单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Reveals That TAM2-Driven Genes Affect Immunotherapeutic Response and Prognosis in Pancreatic Cancer
2023-Aug-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241612787
PMID:37628967
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞M2（TAM2）驱动基因在胰腺癌免疫治疗反应和预后中的影响 | 提出了基于TAM2驱动基因的免疫表型和预后模型，为胰腺癌的临床管理奠定了基础 | 对TAM2相关基因在胰腺癌中的免疫治疗反应和预后意义仍缺乏深入了解 | 研究TAM2驱动基因在胰腺癌中的作用及其对免疫治疗的影响 | 研究对象为胰腺癌患者及其肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序和批量RNA测序 | Lasso-COX回归模型 | 转录组数据 | 178个样本 |
| 122 | 2024-08-05 |
Machine learning modeling and prognostic value analysis of invasion-related genes in cutaneous melanoma
2023-08, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.107089
PMID:37267825
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研究论文 | 本研究确定了与侵袭相关的风险特征和预后模型，以便于皮肤黑色素瘤的个性化治疗和预后预测 | 提出了一个基于20个预后基因的风险评分模型，识别了与黑色素瘤相关的潜在生物标记 | 研究可能受到样本量和基因验证方法限制 | 为皮肤黑色素瘤开发个性化治疗和预后预测模型 | 皮肤黑色素瘤中的侵袭相关基因 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | 基因表达分析、单细胞测序 | Extra Trees Classifier | 基因表达数据 | 124个差异表达的侵袭相关基因 |
| 123 | 2024-08-07 |
Analysis of cuproptosis-related lncRNA signature for predicting prognosis and tumor immune microenvironment in pancreatic cancer
2023-08, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01843-3
PMID:37079192
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研究论文 | 本研究旨在建立一种与铜死亡相关的长链非编码RNA（lncRNA）特征，用于预测胰腺癌患者的预后并辅助临床决策 | 首次建立了基于铜死亡相关lncRNA的预后特征，并验证了CASC8在胰腺癌进展和免疫微环境中的作用 | NA | 建立和验证一种新的生物标志物，用于预测胰腺癌患者的预后和免疫反应 | 胰腺癌患者及其肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 实时聚合酶链反应（Real-Time PCR），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 30名胰腺癌患者样本，TCGA-PAAD数据库和ICGC队列数据 |
| 124 | 2024-08-07 |
The ALOX5 inhibitor Zileuton regulates tumor-associated macrophage M2 polarization by JAK/STAT and inhibits pancreatic cancer invasion and metastasis
2023-Aug, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110505
PMID:37348233
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研究论文 | 研究Zileuton通过抑制ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞M2极化，从而抑制胰腺癌的侵袭和转移 | 首次揭示了Zileuton通过抑制ALOX5调控肿瘤相关巨噬细胞M2极化，进而抑制胰腺癌侵袭和转移的机制 | NA | 探讨Zileuton对肿瘤相关巨噬细胞M2极化和胰腺癌侵袭及转移的影响 | 胰腺癌细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 包括人类胰腺癌细胞和巨噬细胞，以及裸鼠模型 |
| 125 | 2024-08-07 |
Preparation of a Single-Cell Suspension from Tumor Biopsy Samples for Single-Cell RNA Sequencing
2023-Aug, Bulletin of experimental biology and medicine
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s10517-023-05898-9
PMID:37770788
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研究论文 | 本文研究了从肿瘤活检样本中制备高质量单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 本文开发并优化了机械分离与胶原酶/透明质酸酶混合物孵育相结合的方法，以提高细胞悬液的存活率 | NA | 优化从肿瘤活检组织中制备单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 肿瘤活检样本的单细胞悬液制备方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞悬液 | 至少80%存活率的细胞悬液 |
| 126 | 2024-08-07 |
A bioinformatics analysis of potential cellular communication networks in non-alcoholic steatohepatitis and colorectal adenoma using scRNA-seq and bulk-seq
2023-Aug-31, Journal of gastrointestinal oncology
IF:2.0Q3
DOI:10.21037/jgo-23-502
PMID:37720432
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞数据和在线数据库中的高通量测序数据，筛选了非酒精性脂肪肝炎（NASH）和结直肠腺瘤（CRA）之间的差异表达基因和核心效应通路，以探索NASH/NAFLD-CRA的潜在机制 | 本研究利用scRNA-seq和bulk-seq技术，通过细胞注释和细胞通信分析，筛选了NASH-CRA共病的核心效应通路和特定信号通路，揭示了WNT通路在NASH-CRA细胞信号通信中的关键作用 | 本研究可能遗漏一些生物学上重要的基因表达程序 | 寻找NASH-CRA的潜在生物标志物、治疗靶点和相关效应通路 | 非酒精性脂肪肝炎（NASH）和结直肠腺瘤（CRA） | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病 | scRNA-seq, bulk-seq | NA | 单细胞数据, 高通量测序数据 | CRA患者单细胞数据和GSE37364、GSE89632数据库中的高通量测序数据 |
| 127 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Changes in Cell Subsets in the Cortical Microenvironment during Acute Phase of Ischemic Stroke Rats
2023-Aug-22, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2205128
PMID:37735120
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了急性缺血性中风大鼠皮层微环境中细胞亚群的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了缺血再灌注损伤（CIRI）中不同细胞亚群的生物功能和信号通路 | 仅限于大鼠模型，可能无法完全反映人类中风的复杂生物机制 | 研究缺血性中风中CIRI的机制，以找到更好的预防和治疗方法 | 缺血性中风大鼠模型及其脑皮层细胞亚群 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠的21个脑细胞群集以及6个显著差异的细胞亚群 |
| 128 | 2024-08-05 |
Temporal dynamics of microglia-astrocyte interaction in neuroprotective glial scar formation after intracerebral hemorrhage
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.02.007
PMID:37719195
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研究论文 | 本研究探讨了微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用如何影响胶质瘢痕形成及其具体功能。 | 研究首次揭示了微胶质细胞缺失如何在不同阶段影响胶质瘢痕的形成及其修复功能的时间动态。 | 研究主要关注于药理学方法引导的微胶质细胞消耗，可能影响对其自然变化的理解。 | 旨在探讨胶质瘢痕在脑出血后的作用及其形成机制。 | 研究对象为脑出血后微胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及胶质瘢痕。 | 数字病理学 | 脑出血 | 空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 129 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial heterogeneity landscapes of mature epicardial cells
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.07.011
PMID:37719196
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研究论文 | 该文章研究了成熟心外膜细胞的单细胞和空间异质性景观 | 识别了特定于产后心外膜组织的几种基因标记，并揭示了心外膜细胞在发育过程中的转录特征 | 研究中未明确指出样本数量和具体的基因标记 | 阐明成熟心外膜细胞的基因标记和发育过程 | 小鼠心脏中的心外膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组分析和空间转录组学 | NA | RNA | 9.5天胚胎至9天后出生的小鼠心脏细胞 |
| 130 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveals asymmetric cellular responses to injury in the regenerating spiny mouse (Acomys) ear
2023-08, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277538.122
PMID:37726147
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研究论文 | 该论文探讨了刺鼠耳部再生过程中不对称的细胞反应 | 首次利用空间转录组学揭示了刺鼠耳部再生中的不对称基因表达模式 | 未详细研究其他哺乳动物在再生过程中的机理 | 理解刺鼠耳部再生的分子和细胞事件 | 刺鼠耳部的再生过程 | 数字病理 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 131 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis uncovers underlying mechanisms of acute liver injury induced by tripterygium glycosides tablet in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.03.004
PMID:37719192
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤的细胞和分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤中的细胞亚型和分子变化 | NA | 阐明雷公藤多苷片诱导的急性肝损伤的细胞和分子事件 | 雷公藤多苷片诱导的小鼠急性肝损伤模型 | 数字病理学 | 肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括多种肝脏细胞亚型，如内皮细胞、肝细胞、胆管细胞和肝星状细胞等 |
| 132 | 2024-08-07 |
A single-cell landscape of triptolide-associated testicular toxicity in mice
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.04.006
PMID:37719193
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研究论文 | 研究了雷公藤内酯引起的雄性小鼠睾丸毒性的单细胞转录组图谱 | 首次在单细胞分辨率下全面剖析了雷公藤内酯相关的睾丸毒性，并构建了单细胞转录组图谱 | NA | 探讨雷公藤内酯引起的睾丸损伤机制及其治疗靶点 | 雷公藤内酯对小鼠睾丸细胞的影响 | 数字病理学 | 生殖毒性 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 59,127个细胞 |
| 133 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the dynamics of hepatic non-parenchymal cells in autoprotection against acetaminophen-induced hepatotoxicity
2023-Aug, Journal of pharmaceutical analysis
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.jpha.2023.05.004
PMID:37719199
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了在对抗对乙酰氨基酚诱导的肝毒性中，肝非实质细胞（NPCs）的动态变化及其功能 | 首次详细描述了在对抗药物诱导的肝损伤中，肝非实质细胞的动态变化及其在自动保护机制中的作用 | NA | 深入理解药物诱导肝损伤的自动保护机制，为预防和治疗提供新策略 | 肝非实质细胞（NPCs）在自动保护机制中的动态变化及其功能 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用对乙酰氨基酚（APAP）作为模型药物，在小鼠中进行预处理和二次挑战 |
| 134 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptional Landscape Reveals the Regulatory Network and Its Heterogeneity of Renal Mitochondrial Damages in Diabetic Kidney Disease
2023-Aug-31, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241713502
PMID:37686311
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了db/db小鼠（一种2型糖尿病和糖尿病肾病研究模型）肾细胞中线粒体稳态的单细胞水平转录组异质性。 | 研究揭示了糖尿病肾病进展和药物治疗期间，收集管主细胞和B细胞等不同细胞类型中线粒体紊乱的异质性，为理解糖尿病肾病的发病机制提供了新视角。 | NA | 探讨糖尿病肾病中肾细胞线粒体损伤的调控网络及其异质性。 | db/db小鼠的肾细胞线粒体稳态。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 包含13种精心捕获和验证的肾细胞类型的综合数据集 |
| 135 | 2024-08-07 |
Dynamic changes in macrophage subtypes during lung cancer progression and metastasis at single-cell resolution
2023-Aug-31, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-23-1012
PMID:37691661
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据的重分析和图谱重建，系统比较了不同阶段肺癌中巨噬细胞亚型的组成和转录变化 | 发现随着肺癌的进展，肺泡巨噬细胞的比例逐渐减少，而巨噬细胞和单核细胞的比例逐渐增加，并识别出9种在肺癌进展和转移中富集的巨噬细胞特异性相互作用 | NA | 揭示肺癌进展和转移过程中巨噬细胞在不同阶段的详细变化，并提供潜在的治疗靶点 | 肺癌中的巨噬细胞亚型及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 136 | 2024-08-07 |
Application of single-cell RNA sequencing in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Aug-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
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research paper | 本文总结了单细胞RNA测序在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中的应用，探讨了其研究方法和临床转化思路。 | 通过单细胞RNA测序，发现了肿瘤细胞表达程序和分化轨迹的差异，以及免疫微环境中的免疫细胞亚群、免疫检查点的广泛表达和免疫细胞与非免疫细胞之间的复杂相互作用网络。 | NA | 探索单细胞RNA测序在头颈鳞状细胞癌中的研究方法和临床应用价值。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的异质性和基因组突变，以及癌症相关成纤维细胞（CAFs）的分化状态和与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用。 | digital pathology | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 137 | 2024-08-07 |
A novel f -divergence based generative adversarial imputation method for scRNA-seq data analysis
2023-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.28.555223
PMID:37693609
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研究论文 | 本文提出了一种基于f-散度的生成对抗插补方法sc-GAIN，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的缺失值插补 | 该方法通过集成四种f-散度函数（交叉熵、Kullback-Leibler、反向KL和Jensen-Shannon）与生成对抗网络，实现了无需假设的插补值生成，并证明了插补数据与原始数据分布一致 | NA | 旨在提高对单细胞RNA测序数据中缺失值的插补性能，以增强对细胞多样性的理解并促进个性化治疗的发展 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 生成对抗网络（GAN） | GAN | scRNA-seq数据 | NA |
| 138 | 2024-08-05 |
scTIGER: A Deep-Learning Method for Inferring Gene Regulatory Networks from Case versus Control scRNA-seq Datasets
2023-Aug-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241713339
PMID:37686146
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研究论文 | 提出了一种深度学习方法scTIGER，用于从病例与对照的scRNA-seq数据推断基因调控网络 | scTIGER通过使用配对scRNA-seq数据的共差异基因表达特征进行基因调控网络的推断，是一种创新的方法 | 该方法的具体限制在摘要中未详细说明 | 研究如何从单细胞RNA序列数据中推断基因调控网络 | 使用前列腺癌细胞和神经元的scRNA-seq数据进行研究 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 深度学习 | 卷积神经网络 | 基因表达数据 | 使用前列腺癌细胞的scRNA-seq数据，具体样本量在摘要中未说明 |
| 139 | 2024-08-05 |
Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Data to Explore the Key Role of Fatty Acid Metabolism in Breast Cancer
2023-Aug-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241713209
PMID:37686016
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研究论文 | 本研究探讨了脂肪酸代谢在乳腺癌中的关键作用 | 建立了FMGsScore以量化脂肪酸代谢相关基因的修饰模式，并揭示其与免疫微环境和免疫疗法预测之间的关系 | 研究对脂肪酸代谢机制的理解仍不充分 | 研究脂肪酸代谢在乳腺癌中的作用及其对免疫微环境的影响 | 筛选了309个与脂肪酸代谢相关的基因并进行了差异表达分析 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-Seq | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 309个脂肪酸代谢相关基因 |
| 140 | 2024-08-07 |
Construction of a Matrix Cancer-Associated Fibroblast Signature Gene-Based Risk Prognostic Signature for Directing Immunotherapy in Patients with Breast Cancer Using Single-Cell Analysis and Machine Learning
2023-Aug-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241713175
PMID:37685980
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和机器学习技术，构建了一个基于矩阵癌相关成纤维细胞（mCAFs）特征基因的风险预测模型，用于指导乳腺癌患者的免疫治疗 | 开发了一种新的mCAF风险预测签名（mRPS），其临床结果预测准确性高于传统的TNM分期系统，并与抗肿瘤效应免疫细胞的浸润水平相关 | NA | 构建一个基于mCAFs特征基因的风险预测模型，以指导乳腺癌患者的免疫治疗 | 乳腺癌患者的癌相关成纤维细胞（CAFs）及其亚型mCAFs | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA-seq数据 | 使用了The Cancer Genome Atlas（TCGA）的乳腺癌数据集 |