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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 41 | 2025-10-07 |
Circadian regulation of lung repair and regeneration
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.164720
PMID:37463053
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研究论文 | 本研究探讨生物钟对肺修复和再生的调控机制及其在呼吸道感染恢复中的作用 | 首次揭示生物钟通过不同通路调控肺再生：在气管细胞中通过Wnt/β-catenin通路，在肺泡上皮细胞中通过IL-1β | 未明确说明样本规模，且机制研究主要基于模型系统 | 探究生物钟在肺修复和再生过程中的作用机制 | 人类队列数据、肺类器官、气管细胞、肺泡上皮细胞 | 生物医学 | 呼吸道感染 | 单细胞RNA测序、类器官培养、病毒感染模型 | NA | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | UK Biobank队列数据（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-07 |
Alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.11.534630
PMID:37090640
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研究论文 | 开发了一种名为STalign的空间转录组学数据对齐工具，能够处理部分匹配的组织切片和局部非线性形变 | 使用微分同胚度量映射方法实现空间转录组数据对齐，显著改善了基于标志点的仿射对齐方法 | NA | 解决跨切片、样本和技术的空间转录组数据比较难题 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 微分同胚度量映射 | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-07 |
Common and divergent gene regulatory networks control injury-induced and developmental neurogenesis in zebrafish retina
2023-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.08.552451
PMID:37609307
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术比较斑马鱼视网膜发育和损伤诱导的神经再生过程 | 首次系统比较了不同视网膜神经元亚型缺失后Müller胶质细胞重编程的差异，揭示了损伤诱导神经再生与发育过程在基因调控网络上的异同 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探索视网膜损伤后神经再生的分子机制及其与发育过程的异同 | 斑马鱼视网膜发育和损伤再生过程中的Müller胶质细胞和神经祖细胞 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 发育和再生过程中的斑马鱼视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-07 |
Macrophage-mediated PDGF Activation Correlates With Regenerative Outcomes Following Musculoskeletal Trauma
2023-08-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000005704
PMID:36111847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析巨噬细胞亚群与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合的关系 | 首次在多种肌肉骨骼损伤模型中系统鉴定出与再生和纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群，并发现血小板衍生生长因子信号在再生条件下的增强作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 识别与肌肉骨骼损伤后再生或纤维化愈合相关的巨噬细胞亚群和基因特征 | 小鼠肌肉骨骼损伤模型，包括再生性和纤维化肌肉损失、再生性指端截肢和异位骨化 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠损伤模型的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-07 |
Dissection of Cellular Communication between Human Primary Osteoblasts and Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells in Osteoarthritis at Single-Cell Resolution
2023-Aug-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc22101
PMID:37105556
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞在骨关节炎中的细胞通讯机制 | 首次在单细胞水平系统揭示了成骨细胞与骨髓间充质干细胞之间的细胞通讯网络，并发现了一个新的前成骨细胞亚型 | 研究主要基于转录组数据分析，需要进一步的实验验证细胞通讯机制 | 探究人类原发性成骨细胞与骨髓间充质干细胞在骨关节炎中的细胞通讯 | 人类原发性成骨细胞和骨髓间充质干细胞 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-07 |
APOE deficiency impacts neural differentiation and cholesterol biosynthesis in human iPSC-derived cerebral organoids
2023-08-21, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-023-03444-y
PMID:37605285
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研究论文 | 本研究通过人类iPSC来源的脑类器官探究APOE缺失对神经分化和胆固醇生物合成的影响 | 首次在人类iPSC来源的脑类器官模型中系统研究APOE缺失对脑稳态的影响，并发现其通过EIF2和Wnt/β-catenin信号通路调节细胞组成和脂质代谢 | 研究仅使用体外脑类器官模型，未在体内验证结果 | 探究APOE基因在脑稳态中的作用及其作为阿尔茨海默病最强遗传风险因子的机制 | 人类iPSC来源的脑类器官 | 干细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 亲代iPSC系及其同基因APOE缺陷系衍生的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2025-10-07 |
Single-cell analysis of lizard blastema fibroblasts reveals phagocyte-dependent activation of Hedgehog-responsive chondrogenesis
2023-08-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40206-z
PMID:37563130
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析蜥蜴尾部再生过程，揭示了吞噬细胞依赖的Hedgehog信号通路调控软骨形成机制 | 首次在蜥蜴再生模型中鉴定出spp1激活的成纤维细胞作为胚芽细胞来源，并发现sulf1表达群体对Hedgehog信号的特异性响应 | 研究仅针对蜥蜴模型，在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 探索蜥蜴尾部再生过程中胚芽形成和软骨生成的调控机制 | 蜥蜴再生尾部的成纤维细胞和吞噬细胞群体 | 单细胞生物学 | 组织再生障碍 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 蜥蜴再生尾部组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-07 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
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研究论文 | 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征，并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理条件下的衰老细胞异质性 | 建立了体内来源的衰老特征(SenSig)，首次鉴定出周细胞和'软骨样'成纤维细胞作为衰老细胞，并发现了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的细胞间通讯机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展 | 阐明体内衰老细胞的表型特征及其在组织修复和病理过程中的作用机制 | p16-CreER;Ai14报告基因小鼠、小鼠和人类单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 组织纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | 迁移学习 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-07 |
Dynamic Intestinal Stem Cell Plasticity and Lineage Remodeling by a Nutritional Environment Relevant to Human Risk for Tumorigenesis
2023-08-01, Molecular cancer research : MCR
IF:4.1Q2
DOI:10.1158/1541-7786.MCR-22-1000
PMID:37097719
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研究论文 | 本研究通过新型西式饮食NWD1探究营养环境对肠道干细胞可塑性和谱系重塑的影响及其与肿瘤发生风险的关系 | 首次揭示营养环境通过表观遗传调控Ppargc1a表达，改变线粒体结构和功能，从而重编程Lgr5hi干细胞功能并动员替代干细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类肠道黏膜的实际响应机制需要进一步验证 | 阐明营养环境如何影响肠道干细胞可塑性和谱系重塑，及其在肿瘤发生中的作用机制 | 小鼠肠道干细胞和肠道组织 | 功能基因组学 | 肠道肿瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, scATAC-seq, 功能基因组学, 成像技术 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-07 |
Disruption of cortical cell type composition and function underlies diabetes-associated cognitive decline
2023-08, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05935-2
PMID:37351595
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了2型糖尿病引起大脑皮层细胞类型组成和功能紊乱的分子机制 | 首次在2型糖尿病模型中应用单细胞转录组测序技术系统分析大脑皮层细胞组成变化及其与认知功能下降的关联 | 研究样本量相对有限，且主要基于动物模型，人类样本验证仍需扩大 | 探索2型糖尿病相关认知功能下降的病理基础 | db/db糖尿病模型小鼠和2型糖尿病患者的大脑皮层组织 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序，免疫组织化学，代谢评估，行为学测试 | NA | 单细胞RNA测序数据，蛋白质表达数据，行为学数据 | db/db糖尿病模型小鼠和对照小鼠，2型糖尿病患者(74.3±5.5岁)和对照个体(87.0±8.5岁) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-07 |
Endothelial CCRL2 induced by disturbed flow promotes atherosclerosis via chemerin-dependent β2 integrin activation in monocytes
2023-08-07, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad085
PMID:37279540
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研究论文 | 本研究揭示了血流扰动诱导的内皮细胞CCRL2通过chemerin依赖性β2整合素激活促进动脉粥样硬化的新机制 | 发现CCRL2-chemerin-β2整合素轴这一新型动脉粥样硬化形成通路，chemerin具有蛋白二硫键异构酶样活性 | 主要基于小鼠模型研究，临床样本数量有限 | 探究CCRL2及其配体chemerin在动脉粥样硬化中的作用机制 | ApoE-/-小鼠、内皮细胞、单核细胞、动脉粥样硬化患者 | 心血管疾病研究 | 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、Di-E-GSSG测定、邻近连接测定 | NA | 基因表达数据、蛋白质活性数据、临床血清数据 | ApoE-/-小鼠模型、急性动脉粥样硬化血栓性卒中患者与健康个体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-07 |
Using single-cell RNA sequencing to generate predictive cell-type-specific split-GAL4 reagents throughout development
2023-08-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2307451120
PMID:37523539
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞RNA测序的预测性管道，用于在发育过程中生成细胞类型特异性的split-GAL4试剂 | 利用发育单细胞RNA测序数据集选择基因对用于split-GAL4系统，创建了高效预测性管道scMarco，能够基于天然基因调控元件在发育任何时期生成细胞类型特异性工具 | NA | 开发细胞类型特异性遗传工具用于神经环路功能研究 | 果蝇视觉系统发育过程中的细胞类型 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR敲入 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-07 |
Expansion spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01911-1
PMID:37349575
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研究论文 | 本研究提出了一种扩展空间转录组学方法，通过组织透明化和膨胀处理提高基因表达检测的空间分辨率 | 通过组织透明化和膨胀处理结合改进的捕获协议，突破了传统空间转录组技术中阵列密度对分辨率的限制 | 仅在小鼠脑样本中进行了验证，尚未在其他组织类型或物种中测试 | 开发高分辨率空间转录组学技术以更精确解析组织中的基因表达模式 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，polyA转录组捕获 | NA | 基因表达数据，空间位置信息 | 小鼠脑样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-07 |
Ancestry-based differences in the immune phenotype are associated with lupus activity
2023-08-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169584
PMID:37606045
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研究论文 | 通过多组学方法揭示系统性红斑狼疮中与种族相关的免疫表型差异及其对疾病严重程度的影响 | 首次结合质谱流式、单细胞转录组/蛋白质组和血浆介质分析，系统揭示黑人SLE患者特有的免疫细胞活化和表观遗传特征 | 研究样本仅限于黑人和白人群体，未涵盖其他种族群体 | 探究种族相关的免疫表型差异如何影响系统性红斑狼疮的疾病严重程度 | 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的免疫细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 质谱流式技术, 单细胞转录组学, 单细胞蛋白质组学, 多重血浆介质检测 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量（包含SLE患者和健康对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞蛋白质组学 | NA | 基于液滴的单细胞转录组学和蛋白质组学技术 |
| 55 | 2024-12-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals the cellular and molecular heterogeneity of treatment-naïve primary osteosarcoma in dogs
2023-Aug-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3232360/v1
PMID:37609233
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术描述了未治疗的原发性犬骨肉瘤的肿瘤微环境中的细胞和分子组成 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了犬骨肉瘤的细胞和分子异质性，并发现犬和人类骨肉瘤的细胞组成具有高度保守性 | 研究仅限于6只未治疗的犬骨肉瘤样本，样本量较小 | 更好地定义骨肉瘤的肿瘤微环境复杂性，并为转化免疫肿瘤学研究提供细胞和分子路线图 | 未治疗的原发性犬骨肉瘤的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 6只未治疗的犬骨肉瘤样本，共分析了35,310个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-10-30 |
A hybrid machine learning and regression method for cell type deconvolution of spatial barcoding-based transcriptomic data
2023-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554722
PMID:37662370
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研究论文 | 本文介绍了一种混合机器学习和回归方法SDePER，用于空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积 | SDePER方法通过机器学习去除ST和scRNA-seq数据之间的系统差异（平台效应），并考虑了细胞类型的稀疏性和空间相关性 | NA | 开发一种新的方法来提高空间条形码转录组数据的细胞类型反卷积的准确性和鲁棒性 | 空间条形码转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合机器学习和回归模型 | 转录组数据 | 四个真实数据集和模拟数据 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-10-27 |
Neural stem cell metabolism revisited: a critical role for mitochondria
2023-08, Trends in endocrinology and metabolism: TEM
DOI:10.1016/j.tem.2023.05.008
PMID:37380501
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综述 | 本文综述了线粒体代谢在鼠和人类神经干细胞（NSCs）胚胎和成年大脑中的作用 | 本文重新审视了线粒体在神经干细胞代谢中的关键作用，并探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据在成年NSCs代谢特征中的应用 | NA | 探讨线粒体代谢在神经干细胞维持和命运决定中的作用 | 鼠和人类神经干细胞（NSCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-10-19 |
Amphiregulin couples IL1RL1+ regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add7399
PMID:37611111
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研究论文 | 研究揭示了IL1RL1+调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞通过AREG/EGFR轴相互作用，阻碍抗肿瘤免疫 | 首次揭示了AREG/EGFR轴在调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞之间的相互作用，控制成纤维细胞功能状态的分叉 | NA | 探讨调节性T细胞和癌症相关成纤维细胞在肿瘤微环境中的相互作用及其分子机制 | 调节性T细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-10-19 |
Synergism Between IL21 and Anti-PD-1 Combination Therapy is Underpinned by the Coordinated Reprogramming of the Immune Cellular Network in the Tumor Microenvironment
2023-08, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0012
PMID:37546701
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研究论文 | 通过综合分析多个单细胞RNA测序数据集，研究了IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中通过协调重编程免疫细胞网络的协同机制 | 揭示了IL21在肿瘤微环境中通过增强CD4 T细胞的辅助功能，促进CD8 T细胞介导的免疫反应，并与抗PD-1阻断剂协同驱动肿瘤抗原特异性CD8 T细胞的克隆扩增和功能状态分化 | NA | 探讨IL21与抗PD-1联合治疗在肿瘤微环境中的协同机制 | 肿瘤微环境中的免疫细胞网络 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | RNA | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-10-16 |
Transcript accumulation rates in the early Caenorhabditis elegans embryo
2023-08-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi1270
PMID:37611097
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研究论文 | 本文研究了早期秀丽隐杆线虫胚胎中转录积累速率 | 首次在全基因组范围内测量了早期胚胎中单细胞分辨率的转录积累速率，并识别了与高转录速率相关的核心启动子元件 | 研究仅限于早期胚胎阶段，且未涵盖所有发育基因 | 估计早期胚胎中合子mRNA的积累速率，并理解转录动力学如何驱动发育决策 | 早期秀丽隐杆线虫胚胎中的转录积累速率 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序和单分子转录成像 | NA | RNA序列数据 | 早期秀丽隐杆线虫胚胎的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |