单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 359 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-11 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Aug-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02514-2
PMID:37635251
|
研究论文 | 比较BCi-NS1.1细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型在单细胞分辨率下的细胞异质性和基因表达差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较工程化基底细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型的基因表达和免疫功能差异 | 样本量较小（各3个独立分化/供体），未完全表征所有基因表达和免疫功能差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系作为气液界面培养模型的适用性 | 人气道上皮细胞的气液界面培养模型 | 单细胞生物学 | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | BCi-NS1.1来源培养物（3个独立分化），原代细胞来源培养物（3个不同供体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41207-0
PMID:37644108
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型新生小鼠胆道梗阻模型，并通过单细胞测序揭示了梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞的异质性 | 创建了死亡率低的新生儿胆道结扎模型，首次通过单细胞RNA测序比较不同病因胆汁淤积中巨噬细胞功能的特异性差异 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步与人类数据进行比较验证 | 阐明梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞亚群的特异性功能和作用机制 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和轮状病毒诱导的胆道闭锁模型 | 单细胞生物学 | 梗阻性胆汁淤积 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学染色 | 动物模型 | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，组织学图像数据 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 23 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
|
研究论文 | 构建了成人乳腺单细胞和空间分辨率的综合基因组图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率上构建了成人乳腺综合图谱，揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群体以及高度多样化的管腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间结构 | 126名女性的714,331个细胞和20名女性的117,346个细胞核 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，空间映射 | NA | 单细胞转录组数据，空间数据 | 714,331个细胞来自126名女性，117,346个细胞核来自20名女性 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | 使用了四种不同的空间映射技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
|
研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物I通过NAD再生调控肺上皮细胞命运的新机制 | 首次发现线粒体复合物I依赖的NAD再生在肺泡发育中通过抑制整合应激反应控制细胞命运 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探索肺上皮细胞命运的代谢调控机制 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-05 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
|
研究论文 | 本研究开发了FateMap框架，通过DNA条形码和单细胞RNA测序技术揭示了癌细胞在抗癌治疗中的克隆命运多样性 | 开发了结合DNA条形码和单细胞RNA测序的FateMap框架，首次系统揭示了癌细胞耐药类型的多样性及其内在决定机制 | NA | 探究遗传相同癌细胞在药物治疗下产生不同耐药类型的机制 | 单细胞来源的癌细胞系和患者样本 | 单细胞生物学 | 癌症 | DNA条形码技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数十万个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-05 |
Pharmacological targeting of netrin-1 inhibits EMT in cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06372-2
PMID:37532929
|
研究论文 | 本研究通过药理学方法靶向netrin-1抑制癌症中的上皮间质转化 | 首次发现netrin-1在EMT中的关键作用，并开发了靶向netrin-1的单克隆抗体NP137作为新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类癌细胞系，需要更多临床验证 | 开发靶向上皮间质转化的癌症治疗新方法 | 皮肤鳞状细胞癌小鼠模型和A549人类癌细胞系 | 癌症生物学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2024-08-07 |
Spatial transcriptomics of the human heart
2023-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01918-1
PMID:37568021
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-10-05 |
Unraveling Vulnerabilities in Endocrine Therapy-Resistant HER2+/ER+ Breast Cancer
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.554116
PMID:37662291
|
研究论文 | 本研究开发并表征了两种内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌体外模型，以识别潜在的治疗脆弱性 | 建立了两种不同的内分泌治疗耐药HER2+/ER+乳腺癌体外模型，首次发现脂质代谢改变和铁死亡重塑是该类型耐药乳腺癌的脆弱性 | 研究基于体外细胞模型，需要进一步体内实验验证 | 识别内分泌治疗耐药的HER2+/ER+乳腺癌的治疗脆弱性 | HER2+/ER+乳腺癌细胞系 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 体外细胞模型 | 基因组数据,转录组数据 | 两种乳腺癌细胞系(BT-474和MDA-MB-361)及其长期雌激素剥夺衍生株 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-08-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.02.005
PMID:36792015
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了放疗或免疫疗法诱导肺损伤中衰老细胞谱系的细胞图谱 | 首次系统识别了肺损伤中30种不同细胞亚群，发现衰老样成纤维细胞是主要的共同病理机制 | 研究基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明免疫疗法和放疗诱导肺损伤的细胞机制 | C57/BL6小鼠肺组织、人类和小鼠细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、多重免疫组织化学 | Seurat, Cellchat, Monocol, SCENIC | 单细胞转录组数据、组织染色图像 | 75,396个细胞，多个时间点(7,30,60天) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of Rohon-Beard neurons implicates Fgf signaling in axon maintenance and cell survival
2023-Aug-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.26.554953
PMID:37693470
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析斑马鱼Rohon-Beard神经元，揭示其分为三个亚类并发现Fgf信号通路在轴突维持和细胞存活中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统鉴定斑马鱼Rohon-Beard神经元的三个分子亚类，并发现Fgf信号通路对其轴突维持和细胞存活的调控机制 | 研究主要聚焦斑马鱼幼虫期神经元，未验证在成年个体或其他物种中的普适性 | 探究斑马鱼外周感觉神经元的分子分类及其发育调控机制 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼幼虫期Rohon-Beard神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
TPL2 kinase activity regulates microglial inflammatory responses and promotes neurodegeneration in tauopathy mice
2023-08-09, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.83451
PMID:37555828
|
研究论文 | 本研究探讨TPL2激酶活性在小胶质细胞炎症反应中的作用及其在神经退行性疾病中的影响 | 首次揭示TPL2激酶活性通过调节小胶质细胞活化状态促进tau蛋白病变模型中的神经退行性过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究TPL2激酶在神经炎症和神经退行性疾病中的作用机制 | 小鼠小胶质细胞、神经元及tau蛋白病变模型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Phylogenetic inference from single-cell RNA-seq data
2023-08-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39995-6
PMID:37553438
|
研究论文 | 开发了一种从单细胞RNA测序数据重建癌细胞系统发育关系并关联基因表达谱的方法 | 提出PhylinSic方法，首次实现从单细胞RNA测序数据同时推断系统发育关系并关联细胞表型 | NA | 重建癌症进化过程，理解肿瘤恶性特性的获得机制 | 乳腺癌肿瘤细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Core conserved transcriptional regulatory networks define the invasive trophoblast cell lineage
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201826
PMID:37417811
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了大鼠和人类侵袭性滋养层细胞谱系中保守的转录调控网络 | 首次在大鼠妊娠期子宫-胎盘界面生成单核ATAC-seq数据并与单细胞RNA-seq数据整合分析，发现了侵袭性滋养层细胞中保守的基因调控网络 | 对大鼠和人类调控机制异同的理解仍有限，需要进一步验证 | 研究大鼠和人类侵袭性滋养层细胞调控机制的相似性和差异性 | 大鼠妊娠期子宫-胎盘界面组织 | 单细胞组学 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组可及性数据, 转录组数据 | 妊娠期15.5天和19.5天的大鼠子宫-胎盘界面组织 | NA | 单核ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Distinct Inflammatory Milieu in Patients With Right Heart Failure
2023-08, Circulation. Heart failure
|
研究论文 | 本研究通过分析右心衰竭患者的循环炎症标志物，揭示了其独特的炎症特征并发现CD163和CXCL12可作为预后生物标志物 | 首次系统揭示右心衰竭患者特有的循环炎症特征，发现可溶性CD163和CXCL12作为新型预后生物标志物，并证实这些因子可能来源于肝脏库普弗细胞 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证；机制研究尚不充分，需要进一步实验验证心脏-肝脏轴的具体作用机制 | 阐明右心衰竭患者的循环炎症环境特征及其与预后的关系 | 右心衰竭患者、心功能正常对照者、非典型心衰患者 | 心血管疾病研究 | 右心衰竭 | 多重蛋白检测、单细胞RNA测序、组织成像 | NA | 血液样本、基因表达数据、组织图像 | 三组患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 多重蛋白检测, 组织成像 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine..
IF:2.0Q3
DOI:10.24976/Discov.Med.202335177.55
PMID:37553308
|
研究论文 | 本研究通过构建人源化肺芯片模型模拟甲型流感病毒感染过程，分析外周血单核细胞的转录组特征 | 结合肺芯片模型与单细胞RNA测序技术，首次在体外真实模拟肺泡结构功能并系统研究流感病毒感染后的免疫反应机制 | 体外芯片模型可能无法完全模拟体内复杂生理环境，样本规模有限 | 系统分析甲型流感病毒感染后外周血单核细胞的转录组特征及免疫反应机制 | 肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞生物学 | 流感 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | 肺芯片模型 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Vaccine adjuvant-elicited CD8+ T cell immunity is co-dependent on T-bet and FOXO1
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112911
PMID:37516968
|
研究论文 | 本研究揭示疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫需要T-bet和FOXO1转录因子的协同调控 | 发现疫苗佐剂诱导的T细胞应答需要T-bet和FOXO1的协同作用，与感染引发的应答机制不同 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究疫苗佐剂引发CD8+ T细胞免疫的转录调控机制 | 小鼠CD8+ T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Disease-associated astrocytes and microglia markers are upregulated in mice fed high fat diet
2023-08-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39890-0
PMID:37558676
|
研究论文 | 本研究通过分析高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的基因表达数据，揭示了肥胖、糖尿病与阿尔茨海默症之间的新联系 | 首次发现C4b基因在高脂饮食和阿尔茨海默症中共同上调，并证明其在星形胶质细胞中特异性表达，可能作为肥胖或糖尿病患者早期阿尔茨海默症的潜在标志物 | 研究主要基于小鼠模型和已有数据库，需要进一步人类样本验证 | 探索高脂饮食与阿尔茨海默症发病机制之间的分子联系 | 高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的脑组织样本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默症 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
An Atlas of the Developing Drosophila Visual System Glia and Subcellular mRNA Localization of Transcripts in Single Cells
2023-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.06.552169
PMID:37609218
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了果蝇视觉系统胶质细胞发育图谱，并鉴定了亚细胞mRNA定位模式 | 首次在发育中的果蝇视觉系统中全面注释胶质细胞类型，并开发计算方法识别细胞体和细胞突触中特异性定位的mRNA | 研究仅限于果蝇视觉系统胶质细胞，未涉及其他神经系统区域 | 理解胶质细胞的发育轨迹和功能多样性 | 果蝇视觉系统胶质细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞mRNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据 | 发育过程中从幼虫到成虫阶段的果蝇视觉系统胶质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Generative modeling of single-cell gene expression for dose-dependent chemical perturbations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100817
PMID:37602218
|
研究论文 | 提出基于变分自编码器的scVIDR模型，用于预测单细胞基因表达在化学扰动下的剂量依赖性响应 | 首次将变分自编码器应用于多剂量化学扰动的单细胞基因表达预测，优于现有单剂量预测模型 | 模型验证仍需更多实验数据支持，预测精度可能受细胞类型和化学物质种类限制 | 开发能够预测化学扰动剂量依赖性单细胞基因表达响应的计算方法 | 小鼠肝细胞、人血细胞和癌细胞系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 基因表达数据 | 多种细胞类型（小鼠肝细胞、人血细胞、癌细胞系） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.07.002
PMID:37541213
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序鉴定了一类表达Tff2的胰腺腺泡转运扩增祖细胞群体 | 首次发现Tff2标记的胰腺转运扩增祖细胞群体具有抵抗Kras驱动癌变的保护功能 | 未明确Tff2发挥保护作用的具体分子机制 | 研究胰腺腺泡中Tff2表达细胞群体的生物学特性及其在肿瘤发生中的作用 | 小鼠胰腺Tff2表达细胞群体 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 谱系追踪, scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |