及其相关临床和生物特征 | 数字病理学 | 咽癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤样本数据 | NA |
| 96 | 2024-08-04 |
A unified pipeline for FISH spatial transcriptomics
2023-Sep-13, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100384
PMID:37719153
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研究论文 | 本文提出了一个名为PIPEFISH的统一分析管道，用于FISH空间转录组学的转录注释 | PIPEFISH是一个半自动化且可推广的管道，改进了已有的starfish库，以解决空间转录组学数据分析缺乏标准化工具的问题 | 该论文未提及PIPEFISH在特定情况下的性能限制或适用範围 | 旨在提供一种标准化的工具来分析FISH空间转录组学数据 | 使用PIPEFISH对来自三种不同FISH图像实验的真实数据集进行转录注释 | 数字病理学 | NA | FISH | NA | 图像 | 三个不同类型的FISH图像实验的真实数据集 |
| 97 | 2024-08-07 |
scAce: an adaptive embedding and clustering method for single-cell gene expression data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad546
PMID:37672035
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research paper | 本文提出了一种名为scAce的自适应嵌入和聚类方法，用于单细胞基因表达数据的分析 | scAce方法通过构建变分自编码器同时学习细胞嵌入和聚类分配，并开发了一种自适应聚类合并方法，无需预先估计聚类数量 | NA | 旨在改进单细胞RNA测序数据的聚类分析，区分细胞类型并发现新的细胞类型 | 单细胞基因表达数据 | machine learning | NA | scRNA-seq | variational autoencoder | gene expression data | NA |
| 98 | 2024-08-07 |
Club-like cells in proliferative inflammatory atrophy of the prostate
2023-09, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6149
PMID:37550827
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和染色RNA原位杂交技术，在前列腺增生性炎症萎缩（PIA）中发现并定位了类似肺部纤毛细胞的细胞群 | 首次在前列腺中发现与肺部纤毛细胞相似的细胞群，并探讨了这些细胞在前列腺炎症和癌变中的作用 | 研究主要集中在前列腺癌手术标本，对健康前列腺组织的研究较少 | 识别并定位前列腺中的纤毛细胞样细胞，并探讨其在前列腺炎症和癌变中的作用 | 前列腺组织，包括健康捐赠者和前列腺癌患者的前列腺标本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），染色RNA原位杂交 | NA | 组织样本 | 包括健康前列腺组织和前列腺癌手术标本 |
| 99 | 2024-08-07 |
H2-O deficiency promotes regulatory T cell differentiation and CD4 T cell hyperactivity
2023-Sep-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.14.553240
PMID:37645777
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研究论文 | 本文首次提供了H2-O分子在胸腺调节性T细胞选择中的直接证据，并探讨了H2-O缺乏对调节性T细胞和CD4 T细胞活性的影响。 | 首次直接证明H2-O在胸腺调节性T细胞选择中的作用，并揭示了H2-O缺乏对免疫细胞功能的影响。 | NA | 探讨H2-O缺乏对调节性T细胞和CD4 T细胞活性的影响，以更好地理解自身免疫病的易感性并设计治疗方案。 | 胸腺调节性T细胞的发育和CD4 T细胞的活性。 | 免疫学 | 自身免疫病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 100 | 2024-08-04 |
Interferon-independent processes constrain measles virus cell-to-cell spread in primary human airway epithelial cells
2023-Sep-19, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01361-23
PMID:37724882
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研究论文 | 本研究探讨了麻疹病毒在主要人类气道上皮细胞中的细胞间传播机制 | 这项研究揭示了IFN信号在麻疹病毒细胞间传播中并不是限制因素，强调了IFN独立过程的重要性 | 研究未能完全理解阻止麻疹病毒传播的机制 | 了解麻疹病毒在气道上皮细胞中的传播特征和机制 | 主要人类气道上皮细胞(Hae)和麻疹病毒(MeV)突变体 | NA | NA | 深度测序、定量RT-PCR和单细胞RNA测序 | NA | 细胞模型 | 主要人类气道上皮细胞的培养 |