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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-08-27
CNS Repopulation by Hematopoietic-Derived Microglia-Like Cells Corrects Progranulin deficiency
2023-Sep-12, Research square
研究论文 本研究开发了一种基于白消安和PLX3397的高效预处理方案,通过造血干细胞移植实现中枢神经系统内小胶质细胞样细胞的快速、持久替换,并在GRN缺陷小鼠模型中证明其治疗有效性。 该研究首次结合白消安骨髓清除和PLX3397短暂小胶质细胞耗竭,实现高效、快速且持久的中枢神经系统小胶质细胞替换,并通过单细胞RNA测序和CyTOF质谱流式揭示了骨髓来源小胶质样细胞的异质性及其基因表达特征。 摘要中未明确提及局限性,但可能包括对长期安全性、临床转化的有效性以及该方案在人体中的适用性仍需进一步验证。 开发一种高效的预处理方案,用于造血干细胞移植后中枢神经系统小胶质细胞的替换,并验证其在GRN缺陷小鼠模型中的治疗潜力。 小鼠模型,特别是GRN缺陷小鼠和野生型小鼠的骨髓移植。 生物信息学 GRN缺陷相关疾病(如额颞叶痴呆) 单细胞RNA测序、CyTOF质谱流式、造血干细胞移植 NA 基因表达数据、蛋白表达数据 小鼠模型(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-08-21
Autophagy contributes to homeostasis in esophageal epithelium where high autophagic vesicle content marks basal cells with limited proliferation and enhanced self-renewal potential
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨自噬在食管上皮稳态中的作用,发现高自噬囊泡含量的基底细胞具有有限增殖和增强自我更新能力,有助于维持体内食管增殖-分化梯度 首次通过条件性敲除Atg7小鼠和基于Cyto-ID染色的细胞分选,揭示高自噬囊泡水平标记的食管基底细胞具有增强的自我更新潜力,并参与维持组织稳态 研究主要基于小鼠模型,可能不完全反映人类食管上皮的复杂性;未深入探讨自噬调控的具体分子机制 明确自噬在食管上皮稳态条件下的作用 食管上皮基底细胞、小鼠食管组织、3D类器官 分子生物学 食管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 透射电子显微镜, 流式细胞术 条件性基因敲除小鼠模型, 3D类器官模型 基因表达数据, 图像数据, 细胞周期数据 小鼠模型及分选后的细胞样本,具体数量未提供 NA RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-08-19
Single-Cell Analysis of CX3CR1+ Cells Reveals a Pathogenic Role for BIRC5+ Myeloid Proliferating Cells Driven by Staphylococcus aureus Leukotoxins
2023-09-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,研究CX3CR1+细胞来源的BIRC5+髓系增殖细胞在金黄色葡萄球菌感染中的致病作用 首次在慢性感染中发现BIRC5+髓系增殖细胞群,并揭示其扩增依赖于组织损伤毒素,且BIRC5缺失可提高感染小鼠存活率 研究主要基于小鼠模型,具体机制尚未完全阐明 探究炎症组织中干细胞样增殖髓系细胞的来源和致病作用,特别是在金黄色葡萄球菌感染中BIRC5+细胞的功能 小鼠肝脏中的CX3CR1+前体细胞衍生的BIRC5+髓系增殖细胞 单细胞组学 感染性疾病 单细胞RNA测序、遗传谱系追踪 NA 单细胞转录组数据 小鼠感染模型(具体样本量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
4 2026-08-18
Heterogeneous tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma: An emerging role of single-cell analysis
2023-09, Cancer medicine IF:2.9Q2
综述 本文综述了单细胞分析技术在揭示胰腺导管腺癌肿瘤微环境中细胞异质性方面的作用 系统性地总结了单细胞RNA测序和其他单细胞技术在PDAC异质性研究中的新发现,突出了其在评估不同细胞亚群在肿瘤进展中作用的新兴角色 基于综述,可能未涵盖最新或所有相关研究,且单细胞技术本身存在一定局限性 探讨单细胞分析技术在揭示PDAC肿瘤微环境异质性及其对疾病进展影响中的作用 胰腺导管腺癌肿瘤微环境中的肿瘤性导管细胞、癌症相关成纤维细胞和免疫细胞等不同细胞亚群 数字病理学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-08-06
Dual-scRNA-seq analysis reveals rare and uncommon parasitized cell populations in chronic L. donovani infection
2023-09-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 利用双单细胞RNA测序分析慢性利什曼原虫感染小鼠脾脏和骨髓中的寄生细胞群体,发现罕见且非典型的寄生细胞类型 开发了双单细胞RNA测序方法,能同时分析宿主细胞和寄生虫转录组,无偏地检测罕见的寄生细胞群体 未提供明确的局限性信息 识别并注释慢性杜氏利什曼原虫感染中脾脏和骨髓内的寄生细胞群体 慢性感染小鼠的脾脏和骨髓细胞 单细胞转录组学 利什曼病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 慢性感染小鼠的脾脏和骨髓样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-06-18
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过CRISPR-人类类器官-单细胞RNA测序系统筛选36个高风险的孤独症谱系障碍相关基因,揭示了它们对脑细胞命运决定的调控作用 开发了CHOOSE系统,结合CRISPR-Cas9基因编辑、人类大脑类器官模型和单细胞转录组学,实现了在嵌合类器官中进行高通量功能缺失筛选 NA 研究孤独症谱系障碍高风险基因在人类脑发育过程中的细胞类型特异性功能 孤独症谱系障碍相关的36个转录调控基因 机器学 孤独症谱系障碍 CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 诱导多能干细胞 NA 单细胞转录组数据, 染色质模态数据 36个高风险基因扰动实验, 患者特异性诱导多能干细胞来源的类器官 NA 单细胞RNA测序 NA NA
7 2026-05-27
First-in-human clinical trial of personalized neoantigen vaccines as early intervention in untreated patients with lymphoplasmacytic lymphoma
2023-Sep-21, Research square
研究论文 首次人体临床试验评估个性化新抗原疫苗作为无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者的早期干预措施 首次在无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者中进行DNA个体型新抗原疫苗的人体临床试验,通过单细胞转录组分析揭示疫苗诱导肿瘤免疫微环境的双相抗肿瘤反应,发现B细胞与浆细胞亚群的不同响应机制 样本量较小(仅9例患者),主要观察到疾病稳定而非显著缓解,且肿瘤浆细胞亚群对疫苗存在内在及获得性耐药,未来需联合靶向浆细胞亚群或阻断IGF-1信号及髓系检查点的策略 评估个性化新抗原疫苗治疗无症状淋巴浆细胞淋巴瘤的安全性和有效性,并探索其免疫机制 9例无症状淋巴浆细胞淋巴瘤患者 数字病理学 淋巴浆细胞淋巴瘤 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 9例患者的骨髓样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒(用于单细胞转录组分析)
8 2026-05-21
Morphological, molecular, and functional characterization of mouse glutamatergic myenteric neurons
2023-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 系统表征小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特性 首次通过稀疏标记、单细胞mRNA测序和钙成像技术,全面揭示VGLUT2阳性肠神经元为功能独特的神经元群体,具有单个向尾端投射的长轴突,并通过烟碱型胆碱能神经传递间接响应结直肠机械拉伸 单细胞mRNA测序仅分析52个VGLUT2阳性神经元,样本量较小;研究局限于小鼠远端结肠和直肠,未涉及其他肠道区域或物种 阐明小鼠结肠直肠中VGLUT2阳性肠神经元的形态、分子和功能特征 小鼠结肠直肠中的VGLUT2阳性肠神经元 神经科学 NA 单细胞mRNA测序、AAV稀疏标记、GCaMP6f钙成像 NA 基因表达数据、钙成像数据 31个VGLUT2阳性肠神经元用于形态分析,52个用于单细胞测序,215个用于钙成像 NA 单细胞RNA测序 NA NA
9 2026-05-08
Clinical characterization of EFHD2 (swiprosin-1) in Glioma-associated macrophages and its role in regulation of immunosuppression
2023-09, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了EFHD2(swiprosin-1)在胶质瘤相关巨噬细胞中的临床特征及其在免疫抑制调控中的作用 首次利用多民族社区的大规模临床数据研究EFHD2在胶质瘤中的作用,并通过单细胞测序和敲除小鼠模型验证其免疫调节功能 未提及具体局限性,但样本来源主要为数据库回顾性分析,且实验验证仅限于小鼠模型,缺乏临床样本直接验证 阐明EFHD2在胶质瘤相关巨噬细胞中的表达特征及其对肿瘤微环境免疫抑制的调控机制 来自CGGA和TCGA数据库的胶质瘤患者样本,以及小鼠胶质瘤细胞系和巨噬细胞 机器学习 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞测序 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 313或657例CGGA胶质瘤患者和603例TCGA胶质瘤患者 Illumina, 10x Genomics bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium CGGA数据库和GSE131928数据集中的单细胞测序数据
10 2026-04-28
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 该论文通过转基因雪貂模型定义了肺部离子细胞的多样性和功能 首次在鼬科动物中建立条件性遗传模型,揭示人类与小鼠间进化保守的肺部离子细胞功能及亚型 NA 阐明肺部离子细胞在气道中的生物学功能及其在囊性纤维化中的作用 转基因雪貂模型(FOXI1-Cre::ROSA-TG, FOXI1-KO, FOXI1-Cre::CFTR)及囊性纤维化雪貂 自然语言处理 囊性纤维化 单细胞转录组学、谱系追踪、条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据、谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-04-09
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data identifies the characteristics of ferroptosis in lumbar disc herniation
2023-Sep-01, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别了腰椎间盘突出症中铁死亡的特征,并发现MYB基因可能是一个潜在的治疗靶点 首次将单细胞RNA测序与bulk RNA测序数据整合分析,用于研究腰椎间盘突出症中的铁死亡特征,并揭示了MYB基因在疾病中的关键作用及与免疫细胞的关联 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅通过RT-qPCR确认了标志基因的功能,缺乏更深入的体内外功能实验验证 阐明铁死亡在腰椎间盘突出症发病机制中的具体作用,并寻找潜在的治疗靶点 腰椎间盘突出症患者的转录组数据集和单细胞RNA测序数据 生物信息学 腰椎间盘突出症 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 生物信息学分析 LASSO, SVM-RFE, CIBERSORT, AUCell RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
12 2026-04-07
AML/T cell interactomics uncover correlates of patient outcomes and the key role of ICAM1 in T cell killing of AML
2023-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析急性髓系白血病(AML)与T细胞间的相互作用,揭示了ICAM1在T细胞杀伤AML中的关键作用及其与患者预后的关联 首次在单细胞水平上系统解析AML与T细胞相互作用的转录组特征,并发现ICAM1作为免疫突触关键成分在AML免疫杀伤中的决定性作用 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证;样本量相对有限;未涵盖所有AML亚型 探究AML对T细胞杀伤抵抗的机制,并寻找影响患者预后的关键分子 原发性AML患者样本和人类工程化CD4+ T细胞 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用原发性AML患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-04-01
Unsupervised removal of systematic background noise from droplet-based single-cell experiments using CellBender
2023-09, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文开发了一种基于深度生成模型的工具CellBender,用于无监督去除液滴式单细胞实验中的系统性背景噪声 提出了一种基于液滴式检测噪声生成现象学的深度生成模型,能准确区分含细胞与无细胞液滴,学习背景噪声特征,并以端到端方式提供无噪声量化 NA 去除液滴式单细胞实验中的系统性背景噪声,以提高数据质量 液滴式单细胞实验数据,包括scRNA-seq、snRNA-seq和CITE-seq 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单核RNA测序、CITE-seq 深度生成模型 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞多组学 NA NA
14 2026-03-13
Ferroptosis and WDFY4 as novel targets for immunotherapy of lung adenocarcinoma
2023-Sep-19, Aging
研究论文 本研究通过分析铁死亡指数和单细胞RNA测序数据,探索了肺腺癌免疫治疗的潜在靶点,并验证了WDFY4基因在其中的关键作用 首次将铁死亡与B细胞免疫浸润联系起来,并鉴定出WDFY4作为调控B细胞分化和肺腺癌进展的核心基因,为肺腺癌免疫治疗提供了新靶点 研究主要基于生物信息学分析和体外、体内实验,缺乏大规模临床队列验证,且WDFY4的具体作用机制仍需进一步阐明 探索肺腺癌免疫治疗的潜在靶点,改善患者预后 肺腺癌患者组织样本、A549细胞系、裸鼠移植瘤模型 生物信息学与肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学、流式细胞术、Transwell迁移实验、裸鼠移植瘤模型 NA 基因表达数据、单细胞测序数据、组织图像数据 肺腺癌组织微阵列样本、单细胞RNA测序数据(癌与癌旁组织) NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-06
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境,揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性,识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用,以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 样本量较小(仅15例患者),且仅基于单中心前瞻性试验数据,需要更大规模验证 探究肝细胞癌对现代系统性治疗(卡博替尼联合纳武利尤单抗)响应差异的分子和细胞机制 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 空间转录组学 肝细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 15例肝细胞癌患者(其中5例有病理响应) NA 空间转录组学 NA NA
16 2026-03-06
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer IF:3.4Q2
研究论文 本文通过整合基因组学方法,识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点,并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用,同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 基因组学 头颈鳞状细胞癌 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
17 2026-03-02
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,分析了多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗前后的免疫微环境,以探索与长期治疗反应相关的免疫表型特征 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体β测序与质谱流式细胞术,纵向比较了达到持续微小残留病灶阴性与未达到或无法维持阴性的患者免疫微环境差异 样本量较小(仅23名患者),且研究主要关注来那度胺治疗,可能无法推广到其他治疗方案 探索多发性骨髓瘤患者免疫微环境在维持疾病缓解中的作用,并发现与长期治疗反应相关的免疫表型相关性 新诊断的多发性骨髓瘤患者,接受连续来那度胺维持治疗 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 23名患者 NA 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 NA NA
18 2026-02-15
Tuning hyperparameters of doublet-detection methods for single-cell RNA sequencing data
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
研究论文 本研究探索了单细胞RNA测序数据中双联体检测方法scDblFinder的最优超参数设置 采用全因子设计、响应面模型和16个真实scRNA-seq数据集来优化双联体检测方法的超参数,提升了检测性能 研究仅针对scDblFinder方法,且基于有限的数据集,可能不适用于所有生物条件 优化单细胞RNA测序数据分析中双联体检测方法的超参数设置 单细胞RNA测序数据中的双联体检测方法scDblFinder 机器学习 NA 单细胞RNA测序 响应面模型 单细胞RNA测序数据 16个真实scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2025-12-29
Impact of chemotherapeutic agents on liver microenvironment: oxaliplatin create a pro-metastatic landscape
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
研究论文 本研究探讨了奥沙利铂对肝脏微环境的影响,发现其通过诱导免疫抑制促进结直肠癌肝转移 首次利用单细胞RNA测序揭示奥沙利铂如何改变肝脏免疫微环境,并证明T细胞补充可逆转其促转移效应 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未涉及其他化疗药物的比较 探究奥沙利铂对肝脏预转移微环境的影响及其在结直肠癌肝转移中的作用机制 BALB/c和BALB/c-nude小鼠模型、CT26细胞系、结直肠癌患者样本 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、LDH检测、细胞增殖与凋亡实验、荟萃分析 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床荟萃数据 小鼠模型及结直肠癌患者样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2025-12-24
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、谱系追踪和基因靶向技术,揭示了皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子动态,并发现了一种非内皮性间充质神经周细胞类型 首次描述了一种非典型VE-钙黏蛋白细胞群,即非内皮性间充质神经周细胞,并揭示了Alk1在该细胞中维持神经分支稳态的新作用 研究主要基于小鼠模型,人类相关性的验证尚需进一步研究 探究皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子机制 小鼠皮肤VE-钙黏蛋白细胞 单细胞生物学 NA 单细胞转录组学、谱系追踪、基因靶向 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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