单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 449 篇文献,本页显示第 61 - 80 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
61 2024-08-10
Classic genetic and hormonal switches during fetal sex development and beyond
2023-Sep, Medizinische Genetik : Mitteilungsblatt des Berufsverbandes Medizinische Genetik e.V IF:0.8Q4
研究论文 本文探讨了人类胎儿性别发育过程中的关键遗传和激素开关,以及这些开关如何决定性腺性别确定和后续的生殖和体细胞性别表型的分化 文章指出传统的性别发育模型是不充分的,并介绍了在特定突变情况下,这些开关可能表现出不同的功能,导致基因功能和剂量的连续变化,酶活性,性激素水平和敏感性的变化,从而产生广泛的生物性别发育差异(DSD)和潜在的生殖和体细胞性别表型的多样性 NA 探讨人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关的作用 人类胎儿性别发育过程中的遗传和激素开关 NA NA 单细胞和空间转录组学 NA 转录组 NA
62 2024-08-07
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究分析了未接种疫苗的孕妇在孕期经历轻度或无症状COVID-19感染后,新生儿脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞组成变化 首次详细探讨了轻度或无症状孕妇COVID-19感染对新生儿免疫反应的影响,包括免疫细胞的重编程和功能状态的改变 研究主要集中在脐带血和绒毛膜绒毛的免疫细胞分析,未涉及其他可能的影响因素 探讨孕妇轻度或无症状COVID-19感染对新生儿免疫系统的影响 未接种疫苗的孕妇及其新生儿 NA COVID-19 流式细胞术,单细胞RNA测序,体外刺激试验 NA 细胞 多个新生儿的脐带血和绒毛膜绒毛样本
63 2024-08-05
A comprehensive assessment of hurdle and zero-inflated models for single cell RNA-sequencing analysis
2023-09-20, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文全面评估了单细胞RNA测序分析中的障碍和零膨胀模型 提出了一个基于TensorFlow的Python包TensorZINB,解决了零膨胀负二项式模型的数值稳定性问题,并结合了混合模型来提高性能 未提及特定的局限性 提高单细胞RNA测序数据分析中的统计模型的准确性和计算速度 障碍和零膨胀模型的性能评估及其对单细胞RNA测序数据的应用 数字病理 NA RNA-seq 零膨胀负二项式(ZINB)模型 文本 使用真实的单细胞RNA测序数据集进行评估
64 2024-08-04
Multi-omic approach identifies hypoxic tumor-associated myeloid cells that drive immunobiology of high-risk pediatric ependymoma
2023-Sep-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究识别了高风险儿童脊髓膜瘤中促免疫生物学的缺氧肿瘤相关髓系细胞 识别了八种不同的髓系衍生亚群,特别是缺氧髓系细胞,它们展示了髓系抑制细胞的特征 缺乏关于缺氧髓系细胞在其他肿瘤类型中的作用的研究 揭示脊髓膜瘤的免疫环境,以指导免疫治疗 高风险儿童脊髓膜瘤的免疫细胞环境和肿瘤亚型 数字病理学 脊髓膜瘤 单细胞测序(scRNAseq)、肿瘤基因表达去卷积、空间蛋白组学、单细胞细胞因子释放测定 NA 细胞数据 27个单细胞、299个肿瘤样本、54个空间蛋白组样本、12个单细胞细胞因子释放样本
65 2024-08-04
N4-acetylcytidine of Nop2 mRNA is required for the transition of morula-to-blastocyst
2023-Sep-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了Nop2 mRNA的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的作用 首次揭示了NAT10介导的N4-乙酰胞苷修饰在小鼠前植入期胚胎中对mRNA稳定性和翻译效率的重要性 研究主要集中在小鼠胚胎中,结果可能无法直接推广到其他哺乳动物 旨在了解N4-乙酰胞苷修饰在小鼠早期胚胎发育中的功能 小鼠早期胚胎,包括缺乏NAT10的小鼠胚胎 数字病理学 NA 单细胞测序, RNA-seq, 乙酰化RNA免疫沉淀结合PCR(acRIP-PCR) NA NA NA
66 2024-08-05
Stem cell antigen-1+cell-derived fibroblasts are crucial for cardiac fibrosis during heart failure
2023-Sep-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 本研究探讨了干细胞抗原-1+细胞来源的成纤维细胞在心力衰竭中的关键作用 揭示了非骨髓来源的Sca1+细胞通过Wnt4-PDGFRα通路转化为成纤维细胞并促进心脏纤维化的机制 研究主要基于小鼠模型,可能在应用到人类时存在差异 探讨干细胞在心力衰竭中的作用及机制 小鼠和人类心脏中的干细胞抗原-1+细胞及其转化的成纤维细胞 数字病理学 心力衰竭 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 小鼠的非心肌细胞和人类心力衰竭患者的样本
67 2024-08-05
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
研究论文 这篇文章探讨了通过造血干细胞移植来纠正Progranulin缺乏症的方法 提出了一种基于Busulfan和 PLX3397的高效条件处理方案,以增强微胶质细胞的再生 尚未提及该方法在临床应用中的具体限制 研究造血干细胞移植在CNS中替代微胶质细胞的能力 主要研究对象为骨髓来源的微胶质细胞及其在小鼠模型中的应用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序和高维CyTOF质谱细胞计数 NA 细胞 小鼠模型,具体样本大小未详细说明
68 2024-08-04
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学分析,探讨了肝细胞癌中新辅助cabozantinib和nivolumab的免疫疗法组合的肿瘤微环境 研究揭示了不同细胞信号网络在肝细胞癌肿瘤微环境中的异质性,并确定了抵抗和复发的独立机制 仅对少数患者进行了分析,且样本量有限,研究结果需要更大规模的数据验证 研究肝细胞癌患者对现代系统治疗的反应与肿瘤微环境的分子和细胞特征之间的关系 研究对象为接受新辅助cabozantinib和nivolumab治疗的晚期肝细胞癌患者 数字病理学 肝癌 空间转录组学 NA 组织样本 15名患者的切除标本
69 2024-08-05
Unambiguous detection of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs with single-cell RNA sequencing
2023-Sep-07, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
研究论文 本研究比较了不同单细胞RNA测序文库制备方法对SARS-CoV-2亚基因组mRNA的检测能力 开发了一种新的文库制备和数据处理工作流程,提高了对SARS-CoV-2亚基因组mRNA的检测和定量能力 研究仅集中在SARS-CoV-2,不适用于其他病毒或病原体 研究不同单细胞RNA测序方法检测SARS-CoV-2 RNA的能力 SARS-CoV-2及其亚基因组mRNA 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) NA RNA序列数据 涉及数量不明的感染细胞样本
70 2024-08-05
Intragraft B cell differentiation during the development of tolerance to kidney allografts is associated with a regulatory B cell signature revealed by single cell transcriptomics
2023-09, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1
研究论文 该文章探讨了在肾移植物耐受的发展过程中,肾移植物内B细胞的分化与调节B细胞特征的关联 首次展示了在肾移植物中B细胞的比例随时间变化,并揭示了调节B细胞在移植物耐受中的潜在作用 该研究主要基于小鼠模型,可能在临床转化方面存在局限 研究肾移植物接受过程中B细胞的分化和功能 小鼠肾移植物及其免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 接受和拒绝的肾移植物样本,研究涉及的时间范围为1周至6个月
71 2024-08-05
Autophagy contributes to homeostasis in esophageal epithelium where high autophagic vesicle content marks basal cells with limited proliferation and enhanced self-renewal potential
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究旨在定义自噬在食管上皮中的作用,特别是在稳态条件下。 揭示了高自噬小泡含量的食管基底细胞与有限的增殖能力和增强的自我更新潜力之间的关联。 本研究主要集中在小鼠模型上,可能无法完全代表人类生理状态。 探讨自噬在食管上皮稳态中的作用。 主要研究对象为食管基底细胞,特别是自噬小泡含量对其增殖和自我更新能力的影响。 数字病理学 食管疾病 RNA测序,电子显微镜,流式细胞术 NA 组织样本,RNA 使用了转基因小鼠及单细胞(sc)RNA测序分析
72 2024-08-05
Single-cell analysis characterizes PLK1 as a catalyst of an immunosuppressive tumor microenvironment in LUAD
2023-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 这篇文章揭示了PLK1在肺腺癌中作为免疫抑制肿瘤微环境的催化剂的作用 本文首次阐明了PLK1在调控肿瘤免疫和肿瘤微环境中的新作用 对PLK1与肿瘤微环境之间复杂相互作用的理解仍不完整 研究PLK1在肺腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 使用基因工程小鼠模型和单细胞RNA测序分析探索PLK1的功能 数字病理学 肺癌 单细胞RNA-seq 基因工程小鼠模型 基因表达数据 NA
73 2024-08-04
Cell-type specific defects in PTEN-mutant cortical organoids converge on abnormal circuit activity
2023-09-05, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 这篇文章探讨了PTEN基因杂合突变对不同细胞类型在人脑发育中的影响。 本研究通过不同供体的人类皮质类器官揭示了PTEN杂合突变对细胞类型特异性发育事件的影响。 研究的样本量和供体背景的多样性可能限制了结论的普适性。 探讨PTEN基因的杂合突变如何影响人类大脑发育中的不同细胞类型。 使用不同供体的人类皮质类器官作为研究对象。 数字病理学 自闭症谱系障碍 单细胞RNA测序,蛋白质组学,空间转录组学 NA 基因组数据,蛋白质组数据 不同供体的人类皮质类器官
74 2024-08-05
Key Genetic Determinants Driving Esophageal Squamous Cell Carcinoma Initiation and Immune Evasion
2023-09, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了TP53、CDKN2A和NOTCH1的缺失如何诱导食道肿瘤和免疫逃逸,促进食道鳞状细胞癌的发生 建立了32种基因工程食道类器官,并识别出驱动食道鳞状细胞癌启动的关键基因决定因素 本研究的局限性在于只涉及小鼠模型,是否适用于人类尚需进一步验证 探索食道鳞状细胞癌的启动机制和免疫逃逸的遗传决定因素 使用CRISPR/Cas9基因敲除技术靶向9个基因进行的食道类器官研究 数字病理学 食道癌 CRISPR/Cas9 小鼠食道类器官 单细胞RNA测序 32个基因工程食道类器官
75 2024-08-05
Ligament injury in adult zebrafish triggers ECM remodeling and cell dedifferentiation for scar-free regeneration
2023-Sep-19, NPJ Regenerative medicine IF:6.4Q1
研究论文 这项研究揭示了成年斑马鱼韧带在损伤后的无疤痕再生能力 建立了一个新的成年无疤痕韧带再生模型,强调了免疫和间充质细胞相互作用在细胞外基质重塑中的作用 尚未明确不同免疫细胞在再生过程中的具体功能 研究成年斑马鱼韧带受伤后的再生机制 成年斑马鱼的韧带组织 数字病理学 NA 单细胞 RNA 测序 NA NA 斑马鱼数目未具体提及
76 2024-08-05
Gene signature from cutaneous autoimmune diseases provides potential immunotherapy-relevant biomarkers in melanoma
2023-09-12, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究探讨了自身免疫性皮肤病中T细胞基因特征在黑色素瘤免疫治疗中的应用潜力 提出了自身免疫性皮肤病的基因特征可以作为预测黑色素瘤免疫治疗反应的生物标志物 研究可能限制于特定类型的自身免疫性皮肤病,样本数量和多样性尚需进一步验证 探讨自身免疫性皮肤病的免疫细胞在黑色素瘤免疫治疗中的有效性 自身免疫性皮肤病(系统性红斑狼疮、特应性皮炎、银屑病)中的T细胞基因特征 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自多种自身免疫性皮肤病的样本,具体数量未在摘要中明确
77 2024-08-05
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 这篇文章通过整合基因组分析确定了follistatin作为头颈部鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体肿瘤网络的靶点 揭示了follistatin作为p63的直接转录靶标,并且其表达还受到EGFR信号的驱动 尚未详细阐明这些致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的具体机制 识别与头颈部鳞状细胞癌相关的p63肿瘤相关转录靶点 来自HNSCC患者的转录组数据以及代表性细胞系模型 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 数据集 多个转录组数据集,具体样本数未提供
78 2024-08-05
Aerobic Exercise Alters the Melanoma Microenvironment and Modulates ERK5 S496 Phosphorylation
2023-09-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文展示了运动如何改变黑色素瘤微环境以及调节ERK5 S496磷酸化 揭示了运动导致的肿瘤微环境变化中的肿瘤特异性免疫反应差异以及ERK5信号通路的重要性 研究仅使用了小鼠模型,可能无法完全代表人类的反应 探讨运动如何影响黑色素瘤的微环境及其机制 YUMMER 1.7 和 B16F10小鼠模型的黑色素瘤 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA测序和流式细胞术 NA NA 使用了YUMMER 1.7和B16F10小鼠模型
79 2024-08-04
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 本研究探讨了AML患者样本与T细胞相互作用对患者预后的影响及ICAM1的关键作用 揭示了与AML敏感性或抗性相关的转录程序,并发现ICAM1在T细胞介导的杀伤中扮演重要角色 研究可能未涵盖所有AML患者的异质性 探讨T细胞与急性髓性白血病之间的相互作用及其对患者预后的影响 急性髓性白血病患者样本及其与工程化CD4 T细胞的相互作用 数字病理学 急性髓性白血病 单细胞RNA测序 NA RNA数据 多例AML患者样本及CD4 T细胞
80 2024-08-05
Temporal dynamics and genomic programming of plasma cell fates
2023-Sep-06, Research square
研究论文 研究浆细胞命运的时序动态和基因组程序 提出了一种新的浆细胞过渡状态,促使功能性浆细胞前体的生成 尚未明确抗原特异性浆细胞前体的发育动力学和基因组程序 阐明浆细胞的发育动态和基因组程序 研究抗原特异性的浆细胞前体 NA NA scRNA-seq+BCR-seq NA NA NA
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