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当前共找到 359 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-22 |
Integrative Single-Cell and Bulk Transcriptomes Analyses Identify Intrinsic HNSCC Subtypes with Distinct Prognoses and Therapeutic Vulnerabilities
2023-08-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-22-3563
PMID:37192003
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research paper | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别具有不同预后和治疗弱点的头颈部鳞状细胞癌内在亚型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，提出三种内在一致分子亚型（iCMS1-3），并开发机器学习的预后和治疗预测特征 | 未在论文标题和摘要中明确说明局限性 | 通过多队列整合分析，定义头颈部鳞状细胞癌的内在上皮亚型，并评估其分子特征和临床意义 | 头颈部鳞状细胞癌患者的恶性上皮细胞 | machine learning | head and neck squamous cell carcinoma | scRNA-seq, bulk RNA-seq | machine learning | single-cell RNA sequencing data, bulk RNA sequencing data | 1,325名患者来自独立队列 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-06-19 |
Thrombospondin-1 promotes fibro-adipogenic stromal expansion and contractile dysfunction of the diaphragm in obesity
2023-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.17.553733
PMID:37645822
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研究论文 | 本文研究了肥胖状态下血小板反应蛋白-1促进膈肌纤维脂肪基质扩张和收缩功能障碍的机制 | 首次揭示THBS1是肥胖诱导的膈肌基质重塑和收缩功能障碍的必要介质，并发现THBS1敲除小鼠能抵抗肥胖引起的膈肌脂肪沉积和收缩力下降 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的验证尚需进一步研究 | 探讨THBS1在肥胖引起的膈肌功能障碍中的作用及其分子机制 | 饮食诱导肥胖小鼠的膈肌组织及细胞 | 机器学习和数字病理学 | 肥胖相关呼吸功能障碍 | bulk和单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 野生型和THBS1敲除小鼠的膈肌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-05-29 |
Netrin-1 blockade inhibits tumour growth and EMT features in endometrial cancer
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06367-z
PMID:37532934
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研究论文 | 本研究揭示了Netrin-1在子宫内膜癌中上调，使用抗Netrin-1抗体NP137可抑制肿瘤进展和上皮间质转化，并在临床试验中展示初步疗效 | 首次在临床试验中验证Netrin-1单克隆抗体NP137作为单一药物治疗晚期子宫内膜癌的效果，并揭示其通过抑制上皮间质转化发挥抗肿瘤作用的新机制 | 临床试验样本量较小（14例），仅体现初步疗效，且未报告长期生存获益和不良反应详细信息 | 评估Netrin-1阻断剂NP137在子宫内膜癌中的抗肿瘤效果及其作用机制 | 子宫内膜癌患者和小鼠模型 | 机器学习 | 子宫内膜癌 | RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 14例晚期子宫内膜癌患者，以及小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序、空间转录组学以及批量RNA测序的10x Chromium平台 |
| 4 | 2026-05-22 |
ScRNA-seq defines dynamic T-cell subsets in longitudinal colon and peripheral blood samples in immune checkpoint inhibitor-induced colitis
2023-08, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-007358
PMID:37586769
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析免疫检查点抑制剂诱导结肠炎患者纵向结肠和外周血样本中T细胞亚群的动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，纵向追踪结肠炎发展及治疗过程中结肠和外周免疫环境的动态变化，揭示了CD8+ T细胞在生物治疗中的优先耗竭及其与炎症和免疫抑制反应的关联 | 基于单个病例的研究，样本量有限，无法推广至更广泛人群；且未阐明驱动ICI结肠炎的具体分子机制 | 探究免疫检查点抑制剂诱导结肠炎在结肠和外周免疫环境中的动态变化机制 | 一名患有梅克尔细胞癌并接受帕博利珠单抗治疗后发生结肠炎的患者 | 单细胞转录组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和 T细胞受体测序 (TCR-seq) | NA | 单细胞基因表达数据和T细胞受体序列 | 一名患者的多个时间点（治疗前后）的结肠组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 5 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals characteristics of myeloid cells in pulmonary post-acute sequelae of SARS-CoV-2
2023-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.31.551349
PMID:37577518
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了SARS-CoV-2感染后肺部长期后遗症（PPASC）中髓系细胞的免疫特征和代谢变化 | 首次在单细胞水平上详细描述了PPASC患者外周血单核细胞中髓系细胞的转录组特征，并发现了与纤维化、免疫抑制和代谢改变相关的基因表达模式 | 样本量相对较小，且主要关注外周血细胞，未直接分析肺部组织；研究为观察性，需进一步功能验证 | 探究SARS-CoV-2感染后肺部长期后遗症（PPASC）的免疫学机制 | SARS-CoV-2感染后出现慢性肺部症状的患者（PPASC）与未感染对照者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19后遗症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过34,139个外周血单核细胞，整合了公开数据集（GSM4509024） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 6 | 2026-03-13 |
Immunosuppressive tumor microenvironment contributes to tumor progression in diffuse large B-cell lymphoma upon anti-CD19 chimeric antigen receptor T therapy
2023-Aug, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-022-0972-8
PMID:37060525
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了抗CD19 CAR-T细胞疗法在弥漫性大B细胞淋巴瘤患者中的肿瘤微环境变化，揭示了M2亚型巨噬细胞在治疗失败和疾病进展中的关键作用 | 首次在CAR-T细胞治疗背景下，利用单细胞RNA测序技术系统分析了DLBCL患者治疗前后肿瘤微环境的动态变化，并明确了M2巨噬细胞在介导免疫抑制微环境和治疗抵抗中的核心机制 | 样本量相对较小（22例可评估患者），且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性研究验证结论 | 探究抗CD19 CAR-T细胞疗法在DLBCL患者中失败的根本机制，特别是肿瘤微环境的变化如何影响治疗效果 | 接受抗CD19 CD28z CAR-T细胞疗法（FKC876）治疗的复发或难治性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 22例可评估的DLBCL患者（其中7例完全缓解，10例部分缓解，4例疾病稳定） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-06 |
Transcriptomic forecasting with neural ordinary differential equations
2023-Aug-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2023.100793
PMID:37602211
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研究论文 | 本文开发了一种基于神经常微分方程的方法RNAForecaster，用于预测单细胞中多个未来时间步的基因表达状态 | 提出了一种嵌入无关的方法，能够从具有时间信息的高通量数据集中短期预测未来表达状态 | NA | 解决从细胞状态快照推断轨迹到估计细胞基因表达时间变化的挑战 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经常微分方程 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-03-04 |
Integrating spatial and single-nucleus transcriptomic data elucidates microglial-specific responses in female cynomolgus macaques with depressive-like behaviors
2023-08, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01379-4
PMID:37443281
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序数据，揭示了雌性食蟹猴在抑郁样行为中特定于小胶质细胞的反应 | 首次在雌性非人灵长类动物中结合空间转录组学和单核RNA测序，识别出与抑郁样行为相关的小胶质细胞亚群及其在皮质层中的特异性分布 | 研究仅针对雌性食蟹猴，样本可能有限，且结果可能无法直接推广到人类或其他物种 | 探究重度抑郁障碍的细胞和分子机制，特别是在小胶质细胞中的特异性反应 | 雌性食蟹猴的背外侧前额叶皮质 | 数字病理学 | 重度抑郁障碍 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 雌性食蟹猴样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-02 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子调控雌性小鼠皮下白色脂肪组织中冷诱导的UCP1表达，从而影响脂肪细胞产热 | 首次发现乳腺导管上皮细胞分泌的“乳腺因子”在交感神经激活下限制脂肪细胞UCP1表达，揭示了性别特异性脂肪产热调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类中的相关性尚未验证；乳腺因子作用的具体分子通路需进一步阐明 | 探究乳腺导管上皮细胞在调控脂肪细胞产热程序中的作用机制 | 雌性小鼠的皮下白色脂肪组织及乳腺导管上皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序，全组织免疫荧光3D可视化 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 雌性小鼠脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-02-11 |
Olfactomedin-4 + neutrophils exacerbate intestinal epithelial damage and worsen host survival after Clostridioides difficile infection
2023-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.21.553751
PMID:37662327
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞在艰难梭菌感染（CDI）中加剧肠道上皮细胞损伤的作用，并首次通过单细胞转录组学图谱识别了OLFM4+中性粒细胞的致病角色 | 首次建立了CDI后骨髓、血液和结肠中性粒细胞的转录组学图谱，并发现OLFM4作为关键标志物与感染严重程度相关 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限，且OLFM4的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究中性粒细胞在CDI中的功能角色及其对肠道上皮损伤的影响 | 中性粒细胞（特别是OLFM4+亚型）、肠道上皮细胞、CDI感染的小鼠模型和人类样本 | 数字病理学 | 肠道感染 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 包括小鼠模型和人类样本，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-02-05 |
Transfer learning in a biomaterial fibrosis model identifies in vivo senescence heterogeneity and contributions to vascularization and matrix production across species and diverse pathologies
2023-08, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-023-00785-7
PMID:37079217
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研究论文 | 本研究通过生物材料纤维化模型开发了体内衰老特征，并利用迁移学习识别了跨物种和多种病理中的衰老细胞异质性及其在血管化和基质生产中的作用 | 开发了体内来源的衰老特征（SenSig），并应用迁移学习在多种病理的单细胞RNA测序数据中识别衰老细胞，揭示了IL34-CSF1R-TGFβR信号轴介导的衰老细胞与髓系细胞间的串扰 | NA | 识别体内衰老细胞的表型异质性及其在组织修复和病理过程中的作用 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据集，涵盖多种病理状态 | 数字病理学 | 组织纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 迁移学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-09 |
CD4 T cell Responses in the CNS during SIV infection
2023-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554055
PMID:37662237
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研究论文 | 本研究通过模拟亚优依从性的抗逆转录病毒疗法（ART）方案，在SIVmac251感染的恒河猴中，探究了CD4 T细胞在中枢神经系统（CNS）中的分布、对感染的反应以及ART启动后的潜在恢复情况 | 首次在SIV感染模型中，利用单细胞RNA测序技术揭示了CNS中CD4 T细胞与病毒转录本的共定位，以及T细胞内抗病毒分子和特定效应程序的显著激活，强调了CD4 T细胞在CNS病毒感染中的功能性参与 | 研究样本量较小（仅10只恒河猴），且ART方案模拟的是亚优依从性，可能无法完全反映人类HIV感染的最佳治疗情况 | 探究SIV感染期间CD4 T细胞在中枢神经系统中的反应、分布及ART后的恢复潜力，以增进对Neuro-HIV病理机制的理解 | SIVmac251感染的恒河猴，包括急性期（4只）和慢性期（6只）的动物 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 10只SIVmac251感染的恒河猴 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2025-11-27 |
Elevated Mast Cell Abundance Is Associated with Enrichment of CCR2+ Cytotoxic T Cells and Favorable Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-08-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-3140
PMID:37249584
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序分析肺腺癌患者样本，揭示肥大细胞在肿瘤微环境中的功能异质性及其与CCR2+细胞毒性T细胞的相互作用 | 首次发现肺腺癌中肥大细胞的功能异质性及其通过CCL2-CCR2轴招募细胞毒性T细胞的机制 | 肥大细胞浸润与化疗后生存改善无关联，且样本来源仅限于肺腺癌患者 | 探究肥大细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的调控机制和功能作用 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 肺腺癌患者样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2025-11-18 |
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162201
PMID:37338986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现芦可替尼可通过JAK2/STAT1通路直接修复骨髓间充质基质细胞功能，从而改善急性移植物抗宿主病相关的造血功能障碍 | 首次揭示急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤的具体机制，并发现芦可替尼对骨髓间充质基质细胞的直接保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，虽在患者样本中得到验证但样本量有限 | 探究急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤机制及芦可替尼的治疗作用 | 小鼠模型和患者样本中的骨髓非造血细胞，特别是骨髓间充质基质细胞 | 单细胞测序分析 | 急性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单倍体MHC匹配移植急性移植物抗宿主病小鼠模型及患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2025-10-12 |
A transcriptional response to replication stress selectively expands a subset of Brca2-mutant mammary epithelial cells
2023-08-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40956-w
PMID:37626143
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研究论文 | 本研究揭示了BRCA2突变乳腺上皮细胞在复制压力下通过转录反应选择性扩增激素受体阴性管腔细胞的机制 | 首次发现BRCA2杂合突变乳腺器官在复制压力下通过激活特定转录反应选择性扩增HR-管腔细胞，并鉴定出Tspan8和Thrsp基因在此过程中的关键作用 | 研究主要基于乳腺器官模型，需要在体内环境中进一步验证这些发现 | 探究BRCA2突变如何影响乳腺上皮亚群在复制压力下的行为 | Brca2突变乳腺器官和乳腺上皮细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | CyTOF质谱流式,scRNA-seq单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 | 野生型和Brca2突变乳腺器官 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 16 | 2025-10-11 |
A comparative study of in vitro air-liquid interface culture models of the human airway epithelium evaluating cellular heterogeneity and gene expression at single cell resolution
2023-Aug-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-023-02514-2
PMID:37635251
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研究论文 | 比较BCi-NS1.1细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型在单细胞分辨率下的细胞异质性和基因表达差异 | 首次在单细胞分辨率下系统比较工程化基底细胞系与原发性细胞来源的气液界面培养模型的基因表达和免疫功能差异 | 样本量较小（各3个独立分化/供体），未完全表征所有基因表达和免疫功能差异 | 评估BCi-NS1.1细胞系作为气液界面培养模型的适用性 | 人气道上皮细胞的气液界面培养模型 | 单细胞生物学 | 呼吸道感染疾病 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，图像数据 | BCi-NS1.1来源培养物（3个独立分化），原代细胞来源培养物（3个不同供体） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41207-0
PMID:37644108
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研究论文 | 本研究开发了一种新型新生小鼠胆道梗阻模型，并通过单细胞测序揭示了梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞的异质性 | 创建了死亡率低的新生儿胆道结扎模型，首次通过单细胞RNA测序比较不同病因胆汁淤积中巨噬细胞功能的特异性差异 | 研究仅限于小鼠模型，需要进一步与人类数据进行比较验证 | 阐明梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞亚群的特异性功能和作用机制 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和轮状病毒诱导的胆道闭锁模型 | 单细胞生物学 | 梗阻性胆汁淤积 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学染色 | 动物模型 | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，组织学图像数据 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2025-10-05 |
A spatially resolved single-cell genomic atlas of the adult human breast
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06252-9
PMID:37380767
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研究论文 | 构建了成人乳腺单细胞和空间分辨率的综合基因组图谱 | 首次在单细胞和空间分辨率上构建了成人乳腺综合图谱，揭示了丰富的血管周围、内皮和免疫细胞群体以及高度多样化的管腔上皮细胞状态 | NA | 研究成人正常乳腺组织的细胞组成和空间结构 | 126名女性的714,331个细胞和20名女性的117,346个细胞核 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学，空间映射 | NA | 单细胞转录组数据，空间数据 | 714,331个细胞来自126名女性，117,346个细胞核来自20名女性 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | 使用了四种不同的空间映射技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
Mitochondrial integrated stress response controls lung epithelial cell fate
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06423-8
PMID:37558881
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研究论文 | 本研究揭示了线粒体复合物I通过NAD再生调控肺上皮细胞命运的新机制 | 首次发现线粒体复合物I依赖的NAD再生在肺泡发育中通过抑制整合应激反应控制细胞命运 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性尚需验证 | 探索肺上皮细胞命运的代谢调控机制 | 小鼠肺上皮细胞 | 细胞生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 基因敲除 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-10-05 |
Diverse clonal fates emerge upon drug treatment of homogeneous cancer cells
2023-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06342-8
PMID:37468627
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研究论文 | 本研究开发了FateMap框架，通过DNA条形码和单细胞RNA测序技术揭示了癌细胞在抗癌治疗中的克隆命运多样性 | 开发了结合DNA条形码和单细胞RNA测序的FateMap框架，首次系统揭示了癌细胞耐药类型的多样性及其内在决定机制 | NA | 探究遗传相同癌细胞在药物治疗下产生不同耐药类型的机制 | 单细胞来源的癌细胞系和患者样本 | 单细胞生物学 | 癌症 | DNA条形码技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 数十万个克隆 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |