单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
441	2024-08-08	Decellularised spinal cord matrix manipulates glial niche into repairing phase via serglycin-mediated signalling pathway 2023-Sep, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.13429 PMID:36807637	研究论文	本文研究了脱细胞脊髓基质（DSCM）通过serglycin介导的信号通路调控神经胶质微环境，促进脊髓损伤修复的机制	首次揭示了DSCM通过serglycin介导的信号通路逆转星形胶质细胞成熟，改变胶质微环境进入修复阶段	NA	探究DSCM调控胶质微环境在神经-胶质-血管单元中的机制	脱细胞脊髓基质（DSCM）、星形胶质细胞、神经前体细胞	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
442	2024-08-08	Single-cell RNA landscape of the special fiber initiation process in Bombax ceiba 2023-09-11, Plant communications IF:9.4Q1 DOI:10.1016/j.xplc.2023.100554 PMID:36772797	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了木棉树纤维细胞分化过程中的分子机制	发现了木棉树纤维细胞发育的独特机制，与传统棉花纤维启动过程不同	NA	揭示木棉树纤维细胞分化和发育的基因表达特征	木棉树纤维细胞的分化过程	数字病理学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA	15,567个高质量细胞
443	2024-08-05	Improved in situ sequencing for high-resolution targeted spatial transcriptomic analysis in tissue sections 2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao DOI:10.1016/j.jgg.2023.02.004 PMID:36796537	研究论文	提出了一种改进的原位测序方法，用于在组织切片中进行高分辨率的靶向空间转录组分析	采用新的探针和条形码方法，结合先进的图像分析流程，提高了原位测序的信号强度和特异性	NA	旨在改进原位测序技术，以实现精准的空间基因表达轮廓分析	针对新鲜冷冻组织和福尔马林固定石蜡包埋组织切片的单细胞空间基因表达进行分析	数字病理学	NA	原位测序(IISS)	NA	基因表达数据	NA
444	2024-08-05	MHA, an interactive website for scRNA-seq data of male genitourinary development and disease 2023-09, Andrology IF:3.2Q1 DOI:10.1111/andr.13402 PMID:36710661	研究论文	本研究介绍了一个关于男性生殖系统的单细胞测序数据的互动网站MHA	MHA是第一个专注于男性生殖学和男性生殖的单细胞数据库网站，提供了独特的单细胞测序资源和可访问的工具	该研究依赖于已发表的研究数据，可能存在数据质量和完整性的问题	旨在为男性生殖系统的单细胞测序数据提供一个共享平台	男性特定组织和器官的单细胞测序数据	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	单细胞数据	57个样本（人类和小鼠）
445	2024-08-05	Spatial transcriptomics for profiling the tropism of viral vectors in tissues 2023-09, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-022-01648-w PMID:36702899	研究论文	该研究开发了一种超灵敏的空间转录组测序方法，用于在完整组织中分析病毒载体的细胞亚型嗜性	文章提出了一种结合水凝胶组织清洁、信号增强和多重标记的新方法USeqFISH，能够高通量、高清晰度地分析内源性和病毒RNA	尚未提及具体的局限性	研究工程化腺相关病毒载体在哺乳动物组织中传导特性	研究六种系统腺相关病毒（AAV）在小鼠大脑不同区域的转导和细胞亚型嗜性	数字病理	NA	USeqFISH	NA	RNA	六种系统AAV在小鼠脑部的多个区域
446	2024-08-08	Comparing the adult and pre-pubertal testis: Metabolic transitions and the change in the spermatogonial stem cell metabolic microenvironment 2023-09, Andrology IF:3.2Q1 DOI:10.1111/andr.13397 PMID:36690000	综述	本文综述了生精干细胞在维持和分化过程中的代谢需求，并强调了Sertoli细胞和干细胞微环境成熟对生精干细胞代谢需求在发育过程中的潜在影响	提出了生精干细胞成熟的新定义，并根据代谢变化对其进行了修正	NA	深入理解生精干细胞的代谢需求及其调控机制，以改善其在实验室中的培养	生精干细胞的代谢需求及其在发育过程中的变化	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
447	2024-08-08	Droplet-based transcriptome profiling of individual synapses 2023-09, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-022-01635-1 PMID:36646931	研究论文	本研究开发了一种基于液滴的单细胞总RNA测序平台，用于分析单个突触的转录组	首次实现了单个突触的高通量转录组分析，并扩展到阿尔茨海默病模型中检测突触基因表达变化	NA	开发一种高通量的方法来分析单个突触的分子异质性	主要由突触体组成的神经突触	神经科学	阿尔茨海默病	scRNA-seq	NA	转录组	包括小鼠和人类脑样本
448	2024-08-05	Shared developmental pathways of the placenta and fetal heart 2023-09-26, Placenta IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.placenta.2022.12.006 PMID:36604258	综述	本文回顾了先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍之间的临床、结构和分子关系	探讨了胎盘在先天性心脏缺陷发病机制中的特定病因角色	小鼠和大鼠模型在评估心脏与胎盘关系方面存在显著限制	研究先天性心脏缺陷与胎盘功能障碍的关系	先天性心脏缺陷（CHD）和胎盘发育	数字病理学	先天性心脏缺陷	单细胞测序	小鼠和大鼠模型	临床和分子数据	NA
449	2024-08-05	A Bayesian multivariate mixture model for high throughput spatial transcriptomics 2023-09, Biometrics IF:1.4Q2 DOI:10.1111/biom.13727 PMID:35895854	研究论文	本文开发了一种基于贝叶斯的多变量有限混合模型SPRUCE，以识别高通量空间转录组数据中的细胞亚群	提出了利用多变量偏态正态分布的贝叶斯空间多变量有限混合模型，并结合了Pólya-Gamma数据增强和空间随机效应	依赖于模拟研究来证明忽视偏斜性或空间相关性在HST数据中的推断效应	识别组织样本中细胞的亚群以支持生物研究	高通量空间转录组数据中的细胞亚群	数字病理学	乳腺癌	高通量空间转录组技术	多变量有限混合模型	基因表达数据	使用公开的人脑和乳腺癌HST数据集