单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-05 |
Mesenchymal-like Tumor Cells and Myofibroblastic Cancer-Associated Fibroblasts Are Associated with Progression and Immunotherapy Response of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-09-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3034
PMID:37335139
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研究论文 | 本文探讨了间充质样肿瘤细胞与肌成纤维癌症相关成纤维细胞在透明细胞肾细胞癌进展及免疫疗法反应中的关系 | 介绍了透明细胞肾细胞癌细胞的上皮-间充质可塑性及与肌成纤维癌症相关成纤维细胞之间的新关系 | 未能明确所有患者在免疫检查点抑制剂治疗中的反应机制 | 探讨透明细胞肾细胞癌细胞与微环境的相互作用，以更好地预测治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌及其微环境中的细胞群体 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 在不同疾病阶段的ccRCC和正常邻近组织（NAT）中识别了46个细胞群体 |
| 402 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptomic analysis of Graves' disease thyroid glands reveals the broad immunoregulatory potential of thyroid follicular and stromal cells and implies a major re-interpretation of the role of aberrant HLA class II expression in autoimmunity
2023-09, Journal of autoimmunity
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.jaut.2023.103072
PMID:37336012
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了格雷夫斯病甲状腺组织中甲状腺滤泡细胞和间质细胞的免疫调节潜力及其在自身免疫反应中的作用 | 首次对甲状腺滤泡细胞和甲状腺间质细胞进行单细胞转录组分析，揭示了这些细胞在自身免疫反应中的激活和抑制分子/通路，并重新解释了MHC过度表达在自身免疫中的保护作用 | 研究仅限于体外培养的细胞和有限的样本数量 | 深入研究甲状腺自身免疫反应中甲状腺组织细胞的内在特性及其对免疫耐受的影响 | 格雷夫斯病和对照组的甲状腺滤泡细胞及间质细胞 | 数字病理学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5个格雷夫斯病甲状腺组织和4个对照甲状腺组织 |
| 403 | 2024-08-07 |
CCRL2 Expression by Specialized Lung Capillary Endothelial Cells Controls NK-cell Homing in Lung Cancer
2023-09-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0951
PMID:37343073
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研究论文 | 本文研究了CCRL2/chemerin/CMKLR1轴在调控自然杀伤（NK）细胞向肺部迁移中的作用 | 首次揭示了CCRL2作为NK细胞向肺部迁移的关键分子，并发现其表达受表观遗传调控 | NA | 探讨CCRL2在NK细胞向肺部迁移及肺肿瘤生长中的作用 | CCRL2、chemerin、CMKLR1轴及NK细胞 | 数字病理学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 404 | 2024-08-07 |
Integrated immunological analysis of single-cell and bulky tissue transcriptomes reveals the role of interactions between M0 macrophages and naïve CD4+ T cells in the immunosuppressive microenvironment of cervical cancer
2023-09, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107151
PMID:37348264
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研究论文 | 本研究通过综合分析宫颈癌的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞之间的相互作用在宫颈癌免疫抑制微环境中的作用 | 研究发现了M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞之间的信号传导及细胞内转录因子活性在肿瘤状态下的显著改变，并通过LASSO回归模型分析了重叠基因 | 相关分子机制需要通过实验和队列研究进一步验证 | 探究宫颈癌免疫抑制微环境中免疫细胞间的相互作用及其对临床预后的影响 | 宫颈癌中的M0巨噬细胞和幼稚CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA测序 | LASSO回归模型 | RNA测序数据 | NA |
| 405 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing profiles reveal cell type-specific transcriptional regulation networks conditioning fungal invasion in maize roots
2023-09, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14097
PMID:37349934
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了玉米根尖细胞在真菌侵染下的转录组变化，揭示了细胞类型特异性的转录调控网络。 | 首次在单细胞水平上揭示了玉米根尖细胞对真菌侵染的细胞类型特异性免疫调控网络。 | 研究仅限于两个玉米近交系，可能需要进一步扩大样本多样性以验证结果的普遍性。 | 探究玉米根尖细胞对真菌侵染的防御机制及其转录调控网络。 | 玉米根尖细胞在真菌侵染下的转录组变化及其免疫调控网络。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 转录组数据 | 29,217个单细胞 |
| 406 | 2024-08-05 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on NK cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04965-y
PMID:37296316
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研究论文 | 这篇文章关于肝细胞癌中基于NK细胞标记基因的预后模型。 | 提出了一个基于NK细胞标记基因的新特征，能够有效预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗响应。 | 模型在不同数据集上的验证结果可能受到样本异质性的影响。 | 旨在通过单细胞测序数据分析NK细胞标记基因的预后价值。 | 研究对象是肝细胞癌患者的NK细胞标记基因。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq | Cox回归模型 | 转录组数据 | 使用了TCGA、GEO和ICGC的数据进行模型构建和验证 |
| 407 | 2024-08-05 |
