本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-10-20 |
A distal lung organoid model to study interstitial lung disease, viral infection and human lung development
2023-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00827-6
PMID:37165073
|
研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官的策略 | 该方法能够重现肺发育过程,并生成具有分支形态、几乎无非肺内胚层谱系、含有间质且能重现间质性肺疾病的类器官 | NA | 研究间质性肺疾病、病毒感染和人类肺发育 | 人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官 | 干细胞研究 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 类器官生成时间约40天,可维持超过180天 | NA | NA | NA | NA |
| 62 | 2024-10-17 |
Genetic Insights of Schizophrenia via Single Cell RNA-Sequencing Analyses
2023-07-04, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbad002
PMID:36805283
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了精神分裂症的遗传机制 | 本文首次使用单细胞RNA测序数据识别出54个精神分裂症风险基因,其中三分之二未在传统组织测序数据中被发现 | 本文的研究结果依赖于单细胞RNA测序数据,未来需要更多研究来进一步验证这些发现 | 揭示精神分裂症的遗传机制 | 精神分裂症风险基因及其在特定脑细胞类型中的表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个精神分裂症风险基因 | NA | NA | NA | NA |
| 63 | 2024-10-15 |
The heterocellular heart: identities, interactions, and implications for cardiology
2023-07-26, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01000-6
PMID:37495826
|
综述 | 本文综述了心脏的异质细胞特性,包括主要的心脏细胞类型及其在稳态中的作用,并讨论了这些细胞间相互作用对心脏病学基础研究和治疗干预的潜在影响 | 利用单细胞测序技术识别心脏细胞的细微差异,并重新探讨了细胞身份的定义 | NA | 探讨心脏异质细胞特性及其对心脏病学的影响 | 心脏中的主要细胞类型及其相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-10-12 |
Spatially resolved transcriptomic profiles reveal unique defining molecular features of infiltrative 5ALA-metabolizing cells associated with glioblastoma recurrence
2023-07-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01207-1
PMID:37434262
|
研究论文 | 研究通过空间解析的转录组分析揭示了与胶质母细胞瘤复发相关的5-氨基乙酰丙酸代谢细胞的独特分子特征 | 首次揭示了5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的作用及其独特的分子特征 | 研究样本量较小,且仅限于IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | 探讨5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的分子特征及其潜在治疗价值 | 5-氨基乙酰丙酸代谢细胞及其在胶质母细胞瘤复发中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 空间解析的批量RNA分析 | NA | 转录组数据 | 10名IDH-wt胶质母细胞瘤患者和16名独立IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-10-05 |
NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.10.548456
PMID:37503127
|
研究论文 | 研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用 | 发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守,并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型,需要在临床试验中进一步验证 | 探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值 | 脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用,能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型,并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序,可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-09-30 |
MAPK inhibitor sensitivity scores predict sensitivity driven by the immune infiltration in pediatric low-grade gliomas
2023-07-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40235-8
PMID:37500667
|
研究论文 | 本文研究了MAPK抑制剂敏感性评分在预测儿童低级别胶质瘤免疫浸润驱动敏感性中的作用 | 通过单样本基因集富集分析计算MAPKi敏感性评分,并发现其与免疫细胞浸润和治疗反应相关 | 需要在前瞻性临床试验中验证这些评分 | 开发更复杂的生物标志物以识别可能从MAPK抑制剂治疗中受益的儿童低级别胶质瘤患者 | 儿童低级别胶质瘤及其对MAPK抑制剂的反应 | NA | 儿童低级别胶质瘤 | 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GDSC数据集和独立的PDX数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-09-30 |
Liver in infections: a single-cell and spatial transcriptomics perspective
2023-Jul-10, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00945-z
PMID:37430371
|
综述 | 本文综述了高吞吐量单细胞技术的发展及其在理解肝脏在感染中的功能方面的应用 | 本文重新定义了我们对肝脏在感染中的功能的理解,并揭示了以前未知的致病途径和疾病机制 | NA | 总结新兴高吞吐量单细胞技术的发展,并重新定义我们对肝脏在感染中的功能的理解 | 肝脏在感染中的功能,包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、疟原虫、血吸虫病、内毒素血症和新冠病毒病2019 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-09-27 |
Single-cell profiling of Arabidopsis leaves to Pseudomonas syringae infection
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112676
PMID:37342910
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析拟南芥叶片对丁香假单胞菌感染的响应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥叶片在感染丁香假单胞菌后的细胞异质性 | 研究仅限于拟南芥叶片对丁香假单胞菌的响应,未涉及其他植物或病原体 | 探讨植物叶片在病原体感染下的细胞异质性及其响应机制 | 拟南芥叶片在丁香假单胞菌感染下的单细胞响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过11,000个单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-09-25 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2023-Jul-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.07.13.23292633
PMID:37502836
|
研究论文 | 本文通过结合CITE-seq和scRNA-seq技术,详细描述了人类颈动脉粥样硬化的单细胞多模态景观 | 首次全面揭示了颈动脉粥样硬化病变中细胞的转录组和表型景观,并开发了首个用于分离病变中SMC衍生细胞的流式细胞术面板 | NA | 深入了解颈动脉粥样硬化病变中细胞的全面转录组和表型景观 | 颈动脉粥样硬化病变中的细胞类型及其与临床病理生理学的关联 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个病变样本,其中13个为有症状的 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-09-23 |
Yet uninfected? Resolving cell states of plants under pathogen attack
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100538
PMID:37533641
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了植物细胞在面对细菌病原体攻击时的异质性反应 | 首次采用单细胞转录组分析方法,深入研究了植物细胞在病原体攻击下的个体细胞反应 | NA | 旨在填补对植物细胞在病原体攻击下个体细胞反应理解的空白 | 植物细胞在细菌病原体攻击下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-09-23 |
A contamination focused approach for optimizing the single-cell RNA-seq experiment
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107242
PMID:37496679
|
研究论文 | 本文提出了一种基于污染控制的方法来优化单细胞RNA测序实验 | 引入了一套基于污染的定量指标来更有效地评估数据质量,并通过一系列控制实验展示了减少环境污染的方法 | 文中提到的许多参数在商业平台上难以实现 | 优化单细胞RNA测序实验以减少环境污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境污染问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-09-23 |
p53 Regulates the Extent of Fibroblast Proliferation and Fibrosis in Left Ventricle Pressure Overload
2023-07-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320324
PMID:37409456
|
研究论文 | 研究p53在左心室压力超负荷下调节成纤维细胞增殖和纤维化的机制 | 揭示了p53通过调控细胞周期控制成纤维细胞积累和ECM分泌的机制 | NA | 探讨p53在心脏成纤维细胞增殖和纤维化中的作用 | 心脏成纤维细胞和ECM | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tcf21MerCreMer小鼠模型进行研究 | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-09-23 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells promote key cell type transitions controlling plaque stability in atherosclerosis in a Klf4-dependent manner
2023-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.18.549539
PMID:37503181
|
研究论文 | 研究了血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 首次探讨了血管平滑肌来源的间质前体细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用,并揭示了Klf4依赖性调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探讨血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 血管平滑肌来源的间质前体细胞及其在动脉粥样硬化中的分化和功能 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学方法 | NA | 细胞 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-09-23 |
TimiGP: Inferring cell-cell interactions and prognostic associations in the tumor immune microenvironment through gene pairs
2023-07-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101121
PMID:37467716
|
研究论文 | 开发了一种名为TimiGP的计算方法,用于推断肿瘤免疫微环境中细胞间相互作用及其与预后的关联 | 提出了TimiGP方法,通过基因对推断细胞间相互作用,揭示免疫细胞相对丰度与预后的关联 | NA | 理解肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的预后关联,并开发新的治疗策略 | 肿瘤免疫微环境中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个独立的黑色素瘤数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-09-23 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2023-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.13.548855
PMID:37502835
|
研究论文 | 介绍了一种名为HATCHet2的新方法,用于从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 引入了新的统计量mirrored haplotype B-allele frequency (mhBAF),用于识别不同肿瘤克隆中具有不同亲本单倍型拷贝数的镜像亚克隆拷贝数变异 | NA | 开发一种新方法,从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 前列腺癌样本中的拷贝数变异 | 数字病理学 | 前列腺癌 | DNA测序 | NA | DNA序列数据 | 50个前列腺癌样本,来自10名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-09-23 |
A novel cuproptosis-related diagnostic gene signature and differential expression validation in atherosclerosis
2023-Jul-14, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-023-00131-5
PMID:37442861
|
研究论文 | 研究探讨了铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值和差异表达验证 | 首次报道了铜死亡相关基因FDX1、SLC31A1和GLS在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 揭示铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的分子机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化中的铜死亡相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-09-23 |
Multiplex enzymatic synthesis of DNA with single-base resolution
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi0263
PMID:37418522
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的多重DNA合成方法,通过单碱基分辨率实现了高度并行的DNA合成 | 本文创新性地使用微机电系统喷墨分配终端脱氧核苷酸转移酶和3'阻断核苷酸,并通过批量滑动洗涤去除3'阻断基团,实现了微尺度空间控制核酸序列和长度 | NA | 开发一种适用于蛋白质工程和空间转录组学等需要高序列多样性的寡核苷酸池或阵列的酶促DNA合成方法 | 酶促DNA合成方法及其在微尺度空间控制核酸序列和长度中的应用 | NA | NA | 酶促DNA合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-09-23 |
Single-Cell RNA Sequencing: Opportunities and Challenges for Studies on Corneal Biology in Health and Disease
2023-07-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12131808
PMID:37443842
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类角膜生物学研究中的应用,重点讨论了其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 单细胞RNA测序作为一种革命性工具,能够识别角膜组织中的细胞状态 | 目前对角膜中特定细胞类型的各种细胞状态和关键基因的理解尚不充分 | 探讨单细胞RNA测序在角膜生物学研究中的应用及其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 人类角膜的细胞状态和关键基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-09-23 |
Age-related alterations in meningeal immunity drive impaired CNS lymphatic drainage
2023-07-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221929
PMID:37027179
|
研究论文 | 研究揭示了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化如何导致中枢神经系统淋巴引流受损 | 首次证明了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化是导致淋巴引流功能下降的关键因素 | 研究仅在老年小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探讨年龄相关的小胶质淋巴管功能下降的机制及其潜在治疗策略 | 小胶质淋巴管内皮细胞和免疫细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠的小胶质淋巴管内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |