单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202308-202308] [清除筛选条件]
当前共找到 359 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2025-10-06
Exploring Influenza A Virus-Induced Lung Injury and Immune Response Based on Humanized Lung-on-Chip
2023-08, Discovery medicine.. IF:2.0Q3
研究论文 本研究通过构建人源化肺芯片模型模拟甲型流感病毒感染过程,分析外周血单核细胞的转录组特征 结合肺芯片模型与单细胞RNA测序技术,首次在体外真实模拟肺泡结构功能并系统研究流感病毒感染后的免疫反应机制 体外芯片模型可能无法完全模拟体内复杂生理环境,样本规模有限 系统分析甲型流感病毒感染后外周血单核细胞的转录组特征及免疫反应机制 肺泡上皮细胞、血管内皮细胞、肺泡巨噬细胞和外周血单核细胞(PBMCs) 单细胞生物学 流感 单细胞RNA测序,免疫荧光染色 肺芯片模型 单细胞转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
22 2025-10-06
Vaccine adjuvant-elicited CD8+ T cell immunity is co-dependent on T-bet and FOXO1
2023-08-29, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究揭示疫苗佐剂引发的CD8+ T细胞免疫需要T-bet和FOXO1转录因子的协同调控 发现疫苗佐剂诱导的T细胞应答需要T-bet和FOXO1的协同作用,与感染引发的应答机制不同 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 探究疫苗佐剂引发CD8+ T细胞免疫的转录调控机制 小鼠CD8+ T细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
23 2025-10-06
Disease-associated astrocytes and microglia markers are upregulated in mice fed high fat diet
2023-08-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过分析高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的基因表达数据,揭示了肥胖、糖尿病与阿尔茨海默症之间的新联系 首次发现C4b基因在高脂饮食和阿尔茨海默症中共同上调,并证明其在星形胶质细胞中特异性表达,可能作为肥胖或糖尿病患者早期阿尔茨海默症的潜在标志物 研究主要基于小鼠模型和已有数据库,需要进一步人类样本验证 探索高脂饮食与阿尔茨海默症发病机制之间的分子联系 高脂饮食小鼠和阿尔茨海默症患者的脑组织样本 生物信息学 阿尔茨海默症 RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 未明确指定样本数量 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
24 2025-10-06
An Atlas of the Developing Drosophila Visual System Glia and Subcellular mRNA Localization of Transcripts in Single Cells
2023-Aug-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序构建了果蝇视觉系统胶质细胞发育图谱,并鉴定了亚细胞mRNA定位模式 首次在发育中的果蝇视觉系统中全面注释胶质细胞类型,并开发计算方法识别细胞体和细胞突触中特异性定位的mRNA 研究仅限于果蝇视觉系统胶质细胞,未涉及其他神经系统区域 理解胶质细胞的发育轨迹和功能多样性 果蝇视觉系统胶质细胞 单细胞生物学 NA 单细胞mRNA测序(scRNAseq) NA 单细胞转录组数据 发育过程中从幼虫到成虫阶段的果蝇视觉系统胶质细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
25 2025-10-06
Generative modeling of single-cell gene expression for dose-dependent chemical perturbations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 提出基于变分自编码器的scVIDR模型,用于预测单细胞基因表达在化学扰动下的剂量依赖性响应 首次将变分自编码器应用于多剂量化学扰动的单细胞基因表达预测,优于现有单剂量预测模型 模型验证仍需更多实验数据支持,预测精度可能受细胞类型和化学物质种类限制 开发能够预测化学扰动剂量依赖性单细胞基因表达响应的计算方法 小鼠肝细胞、人血细胞和癌细胞系 机器学习 NA 单细胞RNA测序 VAE(变分自编码器) 基因表达数据 多种细胞类型(小鼠肝细胞、人血细胞、癌细胞系) NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2025-10-06
Tff2 defines transit-amplifying pancreatic acinar progenitors that lack regenerative potential and are protective against Kras-driven carcinogenesis
2023-08-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序鉴定了一类表达Tff2的胰腺腺泡转运扩增祖细胞群体 首次发现Tff2标记的胰腺转运扩增祖细胞群体具有抵抗Kras驱动癌变的保护功能 未明确Tff2发挥保护作用的具体分子机制 研究胰腺腺泡中Tff2表达细胞群体的生物学特性及其在肿瘤发生中的作用 小鼠胰腺Tff2表达细胞群体 单细胞生物学 胰腺癌 谱系追踪, scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
27 2025-10-06
Integrative analysis of transcriptome dynamics during human craniofacial development identifies candidate disease genes
2023-08-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合分析人类颅面发育过程中的转录组动态,识别候选疾病基因 结合bulk和单细胞RNA-seq数据,首次系统识别出539个可能参与颅面疾病的候选基因 大多数候选基因尚未在颅面疾病中得到功能验证,需要进一步研究 识别与颅面发育障碍相关的候选疾病基因 人类颅面组织(受孕后4-8周) 生物信息学 颅面畸形 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 转录组数据, 表观基因组数据 人类颅面组织(受孕后4-8周),与数十种其他人组织比较 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
28 2025-10-06
Sub-Cluster Identification through Semi-Supervised Optimization of Rare-Cell Silhouettes (SCISSORS) in single-cell RNA-sequencing
2023-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出SCISSORS框架用于单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的识别 通过多步骤半监督重聚类过程结合轮廓评分来识别异质性聚类中的稀有细胞 NA 开发识别单细胞RNA测序数据中稀有细胞类型的方法 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 半监督聚类算法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2025-10-06
Immunosuppressive role of SPP1-CD44 in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma assessed by single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序评估SPP1-CD44在肝内胆管癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 首次在单细胞水平揭示SPP1-CD44相互作用通过抑制T细胞增殖在肝内胆管癌中发挥免疫抑制功能 样本量较小(仅9例患者),缺乏功能实验验证 探究SPP1在肝内胆管癌中的生物学功能及其免疫抑制作用 肝内胆管癌患者的肿瘤组织和癌旁组织细胞 单细胞转录组学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 差异基因表达分析、生存分析、相关性分析、CellChat、CytoSig 单细胞转录组数据 9例患者的62,770个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2025-10-06
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过T细胞介导的细胞因子信号从免疫抑制表型向免疫激活表型转化的分子机制 首次发现CAFs具有表型可塑性,能够通过T细胞来源的IFNγ和TNFα协调调控趋化因子表达,实现从CXCL12+/CXCL9-免疫抑制表型向CXCL12-/CXCL9+免疫激活表型的转化 研究主要基于小鼠胰腺腺癌模型,在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证 探究癌症相关成纤维细胞是否能够适应不同免疫微环境并形成免疫促进性趋化因子谱 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞和CD8+ T细胞 单细胞生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
31 2025-10-06
Machine Learning Reveals Synovial Fibroblast Genes Associated with Pain Affect Sensory Nerve Growth in Rheumatoid Arthritis
2023-Aug-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 通过机器学习方法识别与类风湿关节炎疼痛相关的滑膜成纤维细胞基因,并验证Netrin-4对疼痛敏感神经生长的促进作用 开发了基于图的基因表达模块识别方法,首次发现滑膜成纤维细胞在无炎症状态下通过Netrin-4促进疼痛敏感神经生长 研究样本主要来自长期RA患者和早期未治疗患者,需在更广泛人群中验证 探索类风湿关节炎疼痛机制与滑膜基因表达的关系 类风湿关节炎患者的滑膜组织样本和疼痛敏感CGRP+背根神经节感觉神经元 机器学习 类风湿关节炎 单细胞RNA测序,受体-配体相互作用分析 GbGMI(基于图的基因表达模块识别) 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 两个独立队列:长期RA患者关节置换样本和早期未治疗RA患者滑膜活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2025-10-06
Key patient demographics shape innate immune topography in noncritical hypoxic COVID-19 pneumonia
2023-08-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析非危重症低氧性COVID-19肺炎患者先天免疫细胞的地形特征与人口统计学风险因素的关系 首次在临床同质性COVID-19肺炎患者中揭示年龄和性别等人口因素如何特异性影响中性粒细胞和单核/树突状细胞 compartments 的免疫应答 样本量较小(38例患者),仅关注非危重症患者,可能无法完全代表所有COVID-19严重程度谱系 探讨COVID-19患者人口统计学风险因素与先天免疫异质性的关联 38名住院的非危重症低氧性COVID-19肺炎患者 单细胞基因组学 COVID-19肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 38例COVID-19肺炎患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2025-10-06
Tumor-associated macrophages trigger MAIT cell dysfunction at the HCC invasive margin
2023-08-17, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间成像技术揭示了肝细胞癌中MAIT细胞功能失调的机制 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过CSF1R/PD-L1相互作用在肝癌侵袭边缘导致MAIT细胞功能失调 研究样本量有限,需要更大规模验证 探究肝细胞癌中MAIT细胞功能失调的机制 肝细胞癌患者样本和小鼠模型 单细胞生物学 肝癌 scRNA-seq, 流式细胞术, CODEX成像 机器学习 单细胞转录组数据, 空间成像数据 配对患者样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
34 2025-10-06
Single-cell profiling of Anopheles gambiae spermatogenesis defines the onset of meiotic silencing and premeiotic overexpression of the X chromosome
2023-08-15, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术解析了冈比亚按蚊精子发生过程,揭示了X染色体减数分裂前过表达和减数分裂沉默的起始机制 首次在冈比亚按蚊中通过单细胞RNA测序定义了精子发生过程中的八个细胞簇,揭示了X染色体在减数分裂前细胞中的过表达现象及其减数分裂沉默的起始阶段 研究仅聚焦于精子发生过程,未涉及卵子发生或其他生殖细胞发育阶段 解析冈比亚按蚊生殖细胞发育和基因调控机制,为开发针对这种疟疾媒介蚊的遗传控制策略提供基础 冈比亚按蚊的生殖细胞和精子发生过程 单细胞基因组学 疟疾 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 四个不同的细胞群体,八个细胞簇 NA 单细胞RNA-seq NA NA
35 2025-10-06
Single-cell transcriptomics identifies prothymosin α restriction of HIV-1 in vivo
2023-08-02, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析鉴定出prothymosin α作为HIV-1体内感染的限制因子 首次使用单细胞转录组技术在全基因组范围内鉴定出prothymosin α与HIV-1控制的关联,并在体外验证其抑制功能 样本量相对有限(29名参与者),需要在更大人群中验证 鉴定HIV-1体内感染的限制性宿主因子 HIV-1感染者的免疫细胞 单细胞生物学 HIV/AIDS 单细胞转录组测序 NA 单细胞RNA测序数据 29名HIV-1感染者(1名深度测序+28名验证) NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2025-10-06
Location of CD39+ T cell subpopulations within tumors predict differential outcomes in non-small cell lung cancer
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过多重免疫荧光和RNA测序技术,揭示了CD39+T细胞亚群在非小细胞肺癌肿瘤组织中的空间分布特征及其与患者预后的关系 首次系统揭示CD39+T细胞在肿瘤基质和肿瘤巢中的差异化分布模式及其对预后的相反影响,发现CD39+CD103+CD8+T细胞在肿瘤巢中的密度与良好预后相关 样本量相对有限(162例),仅针对早期未治疗患者,缺乏多中心验证 探究CD39和CD73在非小细胞肺癌中的预后意义及免疫抑制机制 162例早期未治疗非小细胞肺癌患者组织样本及T细胞亚群 数字病理学 肺癌 多重免疫荧光,流式细胞术,靶向RNA测序,单细胞RNA测序 NA 图像,基因表达数据 162例早期未治疗NSCLC患者 NA RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
37 2025-10-06
Platelet-derived factors dysregulate placental sphingosine-1-phosphate receptor 2 in human trophoblasts
2023-08, Reproductive biomedicine online IF:3.7Q1
研究论文 本研究探讨了人胎盘中S1PR1-S1PR3的表达动态及其在滋养细胞中受血小板衍生因子调控的机制 首次系统揭示胎盘S1PR2在妊娠过程中的表达变化及其受血小板衍生因子特异性调控 研究主要使用BeWo细胞系进行体外实验,需进一步验证在原代滋养细胞中的结果 探究人胎盘中S1PR1-S1PR3的定位及其在不同条件下表达调控机制 人胎盘组织、原代胎盘细胞、BeWo滋养细胞系 生殖生物学 妊娠相关疾病 定量PCR、免疫染色、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、免疫组织化学数据 早期妊娠(n=10)、早产(n=9)、足月(n=10)胎盘样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
38 2025-10-06
Origin and segregation of the human germline
2023-08, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究通过体外模型和单细胞转录组学揭示了人类原始生殖细胞分化的分子机制 阐明了围着床期外胚层发育过程中生殖细胞命运获得能力的分子特征,发现TFAP2A在启动PGC命运中的关键作用 无法直接研究人类胚胎,需依赖体外模型和非人灵长类动物数据 研究人类原始生殖细胞分化的动态过程 人类原始生殖细胞、羊膜细胞、非人灵长类动物(狨猴) 发育生物学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据、3D参考图谱 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
39 2025-10-06
Dedifferentiation and Proliferation of Artery Endothelial Cells Drive Coronary Collateral Development in Mice
2023-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示小鼠冠状动脉内皮细胞去分化能力决定侧支动脉发育的机制 首次发现新生儿动脉内皮细胞通过去分化和增殖驱动冠状动脉侧支发育,而成年细胞缺乏此能力 研究仅针对小鼠模型,尚未在人类中验证 探究冠状动脉再生潜力是否由内皮细胞去分化能力决定 小鼠冠状动脉内皮细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪, 免疫染色, 共聚焦成像 NA 基因表达数据, 图像数据 新生和成年小鼠冠状动脉内皮细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
40 2025-10-07
Relationship between chronic obstructive pulmonary disease and adiponectin concentrations: An updated meta-analysis and single-cell RNA sequencing
2023-Aug-18, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 通过荟萃分析和单细胞RNA测序探讨慢性阻塞性肺疾病与脂联素浓度的关系 结合传统荟萃分析与单细胞测序技术验证脂联素在COPD中的表达差异 纳入研究数量有限(18篇文献24项研究),未说明样本量具体数值 分析COPD与脂联素浓度的关联性 COPD患者和健康对照者 生物医学研究 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, 荟萃分析 NA 基因表达数据, 临床数据 18篇文献24项研究(未提供具体样本数) NA 单细胞RNA测序 NA GSE136831数据集
回到顶部