A pairwise immune gene model for predicting overall survival and stratifying subtypes of colon adenocarcinoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04957-y
PMID:37316691
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研究论文 | 本文开发了一种与免疫基因相关的模型来评估结肠腺癌患者的预后状态 | 提出了一个新的免疫基因对模型，用于预测结肠腺癌的总体生存率和风险分层 | 模型的验证仅依赖于TCGA和GEO数据库中的数据，可能存在样本选择偏差 | 研究结肠腺癌患者的预后和免疫环境之间的关系 | 结肠腺癌患者的基因表达谱和生存随访信息 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠腺癌患者数据集 |
| 408 | 2024-08-07 |
Identification and validation of an ECM organization-related gene signature as a prognostic biomarker and therapeutic target for glioma patients
2023-09, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01413-6
PMID:37301776
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA和GEO数据库中的glioma患者RNA测序数据，识别并验证了与ECM组织相关的九基因标志物，作为glioma的预后生物标志物和治疗靶点 | 首次验证了ECM组织相关基因标志物在glioma中的预后价值，并揭示了TIMP1作为潜在治疗靶点的机制 | NA | 评估ECM组织相关基因在glioma患者中的预后价值并识别潜在治疗靶点 | glioma患者及其ECM组织相关基因 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的glioma患者数据，以及中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据集 |
| 409 | 2024-08-07 |
Induction of IL-32 in the immune response of keratinocytes to Mycobacterium marinum infection
2023-09, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14848
PMID:37309674
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了角质形成细胞在感染海分枝杆菌后的免疫反应，发现IL-32的诱导可能是角质形成细胞防御海分枝杆菌感染的一种机制 | 首次揭示了角质形成细胞在海分枝杆菌感染后IL-32的诱导机制 | 仅限于体外和皮肤活检样本的研究，需要进一步的体内研究验证 | 探讨角质形成细胞在海分枝杆菌感染后的免疫防御机制 | 角质形成细胞和海分枝杆菌感染 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bRNA-seq），定量PCR和Western blot | NA | RNA | 来自海分枝杆菌感染患者的皮肤活检样本和体外培养的感染海分枝杆菌的角质形成细胞 |
| 410 | 2024-08-07 |
Secondary bile acids function through the vitamin D receptor in myeloid progenitors to promote myelopoiesis
2023-09-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009618
PMID:37276450
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研究论文 | 本文研究了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓中的髓系前体细胞促进髓系生成的作用 | 首次揭示了次级胆酸通过维生素D受体在骨髓髓系前体细胞中的作用，以及这种作用对骨髓造血和炎症疾病潜在影响的新机制 | NA | 探讨微生物代谢产物对造血作用的影响，特别是胆酸的作用及其机制 | 次级胆酸（脱氧胆酸和石胆酸）及其在骨髓髓系生成中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 骨髓细胞和造血干细胞及前体细胞 |
| 411 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomics provides insights into the origin and immune microenvironment of cervical precancerous lesions
2023-09, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12451
PMID:37272256
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-07 |
Targeting the NLRP3 inflammasome reduces inflammation in hidradenitis suppurativa skin
2023-09-15, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljad184
PMID:37243544
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析了藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞表达，发现NLRP3炎症小体在藏毛囊肿皮肤中的表达增强，并提出使用小分子抑制剂靶向NLRP3炎症小体作为新的治疗策略。 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术详细分析了藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞表达，并证实了NLRP3炎症小体在疾病中的关键作用。 | NA | 为了更好地理解藏毛囊肿的发病机制，设计新的治疗策略。 | 藏毛囊肿皮肤中的免疫细胞及其基因表达。 | 数字病理学 | 藏毛囊肿 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 藏毛囊肿皮肤样本与健康皮肤样本 |
| 413 | 2024-08-05 |
Mass spectrometry imaging and single-cell transcriptional profiling reveal the tissue-specific regulation of bioactive ingredient biosynthesis in Taxus leaves
2023-09-11, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2023.100630
PMID:37231648
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研究论文 | 该文章揭示了加拿大红松叶中生物活性成分合成的组织特异性调控 | 本研究首次创建了加税叶代谢单细胞图谱，并识别了多个新的细胞特异性转录因子 | 尚未深入探讨的转录调控机制和生物活性成分的全部合成途径 | 研究加拿大红松叶的生物活性成分的分布及其转录调控机制 | 研究对象为Taxus mairei叶片中的细胞及其次级代谢成分 | 数字病理学 | 癌症 | 矩阵辅助激光解吸/电离质谱成像和单细胞测序 | NA | 细胞基因表达数据 | 8846个细胞 |
| 414 | 2024-08-05 |
AHR, a novel inhibitory immune checkpoint receptor, is a potential therapeutic target for chemoresistant glioblastoma
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04894-w
PMID:37233762
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研究论文 | 本研究旨在阐明MGMT启动子低甲基化胶质母细胞瘤患者对替莫唑胺耐药的机制 | 识别AHR作为潜在的新型抑制免疫检查点受体，作为替莫唑胺耐药胶质母细胞瘤的治疗靶点 | 本研究为回顾性研究，可能存在偏倚和数据解释的局限性 | 识别适用于替莫唑胺耐药胶质母细胞瘤患者的治疗靶点和药物 | 457名胶质母细胞瘤患者的转录组测序数据和多组学数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 457名胶质母细胞瘤患者 |
| 415 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-Seq and bulk RNA-Seq reveal reliable diagnostic and prognostic biomarkers for CRC
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04882-0
PMID:37247080
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和整体RNA测序数据，以选择结肠直肠癌（CRC）的诊断和预后生物标志物 | 首次将单细胞RNA测序与整体RNA测序相结合，识别出结肠直肠癌的特异性基因和生物标志物 | 本研究可能缺乏后续临床验证，且样本量需要进一步扩大 | 为结肠直肠癌的发展提供可靠的诊断和预后生物标志物 | 结肠直肠癌相关的上皮特异性基因 | 数字病理学 | 结肠直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和整体RNA测序 | LASSO-Cox回归和两步法回归 | 基因表达数据 | 使用了1063个共享差异表达基因（DEGs） |
| 416 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell RNA-seq analysis revealed podocyte injury through activation of the BMP7/AMPK/mTOR mediated autophagy pathway
2023-Sep-01, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2023.110559
PMID:37247809
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研究论文 | 本研究揭示了BMP7通过激活AMPK/mTOR介导的自噬通路引起的足细胞损伤 | 首次证明了BMP7参与ADR诱导的足细胞损伤并阐明了其潜在机制 | 尚未进行临床试验以验证实验结果 | 探索由足细胞损伤引起的肾病综合征的病理机制 | 主要以足细胞为研究对象，探讨其在肾病综合征中的作用 | 数字病理 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)以及生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 在体外建立的ADR诱导足细胞损伤模型 |
| 417 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the embryogenic callus clarifies the spatiotemporal developmental trajectories of the early somatic embryo in Dimocarpus longan
2023-09, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16319
PMID:37235696
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研究论文 | 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序分析，揭示了龙眼胚性愈伤组织中细胞的时空发育轨迹及其在体细胞胚胎发生过程中的细胞分化路径 | 首次在单细胞水平上解析了龙眼体细胞胚胎发生的分子机制，并揭示了关键转录调控因子在细胞命运决定中的作用 | NA | 探究龙眼体细胞胚胎发生的分子机制及其细胞分化路径 | 龙眼胚性愈伤组织的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 龙眼胚性愈伤组织中的高度异质性细胞被分为12个假定集群 |
| 418 | 2024-08-07 |
Differential regulation of IL-17A and IL-17F via STAT5 contributes to psoriatic disease
2023-09, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2023.03.035
PMID:37244461
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研究论文 | 本文研究了IL-17A和IL-17F在银屑病中的调控机制及其在疾病中的作用 | 开发了一种新的细胞因子捕获技术，结合染色质免疫沉淀测序和RNA测序，以更好地理解IL-17A和IL-17F的表达调控 | NA | 阐明IL-17A和IL-17F在银屑病中的调控机制 | IL-17A和IL-17F在银屑病中的表达及其对炎症细胞群体的影响 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序，染色质免疫沉淀测序，RNA测序 | NA | 组织样本，细胞 | 来自患者的病变皮肤组织样本 |
| 419 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequencing identifies a signature based on T-cell marker genes to predict prognosis and immunotherapy response in bladder cancer
2023-Sep, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-023-04881-1
PMID:37244876
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别出基于T细胞标记基因的签名，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 本研究首次在膀胱癌中利用T细胞标记基因构建了一个新的预后签名，并验证了其在不同队列中的有效性 | NA | 开发一个基于T细胞标记基因的预后签名，用于预测膀胱癌患者的预后和免疫治疗反应 | 膀胱癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 训练队列、测试队列和GEO队列分别包含不同数量的样本 |
| 420 | 2024-08-07 |
scLiverDB: a Database of Human and Mouse Liver Transcriptome Landscapes at Single-Cell Resolution
2023-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202201421
PMID:37259264
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research paper | 本文介绍了scLiverDB数据库，该数据库用于解析人和小鼠肝脏在单细胞分辨率下的转录组景观，涵盖多种肝脏疾病、细胞类型和发展阶段。 | scLiverDB是首个专门针对人和小鼠肝脏转录组的数据库，提供了单细胞分辨率下的细胞类型、细胞异质性和基因表达的详细信息。 | NA | 开发一个专门的数据库，用于解析人和小鼠肝脏在不同疾病和发展阶段的单细胞转录组景观。 | 人和小鼠的肝脏细胞及其在不同疾病和发展阶段的转录组信息。 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | transcriptome | 62个数据集，包含9,050个样本和1,741,734个细胞 |