单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 359 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-04 |
PFKFB3-Mediated Glycolysis Boosts Fibroblast Activation and Subsequent Kidney Fibrosis
2023-08-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12162081
PMID:37626891
|
研究论文 | 该研究探讨了PFKFB3在肾纤维化中的作用，揭示其对成纤维细胞激活的影响 | 首次探索了PFKFB3在肾纤维化中的角色，强调其在成纤维细胞激活和肾纤维化进程中的重要性 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 研究PFKFB3在肾纤维化中的作用及其机制 | 主要研究对象为肾成纤维细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠模型研究中采取了多个样本，包括野生型和缺失PFKFB3的小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 102 | 2024-08-05 |
A stem cell epigenome is associated with primary nonresponse to CD19 CAR T cells in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008977
PMID:36607839
|
研究论文 | 这篇文章探讨了干细胞表观基因组与儿童急性淋巴细胞白血病中CD19 CAR T细胞治疗的初级非应答之间的关联 | 本研究首次揭示了干细胞表观基因组与CD19-CAR治疗初级非应答的关联，为理解白血病抵抗机制提供了新见解 | 研究样本规模有限，仅为14名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 旨在探讨儿童急性淋巴细胞白血病中，与CD19-CAR疗法相关的初级非应答的机制 | 研究对象为14名参与PLAT-02试验的儿童急性淋巴细胞白血病患者，包括7例初级非应答和7例初级敏感 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 长读长PacBio测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 14名患者（7名初级非应答和7名初级敏感） | NA | NA | NA | NA |
| 103 | 2024-08-05 |
Systematic characterization of therapeutic vulnerabilities in Multiple Myeloma with Amp1q reveals increased sensitivity to the combination of MCL1 and PI3K inhibitors
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551480
PMID:37577538
|
研究论文 | 本研究系统性地表征了具有Amp1q的多发性骨髓瘤的治疗脆弱性 | 揭示了MCL1和PI3K抑制剂组合对具有Amp1q的多发性骨髓瘤的增加敏感性 | 未提及具体限制 | 开发针对具有Amp1q的多发性骨髓瘤患者的靶向治疗 | 带有和不带有Amp1q的多发性骨髓瘤亚克隆 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用相同患者肿瘤中的不同亚克隆进行比较，具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 104 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
|
研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 | NA | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-05 |
Single-Cell Multiomics
2023-08-10, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
|
review | 本综述讨论了单细胞多组学技术和计算集成方法，旨在结合不同生物数据以获得更深入的生物学见解 | 提出了新颖的单细胞技术以测量基因组、表观基因组、蛋白组和空间数据，并探索计算集成方法 | NA | 旨在通过集成不同模态的数据来加深对细胞生物学的理解 | 探讨不同单细胞技术和计算集成方法 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组、表观基因组、蛋白组、空间数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 106 | 2024-08-05 |
STREAK: A supervised cell surface receptor abundance estimation strategy for single cell RNA-sequencing data using feature selection and thresholded gene set scoring
2023-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011413
PMID:37603589
|
研究论文 | 本研究介绍了一种新的监督细胞表面受体丰度估计方法STREAK，用于单细胞转录组数据。 | 提出了一种利用联合scRNA-seq/CITE-seq训练数据的监督受体丰度估计方法，并结合了一种阈值基因集评分机制。 | NA | 开发一种更准确的细胞表面受体丰度估计方法。 | 针对六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集进行的受体丰度估计评估。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六个联合scRNA-seq/CITE-seq数据集，代表四种人类和小鼠组织类型 | NA | NA | NA | NA |
| 107 | 2024-08-04 |
Cardiac splicing as a diagnostic and therapeutic target
2023-08, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-022-00828-0
PMID:36653465
|
综述 | 本文讨论了心脏替代剪接在心肌健康和疾病中的重要性及其作为诊断和治疗靶点的潜力 | 强调了心脏剪接调节因子作为治疗靶点的识别以及在临床试验中评估剪接调节剂的转化管道的开发 | 可能缺乏对所有类型心脏病患者的广泛适应性和细节深入的分析 | 识别心脏剪接在心肌疾病中的作用，以改善诊断和治疗 | 心脏病患者及其心肌替代剪接机制的研究 | 数字病理学 | 心肌病 | 多组学技术和长读取及单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 108 | 2024-08-05 |
Systemic Alterations in Type-2 Conventional Dendritic Cells Lead to Impaired Tumor Immunity in Pancreatic Cancer
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0946
PMID:37229629
|
研究论文 | 本研究分析了胰腺癌患者的外周血和骨髓中常规树突状细胞（cDC2）的变化 | 揭示了胰腺癌对系统性cDC2发育和功能的影响 | 未充分研究PDAC对系统性cDC1的影响 | 探讨胰腺癌对树突状细胞功能的影响及其对肿瘤免疫的影响 | 胰腺癌患者的外周血和骨髓样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液和骨髓样本 | 106个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 109 | 2024-08-04 |
ProtoCell4P: an explainable prototype-based neural network for patient classification using single-cell RNA-seq
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad493
PMID:37540223
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ProtoCell4P的原型基础神经网络，用于基于单细胞RNA测序进行患者分类并提供可解释性 | 该模型通过利用细胞知识和细胞的代表（称为原型）来缓解样本稀缺和细胞数量多样性的问题，具备良好的可解释性 | 样本数量通常较小，单细胞表达轮廓较嘈杂，并且高维性可能限制了一些分析 | 旨在设计深度学习模型对患者表型进行精准分类 | 研究对象为通过单细胞RNA测序数据获得的患者样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 原型基础神经网络 | 单细胞表达数据 | 样本数量通常较小，具体数字未给出 | NA | NA | NA | NA |
| 110 | 2024-08-04 |
CCR7+ CD4 T Cell Immunosurveillance Disrupted in Chronic SIV-Induced Neuroinflammation in Rhesus Brain
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.28.555037
PMID:37693567
|
研究论文 | 这篇文章探讨了CCR7+ CD4 T细胞在恒河猴脑中慢性SIV诱导的神经炎症中的免疫监视功能的破坏 | 首次揭示了CCR7+ CD4 T细胞在中枢神经系统中的特定亚群及其功能特点 | 样本主要来自恒河猴，可能限制了结果对人类的直接适用性 | 研究CCR7+ CD4 T细胞在慢性SIV诱导的神经炎症中的角色 | 恒河猴的CCR7+ CD4 T细胞及其在神经炎症中的功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析、ATAC-seq、空间转录组学、流式细胞术 | NA | NA | 慢性SIV感染的恒河猴 | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2024-08-05 |
ScRNA-seq defines dynamic T-cell subsets in longitudinal colon and peripheral blood samples in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007358
PMID:37586769
|
研究论文 | 这篇文章研究了在免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎中动态变化的T细胞亚群 | 文章通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序识别了在结肠炎不同阶段的T细胞群体特征 | 这个研究是基于单一患者的样本，结果可能无法广泛应用于所有患者 | 旨在深入理解免疫检查点抑制剂诱导的结肠炎过程中的免疫环境变化 | 研究对象为接受了pembrolizumab治疗并发生结肠炎的Merkel细胞癌患者 | 数字病理学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序和T细胞受体测序 | NA | 血液和结肠组织样本 | 一个患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 112 | 2024-08-05 |
Long-read single-cell sequencing reveals expressions of hypermutation clusters of isoforms in human liver cancer cells
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532991
PMID:36993628
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于 LOOPseq 技术的合成长读单细胞测序技术，分析了人类肝癌细胞中的超突变亚型表达 | 提出了 LOOPseq 单细胞测序技术，识别出特异性强的肝细胞癌突变 mRNA 亚型及新融合转录本 | 没有提到具体的限制 | 旨在揭示人类肝癌细胞中蛋白质表达的复杂性与多样性 | 分析了来自个体的 447 份肝细胞癌与良性肝组织的转录组 | 数字病理学 | 肝癌 | 长读单细胞测序 | NA | 转录组 | 447 份转录组样本 | NA | NA | NA | NA |
| 113 | 2024-08-05 |
Intercellular communication atlas reveals Oprm1 as a neuroprotective factor for retinal ganglion cells
2023-Aug-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3193738/v1
PMID:37645816
|
研究论文 | 本文探讨了细胞间通信如何影响视网膜神经节细胞的存活 | 首次揭示了μ阿片受体(Oprm1)作为视网膜神经节细胞的神经保护因子的作用 | 未提及具体的临床应用或人类数据 | 研究细胞间信号在视网膜神经节细胞存活中的贡献 | 视网膜神经节细胞及其与其他视网膜细胞的相互作用 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
Early clonal extinction in glioblastoma progression revealed by genetic barcoding
2023-08-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.001
PMID:37541243
|
研究论文 | 本文通过在鼠脑中转移PDGFB和遗传条形码来启动胶质瘤发生，并直接追踪胶质母细胞瘤从最早可能阶段的演化，揭示了胶质母细胞瘤早期克隆消亡的现象。 | 本文首次观察到胶质母细胞瘤早期阶段的高频率克隆消亡事件和克隆大小的渐进性分歧，并通过计算模型和转录组分析揭示了这些动态变化的原因。 | NA | 研究胶质母细胞瘤在其早期阶段的进展和演化机制。 | 胶质母细胞瘤的早期克隆消亡和演化。 | NA | 脑肿瘤 | 遗传条形码 | 计算模型 | 转录组 | 鼠脑中的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-05 |
Immune dysfunction revealed by digital spatial profiling of immuno-oncology markers in progressive stages of renal cell carcinoma and in brain metastases
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007240
PMID:37586773
|
研究论文 | 本研究揭示了肾细胞癌进展阶段和脑转移中的免疫功能障碍 | 利用数字空间分析技术，首次对肾细胞癌不同进展阶段及脑转移进行详尽的免疫肿瘤标志物分析 | 样本量虽然相对较大，但仍可能存在选择偏差，并且结果需要进一步验证 | 探索肾细胞癌及其脑转移的肿瘤微环境对免疫反应的影响 | 76个原发肿瘤、27个相邻的正常肾样本和86个转移样本，包括24个脑转移样本 | 数字病理学 | 肾癌 | 数字空间分析 | NA | 组织样本 | 76个原发肿瘤，27个正常肾样本，86个转移样本，包括24个脑转移样本 | NA | NA | NA | NA |
| 116 | 2024-08-07 |
Assessment of Treatment-Relevant Immune Biomarkers in Psoriasis and Atopic Dermatitis: Toward Personalized Medicine in Dermatology
2023-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.04.005
PMID:37341663
|
综述 | 本文综述了用于测量炎症性皮肤病中与治疗相关的免疫生物标志物的转化免疫学方法 | 介绍了胶带剥离分析、微针基生物标志物贴片、表皮刮除术的分子分析、RNA原位杂交组织染色和单细胞RNA测序等新技术 | 目前没有批准或广泛使用的皮肤科个性化治疗方法 | 探讨个性化医学在炎症性皮肤病中的应用前景 | 牛皮癣和特应性皮炎中的治疗相关免疫生物标志物 | NA | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 117 | 2024-08-07 |
Clinical-mediated discovery of pyroptosis in CD8+ T cell and NK cell reveals melanoma heterogeneity by single-cell and bulk sequence
2023-08-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-06068-5
PMID:37620327
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量测序技术，分析了黑色素瘤中与细胞焦亡相关的基因表达，特别是在CD8 T细胞和NK细胞中的表达情况 | 首次综合分析了黑色素瘤中单细胞转录组景观中的细胞焦亡现象，并通过实验验证了免疫细胞簇和免疫基因模块 | 研究主要集中在CD8 T细胞和NK细胞，未涵盖所有类型的免疫细胞 | 探讨细胞焦亡在黑色素瘤中的作用及其对肿瘤微环境和免疫治疗的影响 | 黑色素瘤组织中的CD8 T细胞和NK细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 | NA | NA | NA | NA |
| 118 | 2024-08-07 |
Unraveling the activation process and core driver genes of HSCs during cirrhosis by single-cell transcriptome
2023-08, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231191109
PMID:37674431
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了非肝硬化和肝硬化肝组织样本，深入探索了肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现了更好的治疗靶基因 | 通过单细胞RNA测序和伪时间分析，揭示了HSCs向肌成纤维细胞分化的关键基因，并识别了HSCs从静止到激活状态的主要调控因子 | NA | 深入探索肝星状细胞（HSCs）的激活过程并发现更好的治疗靶基因 | 肝星状细胞（HSCs）及其在肝硬化中的激活过程 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个非肝硬化肝组织样本和10个肝硬化肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 119 | 2024-08-07 |
iDESC: identifying differential expression in single-cell RNA sequencing data with multiple subjects
2023-Aug-22, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05432-8
PMID:37608264
|
研究论文 | 本文开发了iDESC方法，用于在包含多个受试者的单细胞RNA测序数据中检测细胞类型特异性的差异表达基因 | iDESC采用零膨胀负二项混合模型，同时考虑了受试者效应和数据中的脱落事件，提高了差异表达分析的准确性和稳健性 | NA | 开发和评估一种新的方法，用于在单细胞RNA测序数据中进行差异表达分析，特别是在考虑多个受试者效应和数据脱落事件的情况下 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项混合模型 | RNA测序数据 | 多个受试者 | NA | NA | NA | NA |
| 120 | 2024-08-05 |
mRNA vaccination boosts S-specific T cell memory and promotes expansion of CD45RAint TEMRA-like CD8+ T cells in COVID-19 recovered individuals
2023-08-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101149
PMID:37552991
|
研究论文 | 这篇文章研究了mRNA疫苗如何影响COVID-19感染者的T细胞记忆及CD8+ T细胞的扩增 | 本研究揭示了感染引发的S特异性CD8 T细胞记忆在疫苗接种后影响T细胞反应的程度和克隆组成 | 未提及具体的样本限制或实验设计的局限性 | 分析COVID-19感染者接种mRNA疫苗后的T细胞反应 | 之前感染的疫苗接种者与未感染的疫苗接种者的对比研究 | 免疫学 | COVID-19 | mRNA疫苗 | NA | T细胞反应数据 | NA | NA | NA | NA | NA |