单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-07 |
Multiplexed single-cell lineage tracing of mitotic kinesin inhibitor resistance in glioblastoma
2023-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.09.557001
PMID:37745469
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研究论文 | 利用多重单细胞谱系追踪和单细胞RNA测序技术研究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂的耐药机制 | 首次在患者来源的胶质母细胞瘤神经球中应用多重谱系追踪条码技术，揭示长期KIF11抑制剂治疗诱导细胞向预后较好的前神经表型转变 | 主要基于体外细胞模型研究，动物模型验证相对有限 | 探究胶质母细胞瘤对KIF11抑制剂ispinesib产生耐药性的机制 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球细胞 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 多重谱系追踪条码技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源的胶质母细胞瘤神经球细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-01-03 |
Single-Cell Sequencing in Neurodegenerative Disorders
2023-09, Molecular diagnosis & therapy
IF:4.1Q1
DOI:10.1007/s40291-023-00668-9
PMID:37552451
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综述 | 本文回顾了单细胞测序技术在神经退行性疾病中的应用及其最新进展 | 利用单细胞组学技术深入探索神经退行性疾病中的细胞异质性，为诊断和治疗提供新视角 | 目前主要关注转录组变化，未来需要进一步技术发展以更好地理解和操纵相关通路 | 探讨单细胞测序技术在神经退行性疾病中的应用及其潜力 | 帕金森病、阿尔茨海默病、亨廷顿病和多发性硬化症等常见神经退行性疾病 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-12-23 |
Metabolic transcriptomics dictate responses of cone photoreceptors to retinitis pigmentosa
2023-09-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113054
PMID:37656622
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研究论文 | 本研究通过质谱分析和单细胞RNA测序，探讨了视网膜色素变性（RP）中视锥细胞的代谢转录组响应 | 首次将视锥细胞的代谢转录组与视网膜色素变性中的氧化磷酸化和糖酵解过程联系起来，揭示了不同类型视锥细胞在疾病进展中的不同代谢策略 | 研究主要集中在视锥细胞的代谢转录组，未深入探讨其他细胞类型的响应机制 | 探讨视网膜色素变性中视锥细胞的代谢转录组响应及其与疾病进展的关系 | 视网膜色素变性中的视锥细胞 | NA | 视网膜色素变性 | 质谱分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢物，转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-12-13 |
The cellular response to extracellular vesicles is dependent on their cell source and dose
2023-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adh1168
PMID:37656796
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研究论文 | 研究探讨了不同细胞来源和剂量的外泌体对细胞反应的影响 | 首次系统分析了不同细胞来源和剂量的外泌体对细胞转录效应的影响，并使用单细胞RNA测序技术在体内外进行了验证 | 研究主要集中在体外和体内实验，未涉及临床应用 | 探讨外泌体在细胞间通讯中的作用及其作为治疗剂的潜力 | 不同细胞来源和剂量的外泌体对成纤维细胞的转录效应 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 12种不同细胞来源的外泌体，剂量范围为每细胞20到200,000 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-12-12 |
Single-cell transcriptomics suggest distinct upstream drivers of IL-17A/F in hidradenitis versus psoriasis
2023-09, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.05.012
PMID:37271319
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研究论文 | 研究比较了化脓性汗腺炎（HS）和银屑病中T17细胞的转录组及其与邻近免疫细胞亚群的配体-受体相互作用 | 首次揭示了HS和银屑病中T17细胞的不同上游驱动因素，特别是IL-1β在HS中的主导作用 | 研究仅限于皮肤样本，未涵盖全身免疫反应 | 探讨化脓性汗腺炎和银屑病中T17细胞的转录组特征及其驱动机制 | 化脓性汗腺炎和银屑病中的T17细胞及其与邻近免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 12,300个来自8个化脓性汗腺炎皮肤样本的免疫细胞，19,525个来自11个银屑病皮肤样本的细胞，以及11,920个来自10个对照皮肤样本的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-10-14 |
Predicting gene regulatory links from single-cell RNA-seq data using graph neural networks
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad414
PMID:37985457
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研究论文 | 本文提出了一种基于图神经网络的框架GNNLink，用于从单细胞RNA测序数据中预测基因调控关系 | 本文的创新点在于将基因调控网络推断问题转化为图链接预测任务，并利用图卷积网络捕捉基因间的相互依赖关系 | 本文未详细讨论GNNLink在处理大规模数据集时的计算效率问题 | 本文的研究目的是从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | 本文的研究对象是单细胞RNA测序数据中的基因调控关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图卷积网络 | 基因表达数据 | 本文使用了七个单细胞RNA测序数据集进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-10-13 |
Thalamocortical control of cell-type specificity drives circuits for processing whisker-related information in mouse barrel cortex
2023-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41749-x
PMID:37770450
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研究论文 | 研究了小鼠体感皮层中棘星形神经元和锥体神经元在处理胡须诱发信号中的不同作用 | 通过空间转录组学技术，识别了与细胞类型相关的基因表达模式，并揭示了这些模式与特定丘脑输入在发育过程中的关联 | NA | 探讨棘星形神经元在处理特定胡须信号和形成特定胡须相关皮层回路中的作用 | 小鼠体感皮层中的棘星形神经元和锥体神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠体感皮层样本 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-10-13 |
scBridge embraces cell heterogeneity in single-cell RNA-seq and ATAC-seq data integration
2023-09-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41795-5
PMID:37770437
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scBridge的多组学数据整合方法，通过利用细胞异质性来提高单细胞RNA测序和ATAC测序数据的整合效果 | 本文创新性地利用细胞异质性来改善多组学数据整合，而不是将其视为干扰因素 | NA | 研究如何通过利用细胞异质性来提高单细胞多组学数据的整合效果 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 七个多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-10-11 |
Artificial Intelligence Models for Cell Type and Subtype Identification Based on Single-Cell RNA Sequencing Data in Vision Science
2023 Sep-Oct, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2023.3284795
PMID:37294649
|
综述 | 本文综述了基于单细胞RNA测序数据在视觉科学中使用人工智能技术进行细胞类型和亚型识别的最新进展 | 介绍了人工智能在细胞类型识别中的应用，提供了更快、更准确和用户友好的方法 | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法仍然是未来研究需要解决的问题 | 帮助视觉科学家选择合适的单细胞RNA测序数据集和计算工具进行分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型和亚型 | 计算机视觉 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-10-02 |
Simultaneous estimation of gene regulatory network structure and RNA kinetics from single cell gene expression
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.21.558277
PMID:37790443
|
研究论文 | 开发了一种深度学习模型，通过单细胞RNA测序数据同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 首次将深度学习模型应用于同时推断基因调控网络结构和RNA动力学参数，并展示了其在预测基因表达状态和模拟转录因子变化效果方面的优越性 | NA | 构建一个完整的、预测性的生物物理模型，用于基因表达调控 | 基因调控网络结构和RNA动力学参数 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | 175,000个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-10-02 |
Single-Nucleus RNA-Seq: Open the Era of Great Navigation for FFPE Tissue
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813744
PMID:37762049
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综述 | 本文综述了单核RNA测序（snRNA-seq）在福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中的应用及其技术进展 | snRNA-seq技术减少了离子化转录偏差，适用于更丰富的样本，为深入探索FFPE组织提供了新机会 | 本文总结了snRNA-seq在FFPE样本中的局限性和潜在技术发展 | 探讨单核RNA测序技术在福尔马林固定石蜡包埋组织中的应用 | 单核RNA测序技术及其在FFPE组织中的应用 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-09-30 |
Hormonal gatekeeping via the blood-brain barrier governs caste-specific behavior in ants
2023-09-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2023.08.002
PMID:37683635
|
研究论文 | 揭示血脑屏障在调节蚂蚁复杂社会行为中的新作用 | 发现血脑屏障中的关键激素降解酶——保幼激素酯酶（Jhe）在调节蚂蚁社会行为中的作用 | 研究主要集中在蚂蚁和果蝇，未涉及其他物种 | 探讨血脑屏障在调节蚂蚁社会行为中的作用 | 蚂蚁和果蝇的血脑屏障及保幼激素酯酶 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 蚂蚁和果蝇的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-09-28 |
Modeling idiopathic autism in forebrain organoids reveals an imbalance of excitatory cortical neuron subtypes during early neurogenesis
2023-09, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01399-0
PMID:37563294
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研究论文 | 使用皮质类器官和单细胞转录组学研究自闭症谱系障碍（ASD）患者前脑发育的改变 | 首次通过皮质类器官和单细胞转录组学研究自闭症谱系障碍患者前脑发育的改变，揭示了兴奋性皮质神经元亚型在早期神经发生中的不平衡 | 未发现基因组变异解释观察到的转录组改变 | 研究自闭症谱系障碍患者前脑发育的改变及其潜在机制 | 自闭症谱系障碍患者及其未受影响的父亲的前脑发育 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 13个家庭的自闭症谱系障碍男孩及其未受影响的父亲 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-09-27 |
Single-cell assignment using multiple-adversarial domain adaptation network with large-scale references
2023-09-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100577
PMID:37751689
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研究论文 | 介绍了一种名为SELINA的单细胞RNA-seq数据注释框架，利用多对抗域适应网络和预先整理的参考图谱进行细胞类型注释 | 提出了SELINA框架，通过多对抗域适应网络消除批次效应，并使用合成少数类过采样技术增强稀有细胞类型的注释 | NA | 开发一种能够准确注释单细胞RNA-seq数据的自动化框架 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | 多对抗域适应网络 | 单细胞RNA-seq数据 | 170万细胞，涵盖230种不同的人类细胞类型 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-09-27 |
Generation and molecular characterization of human pluripotent stem cell-derived pharyngeal foregut endoderm
2023-09-25, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.024
PMID:37751684
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类多能干细胞高效生成咽前肠内胚层的方法，并对其进行了分子表征 | 开发了一种高效的逐步分化方法，并引入了计算分类工具CellMatch，用于确认细胞成熟度 | NA | 研究与咽部发育和器官发生相关的人类综合征，并提供疾病相关位点和基因调控网络的研究方法 | 人类咽前肠内胚层及其衍生物 | NA | NA | 转录组分析、染色质分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-09-27 |
Inferring single-cell transcriptomic dynamics with structured latent gene expression dynamics
2023-09-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100581
PMID:37708894
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研究论文 | 本文提出了一种名为LatentVelo的方法，利用深度学习计算单细胞RNA测序数据的基因表达动态的低维表示 | LatentVelo通过变分自编码器将细胞嵌入潜在空间，并使用神经常微分方程在基于动态的潜在空间中建模分化动态，能够推断潜在的调节状态以模拟多个谱系 | NA | 开发一种新的方法来推断单细胞RNA测序数据中的基因表达动态 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达动态 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 变分自编码器，神经常微分方程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-09-27 |
Single-cell multi-omics defines the cell-type-specific impact of splicing aberrations in human hematopoietic clonal outgrowths
2023-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.012
PMID:37582363
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研究论文 | 本文通过整合基因型转录组学（GoT）与长读长单细胞转录组学和蛋白质组学，研究了人类造血克隆性增殖中剪接异常的细胞类型特异性影响 | 本文创新性地应用了GoT-Splice技术，结合单细胞多组学分析，揭示了SF3B1突变在不同造血祖细胞群体中的隐秘3'剪接位点使用情况及其在红细胞分化过程中的阶段特异性异常剪接 | 本文主要集中在SF3B1突变相关的骨髓增生异常综合征（MDS）患者样本，未来研究可以扩展到其他类型的血液疾病和突变 | 研究剪接因子突变在人类造血克隆性增殖中的细胞类型特异性影响 | 骨髓增生异常综合征（MDS）患者中的造血祖细胞 | 数字病理学 | 血液疾病 | 基因型转录组学（GoT）、长读长单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 转录组、表面蛋白、体细胞突变、RNA剪接 | 骨髓增生异常综合征（MDS）患者中的造血祖细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-09-27 |
TGF-β1 mediates tumor immunosuppression aggravating at the late stage post-high-light-dose photodynamic therapy
2023-Sep, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03479-3
PMID:37351605
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研究论文 | 本研究探讨了光动力疗法（PDT）后肿瘤微环境中免疫状态的动态变化，揭示了高剂量PDT诱导的早期免疫激活和晚期免疫抑制的机制 | 首次系统阐述了高剂量PDT后免疫抑制的机制，并提出了TGF-β阻断治疗策略作为逆转免疫抑制的潜在组合策略 | 研究主要集中在体外实验和动物模型上，尚未进行临床试验验证 | 揭示光动力疗法后肿瘤免疫抑制的机制，并提出改进策略 | 光动力疗法后的肿瘤微环境及免疫状态变化 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 光动力疗法 | NA | 空间转录组学数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-09-26 |
Towards Universal Cell Embeddings: Integrating Single-cell RNA-seq Datasets across Species with SATURN
2023-Sep-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.03.526939
PMID:36778387
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SATURN的深度学习方法，用于学习跨物种的通用细胞嵌入，通过结合蛋白质语言模型和RNA表达来整合不同物种的单细胞RNA测序数据 | SATURN能够检测跨物种共同表达的功能相关基因，重新定义了跨物种分析的差异表达，并展示了其在跨物种注释转移和细胞类型识别中的有效性 | NA | 开发一种能够整合跨物种单细胞RNA测序数据的方法，以揭示细胞类型的进化保守性和多样性 | 跨物种的单细胞RNA测序数据，包括三种物种的全器官图谱和蛙与斑马鱼的胚胎发育数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | 涉及三种物种的全器官图谱和蛙与斑马鱼的胚胎发育数据 | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-09-26 |
Novel human pluripotent stem cell-derived hypothalamus organoids demonstrate cellular diversity
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107525
PMID:37646018
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研究论文 | 本文介绍了一种从人类多能干细胞（hPSCs）衍生出的下丘脑类器官分化协议，用于模拟该脑区的细胞多样性 | 首次建立了从hPSCs衍生出的下丘脑类器官分化协议，并使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）揭示了成熟下丘脑类器官中多样化的神经元和非神经元细胞类型 | NA | 研究下丘脑的发育及其在疾病建模中的应用，以开发针对下丘脑相关疾病的新疗法 | 人类多能干细胞衍生的下丘脑类器官及其细胞多样性 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用了一个带有酪氨酸羟化酶（TH）-TdTomato报告基因的hPSC系，用于多巴胺能神经元（DNs）和其他TH表达细胞的研究 | NA | NA | NA | NA |