单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-07 |
Impact of delayed PBMC processing on functional and genomic assays
2023-08, Journal of immunological methods
IF:1.6Q4
DOI:10.1016/j.jim.2023.113514
PMID:37353001
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研究论文 | 本研究探讨了外周血单个核细胞（PBMCs）处理延迟对其功能和基因组分析的影响 | 首次系统评估了PBMC处理延迟对下游分析（如流式细胞术、单细胞RNA测序和ELISpot分析）的影响 | 研究仅限于健康成人样本，未涵盖疾病状态下的PBMC处理延迟影响 | 评估PBMC处理延迟对下游分析结果的影响，以指导临床试验设计 | 来自20名健康成人的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、ELISpot分析 | NA | 基因表达数据 | 20名健康成人 |
| 302 | 2024-08-07 |
STING regulates the transformation of the proinflammatory macrophage phenotype by HIF1A into autoimmune myocarditis
2023-Aug, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110523
PMID:37354779
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研究论文 | 研究探讨了STING在自身免疫性心肌炎中的作用及其通过HIF1A调控促炎巨噬细胞表型的分子机制 | 首次揭示了STING通过HIF1A调控促炎巨噬细胞表型在自身免疫性心肌炎发病机制中的作用 | NA | 探究STING在自身免疫性心肌炎中的作用及其分子机制 | BALB/c小鼠及人类自身免疫性心肌炎心脏样本中的巨噬细胞 | NA | 自身免疫性心肌炎 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | 六周龄雄性BALB/c小鼠及人类自身免疫性心肌炎心脏样本 |
| 303 | 2024-08-07 |
Single-cell and bulk transcriptomics reveals M2d macrophages as a potential therapeutic strategy for mucosal healing in ulcerative colitis
2023-Aug, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110509
PMID:37369160
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研究论文 | 本文通过单细胞和批量转录组测序分析，揭示了M2d巨噬细胞在溃疡性结肠炎黏膜愈合中的潜在治疗作用 | 首次详细探讨了M2d巨噬细胞在溃疡性结肠炎黏膜愈合中的作用机制，并通过轨迹分析和CellChat分析揭示了M1和M2d巨噬细胞在UC和健康组中的分化差异 | 在利用M2d巨噬细胞作为治疗靶点之前，需要建立可靠的分离和纯化M2d巨噬细胞的方法 | 探讨不同巨噬细胞亚型在溃疡性结肠炎黏膜愈合中的作用 | 巨噬细胞亚型及其在溃疡性结肠炎中的作用 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞和批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 304 | 2024-08-07 |
Elevated intracellular pH of zygotes during mouse aging causes mitochondrial dysfunction associated with poor embryo development
2023-08-20, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2023.111991
PMID:37336488
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研究论文 | 研究揭示了衰老导致小鼠受精卵内细胞质pH升高，进而引发线粒体功能障碍和胚胎发育不良的机制 | 首次发现衰老引起受精卵内细胞质pH升高，并通过单细胞转录组测序识别出与年轻和老年受精卵差异表达的120个基因 | 研究主要集中在受精卵阶段，未涉及胚胎发育后续阶段的详细机制 | 阐明衰老对小鼠植入前胚胎质量和发展不良的影响机制 | 小鼠受精卵及其基因表达 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠受精卵 |
| 305 | 2024-08-07 |
Repurposing of the multiciliation gene regulatory network in fate specification of Cajal-Retzius neurons
2023-08-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.05.011
PMID:37321213
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术重构了从小鼠海马体衍生的Cajal-Retzius神经元的分化轨迹，并揭示了控制多纤毛生成的完整基因模块在Cajal-Retzius神经元中的短暂表达。 | 研究展示了如何重新利用一个完整的基因模块来控制不同的过程，从而有助于新细胞身份的出现。 | NA | 探讨Cajal-Retzius神经元的命运特化过程中多纤毛基因调控网络的重新利用。 | Cajal-Retzius神经元及其在脑皮质发育中的作用。 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠海马体衍生的Cajal-Retzius神经元样本 |
| 306 | 2024-08-07 |
The maturation and aging trajectory of Marchantia polymorpha at single-cell resolution
2023-08-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.05.014
PMID:37321217
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研究论文 | 本文利用时间分辨的单细胞RNA测序技术，定义了Marchantia polymorpha在无性繁殖阶段的细胞分类学，并识别了其主要植物体在单细胞分辨率下的成熟和衰老轨迹。 | 首次在单细胞分辨率下定义了Marchantia polymorpha的细胞类型和转录状态，揭示了其时间和空间上的发育和衰老过程。 | NA | 研究苔藓植物Marchantia polymorpha的细胞异质性及其在时间和空间上的发育和衰老过程。 | Marchantia polymorpha的细胞类型和转录状态。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 307 | 2024-08-05 |
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162201
PMID:37338986
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研究论文 | 该论文探讨了ruxolitinib如何通过恢复间充质基质细胞功能来改善急性移植物抗宿主病中的造血恢复。 | 此研究首次全面分析了急性移植物抗宿主病中骨髓间充质基质细胞的功能损伤，并提出ruxolitinib可以通过JAK2/STAT1途径直接恢复其功能。 | 该研究主要基于小鼠模型，临床转化的具体过程和效果仍需进一步验证。 | 研究目的是解决急性移植物抗宿主病所导致的造血功能障碍问题。 | 研究对象包括小鼠模型和患者样本中的非造血性骨髓细胞。 | 数字病理学 | 急性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | haplo-MHC匹配小鼠移植模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型及患者样本，但确切样本数量未提供 |
| 308 | 2024-08-07 |
AGRN promotes lung adenocarcinoma progression by activating Notch signaling pathway and acts as a therapeutic target
2023-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.106819
PMID:37321467
|
研究论文 | 本研究探讨了AGRN在肺腺癌进展中的作用及其通过激活Notch信号通路的机制 | 首次阐明了AGRN在肺腺癌中的上调表达及其通过与NOTCH1相互作用激活Notch信号通路的机制 | 研究样本量有限，需要进一步的大规模临床研究验证 | 揭示AGRN在肺腺癌发展中的作用及其调控机制，并探索其作为治疗靶点的潜力 | AGRN在肺腺癌中的表达及其对肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学 | NA | RNA | 120名肺腺癌患者 |
| 309 | 2024-08-07 |
Innovations advancing our understanding of microglia in Alzheimer's disease: From in vitro to in vivo models
2023-08, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15885
PMID:37323026
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综述 | 本文综述了近年来在阿尔茨海默病中对小胶质细胞研究的创新方法，包括使用人多能干细胞（hPSC）衍生的小胶质细胞在2D或3D培养系统中的应用，以及将hPSC衍生的小胶质细胞异种移植到小鼠大脑中 | 引入了人多能干细胞衍生的小胶质细胞模型，以及单细胞RNA测序和脑类器官培养等新技术 | 现有研究常受限于仅能代表人类组织的一个时间点或由于物种间小胶质细胞转录组、蛋白质组和细胞状态的差异 | 提高对阿尔茨海默病中小胶质细胞复杂作用的认识 | 小胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 310 | 2024-08-07 |
Optimization of method for achieving a single-cell suspension from mouse corneas
2023-08, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2023.109544
PMID:37336469
|
研究论文 | 本研究旨在优化从鼠角膜中获取单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序技术 | 研究比较了五种不同的鼠角膜消化方法，确定了最佳的消化方案 | 研究仅限于鼠角膜，未涉及其他组织或物种 | 优化从鼠角膜中获取单细胞悬液的方法，以用于单细胞RNA测序 | 鼠角膜 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 5个鼠角膜 |
| 311 | 2024-08-07 |
Intravital imaging of three different microvascular beds in SARS-CoV-2-infected mice
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009430
PMID:37307197
|
研究论文 | 本研究使用活体显微镜在三级生物安全级别下观察了表达人血管紧张素转换酶2（ACE-2）的小鼠体内SARS-CoV-2感染的三种不同微血管床的病理过程 | 首次通过活体显微镜直接观察到SARS-CoV-2感染小鼠肺部和脑部微循环的显著扰动，以及由此导致的局部炎症和血栓形成 | 研究仅限于小鼠模型，且使用了特定的ACE-2表达小鼠，可能限制了研究结果的普遍性 | 探究SARS-CoV-2感染对小鼠不同器官微血管床的影响 | SARS-CoV-2感染的小鼠及其不同器官的微血管床 | NA | NA | 活体显微镜 | NA | 图像 | 表达人ACE-2的小鼠（CAG-AC-70和K18-promoter） |
| 312 | 2024-08-05 |
A posterior probability based Bayesian method for single-cell RNA-seq data imputation
2023-08, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2023.06.004
PMID:37315825
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研究论文 | 本文提出了一种BayesImpute方法，用于推断和填补单细胞RNA-seq数据中的缺失事件 | BayesImpute利用基因的表达率和变异系数来确定缺失事件，并通过后验分布推断缺失值，具有较快的速度和最小的内存使用 | 未提及具体的局限性 | 研究单细胞RNA-seq数据的缺失值插补问题 | 针对单细胞RNA-seq数据中的掉落事件进行推断和填补 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据 | 模拟和真实实验示例 |
| 313 | 2024-08-05 |
Overexpression of sirtuin 1 attenuates calcium oxalate-induced kidney injury by promoting macrophage polarization
2023-Aug, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110398
PMID:37301123
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研究论文 | 这项研究探讨了SIRT1在钙草酸盐导致肾损伤中的作用与机制 | 本研究首次揭示了SIRT1通过抑制NOTCH信号通路促进巨噬细胞极化，从而减少钙草酸盐结晶沉积和肾损伤的机制 | 本研究未探讨SIRT1在不同类型的肾脏疾病中的普遍性 | 研究SIRT1对钙草酸盐引起的肾小管上皮细胞损伤的影响 | 研究对象为钙草酸盐处理的巨噬细胞及其在小鼠肾脏中的作用 | NA | 肾结石 | 单细胞测序, RT-qPCR, 免疫染色, Western blot | NA | NA | 小鼠模型中进行的实验 |
| 314 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics combined with single-cell RNA-sequencing unravels the complex inflammatory cell network in atopic dermatitis
2023-08, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15781
PMID:37312623
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研究论文 | 这项研究揭示了特应性皮炎中复杂的炎性细胞网络 | 首次深入探讨了特应性皮炎皮损区域中细胞间的相互作用和不同细胞群体的独特特征 | 研究样本数量相对较小，且仅限于特定区域的皮肤组织 | 了解特应性皮炎皮肤中的细胞和分子相互作用 | 来自健康对照和特应性皮炎患者的皮肤组织样本 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 空间转录组测序和单细胞RNA测序 | NA | 皮肤组织样本、血清样本 | 6名健康对照，7名特应性皮炎患者（病变和非病变） |
| 315 | 2024-08-05 |
Platelet-derived factors dysregulate placental sphingosine-1-phosphate receptor 2 in human trophoblasts
2023-08, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2023.04.006
PMID:37301709
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研究论文 | 本文研究了人类滋养层细胞中血小板来源因子对胎盘鞘氨醇-1-磷酸受体2的调控作用 | 本研究首次揭示了胎盘S1PR亚型在妊娠过程中表达的差异性以及血小板来源因子对S1PR2表达的负面影响 | 研究中样本量相对较小，可能影响结果的推广性 | 探讨血小板来源因子对胎盘中S1PR表达的影响及其变化模式 | 研究对象为不同妊娠阶段的人类胎盘样本及其中的滋养层细胞 | 数字病理学 | NA | 定量聚合酶链反应、单细胞RNA测序、免疫染色 | NA | 生物样本 | 第一三个月（n=10）、早产（n=9）和足月（n=10），共29份胎盘样本 |
| 316 | 2024-08-07 |
Enhancing the sensitivity of bacterial single-cell RNA sequencing using RamDA-seq and Cas9-based rRNA depletion
2023-Aug, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2023.05.010
PMID:37311684
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研究论文 | 本文介绍了一种结合随机位移扩增测序（RamDA-seq）和基于Cas9的rRNA耗竭方法，用于提高细菌单细胞RNA测序的敏感性 | 该方法允许从低丰度的细菌RNA中进行cDNA扩增和随后的测序文库制备，相比传统方法，在较少的测序努力下能够检测到更多的基因 | NA | 旨在解决通过群体水平基因表达分析揭示稀有亚群和基因表达异质性的挑战 | 细菌单细胞RNA测序方法 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从单个大肠杆菌细胞中检测到超过1000个基因 |
| 317 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Peripheral Neutrophils From Patients With Idiopathic Pulmonary Arterial Hypertension
2023-08, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了特发性肺动脉高压患者外周中性粒细胞的细胞表型和候选基因 | 首次提供了特发性肺动脉高压患者中性粒细胞的参考图谱，并验证了差异上调基因在疾病中的作用 | NA | 旨在提供中性粒细胞的参考图谱，以促进对细胞表型的更好理解并发现候选基因 | 特发性肺动脉高压患者的外周中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 特发性肺动脉高压患者和匹配对照组的外周中性粒细胞 |
| 318 | 2024-08-07 |
Identification of evolutionary mechanisms of myelomatous effusion by single-cell RNA sequencing
2023-08-08, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022009477
PMID:37276129
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的转录组，以识别多发性骨髓瘤浆膜腔积液的进化机制 | 本研究首次定义了外周起始细胞（EMICs）并发现LILRB4在其中的上调，证实了LILRB4促进骨髓瘤细胞的体外迁移 | 研究样本量较小，仅涉及3名患者 | 探索多发性骨髓瘤浆膜腔积液的分子机制 | 骨髓、外周血和胸腔积液/腹水中的细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 3名患者 |
| 319 | 2024-08-05 |
Somatosensory neuron types and their neural networks as revealed via single-cell transcriptomics
2023-08, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2023.05.005
PMID:37268541
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在脊髓后根神经节（DRG）神经元类型及其神经网络研究中的应用 | 整合了以往DRG转录组研究的发现，并提出进一步研究的建议 | 缺乏统一的分类标准，使得DRG神经元的类型鉴定存在困难 | 旨在全面了解DRG神经元的转录状态及其在生理和慢性疼痛中的作用 | 主要研究脊髓后根神经节中的不同类型神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 320 | 2024-08-07 |
Mapping the transcriptional landscape of human white and brown adipogenesis using single-nuclei RNA-seq
2023-08, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2023.101746
PMID:37286033
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研究论文 | 通过单核RNA测序技术研究人类白色和棕色脂肪细胞分化的转录组动态变化 | 首次使用单核RNA测序技术构建了人类白色和棕色脂肪细胞分化的高分辨率转录组图谱，并发现了新的转录因子TRPS1在脂肪细胞分化中的作用 | 研究仅限于单个个体的颈部区域细胞，可能无法完全代表所有人群 | 深入理解人类脂肪细胞分化的分子调控机制 | 人类白色和棕色脂肪细胞的分化过程 | 数字病理学 | 代谢疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA序列 | 超过20,000个正在分化的白色和棕色前脂肪细胞 |