单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 450 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of murine hearts for studying the development of the cardiac conduction system
2023-09-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02333-6
PMID:37666871
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠心脏传导系统的发育过程 | 建立了包含约50万个细胞的大规模单细胞转录组数据集，覆盖心脏发育的六个连续阶段 | 研究仅限于小鼠模型，人类心脏发育可能存在差异 | 解析哺乳动物心脏传导系统在发育过程中的细胞类型组成 | 小鼠心脏细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约50万个单个细胞，来自六个发育阶段的小鼠心脏 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human MAIT cell transcriptional, functional and clonal diversity
2023-09, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01575-1
PMID:37580605
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了人类MAIT细胞在转录组、功能和克隆层面的多样性 | 开发了功能性RNA测序方法，首次在单细胞分辨率整合功能与TCR克隆型分析 | 研究主要关注血液和肝脏MAIT细胞，其他组织中的MAIT细胞多样性仍需进一步探索 | 解析人类MAIT细胞的功能和克隆多样性 | 人类血液和肝脏中的MAIT细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，TCR repertoire分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of CX3CR1+ Cells Reveals a Pathogenic Role for BIRC5+ Myeloid Proliferating Cells Driven by Staphylococcus aureus Leukotoxins
2023-09-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300166
PMID:37466391
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传命运追踪技术，揭示了金黄色葡萄球菌白细胞毒素驱动BIRC5+髓系增殖细胞的致病作用 | 首次发现BIRC5+髓系细胞在金黄色葡萄球菌感染中的毒素依赖性致病机制，并通过基因敲除验证其功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究CX3CR1+髓系细胞在感染性疾病中的致病机制 | 小鼠肝脏中的CX3CR1+髓系细胞 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序，遗传命运追踪，基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染曼氏血吸虫和金黄色葡萄球菌的小鼠肝脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
A protocol to analyze single-cell RNA-seq data from Mycobacterium tuberculosis-infected mice lung
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102544
PMID:37659083
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研究论文 | 提出一种分析结核分枝杆菌感染小鼠肺部单细胞RNA测序数据的标准化流程 | 开发了专门针对肺部淋巴细胞群体的单细胞RNA测序数据分析流程，特别针对感染与健康状态的比较分析 | 未明确说明样本数量和技术重复情况，依赖已处理数据而非原始数据 | 建立标准化分析流程以解析肺部淋巴细胞在结核感染中的变化 | 健康与结核分枝杆菌感染小鼠的肺部淋巴细胞 | 生物信息学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Protocol for identifying immune checkpoint on circulating tumor cells of human pancreatic ductal adenocarcinoma by single-cell RNA sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102539
PMID:37659082
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研究论文 | 本文介绍了一种通过单细胞RNA测序识别胰腺导管腺癌循环肿瘤细胞上免疫检查点的实验方案 | 开发了从胰腺导管腺癌肝转移患者中分离循环肿瘤细胞并进行单细胞RNA测序以识别免疫检查点的标准化流程 | NA | 建立有效的免疫治疗方案以预防肿瘤转移 | 胰腺导管腺癌肝转移患者的循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and analysis of rodent blood stage Plasmodium
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102491
PMID:37581982
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研究论文 | 本文提供了一种利用单细胞RNA测序技术分析啮齿动物血液阶段疟原虫发育阶段特异性基因表达调控的方案 | 首次应用单细胞RNA测序技术于疟原虫血液阶段研究，克服了传统批量RNA测序无法区分发育阶段特异性基因调控的局限 | NA | 建立疟原虫血液阶段发育特异性基因表达分析的方法学 | 啮齿动物血液阶段的疟原虫(Plasmodium chabaudi chabaudi AS)感染的红色血细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序，FACS分选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Protocol for profiling in vitro intratumor heterogeneity using spatially annotated single-cell sequencing
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102447
PMID:37453069
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研究论文 | 介绍一种利用空间注释单细胞测序分析体外肿瘤异质性的实验方案 | 结合活细胞成像和光图案化照明技术，实现特定区域细胞的空间标记和单细胞RNA测序 | 目前主要应用于体外肿瘤模型，尚未在组织切片中广泛应用 | 开发空间解析的肿瘤异质性分析技术 | 体外培养的肿瘤细胞系 | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 活细胞成像, 光激活标记 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间成像数据 | 多种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Computational workflow for investigating highly variable genes in single-cell RNA-seq across multiple time points and cell types
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102387
PMID:37379219
|
研究论文 | 提出一种用于分析单细胞RNA测序数据中跨多个时间点和细胞类型的高变基因的计算工作流程 | 开发了能够同时分析多个时间点和细胞类型中高变基因的计算框架，重点关注与生物学通路相关的基因动态表达 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中高变基因在多个时间点和细胞类型中的表达特征 | 登革热病毒和COVID-19数据集中的免疫细胞类型 | 生物信息学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Isolation and profiling of viable tumor cells from human ex vivo glioblastoma cultures through single-cell transcriptomics
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102383
PMID:37393609
|
研究论文 | 本文提出了一种从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞并进行单细胞转录组分析的实验方案 | 开发了从人源体外胶质母细胞瘤培养物中分离存活肿瘤细胞进行单细胞转录组分析的完整实验流程 | NA | 建立胶质母细胞瘤单细胞水平的研究方法 | 人源体外胶质母细胞瘤培养物中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Optimized single-cell RNA sequencing protocol to study early genome activation in mammalian preimplantation development
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102357
PMID:37314922
|
研究论文 | 本文提出了一种优化的单细胞RNA测序方案，用于研究哺乳动物着床前发育过程中的早期基因组激活 | 改进了单细胞标记逆转录协议，优化了逆转录酶、cDNA扩增酶、裂解缓冲液和纯化步骤，适用于手工挑选的单细胞或数十至数百个细胞 | NA | 开发优化的单细胞RNA测序方案以研究基因表达 | 哺乳动物着床前发育阶段的细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 单个细胞至数百个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基于单细胞标记逆转录协议的改进方法 |
| 51 | 2025-10-06 |
Optimized protocol for mouse footpad immune cell isolation for single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102409
PMID:37402171
|
研究论文 | 本文提出了一种优化的小鼠足垫免疫细胞分离方案，用于单细胞RNA测序和流式细胞术分析 | 开发了专门针对小鼠足垫组织的免疫细胞分离方案，能够在保持高细胞活力的前提下获得可靠的单细胞悬液 | NA | 建立适用于单细胞RNA测序的小鼠足垫免疫细胞分离和制备方法 | 小鼠足垫组织中的白细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，酶组织消化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
Protocol to dissociate and isolate wide-diversity single cells by density gradient centrifugation from human hepatoblastoma tissue
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102449
PMID:37459235
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研究论文 | 介绍从人类肝母细胞瘤组织中分离高活性肝细胞和免疫细胞的实验方案 | 开发了基于Percoll密度梯度离心的单细胞分离方案，适用于人类肝母细胞瘤组织 | 方案主要针对肝母细胞瘤组织，对其他组织类型的适用性需要进一步验证 | 建立从人类肝母细胞瘤组织中分离高质量单细胞的标准化流程 | 人类肝母细胞瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Protocol to isolate human normal and neoplastic pancreatic cells for single-cell omic analyses
2023-09-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102464
PMID:37480562
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研究论文 | 本文介绍了一种从正常和肿瘤人类胰腺组织中分离单细胞的实验方案 | 提供了专门针对人类胰腺组织（包括正常和肿瘤样本）的单细胞分离标准化流程 | NA | 建立高质量的人类胰腺单细胞分离方法，用于后续单细胞组学分析 | 人类正常和肿瘤胰腺组织 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞分离技术 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | 10x Genomics platform | NA |
| 54 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq and scRNA-seq reveal SLC7A11, a key regulatory molecule of ferroptosis, is a prognostic-related biomarker and highly related to the immune system in lung adenocarcinoma
2023-Sep-15, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034876
PMID:37713821
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研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，揭示SLC7A11作为铁死亡关键调控分子在肺腺癌中的预后价值和免疫系统相关性 | 首次系统性地结合bulk和单细胞转录组数据，证实SLC7A11在肺腺癌中的预后价值及其与免疫状态的密切关联 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探讨SLC7A11在肺腺癌中的预后价值和免疫治疗疗效预测作用 | 肺腺癌组织和正常肺组织 | 生物信息学 | 肺腺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | Cox回归分析, 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Sep-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3294233/v1
PMID:37790324
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导再生的基因调控网络 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后诱导的米勒胶质细胞重编程差异，以及再生过程与发育过程的异同 | 研究仅限于斑马鱼模型，结果可能不完全适用于哺乳动物 | 探索视网膜损伤后再生与发育过程中基因调控网络的共同点和差异 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的米勒胶质细胞和神经元前体细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生视网膜样本 | NA | single-cell RNA-seq, single-nuclear RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-07 |
The Histone Methyltransferase SETDB2 Modulates Tissue Inhibitors of Metalloproteinase-Matrix Metalloproteinase Activity During Abdominal Aortic Aneurysm Development
2023-09-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005963
PMID:37325923
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研究论文 | 本研究揭示组蛋白甲基转移酶SETDB2通过调控TIMP-MMP活性在腹主动脉瘤发展中的关键作用 | 首次发现SETDB2通过H3K9me3修饰抑制TIMP1-3基因表达，从而调控巨噬细胞介导的蛋白酶活性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探究巨噬细胞特异性表观遗传酶在腹主动脉瘤发展中的作用机制 | 人类主动脉组织样本和髓系特异性SETDB2缺陷小鼠模型 | 表观遗传学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序，基因敲除，表观遗传分析 | NA | 基因表达数据，组织学数据 | 人类AAA组织和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-07 |
Hematopoietic stem and progenitor cells confer cross-protective trained immunity in mouse models
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107596
PMID:37664586
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研究论文 | 本研究揭示了造血干细胞和祖细胞通过训练免疫机制在不同病原体间提供交叉保护作用 | 发现HSPCs对感染产生异质性反应，可诱导骨髓源性巨噬细胞功能增强并产生针对不同病原体的交叉保护 | 研究仅限于小鼠模型，特异性反应和负责细胞类型仍需进一步明确 | 探究造血干细胞和祖细胞在训练免疫中的作用机制和交叉保护效应 | 小鼠造血干细胞和祖细胞及衍生的巨噬细胞 | 免疫学 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomics of Mtb/HIV Co-Infection
2023-09-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182295
PMID:37759517
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究结核分枝杆菌/艾滋病共感染的免疫图谱进展 | 系统总结了单细胞RNA测序在揭示结核/艾滋病共感染中宿主-病原体相互作用和免疫异质性的创新应用 | 作为综述文章，不涉及原始实验数据，主要基于已有研究进行总结分析 | 探讨单细胞转录组学在结核/艾滋病共感染研究中的应用价值 | 结核分枝杆菌和艾滋病病毒的共感染机制及免疫反应 | 单细胞组学 | 结核病/艾滋病共感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-07 |
Single-cell profiling of murine bladder cancer identifies sex-specific transcriptional signatures with prognostic relevance
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107703
PMID:37701814
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠膀胱癌模型，识别具有预后相关性的性别特异性转录特征 | 首次在单细胞水平系统比较雄性和雌性膀胱癌肿瘤微环境的转录差异，并验证了BBN模型在研究人类膀胱癌性别差异中的相关性 | 研究基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探究膀胱癌性别差异的分子机制并识别预后相关标志物 | BBN诱导的小鼠膀胱癌模型 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | BBN诱导的小鼠膀胱癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-07 |
Transcriptional Signatures of Hippocampal Tau Pathology in Primary Age-Related Tauopathy and Alzheimer's Disease
2023-Sep-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.09.12.23295440
PMID:37745408
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学技术分析海马区tau病理相关的转录特征，比较原发性年龄相关tau病和阿尔茨海默病的分子变化 | 首次在PART和AD中识别出与神经元内tau病理相关的两个新型基因表达特征，并发现两种疾病具有相似的转录变化 | 样本量较小（仅16例），仅关注海马CA1锥体神经元，结果需要在更大样本和更广泛脑区验证 | 探索PART和AD中神经元内tau病理相关的分子变化及其相似性 | 人类海马组织样本，包括6例PART、6例AD和4例对照病例 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16例人类海马组织样本（6例PART、6例AD、4例对照） | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |