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当前共找到 449 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2024-08-07 |
GOWDL: gene ontology-driven wide and deep learning model for cell typing of scRNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad332
PMID:37756593
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研究论文 | 本文介绍了一种基于基因本体驱动的宽深学习模型（GOWDL），用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | GOWDL模型结合了基因本体的功能注释和特定细胞类型的标记基因，实现了混合架构 | 在召回率方面，GOWDL达到了约92%，而最佳工具达到了97% | 开发一种自动分类方法，用于基于最新的深度学习技术对单细胞RNA测序数据进行细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 宽深学习模型 | 基因表达数据 | 涉及多种组织 | NA | NA | NA | NA |
| 222 | 2024-08-07 |
scRNA-seq Reveals the Mechanism of Fatty Acid Desaturase 2 Mutation to Repress Leaf Growth in Peanut (Arachis hypogaea L.)
2023-09-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182305
PMID:37759528
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了花生叶中脂肪酸去饱和酶2突变对叶片生长的影响及其分子机制 | 首次在单细胞水平上阐明了脂肪酸去饱和酶2突变抑制花生叶片生长的分子机制 | NA | 探究脂肪酸去饱和酶2突变对花生叶片生长的影响及其分子机制 | 花生叶中的脂肪酸去饱和酶2突变及其对叶片生长的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约24,988个单细胞，表达10,249个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 223 | 2024-08-07 |
Amyloid-Beta Peptides Trigger Premature Functional and Gene Expression Alterations in Human-Induced Neurons
2023-Sep-18, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11092564
PMID:37761004
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研究论文 | 研究探讨了Aβ肽在人诱导神经元中的早期效应及其对功能特性和基因表达谱的影响 | 首次展示了低浓度Aβ肽暴露导致人诱导神经元钙瞬变频率改变，并使用单细胞RNA测序揭示了Aβ肽对突触相关基因表达的调控 | NA | 探究Aβ肽在阿尔茨海默病中导致神经元功能障碍的分子机制 | 人诱导神经元 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种神经元和星形胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 224 | 2024-08-05 |
Investigating the Heterogeneity of Immune Cells in Triple-Negative Breast Cancer at the Single-Cell Level before and after Paclitaxel Chemotherapy
2023-Sep-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241814188
PMID:37762493
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研究论文 | 本研究探讨了在紫杉醇化疗前后三阴性乳腺癌中免疫细胞的异质性及其与治疗结果的关系 | 本研究首次通过单细胞测序分析免疫细胞在三阴性乳腺癌化疗过程中的多样性和其对治疗效果的影响 | 研究仅专注于紫杉醇治疗，可能无法全面反映所有类型化疗对免疫细胞的影响 | 探索免疫细胞的不同角色及其与治疗结果的关系 | 三阴性乳腺癌患者的肿瘤及血液中的免疫细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 225 | 2024-08-07 |
Investigation of Tumor Heterogeneity Using Integrated Single-Cell RNA Sequence Analysis to Focus on Genes Related to Breast Cancer-, EMT-, CSC-, and Metastasis-Related Markers in Patients with HER2-Positive Breast Cancer
2023-09-15, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182286
PMID:37759508
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，分析HER2阳性乳腺癌患者的肿瘤异质性，重点关注与乳腺癌、EMT、CSC和转移相关标记基因的表达。 | 本研究首次整合公共数据集和自身队列的单细胞RNA测序数据，探讨HER2阳性乳腺癌的肿瘤异质性及其与药物耐药性的关系。 | 研究仅限于HER2阳性乳腺癌患者，且依赖于公共数据集和自身队列的数据，可能存在样本选择偏倚。 | 探讨HER2阳性乳腺癌的肿瘤异质性及其与药物耐药性的关系。 | HER2阳性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及HER2阳性乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据，具体样本数量未详述。 | NA | NA | NA | NA |
| 226 | 2024-08-07 |
Single-Cell Network-Based Drug Repositioning for Discovery of Therapies against Anti-Tumour Necrosis Factor-Resistant Crohn's Disease
2023-Sep-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241814099
PMID:37762402
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探索了抗肿瘤坏死因子（TNF）治疗抵抗的克罗恩病患者的细胞现象，并识别了潜在的药物候选 | 本研究首次在克罗恩病中进行了基于单细胞网络的药物再定位研究，并发现了针对抗TNF抵抗的克罗恩病的新药物候选vorinostat | 研究仅使用了Gene Expression Omnibus和Library of Integrated Network-Based Cellular Signatures L1000项目的数据，可能未涵盖所有相关细胞类型和功能 | 阐明抗TNF治疗抵抗的克罗恩病患者中的细胞现象，并识别潜在的药物候选 | 抗TNF治疗抵抗的克罗恩病患者 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 93,893个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2024-08-05 |
Elucidating Cuproptosis-Associated Genes in the Progression from Nash to HCC Using Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Analyses and Experimental Validation
2023-Sep-11, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59091639
PMID:37763758
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研究论文 | 本研究探讨了与杯死亡相关的基因在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）向肝细胞癌（HCC）进展中的作用 | 发现FDX1等基因在NASH和NASH向HCC进展过程中起着关键作用，并构建了与杯死亡相关的基因簇 | 研究未提及样本量的具体细节和方法的广泛应用性 | 探讨杯死亡相关基因在NASH与HCC进展中的角色与机制 | NASH患者及其向HCC进展的病例 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种NASH患者的模型和人类样本 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Immuno-Oncology Characteristics of Tumor-Infiltrating T Lymphocytes in Photodynamic Therapy-Treated Colorectal Cancer Mouse Model
2023-Sep-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813913
PMID:37762216
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了光动力疗法治疗结直肠癌小鼠模型中肿瘤浸润T淋巴细胞的免疫肿瘤学特征 | 首次揭示了光动力疗法通过调节肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是增加CD8激活T细胞和CD8细胞毒性T细胞，减少耗竭CD8 T细胞，从而增强抗肿瘤免疫 | NA | 探究光动力疗法在结直肠癌治疗中的免疫调节机制 | 结直肠癌小鼠模型中的肿瘤浸润T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用人源化的PD-1/PD-L1 MC38细胞异种移植小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2024-08-05 |
Dissecting the Molecular Mechanisms Driving Electropathology in Atrial Fibrillation: Deployment of RNA Sequencing and Transcriptomic Analyses
2023-09-09, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12182242
PMID:37759465
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综述 | 本文综述了房颤中分子机制的解析，特别是RNA测序和转录组分析的应用 | 提供了关于房颤相关的转录组变化的新见解，并介绍了新的RNA-seq方法 | 未明确讨论实验模型与人类研究结果之间的所有差异 | 深入理解驱动房颤的电病理学的分子根源 | 关注房颤患者与正常心律控制组之间的转录组差异 | 数字病理学 | 房颤 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多项房颤患者的房腔组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2024-08-07 |
A Novel Lipid Metabolism and Endoplasmic Reticulum Stress-Related Risk Model for Predicting Immune Infiltration and Prognosis in Colorectal Cancer
2023-Sep-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813854
PMID:37762157
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研究论文 | 本研究构建了一个基于脂质代谢和内质网应激相关基因的预测结直肠癌患者预后和免疫反应的预后特征模型 | 首次开发了一个结合脂质代谢和内质网应激相关基因的风险模型，用于预测结直肠癌的预后和免疫浸润 | NA | 旨在预测结直肠癌患者的预后和免疫反应 | 结直肠癌患者 | NA | 结直肠癌 | RNA测序 | LASSO回归 | RNA序列数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的RNA测序和临床数据 | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2024-08-07 |
Current Status of Next-Generation Sequencing in Bone Genetic Diseases
2023-Sep-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813802
PMID:37762102
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研究论文 | 本文讨论了下一代测序（NGS）在骨遗传疾病中的应用现状 | NGS技术的发展显著提高了遗传分析的速度和容量，并扩展到基因组、表观基因组、宏基因组和转录组分析 | NA | 探讨NGS在骨遗传疾病中的应用 | 骨组织及其相关的遗传疾病 | 基因组学 | 骨疾病 | NGS | NA | 基因组、表观基因组、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2024-08-07 |
Identification of Colon Immune Cell Marker Genes Using Machine Learning Methods
2023-Sep-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13091876
PMID:37763280
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研究论文 | 本研究利用机器学习方法分析单细胞RNA测序数据，旨在筛选结肠肿瘤微环境中25种候选免疫细胞类型的遗传标记基因 | 采用五种特征排序算法和增量特征选择方法，结合决策树和随机森林分类算法，筛选出不同免疫细胞亚型的标记基因 | NA | 筛选结肠肿瘤微环境中免疫细胞类型的遗传标记基因，并揭示其定量差异 | 结肠肿瘤微环境中的25种候选免疫细胞类型 | 机器学习 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | 决策树, 随机森林 | 基因表达数据 | 41,650个细胞，每个细胞表达22,164个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2024-08-07 |
Establishment of a Seven-Gene Signature Associated with CD8+ T Cells through the Utilization of Both Single-Cell and Bulk RNA-Sequencing Techniques in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241813729
PMID:37762031
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序技术，在透明细胞肾细胞癌中建立了一个与CD8+ T细胞相关的七基因标志物 | 首次通过结合单细胞和批量RNA测序数据，识别并验证了与CD8+ T细胞相关的基因标志物，用于透明细胞肾细胞癌的预后评估和免疫治疗反应预测 | 研究样本仅来自TCGA和IMvigor210队列，可能需要更多样本来验证基因标志物的普遍性 | 确定与CD8+ T细胞相关的分子标志物，用于透明细胞肾细胞癌的诊断和治疗 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤免疫微环境中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO-Cox分析 | RNA测序数据 | 来自TCGA的透明细胞肾细胞癌患者被随机分配到测试组和训练组，IMvigor210队列用于评估标志物的有效性 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2024-08-07 |
ScRNA-seq revealed disruption in CD8+ NKG2A+ natural killer T cells in patients after liver transplantation and immunosuppressive therapy
2023-Sep, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.990
PMID:37773707
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了肝移植患者在接受免疫抑制治疗后的免疫细胞组成和基因表达变化 | 首次揭示了肝移植后CD8+ NKG2A+自然杀伤T细胞的动态变化及其在免疫耐受中的重要作用 | NA | 阐明肝移植后免疫耐受的机制 | 肝移植患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 肝移植 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了17,462个外周血单个核细胞，来自一个正常个体和四个接受肝移植及免疫抑制治疗的患者 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2024-08-05 |
Microfluidic design in single-cell sequencing and application to cancer precision medicine
2023-09-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100591
PMID:37725985
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综述 | 本文评估了微流体设计在单细胞测序和癌症精准医学中的应用 | 讨论了微流体架构如何促进单细胞组学分析在肿瘤学研究中的最新应用 | 未详细描述微流体方法在不同癌症类型中的适用性 | 探讨微流体技术在单细胞测序中的重要性和潜在应用 | 单细胞测序技术及其在肿瘤研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2024-08-07 |
Synovium is a sensitive tissue for mapping the negative effects of systemic iron overload in osteoarthritis: identification and validation of two potential targets
2023-09-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04541-5
PMID:37741987
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研究论文 | 本研究旨在探讨骨关节炎（OA）患者中与铁超载相关的潜在靶基因 | 识别并验证了JUN和ZFP36作为OA治疗中减轻铁超载的潜在靶基因 | 需要进一步研究JUN和ZFP36在OA发病机制中诱导细胞成分变化的作用 | 研究骨关节炎中与铁超载相关的潜在靶基因 | 骨关节炎患者的滑膜组织 | NA | 骨关节炎 | 定量逆转录-PCR, 免疫印迹, 免疫组织化学, ELISA | NA | RNA测序数据 | 使用了多个微阵列数据集和单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2024-08-07 |
Establishing a prognostic model based on immune-related genes and identification of BIRC5 as a potential biomarker for lung adenocarcinoma patients
2023-Sep-23, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11249-8
PMID:37741993
|
研究论文 | 本文构建了一个基于免疫相关基因的预测模型，并识别BIRC5作为肺腺癌潜在的生物标志物 | 本文首次利用免疫相关mRNA构建预测模型，并通过单细胞RNA测序和体外实验验证了BIRC5的功能 | NA | 开发一种基于免疫基因的预测模型，用于早期诊断和准确预测肺腺癌的预后 | 肺腺癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2024-08-05 |
Hypoxia-induced AFAP1L1 regulates pathological neovascularization via the YAP-DLL4-NOTCH axis
2023-09-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04503-x
PMID:37737201
|
研究论文 | 本研究探讨了AFAP1L1在肿瘤和眼部病理性新生血管形成中的作用 | 首次确认AFAP1L1作为一种与缺氧相关的调节蛋白，通过YAP-DLL4-NOTCH轴抑制血管生成 | 目前尚未探讨AFAP1L1在其他类型疾病中的影响 | 研究AFAP1L1在调控病理性新生血管形成中的机制和作用 | 肿瘤细胞和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 数字病理学 | 肿瘤和眼部病理性新生血管疾病 | 高通量测序技术，qRT-PCR，西方印迹 | 肿瘤异种移植模型和眼部病理性新生血管模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2024-08-05 |
Defining and identifying cell sub-crosstalk pairs for characterizing cell-cell communication patterns
2023-09-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-42883-8
PMID:37735248
|
研究论文 | 本研究通过定义和识别细胞亚间质对来表征细胞间通信模式 | 提出了细胞亚间质对（CSCP）的概念，能够识别细胞亚群之间的相似信号，揭示被掩盖的配体-受体相互作用 | 研究可能受限于所用的数据集和方法，需在更广泛的样本上验证 | 旨在通过细分细胞类型的亚群体，深入理解组织和肿瘤微环境中的细胞间通信 | 使用小鼠嗅球和视觉皮层的单细胞空间转录组数据进行分析 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | 非负矩阵分解 | 转录组数据 | 来自29名不同免疫治疗反应的乳腺癌患者的单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2024-08-05 |
Reducing gut microbiome-driven adipose tissue inflammation alleviates metabolic syndrome
2023-09-21, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-023-01637-4
PMID:37735685
|
研究论文 | 这篇文章探讨了啤酒花衍生的类黄酮对饮食诱导的肥胖和代谢综合症的影响 | 本研究首次揭示了四羟基黄酮在减轻脂肪组织中巨噬细胞介导的炎症中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏对人类的临床验证 | 识别和开发能够减少代谢综合症影响的干预措施 | 小鼠模型，尤其是C57Bl/6J小鼠 | 数字病理学 | 代谢综合症 | 16S rRNA测序和单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据 | C57Bl/6J小鼠实验 | NA | NA | NA | NA |