单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 449 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Robust Identification of Differential Gene Expression Patterns from Multiple Transcriptomics Datasets for Early Diagnosis, Prognosis, and Therapies for Breast Cancer
2023-09-24, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina59101705
PMID:37893423
|
研究论文 | 本研究通过综合稳健统计学和生物信息学方法，从多个转录组数据集中识别出与乳腺癌相关的差异表达基因，用于早期诊断、预后和治疗。 | 本研究采用稳健的统计方法来识别乳腺癌相关的关键基因，这些方法对异常值不敏感，提高了结果的可靠性。 | NA | 探索乳腺癌相关潜在的关键基因，并评估其在早期诊断、预后和治疗中的表现。 | 乳腺癌相关的差异表达基因及其在诊断、预后和治疗中的应用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 微阵列分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 分子对接分析 | NA | 基因表达数据 | 从三个微阵列（GSE26910, GSE42568, GSE65194）和一个单细胞RNA测序（GSE235168）数据集中识别出46个共同差异表达基因。 | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-05 |
Emerging Insights into Molecular Mechanisms of Inflammation in Myelodysplastic Syndromes
2023-Sep-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11102613
PMID:37892987
|
综述 | 本文总结了慢性骨髓增生性疾病(MDS)中炎症信号的作用机制。 | 通过单细胞测序和多组学方法揭示了MDS进展中炎症信号及天然免疫反应的重要性。 | 本文未提供具体的实验数据来支持所讨论的机制。 | 探讨炎症在骨髓增生性疾病中的作用与机制。 | 主要关注骨髓微环境中炎症因子对造血干细胞(HSC)命运的影响。 | 数字病理 | 骨髓增生性疾病 | 单细胞测序、多组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-sequencing data clustering using variational graph attention auto-encoder with self-supervised leaning
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad383
PMID:37898127
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序数据聚类的新型深度学习框架VGAAE | 创新地引入了多头注意力机制和自监督学习以提高聚类质量 | 未提及模型在真实生物场景中的应用情况 | 研究希望改善单细胞RNA-seq数据的聚类性能 | 集中在单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 变分图注意自编码器（VGAAE） | NA | 在不同数据集上进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Quantum annealing-based clustering of single cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad377
PMID:37874950
|
研究论文 | 本文探讨了使用量子退火技术对单细胞RNA测序数据进行聚类分析的方法 | 提出了一种利用量子计算中的量子退火技术来探索聚类成本函数的新方法 | NA | 解决单细胞基因表达数据聚类分析中参数选择和算法选择的难题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 量子退火 | 量子计算 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Combining Bulk RNA-seq and scRNA-seq data to identify RNA m5C methyltransferases NSUN1: a rising star as a biomarker for cancer diagnosis, prognosis and therapy
2023-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-66
PMID:37859740
|
研究论文 | 本研究结合Bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，全面分析了NSUN1在癌症中的表达及其作为癌症诊断、预后和治疗标志物的潜力 | 首次在多种癌症中全面分析NSUN1的基因表达、生存状态、遗传改变、甲基化和磷酸化以及浸润性免疫细胞的关系 | 研究主要基于在线资源和公共数据库，缺乏实验验证 | 探讨NSUN1作为癌症诊断、预后和治疗标志物的有效性 | NSUN1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌，结肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，Bulk RNA-seq | NA | RNA序列数据 | 多种人类癌症样本 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Characterization of the tumor microenvironment by single-cell RNA sequencing in non-small cell lung cancer treated with neo-adjuvant immunotherapy
2023-Sep-28, Translational lung cancer research
IF:4.0Q1
DOI:10.21037/tlcr-23-413
PMID:37854164
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
NG-SEM: an effective non-Gaussian structural equation modeling framework for gene regulatory network inference from single-cell RNA-seq data
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad369
PMID:37864293
|
研究论文 | 提出了一种新的非高斯结构方程模型框架NG-SEM，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络。 | 引入了一种灵活的噪声建模策略，以高斯混合模型近似生物系统的复杂随机特性，改进了传统结构方程模型。 | 未提及具体限制因素 | 提高单细胞RNA-seq数据中基因调控网络推断方法的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络。 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | 非高斯结构方程模型 | 生物数据集 | 合成数据和真实生物数据集的多种控制实验 | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-05 |
