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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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321 | 2024-08-07 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了肺腺癌(LUAD)患者的样本,全面描述了LUAD浸润性肥大细胞的特征 | 发现肥大细胞在LUAD中表现出功能异质性,并与CCR2+细胞毒性T细胞的招募有关,这可能是一种新的免疫治疗策略 | 研究结果显示肥大细胞和CCR2+细胞毒性T细胞的浸润与手术后良好预后相关,但未与化疗后生存改善相关 | 探究肥大细胞在肺腺癌中的调控和功能,以发现重新编程肿瘤微环境的潜在治疗策略 | 肺腺癌(LUAD)中的肥大细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个肺腺癌(LUAD)患者样本 |
322 | 2024-08-05 |
Small Gene Networks Delineate Immune Cell States and Characterize Immunotherapy Response in Melanoma
2023-08-03, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0563
PMID:37229623
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研究论文 | 该文章探讨了小基因网络如何区分免疫细胞状态并特征化黑色素瘤的免疫治疗反应 | 提出了一种新的方法,通过转录因子指导的共表达网络从大规模RNA测序数据中解构免疫功能状态 | 研究仅包括19个治疗过免疫检查点抑制剂的转移性黑色素瘤样本,样本量较小 | 研究免疫细胞在黑色素瘤中的状态及其与免疫治疗反应的关系 | 研究对象为CD45+免疫细胞以及接受免疫检查点抑制剂治疗的黑色素瘤样本 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | RNA测序 | NA | RNA数据 | 19个(发现数据集)和209个(验证数据集)黑色素瘤样本 |
323 | 2024-08-05 |
p53 deacetylation alleviates calcium oxalate deposition-induced renal fibrosis by inhibiting ferroptosis
2023-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114925
PMID:37236026
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研究论文 | 该研究揭示了p53去乙酰化如何通过抑制铁死亡减轻钙草酸盐沉积引起的肾纤维化 | 本研究首次将p53去乙酰化与钙草酸盐诱导的肾纤维化及其对铁死亡的调控联系起来 | 本研究未能完全阐明钙草酸盐引起的肾纤维化的所有机制 | 探讨钙草酸盐结石引起的肾纤维化机制及其与铁死亡的关系 | 重点研究肾结石患者及高草酸尿症小鼠中p53及铁死亡的表现 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | RNA-seq, 单细胞测序, 西方印迹分析 | NA | NA | 在慢性肾病患者和HK-2细胞系中进行的实验 |
324 | 2024-08-07 |
The single-cell landscape of alternative transcription start sites of diabetic retina
2023-08, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2023.109520
PMID:37236522
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研究论文 | 本研究通过基于5'-标签的单细胞RNA测序技术,分析了糖尿病视网膜中细胞类型特异性的替代转录起始位点(TSS)事件及其相关转录因子,并探讨了这些变化与糖尿病视网膜病变的关系 | 首次在单细胞水平上全面分析了糖尿病视网膜中不同细胞类型的替代TSS使用情况,并识别了可能的早期糖尿病视网膜病变标志物 | NA | 探究糖尿病视网膜中细胞类型特异性的替代TSS事件及其与疾病的关系 | 糖尿病视网膜中的细胞类型特异性替代TSS事件 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
325 | 2024-08-07 |
The multifaceted roles of CD4+ T cells and MHC class II in cancer surveillance
2023-08, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2023.102345
PMID:37245413
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研究论文 | 本文讨论了CD4+ T细胞和MHC II类分子在癌症监测中的多方面作用 | 通过单细胞转录组分析揭示了肿瘤中几种不同的CD4 T细胞分化状态,包括与有利或不利结果相关的细胞毒性和调节性亚群 | NA | 探讨肿瘤微环境中的细胞网络如何促进或阻碍CD4 T细胞的癌症监测 | CD4+ T细胞和MHC II类分子在癌症监测中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
326 | 2024-08-07 |
Bestrophin3 Deficiency in Vascular Smooth Muscle Cells Activates MEKK2/3-MAPK Signaling to Trigger Spontaneous Aortic Dissection
2023-08-15, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究探讨了Bestrophin3在血管平滑肌细胞中的缺乏如何通过激活MEKK2/3-MAPK信号通路引发主动脉夹层 | 揭示了Bestrophin3在调控血管平滑肌细胞表型转换和主动脉结构完整性中的关键作用,并提出Best3-MEKK2/3信号通路作为治疗主动脉夹层的新靶点 | NA | 研究Bestrophin3在血管疾病中的作用及其机制 | 血管平滑肌细胞和内皮细胞中的Bestrophin3缺乏 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析,共免疫沉淀结合质谱 | NA | RNA,蛋白质 | 包括Best3SMKO和Best3ECKO小鼠模型,以及人类主动脉夹层样本 |
327 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA seq identifies Plg-RKT-PLG as signals inducing phenotypic transformation of scar-associated macrophage in liver fibrosis
2023-08, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166754
PMID:37207518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,揭示了肝纤维化过程中瘢痕相关巨噬细胞(SAMs)的表型转化机制,并发现Plg-RKT-PLG信号在这一过程中起关键作用 | 首次揭示了Plg-RKT-PLG信号在肝纤维化过程中瘢痕相关巨噬细胞表型转化中的作用 | NA | 旨在表征瘢痕相关巨噬细胞并阐明其在肝纤维化过程中的转化机制 | 瘢痕相关巨噬细胞(SAMs)及其在肝纤维化中的作用 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | RNA | 使用胆管结扎(BDL)和四氯化碳(CCl)诱导的小鼠肝纤维化模型 |
328 | 2024-08-08 |
ScRNA-seq links dental fibroblasts heterogeneity with mechanoresponsiveness
2023-Aug, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13139
PMID:37221903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析了人类牙周韧带(PDL)和牙髓(DP)的细胞异质性及其与机械应答特性的关系 | 本研究首次揭示了PDL中存在一种特定的机械应答性成纤维细胞亚型,并阐明了其分子机制 | NA | 旨在解析牙源性软组织的细胞异质性和独特的机械应答特性及其分子机制 | 人类牙周韧带(PDL)和牙髓(DP)的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 人类牙周韧带(PDL)和牙髓(DP)的细胞样本 |
329 | 2024-08-05 |
Apposition of Fibroblasts With Metaplastic Gastric Cells Promotes Dysplastic Transition
2023-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.04.038
PMID:37196797
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研究论文 | 这篇文章研究了成纤维细胞与变性胃细胞的关系如何促进胃癌前病变的进展。 | 文章创新性地识别了四种不同亚群的成纤维细胞,并探讨了它们在变性转化中的作用。 | 研究主要基于患者样本,可能无法完全代表所有情况。 | 探讨成纤维细胞在胃癌前病变进展中的重要性和作用机制。 | 研究对象为来自胃癌患者的黏膜细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学 | NA | 组织切片,细胞培养 | 来源于胃癌患者的组织和细胞样本 |
330 | 2024-08-05 |
A novel T-cell proliferation-associated gene predicts prognosis and reveals immune infiltration in patients with oral squamous cell carcinoma
2023-Aug, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 这篇文章建立了一种新的T细胞增殖调节因子的标志物,以预测口腔鳞状细胞癌(OSCC)的预后。 | 创新点在于识别了T细胞增殖调节因子在OSCC中的预后价值,并通过生物标志物分类患者风险。 | 研究限制在于依赖于TCGA数据库的单一数据集,可能影响结果的广泛适用性。 | 该研究旨在探讨OSCC的T细胞增殖调节因子与患者预后的关系。 | 研究对象是口腔鳞状细胞癌患者及其肿瘤微环境。 | 数字病理学 | 口腔癌 | mRNA表达谱分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | TCGA队列中涉及的OSCC患者数量不明确 |
331 | 2024-08-08 |
Analysis of meristems and plant regeneration at single-cell resolution
2023-08, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2023.102378
PMID:37172363
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在解析植物分生组织和再生过程中的细胞异质性方面的应用 | scRNA-seq技术使得研究人员能够以前所未有的分辨率区分不同的植物细胞群体,描绘细胞周期连续体,并推断多样细胞类型在不同分生组织中的连续分化轨迹 | NA | 探讨scRNA-seq技术在揭示植物细胞类型、细胞状态及发育轨迹中的应用 | 植物分生组织和再生过程中的细胞类型和状态 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列 | NA |
332 | 2024-08-08 |
DLP printed hDPSC-loaded GelMA microsphere regenerates dental pulp and repairs spinal cord
2023-08, Biomaterials
IF:12.8Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分析,提供了非培养和单层培养的牙髓细胞图谱,并使用数字光处理(DLP)打印机制备了载有人牙髓干细胞(hDPSC)的微球,这些微球能够促进牙髓再生和脊髓修复。 | 本研究首次使用DLP打印技术制备载有hDPSC的微球,这些微球具有增强的干细胞特性和多向分化潜能,能够促进血管、神经和牙本质组织的形成。 | NA | 探索牙髓再生和脊髓修复的新疗法 | 牙髓细胞和脊髓损伤模型 | 生物医学工程 | 口腔疾病 | 数字光处理(DLP)打印技术 | NA | 细胞 | 涉及大鼠和裸鼠的脊髓损伤模型以及迷你猪的牙髓再生实验 |
333 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomes Analyses Identify Intrinsic HNSCC Subtypes with Distinct Prognoses and Therapeutic Vulnerabilities
2023-Aug-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3563
PMID:37192003
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞和批量RNA测序数据,确定了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的内在上皮亚型,并评估了它们的分子特征和临床意义 | 提出了三种内在共识分子亚型(iCMS1-3),并开发了用于患者预后和治疗反应预测的新型机器学习特征 | NA | 定义HNSCC的内在上皮亚型,并评估其分子特征和临床意义 | HNSCC的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习 | RNA测序数据 | 1,325名患者 |
334 | 2024-08-08 |
Tr1 cell-mediated protection against autoimmune disease by intranasal administration of a fusion protein targeting cDC1 cells
2023-08, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.05.006
PMID:37192682
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研究论文 | 本文开发了一种针对自身免疫疾病的治疗性疫苗新策略,通过鼻内给药融合蛋白tolerogen,诱导Tr1细胞产生IL-10,抑制效应CD4 T细胞反应,从而减轻多发性硬化症模型的临床症状 | 首次报道了通过鼻内给药融合蛋白tolerogen,诱导Tr1细胞产生IL-10,抑制效应CD4 T细胞反应,有效减轻多发性硬化症模型的临床症状 | 治疗效果依赖于IL-27信号传导,且在缺乏IL-27Ra的骨髓嵌合体中无效 | 开发针对自身免疫疾病的治疗性疫苗新策略 | 多发性硬化症模型及其他自身免疫疾病 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 融合蛋白技术 | NA | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序分析了引流淋巴结中的树突状细胞 |
335 | 2024-08-05 |
Molecular Profiling Provides Clinical Insights Into Targeted and Immunotherapies as Well as Colorectal Cancer Prognosis
2023-08, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.04.029
PMID:37146911
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研究论文 | 该文章探讨了结直肠癌的肿瘤遗传测试及其在精准医学和免疫治疗中的临床意义 | 集成分析揭示了不同基因组背景下肿瘤免疫微环境的异质性以及针对结直肠癌的个性化治疗策略 | 研究主要集中在特定人群(中国患者),可能限制结果的普遍性 | 了解肿瘤遗传测试在结直肠癌管理中的重要性并优化个性化治疗 | 869名中国结直肠癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子测序、转录组测序、单细胞测序 | NA | 样本数据、基因组数据 | 869例结直肠癌患者的肿瘤样本 |
336 | 2024-08-05 |
Single-Cell Sequencing Informs That Mesenchymal Stem Cell Alleviates Renal Injury Through Regulating Kidney Regional Immunity in Lupus Nephritis
2023-08, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0047
PMID:37082951
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序系统地调查了间充质干细胞在系统性红斑狼疮性肾炎中的作用 | 首次系统性研究了间充质干细胞对肾脏区域免疫细胞的影响 | 过滤的细胞类型和机制仍需进一步探索 | 探讨间充质干细胞在狼疮性肾炎中的作用机制 | 狼疮性肾炎中的免疫细胞 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
337 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 研究抗CD19嵌合抗原受体T细胞疗法在复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者中的效果及肿瘤微环境的影响 | 首次揭示了M2亚型巨噬细胞在CAR-T细胞疗法失败和疾病进展中的作用,并提出了针对肿瘤微环境和免疫细胞代谢重编程的治疗策略 | 研究样本量较小,需要进一步的大规模临床试验验证 | 探讨CAR-T细胞疗法失败的原因及肿瘤微环境的影响 | 复发或难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | CAR-T细胞 | RNA | 22名可评估的弥漫大B细胞淋巴瘤患者 |
338 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing for Studying Human Cancers
2023-08-10, Annual review of biomedical data science
IF:7.0Q1
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)在人类癌症研究中的应用及其在癌症生物学中的进展 | scRNA-seq技术已应用于多种癌症类型和多样化的研究设计,以增进对肿瘤生物学、肿瘤微环境和治疗反应的理解 | scRNA-seq技术在癌症研究中面临特定的计算挑战 | 回顾scRNA-seq在癌症生物学中的进展并讨论其计算挑战 | 单细胞RNA测序技术及其在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 数千个scRNA-seq研究 |
339 | 2024-08-05 |
Identification of HDAC4 as a potential therapeutic target and prognostic biomarker for ZFTA-fused ependymomas
2023-08, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-023-00616-z
PMID:37041276
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研究论文 | 本研究识别了HDAC4作为ZFTA融合的脑室上皮肿瘤的潜在治疗靶标和预后生物标志物 | 首次分析了HDAC家族在脑室上皮肿瘤中的作用,并确立了HDAC4作为预后指标 | 尚未阐明HDAC家族其他成员在脑室上皮肿瘤中的具体角色 | 研究HDAC家族在脑室上皮肿瘤中的生物学作用 | ZFTA融合的脑室上皮肿瘤样本 | 数字病理学 | 脑室上皮瘤 | 单细胞RNA测序、定量实时聚合酶链反应、免疫组化 | NA | 转录组数据 | 十八个HDAC基因的样本 |
340 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of a COVID-19-associated maculopapular rash in a patient with psoriasis treated with ustekinumab
2023-Aug, The Journal of dermatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1111/1346-8138.16793
PMID:37002794
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了一位接受ustekinumab治疗的银屑病患者在感染COVID-19后出现的丘疹性皮疹的转录组特征 | 首次对COVID-19相关皮疹进行了转录组分析,揭示了ACE2+角质形成细胞的深刻转录变化和炎症免疫细胞的特征 | 研究样本仅为单一病例,结果的普遍性有待进一步验证 | 探讨COVID-19相关皮疹的转录组特征及其与SARS-CoV-2相关皮肤状况的关系 | COVID-19感染患者的丘疹性皮疹及其与健康皮肤和未治疗的银屑病皮损的比较 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 单一病例 |