单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-07 |
Heterogeneity of lipid metabolism and its clinical and immune correlation in lung adenocarcinoma
2023-Aug-18, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 研究肺腺癌中脂质代谢的异质性及其与临床和免疫的相关性 | 首次详细探讨了脂质代谢在肺腺癌中的作用及其与肿瘤微环境的关系 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏差 | 探讨脂质代谢在肺腺癌中的作用及其与临床和免疫的关系 | 肺腺癌患者的脂质代谢特征及其与肿瘤微环境和免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 包括4001个免疫细胞，其中483个恶性细胞和3518个正常细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-07 |
Increased NMDARs in neurons and glutamine synthetase in astrocytes underlying autistic-like behaviors of Gabrb1-/- mice
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107476
PMID:37599823
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研究论文 | 研究探讨了Gabrb1基因突变导致自闭症样行为的机制，通过RNA测序和单细胞RNA测序等技术，发现神经元中NMDARs和星形胶质细胞中谷氨酰胺合成酶的上调可能与自闭症样行为有关。 | 首次揭示了Gabrb1基因突变导致自闭症样行为的机制，特别是在神经元和星形胶质细胞中特定蛋白质的上调。 | 研究仅限于Gabrb1基因突变的特定小鼠模型，可能不完全适用于所有自闭症患者。 | 探究Gabrb1基因突变如何导致自闭症样行为。 | Gabrb1基因突变的小鼠模型及其神经和代谢变化。 | 神经科学 | 自闭症 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫荧光，电生理学，代谢物检测 | NA | RNA序列数据 | 特定细胞类型的小鼠脑组织 | NA | NA | NA | NA |
| 203 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomic analysis of the identity and function of fibro/adipogenic progenitors in healthy and dystrophic muscle
2023-Aug-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107479
PMID:37599828
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了健康和肌营养不良肌肉中成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs）的特性和功能 | 首次揭示了FAPs与间充质干细胞（MeSCs）之间的转录相似性，并确认了PDGFRα作为FAPs的报告基因，同时发现细胞外蛋白水解是FAPs的新功能 | NA | 探究FAPs在健康和肌营养不良肌肉中的特性和功能 | 成纤维/脂肪生成前体细胞（FAPs） | 数字病理学 | 肌营养不良 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 来自多个小鼠组织的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 204 | 2024-08-07 |
Construction of stemness gene score by bulk and single-cell transcriptome to characterize the prognosis of breast cancer
2023-08-18, Aging
DOI:10.18632/aging.204963
PMID:37602872
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研究论文 | 本研究构建了一个基于单细胞转录组数据的干细胞风险基因评分（SGS）模型，用于预测乳腺癌患者的预后 | 首次利用单细胞转录组数据构建干细胞风险基因评分模型，考虑了肿瘤异质性 | NA | 开发一种新的工具，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | ssGSEA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 205 | 2024-08-07 |
Interactive analysis of single-cell data using flexible workflows with SCTK2
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100814
PMID:37602214
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research paper | 本文介绍了Single-Cell Toolkit 2 (SCTK2)，一个集成多种流行工具和流程的单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析平台 | SCTK2通过整合多种工具和流程，提供了一个直观的图形用户界面，使得非计算用户也能无缝进行scRNA-seq数据分析 | NA | 开发一个集成化的工具包，以简化单细胞RNA测序数据的分析过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 206 | 2024-08-05 |
A standard for sharing spatial transcriptomics data
2023-Aug-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100374
PMID:37601972
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研究论文 | 该文章提供了一种共享空间转录组数据的标准模型 | 提出了一套必要的主要数据和元数据，以重现分析和促进计算方法的发展 | NA | 建立一种共享空间转录组数据的标准 | 空间转录组数据及其相关分析 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 数据和元数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 207 | 2024-08-05 |
A collaboration between immune cells and the choroid plexus epithelium in brain inflammation
2023-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.07.552298
PMID:37609192
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研究论文 | 该研究揭示了脉络丛在脑炎症中的免疫调节作用 | 提出了脉络丛作为复杂免疫器官的概念，并识别了在炎症过程中特殊化的上皮细胞 | 在小鼠模型中进行的研究可能不完全能够代表人类的情况 | 研究脉络丛在脑炎症中的作用及其与免疫细胞的相互作用 | 小鼠模型中的免疫细胞与脉络丛上皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 慢性双光子成像和单细胞转录组学 | NA | NA | 使用小鼠模型进行实验，样本规模为小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 208 | 2024-08-05 |
Regulatory roles of Osteopontin in lung epithelial inflammation and epithelial-telocyte interaction
2023-08, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1381
PMID:37605313
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研究论文 | 研究表明骨桥蛋白在肺上皮炎症和上皮细胞与间质细胞之间的相互作用中发挥调节作用 | 首次探讨了骨桥蛋白在急性和慢性肺损伤中对肺上皮炎症的调节机制 | 未能明确骨桥蛋白在不同肺炎症情况下的具体机制 | 探讨骨桥蛋白在肺上皮来源的肺炎症及上皮细胞与间质细胞相互作用中的调节作用 | 肺上皮细胞和间质细胞的相互作用以及骨桥蛋白的调节作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 基因敲除小鼠模型 | 生物信息学数据，转录组数据 | 包括吸烟者、慢性阻塞性肺病（COPD）患者及健康非吸烟者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 209 | 2024-08-07 |
C1q+ tumor-associated macrophages contribute to immunosuppression through fatty acid metabolic reprogramming in malignant pleural effusion
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007441
PMID:37604643
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研究论文 | 本文研究了C1q+肿瘤相关巨噬细胞通过脂肪酸代谢重编程促进恶性胸腔积液免疫抑制的机制 | 首次揭示了C1q+肿瘤相关巨噬细胞通过增强脂肪酸结合蛋白5介导的脂肪酸代谢，激活转录因子PPAR-gamma，从而增加抑制分子表达的机制 | NA | 探讨C1q+肿瘤相关巨噬细胞在恶性胸腔积液中的免疫抑制作用及其机制 | C1q+肿瘤相关巨噬细胞及其在恶性胸腔积液中的作用 | NA | 恶性胸腔积液 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA | 人类和小鼠的恶性胸腔积液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 210 | 2024-08-07 |
Treponema pallidum promoted microglia apoptosis and prevented itself from clearing by human microglia via blocking autophagic flux
2023-08, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011594
PMID:37611054
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研究论文 | 本研究探讨了梅毒螺旋体（Tp）与小胶质细胞的相互作用及其潜在机制 | 发现Tp通过抑制TFEB介导的溶酶体生物合成阻断自噬流，从而促进小胶质细胞凋亡并防止自身被清除 | NA | 研究Tp与小胶质细胞的相互作用及其潜在机制 | 梅毒螺旋体（Tp）和小胶质细胞 | NA | 神经梅毒 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Tg (mpeg1: EGFP)转基因斑马鱼胚胎和人类HMC3小胶质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 211 | 2024-08-05 |
FoxM1 coordinates cell division, protein synthesis, and mitochondrial activity in a subset of β cells during acute metabolic stress
2023-08-29, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112986
PMID:37590136
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研究论文 | 本文探讨了在急性代谢压力下，FoxM1如何协调细胞分裂、蛋白质合成和线粒体活性 | 揭示了FoxM1在代谢压力下对β细胞增殖和功能的调控作用 | 对β细胞异质性的整体作用机制尚未完全理解 | 研究急性代谢压力下β细胞的功能与转录异质性 | 特定亚群的β细胞在代谢压力下的反应 | 数字病理学 | NA | RNA测序、ATAC-seq、单细胞RNA-seq、ChIP-seq、实时成像 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 212 | 2024-08-07 |
Metformin escape in prostate cancer by activating the PTGR1 transcriptional program through a novel super-enhancer
2023-08-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01516-2
PMID:37582751
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研究论文 | 本研究探讨了二甲双胍在前列腺癌中治疗失败的可能机制，发现超增强子与前列腺素还原酶1（PTGR1）表达的关联，以及PTGR1过表达如何促进细胞周期进展并降低对二甲双胍的敏感性 | 揭示了二甲双胍耐药性的细胞机制，并提出了通过调控SE-TFs-PTGR1轴来增强二甲双胍治疗效果的新途径 | NA | 探讨二甲双胍在前列腺癌治疗中的耐药机制 | 前列腺癌细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 213 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics reveal markers of histopathological changes in Duchenne muscular dystrophy mouse models
2023-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40555-9
PMID:37582915
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研究论文 | 本文采用空间转录组技术识别杜氏肌营养不良症小鼠模型中与组织病理变化相关的基因表达特征 | 首次在不同病程严重程度的杜氏肌营养不良症小鼠模型中利用空间转录组技术直接关联基因表达与肌肉组织学 | 未明确提及研究的具体局限性 | 识别驱动组织重塑的基因和细胞类型，以开发有效的疗法 | 使用了两种不同病程严重程度的杜氏肌营养不良症小鼠模型 | 数字病理学 | 杜氏肌营养不良症 | 空间转录组 | NA | 基因表达数据 | 使用了两种杜氏肌营养不良症小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 214 | 2024-08-05 |
COMPASS: joint copy number and mutation phylogeny reconstruction from amplicon single-cell sequencing data
2023-08-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40378-8
PMID:37582954
|
研究论文 | 提出了一种新的计算方法COMPASS，用于从靶向单细胞DNA测序数据中推断SNV和CNA的联合系统发育 | 开发了一个能够同时处理SNV和CNA的联合系统发育重建的方法 | 目前方法的适用性可能受限于特定类型的测序数据 | 理解肿瘤演变历史并预测其对治疗的抵抗力 | 使用COMPASS方法分析急性髓性白血病患者的数据集 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞DNA测序 | NA | 基因组数据 | 123名急性髓性白血病患者 | NA | NA | NA | NA |
| 215 | 2024-08-07 |
Astrocyte senescence-like response related to peripheral nerve injury-induced neuropathic pain
2023-Aug-15, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-023-00474-5
PMID:37582709
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研究论文 | 本研究探讨了星形胶质细胞衰老与慢性坐骨神经损伤后神经病理性疼痛之间的关系 | 首次揭示了星形胶质细胞衰老在神经炎症中的潜在作用，并提出了针对CLU激活的新治疗策略 | NA | 探索星形胶质细胞衰老与神经病理性疼痛之间的可能联系 | 成年大鼠的坐骨神经损伤模型 | NA | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年大鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 216 | 2024-08-07 |
Bioengineered human tissue regeneration and repair using endogenous stem cells
2023-08-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101156
PMID:37586324
|
研究论文 | 本文描述了一种利用肋间隙的自愈能力生成骨和软骨结构的方法，用于治疗变形的手指关节和小耳畸形 | 利用内源性干细胞和3D模具精确再生和修复人体组织 | NA | 开发一种仅使用内源性因素修复和再生骨及组织结构缺陷的治疗策略 | 骨和软骨结构的再生与修复 | 生物工程 | 小耳畸形 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 5名单侧小耳畸形患者 | NA | NA | NA | NA |
| 217 | 2024-08-07 |
METTL3 drives NAFLD-related hepatocellular carcinoma and is a therapeutic target for boosting immunotherapy
2023-08-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101144
PMID:37586322
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研究论文 | 本文研究了METTL3在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）相关肝细胞癌（HCC）中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了METTL3通过调节胆固醇生物合成和免疫细胞功能，促进NAFLD-HCC的发展，并提出METTL3作为免疫检查点阻断疗法的联合治疗靶点 | NA | 探讨METTL3在NAFLD-HCC中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 | METTL3在NAFLD-HCC中的作用及其对免疫疗法的影响 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 218 | 2024-08-07 |
Prolonged cytopenia following CD19 CAR T cell therapy is linked with bone marrow infiltration of clonally expanded IFNγ-expressing CD8 T cells
2023-08-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101158
PMID:37586321
|
研究论文 | 研究探讨了自体抗CD19嵌合抗原受体T细胞（CAR T）疗法后长期细胞减少与骨髓中克隆扩增的IFNγ表达CD8 T细胞浸润之间的关系 | 通过单细胞RNA测序发现，长期细胞减少与骨髓中高表达IFN-γ和细胞因子信号基因集的克隆扩增CX3CR1细胞毒性T细胞频率增加有关 | 对于长期细胞减少的病理生理机制理解不足 | 研究CAR T细胞疗法后长期细胞减少的生物学机制 | 骨髓样本中的T细胞和造血干细胞 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 健康捐赠者和复发/难治性大B细胞淋巴瘤（rrLBCL）患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-07 |
C5aR+ dendritic cells fine-tune the Peyer's patch microenvironment to induce antigen-specific CD8+ T cells
2023-Aug-14, NPJ vaccines
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41541-023-00720-z
PMID:37580335
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研究论文 | 研究探讨了Peyer's patch（PP）树突状细胞（DCs）在口服疫苗策略中的特征和免疫潜能 | 发现C5aR信号在黏膜DCs中通过调节组织微环境来调控佐剂活性 | NA | 开发针对黏膜树突状细胞的免疫策略 | Peyer's patch树突状细胞及其在免疫反应中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 220 | 2024-08-07 |
Investigating the biology of yeast aging by single-cell RNA-seq
2023-08-14, Aging
DOI:10.18632/aging.204991
PMID:37580796
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |