单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-05 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
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研究论文 | 本文讨论了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量及其应用 | 首次提出了机器学习辅助的转录组量化CD8 T细胞年龄的方法 | 本文未提及具体的样本大小和实验条件 | 提高对T细胞老化相关细胞变化的测量 | CD8+ T细胞的年龄和相关的基因表达变化 | 机器学习 | 老年疾病 | 转录组分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA |
| 62 | 2024-08-05 |
Lineage-Specific Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Smooth Muscle Cell Modeling Predicts Integrin Alpha-V Antagonism Reduces Aortic Root Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice
2023-07, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318448
PMID:37078287
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研究论文 | 本研究探讨了整合素αv在马凡综合症主动脉瘤形成中的作用，并验证了其拮抗剂GLPG0187的治疗效果 | 首次展示了从特定谱系衍生的诱导性多能干细胞光滑肌细胞对整合素αv的过表达及其在马凡综合症相关主动脉瘤中的作用机制 | 研究主要集中在小鼠模型上，临床适用性尚需进一步验证 | 探讨整合素αv信号通路在马凡综合症主动脉瘤中的机制及其作为治疗策略的有效性 | 研究对象为诱导性多能干细胞生成的主动脉光滑肌细胞以及马凡综合症小鼠模型 | 数字病理学 | 马凡综合症 | 单细胞RNA测序 | Fbn1C1039G/+小鼠模型 | 细胞 | 涉及的样本包括小鼠模型和不同谱系的光滑肌细胞 |
| 63 | 2024-08-05 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 本文探讨了人类胎盘T细胞的独特转录编程和克隆分布 | 使用单细胞RNA测序技术同时获得转录、有限蛋白和受体组合，揭示了胎盘T细胞的特殊转录组特征和克隆多样性减少 | 目前对母体与胎儿免疫共存的调控机制仍然认识不足 | 研究胎盘T细胞的转录组特征及其在母胎界面的作用 | 胎盘和匹配的母体外周人类T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | NA |
| 64 | 2024-08-05 |
Dynamics of human hematopoietic stem and progenitor cell differentiation to the erythroid lineage
2023-07, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2023.05.001
PMID:37172755
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综述 | 该文章深入探讨了红血球生成过程中所有细胞类型的免疫表型特征 | 文章强调了红血球不同阶段的异质性，并描述了与经典红血球生成模型的偏差 | 尽管scRNA-seq提供了新见解，但流式细胞术仍然是验证新免疫表型的主要方法 | 研究红血球生成过程中细胞类型的免疫表型特征及其异质性 | 研究对象包括人类造血干细胞和其转化为红血球的各个阶段 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-08-05 |
Unbiased Human Kidney Tissue Proteomics Identifies Matrix Metalloproteinase 7 as a Kidney Disease Biomarker
2023-07-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000141
PMID:37022120
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研究论文 | 该论文通过无偏的蛋白质组学分析确定基质金属蛋白酶7作为肾病生物标志物。 | 首次利用无偏的组织蛋白质组学信息发现MMP7与肾功能和纤维化的显著相关性，并识别MMP7作为未来肾功能下降的生物标志物。 | 研究主要集中于样本数量较小的个体，并可能受限于特定人群的临床信息。 | 研究人类糖尿病肾病（DKD）的无偏组织蛋白质组学，以确定潜在生物标志物。 | 23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本。 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | SomaScan平台与单细胞RNA测序 | NA | 组织样本与血液样本 | 共收集23名DKD患者和10名健康对照的肾脏样本，和11,030份血液样本 |
| 66 | 2024-08-05 |
The Long Noncoding RNA Cardiac Mesoderm Enhancer-Associated Noncoding RNA (Carmn) Is a Critical Regulator of Gastrointestinal Smooth Muscle Contractile Function and Motility
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.229
PMID:37030336
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研究论文 | 本研究揭示了长非编码RNA Carmn在调节胃肠道平滑肌收缩功能和运动性方面的关键作用 | 这是首次研究长非编码RNA在调节内脏平滑肌表型中的重要性 | 仅在小鼠模型中进行研究，人体临床相关性尚需进一步验证 | 研究Carmn在维持胃肠道平滑肌收缩功能中的角色 | 以小鼠为模型，重点研究内脏平滑肌细胞的功能 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 使用了小鼠及人类的胚胎、成年胃肠道组织样本 |
| 67 | 2024-08-05 |
Detection of the effect of microvibrational stimulation on human discarded immature oocytes by single-cell transcriptome sequencing technology
2023-Jul, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02837-5
PMID:37273164
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研究论文 | 本研究探讨了对人类未成熟卵母细胞施加微振动机械刺激后转录组水平的变化。 | 该研究首次使用单细胞转录组测序技术揭示微振动刺激对卵母细胞基因表达的影响。 | 研究仅使用了有限数量的卵母细胞样本，且主要集中在特定的刺激频率上。 | 研究微振动机械刺激对人类卵母细胞转录组的影响。 | 被收集的为辅助生殖周期中未受精的废弃卵母细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 12个（每组6个，分别为微振动组和静态培养组） |
| 68 | 2024-08-05 |
Stress promotes the infiltration of peripheral immune cells to the brain
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.05.003
PMID:37169132
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研究论文 | 本研究报道了应激后海马免疫微环境的变化，揭示了免疫细胞向海马的浸润与其适应或抗压能力之间的关系 | 首次在单细胞水平揭示了应激后海马中免疫细胞浸润的调控机制 | 本研究可能未考虑其他潜在因素对免疫细胞浸润的影响 | 探讨应激对海马中免疫细胞分布和功能的影响 | 研究对象为经历学习无助实验的小鼠，关注其海马区域的免疫细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫荧光 | NA | 生物数据 | 实验中使用了学习无助小鼠的多个样本 |
| 69 | 2024-08-05 |
Tumor gene signatures that correlate with release of extracellular vesicles shape the immune landscape in head and neck squamous cell carcinoma
2023-07-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad019
PMID:36752300
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研究论文 | 这项研究评估了与肿瘤释放的细胞外小泡相关的基因特征对抗肿瘤免疫反应的临床相关性和影响 | 研究揭示了肿瘤基因特征与细胞外小泡产生之间的关系，及其如何影响免疫细胞浸润和抗肿瘤免疫 | 样本来源限制于单一的癌症基因组图谱和几个小型数据集，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨头颈鳞状细胞癌中基因特征与细胞外小泡释放的相关性及其对免疫反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者的基因表达和免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 522名患者（癌症基因组图谱），250名患者（GSE65858数据集），18名患者（单细胞RNA测序数据集） |
| 70 | 2024-08-04 |
Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
2023-07, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-023-01390-w
PMID:37133723
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研究论文 | 本研究利用公共单细胞RNA-seq数据研究溃疡性结肠炎的组织微环境 | 研究揭示了溃疡性结肠炎特异性的免疫细胞标志，并探讨了不同免疫细胞间的相互作用 | 未提及所有数据集的细胞类型注释，可能影响细胞群体的选择 | 研究溃疡性结肠炎的组织微环境及其免疫细胞机制 | 溃疡性结肠炎患者的免疫细胞亚群 | 数字病理 | 肠道炎症 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及的样本量未具体说明 |
| 71 | 2024-08-05 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
|
研究论文 | 本文重新分析了单细胞RNA测序数据，未能支持小鼠非神经节细胞中存在单纯疱疹病毒1型的潜伏感染。 | 研究证明了在小鼠模型中，数据分析的不准确性导致了对潜伏病毒存在的错误结论。 | 该研究依赖于现有数据，未能提供新的实验数据。 | 重新分析与单纯疱疹病毒潜伏感染相关的RNA测序数据。 | 小鼠模型中的非神经节细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | RNA测序数据 | NA |
| 72 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis of the nervous system at small and large scales with instant partitions
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.14.549051
PMID:37503160
|
研究论文 | 这篇文章探讨了PIPseq在神经科学中进行单细胞RNA测序的应用。 | 引入PIPseq方法，能够在不同规模和神经科学实验中收集和序列化单细胞基因表达变化。 | 样本输入大小和初始资本投入的限制可能会排除一些研究者的应用。 | 研究PIPseq在单细胞RNA测序中的有效性和应用。 | 涉及多种样本和实验，包括小鼠模型和非传统模型物种的基因表达分析。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 数十个样本（每个样本1,000-100,000个细胞） |
| 73 | 2024-08-05 |
Emergence of highly profibrotic and proinflammatory Lrat+Fbln2+ HSC subpopulation in alcoholic hepatitis
2023-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32793
PMID:36181700
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研究论文 | 本研究识别了在酒精性肝炎中HSC的高纤维化和促炎性亚群 | 发现了Lrat+Fbln2+细胞亚群在酒精性肝炎中的显著扩展及其功能 | 实验主要集中在小鼠模型，可能与人类疾病表现有差异 | 研究酒精性肝炎中HSC和门静脉成纤维细胞的相对作用 | 小鼠模型中的胶原蛋白1α1表达细胞亚群 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 涉及Col1a1-GFP小鼠的多种处理，包括酒精性肝炎、CCl4和胆管结扎 |
| 74 | 2024-08-04 |
The Use of Single-Cell RNA-Sequencing and Spatial Transcriptomics in Understanding the Pathogenesis and Treatment of Skin Diseases
2023-Jul, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2023.100198
PMID:37205302
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review | 本论文回顾了单细胞RNA测序和空间转录组学在皮肤疾病研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学来剖析皮肤疾病的关键细胞成分及其空间排列 | NA | 提升皮肤疾病治疗的精准医学水平 | 皮肤疾病，包括异常伤口愈合、炎症性皮肤疾病和癌症 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-08-05 |
Single-Cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-Ring Cell Carcinoma
2023-07, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.03.008
PMID:36921674
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研究论文 | 本研究揭示了胃信号环细胞癌（GSRCC）肿瘤免疫微环境的特征及其临床意义 | 提供了GSRCC肿瘤免疫微环境特征的全面分子图谱，并指出CXCL13在适应性免疫无反应中的中介作用 | 样本量有限，仅包含32名晚期GC患者，可能影响结果的广泛适用性 | 探讨胃信号环细胞癌的肿瘤免疫微环境特征及其对临床结果的影响 | 纳入32名不同亚型的晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 针对抗体面板的质量细胞计数 | NA | RNA, 蛋白质 | 32名晚期胃癌患者 |
| 76 | 2024-08-05 |
CONSTRUCTION OF SEPSIS DIAGNOSTIC MODELS AND IDENTIFICATION OF MACROPHAGE SUBPOPULATIONS BASED ON PYROPTOSIS-RELATED GENES
2023-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002137
PMID:37179249
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研究论文 | 本文构建了基于炎性细胞死亡相关基因的败血症诊断模型，并识别了巨噬细胞亚群 | 创新点在于基于10种关键炎性细胞死亡相关基因构建败血症风险评分，并确定了一种与预后相关的巨噬细胞亚群 | 研究局限性在于样本来源仅依赖公共数据库，可能忽略了临床样本的多样性 | 研究炎性细胞死亡在败血症患者中的预后和诊断价值 | 研究对象包括败血症患者的单细胞和总体RNA序列数据 | 数字病理 | 败血症 | RNA-seq | 逻辑回归模型 | 基因表达数据 | 根据公共数据库进行分析，样本数量未明确 |
| 77 | 2024-08-07 |
Identifying leukocyte phenotypes by scRNA-seq to predict cardiovascular risk
2023-07, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00891-1
PMID:37217590
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-08-04 |
Single-cell and spatial transcriptomics identify a macrophage population associated with skeletal muscle fibrosis
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add9984
PMID:37418531
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研究论文 | 该文章研究了与骨骼肌纤维化相关的巨噬细胞群体 | 通过单细胞转录组分析，揭示了骨骼肌巨噬细胞的新型转录程序和其在肌肉病中的作用 | 未详细讨论巨噬细胞在不同类型肌病中的具体功能 | 探讨巨噬细胞在肌肉疾病发展中作用机制 | 骨骼肌中的健康和病变的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 发现六个巨噬细胞群体，涉及不同的肌肉病变样本 |
| 79 | 2024-08-04 |
Nextflow Pipeline for Visium and H&E Data from Patient-Derived Xenograft Samples
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550727
PMID:37546876
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研究论文 | 我们开发了一个自动化数据处理流程，以量化来自患者衍生异种移植样本的鼠和人数据 | 该文章的创新点在于设计了一个基于Nextflow DSL2的流程，首次组合了空间转录组学数据和对应的H&E染色全序列图像的数据处理 | 文章未提及具体的局限性 | 本研究旨在优化对患者衍生异种移植癌症标本的空间转录组学数据和H&E图像的同时处理 | 研究对象为来自四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本的数据集 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学和H&E染色成像 | NA | 图像和基因表达数据 | 四个黑色素瘤患者衍生异种移植样本 |
| 80 | 2024-08-05 |
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04869-7
PMID:37480481
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研究论文 | 本研究揭示了猪皮肤来源的多能成纤维母细胞前体的转录组特征及其潜在生殖功能 | 本研究发现猪皮肤来源干细胞（SDSCs）主要源于多能成纤维母细胞前体（MDFPs），并展示了其分化为原始生殖细胞样细胞（PGCLCs）的多能性和转录调控机制 | 尚未讨论SDSCs的细胞起源及其在体外分化成PGCLCs过程中的动态转录特征 | 探讨猪皮肤来源干细胞在不育治疗中的潜在应用 | 研究对象为猪皮肤来源干细胞及其分化过程 | 再生医学 | 不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |