单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 341 - 359 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-08 |
Fascinating strategies of marine benthic organisms to cope with emerging pollutant: Titanium dioxide nanoparticles
2023-Aug-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2023.121538
PMID:37011780
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研究论文 | 研究海洋底栖生物如何应对新兴污染物——二氧化钛纳米颗粒的毒性和解毒机制 | 揭示了底栖有孔虫通过产生活性氧物种和利用有机化合物封装并排出二氧化钛纳米颗粒的独特策略 | NA | 探究二氧化钛纳米颗粒的细胞毒性和解毒机制 | 海洋底栖有孔虫 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞观察数据 | 一种海洋底栖有孔虫菌株 |
| 342 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals Müller glia coordinate retinal intercellular communication during light/dark adaptation via thyroid hormone signaling
2023-08-01, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwad007
PMID:36930538
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了小鼠视网膜在光照与黑暗适应过程中的细胞类型特异性转录组变化 | 首次揭示了Müller胶质细胞在光照与黑暗适应过程中通过甲状腺激素信号协调视网膜细胞间通讯的作用 | NA | 探究视网膜细胞在光照与黑暗适应过程中的细胞和分子水平上的相互作用 | 小鼠视网膜细胞在光照与黑暗适应过程中的转录组变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠视网膜细胞 |
| 343 | 2024-08-05 |
Single-cell Sequence Analysis Combined with Multiple Machine Learning to Identify Markers in Sepsis Patients: LILRA5
2023-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-023-01803-8
PMID:36920635
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析结合多种机器学习方法识别脓毒症患者的标志物LILRA5。 | 提出了结合单细胞层面和多种机器学习算法来识别脓毒症相关的标志基因，特别是LILRA5的诊断价值，表明LILRA5在脓毒症患者中的潜在应用。 | 本研究的样本量有限，主要集中在某些数据集的外部验证，可能不代表所有脓毒症患者的特征。 | 本研究旨在深入探索脓毒症患者的特定细胞亚群与疾病标志物。 | 研究对象为脓毒症感染的外周血单细胞，重点关注脓毒症表型的单核细胞。 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞测序 | 随机森林、支持向量机、最小绝对收缩和选择算子 | 细胞数据 | 29个外周血单细胞测序数据，包括来自10个脓毒症样本和19个健康样本的66,283个细胞 |
| 344 | 2024-08-05 |
Single-Cell Analysis of Patients with Axial Spondyloarthritis After Anti-TNFα Treatment: Experimental Data and Review of the Literature
2023-Aug, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-023-08959-z
PMID:36884135
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研究论文 | 本研究使用单细胞转录组学和蛋白质组学分析了抗TNFα治疗前后轴性脊柱关节炎患者的外周免疫景观 | 首次在单细胞水平上阐明了抗TNFα治疗对轴性脊柱关节炎患者的免疫细胞亚群影响 | 研究可能未涵盖所有免疫细胞亚群的功能，因此对轴性脊柱关节炎的整体免疫机制仍可能存在未解之处 | 阐明抗TNFα治疗对轴性脊柱关节炎患者免疫系统的影响 | 关注轴性脊柱关节炎患者的免疫细胞亚群及其在治疗前后的变化 | 数字病理学 | 轴性脊柱关节炎 | 单细胞转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | 轴性脊柱关节炎患者的外周免疫细胞 |
| 345 | 2024-08-05 |
Cancer-associated Fibroblasts in Bladder Cancer: Origin, Biology, and Therapeutic Opportunities
2023-08, European urology oncology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.euo.2023.02.011
PMID:36890105
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综述 | 本文综述了膀胱癌中与癌症相关的成纤维细胞的起源、生物学和治疗机会 | 提供了对膀胱癌中CAFs的分类、标志物及其表型和功能特性的深入理解 | 膀胱癌中CAFs的研究尚不如其他肿瘤广泛，现有知识深度不足 | 探讨CAFs在膀胱癌生物学中的作用，以改善患者管理 | 膀胱癌中与癌症相关的成纤维细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 文本 | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Cell-type profiling of the sympathetic nervous system using spatial transcriptomics and spatial mapping of mRNA
2023-08, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.577
PMID:36840366
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研究论文 | 本研究使用空间转录组学和mRNA的空间映射，分析了交感神经系统的细胞类型轮廓 | 创新性地结合了Slide-seq空间转录组学和单细胞RNA-seq，揭示了周围交感神经节内的神经祖细胞的分子特征 | 技术限制仍然妨碍了神经祖细胞群体的分子鉴定 | 探索交感神经系统的分子组成和细胞类型特征 | 新鲜冷冻小鸡躯干组织中神经祖细胞的分子鉴定 | 数字病理学 | NA | Slide-seq空间转录组学、单细胞RNA-seq、HiPlex RNAscope荧光原位杂交 | NA | 组织样本 | 新鲜冷冻小鸡躯干组织样本 |
| 347 | 2024-08-05 |
RNA helicase DHX15 exemplifies a unique dependency in acute leukemia
2023-08-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282066
PMID:36861414
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研究论文 | 该研究探讨了RNA解旋酶DHX15在急性淋巴细胞白血病中的独特依赖性 | 首次系统性评估了DHX15作为T-ALL依赖因子的独特功能及其在肿瘤细胞存活和白血病发生中的重要性 | 目前仍不清楚其它潜在的RNA结合蛋白在T-ALL转化中的角色 | 研究DHX15在T细胞急性淋巴母细胞白血病中的作用及其机制 | T细胞急性淋巴母细胞白血病及相关小鼠模型 | 数字病理学 | 急性淋巴细胞白血病 | 功能分析，转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 多个小鼠T-ALL模型 |
| 348 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of entorhinal cortex reveals widespread disruption of neuropeptide networks in Alzheimer's disease
2023-08, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.12979
PMID:36825405
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研究论文 | 本研究揭示了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 | 首次使用单细胞转录组数据明确了阿尔茨海默病中神经肽网络的广泛破坏 | 研究可能受限于样本大小和选择偏差 | 探讨神经肽网络在阿尔茨海默病中的破坏情况 | 阿尔茨海默病中颞叶皮层的神经肽表达情况 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA |
| 349 | 2024-08-08 |
GGC repeat expansion in NOTCH2NLC induces dysfunction in ribosome biogenesis and translation
2023-08-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awad058
PMID:36825461
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研究论文 | 研究探讨了NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制，特别是在神经元内核包涵体病（NIID）中的作用 | 使用患者特异性的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的三维大脑类器官（3DCOs）和细胞模型，揭示了NOTCH2NLC GGC重复序列扩展导致的核仁应激和核糖体生物发生及翻译功能障碍 | NA | 研究NOTCH2NLC基因中GGC重复序列扩展导致的神经毒性机制 | NOTCH2NLC基因中的GGC重复序列扩展及其在神经元内核包涵体病（NIID）中的作用 | 遗传学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 3D大脑类器官（3DCOs） | RNA | 使用患者特异性的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的三维大脑类器官（3DCOs）和细胞模型进行研究 |
| 350 | 2024-08-08 |
Chemoresistance in acute myeloid leukemia: An alternative single-cell RNA sequencing approach
2023-Aug, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.3129
PMID:36790759
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了急性髓系白血病（AML）细胞的遗传特征，以识别“7+3”诱导化疗耐药的潜在机制 | 本研究首次使用单细胞RNA测序技术分析AML细胞的遗传特征，揭示了化疗耐药AML细胞在早期造血过程中的提前积累现象 | 研究样本仅包括13名未经治疗的AML患者，可能不足以全面代表所有AML患者的情况 | 识别急性髓系白血病中“7+3”诱导化疗耐药的潜在机制 | 急性髓系白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 13名未经治疗的AML患者，共28,950个AML细胞 |
| 351 | 2024-08-08 |
Cellular Atlas of Senescent Lineages in Radiation- or Immunotherapy-Induced Lung Injury by Single-Cell RNA-Sequencing Analysis
2023-Aug-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2023.02.005
PMID:36792015
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了免疫疗法和放疗诱导的肺损伤中衰老细胞谱系的变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细解析了免疫疗法和放疗诱导的肺损伤中衰老细胞的积累及其病理机制 | 研究仅限于C57/BL6小鼠模型，尚未在人类中验证这些发现 | 探究免疫疗法和放疗诱导的肺损伤的细胞和分子机制 | C57/BL6小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 75,396个细胞 |
| 352 | 2024-08-08 |
Rhinovirus C causes heterogeneous infection and gene expression in airway epithelial cell subsets
2023-08, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.01.008
PMID:36796588
|
研究论文 | 研究揭示了鼻病毒C在呼吸道上皮细胞亚群中引起异质性感染和基因表达的现象 | 首次使用单细胞RNA测序技术展示了感染和未感染细胞上调抗病毒基因的相似动力学，并发现未感染的非纤毛细胞是促炎趋化因子的主要来源 | NA | 探究鼻病毒C在呼吸道上皮细胞中的感染机制及其对免疫反应的影响 | 呼吸道上皮细胞及其亚群 | NA | 哮喘，慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个呼吸道上皮细胞亚群 |
| 353 | 2024-08-05 |
Defining the cellular complexity of the zebrafish bipotential gonad
2023-Aug-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.18.524593
PMID:36712047
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研究论文 | 研究揭示了斑马鱼双潜性生殖腺发育过程中的细胞复杂性和相互作用 | 首次通过转基因报告和单细胞测序分析明确不同关键细胞类型到达斑马鱼生殖腺的时间 | 研究仅限于斑马鱼，可能不适用于其他物种的生殖腺发育研究 | 阐明早期双潜性生殖腺发育中的基本步骤和细胞类型 | 斑马鱼的双潜性生殖腺及其相关细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 215个唯一表达的基因 |
| 354 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing: Inhibited Notch2 signalling underlying the increased lens fibre cells differentiation in high myopia
2023-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13412
PMID:36717696
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞的转录组图谱，揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系。 | 首次揭示了高度近视中晶状体纤维细胞分化增加与Notch2信号通路抑制的关系，并验证了NOTCH2在高度近视晶状体上皮细胞中的下调作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，需要进一步在人类样本中验证这些发现。 | 探究高度近视中晶状体纤维细胞分化增加的细胞过程及其涉及的信号通路。 | 高度近视小鼠和对照小鼠的晶状体上皮细胞。 | 数字病理学 | 高度近视 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 50,375个单细胞 |
| 355 | 2024-08-08 |
Selective Clearance of Senescent Chondrocytes in Osteoarthritis by Targeting Excitatory Amino Acid Transporter Protein 1 to Induce Ferroptosis
2023-08, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2022.0141
PMID:36601724
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研究论文 | 本研究旨在探索衰老软骨细胞对铁死亡（一种铁依赖性的非凋亡细胞死亡形式）的抵抗机制。通过代谢组学和单细胞RNA测序，发现铁死亡代谢的过度激活是衰老软骨细胞的显著代谢特征之一。衰老软骨细胞通过过度表达膜蛋白EAAT1来提高细胞内谷氨酸水平并激活谷胱甘肽系统，从而抵抗铁死亡。使用EAAT1的特异性抑制剂UCPH-101和siRNA-EAAT1可以显著增加衰老软骨细胞对铁死亡的敏感性，并诱导细胞死亡，而对正常细胞无明显影响。通过关节内注射UCPH-101，可以选择性地抑制EAAT1，清除软骨中的衰老软骨细胞，改善软骨稳态，并显著延缓骨关节炎的进展。 | 本研究揭示了衰老软骨细胞通过过度表达EAAT1来抵抗铁死亡的机制，并发现EAAT1是骨关节炎抗衰老治疗的有效且特异性靶点。 | NA | 探索衰老软骨细胞对铁死亡的抵抗机制，并寻找骨关节炎的潜在治疗靶点。 | 衰老软骨细胞及其在骨关节炎中的作用。 | NA | 骨关节炎 | 代谢组学，单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 356 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive role of SPP1-CD44 in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma assessed by single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-022-04498-w
PMID:36469154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了分泌磷蛋白1（SPP1）及其在肝内胆管癌（ICC）肿瘤微环境中通过CD44的免疫抑制作用。 | 首次揭示了SPP1通过CD44在肝内胆管癌肿瘤微环境中对T细胞增殖的抑制作用，并识别了免疫抑制细胞因子TGFβ-3作为CD44的诱导因子。 | 研究基于已发表的转录组数据，可能受限于样本量和数据来源的多样性。 | 旨在阐明SPP1在肝内胆管癌中的生物学功能及其免疫抑制作用。 | 研究对象包括9名患者的肝内胆管癌及其邻近肝组织的细胞。 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 62,770个细胞 |
| 357 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the adverse effects of cadmium on the trajectory of neuronal maturation
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09775-5
PMID:36114956
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析镉对神经元成熟轨迹的不良影响 | 首次揭示了镉通过改变细胞阶段数量和阻碍细胞成熟来影响神经元成熟轨迹的分子机制 | NA | 探讨镉对神经元成熟的影响及其分子机制 | 新生小鼠侧脑室下区神经干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 神经干细胞在镉处理24小时后分化7天得到的神经元谱系细胞 |
| 358 | 2024-08-08 |
The aryl hydrocarbon receptor directs the differentiation of murine progenitor blastomeres
2023-08, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-022-09755-9
PMID:36029422
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序研究了早期胚胎发育阶段中芳香烃受体（AHR）对胚胎细胞分化的影响 | 首次揭示了AHR在胚胎发育早期作为分化调控因子的作用 | NA | 探讨AHR在哺乳动物胚胎发育中的调控作用及其对胚胎细胞分化的影响 | 早期胚胎发育阶段的2细胞、4细胞和8细胞胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 359 | 2024-08-08 |
AIF1 + CSF1R + MSCs, induced by TNF-α, act to generate an inflammatory microenvironment and promote hepatocarcinogenesis
2023-08-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32738
PMID:35989499
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了一种与炎症相关的特定MSC亚群，即AIF1+ CSF1R+ MSCs，并探讨了其在肝癌发生中的作用 | 首次揭示了AIF1+ CSF1R+ MSCs在肝癌发生前的微环境中存在，并通过TNF-α刺激通过TNFR1/SIRT1途径诱导 | 研究主要基于大鼠模型，未来需在人体中进一步验证 | 探讨炎症环境下内源性MSC的特性及其在肝癌发生中的作用 | AIF1+ CSF1R+ MSCs及其在肝癌发生中的作用 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠初级肝癌模型 |