单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-07 |
Cell Fate Programming by Transcription Factors and Epigenetic Machinery in Stomatal Development
2023-Aug-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.23.554515
PMID:37662219
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研究论文 | 本文探讨了转录因子与表观遗传机制在气孔发育中的细胞命运编程作用 | 通过scRNA-seq和ChIP-seq数据分析，揭示了气孔发育中转录调控的独特阶段，并提出了染色质重塑通过特定的物理相互作用因子介导的模型 | NA | 研究转录因子和表观遗传机器如何在气孔发育中协同调控转录和染色质重塑 | 气孔发育中的细胞命运编程 | NA | NA | scRNA-seq, ChIP-seq, MNase-seq | NA | 基因组数据 | 特定阶段的植物样本 |
| 142 | 2024-08-05 |
Machine Learning Reveals Synovial Fibroblast Genes Associated with Pain Affect Sensory Nerve Growth in Rheumatoid Arthritis
2023-Aug-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.08.17.23294232
PMID:37662384
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因模块 | 提出了一种新颖的机器学习方法，Graph-based Gene expression Module Identification (GbGMI)，用于识别与疼痛相关的基因模块 | 研究样本主要限于长期类风湿关节炎患者，可能不代表所有类风湿关节炎患者的情况 | 探究类风湿关节炎中与疼痛相关的基因及其作用机制 | 以长期类风湿关节炎患者的滑膜样本和早期未治疗患者的滑膜活检样本为研究对象 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 815个基因和多个滑膜样本 |
| 143 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals the Molecular Profile of Go-Opsin Photoreceptor Cells in Sea Urchin Larvae
2023-08-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12172134
PMID:37681865
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了海胆幼虫中Go-Opsin光感受器细胞的分子特征 | 研究了Go-Opsin光感受器细胞的发育及其古老的调控程序 | 没有提到具体的实验样本和数量限制 | 探讨海胆幼虫光感受器细胞的分子特征及发育机制 | 海胆幼虫中的Go-Opsin光感受器细胞 | NA | NA | 免疫组化和荧光原位杂交，单细胞转录组学 | NA | 分子数据 | NA |
| 144 | 2024-08-05 |
Spatiotemporal molecular dynamics of the developing human thalamus
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554174
PMID:37662287
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研究论文 | 这篇文章探讨了人类丘脑发育过程中的分子动态 | 揭示了人类丘脑发育中细胞命运特征和组织的分子轨迹 | 在人类丘脑发育过程中，某些分子结构尚未完全明确 | 旨在阐明人类丘脑发育的分子动态 | 研究对象为正在发育的人类丘脑神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞和多重空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-05 |
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553751
PMID:37662327
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研究论文 | 本研究探讨了嗅觉素-4阳性中性粒细胞在艰难梭状芽胞杆菌感染中加重肠上皮损伤和降低宿主生存率的作用 | 建立了第一个关于骨髓、血液和结肠中性粒细胞的转录组图谱，揭示了其在艰难梭状芽胞杆菌感染后的病理作用 | 本文未详细探讨中性粒细胞在不同阶段感染中的具体功能角色 | 旨在阐明中性粒细胞在艰难梭状芽胞杆菌感染中的功能及其对宿主的影响 | 研究了中性粒细胞与肠上皮细胞的共同培养以及预临床动物模型中的反应 | 数字病理学 | 艰难梭状芽胞杆菌感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠样本均显示感染后OLFM4水平升高 |
| 146 | 2024-08-05 |
Liver Injury and Regeneration: Current Understanding, New Approaches, and Future Perspectives
2023-08-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12172129
PMID:37681858
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研究论文 | 这篇文章探讨了肝脏损伤和再生的当前理解、创新方法以及未来展望 | 文章强调了基因编辑、组织工程、干细胞分化等领域的最新进展在肝再生研究中的重要性 | 文章未具体提及实验数据或样本量，这可能限制了结论的广泛适用性 | 研究肝脏损伤和再生的细胞和分子机制，以开发有效的肝病治疗方法 | 解析肝脏损伤和再生过程中的信号通路、细胞类型和基质成分 | 数字病理 | 肝病 | 基因编辑、干细胞分化、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-05 |
Bulk RNA-Seq Combined with Single-Cell Transcriptome Sequencing Reveals the Possible Mechanisms by Which HDGFL3 Involves in Prostate Cancer Growth and Metastasis
2023-Aug, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌衍生生长因子样3（HDGFL3）在前列腺癌生长和转移中的分子机制 | 识别出HDGFL3作为内皮细胞的关键基因，可能刺激肿瘤血管生成以增强前列腺癌的生长和扩散 | 该研究可能缺乏大规模临床验证以确认结果 | 探索HDGFL3在前列腺癌发育和转移中的作用机制 | 研究对象包括前列腺癌细胞系及相关的基因表达数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本包括前列腺癌细胞系PC-3和DU145及小鼠模型 |
| 148 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals multiple chemoresistant properties in leukemic stem and progenitor cells in pediatric AML
2023-08-31, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03031-7
PMID:37653425
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了儿童急性髓性白血病患者中的多种化疗耐药特性 | 发现CD69作为化疗耐药白血病干细胞亚群的潜在生物标志物 | 样本量有限，仅涵盖13名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究儿童急性髓性白血病患者的化疗耐药机制 | 研究对象为13名儿童急性髓性白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个儿童急性髓性白血病患者的骨髓样本 |
| 149 | 2024-08-07 |
Development and validation a prognostic model based on natural killer T cells marker genes for predicting prognosis and characterizing immune status in glioblastoma through integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing
2023-Aug-31, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01217-7
PMID:37650991
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据，开发并验证了一种基于自然杀伤T细胞标记基因的预测胶质母细胞瘤预后和表征免疫状态的预后模型。 | 本研究首次整合单细胞和批量RNA测序数据，开发了一种包含CD44和TNFSF14两个关键自然杀伤T细胞标记基因的预后预测模型，并初步探讨了不同风险组的免疫微环境。 | NA | 开发一种预后模型，用于预测胶质母细胞瘤患者的预后并表征其免疫状态。 | 胶质母细胞瘤患者的自然杀伤T细胞标记基因及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | LASSO和多元Cox回归分析 | RNA测序数据 | 从Gene Expression Omnibus（GEO）数据库获取的胶质母细胞瘤单细胞RNA测序数据，以及来自The Cancer Genome Atlas（TCGA）和中国胶质瘤基因组图谱（CGGA）数据库的胶质母细胞瘤队列。 |
| 150 | 2024-08-07 |
Interlukin-4 weakens resistance to stress injury and megakaryocytic differentiation of hematopoietic stem cells by inhibiting Psmd13 expression
2023-08-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41479-6
PMID:37653079
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素-4（IL-4）通过抑制Psmd13表达，影响造血干细胞（HSCs）对压力损伤的抵抗力和巨核细胞分化的机制 | 揭示了IL-4-Psmd13信号通路在HSCs抗压力和巨核细胞分化能力中的新调控作用 | NA | 阐明IL-4在急性髓系白血病（AML）中对造血干细胞巨核细胞分化的具体机制 | 造血干细胞（HSCs）和巨核细胞分化 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组 | 来自AML骨髓的HSCs样本 |
| 151 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the effects of anti-PD-L1 therapy on 3LL lung cancer model and its tumor microenvironment
2023-Aug-31, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-023-02156-w
PMID:37653265
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了抗PD-L1疗法对3LL肺癌模型及其肿瘤微环境的影响 | 首次详细描述了抗PD-L1疗法对肺癌肿瘤微环境的重组，并发现了治疗后肿瘤免疫原性的增强和炎症反应的促进 | NA | 探讨抗PD-L1疗法对肺癌肿瘤微环境的具体影响及其潜在机制 | 3LL肺癌细胞模型及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括肿瘤细胞、基质细胞、髓系细胞、T细胞和NK细胞等五种主要细胞群 |
| 152 | 2024-08-07 |
scSNPdemux: a sensitive demultiplexing pipeline using single nucleotide polymorphisms for improved pooled single-cell RNA sequencing analysis
2023-Aug-31, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05440-8
PMID:37653401
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scSNPdemux的单细胞RNA测序样本解复用管道，利用人类自然遗传变异进行样本识别 | 该管道在单细胞和单核RNA测序数据集上展示了优于CellPlex和Multi-seq技术的解复用性能，特别是在低RNA含量的免疫细胞类型上表现出更高的敏感性和特异性 | NA | 设计一个简化的单细胞样本解复用管道，旨在克服使用单细胞文库进行样本复用时可能影响数据质量和成本的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 153 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing reveals the existence of fetal vascular endothelial stem cell-like cells in mouse liver
2023-08-30, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03460-y
PMID:37649114
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠肝脏中胎儿血管内皮干细胞样细胞的存在。 | 首次确定了围产期血管内皮干细胞样细胞的存在及其与成年干细胞样细胞群体的关系。 | 研究仅限于小鼠模型，结果的转化性需要进一步验证。 | 探究围产期血管内皮干细胞样细胞的存在及其发育过程。 | 围产期小鼠肝脏的内皮细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自不同发育阶段的小鼠肝脏内皮细胞，样本分别为E14，E18，P7，P14和W8 |
| 154 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing to detect age-associated genes that identify senescent cells in the liver of aged mice
2023-08-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41352-6
PMID:37648885
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在老年动物肝脏中鉴定出与衰老相关的基因，以识别衰老细胞 | 首次在老鼠肝脏中鉴定出Glipr1、Clec12a和Phlda3作为与年龄相关的基因 | NA | 寻找与年龄相关的基因，以识别老年动物组织中的衰老细胞 | 老年动物肝脏中的衰老细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | mRNA表达数据 | 年轻和老年大鼠的原代肝细胞，27个月大的小鼠原代肝细胞 |
| 155 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human non-hematopoietic bone marrow cells reveals a unique set of inter-species conserved biomarkers for native mesenchymal stromal cells
2023-08-30, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03437-x
PMID:37649081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对人类非造血骨髓细胞进行分析，揭示了原生间充质基质细胞的跨物种保守生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，对人类骨髓中的非造血细胞亚群进行了详细的分类和生物标志物的鉴定，特别是在间充质基质细胞方面，发现了跨物种保守的核心基因。 | 研究仅基于5个骨髓捐献者的样本，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性。 | 旨在通过单细胞RNA测序技术，定义人类骨髓中非造血细胞亚群的正确分类，特别是间充质基质细胞。 | 人类骨髓中的非造血细胞亚群，包括内皮细胞、壁细胞和间充质基质细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5个不同的骨髓捐献者 |
| 156 | 2024-08-07 |
Combining bulk and single-cell RNA-sequencing data to develop an NK cell-related prognostic signature for hepatocellular carcinoma based on an integrated machine learning framework
2023-Aug-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01300-6
PMID:37649103
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研究论文 | 本研究结合批量和单细胞RNA测序数据，基于综合机器学习框架开发了与自然杀伤细胞（NK细胞）相关的肝细胞癌（HCC）预后标志物 | 本研究创新性地结合了批量和单细胞RNA测序数据，并开发了一个包含77种算法的共识机器学习框架，以建立基因标志物，用于预测HCC患者的预后和免疫治疗反应 | NA | 开发一种基于NK细胞相关基因的基因标志物，用于评估HCC患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌（HCC）患者的预后和免疫治疗反应 | 机器学习 | 肝癌 | RNA测序 | 机器学习框架 | RNA测序数据 | 使用了来自TCGA-LIHC、GSE14520、GSE76427和ICGC-LIRI-JP等多个数据集的数据 |
| 157 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41207-0
PMID:37644108
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研究论文 | 本文开发了一种新生小鼠胆管结扎的模型，以研究阻塞性胆汁淤积中的巨噬细胞异质性 | 开发了一种创新的新生小鼠阻塞性胆汁淤积模型，展示了病因特异性的巨噬细胞功能 | 与人类数据的进一步比较尚待进行以验证结果 | 研究新生小鼠中阻塞性胆汁淤积的巨噬细胞极化和异质性 | 新生雌性BALB/c小鼠及其在胆管结扎手术后的反应 | 数字病理学 | 阻塞性胆汁淤积 | 单细胞RNA测序 | NA | 实验室数据、组织学、流式细胞术、RNA测序数据 | 新生小鼠，样本数量未具体说明 |
| 158 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA reveals a tumorigenic microenvironment in the interface zone of human breast tumors
2023-08-29, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-023-01703-7
PMID:37644609
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术探索了人乳腺癌肿瘤界面区域的微环境异质性和特征 | 首次详细描述了乳腺癌肿瘤界面区域的独特肿瘤生成微环境，包括特定细胞类型及其相互作用 | NA | 深入了解乳腺癌肿瘤微环境，为乳腺癌的诊断和治疗提供资源 | 乳腺癌肿瘤界面区域的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 88,548个高质量细胞 |
| 159 | 2024-08-07 |
Remibrutinib (LOU064) inhibits neuroinflammation driven by B cells and myeloid cells in preclinical models of multiple sclerosis
2023-Aug-26, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02877-9
PMID:37633912
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研究论文 | 本文研究了Remibrutinib（LOU064）在多发性硬化症（MS）的两种实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）小鼠模型中抑制B细胞和髓样细胞驱动的神经炎症的效果和机制 | Remibrutinib通过抑制病理性B细胞自身反应和微胶质细胞的直接抗炎作用，显示出对EAE模型的双重抑制机制 | NA | 评估Remibrutinib在多发性硬化症的两种EAE小鼠模型中的疗效和作用机制 | Remibrutinib对B细胞和髓样细胞驱动的神经炎症的影响 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织 | 两种EAE小鼠模型 |
| 160 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals small extracellular vesicles derived from malignant cells that contribute to angiogenesis in human breast cancers
2023-08-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04438-3
PMID:37626402
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了来源于恶性细胞的小型细胞外囊泡在乳腺癌中的促进血管生成作用 | 该研究首次揭示了乳腺癌恶性细胞衍生的小型细胞外囊泡通过PPP1R1B激活内皮细胞，促进血管生成的机制 | 样本量较小，仅来自八名乳腺癌患者，结果可能存在个体差异 | 研究乳腺癌微环境中细胞的异质性及其在血管生成中的作用 | 研究乳腺癌患者体内肿瘤内皮细胞和恶性细胞的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 八名乳腺癌患者的组织样本 |