单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-07 |
Isoformic PD-1-mediated immunosuppression underlies resistance to PD-1 blockade in hepatocellular carcinoma patients
2023-Aug, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-327133
PMID:36450387
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研究论文 | 本文探讨了程序性细胞死亡蛋白1（PD-1）的同种型Δ42PD-1在肝细胞癌（HCC）进展和对抗PD-1免疫检查点阻断（ICB）耐药性中的作用 | 发现了Δ42PD-1同种型在HCC患者中对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并验证了针对Δ42PD-1的单克隆抗体在HCC免疫治疗中的效用 | NA | 阐明HCC患者对抗PD-1 ICB耐药性的机制，并探索新的免疫治疗策略 | 74名HCC患者，包括未治疗、接受nivolumab治疗和接受pembrolizumab治疗的患者 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和肿瘤组织中的外周血单个核细胞及肿瘤浸润淋巴细胞 | 74名HCC患者 |
| 62 | 2024-08-07 |
Renin Cell Development: Insights From Chromatin Accessibility and Single-Cell Transcriptomics
2023-08-04, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322827
PMID:37395102
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-08-07 |
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.002
PMID:37541213
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研究论文 | 研究通过长期谱系追踪和单细胞RNA测序分析，揭示了表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞在正常稳态中的作用及其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | 首次定义了表达Tff2的胰腺腺泡过渡放大前体细胞（TAP），并揭示其在Kras驱动的癌变中的保护作用 | NA | 探讨胰腺腺泡前体细胞在正常稳态及癌变过程中的作用 | 表达Tff2的胰腺腺泡前体细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 64 | 2024-08-04 |
Molecular and immune signatures, and pathological trajectories of fatal COVID-19 lungs defined by in situ spatial single-cell transcriptome analysis
2023-08, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29009
PMID:37563850
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研究论文 | 本研究通过原位测序分析了COVID-19死亡患者肺部的单细胞分子和细胞特征 | 首次建立了COVID-19肺部细胞和分子特征的空间单细胞图谱 | 仅针对死后肺组织进行研究，可能无法全面代表所有COVID-19患者的肺部病理 | 旨在定义COVID-19肺部的分子和免疫特征及病理轨迹 | 研究对象为COVID-19死亡患者的肺部组织样本 | 数字病理学 | 肺炎COVID-19 | 原位测序（ISS） | 稀疏非负矩阵分解（SNMF） | 转录组数据 | 研究中涉及221个基因，分析了1719459个细胞 |
| 65 | 2024-08-04 |
The progenitor basis of cortical projection neuron diversity
2023-08, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2023.102726
PMID:37148649
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研究论文 | 本研究探讨了不同类型的神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性。 | 创新点在于通过细胞类型解析的追踪方法来理解神经祖细胞在投射神经元多样性中的作用。 | 目前关于中间祖细胞在投射神经元多样性中的角色仍然研究不足。 | 研究神经祖细胞如何产生皮层投射神经元的多样性和层级组织。 | 主要研究对象为辐射胶质细胞和中间祖细胞。 | 神经科学 | NA | 细胞类型解析遗传命运追踪，轴突追踪，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-08-05 |
Protective Renalase Deficiency in β-Cells Shapes Immune Metabolism and Function in Autoimmune Diabetes
2023-08-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db23-0030
PMID:37216639
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研究论文 | 本文探讨了肾素缺乏如何影响自身免疫糖尿病中β细胞的免疫代谢和功能 | 首次揭示了肾素缺乏在移植的β细胞中调节局部免疫细胞代谢和功能的能力 | 研究仅在小鼠模型中进行，缺乏对人类适用性的验证 | 本研究旨在了解肾素缺乏对自身免疫糖尿病中β细胞的影响 | 主要研究对象为小鼠模型中的β细胞和浸润的免疫细胞 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 流式细胞术和单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 细胞 | NA |
| 67 | 2024-08-05 |
Ezh2 Knockout in B Cells Impairs Plasmablast Differentiation and Ameliorates Lupus-like Disease in MRL/lpr Mice
2023-08, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42492
PMID:36897808
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研究论文 | 本研究评估了EZH2在B细胞中的表达对狼疮病理机制的影响 | 首次揭示EZH2缺失对浆细胞发育和狼疮样疾病的改善效果 | 研究主要集中在小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 评估EZH2在B细胞中的角色及其与狼疮发病机制的关系 | MRL/lpr小鼠模型中的B细胞和人类狼疮患者的B细胞 | 数字病理 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | 鼠模型 | 细胞类型数据 | 小鼠模型和人类狼疮患者的多样本 |
| 68 | 2024-08-05 |
Stimulation of Immune Checkpoint Molecule B and T-Lymphocyte Attenuator Alleviates Experimental Crescentic Glomerulonephritis
2023-08-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000159
PMID:37367205
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研究论文 | 这篇文章探讨了免疫检查点分子BTLA在实验性新月型肾小管肾炎中的作用 | 这项研究首次揭示BTLA在新月型肾小管肾炎中的保护作用和抗体治疗的潜力 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能在临床应用中存在差异 | 研究BTLA在新月型肾小管肾炎中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠的实验 | 免疫学 | 肾炎 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 生物样本（小鼠模型） | 使用BTLA缺陷小鼠和野生型小鼠进行实验，但具体样本量未提及 |
| 69 | 2024-08-05 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
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研究论文 | 这项研究探讨了右心衰竭患者的循环炎症环境 | 识别了可预测患者预后的新生物标志物soluble CD163和CXCL12 | 样本数量较小，且需进一步研究这些分子如何影响心衰表现和疾病进展 | 了解右心衰竭与肝脏相互作用的机制 | 包括正常心脏功能的对照组和满足右心衰竭标准的心衰患者 | 数字病理学 | 心衰 | 多重蛋白检测和单细胞RNA测序 | NA | 血液样本和组织成像 | 三组患者的血液样本，具体数量未说明 |
| 70 | 2024-08-05 |
Spatially patterned 3D model mimics key features of cancer metastasis to bone
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本文报道了空间模式化的组织工程3D模型，模仿乳腺癌和前列腺癌骨转移的关键特征 | 提出了一种空间模式化的3D骨转移模型，可以模拟骨特异性侵袭和癌症对骨重塑的诱导性失调 | 缺乏对这些模型的广泛验证和应用研究 | 填补缺乏生理相关的体外模型的空白，探索骨转移的生物学 | 乳腺癌和前列腺癌的骨转移 | 数字病理学 | 乳腺癌和前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 3D模型 | NA | NA |
| 71 | 2024-08-05 |
Genome-wide identification and functional prediction of BYPASS1-related (BPS1) homologs in soybean
2023-Aug, Molecular breeding : new strategies in plant improvement
IF:2.6Q2
DOI:10.1007/s11032-023-01403-2
PMID:37496826
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研究论文 | 本文系统研究了大豆中的BYPASS1相关基因家族及其功能预测 | 首次全面识别并分类了大豆中的BYPASS1相关基因，并探讨了其与根结表型的潜在关联 | 未能详细阐明BYPASS1相关基因的具体功能和机制 | 研究大豆中BYPASS1相关基因家族及其在植物生长发育中的作用 | 大豆及其野生种中的BYPASS1相关基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 遗传变异数据、表型变异数据、转录组数据 | 涉及23个大豆基因和20个野生大豆基因 |
| 72 | 2024-08-05 |
Single Cell Transcriptome of Stress Vulnerability Network in mouse Prefrontal Cortex
2023-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.14.540705
PMID:37662266
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研究论文 | 该文章探讨了小鼠前额皮层中与压力脆弱性网络相关的单细胞转录组。 | 首次结合单细胞RNA测序和电脑网络测量，揭示压力脆弱性脑状态下的基因表达架构。 | 研究主要集中于小鼠模型，可能不完全适用于人类情绪障碍的理解。 | 探讨与压力脆弱性相关的基因表达和电脑网络活动之间的关系。 | 主要对象为小鼠，特别关注于小鼠前额皮层中不同细胞类型的转录组。 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多只小鼠，具体样本数量未在摘要中提供 |
| 73 | 2024-08-05 |
A fibroblast-dependent TGFβ1/sFRP2 noncanonical Wnt signaling axis underlies epithelial metaplasia in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.02.551383
PMID:37577522
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研究论文 | 探讨了间质肺疾病中，成纤维细胞与上皮细胞之间相互作用的机制及其对肺上皮变性的影响 | 识别了通过sFRP2介导的TGFβ1-非经典Wnt信号通路在特发性肺纤维化中的新机制 | 本研究的样本大小和临床数据的多样性未在摘要中明确说明 | 研究成纤维细胞与上皮细胞在特发性肺纤维化中的相互作用及其机制 | 针对间质肺病患者的成纤维细胞和上皮细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 间质肺病患者的活检样本和正常供体的组织样本 |
| 74 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
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研究论文 | 本文揭示了SARS-CoV-2后肺病症状患者中骨髓来源细胞的特征。 | 通过单细胞RNA测序，首次详细描绘了与COVID-19后急性并发症相关的免疫细胞特征和代谢变化。 | 样本大小和控制组的选择可能限制了结果的普遍适用性。 | 研究COVID-19后急性并发症患者中免疫反应的特点。 | 与SARS-CoV-2病毒感染后的慢性肺部症状相关的外周血单核细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 分析了34,139个外周血单核细胞样本 |
| 75 | 2024-08-05 |
Sub-Cluster Identification through Semi-Supervised Optimization of Rare-Cell Silhouettes (SCISSORS) in single-cell RNA-sequencing
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad449
PMID:37498558
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研究论文 | 本研究提出了SCISSORS框架，用于在单细胞RNA测序数据中识别稀有细胞类型的亚簇。 | SCISSORS通过轮廓评分评估簇的异质性，并通过多步骤半监督重聚类过程揭示异质簇中的稀有细胞，提供了一种高特异性标记基因的识别方法。 | 本研究可能受到现有聚类方法的局限，尤其是在分析和参数选择上可能影响结果的稳定性。 | 研究的目的是通过改进的聚类方法来提升稀有细胞类型的识别能力。 | 研究对象为使用单细胞RNA测序技术获得的生物异质样本中的细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 半监督聚类 | 基因表达数据 | 数千到数百万个细胞 |
| 76 | 2024-08-04 |
Smooth muscle α-actin missense variant promotes atherosclerosis through modulation of intracellular cholesterol in smooth muscle cells
2023-08-01, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehad373
PMID:37377039
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研究论文 | 该研究探讨了平滑肌α-肌动蛋白突变如何通过调节平滑肌细胞内胆固醇促进动脉粥样硬化 | 建立了一种新的机制，表明平滑肌特异性收缩蛋白中的致病性突变与动脉粥样硬化的易感性有关 | 研究未考虑其他可能影响动脉粥样硬化的环境因素 | 研究平滑肌α-肌动蛋白变异如何导致动脉粥样硬化 | 使用携带ACTA2变异的小鼠模型和体外提取的平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 基因组学，单细胞转录组分析 | NA | 生物样本 | Apoe-/-小鼠及其携带和不携带变异的平滑肌细胞 |
| 77 | 2024-08-04 |
PFKFB3-Mediated Glycolysis Boosts Fibroblast Activation and Subsequent Kidney Fibrosis
2023-08-17, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12162081
PMID:37626891
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研究论文 | 该研究探讨了PFKFB3在肾纤维化中的作用，揭示其对成纤维细胞激活的影响 | 首次探索了PFKFB3在肾纤维化中的角色，强调其在成纤维细胞激活和肾纤维化进程中的重要性 | 本研究主要基于小鼠模型，尚需在人类样本中验证 | 研究PFKFB3在肾纤维化中的作用及其机制 | 主要研究对象为肾成纤维细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 慢性肾病 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 生物样本数据 | 小鼠模型研究中采取了多个样本，包括野生型和缺失PFKFB3的小鼠 |
| 78 | 2024-08-05 |
A stem cell epigenome is associated with primary nonresponse to CD19 CAR T cells in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022008977
PMID:36607839
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研究论文 | 这篇文章探讨了干细胞表观基因组与儿童急性淋巴细胞白血病中CD19 CAR T细胞治疗的初级非应答之间的关联 | 本研究首次揭示了干细胞表观基因组与CD19-CAR治疗初级非应答的关联，为理解白血病抵抗机制提供了新见解 | 研究样本规模有限，仅为14名患者，可能影响结果的广泛适用性 | 旨在探讨儿童急性淋巴细胞白血病中，与CD19-CAR疗法相关的初级非应答的机制 | 研究对象为14名参与PLAT-02试验的儿童急性淋巴细胞白血病患者，包括7例初级非应答和7例初级敏感 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 长读长PacBio测序和单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 14名患者（7名初级非应答和7名初级敏感） |
| 79 | 2024-08-05 |
Systematic characterization of therapeutic vulnerabilities in Multiple Myeloma with Amp1q reveals increased sensitivity to the combination of MCL1 and PI3K inhibitors
2023-Aug-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.01.551480
PMID:37577538
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研究论文 | 本研究系统性地表征了具有Amp1q的多发性骨髓瘤的治疗脆弱性 | 揭示了MCL1和PI3K抑制剂组合对具有Amp1q的多发性骨髓瘤的增加敏感性 | 未提及具体限制 | 开发针对具有Amp1q的多发性骨髓瘤患者的靶向治疗 | 带有和不带有Amp1q的多发性骨髓瘤亚克隆 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用相同患者肿瘤中的不同亚克隆进行比较，具体样本数量未提及 |
| 80 | 2024-08-04 |
Targeting intratumor heterogeneity suppresses colorectal cancer chemoresistance and metastasis
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256416
PMID:37338390
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研究论文 | 本文研究了肠道肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌化疗抗性和转移的影响 | 创新点在于揭示了结直肠癌干细胞样细胞的不对称分裂在早期肿瘤异质性建立中的关键作用 | 本研究仅集中于结直肠癌，可能无法广泛适用于其他类型癌症 | 研究肠内肿瘤异质性的建立及其对结直肠癌治疗的影响 | 研究对象为结直肠癌干细胞样细胞及其衍生的细胞亚型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 七个细胞亚型的异种移植模型 |