单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
High EVI1 and PARP1 expression as favourable prognostic markers in high-grade serous ovarian carcinoma
2023-Jul-31, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01239-6
PMID:37525239
|
研究论文 | 本文探讨了EVI1和PARP1在高级别漿液性卵巢癌中的预后意义 | 发现EVI1和PARP1的高表达与高级别漿液性卵巢癌的良好预后显著相关 | 没有提供关于其机制的深入研究 | 研究EVI1和PARP1在高级别漿液性卵巢癌中的预后作用 | 562名高级别漿液性卵巢癌患者 | 肿瘤病理学 | 卵巢癌 | 免疫组化染色，数字半自动阳性细胞检测 | NA | 组织样本 | 562名患者 |
| 162 | 2024-08-05 |
Decoding key cell sub-populations and molecular alterations in glioblastoma at recurrence by single-cell analysis
2023-07-31, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-023-01613-x
PMID:37525259
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研究论文 | 这篇文章探讨了在复发性胶质母细胞瘤中关键细胞亚群和分子变化。 | 文章揭示了一种在初发胶质母细胞瘤中检测较少但在复发性胶质母细胞瘤中高度表达的独特细胞亚群，暗示其可能在复发过程中起到关键作用。 | 文章没有提供关于如何应用发现的新靶点进行临床治疗的具体建议。 | 旨在理解驱动胶质母细胞瘤复发的关键机制以及识别新的干预靶点。 | 研究对象为36名患者的初发和复发胶质母细胞瘤样本以及6个纵向的胶质母细胞瘤空间转录组数据。 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 36个患者的初发和复发胶质母细胞瘤样本 |
| 163 | 2024-08-07 |
Exploring the cellular and molecular differences between ovarian clear cell carcinoma and high-grade serous carcinoma using single-cell RNA sequencing and GEO gene expression signatures
2023-Jul-31, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01087-3
PMID:37525249
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和GEO基因表达签名数据，探索卵巢透明细胞癌和高度浆液性卵巢癌之间的细胞和分子差异 | 首次全面揭示了卵巢透明细胞癌和高度浆液性卵巢癌在细胞和分子层面的区别，并发现了新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 旨在发现卵巢透明细胞癌的新治疗靶点，以改善患者的预后 | 卵巢透明细胞癌和高度浆液性卵巢癌 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 使用了GSE189553数据集中的批量RNA-seq数据和单细胞RNA测序数据 |
| 164 | 2024-08-07 |
A meta-analysis of immune-cell fractions at high resolution reveals novel associations with common phenotypes and health outcomes
2023-07-31, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01211-5
PMID:37525279
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meta-analysis | 本研究通过高分辨率DNA甲基化参考矩阵，对12种免疫细胞类型在血液中的比例进行meta分析，揭示了这些细胞比例与多种常见表型和健康结果的关联 | 本研究首次在高分辨率下使用DNA甲基化数据进行meta分析，提供了广泛验证的血液DNA甲基化参考矩阵，并揭示了免疫细胞比例与多种健康结果的关联 | 研究主要集中在血液样本，且使用的DNA甲基化数据分辨率相对较低 | 探索免疫细胞类型比例与常见表型及健康结果的关联 | 12种免疫细胞类型在血液中的比例 | machine learning | NA | DNA methylation sequencing | NA | DNA methylation data | 23,053个血液样本 |
| 165 | 2024-08-05 |
Follicular development and ovary aging: single-cell studies
2023-Jul-28, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioad080
PMID:37504504
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综述 | 本文总结了卵泡发育与卵巢衰老的单细胞研究进展 | 强调单细胞测序技术在揭示个体细胞独特分子机制方面的创新 | 总结了传统方法在卵泡发育研究中的局限性 | 探讨卵泡发育的生理与病理机制 | 聚焦卵巢内的卵母细胞、颗粒细胞、冠层细胞和卵泡膜细胞等各种细胞 | 数字病理学 | 不育症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 166 | 2024-08-05 |
Evaluating imputation methods for single-cell RNA-seq data
2023-Jul-28, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05417-7
PMID:37507764
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研究论文 | 本研究对11种最新的单细胞RNA测序数据插补方法进行了评估 | 评估了多种插补算法在不同真实和模拟数据集上的表现，并揭示了它们的优缺点 | 一些方法在真实数据集上的表现差，且未能成功插补所有标记基因 | 系统评估不同的单细胞RNA测序数据插补算法 | 12个真实的生物数据集和4个模拟数据集 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 生物数据集 | 12个真实数据集和4个模拟数据集 |
| 167 | 2024-08-07 |
Small Leucine-Rich Proteoglycan PODNL1 Identified as a Potential Tumor Matrix-Mediated Biomarker for Prognosis and Immunotherapy in a Pan-Cancer Setting
2023-Jul-22, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb45070386
PMID:37504302
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研究论文 | 本文研究了小亮氨酸丰富蛋白聚糖家族成员PODNL1在泛癌环境中的预后价值和免疫治疗作用 | 首次系统评估了PODNL1在泛癌环境中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 探讨PODNL1作为泛癌环境下肿瘤基质介导的生物标志物在预后和免疫治疗中的潜力 | PODNL1在不同癌症中的表达及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 数字病理学 | 泛癌 | 多重免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 涉及33种癌症类型的样本 |
| 168 | 2024-08-07 |
Tissue Inhibitor of Metalloproteinases-1 Interacts with CD74 to Promote AKT Signaling, Monocyte Recruitment Responses, and Vascular Smooth Muscle Cell Proliferation
2023-07-20, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141899
PMID:37508563
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研究论文 | 研究探讨了组织金属蛋白酶抑制剂-1（TIMP-1）与CD74相互作用对AKT信号传导、单核细胞招募反应和血管平滑肌细胞增殖的影响 | 首次详细研究了TIMP-1通过CD74介导的生物学效应，包括对单核细胞和血管平滑肌细胞的影响 | NA | 评估TIMP-1-CD74轴在血管炎症和动脉粥样硬化中的作用 | TIMP-1与CD74的相互作用及其对单核细胞和血管平滑肌细胞的影响 | NA | 心血管疾病 | 序列比对、蛋白质-蛋白质对接分析、磷酸化激酶阵列、Transwell迁移、3D-基于趋化性、流粘附试验、活细胞成像 | NA | scRNA-seq数据 | THP-1前单核细胞、初级人类单核细胞、血管平滑肌细胞 |
| 169 | 2024-08-07 |
Smooth Muscle Heterogeneity and Plasticity in Health and Aortic Aneurysmal Disease
2023-Jul-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411701
PMID:37511460
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞（VSMCs）在健康和主动脉瘤疾病中的异质性和可塑性 | 通过高分辨率研究方法，如谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示了VSMCs前所未有的异质性和多样性及其与主动脉瘤的复杂关系 | NA | 旨在增进对健康和动脉瘤疾病中VSMC多样性的理解 | 血管平滑肌细胞（VSMCs）及其在主动脉瘤中的作用 | NA | 主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 170 | 2024-08-05 |
Recurrent composite markers of cell types and states
2023-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549344
PMID:37503180
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研究论文 | 本文介绍了一种开发的计算方法RECOMBINE，用于识别生物身份的复合标记。 | 该研究提出了一种新的数据驱动的方法RECOMBINE，用于无偏选择复合标记，从而改善细胞类型和状态的解释、发现和验证 | 未在标题和摘要中提及具体的局限性 | 旨在克服确定特定基因组标记以识别组织生态系统中的细胞类型和状态的挑战 | 研究对象包括小鼠视觉皮层CD8 T细胞状态及其对抗PD1治疗反应的标记 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 利用模拟和转录组数据进行验证，包括批量、单细胞和空间分辨率数据 |
| 171 | 2024-08-07 |
Cuproptosis and Immune-Related Gene Signature Predicts Immunotherapy Response and Prognosis in Lung Adenocarcinoma
2023-Jul-19, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life13071583
PMID:37511958
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研究论文 | 研究探讨了铜死亡及其相关免疫基因在肺腺癌中的作用，以及它们对免疫治疗反应和预后的影响 | 首次揭示了铜死亡相关免疫基因在肺腺癌中的作用，并建立了一个风险模型和诺模图来预测免疫治疗反应和预后 | 研究主要基于生物信息学方法和体外实验，需要进一步的临床验证 | 评估铜死亡相关免疫基因在肺腺癌中的作用，并预测免疫治疗反应和预后 | 肺腺癌患者及其免疫治疗反应和预后 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 实时定量PCR (RT-qPCR), 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 风险模型和诺模图 | 基因表达数据 | 具体的样本数量未在摘要中明确提及 |
| 172 | 2024-08-07 |
Embryonic Development of Parthenogenetic and Sexual Eggs in Lower Termites
2023-Jul-15, Insects
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/insects14070640
PMID:37504646
|
研究论文 | 本研究观察并描述了低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育阶段 | 首次完成了孤雌生殖和有性卵的数据库 | NA | 研究低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育 | 低等白蚁的孤雌生殖和有性卵 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
Scaffold-Based (Matrigel™) 3D Culture Technique of Glioblastoma Recovers a Patient-like Immunosuppressive Phenotype
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141856
PMID:37508520
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研究论文 | 本研究探讨了支架基础（Matrigel™）3D培养技术如何改善2D培养的局限性 | 发现支架基础（Matrigel™）3D培养技术可影响GBM模型的转录谱，体现肿瘤-免疫相互作用的临床相关性 | 研究中未提到的局限性 | 研究支架基础3D培养技术在癌症研究中的应用 | 比较2D和3D模型中与免疫相关基因转录的变化 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | NGS | 未提及 | 基因组数据 | 未明确提及的配对样本数量 |
| 174 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics for Unlocking Personalized Cancer Immunotherapy: Toward Targeting the Origin of Tumor Development Immunogenicity
2023-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143615
PMID:37509276
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综述 | 本文探讨了单细胞转录组学如何用于开发个性化癌症免疫疗法。 | 本研究创新性地将未分化肿瘤细胞群体与个性化免疫治疗联系起来，强调了OTD在肿瘤异质性中的作用。 | 缺乏具体的实验数据来支持OTD的功能和生物标志物的验证。 | 研究如何利用单细胞转录组学信息来增强癌症免疫疗法的个性化效果。 | 研究主要集中在不同患者的肿瘤细胞及其微环境，特别是OTD细胞群体。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | NA |
| 175 | 2024-08-07 |
Cryobiopsy: A Breakthrough Strategy for Clinical Utilization of Lung Cancer Organoids
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141854
PMID:37508518
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research paper | 本文探讨了使用冷冻活检技术从晚期肺癌患者中成功生成肺肿瘤类器官（LCOs）的方法 | 首次尝试从冷冻活检样本中创建肺肿瘤类器官，提高了类器官培养的成功率，并保留了原发肿瘤的特征 | 肺肿瘤类器官培养中正常肺细胞的过度生长问题以及最佳培养条件的确定仍待解决 | 解决晚期肺癌患者无法通过手术获取肺肿瘤类器官的问题，提高类器官培养的成功率 | 晚期肺癌患者的冷冻活检样本 | digital pathology | lung cancer | 冷冻活检 | NA | 组织样本 | 113例晚期肺癌患者 |
| 176 | 2024-08-07 |
Crk/Crkl regulates early angiogenesis in mouse embryos by accelerating endothelial cell maturation
2023-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.12.548782
PMID:37503032
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研究论文 | 本文研究了Crk和Crkl在胚胎早期血管发育中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了它们对内皮细胞成熟的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Crk和Crkl在胚胎血管发育中的作用，并通过单细胞RNA测序分析了其分子机制 | 研究仅限于小鼠胚胎，且未探讨Crk和Crkl在其他物种或成人中的作用 | 确定Crk和Crkl在胚胎中胚层早期小鼠血管发育中的功能，并探索其分子机制 | Crk和Crkl在小鼠胚胎血管发育中的作用及内皮细胞的分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠胚胎的中胚层细胞 |
| 177 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas Reveals the Hemocyte Subpopulations and Stress Responses in Asian Giant Softshell Turtle during Hibernation
2023-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology12070994
PMID:37508424
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了亚洲巨型软壳龟在活跃状态和冬眠期间血细胞的分子特征，揭示了血细胞亚群及其在冬眠期间的应激反应 | 发现了六种细胞类型及每个细胞亚群的新标记基因，并确定了冬眠期间上调的热休克基因和免疫相关基因 | NA | 探究龟类冬眠期间的季节性适应机制 | 亚洲巨型软壳龟的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 178 | 2024-08-07 |
Derivation of Human Extraembryonic Mesoderm-like Cells from Primitive Endoderm
2023-Jul-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411366
PMID:37511125
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研究论文 | 本研究开发了一种从原始内胚层样细胞（nEnd）生成人类胚外中胚层样细胞（ExM-like）的协议 | 首次证实了人类胚外中胚层可以从原始内胚层衍生，并建立了一个细胞培养系统来研究人类胚外中胚层在胚胎发育早期的作用 | NA | 探讨人类胚外中胚层的起源及其在胚胎发育中的作用 | 人类胚外中胚层样细胞及其在胚胎发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | NA |
| 179 | 2024-08-07 |
Molecular Subtypes and Tumor Microenvironment Characteristics of Small-Cell Lung Cancer Associated with Platinum-Resistance
2023-Jul-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143568
PMID:37509231
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研究论文 | 本文旨在通过基因表达分类细化小细胞肺癌（SCLC）的分子亚型，并探索与铂类耐药相关的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次揭示了SCLC的四种分子亚型及其与铂类耐药的关系，特别是EndMT在SCLC-I亚型中的不良预后作用，并提出了BET抑制剂作为克服铂类耐药的新候选药物 | NA | 细化小细胞肺癌的分子亚型并揭示与铂类耐药相关的肿瘤微环境特征 | 小细胞肺癌的分子亚型及其与铂类耐药的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 81个基因表达样本和87个验证样本 |
| 180 | 2024-08-05 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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评论 | 本文章探讨了与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞的作用 | 强调了少突胶质细胞在阿尔茨海默病及中枢神经系统病理中的潜在新角色 | 研究主要为综述，缺乏实证研究支持 | 探讨少突胶质细胞在认知下降中的角色及其分子特征 | 与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |