单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2024-08-05 |
Early cortical oligodendrocyte precursor cells are transcriptionally distinct and lack synaptic connections
2023-09, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24388
PMID:37226895
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研究论文 | 研究早期皮层少突胶质前体细胞的转录特征及其缺乏突触连接的情况 | 首次明确表明早期胚胎少突胶质前体细胞在转录上与后天细胞显著不同且缺乏突触输入 | 未能直接展示突触信号对少突胶质前体细胞发展的影响 | 探究早期少突胶质前体细胞在胚胎大脑中的功能和分子特征 | 小鼠胚胎阶段的少突胶质前体细胞 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎阶段的少突胶质前体细胞 |
| 422 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals heterogeneity of the patterns of responsive genes and cell communications in liver cell populations of zebrafish exposed to polystyrene nanoplastics
2023-Sep-01, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2023.164082
PMID:37207780
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了聚苯乙烯纳米塑料暴露后斑马鱼肝脏细胞群体中的异质性响应模式和细胞通讯模式 | 本研究首次阐明了纳米塑料暴露对斑马鱼肝脏细胞群体的异质性响应模式，并通过单细胞转录组学分析揭示了细胞间的特殊相互作用 | NA | 探索纳米塑料对斑马鱼肝脏细胞的细胞毒性及其异质性响应模式 | 斑马鱼肝脏细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 九种细胞类型 |
| 423 | 2024-08-08 |
Integrated mass spectrometry imaging and single-cell transcriptome atlas strategies provide novel insights into taxoid biosynthesis and transport in Taxus mairei stems
2023-09, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16315
PMID:37219365
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研究论文 | 本研究结合质谱成像和单细胞转录组图谱技术，探索了红豆杉茎中紫杉醇生物合成及运输的精确分布和转录调控 | 开发了一种单细胞策略来筛选紫杉醇生物合成调控的新转录因子，并提出了潜在的紫杉醇转运蛋白候选基因 | NA | 揭示紫杉醇在红豆杉茎中的分布及其生物合成途径的细胞特异性转录调控机制 | 红豆杉茎中的紫杉醇生物合成及运输 | NA | NA | MALDI-IMS分析, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 转录组 | 涉及红豆杉茎的多个细胞类型 |
| 424 | 2024-08-05 |
Role of Gltp in Maturation of Oligodendrocytes Under the Regulation of Nkx2.2
2023-Sep, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03383-y
PMID:37191854
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研究论文 | 本研究探讨了GLTP在髓鞘形成的成熟寡突胶质细胞中的作用 | 识别了Gltp作为髓鞘形成寡突胶质细胞中的关键脂质代谢基因并揭示了其在分化过程中的重要性 | 尚未明确GLTP在髓鞘发育和维持中的具体机制 | 研究Gltp在寡突胶质细胞分化和成熟中的功能 | 寡突胶质细胞及其相关基因表达 | 数字病理学 | NA | 综合组学分析，转录组分析，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 独立的转录组和单细胞测序研究 |
| 425 | 2024-08-08 |
Angiopoietin-like 4 Is a Critical Regulator of Fibroblasts during Pulmonary Fibrosis Development
2023-Sep, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0304OC
PMID:37192434
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研究论文 | 研究探讨了Angiopoietin-like 4（ANGPTL4）在特发性肺纤维化（IPF）发展中对成纤维细胞的关键调控作用 | 首次发现ANGPTL4在肺纤维化区域的成纤维细胞中高度表达，并且能够调控纤维化相关基因表达、细胞迁移和增殖 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者的肺成纤维细胞，可能需要更多临床数据支持 | 揭示ANGPTL4在肺纤维化发展中的作用机制，探索其作为IPF早期诊断标志物和治疗靶点的可能性 | 特发性肺纤维化患者的肺成纤维细胞和小鼠肺纤维化模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | DNA微阵列分析 | NA | 基因表达数据 | 包括来自IPF患者肺纤维化和非纤维化区域的成纤维细胞，以及接受bleomycin处理的小鼠模型 |
| 426 | 2024-08-08 |
Monocyte heterogeneity in cardiovascular disease
2023-09-05, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad069
PMID:37161473
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研究论文 | 本文综述了单核细胞在心血管疾病中的异质性及其在稳态和疾病中的功能差异 | 提出了超越当前三分法子集划分的单核细胞异质性新范式，并主张更新命名法和功能研究以证实基于标记的子集划分 | 缺乏明确的因果关系证据以及对心血管疾病的预测价值 | 探讨单核细胞异质性在心血管疾病中的作用及其潜在的子集特异性影响 | 单核细胞及其在心血管疾病中的异质性和功能 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 427 | 2024-08-05 |
M2 macrophage marker CHI3L2 could serve as a potential prognostic and immunological biomarker in glioma by integrated single-cell and bulk RNA-Seq analysis
2023-09, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3523
PMID:37147894
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研究论文 | CHI3L2在胶质瘤中具有预后和免疫标志物的潜在价值 | 综合了散装RNA测序、蛋白组学和单细胞RNA测序以确定CHI3L2在胶质瘤中的作用 | 该研究主要依赖于在线数据库的分析，可能存在数据库数据的局限性 | 探讨CHI3L2在胶质瘤中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 研究对象为胶质瘤患者的CHI3L2表达 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, IHC | Cox回归模型 | 基因数据 | 涉及多组胶质瘤的样本数据来自多个数据库 |
| 428 | 2024-08-08 |
Microbiota-mediated shaping of mouse spleen structure and immune function characterized by scRNA-seq and Stereo-seq
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.012
PMID:37156441
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和Stereo-seq技术研究了无菌（GF）小鼠中微生物群对脾脏结构和免疫功能的影响 | 首次揭示了微生物群缺失对脾脏红髓区域红细胞生成和白髓区域先天免疫缺陷的影响，并展示了脾脏免疫细胞的空间分布层次 | NA | 探索微生物群在调节和塑造脾脏结构和免疫功能中的作用 | 小鼠脾脏的结构、细胞类型、功能和空间分子特征 | 免疫学 | NA | scRNA-seq, Stereo-seq | NA | 细胞和分子数据 | 无菌小鼠 |
| 429 | 2024-08-05 |
VT3D: a visualization toolbox for 3D transcriptomic data
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.001
PMID:37054878
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研究论文 | 本文介绍了VT3D，一个用于3D转录组数据可视化的工具箱 | VT3D允许用户探索3D转录组数据，并支持基因表达映射到任意感兴趣的2D平面 | 目前缺乏广泛可用的数据可视化工具，限制了该技术的潜在影响和应用 | 研究目的是开发一个可视化工具，以促进3D转录组数据的探索和理解 | 研究对象包括多种基于测序和成像的技术生成的数据集 | 数字病理学 | NA | 转录组测序 | NA | 3D转录组数据 | 多个数据集，包括Stereo-seq, 空间转录组学和Slide-seq等技术生成的数据 |
| 430 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies a highly replicating Cd168+ skeletal stem/progenitor cell population in mouse long bones
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.04.004
PMID:37075860
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析了小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）的异质性，并发现了一种具有高度复制能力的Cd168+ SSPC群体 | 本研究首次鉴定出一种新的Cd168 SSPC群体，具有高度复制能力和成骨软骨生成潜力，并能在骨折愈合过程中贡献于新形成的骨骼组织 | NA | 阐明小鼠长骨中SSPC群体的异质性及其各自的再生能力 | 小鼠长骨中的骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠后肢芽、新生长骨和骨折长骨的单细胞RNA测序数据 |
| 431 | 2024-08-08 |
Targeting PPAR-gamma counteracts tumour adaptation to immune-checkpoint blockade in hepatocellular carcinoma
2023-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328364
PMID:37019619
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research paper | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者对免疫检查点抑制剂治疗产生耐药性的机制，并发现PPARγ/VEGF-A介导的肿瘤微环境免疫抑制是关键因素 | 首次揭示了PPARγ通过上调VEGF-A促进骨髓源性抑制细胞（MDSC）扩张和CD8+ T细胞功能障碍，从而导致肿瘤对免疫检查点抑制剂产生耐药性 | NA | 研究肝细胞癌对免疫检查点抑制剂治疗的耐药机制 | 肝细胞癌模型及患者肿瘤样本 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据和免疫数据 | 两个免疫治疗耐药的HCC模型，15名对pembrolizumab耐药的HCC患者 |
| 432 | 2024-08-08 |
Discovery of cellular and genetic signatures of immune tolerance in kidney transplant recipients through single cell RNA sequencing analysis
2023-09, HLA
IF:5.9Q1
DOI:10.1111/tan.15061
PMID:37038287
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了肾移植受者中移植操作耐受性的细胞和遗传特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术，分析了肾移植受者外周血单个核细胞中的细胞分布和基因表达差异，揭示了移植操作耐受性的独特细胞和遗传特征 | 样本量较小，仅包括12名肾移植受者，可能影响结果的普遍性 | 揭示肾移植受者中移植操作耐受性的细胞和遗传特征 | 肾移植受者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12名肾移植受者，包括4名移植操作耐受性受者，4名稳定移植物功能受者，4名活检证实的移植物排斥受者 |
| 433 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomics: a comprehensive review of their technological advances, applications, and challenges
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.03.011
PMID:36990426
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综述 | 本文综述了空间分辨转录组学技术的进展、应用和挑战 | 介绍了空间分辨转录组学(SRT)技术在探索生命分子基础的空间组织方面的创新 | 本文未详细讨论SRT技术的具体实施困难和限制 | 探讨空间分辨转录组学技术的最新进展和挑战 | 聚焦于空间分辨转录组学技术及其在生物医学中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间分辨转录组学(SRT) | NA | NA | NA |
| 434 | 2024-08-08 |
FishSCT: a zebrafish-centric database for exploration and visualization of fish single-cell transcriptome
2023-09, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-022-2293-4
PMID:36971993
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 435 | 2024-08-05 |
GoM DE: interpreting structure in sequence count data with differential expression analysis allowing for grades of membership
2023-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.03.531029
PMID:36945441
|
研究论文 | 本文扩展了差异表达分析方法，以允许细胞部分归属于多个组，称为会员等级差异表达（GoM DE） | 该研究通过GoM DE方法改进了单细胞测序数据集中结构的解释能力，尤其是在处理部分归属的细胞时 | 本文未明确讨论方法在其他类型测序数据集上的适用性 | 研究旨在提高对单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集中各主题的注释能力 | 主要研究单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据集 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq | NA | 序列计数数据 | NA |
| 436 | 2024-08-05 |
Impact of dual-baculovirus infection on the Sf9 insect cell transcriptome during rAAV production using single-cell RNA-seq
2023-09, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28377
PMID:36919374
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研究论文 | 本研究分析了双昆虫病毒感染对Sf9昆虫细胞在rAAV生产期间的转录组的影响 | 首次应用单细胞RNA测序(scRNA-seq)于IC-BEVS，揭示了细胞群体中个体细胞的显著变异 | 在感染24小时后，仅29.4%的细胞包含生产rAAV2颗粒所需的所有三个转基因，说明双昆虫病毒系统的局限性 | 研究昆虫细胞在rAAV生产中的转录组变化及其对产品品质的影响 | Sf9昆虫细胞及其在生产rAAV2过程中的表现 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 437 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional regulatory networks directing the development of mouse maxillary prominence
2023-09, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2023.02.008
PMID:36841529
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了小鼠上颌突发育过程中的转录调控网络 | 研究中识别了与间充质命运转变相关的一系列关键转录因子，并推导了由这些转录因子指导的基因调控网络 | 尽管揭示了转录调控网络，但具体的机制尚未完全阐明 | 研究小鼠上颌发育过程中转录动态及其调控机制 | 探索小鼠上颌突中神经嵴来源的间充质的发育及其转录网络 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约28,000个细胞 |
| 438 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics implicates the FEZ1-DKK1 axis in the regulation of corneal epithelial cell proliferation and senescence
2023-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13433
PMID:36851859
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研究论文 | 本研究揭示了FEZ1-DKK1轴在角膜上皮细胞增殖和衰老调控中的作用 | 首次通过单细胞转录组学揭示了FEZ1和DKK1作为角膜干/祖细胞增殖和衰老的重要调节因子 | 未深入探讨其他可能参与角膜上皮细胞调控的因子 | 研究角膜干/祖细胞增殖和衰老的调控机制 | 多次传代的角膜干/祖细胞及其相关轴 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | NA | 多次传代的初级角膜干/祖细胞 |
| 439 | 2024-08-05 |
Transcriptional and open chromatin analysis of bovine skeletal muscle development by single-cell sequencing
2023-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13430
PMID:36855961
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序分析了牛骨骼肌发育的转录和开放染色质特征 | 采用scRNA-seq和scATAC-seq揭示了牛骨骼肌不同细胞类型和转录调控的动态特征 | 未提及具体限制 | 理解牛骨骼肌发育过程中的细胞异质性和转录及表观遗传调控 | 发育阶段的牛骨骼肌细胞类型及其分子特征 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq和scATAC-seq | NA | 基因表达数据 | 在三个发育阶段识别的多种细胞类型，包括脂肪细胞、内皮细胞等 |
| 440 | 2024-08-05 |
Single-cell profiling reveals various types of interstitial cells in the bladder
2023-Sep, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13431
PMID:36824020
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研究论文 | 本研究揭示了膀胱中不同类型的间质细胞及其功能和位置 | 识别了膀胱组织中两种重要的间质细胞类型，并强调了其在正常生理、药物诱导损伤及衰老中的作用 | 该研究可能未探讨所有间质细胞的种类及其相互作用 | 探讨膀胱间质细胞的定位、分子标志物、功能与角色 | 人类、老鼠和大鼠膀胱组织的单细胞数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 人类、老鼠和大鼠的膀胱组织样本 |