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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling of Anopheles gambiae spermatogenesis defines the onset of meiotic silencing and premeiotic overexpression of the X chromosome
2023-08-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05224-z
PMID:37582841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了冈比亚按蚊精子发生过程,揭示了X染色体减数分裂前过表达和减数分裂沉默的起始机制 | 首次在冈比亚按蚊中通过单细胞RNA测序定义了精子发生过程中的八个细胞簇,揭示了X染色体在减数分裂前细胞中的过表达现象及其减数分裂沉默的起始阶段 | 研究仅聚焦于精子发生过程,未涉及卵子发生或其他生殖细胞发育阶段 | 解析冈比亚按蚊生殖细胞发育和基因调控机制,为开发针对这种疟疾媒介蚊的遗传控制策略提供基础 | 冈比亚按蚊的生殖细胞和精子发生过程 | 单细胞基因组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四个不同的细胞群体,八个细胞簇 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identifies prothymosin α restriction of HIV-1 in vivo
2023-08-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adg0873
PMID:37531416
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定出prothymosin α作为HIV-1体内感染的限制因子 | 首次使用单细胞转录组技术在全基因组范围内鉴定出prothymosin α与HIV-1控制的关联,并在体外验证其抑制功能 | 样本量相对有限(29名参与者),需要在更大人群中验证 | 鉴定HIV-1体内感染的限制性宿主因子 | HIV-1感染者的免疫细胞 | 单细胞生物学 | HIV/AIDS | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 29名HIV-1感染者(1名深度测序+28名验证) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Location of CD39+ T cell subpopulations within tumors predict differential outcomes in non-small cell lung cancer
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006770
PMID:37648263
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研究论文 | 本研究通过多重免疫荧光和RNA测序技术,揭示了CD39+T细胞亚群在非小细胞肺癌肿瘤组织中的空间分布特征及其与患者预后的关系 | 首次系统揭示CD39+T细胞在肿瘤基质和肿瘤巢中的差异化分布模式及其对预后的相反影响,发现CD39+CD103+CD8+T细胞在肿瘤巢中的密度与良好预后相关 | 样本量相对有限(162例),仅针对早期未治疗患者,缺乏多中心验证 | 探究CD39和CD73在非小细胞肺癌中的预后意义及免疫抑制机制 | 162例早期未治疗非小细胞肺癌患者组织样本及T细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫荧光,流式细胞术,靶向RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 图像,基因表达数据 | 162例早期未治疗NSCLC患者 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Platelet-derived factors dysregulate placental sphingosine-1-phosphate receptor 2 in human trophoblasts
2023-08, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2023.04.006
PMID:37301709
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研究论文 | 本研究探讨了人胎盘中S1PR1-S1PR3的表达动态及其在滋养细胞中受血小板衍生因子调控的机制 | 首次系统揭示胎盘S1PR2在妊娠过程中的表达变化及其受血小板衍生因子特异性调控 | 研究主要使用BeWo细胞系进行体外实验,需进一步验证在原代滋养细胞中的结果 | 探究人胎盘中S1PR1-S1PR3的定位及其在不同条件下表达调控机制 | 人胎盘组织、原代胎盘细胞、BeWo滋养细胞系 | 生殖生物学 | 妊娠相关疾病 | 定量PCR、免疫染色、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、免疫组织化学数据 | 早期妊娠(n=10)、早产(n=9)、足月(n=10)胎盘样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Origin and segregation of the human germline
2023-08, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202201706
PMID:37217306
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研究论文 | 本研究通过体外模型和单细胞转录组学揭示了人类原始生殖细胞分化的分子机制 | 阐明了围着床期外胚层发育过程中生殖细胞命运获得能力的分子特征,发现TFAP2A在启动PGC命运中的关键作用 | 无法直接研究人类胚胎,需依赖体外模型和非人灵长类动物数据 | 研究人类原始生殖细胞分化的动态过程 | 人类原始生殖细胞、羊膜细胞、非人灵长类动物(狨猴) | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、3D参考图谱 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Dedifferentiation and Proliferation of Artery Endothelial Cells Drive Coronary Collateral Development in Mice
2023-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.319319
PMID:37345524
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示小鼠冠状动脉内皮细胞去分化能力决定侧支动脉发育的机制 | 首次发现新生儿动脉内皮细胞通过去分化和增殖驱动冠状动脉侧支发育,而成年细胞缺乏此能力 | 研究仅针对小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探究冠状动脉再生潜力是否由内皮细胞去分化能力决定 | 小鼠冠状动脉内皮细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 免疫染色, 共聚焦成像 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 新生和成年小鼠冠状动脉内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-07 |
Relationship between chronic obstructive pulmonary disease and adiponectin concentrations: An updated meta-analysis and single-cell RNA sequencing
2023-Aug-18, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000034825
PMID:37603523
|
研究论文 | 通过荟萃分析和单细胞RNA测序探讨慢性阻塞性肺疾病与脂联素浓度的关系 | 结合传统荟萃分析与单细胞测序技术验证脂联素在COPD中的表达差异 | 纳入研究数量有限(18篇文献24项研究),未说明样本量具体数值 | 分析COPD与脂联素浓度的关联性 | COPD患者和健康对照者 | 生物医学研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 荟萃分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | 18篇文献24项研究(未提供具体样本数) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | GSE136831数据集 |
| 48 | 2025-10-07 |
Circadian regulation of lung repair and regeneration
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164720
PMID:37463053
|
研究论文 | 本研究探讨生物钟对肺修复和再生的调控机制及其在呼吸道感染恢复中的作用 | 首次揭示生物钟通过不同通路调控肺再生:在气管细胞中通过Wnt/β-catenin通路,在肺泡上皮细胞中通过IL-1β | 未明确说明样本规模,且机制研究主要基于模型系统 | 探究生物钟在肺修复和再生过程中的作用机制 | 人类队列数据、肺类器官、气管细胞、肺泡上皮细胞 | 生物医学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序、类器官培养、病毒感染模型 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | UK Biobank队列数据(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-07 |
Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.534630
PMID:37090640
|
研究论文 | 开发了一种名为STalign的空间转录组学数据对齐工具,能够处理部分匹配的组织切片和局部非线性形变 | 使用微分同胚度量映射方法实现空间转录组数据对齐,显著改善了基于标志点的仿射对齐方法 | NA | 解决跨切片、样本和技术的空间转录组数据比较难题 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 微分同胚度量映射 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.08.552451
PMID:37609307
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后Müller胶质细胞重编程的差异,揭示了损伤诱导神经再生与发育过程在基因调控网络上的异同 | 研究主要基于斑马鱼模型,结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的Müller胶质细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群,并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型,包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-07 |
Dissection of Cellular Communication between Human Primary Osteoblasts and Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells in Osteoarthritis at Single-Cell Resolution
2023-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc22101
PMID:37105556
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞在骨关节炎中的细胞通讯机制 | 首次在单细胞水平系统揭示了成骨细胞与骨髓间充质干细胞之间的细胞通讯网络,并发现了一个新的前成骨细胞亚型 | 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的实验验证细胞通讯机制 | 探究人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞在骨关节炎中的细胞通讯 | 人类原发性成骨细胞和骨髓间充质干细胞 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-07 |
APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids
2023-08-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03444-y
PMID:37605285
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研究论文 | 本研究通过人类iPSC来源的脑类器官探究APOE缺失对神经分化和胆固醇生物合成的影响 | 首次在人类iPSC来源的脑类器官模型中系统研究APOE缺失对脑稳态的影响,并发现其通过EIF2和Wnt/β-catenin信号通路调节细胞组成和脂质代谢 | 研究仅使用体外脑类器官模型,未在体内验证结果 | 探究APOE基因在脑稳态中的作用及其作为阿尔茨海默病最强遗传风险因子的机制 | 人类iPSC来源的脑类器官 | 干细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 亲代iPSC系及其同基因APOE缺陷系衍生的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40206-z
PMID:37563130
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾部再生过程,揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控软骨形成机制 | 首次在蜥蜴再生模型中鉴定出spp1激活的成纤维细胞作为胚芽细胞来源,并发现sulf1表达群体对Hedgehog信号的特异性响应 | 研究仅针对蜥蜴模型,在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 探索蜥蜴尾部再生过程中胚芽形成和软骨生成的调控机制 | 蜥蜴再生尾部的成纤维细胞和吞噬细胞群体 | 单细胞生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 蜥蜴再生尾部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-07 |
Dynamic Intestinal Stem Cell Plasticity and Lineage Remodeling by a Nutritional Environment Relevant to Human Risk for Tumorigenesis
2023-08-01, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-1000
PMID:37097719
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研究论文 | 本研究通过新型西式饮食NWD1探究营养环境对肠道干细胞可塑性和谱系重塑的影响及其与肿瘤发生风险的关系 | 首次揭示营养环境通过表观遗传调控Ppargc1a表达,改变线粒体结构和功能,从而重编程Lgr5hi干细胞功能并动员替代干细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类肠道黏膜的实际响应机制需要进一步验证 | 阐明营养环境如何影响肠道干细胞可塑性和谱系重塑,及其在肿瘤发生中的作用机制 | 小鼠肠道干细胞和肠道组织 | 功能基因组学 | 肠道肿瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, scATAC-seq, 功能基因组学, 成像技术 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-07 |
Disruption of cortical cell type composition and function underlies diabetes-associated cognitive decline
2023-08, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05935-2
PMID:37351595
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了2型糖尿病引起大脑皮层细胞类型组成和功能紊乱的分子机制 | 首次在2型糖尿病模型中应用单细胞转录组测序技术系统分析大脑皮层细胞组成变化及其与认知功能下降的关联 | 研究样本量相对有限,且主要基于动物模型,人类样本验证仍需扩大 | 探索2型糖尿病相关认知功能下降的病理基础 | db/db糖尿病模型小鼠和2型糖尿病患者的大脑皮层组织 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序,免疫组织化学,代谢评估,行为学测试 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | db/db糖尿病模型小鼠和对照小鼠,2型糖尿病患者(74.3±5.5岁)和对照个体(87.0±8.5岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-07 |
Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes
2023-08-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad085
PMID:37279540
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研究论文 | 本研究揭示了血流扰动诱导的内皮细胞CCRL2通过chemerin依赖性β2整合素激活促进动脉粥样硬化的新机制 | 发现CCRL2-chemerin-β2整合素轴这一新型动脉粥样硬化形成通路,chemerin具有蛋白二硫键异构酶样活性 | 主要基于小鼠模型研究,临床样本数量有限 | 探究CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-小鼠、内皮细胞、单核细胞、动脉粥样硬化患者 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、临床血清数据 | ApoE-/-小鼠模型、急性动脉粥样硬化血栓性卒中患者与健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-07 |
Using single-cell RNA sequencing to generate predictive cell-type-specific split-GAL4 reagents throughout development
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307451120
PMID:37523539
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的预测性管道,用于在发育过程中生成细胞类型特异性的split-GAL4试剂 | 利用发育单细胞RNA测序数据集选择基因对用于split-GAL4系统,创建了高效预测性管道scMarco,能够基于天然基因调控元件在发育任何时期生成细胞类型特异性工具 | NA | 开发细胞类型特异性遗传工具用于神经环路功能研究 | 果蝇视觉系统发育过程中的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR敲入 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 59 | 2025-10-07 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
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研究论文 | 本研究提出了一种扩展空间转录组学方法,通过组织透明化和膨胀处理提高基因表达检测的空间分辨率 | 通过组织透明化和膨胀处理结合改进的捕获协议,突破了传统空间转录组技术中阵列密度对分辨率的限制 | 仅在小鼠脑样本中进行了验证,尚未在其他组织类型或物种中测试 | 开发高分辨率空间转录组学技术以更精确解析组织中的基因表达模式 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,polyA转录组捕获 | NA | 基因表达数据,空间位置信息 | 小鼠脑样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-07 |
Ancestry-based differences in the immune phenotype are associated with lupus activity
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169584
PMID:37606045
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研究论文 | 通过多组学方法揭示系统性红斑狼疮中与种族相关的免疫表型差异及其对疾病严重程度的影响 | 首次结合质谱流式、单细胞转录组/蛋白质组和血浆介质分析,系统揭示黑人SLE患者特有的免疫细胞活化和表观遗传特征 | 研究样本仅限于黑人和白人群体,未涵盖其他种族群体 | 探究种族相关的免疫表型差异如何影响系统性红斑狼疮的疾病严重程度 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的免疫细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式技术, 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 多重血浆介质检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量(包含SLE患者和健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于液滴的单细胞转录组学和蛋白质组学技术 |