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当前共找到 450 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-13 |
Ferroptosis and WDFY4 as novel targets for immunotherapy of lung adenocarcinoma
2023-Sep-19, Aging
DOI:10.18632/aging.205042
PMID:37728413
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研究论文 | 本研究通过分析铁死亡指数和单细胞RNA测序数据，探索了肺腺癌免疫治疗的潜在靶点，并验证了WDFY4基因在其中的关键作用 | 首次将铁死亡与B细胞免疫浸润联系起来，并鉴定出WDFY4作为调控B细胞分化和肺腺癌进展的核心基因，为肺腺癌免疫治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外、体内实验，缺乏大规模临床队列验证，且WDFY4的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探索肺腺癌免疫治疗的潜在靶点，改善患者预后 | 肺腺癌患者组织样本、A549细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、流式细胞术、Transwell迁移实验、裸鼠移植瘤模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、组织图像数据 | 肺腺癌组织微阵列样本、单细胞RNA测序数据（癌与癌旁组织） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-06 |
Spatial transcriptomics analysis of neoadjuvant cabozantinib and nivolumab in advanced hepatocellular carcinoma identifies independent mechanisms of resistance and recurrence
2023-09-18, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01218-y
PMID:37723590
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析肝细胞癌新辅助卡博替尼和纳武利尤单抗治疗后的肿瘤微环境，揭示了响应与非响应肿瘤的异质性机制 | 首次应用空间转录组学技术系统性描绘肝细胞癌新辅助联合治疗下的肿瘤微环境异质性，识别出PAX5模块激活和B细胞成熟在治疗响应中的关键作用，以及癌症相关成纤维细胞介导的细胞外基质重塑机制 | 样本量较小（仅15例患者），且仅基于单中心前瞻性试验数据，需要更大规模验证 | 探究肝细胞癌对现代系统性治疗（卡博替尼联合纳武利尤单抗）响应差异的分子和细胞机制 | 肝细胞癌患者的肿瘤切除标本 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 15例肝细胞癌患者（其中5例有病理响应） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-03-06 |
An integrated genomic approach identifies follistatin as a target of the p63-epidermal growth factor receptor oncogenic network in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Sep, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad038
PMID:37492374
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研究论文 | 本文通过整合基因组学方法，识别了头颈鳞状细胞癌中p63-表皮生长因子受体致癌网络的关键靶点卵泡抑素 | 首次将卵泡抑素确定为p63的直接转录靶点，并揭示了其在连接TGF-β和EGFR通路中的功能作用，同时通过单细胞RNA测序数据明确了癌细胞是肿瘤微环境中卵泡抑素的主要来源 | 未详细探讨卵泡抑素在肿瘤微环境中与免疫细胞相互作用的分子机制 | 阐明头颈鳞状细胞癌中致癌基因及其下游靶点介导肿瘤进展的机制 | 头颈鳞状细胞癌患者样本和代表性细胞系模型 | 基因组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 整合基因组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 来自头颈鳞状细胞癌患者和细胞系模型的多个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-02 |
Immunophenotypic correlates of sustained MRD negativity in patients with multiple myeloma
2023-09-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40966-8
PMID:37660077
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术，分析了多发性骨髓瘤患者在接受来那度胺维持治疗前后的免疫微环境，以探索与长期治疗反应相关的免疫表型特征 | 首次结合单细胞RNA测序和T细胞受体β测序与质谱流式细胞术，纵向比较了达到持续微小残留病灶阴性与未达到或无法维持阴性的患者免疫微环境差异 | 样本量较小（仅23名患者），且研究主要关注来那度胺治疗，可能无法推广到其他治疗方案 | 探索多发性骨髓瘤患者免疫微环境在维持疾病缓解中的作用，并发现与长期治疗反应相关的免疫表型相关性 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者，接受连续来那度胺维持治疗 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体β测序, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 质谱流式细胞术数据 | 23名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 5 | 2026-02-15 |
Tuning hyperparameters of doublet-detection methods for single-cell RNA sequencing data
2023-Sep, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.15302/J-QB-022-0324
PMID:41675246
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研究论文 | 本研究探索了单细胞RNA测序数据中双联体检测方法scDblFinder的最优超参数设置 | 采用全因子设计、响应面模型和16个真实scRNA-seq数据集来优化双联体检测方法的超参数，提升了检测性能 | 研究仅针对scDblFinder方法，且基于有限的数据集，可能不适用于所有生物条件 | 优化单细胞RNA测序数据分析中双联体检测方法的超参数设置 | 单细胞RNA测序数据中的双联体检测方法scDblFinder | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 响应面模型 | 单细胞RNA测序数据 | 16个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2025-12-29 |
Impact of chemotherapeutic agents on liver microenvironment: oxaliplatin create a pro-metastatic landscape
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02804-z
PMID:37697332
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研究论文 | 本研究探讨了奥沙利铂对肝脏微环境的影响，发现其通过诱导免疫抑制促进结直肠癌肝转移 | 首次利用单细胞RNA测序揭示奥沙利铂如何改变肝脏免疫微环境，并证明T细胞补充可逆转其促转移效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未涉及其他化疗药物的比较 | 探究奥沙利铂对肝脏预转移微环境的影响及其在结直肠癌肝转移中的作用机制 | BALB/c和BALB/c-nude小鼠模型、CT26细胞系、结直肠癌患者样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、LDH检测、细胞增殖与凋亡实验、荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床荟萃数据 | 小鼠模型及结直肠癌患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2025-12-24 |
Alk1 acts in non-endothelial VE-cadherin+ perineurial cells to maintain nerve branching during hair homeostasis
2023-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40761-5
PMID:37699906
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、谱系追踪和基因靶向技术，揭示了皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子动态，并发现了一种非内皮性间充质神经周细胞类型 | 首次描述了一种非典型VE-钙黏蛋白细胞群，即非内皮性间充质神经周细胞，并揭示了Alk1在该细胞中维持神经分支稳态的新作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性的验证尚需进一步研究 | 探究皮肤VE-钙黏蛋白细胞在毛囊稳态中的细胞和分子机制 | 小鼠皮肤VE-钙黏蛋白细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、基因靶向 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2025-12-13 |
Determinants of Survival with Combined HER2 and PD-1 Blockade in Metastatic Esophagogastric Cancer
2023-09-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3769
PMID:37406106
|
研究论文 | 本研究探讨了在转移性食管胃癌中，联合使用HER2和PD-1阻断疗法（帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗）的生存决定因素，并评估了多种生物标志物和测序技术 | 通过整合89Zr-曲妥珠单抗PET、血浆循环肿瘤DNA动态监测和单细胞RNA测序，揭示了患者内基因组异质性对治疗反应的影响，并识别了与治疗抵抗相关的转录程序 | 研究基于相对较小的样本量（如MSK队列n=226），且为观察性研究，可能受限于回顾性数据分析和潜在的选择偏倚 | 识别转移性食管胃癌患者在接受HER2和PD-1联合阻断疗法时的预后生物标志物和抵抗机制 | 转移性食管胃癌患者，包括接受帕博利珠单抗、曲妥珠单抗和化疗联合治疗的患者以及MSK队列中的曲妥珠单抗治疗患者 | 数字病理学 | 食管胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、全外显子测序、循环肿瘤DNA（ctDNA）监测、89Zr-曲妥珠单抗PET成像 | 多变量Cox回归模型 | 影像数据（PET）、基因组数据（ctDNA、scRNA-seq、全外显子测序） | MSK队列中226名曲妥珠单抗治疗患者，以及来自MSK和三星的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2025-12-11 |
A novel mutation in intron 1 of Wnt1 causes developmental loss of dopaminergic neurons in midbrain and ASD-like behaviors in rats
2023-09, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02223-8
PMID:37658228
|
研究论文 | 本研究通过大规模筛选自闭症谱系障碍（ASD）风险/致病基因，发现Wnt1内含子1中的一种新型突变，该突变导致WNT1表达降低，并在人源化大鼠模型中引发ASD样行为和中脑多巴胺能神经元发育性缺失 | 首次报道中脑多巴胺能神经元的发育性缺失是ASD的发病机制，并揭示异常祖细胞模式是这种发育性多巴胺能神经元缺失的细胞基础 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探索ASD的潜在致病机制，特别是遗传突变对神经发育的影响 | 人源化大鼠模型，重点关注中脑多巴胺能神经元 | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据，行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及大规模基因筛查和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2025-11-15 |
Cell-intrinsic effects of clonal hematopoiesis in heart failure
2023-09, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-023-00322-x
PMID:39196061
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研究论文 | 本研究通过改进的单细胞测序技术探究了克隆性造血在心力衰竭中的细胞内在效应 | 开发了改进的单细胞测序流程MutDetect-Seq，首次在心力衰竭患者中揭示了CHIP突变细胞的细胞内在基因表达改变 | 研究样本量未明确说明，且仅关注了DNMT3A突变类型 | 探究克隆性造血突变细胞在心力衰竭中的细胞内在效应机制 | 心力衰竭患者中携带DNMT3A突变的单核细胞、CD4+ T细胞和NK细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | MutDetect-Seq（改进的单细胞测序流程） |
| 11 | 2025-11-06 |
ScRNA analysis and ferroptosis-related ceRNA regulatory network investigation in microglia cells at different time points after spinal cord injury
2023-Sep-19, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-023-04195-5
PMID:37726826
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞，并研究铁死亡相关的ceRNA调控网络 | 首次在单细胞水平揭示脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞的铁死亡相关ceRNA调控网络，鉴定出关键基因Stmn1和Fgfbr1 | 研究基于小鼠模型数据，尚未进行实验验证 | 探究脊髓损伤后不同时间点小胶质细胞的免疫炎症生物标志物和调控机制 | 小鼠脊髓损伤后3天和14天的小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠脊髓损伤后3天和14天的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2025-10-05 |
Transgenic ferret models define pulmonary ionocyte diversity and function
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06549-9
PMID:37730992
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研究论文 | 本研究通过构建转基因雪貂模型揭示肺离子细胞的多样性和功能 | 首次在非啮齿类哺乳动物中建立条件性遗传雪貂模型，用于研究肺离子细胞生物学 | 研究仅限于雪貂模型，需要进一步验证在人类中的适用性 | 阐明肺离子细胞在气道生理和囊性纤维化疾病中的作用 | 转基因雪貂模型和囊性纤维化雪貂模型 | 发育生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序, 体内谱系追踪 | 条件性遗传模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种转基因雪貂模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 13 | 2025-10-05 |
Single-cell brain organoid screening identifies developmental defects in autism
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06473-y
PMID:37704762
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研究论文 | 开发CHOOSE系统用于自闭症高风险基因的脑类器官筛选，揭示这些基因对细胞命运决定的影响 | 开发了CRISPR-人类类器官-单细胞RNA测序(CHOOSE)系统，首次在嵌合类器官中进行高通量功能缺失筛选 | 研究仅限于36个高风险自闭症基因，且类器官模型可能无法完全模拟人脑发育的复杂性 | 研究自闭症谱系障碍相关基因在人类大脑发育过程中的作用机制 | 人类脑类器官和患者特异性诱导多能干细胞衍生的类器官 | 发育生物学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 染色质分析 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 染色质数据 | 36个高风险自闭症基因的扰动分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-10-05 |
Inferring and perturbing cell fate regulomes in human brain organoids
2023-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-022-05279-8
PMID:36198796
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术分析人脑类器官发育过程，建立了基因调控网络推断框架Pando，并利用遗传扰动揭示了转录因子GLI3在端脑命运决定中的关键作用 | 开发了整合多组学数据的Pando框架来推断全局基因调控网络，并通过单细胞水平的遗传扰动验证转录因子功能 | 基于类器官模型的研究可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 解析人脑发育过程中的基因调控网络 | 人多能干细胞衍生的神经类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序, 单细胞染色质可及性检测, 遗传扰动 | 基因调控网络推断模型 | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 密集时间点的类器官样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-05 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
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研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的单细胞RNA测序数据，揭示癌症转录异质性的重复模式及其功能意义 | 首次大规模整合跨癌症类型的单细胞转录组数据，系统识别转录异质性的重复模式 | NA | 解析癌症转录异质性景观并探索其功能意义 | 24种癌症类型的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 77项研究整合数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2025-10-06 |
Denoising sparse microbial signals from single-cell sequencing of mammalian host tissues
2023-Sep, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00507-1
PMID:37946872
|
研究论文 | 开发SAHMI计算方法从哺乳动物组织单细胞测序数据中识别真实存在的微生物核酸并过滤污染物 | 首次提出专门针对单细胞和空间基因组数据中稀疏微生物信号去噪的计算方法 | NA | 解决宿主-微生物组生态系统研究中微生物信号与污染物区分的技术难题 | 哺乳动物组织中的微生物核酸 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序, 空间基因组测序, 转录组测序 | NA | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-06 |
A single-cell CRISPRi platform for characterizing candidate genes relevant to metabolic disorders in human adipocytes
2023-09-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00148.2023
PMID:37486064
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研究论文 | 开发了一种结合CRISPR干扰和单细胞RNA测序的平台，用于研究人类脂肪细胞中与代谢紊乱相关的候选基因 | 首次将CROP-Seq技术应用于脂肪生成和脂肪细胞生物学研究，能够同时评估多个候选基因的转录效应 | 研究基于SGBS细胞系，可能无法完全代表体内脂肪细胞的行为 | 识别与代谢疾病相关的脂肪生成、前脂肪细胞和脂肪细胞功能的新型调节因子 | 人类前脂肪细胞SGBS细胞系 | 单细胞基因组学 | 代谢紊乱 | CRISPR干扰, 单细胞RNA测序 | CROP-Seq | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 微流控单细胞捕获 |
| 18 | 2025-10-06 |
Mild/asymptomatic COVID-19 in unvaccinated pregnant mothers impairs neonatal immune responses
2023-09-12, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172658
PMID:37698937
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研究论文 | 本研究揭示未接种疫苗孕妇的轻度/无症状COVID-19感染会改变新生儿免疫细胞组成和功能 | 首次系统分析轻度/无症状感染对新生儿免疫系统的影响，发现即使无垂直传播或新生儿症状，胎儿免疫细胞仍出现功能改变 | 研究样本仅限于未接种疫苗孕妇，未评估疫苗接种对观察效应的影响 | 探究轻度/无症状母体SARS-CoV-2感染对新生儿免疫反应的影响 | 未接种疫苗孕妇的新生儿脐带血和绒毛膜绒毛样本 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术，单细胞RNA测序，TLR激动剂和病原体体外刺激 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，功能反应数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2025-10-06 |
Bering: joint cell segmentation and annotation for spatial transcriptomics with transferred graph embeddings
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.19.558548
PMID:37786667
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研究论文 | 提出一种名为Bering的图深度学习模型，用于空间转录组数据的联合细胞分割和分子注释 | 利用转录共定位关系进行联合噪声感知细胞分割，通过转移图嵌入实现多模态输入，并构建预训练模型提高泛化能力 | 未明确说明模型在特定组织类型或技术平台上的性能限制 | 解决空间转录组学中细胞分割和注释的准确性问题 | 空间转录组数据中的单个细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序技术 | 图深度学习模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-06 |
A spatially mapped gene expression signature for intestinal stem-like cells identifies high-risk precursors of gastric cancer
2023-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.09.20.558462
PMID:37786704
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别了胃肠化生中高风险前体病变的26基因表达特征 | 首次通过空间转录组学定位了高风险胃肠化生前体病变中异常肠干样细胞的基因表达特征 | 样本量相对有限，特别是空间验证队列仅包含5个样本 | 识别胃肠化生高风险前体病变的分子生物标志物以改善癌症预防 | 胃肠化生患者组织样本和胃癌样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 单分子多重荧光原位杂交 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 303个GIM样本, 198个TCGA样本, 40个scRNA-seq样本, 5个空间验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |