单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 449 篇文献,本页显示第 41 - 60 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
41 2024-09-25
Activin A-Mediated Polarization of Cancer-Associated Fibroblasts and Macrophages Confers Resistance to Checkpoint Immunotherapy in Skin Cancer
2023-09-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 研究探讨了皮肤癌中免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 首次揭示了Activin A介导的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞的极化在皮肤癌免疫治疗抵抗中的关键作用 研究仅限于基底细胞癌,未涵盖其他类型的皮肤癌 探究基底细胞癌对免疫检查点抑制剂治疗抵抗的细胞和分子机制 基底细胞癌中的癌症相关成纤维细胞和巨噬细胞 NA 皮肤癌 空间转录组学和单细胞转录组学 NA 转录组数据 包括对免疫治疗敏感和抵抗的基底细胞癌患者
42 2024-09-25
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-Sep, Nature IF:50.5Q1
研究论文 研究利用人类脑类器官和单细胞基因组技术,推断和扰动细胞命运调控网络 开发了Pando框架,整合多组学数据和转录因子结合位点预测,推断出描述类器官发育的全局基因调控网络 NA 研究人类脑发育中的基因调控网络,并评估转录因子对细胞命运和状态调控的影响 人类脑类器官中的单细胞转录组和可及染色质数据 数字病理学 NA 单细胞转录组测序 NA 基因组数据 覆盖神经上皮形成、模式化、脑区域化和神经发生的密集时间序列数据
43 2024-09-23
Camel nanobody-based B7-H3 CAR-T cells show high efficacy against large solid tumours
2023-09-22, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究基于骆驼纳米抗体的B7-H3 CAR-T细胞对大型实体瘤的高效性 开发了基于骆驼纳米抗体识别B7-H3 IgC域的CAR-T细胞,显示出对大型肿瘤的强大抗肿瘤活性 研究仅在雌性小鼠模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 优化基于CAR-T细胞的免疫疗法,特别是针对实体瘤 B7-H3蛋白及其在实体瘤中的作用 NA NA 单细胞转录组RNA测序,功能性T细胞蛋白质组学分析 NA RNA测序数据,蛋白质组学数据 雌性小鼠
44 2024-09-23
Genetic activation of glycolysis in osteoblasts preserves bone mass in type I diabetes
2023-09-21, Cell chemical biology IF:6.6Q1
研究论文 研究探讨了I型糖尿病中骨形成受损的机制,并发现通过激活成骨细胞中的糖酵解可以维持骨量 首次揭示了I型糖尿病中成骨细胞糖代谢缺陷是骨质疏松的致病机制,并提出增强成骨细胞糖酵解可能是一种潜在的骨形成疗法 研究基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 探讨I型糖尿病中骨形成受损的机制,并寻找潜在的治疗策略 I型糖尿病小鼠的成骨细胞和骨组织 NA 糖尿病 单细胞RNA测序、稳定同位素示踪 NA RNA序列数据 小鼠模型
45 2024-09-23
Bulk brain tissue cell-type deconvolution with bias correction for single-nuclei RNA sequencing data using DeTREM
2023-Sep-19, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本文提出了一种名为DeTREM的改进方法,用于校正单核RNA测序数据与批量RNA测序数据之间的偏差,以提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 DeTREM方法通过补偿单核RNA测序与批量RNA测序数据之间的差异,提高了细胞类型反卷积的准确性,并优于其他反卷积方法 NA 提高脑组织细胞类型反卷积的准确性 人脑组织的细胞类型反卷积 数字病理学 NA 单核RNA测序 (snRNA-seq) MuSiC RNA测序数据 NA
46 2024-09-23
SiGra: single-cell spatial elucidation through an image-augmented graph transformer
2023-09-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为SiGra的方法,通过图像增强的图变换器来揭示单细胞空间域并增强稀疏和噪声的转录组数据 SiGra方法结合了多通道免疫组化图像信息,通过混合图变换器在单细胞空间图上进行处理,显著提高了模型性能 NA 开发一种方法来利用图像信息揭示空间域并增强转录组数据 单细胞和斑点级别的空间转录组数据 数字病理学 NA 免疫组化 图变换器 图像 复杂组织中的单细胞和斑点级别的空间转录组数据
47 2024-09-23
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究了VE-cadherin和Alk1在非内皮细胞中的作用,特别是在神经分支维持中的作用 发现VE-cadherin和Alk1不仅在内皮细胞中起作用,还在非内皮细胞中维持神经分支 NA 探讨VE-cadherin和Alk1在皮肤血管重塑和神经分支维持中的作用 VE-cadherin阳性细胞和Alk1在皮肤中的作用 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 小鼠
48 2024-09-23
Notch and retinoic acid signals regulate macrophage formation from endocardium downstream of Nkx2-5
2023-09-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究揭示了Nkx2-5下游的Notch和视黄酸信号在心肌内膜向巨噬细胞分化的调控网络 首次揭示了Nkx2-5/Notch/RA信号通路在心肌内膜向巨噬细胞分化中的关键作用 NA 探讨心肌内膜向巨噬细胞分化的分子机制 心肌内膜、巨噬细胞、Nkx2-5、Notch信号、视黄酸信号 NA NA scRNA-seq NA 基因表达数据 NA
49 2024-09-23
NF-κB subunits direct kinetically distinct transcriptional cascades in antigen receptor-activated B cells
2023-09, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 研究了NF-κB家族中的Rel和RelA在B细胞受体激活后的基因表达调控中的不同功能 揭示了Rel和RelA在B细胞激活后基因表达调控中的不同动力学特征和功能对抗性 NA 探讨NF-κB家族成员在B细胞激活后的基因表达调控中的特异性功能 Rel和RelA在B细胞中的基因表达调控功能 NA NA 多组学分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA
50 2024-09-21
Epigenetic Induction of Smooth Muscle Cell Phenotypic Alterations in Aortic Aneurysms and Dissections
2023-09-19, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 研究了主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型改变的表观遗传诱导机制 揭示了DNA损伤和细胞质泄漏驱动平滑肌细胞从收缩表型向炎症表型转变的机制 NA 探讨主动脉瘤和夹层中平滑肌细胞表型改变的机制 主动脉平滑肌细胞的表型改变 NA 心血管疾病 单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序 NA 基因表达数据和染色质可及性数据 小鼠和人类升主动脉瘤和夹层组织
51 2024-09-14
ConSpaS: a contrastive learning framework for identifying spatial domains by integrating local and global similarities
2023-09-22, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为ConSpaS的新型节点表示学习框架,通过整合局部和全局相似性来精确解码空间域 ConSpaS框架结合了图自编码器(GAE)和对比学习(CL),通过无增强机制构建全局正样本和半简单采样策略定义负样本,有效提高了空间域识别的准确性 NA 开发一种新的方法来提高空间转录组学中空间域识别的准确性 空间转录组学中的空间域 生物信息学 NA 对比学习(CL) 图自编码器(GAE) 基因表达数据 多种组织类型和技术平台
52 2024-09-14
Cardiac Pericytes Acquire a Fibrogenic Phenotype and Contribute to Vascular Maturation After Myocardial Infarction
2023-09-12, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 研究心肌梗死后心脏周细胞获得纤维化表型并参与血管成熟的过程 首次揭示了心肌梗死后周细胞在纤维化修复中的作用及其表型变化 周细胞特异性TGF-β受体2敲除对心肌纤维化重塑的影响不显著 探讨心肌梗死后周细胞的命运及其在心肌疾病中的作用 心脏周细胞及其在心肌梗死后的表型变化 NA 心血管疾病 聚合酶链反应阵列、单细胞RNA测序 NA RNA 使用NG2Dsred;PDGFRαEGFP周细胞:成纤维细胞双报告小鼠和可诱导的NG2CreER小鼠进行研究
53 2024-09-10
SARS-CoV-2 niches in human placenta revealed by spatial transcriptomics
2023-09-08, Med (New York, N.Y.)
研究论文 研究利用空间转录组学揭示了SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境 首次利用空间转录组学技术生成高分辨率的胎盘转录图谱,揭示了SARS-CoV-2在胎盘微环境中的动态响应 样本量较小,仅包括少数健康对照和COVID-19感染者 探究SARS-CoV-2在人类胎盘中的微环境及其对胎盘功能的影响 人类胎盘中的SARS-CoV-2感染及其转录组变化 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组 13个胎盘样本,包括4个健康对照、4个无症状感染者和5个有症状感染者
54 2024-09-10
Durable alveolar engraftment of PSC-derived lung epithelial cells into immunocompetent mice
2023-09-07, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本文研究了多能干细胞衍生的肺上皮细胞在免疫活性小鼠中的持久植入 首次实现了多能干细胞衍生的肺上皮祖细胞在免疫活性小鼠中的持久植入,并展示了其在肺损伤修复中的潜力 NA 探索多能干细胞衍生的肺上皮细胞在肺损伤修复中的应用 多能干细胞衍生的肺上皮祖细胞在免疫活性小鼠中的植入和成熟 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA NA
55 2024-09-07
Innate and adaptive AAV-mediated immune responses in a mouse model of Duchenne muscular dystrophy
2023-Sep-14, Molecular therapy. Methods & clinical development
研究论文 研究了在小鼠杜氏肌营养不良模型中,AAV介导的先天性和适应性免疫反应 开发了一种双剂量AAV9模型,更好地模拟了人类对AAV的免疫反应 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 研究AAV介导的免疫反应,并开发改进的临床前模型 AAV9介导的免疫反应及其在小鼠模型中的表现 NA 杜氏肌营养不良 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
56 2024-09-04
Single-cell RNA sequencing deciphers the mechanism of sepsis-induced liver injury and the therapeutic effects of artesunate
2023-Sep, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了脓毒症诱导的肝脏损伤机制及青蒿琥酯的治疗效果 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脓毒症对肝脏细胞的具体影响,并评估了青蒿琥酯的肝保护作用 研究仅限于小鼠模型,尚未进行临床试验验证 探讨脓毒症对肝脏的影响及青蒿琥酯的肝保护机制 小鼠肝脏在脓毒症感染后的细胞反应及青蒿琥酯的治疗效果 数字病理学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠模型
57 2024-09-01
Cell-intrinsic effects of clonal hematopoiesis in heart failure
2023-Sep, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本文研究了克隆性造血(CHIP)在心力衰竭患者中的细胞内在效应 使用改进的单细胞测序流程(MutDetect-Seq)展示了DNMT3A突变型单核细胞、CD4+ T细胞和NK细胞的基因表达谱改变,并验证了突变型与野生型单核细胞和T细胞之间的旁分泌信号通路 NA 探讨CHIP在心力衰竭患者中的细胞内在效应及其对预后的影响 心力衰竭患者中的CHIP突变细胞 NA 心力衰竭 单细胞测序 NA 基因表达数据 具体样本数量未在摘要中提及
58 2024-08-31
Antigen-specific CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph node and blood following vaccination in humans
2023-Sep-15, Research square
研究论文 本研究评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后人类血液和引流淋巴结中刺突特异性CD4 T细胞的单细胞转录组学特征 本研究定义了新的克隆型,并使用基于深度学习的反向表位映射方法Trex来预测抗原特异性 NA 研究SARS-CoV-2感染和mRNA疫苗接种诱导的CD4 T细胞反应及其在保护性免疫中的作用 人类血液和引流淋巴结中的刺突特异性CD4 T细胞 免疫学 NA 单细胞转录组学 深度学习 转录组数据 多个刺突特异性CD4 T细胞克隆型
59 2024-08-27
Dual inhibition of glycolysis and glutaminolysis for synergistic therapy of rheumatoid arthritis
2023-09-20, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 研究通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径,探讨其在类风湿性关节炎治疗中的协同作用 提出通过双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径作为治疗类风湿性关节炎的新方法 NA 探讨双重抑制糖酵解和谷氨酰胺分解途径在类风湿性关节炎治疗中的潜在协同作用 类风湿性关节炎中的滑膜成纤维细胞 NA 类风湿性关节炎 scRNA-seq, H1-核磁共振波谱 NA 细胞类型, 基因表达 涉及人类滑膜细胞和关节炎小鼠模型
60 2024-08-27
CTLA-4 tail fusion enhances CAR-T antitumor immunity
2023-09, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过将细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(CTLA-4)的细胞质尾部融合到嵌合抗原受体(CAR)的C端,重新编程CAR功能,显著增强了CAR-T细胞的体内疗效 通过融合CTLA-4的细胞质尾部到CAR的C端,实现了CAR-T细胞功能的重新编程,从而提高了其抗肿瘤免疫效果 NA 研究如何通过融合CTLA-4的细胞质尾部到CAR的C端来增强CAR-T细胞的抗肿瘤免疫效果 嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)及其在抗肿瘤免疫中的应用 免疫学 白血病 单细胞RNA测序和流式细胞术 NA 细胞 NA
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