单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing captures patient-level heterogeneity and associated molecular phenotypes in breast cancer pleural effusions
2023-09, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1356
PMID:37691350
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了乳腺癌恶性胸腔积液中的细胞异质性和相关分子表型 | 首次在单细胞分辨率下无偏见地评估了与乳腺癌相关的恶性胸腔积液，为研究提供了宝贵的资源 | NA | 研究乳腺癌恶性胸腔积液中的细胞异质性和相关分子表型 | 乳腺癌恶性胸腔积液中的细胞类型、基因表达和拷贝数变异模式 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个恶性胸腔积液样本，来自7名转移性乳腺癌患者，包含近65,000个细胞 |
| 282 | 2024-08-07 |
Mechanisms of Extraorbital Lacrimal Gland Aging in Mice: An Integrative Analysis of the Temporal Transcriptome
2023-09-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.12.18
PMID:37695604
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研究论文 | 本研究使用高通量RNA测序（RNA-Seq）和生物信息学分析，探讨了小鼠泪腺衰老过程中24小时周期内转录组的变化 | 首次全面分析了小鼠泪腺衰老过程中24小时周期内转录组的变化，并验证了这些变化在单细胞RNA测序水平上的细胞群和信号通路 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠，可能不适用于其他品种的小鼠 | 探讨小鼠泪腺衰老过程中转录组的变化及其潜在机制 | 小鼠的外泪腺（ELGs） | 生物信息学 | NA | RNA测序（RNA-Seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 12周龄和20月龄的C57BL/6J雄性小鼠各一组，每组在24小时内收集8个时间点的样本 |
| 283 | 2024-08-07 |
Therapeutic Effects of Upadacitinib on Experimental Autoimmune Uveitis: Insights From Single-Cell Analysis
2023-09-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.64.12.28
PMID:37713206
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研究论文 | 本研究旨在阐明JAK1特异性抑制剂upadacitinib对实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）的影响及其潜在机制 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞可及染色质测序（scATAC-seq）技术，首次深入分析了upadacitinib对EAU中JAK/STAT通路的影响，并揭示了其对免疫细胞基因表达和细胞间通讯的调控作用 | 研究样本仅限于12名Vogt-Koyanagi-Harada（VKH）疾病患者和EAU的颈淋巴结细胞，样本量较小可能影响结果的普遍性 | 探讨upadacitinib对EAU的治疗效果及其作用机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎（EAU）和Vogt-Koyanagi-Harada（VKH）疾病患者的外周血单个核细胞（PBMCs）及颈淋巴结细胞（CDLN） | NA | 眼科疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、单细胞可及染色质测序（scATAC-seq）、流式细胞术、蛋白质印迹法 | NA | 单细胞数据 | 12名Vogt-Koyanagi-Harada（VKH）疾病患者和EAU的颈淋巴结细胞 |
| 284 | 2024-08-07 |
Dual-scRNA-seq analysis reveals rare and uncommon parasitized cell populations in chronic L. donovani infection
2023-Sep-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.113097
PMID:37682713
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研究论文 | 本研究利用无偏倚的单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）同时分析宿主细胞和利什曼原虫转录组，以识别和注释在慢性感染小鼠的脾脏和骨髓中的寄生细胞群体 | 本研究采用的双重scRNA-seq方法能够检测到异质性的寄生细胞群体，并首次发现了一些非预期的寄生细胞类型，如巨核细胞、嗜碱性粒细胞和自然杀伤细胞 | NA | 旨在揭示慢性利什曼原虫感染中罕见的和不常见的寄生细胞群体 | 慢性感染利什曼原虫的小鼠的脾脏和骨髓中的寄生细胞 | 数字病理学 | 利什曼病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 慢性感染利什曼原虫的小鼠的脾脏和骨髓样本 |
| 285 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics identifies new blood cell populations in Drosophila released at the onset of metamorphosis
2023-09-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201767
PMID:37681301
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学识别出果蝇在蛹期的新型血细胞群体 | 首次对蛹期果蝇血细胞进行分子描述，并揭示其功能多样化和可塑性 | 未深入探讨果蝇血细胞在其他生物体内的相似性 | 研究果蝇在蛹期血细胞的多样性和功能可塑性 | 果蝇的血细胞，特别是蛹期的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，高分辨率显微镜 | NA | 分子数据 | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
Human iPS cell-derived sensory neurons can be infected by SARS-CoV-2
2023-Sep-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107690
PMID:37680484
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研究论文 | 研究使用诱导多能干细胞衍生的感觉神经元感染SARS-CoV-2及其变种，通过单细胞RNA测序分析感染情况 | 首次证明人类感觉神经元可以被SARS-CoV-2及其变种感染，但不能产生传染性病毒 | 研究仅限于特定SARS-CoV-2株及其变种，未涵盖所有可能的病毒株 | 探究SARS-CoV-2对周围神经系统的影响 | 诱导多能干细胞衍生的感觉神经元 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 特定SARS-CoV-2株WA1/2020及其变种delta和omicron |
| 287 | 2024-08-07 |
The regulatory role of cancer stem cell marker gene CXCR4 in the growth and metastasis of gastric cancer
2023-Sep-07, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00436-2
PMID:37679408
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）揭示了癌症干细胞标记基因CXCR4在胃癌生长和转移中的分子机制 | 首次通过scRNA-seq和bulk RNA-seq结合的方法，详细研究了CXCR4在胃癌中的作用及其对恶性表型、肿瘤发生和肝转移的影响 | 研究主要集中在体外和体内功能实验，可能需要更多的临床样本验证 | 揭示CXCR4作为癌症干细胞标记基因在胃癌生长和转移中的分子机制 | 胃癌组织样本中的CXCR4基因及其对恶性表型、肿瘤发生和肝转移的影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA序列 | 大量胃癌组织样本，以及裸鼠模型 |
| 288 | 2024-08-07 |
Large-scale production of human blastoids amenable to modeling blastocyst development and maternal-fetal cross talk
2023-09-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.08.002
PMID:37683605
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研究论文 | 本文报道了一种优化的人类囊胚样体生成协议，用于高效生产大量高保真的人类囊胚样体，并探讨了其在早期人类发育和植入模型中的应用 | 提出了一个优化的人类囊胚样体生成协议，提高了生成效率，并进行了蛋白质组学分析和单细胞RNA测序，揭示了囊胚样体与母体-胎儿交流中的新发现 | NA | 研究人类囊胚样体在早期人类发育和植入模型中的应用 | 人类囊胚样体及其在母体-胎儿交流中的作用 | NA | NA | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组学数据，RNA测序数据 | 大量高保真的人类囊胚样体 |
| 289 | 2024-08-05 |
HMGCS2 serves as a potential biomarker for inhibition of renal clear cell carcinoma growth
2023-09-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41343-7
PMID:37670031
|
研究论文 | HMGCS2在透明细胞肾细胞癌中的表达及其作为潜在生物标志物的作用 | 首次提出HMGCS2作为清晰细胞肾细胞癌的预后标志物 | 研究主要依赖多数据集分析，缺乏临床试验验证 | 探讨HMGCS2在肾透明细胞癌中的作用及其作为生物标志物的潜力 | 主要关注肾透明细胞癌及其与HMGCS2的关系 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 多癌种数据库中的肿瘤组织与正常组织对照 |
| 290 | 2024-08-07 |
Single cell multiomic analysis reveals diabetes-associated β-cell heterogeneity driven by HNF1A
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41228-3
PMID:37669939
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组、单核染色质可及性和细胞类型特异性3D基因组图谱，揭示了与2型糖尿病相关的β细胞异质性，并发现HNF1A是其主要驱动因素 | 开发了一种计算方法来解析单个β细胞之间的供体内和供体间异质性，并揭示了HNF1A在β细胞异质性中的作用 | NA | 研究2型糖尿病相关的β细胞异质性及其机制 | 人类胰岛中的β细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞转录组、单核染色质可及性分析 | NA | 转录组、染色质可及性数据 | 来自多个供体的人类胰岛样本 |
| 291 | 2024-08-07 |
Neutrophil metalloproteinase driven spleen damage hampers infection control of trypanosomiasis
2023-09-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-41089-w
PMID:37669943
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研究论文 | 本文研究了中性粒细胞金属蛋白酶在布氏锥虫感染中对脾脏损伤的影响及其对睡眠病感染控制的影响。 | 首次揭示了布氏锥虫感染导致脾脏中四种中性粒细胞亚群的扩张和分化，并发现这些中性粒细胞通过金属蛋白酶导致脾脏结构重塑。 | NA | 探讨中性粒细胞在布氏锥虫感染中的作用及其对脾脏结构和功能的影响。 | 布氏锥虫感染引起的中性粒细胞亚群及其对脾脏的影响。 | 免疫学 | 睡眠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 292 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes reveal a molecular link between diabetic kidney and retinal lesions
2023-09-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05300-4
PMID:37670124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变之间的细胞和分子关联。 | 发现了肾小球膜细胞和视网膜周细胞在糖尿病状态下具有相似的分子特征和转变，并揭示了这两种细胞类型共享的趋化因子调控对糖尿病肾病和视网膜病变并发的重要性。 | NA | 揭示糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变之间的细胞和分子关联，以改善这两种疾病的预防和治疗。 | 糖尿病肾病和糖尿病视网膜病变的细胞和分子关联。 | 数字病理学 | 糖尿病并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 293 | 2024-08-07 |
Self-formation of concentric zones of telencephalic and ocular tissues and directional retinal ganglion cell axons
2023-09-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.87306
PMID:37665325
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研究论文 | 本文报道了人脑前脑-眼器官的自形成现象，包括前脑、视神经、视盘和神经视网膜组织沿中心-周边轴的同心区形成，并探讨了视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制。 | 首次报道了人脑前脑-眼器官的自形成现象，并通过单细胞RNA测序确认了前脑和眼组织的身份，识别了早期视盘、视神经和视网膜神经节细胞的表达特征。 | NA | 探讨人脑前脑和眼组织在早期发育中的协调指定机制，以及视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制。 | 人脑前脑-眼器官的自形成现象，视网膜神经节细胞轴突的定向生长。 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞表面标记物CNTN2 | NA |
| 294 | 2024-08-07 |
Abnormal accumulation of extracellular vesicles in hippocampal dystrophic axons and regulation by the primary cilia in Alzheimer's disease
2023-09-04, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01637-3
PMID:37667395
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病中异常轴突和树突的形成机制及其与细胞外囊泡和初级纤毛的关系 | 首次揭示了初级纤毛在阿尔茨海默病中通过调节细胞外囊泡的积累影响异常轴突和树突的形成 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 旨在阐明阿尔茨海默病中异常轴突和树突的形成机制及其与细胞外囊泡和初级纤毛的关系 | 阿尔茨海默病中的异常轴突和树突 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 三维渲染技术、腺相关病毒（AAV）1、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 小鼠模型中的海马神经元 |
| 295 | 2024-08-05 |
ePlatypus: an ecosystem for computational analysis of immunogenomics data
2023-09-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad553
PMID:37682115
|
研究论文 | 本文介绍了ePlatypus，一个用于免疫基因组数据分析的计算生态系统 | ePlatypus是一个开源的基于网络的平台，整合了多种数据模式，并提供编程教程和整合数据库 | NA | 旨在促进计算免疫学和免疫基因组学领域的研究 | 主要关注适应性免疫库和单细胞测序数据 | 计算免疫学 | NA | 单细胞测序，机器学习 | NA | 免疫基因组数据 | NA |
| 296 | 2024-08-05 |
TimeTalk uses single-cell RNA-seq datasets to decipher cell-cell communication during early embryo development
2023-09-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05283-2
PMID:37660148
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研究论文 | 本文开发了一个名为TimeTalk的计算框架，用于解密早期胚胎发育中细胞间通讯的秘密 | 提出了一个新的计算框架，从公共小鼠单细胞RNA-seq数据集中整合而来，以揭示与早期胚胎发育相关的配体-受体对 | 对eLRs的影响范围和作用尚不清晰，且需要更多的实验验证 | 研究早期胚胎发育过程中细胞间信号传递的机制 | 利用整合的时间序列小鼠单细胞RNA-seq数据集，识别并分析与早期胚胎发育相关的配体-受体对 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 数据集 | 使用了公共的小鼠单细胞RNA-seq数据集 |
| 297 | 2024-08-07 |
Deciphering early human pancreas development at the single-cell level
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40893-8
PMID:37660175
|
research paper | 本文通过大规模单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序技术，研究了人类胚胎早期胰腺组织的分子异质性、发育轨迹和调控网络 | 揭示了人类背侧胰腺多能细胞与腹侧多能细胞不同的基因表达模式，并识别了胰胆祖细胞和具有不同分化潜能的内分泌祖细胞亚群 | NA | 理解胰腺发育，为胰腺疾病的治疗提供线索 | 人类胚胎早期胰腺组织的分子异质性和发育轨迹 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序、单细胞转座酶可及染色质测序 | NA | 基因表达数据 | 来自第一孕期胚胎的人类胚胎胰腺组织 |
| 298 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of human prepuce reveals dynamic changes in gene regulation and cellular communications
2023-Sep-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09615-8
PMID:37658288
|
研究论文 | 本研究系统性分析了人类包皮在单细胞分辨率下的细胞变异和分子变化 | 首次识别了15种包皮细胞亚型，并揭示了儿童和成人之间的细胞类型特异性基因调控网络的动态变化 | 未能提供成年人和儿童包皮细胞组成和异质性的全面基础数据 | 研究人类包皮的细胞和分子动态，深入了解其生物学和生理功能 | 人类儿童和成人的包皮细胞 | 数字病理学 | 生殖系统相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 90,770个合格细胞 |
| 299 | 2024-08-05 |
ShIVA: a user-friendly and interactive interface giving biologists control over their single-cell RNA-seq data
2023-09-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-40959-z
PMID:37658061
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研究论文 | 本文提出了ShIVA，一个用户友好且互动的界面，旨在使生物学家能够控制他们的单细胞RNA-seq数据 | ShIVA提供了一种直观和迭代的分析过程，专门为生物学家设计，结合了视频教程，增强了用户体验 | 该界面主要依赖于Seurat v4 R包，可能限制了其对其他分析工具的适用性 | 研究单细胞RNA-seq和CITE-seq数据的分析方法，以帮助生物学家 | 单细胞RNA-seq和CITE-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
| 300 | 2024-08-05 |
Inhibition of TCA cycle improves the anti-PD-1 immunotherapy efficacy in melanoma cells via ATF3-mediated PD-L1 expression and glycolysis
2023-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007146
PMID:37678921
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研究论文 | 本研究探讨了抑制TCA循环如何通过ATF3介导的PD-L1表达和糖酵解，提高黑色素瘤细胞对抗PD-1免疫治疗的疗效 | 研究揭示了TCA循环在免疫检查点抑制中的作用，并提供了一种新的抗PD-1免疫治疗组合策略 | 本研究主要集中在黑色素瘤细胞，结果可能不具有普遍适用性 | 旨在改善黑色素瘤患者抗PD-1免疫治疗的有效性 | 主要研究黑色素瘤细胞及其对免疫治疗的反应 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | NMR，RNA测序，qRT-PCR，西方印迹，氧气凝胶法 | NA | 代谢物，转录组 | 患者的血浆样本及B16F10肿瘤小鼠 |