单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
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研究论文 | 本文探讨了如何通过常规染色法推断空间转录组学信息，以增强皮肤光老化的大规模分子评估 | 提出了一种利用常规H&E染色切片推断空间转录组学信息的新方法，以提高评估光老化的可靠性 | 使用最先进的空间转录组学技术成本高，且不同患者间存在变异性，限制了大规模分子流行病学研究的范围 | 研究空间转录组学在皮肤光老化评估中的应用潜力 | 分析261个皮肤标本中4位患者的基底细胞和鳞状细胞肿瘤切片 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 261个皮肤标本，分析4位患者的切片 |
| 122 | 2024-08-07 |
Pathogenic Roles of Cardiac Fibroblasts in Pediatric Dilated Cardiomyopathy
2023-07-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.029676
PMID:37345811
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研究论文 | 研究探讨了心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的致病作用 | 首次揭示了心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中通过体液因子和细胞间直接接触影响健康心肌细胞的收缩和舒张功能 | 研究未发现心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中生理行为的改变，且未识别出特定的亚群细胞 | 探究心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的病理作用 | 儿童扩张型心肌病患者的心脏成纤维细胞与健康对照组的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 原子力显微镜，RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 四条来自儿童扩张型心肌病患者的原代培养心脏成纤维细胞系与三条来自健康对照的心脏成纤维细胞系 |
| 123 | 2024-08-05 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
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研究论文 | 本文探讨了紫杉醇诱导的内皮细胞衰老如何导致小鼠认知功能下降的机制 | 研究首次验证了紫杉醇诱导的内皮衰老与微血管功能障碍之间的因果关系 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在临床试验中验证 | 研究目标是探讨紫杉醇如何通过内皮细胞衰老影响微血管功能并导致认知下降 | 研究对象为转基因p16-3MR小鼠，允许检测和选择性消除衰老细胞 | 数字病理学 | 癌症相关认知损害 | 流式细胞术和单细胞转录组学 | NA | 行为测试数据和生理测量数据 | PTX处理的转基因小鼠和对照小鼠 |
| 124 | 2024-08-07 |
Identification of biomarkers and immune infiltration in acute myocardial infarction and heart failure by integrated analysis
2023-07-26, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20222552
PMID:37334672
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研究论文 | 本研究通过综合分析方法，鉴定了急性心肌梗死和心力衰竭中的生物标志物和免疫浸润情况 | 本研究首次通过xCell算法和单细胞RNA测序数据，分析了急性心肌梗死和心力衰竭患者的免疫细胞浸润模式，并验证了相关枢纽基因 | NA | 旨在分析急性心肌梗死和心力衰竭患者的枢纽基因和免疫浸润情况 | 急性心肌梗死和心力衰竭患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自急性心肌梗死患者的五个公开基因表达数据集 |
| 125 | 2024-08-07 |
Paired single-cell host profiling with multiplex-tagged bacterial mutants reveals intracellular virulence-immune networks
2023-07-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2218812120
PMID:37399397
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research paper | 本文开发了一种名为scPAIR-seq的单细胞方法，用于分析感染过程中宿主细胞和细菌突变体的相互作用 | scPAIR-seq方法能够同时捕获感染宿主细胞和内部细菌突变体的条形码，从而分析突变体对宿主转录组的影响 | NA | 研究宿主细胞与内部细菌病原体相遇后复杂的表型及其对感染结果的影响 | 宿主细胞和内部细菌病原体的相互作用 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 使用了感染了Typhimurium分泌系统效应子突变体库的巨噬细胞样本 |
| 126 | 2024-08-07 |
Liquid biopsy-based protein biomarkers for risk prediction, early diagnosis, and prognostication of cholangiocarcinoma
2023-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.02.027
PMID:36868481
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研究论文 | 本研究通过液态活检技术，在血清细胞外囊泡中寻找胆管癌的风险预测、早期诊断和预后蛋白标志物。 | 提出了基于蛋白标志物的预测、诊断和预后模型，为个性化医疗提供了新的液态活检工具。 | NA | 探索胆管癌的风险预测、早期诊断和预后蛋白标志物。 | 胆管癌患者及健康个体的血清细胞外囊泡。 | 数字病理学 | 胆管癌 | 质谱分析、ELISA、机器学习算法 | 机器学习 | 蛋白质 | 共256个样本，包括不同类型的胆管癌患者和健康个体。 |
| 127 | 2024-08-07 |
TREM2+ macrophages suppress CD8+ T-cell infiltration after transarterial chemoembolisation in hepatocellular carcinoma
2023-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2023.02.032
PMID:36889359
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）患者在接受经动脉化疗栓塞（TACE）治疗后的免疫环境变化及其机制 | 发现TREM2+肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）在TACE治疗后抑制CD8+ T细胞的浸润，并通过分泌Galectin-1促进PD-L1在血管内皮细胞中的过度表达，从而阻碍CD8+ T细胞的招募 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的HCC患者 | 阐明HCC患者在接受TACE治疗后的免疫环境变化及其对疾病进展的影响 | HCC患者的肿瘤样本及TACE治疗后的免疫细胞变化 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名未治疗HCC患者和5名接受TACE治疗的HCC患者的肿瘤样本，以及22对配对样本 |
| 128 | 2024-08-05 |
Respiratory epithelial cell types, states and fates in the era of single-cell RNA-sequencing
2023-07-12, The Biochemical journal
DOI:10.1042/BCJ20220572
PMID:37410389
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综述 | 本文章回顾了单细胞转录组学在呼吸道内细胞类型、状态和命运的研究中的基本概念 | 强调了呼吸道中细胞异质性和可塑性的发现，并提出了生成参考注释和标准化文献术语的必要性 | 研究涉及的数据归纳和标准化面临新的挑战，需要解决的关键限制 | 探讨单细胞RNA测序在呼吸道细胞身份理解中的应用 | 呼吸道上皮细胞类型、状态和命运 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 129 | 2024-08-07 |
SELENOP modifies sporadic colorectal carcinogenesis and WNT signaling activity through LRP5/6 interactions
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI165988
PMID:37166989
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研究论文 | 本研究探讨了硒蛋白P（SELENOP）在散发性结直肠癌（CRC）中的作用及其对WNT信号通路的影响 | 首次揭示了SELENOP通过与WNT核心受体LRP5/6的相互作用调节WNT信号通路，从而影响散发性结直肠癌的发展 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步的人体临床研究验证 | 阐明SELENOP在散发性结直肠癌中的作用及其机制 | SELENOP在散发性结直肠癌中的表达及其对WNT信号通路的影响 | NA | 结直肠癌 | 单细胞cRNA-Seq（scRNA-Seq） | NA | 细胞数据 | 涉及人类单细胞数据集和小鼠腺瘤模型 |
| 130 | 2024-08-07 |
Clonally expanded PD-1-expressing T cells are enriched in synovial fluid of juvenile idiopathic arthritis patients
2023-07, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250162
PMID:37086046
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，分析了幼年特发性关节炎患者关节液中T细胞的特征，特别是PD-1表达的T细胞的克隆扩增和炎症能力。 | 首次在单细胞水平上揭示了PD-1表达的T细胞在幼年特发性关节炎慢性炎症中的作用，并提出了针对PD-1的新治疗策略。 | NA | 探讨PD-1表达的T细胞在幼年特发性关节炎慢性炎症中的作用，并评估针对PD-1的治疗策略的有效性。 | 幼年特发性关节炎患者的关节液中的T细胞。 | 免疫学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 131 | 2024-08-05 |
NUSAP1-LDHA-Glycolysis-Lactate feedforward loop promotes Warburg effect and metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2023.216285
PMID:37354982
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研究论文 | 本研究探讨了NUSAP1在胰腺导管腺癌中的糖酵解代谢和转移中的作用 | 提出了NUSAP1-LDHA-糖酵解-乳酸的正反馈环作为胰腺导管腺癌转移和代谢潜能的新机制 | 研究未提及具体的样本大小和临床验证 | 探索NUSAP1在胰腺导管腺癌发病机制中的作用 | 胰腺导管腺癌（PDAC）和常见的胃肠道肿瘤 | 数字病理学 | 胰腺癌 | RNA测序，ChIP-seq | 小鼠异种移植模型，自发性PDAC小鼠模型 | 基因表达数据，组织微阵列 | NA |
| 132 | 2024-08-07 |
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112732
PMID:37402168
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和巨噬细胞命运图谱方法，研究了胰腺导管腺癌（PDA）中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的调控作用 | 首次揭示了肿瘤特异性CD4 T细胞通过促进单核细胞分化为MHCII抗肿瘤巨噬细胞，从而影响肿瘤微环境 | NA | 探讨胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞对单核细胞命运的影响 | 胰腺导管腺癌中的单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 133 | 2024-08-05 |
Nerve growth factor receptor (Ngfr) induces neurogenic plasticity by suppressing reactive astroglial Lcn2/Slc22a17 signaling in Alzheimer's disease
2023-Jul-10, NPJ Regenerative medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41536-023-00311-5
PMID:37429840
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研究论文 | 这项研究探讨了神经生长因子受体（Ngfr）如何通过抑制阿尔茨海默病中的反应性星形胶质细胞信号传导来诱导神经发生可塑性 | 该研究揭示了Ngfr在阿尔茨海默病背景下促进星形胶质细胞神经发生命运的作用，并识别了Lcn2/Slc22a17信号通路的关键作用 | 本研究的局限性在于没有详细探讨Ngfr在不同阶段阿尔茨海默病进展中的具体作用 | 研究Ngfr在阿尔茨海默病中调控星形胶质细胞神经发生的机制 | 使用APP/PS1dE9小鼠模型和人类阿尔茨海默病组织样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学，空间蛋白组学，功能敲除研究 | 小鼠模型及人类星形胶质细胞三维培养 | 组织，转录组数据 | 使用APP/PS1dE9小鼠模型及后期人类阿尔茨海默病海马体组织 |
| 134 | 2024-08-05 |
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-Jul, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02061-8
PMID:37037874
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综述 | 这篇文章回顾了反应性星形胶质细胞在多种神经退行性疾病中的重要作用 | 提出了基于单细胞测序分析的星形胶质细胞亚群与其功能之间的精确联系 | 对于反应性星形胶质细胞的亚群识别和功能仍存在争议 | 探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维角色 | 阿尔茨海默病、帕金森病、亨廷顿病、多发性硬化和肌萎缩侧索硬化的特点 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 135 | 2024-08-07 |
IL-4 drastically decreases deuterosomal and multiciliated cells via alteration in progenitor cell differentiation
2023-07, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.15705
PMID:36883528
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响，特别是在IL-4刺激下的细胞亚型变化 | 首次揭示了IL-4通过改变前体细胞分化，显著减少多纤毛细胞和双体细胞的比例，并提出了可能对研究呼吸系统炎症疾病至关重要的细胞特异性标记 | NA | 研究过敏性炎症对鼻上皮细胞转录组的影响 | 人鼻上皮细胞及其在IL-4刺激下的转录组特征 | NA | 呼吸系统炎症疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及培养的人鼻上皮细胞和活体鼻上皮细胞样本 |
| 136 | 2024-08-07 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
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研究论文 | 本文通过单细胞mRNA测序和生物信息学方法分析了心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 首次系统比较了心脏成纤维细胞的转录组特征，并揭示了其在不同发育阶段的作用 | NA | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育中的异质性和功能 | 心脏成纤维细胞及其在心脏发育中的作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 18个阶段来自两种小鼠品系的心脏成纤维细胞 |
| 137 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptome and Pigment Biochemistry Analysis Reveals the Potential for the High Nutritional and Medicinal Value of Purple Sea Cucumbers
2023-Jul-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512213
PMID:37569587
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研究论文 | 本文分析了紫色海参的单细胞转录组和色素生物化学，以揭示它们的营养和药用价值 | 首次通过单细胞RNA-seq揭示了海参色彩形态的基因活性和相应的细胞群体 | 缺乏对活性化学物质来源的深入了解 | 研究紫色海参的营养和药用价值，及其色素的生物化学机制 | 紫色海参及其色素合成相关细胞群体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 138 | 2024-08-05 |
A Review of Single-Cell RNA-Seq Annotation, Integration, and Cell-Cell Communication
2023-07-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12151970
PMID:37566049
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综述 | 本综述评估了单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析方法和工具的当前状况 | 强调了新工具的发展，用于注释单细胞数据、整合和解释多模态数据集 | 讨论了在scRNA-seq分析中遇到的挑战，包括稀疏性或低表达问题、细胞注释的可靠性等 | 旨在增强单细胞RNA测序分析的理解和应用 | 涉及单细胞RNA测序和细胞间通信的研究对象 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | NA |
| 139 | 2024-08-05 |
Application of single-cell omics in inflammatory bowel disease
2023-Jul-28, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v29.i28.4397
PMID:37576705
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞组学在炎症性肠病的应用 | 通过单细胞组学技术，识别了肠道免疫系统中的关键免疫细胞并探索了功能异质性 | 尚未提及具体的局限性 | 旨在深入理解炎症性肠病中的复杂粘膜免疫系统 | 研究对象为炎症性肠病患者的粘膜组织和外周血样本 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织和血液样本 | NA |
| 140 | 2024-08-07 |
The Transcriptome Landscape of the In Vitro Human Airway Epithelium Response to SARS-CoV-2
2023-Jul-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241512017
PMID:37569398
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研究论文 | 研究使用体外人呼吸道上皮细胞模型（ALI和iALI）感染SARS-CoV-2后的基因表达谱变化 | 首次详细描述了SARS-CoV-2感染后呼吸道上皮细胞的基因表达变化，特别是干扰素刺激基因和炎症基因的表达增加 | NA | 探究SARS-CoV-2感染对人呼吸道上皮细胞基因表达的影响 | 人呼吸道上皮细胞（ALI和iALI模型） | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了自有的和公开的批量及单细胞转录组数据集 |