单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Computational workflow for investigating highly variable genes in single-cell RNA-seq across multiple time points and cell types
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102387
PMID:37379219
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研究论文 | 提出一种用于分析单细胞RNA测序数据中跨多个时间点和细胞类型的高变基因的计算工作流程 | 开发了能够同时分析多个时间点和细胞类型中高变基因的计算框架，重点关注与生物学通路相关的基因动态表达 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中高变基因在多个时间点和细胞类型中的表达特征 | 登革热病毒和COVID-19数据集中的免疫细胞类型 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Isolation and profiling of viable tumor cells from human ex vivo glioblastoma cultures through single-cell transcriptomics
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102383
PMID:37393609
|
研究论文 | 本文提出了一种从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞并进行单细胞转录组分析的实验方案 | 开发了从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞进行单细胞转录组分析的完整实验流程 | NA | 建立胶质母细胞瘤单细胞水平的研究方法 | 人源体外胶质母细胞瘤培养物中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Optimized single-cell RNA sequencing protocol to study early genome activation in mammalian preimplantation development
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102357
PMID:37314922
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研究论文 | 本文提出了一种优化的单细胞RNA测序方案，用于研究哺乳动物着床前发育过程中的早期基因组激活 | 改进了单细胞标记逆转录协议，优化了逆转录酶、cDNA扩增酶、裂解缓冲液和纯化步骤，适用于手工挑选的单细胞或数十至数百个细胞 | NA | 开发优化的单细胞RNA测序方案以研究基因表达 | 哺乳动物着床前发育阶段的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单个细胞至数百个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞标记逆转录协议的改进方法 |
| 44 | 2025-10-06 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
|
研究论文 | 本文提出了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离方案，用于单细胞RNA测序和流式细胞术分析 | 开发了专门针对小鼠足垫组织的免疫细胞分离方案，能够在保持高细胞活力的前提下获得可靠的单细胞悬液 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离和制备方法 | 小鼠足垫组织中的白细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，酶组织消化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Protocol to dissociate and isolate wide-diversity single cells by density gradient centrifugation from human hepatoblastoma tissue
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102449
PMID:37459235
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研究论文 | 介绍从人类肝母细胞瘤组织中分离高活性肝细胞和免疫细胞的实验方案 | 开发了基于Percoll密度梯度离心的单细胞分离方案，适用于人类肝母细胞瘤组织 | 方案主要针对肝母细胞瘤组织，对其他组织类型的适用性需要进一步验证 | 建立从人类肝母细胞瘤组织中分离高质量单细胞的标准化流程 | 人类肝母细胞瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Protocol to isolate human normal and neoplastic pancreatic cells for single-cell omic analyses
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102464
PMID:37480562
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研究论文 | 本文介绍了一种从正常和肿瘤人类胰腺组织中分离单细胞的实验方案 | 提供了专门针对人类胰腺组织（包括正常和肿瘤样本）的单细胞分离标准化流程 | NA | 建立高质量的人类胰腺单细胞分离方法，用于后续单细胞组学分析 | 人类正常和肿瘤胰腺组织 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | 10x Genomics platform | NA |
| 47 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq reveal SLC7A11, a key regulatory molecule of ferroptosis, is a prognostic-related biomarker and highly related to the immune system in lung adenocarcinoma
2023-Sep-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034876
PMID:37713821
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示SLC7A11作为铁死亡关键调控分子在肺腺癌中的预后价值和免疫系统相关性 | 首次系统性地结合bulk和单细胞转录组数据，证实SLC7A11在肺腺癌中的预后价值及其与免疫状态的密切关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探讨SLC7A11在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗疗效预测作用 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归分析, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Sep-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3294233/v1
PMID:37790324
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导再生的基因调控网络 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后诱导的米勒胶质细胞重编程差异，以及再生过程与发育过程的异同 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探索视网膜损伤后再生与发育过程中基因调控网络的共同点和差异 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和神经元前体细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达，从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，表观遗传分析 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-07 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
|
研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞和祖细胞通过训练免疫机制在不同病原体间提供交叉保护作用 | 发现HSPCs对感染产生异质性反应，可诱导骨髓源性巨噬细胞功能增强并产生针对不同病原体的交叉保护 | 研究仅限于小鼠模型，特异性反应和负责细胞类型仍需进一步明确 | 探究造血干细胞和祖细胞在训练免疫中的作用机制和交叉保护效应 | 小鼠造血干细胞和祖细胞及衍生的巨噬细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics of Mtb/HIV Co-Infection
2023-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182295
PMID:37759517
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究结核分枝杆菌/艾滋病共感染的免疫图谱进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示结核/艾滋病共感染中宿主-病原体相互作用和免疫异质性的创新应用 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在结核/艾滋病共感染研究中的应用价值 | 结核分枝杆菌和艾滋病病毒的共感染机制及免疫反应 | 单细胞组学 | 结核病/艾滋病共感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of murine bladder cancer identifies sex-specific transcriptional signatures with prognostic relevance
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107703
PMID:37701814
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠膀胱癌模型，识别具有预后相关性的性别特异性转录特征 | 首次在单细胞水平系统比较雄性和雌性膀胱癌肿瘤微环境的转录差异，并验证了BBN模型在研究人类膀胱癌性别差异中的相关性 | 研究基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究膀胱癌性别差异的分子机制并识别预后相关标志物 | BBN诱导的小鼠膀胱癌模型 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | BBN诱导的小鼠膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-07 |
Transcriptional Signatures of Hippocampal Tau Pathology in Primary Age-Related Tauopathy and Alzheimer's Disease
2023-Sep-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.09.12.23295440
PMID:37745408
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析海马区tau病理相关的转录特征，比较原发性年龄相关tau病和阿尔茨海默病的分子变化 | 首次在PART和AD中识别出与神经元内tau病理相关的两个新型基因表达特征，并发现两种疾病具有相似的转录变化 | 样本量较小（仅16例），仅关注海马CA1锥体神经元，结果需要在更大样本和更广泛脑区验证 | 探索PART和AD中神经元内tau病理相关的分子变化及其相似性 | 人类海马组织样本，包括6例PART、6例AD和4例对照病例 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例人类海马组织样本（6例PART、6例AD、4例对照） | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 54 | 2024-08-07 |
Re: Single-cell transcriptome analysis for characterizing primary Sca-1 positive, non-endothelial cardiac cells
2023-09, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2023.07.001
PMID:37454412
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2025-10-07 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术分析多发性骨髓瘤患者免疫微环境特征与持续微小残留病阴性状态的相关性 | 首次结合单细胞RNA测序、T细胞受体测序和质谱流式技术，纵向分析维持治疗期间多发性骨髓瘤患者的免疫微环境动态变化 | 样本量较小（23例患者），且研究人群限于接受来那度胺维持治疗的新诊断患者 | 探索多发性骨髓瘤患者长期治疗反应与免疫微环境特征之间的关联 | 新诊断多发性骨髓瘤患者 | 单细胞分析 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据, 蛋白质表达数据 | 23例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式技术 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-07 |
Innate and adaptive AAV-mediated immune responses in a mouse model of Duchenne muscular dystrophy
2023-Sep-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2023.06.002
PMID:37746243
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研究论文 | 本研究通过建立小鼠模型探究AAV介导的先天性和适应性免疫反应机制 | 开发了间隔4周双次给药AAV9的小鼠模型，更好地模拟人类对AAV的免疫反应 | 研究仅在小鼠模型中进行，与人类免疫系统存在差异 | 理解AAV诱导的免疫反应机制 | 杜氏肌营养不良症小鼠模型 | 免疫学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-07 |
Immune checkpoint blockade induces distinct alterations in the microenvironments of primary and metastatic brain tumors
2023-09-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169314
PMID:37655659
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了免疫检查点阻断对脑转移瘤和胶质母细胞瘤微环境的不同影响 | 首次在单细胞水平比较ICB对原发性和转移性脑肿瘤免疫微环境的差异影响，发现ICB在脑转移瘤中诱导更显著的T细胞浸润和独特的血管周巨噬细胞变化 | 样本量相对有限（28个脑转移瘤样本），且为观察性研究 | 探究免疫检查点阻断对脑肿瘤微环境的调控机制 | 脑转移瘤患者肿瘤组织 | 单细胞组学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 28个脑转移瘤样本（19个ICB初治，9个ICB治疗） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-07 |
Peripheral Blood Single-Cell Sequencing Uncovers Common and Specific Immune Aberrations in Fibrotic Lung Diseases
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.558301
PMID:37786685
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研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示纤维化肺病患者外周血中共同和特异性的免疫异常 | 首次系统性比较IPF和FHP两种纤维化肺病的外周血免疫细胞异常，发现单核细胞变化为共同特征而淋巴细胞异常具有疾病特异性 | 样本量相对有限（83个样本），需要更大规模研究验证发现 | 鉴定特发性肺纤维化和纤维化过敏性肺炎患者的共同和特异性免疫异常 | IPF和FHP患者及健康对照的外周血和支气管肺泡灌洗样本 | 单细胞组学 | 肺纤维化疾病 | 单细胞RNA测序，V(D)J谱分析，RNA速度分析，伪时间分析 | Seurat, Monocle3, Velocyto, scVelo, CellRank, Connectome, CellRanger, Immcantation | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 83个样本中的327,990个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞V(D)J测序 | 10x Chromium | 10x Genomics 5'基因表达和V(D)J谱分析 |
| 59 | 2025-10-07 |
Distinct mechanisms for sebaceous gland self-renewal and regeneration provide durability in response to injury
2023-09-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113121
PMID:37715952
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研究论文 | 本研究揭示了皮脂腺在稳态下通过专用干细胞池自我更新，在损伤后通过毛囊来源的替代干细胞再生的双重机制 | 首次发现皮脂腺损伤后可通过毛囊 bulge 区的替代干细胞实现再生，且该过程依赖 FGFR2 信号通路并可被毛发生长加速 | 研究主要集中于小鼠背部皮肤模型，尚未验证其他部位或其他物种的适用性 | 探究皮脂腺在稳态维持和损伤应答中的细胞机制 | 小鼠皮脂腺及其干细胞 | 细胞生物学 | 皮肤损伤 | 靶向单细胞 RNA 测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞 RNA 测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-07 |
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的表观遗传调控机制 | 首次发现IRF3通过STING-TBK1信号通路调控平滑肌细胞表型转变的表观遗传机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型转变的分子机制 | 小鼠主动脉平滑肌细胞和人类升主动脉瘤组织 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 小鼠模型和人类主动脉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |