单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
Systemic host inflammation induces stage-specific transcriptomic modification and slower maturation in malaria parasites
2023-08-31, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01129-23
PMID:37449844
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研究论文 | 本文研究了系统性宿主炎症对疟原虫在红细胞内成熟速度的影响 | 发现宿主炎症反应可以减缓疟原虫的成熟过程，并识别出可能抑制疟原虫成熟的候选代谢物 | NA | 探讨宿主炎症反应对疟原虫成熟的影响 | 疟原虫在红细胞内的成熟过程 | NA | 疟疾 | scRNA-seq | NA | 代谢物 | 小鼠模型 |
| 282 | 2024-08-07 |
Identifying a Lung Stem Cell Subpopulation by Combining Single-Cell Morphometrics, Organoid Culture, and Transcriptomics
2023-08-16, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad044
PMID:37468433
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研究论文 | 本文通过结合单细胞形态学、类器官培养和转录组学，建立了一种新的单细胞分析方法scMORN，用于揭示肺组织干细胞的亚群 | 开发了一种名为scMORN的新方法，整合了单细胞形态学、类器官形成实验和RNA测序，以揭示组织干细胞的亚群及其分化潜能 | NA | 探索肺上皮干细胞，并揭示其亚群及其分化潜能 | 肺组织干细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及多种肺干细胞，包括基底细胞、杯状细胞和肺泡类型2细胞 |
| 283 | 2024-08-05 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学，对患有社交压力相关抑郁症状的雌性猕猴的背外侧前额叶皮层进行了分析 | 首次揭示了与抑郁样行为相关的微胶质细胞特异性基因表达变化 | 研究主要集中于特定物种的特定行为，可能无法完全推广至其他物种或抑郁症的所有方面 | 探讨与抑郁样行为相关的细胞和分子机制 | 雌性猕猴，这些猕猴表现出社会压力相关的抑郁样行为 | 数字病理学 | 抑郁症 | 单核RNA测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 通过分析雌性猕猴的背外侧前额叶皮层得到的数据，样本数量未具体列出 |
| 284 | 2024-08-07 |
Integrated multiomic analysis and high-throughput screening reveal potential gene targets and synergetic drug combinations for osteosarcoma therapy
2023-Aug, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.317
PMID:37457661
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研究论文 | 本研究通过综合多组学分析和高通量筛选，揭示了骨肉瘤治疗中潜在的基因靶点和协同药物组合 | 首次通过长读RNA测序和基于串联质谱标签（TMT）的定量蛋白质组学，结合下一代测序（NGS）和高通量药物组合筛选，全面分析了骨肉瘤的分子特征和治疗靶点 | NA | 旨在发现骨肉瘤治疗的新基因靶点和协同药物组合 | 骨肉瘤及其邻近正常组织，骨肉瘤细胞系 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 长读RNA测序，串联质谱标签（TMT）定量蛋白质组学，下一代测序（NGS） | NA | RNA序列，蛋白质组数据 | 骨肉瘤和邻近正常组织样本，骨肉瘤细胞系 |
| 285 | 2024-08-07 |
FDG uptake reflects an immune-enriched subtype of thyroid cancer: Clinical implications of imaging-based molecular characterization
2023-08, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6350
PMID:37466323
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研究论文 | 本文通过转录组分析研究了甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境（TME）之间的关系，并探讨了FDG摄取在甲状腺癌中的临床意义。 | 本文首次探讨了甲状腺癌中FDG摄取与免疫细胞富集的TME之间的关联，并提出了FDG摄取作为免疫富集型甲状腺癌的标志。 | NA | 研究甲状腺癌中葡萄糖代谢与肿瘤微环境的关系，并探讨FDG摄取的临床意义。 | 甲状腺癌及其肿瘤微环境中的葡萄糖代谢和免疫细胞。 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | F-18 FDG PET、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA序列 | NA |
| 286 | 2024-08-07 |
Assessment of the Cardiac Noncoding Transcriptome by Single-Cell RNA Sequencing Identifies FIXER, a Conserved Profibrogenic Long Noncoding RNA
2023-08-29, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序评估心脏非编码转录组，识别出一种保守的促纤维化长非编码RNA——FIXER | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，在心脏非心肌细胞中鉴定出富集于相关成纤维细胞亚群的长非编码RNA，并发现FIXER的沉默能限制纤维化并改善心脏功能 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术评估心脏非编码转录组，寻找心脏疾病治疗的新靶点 | 心脏非心肌细胞中的长非编码RNA | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 287 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq explore the prognostic value of exhausted T cells in hepatocellular carcinoma
2023-08, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.12072
PMID:37431788
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研究论文 | 该文章探讨了耗竭T细胞在肝细胞癌中的预后价值 | 提供了关于耗竭T细胞及其临床重要性的详尽特征分析，并构建了一个稳健的预后模型 | 研究可能受限于数据库的样本量和选择偏差 | 调查耗竭T细胞在肝细胞癌进展中的作用和预后价值 | 肝细胞癌患者的T细胞演变及其临床结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序和大规模RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了GSE146115和国际癌症基因组数据库中的患者信息 |
| 288 | 2024-08-05 |
SCS: cell segmentation for high-resolution spatial transcriptomics
2023-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-023-01939-3
PMID:37429992
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的细胞分割方法SCS，以提高次细胞空间转录组学的精度 | SCS结合了成像数据与测序数据，通过自适应学习的Transformer神经网络来改进细胞分割的准确性 | 未提及具体的局限性 | 该研究旨在提高高分辨率空间转录组学中细胞分割的准确性 | 研究对象为应用在新的次细胞空间转录组学技术上的细胞分割 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Transformer神经网络 | 成像数据和测序数据 | 在两种新的次细胞空间转录组学技术上的测试 |
| 289 | 2024-08-05 |
AXL+SIGLEC6+ dendritic cells in cerebrospinal fluid and brain tissues of patients with autoimmune inflammatory demyelinating disease of CNS
2023-08, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109686
PMID:37414380
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研究论文 | 本研究识别了自身免疫性炎症性脱髓鞘疾病患者中AXL+SIGLEC6+树突细胞的存在 | 首次在人体中识别了AXL+SIGLEC6树突细胞，并发现其在CNS自体免疫中的潜在作用 | 样本数量较小，仅涉及9名患者 | 研究AXL+SIGLEC6树突细胞在自身免疫性炎症性脱髓鞘疾病中的作用 | 来自自身免疫性炎症性脱髓鞘疾病患者及实验性自身免疫性脑脊髓炎模型的样本 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 血液和脑脊液样本 | 9名自身免疫性炎症性脱髓鞘疾病患者的配对样本 |
| 290 | 2024-08-07 |
Integrated analyses reveal the prognostic, immunological features and mechanisms of cuproptosis critical mediator gene FDX1 in KIRC
2023-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-023-00211-0
PMID:37430022
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，探讨了铁氧还原蛋白1（FDX1）在肾透明细胞癌（KIRC）中的作用及其潜在分子机制 | 首次揭示了FDX1在KIRC中的预后和免疫学特征，并阐明了其通过LncRNA/RBP/FDX1网络的分子机制 | NA | 探索FDX1在肾透明细胞癌中的作用及其分子机制 | FDX1基因在肾透明细胞癌中的表达及其对预后和免疫反应的影响 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 291 | 2024-08-07 |
Identification of angiogenesis-related genes signature for predicting survival and its regulatory network in glioblastoma
2023-08, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.6316
PMID:37434432
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研究论文 | 本研究旨在识别与胶质母细胞瘤（GBM）预后相关的血管生成相关基因及其潜在调控机制 | 构建了基于9个预后相关血管生成相关基因的风险预测模型，并建立了以三个关键基因为中心的调控网络 | NA | 识别胶质母细胞瘤中的预后相关血管生成相关基因及其调控机制 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 173名胶质母细胞瘤患者 |
| 292 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq Revealed that Altered Tumor Infiltrating Lymphocytes in Cirrhotic Liver Indicate Development of Hepatocellular Carcinoma
2023-Aug-28, Journal of clinical and translational hepatology
IF:3.1Q2
DOI:10.14218/JCTH.2022.00062
PMID:37408821
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研究论文 | 本研究探讨了健康、肝硬化和肝细胞癌（HCC）肿瘤组织中的免疫微环境特征 | 发现肝硬化患者中减少的天真T细胞浸润和增加的中性粒细胞浸润可能是HCC发展的指征，并且这些免疫细胞亚群的动态变化可能作为新的生物标志物 | 本研究可能对肝硬化和HCC的生物标志物识别存在局限性，需进一步验证 | 旨在识别肝硬化向HCC过渡的免疫生物标志物 | 研究对象包括健康肝、肝硬化肝和HCC肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 样本表达矩阵 | NA |
| 293 | 2024-08-05 |
Probabilistic tensor decomposition extracts better latent embeddings from single-cell multiomic data
2023-08-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad570
PMID:37403780
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研究论文 | 该文章提出了一种概率张量分解框架，SCOIT，用于从单细胞多组学数据中提取嵌入。 | SCOIT结合了多种分布来处理稀疏、嘈杂和异质的单细胞数据，提升了嵌入的提取质量。 | NA | 研究单细胞多组学数据的嵌入提取和分析方法。 | 八个来自不同测序协议的单细胞多组学数据集。 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 多组学数据 | 八个单细胞多组学数据集 |
| 294 | 2024-08-07 |
DOT1L activity affects neural stem cell division mode and reduces differentiation and ASNS expression
2023-08-03, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256233
PMID:37382163
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研究论文 | 本文研究了组蛋白甲基转移酶DOT1L的酶活性对神经干细胞分裂模式的影响，并探讨了其对神经元分化和ASNS表达的调控作用 | 首次揭示了DOT1L通过调控神经干细胞的分裂模式和代谢基因的转录，影响神经元分化和ASNS表达 | NA | 探讨DOT1L在皮质神经发生中的作用及其分子机制 | 神经干细胞的分裂模式和神经元分化 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 295 | 2024-08-05 |
Developmental emergence of cortical neurogliaform cell diversity
2023-08-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201830
PMID:37401408
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研究论文 | 研究聚焦于皮层神经胶质细胞的多样性及其发育过程 | 揭示了皮层神经胶质细胞的分子亚型及其发育中的标志性转录因子Tox2的重要性 | 本研究主要集中于小鼠大脑皮层，可能不适用于其他物种的神经胶质细胞研究 | 探讨皮层神经胶质细胞的发育过程及其多样性 | 小鼠的皮层神经胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学, CRISPR-Cas9 | NA | NA | 使用小鼠模型的不同发育阶段的神经胶质细胞 |
| 296 | 2024-08-05 |
Integrated analysis identifies RAC3 as an immune-related prognostic biomarker associated with chemotherapy sensitivity in endometrial cancer
2023-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17824
PMID:37386813
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研究论文 | 本研究揭示了RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力 | 本研究首次指出RAC3在子宫内膜癌中的高表达与化疗敏感性之间的关系，并提出了其作为新型诊断生物标志物的可能性 | 本研究未提供RAC3在不同癌症类型中的比较数据，局限于子宫内膜癌的特定分析 | 探讨RAC3在子宫内膜癌中的作用及其作为化疗敏感性的生物标志物的潜力 | 本研究主要分析了子宫内膜癌组织中的RAC3的表达及其相关性 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本 | 基于TCGA，单细胞RNA测序，以及临床样本的分析 |
| 297 | 2024-08-07 |
PRRX1+MSCs Enhance Mandibular Regeneration during Distraction Osteogenesis
2023-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231176522
PMID:37387366
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研究论文 | 本研究通过建立犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型，探讨了牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的影响 | 首次通过单细胞RNA测序分析了下颌骨牵张成骨和骨缺损中的细胞差异，并验证了PRRX1+MSCs在牵张成骨中的重要作用 | 研究主要在犬模型中进行，未来需在人类中进一步验证 | 探讨牵张成骨过程中PRRX1+MSCs对下颌骨再生的作用及其机制 | 犬下颌骨牵张成骨和骨缺损模型中的间充质干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 细胞 | 26个细胞集群，代表6种主要细胞群体 |
| 298 | 2024-08-07 |
Updated skin transcriptomic atlas depicted by reciprocal contribution of single-nucleus RNA sequencing and single-cell RNA sequencing
2023-Aug, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2023.06.005
PMID:37407342
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序（snRNA-seq）与单细胞RNA测序（scRNA-seq）相结合的方法，更新了皮肤转录组图谱 | snRNA-seq能够使用冷冻、难以分离的材料，避免了scRNA-seq的局限性，并能更有效地检测转录因子 | NA | 通过snRNA-seq与scRNA-seq并行分析，绘制皮肤细胞图谱 | 皮肤细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 一个皮肤样本 |
| 299 | 2024-08-05 |
Spatially resolved transcriptomic analysis of the germinating barley grain
2023-08-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad521
PMID:37351575
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研究论文 | 本研究开发了一种空间转录组学工作流程，以分析发芽大麦种子的基因表达 | 开发了一种空间转录组学方法，以高通量分析种子发芽过程中的空间基因表达 | 缺乏对各个种子细胞类型的空间信息 | 探讨大麦发芽过程中基因表达的空间特征 | 发芽过程中的大麦种子 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 超过14,000个基因 |
| 300 | 2024-08-05 |
Disruption of cortical cell type composition and function underlies diabetes-associated cognitive decline
2023-08, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05935-2
PMID:37351595
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研究论文 | 这篇文章探讨了2型糖尿病对大脑皮层细胞类型组成和功能的影响，从而导致认知能力下降。 | 研究揭示了与功能调节破坏相关的细胞群体变化，包括神经元成熟和代谢改变，提出了潜在的治疗靶点。 | 本研究的限制在于仅使用m鼠模型，可能无法完全代表人类疾病的复杂性。 | 旨在阐明2型糖尿病对大脑皮层细胞的影响及其对认知能力下降的机制。 | 研究对象为2型糖尿病小鼠模型（db/db小鼠）与非糖尿病对照小鼠。 | 数字病理学 | 糖尿病相关认知下降 | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | db/db小鼠及非糖尿病对照小鼠，采集了74个糖尿病患者和87个非糖尿病患者的组织样本 |