Screening single-cell trajectories via continuity assessments for cell transition potential
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad356
PMID:37864296
|
研究论文 | 本文提出了一种评估细胞转变潜力的连续性的方法，用于单细胞轨迹分析 | 创新地生成了一种简单的评分算法来评估轨迹的连续性 | 当前缺乏评估指标，使得确定轨迹何时偏离连续性变得困难 | 研究单细胞轨迹的连续性评估，以提高推断准确性 | 对肠道干细胞发育和CD8+ T细胞分化的真实案例进行了研究 | 数字病理学 | 牛皮癣关节炎和急性肾损伤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 在模拟和真实的单细胞数据中分析了断裂情况 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-07 |
[Identification of Peripheral Blood GZMK + CD8 + T Cells As Biomarkers of Alzheimer's Disease Based on Single-Cell Transcriptome]
2023-Sep, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20230960107
PMID:37866940
|
研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，探索阿尔茨海默病（AD）患者外周血中的免疫特征，并识别GZMK+ CD8+ T细胞作为潜在的生物标志物 | 首次发现AD患者外周血中GZMK+ CD8+ T细胞含量增加，并与其异常信号传导及RESISTIN信号通路的增强相关 | 研究仅基于单一数据集GSE168522，可能存在样本偏倚；未涉及临床验证 | 识别阿尔茨海默病的潜在血液生物标志物 | 阿尔茨海默病患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用来自Gene Expression Omnibus数据库的GSE168522数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-07 |
Transcriptional Regulation of Airway Epithelial Cell Differentiation: Insights into the Notch Pathway and Beyond
2023-Sep-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914789
PMID:37834236
|
综述 | 本文综述了气道上皮细胞分化的转录调控机制，特别关注了Notch信号通路及其相关因素 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了气道上皮细胞的组成，包括一些特殊和罕见的细胞类型 | NA | 探讨气道上皮细胞分化的机制，为呼吸系统疾病的治疗提供靶向疗法 | 气道上皮细胞的分化过程及其在呼吸系统疾病中的作用 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
SLAM Modification as an Immune-Modulatory Therapeutic Approach in Cancer
2023-Sep-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194808
PMID:37835502
|
综述 | 本文综述了信号淋巴细胞激活分子（SLAM）家族在肿瘤环境中调节免疫反应的关键作用，并探讨了基于SLAM的免疫调节治疗在癌症治疗中的潜力 | 文章提出了基于SLAM家族的精确靶向治疗方法，利用单细胞RNA测序和高级成像技术，为更个性化和适应性强的癌症治疗提供了新方向 | 文章强调了患者安全性和临床试验的重要性，暗示当前研究可能存在临床应用上的限制 | 探讨SLAM家族在癌症治疗中的应用，特别是作为免疫调节治疗的新策略 | 研究对象为SLAM家族及其在肿瘤免疫反应中的作用 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Recent Advances in Single-Cell RNA-Sequencing of Primary and Metastatic Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2023-Sep-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15194734
PMID:37835428
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在原发性和转移性透明细胞肾细胞癌研究中的最新进展 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了肿瘤、免疫和基质细胞的多样性及其在疾病进展中的相互作用和通路 | 对于转移性透明细胞肾细胞癌的研究相对有限，这可能是导致该类型患者生存率和响应率较低的原因之一 | 旨在填补透明细胞肾细胞癌转移研究的知识空白，并强调提高转移性透明细胞肾细胞癌生存率的关键步骤 | 原发性和转移性透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Deciphering Cellular Heterogeneity and Communication Patterns in Porcine Antral Follicles by Single-Cell RNA Sequencing
2023-Sep-26, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani13193019
PMID:37835625
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了猪腔前卵泡中颗粒细胞的分子和细胞特征 | 揭示了猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式，以及它们在卵泡发育和卵母细胞成熟中的作用 | NA | 理解猪腔前卵泡中颗粒细胞的异质性和通信模式 | 猪腔前卵泡中的颗粒细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Donor-Reactive T Cells Reveals Role of Apoptosis in Donor-Specific Hyporesponsiveness of Kidney Transplant Recipients
2023-Sep-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914463
PMID:37833911
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，揭示了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了肾移植受者中供体反应性T细胞的转录组和T细胞受体谱，并发现了凋亡在供体特异性低反应性中的作用 | 研究样本量较小，仅包括7名肾移植受者，可能影响结果的普遍性 | 探究肾移植后供体特异性低反应性的潜在机制 | 肾移植受者的供体反应性T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 7名肾移植受者 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-05 |
Decoding functional cell-cell communication events by multi-view graph learning on spatial transcriptomics
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad359
PMID:37824741
|
研究论文 | 该文章开发了一种名为HoloNet的方法，通过空间转录组学数据解码功能性细胞间通信事件。 | 本研究的创新点在于整合了配体-受体对、细胞类型空间分布和下游基因表达到深度学习模型中，以解码功能性通信事件和其目标基因关系。 | 没有提供HoloNet在其他类型的癌症或疾病中的应用结果，可能限制了其普遍性。 | 本研究旨在解码功能性细胞间通信事件，以理解生物过程的机制。 | 研究对象为乳腺癌和肝癌的三组Visium数据集，专注于细胞间的配体-受体相互作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌, 肝癌 | 空间转录组学 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三组Visium数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Cells in the Lung of a Patient with Chronic Hypersensitivity Pneumonitis Reveals Inflammatory Niche with Abundant CD39+ T Cells with Functional ATPase Phenotype: A Case Study
2023-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241914442
PMID:37833889
|
研究论文 | 本研究调查了慢性超敏性肺炎中免疫细胞特征，重点关注CD39表达细胞对炎症和组织重塑的影响 | 揭示了CD39表达的T细胞在慢性超敏性肺炎中的双重性质，提示其在调节肺炎症中的潜在作用 | 本研究是单一病例研究，样本量较小，可能限制了广泛的适用性 | 探讨慢性超敏性肺炎中免疫细胞的特征及其对病理机制的影响 | 分析一名慢性超敏性肺炎患者的肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 慢性超敏性肺炎 | 单细胞转录组学，流式细胞术，基因表达分析 | NA | 组织样本 | 1名慢性超敏性肺炎患者的肺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-05 |
SGAE: single-cell gene association entropy for revealing critical states of cell transitions during embryonic development
2023-09-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad366
PMID:37833841
|
研究论文 | 本研究提出了一种新颖的计算方法SGAE，用于揭示早期胚胎发育过程中细胞转变的关键状态 | 提出了一种基于基因关联信息的单细胞基因关联熵(SGAE)方法，用于分析单细胞RNA-seq数据，并定量评估基因调控网络的关键特性 | 对单细胞RNA测序数据的精确检测仍然面临稀疏性、噪音和异质性的挑战 | 研究单细胞转变的关键点，以追踪细胞异质性并阐明细胞分化的分子机制 | 分析五个关于胚胎发育的单细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA表达数据 | 五个单细胞数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-05 |
Development and validation of a differentiation-related signature based on single-cell RNA sequencing data of immune cells in spinal cord injury
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19853
PMID:37809933
|
研究论文 | 本文基于脊髓损伤后免疫细胞的单细胞RNA测序数据，开发并验证了一个相关的分化标志。 | 该研究首次利用单细胞RNA测序数据识别了脊髓损伤后的免疫亚型和分子标志。 | 未提及具体的样本来源及其异质性对结果的影响。 | 探讨脊髓损伤后免疫系统的分子亚型及其潜在的诊断标志。 | 脊髓损伤后的免疫细胞及其相关的分化基因。 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三次脊髓样本，时间点为3、10和21天 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Single-cell data analysis of malignant epithelial cell heterogeneity in lung adenocarcinoma for patient classification and prognosis prediction
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e20164
PMID:37809682
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，分析了肺腺癌（LUAD）中的恶性上皮细胞异质性，并识别出与不良预后相关的新型恶性上皮细胞簇KRT81。 | 识别出与不良预后相关的新型恶性上皮细胞簇KRT81，并揭示了这些细胞在缺氧和上皮-间质转化（EMT）途径中的激活状态。 | NA | 研究肺腺癌患者分类和预后预测中的恶性上皮细胞异质性。 | 肺腺癌（LUAD）患者的恶性上皮细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Integrative analysis of cancer-associated fibroblast signature in gastric cancer
2023-Sep, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e19217
PMID:37809716
|
研究论文 | 本研究通过整合分析癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中的特征，探索了CAFs在肿瘤微环境（TME）中的异质性，并为GC的生物标志物和精准治疗开发奠定了基础。 | 本研究首次识别了胃癌中的五种CAFs亚型，并发现CAF_0亚型与不良预后相关，同时构建了基于CAFs的预后评分模型（CAFs-score），该模型与免疫细胞、基质成分和免疫评分有显著相关性，具有指导治疗决策的潜力。 | NA | 探索癌症相关成纤维细胞在胃癌中的异质性，并为胃癌的生物标志物和精准治疗开发提供基础。 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）在胃癌（GC）中的特征及其与预后的关系。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq）、免疫组织化学、免疫荧光、Western blotting | LASSO回归分析、多变量Cox回归 | RNA测序数据 | 来自GEO和TCGA的数据集，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |