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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-07 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
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病例报告 | 报告首例基因工程猪-人心脏异种移植的临床病例,分析移植功能障碍的原因 | 首次在人类患者中实施基因工程猪心脏异种移植并详细分析移植失败机制 | 单病例研究,结果可能不具有普遍性 | 探索异种心脏移植的临床可行性和失败机制 | 57岁终末期心力衰竭男性患者和基因工程猪心脏移植物 | 移植医学 | 心血管疾病 | DNA PCR, RNA转录分析, 单细胞RNA测序, 电子显微镜, 免疫组化 | NA | 临床监测数据, 分子生物学数据, 病理学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-07 |
CTLA4 protects against maladaptive cytotoxicity during the differentiation of effector and follicular CD4+ T cells
2023-07, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01027-8
PMID:37161048
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示CTLA4在调控CD4+ T细胞分化过程中抑制细胞毒性表型形成的作用机制 | 首次发现CD57标记的CD4+ T细胞具有细胞毒性功能,并证明CTLA4是调控该表型的关键因子 | 样本量有限,主要聚焦于原发性抗体缺陷症患者 | 探究CTLA4在CD4+ T细胞分化过程中的保护作用机制 | 原发性抗体缺陷症患者的CD57+ CD4+ T细胞 | 免疫学 | 原发性抗体缺陷症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 匹配的血液和扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-07 |
Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis
2023-07-08, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-023-03181-x
PMID:37422651
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研究论文 | 通过生物信息学分析揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在分子机制 | 整合单细胞转录组和批量RNA测序数据,结合分子对接和动力学模拟筛选姜黄素治疗牙周炎的关键靶点 | 研究基于计算模拟,缺乏实验验证 | 探索姜黄素治疗牙周炎的分子作用机制 | 牙周炎相关基因和姜黄素分子 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | PPI网络分析, KEGG/GO富集分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE164241, GSE10334, GSE16134) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 使用Seurat和Limma软件包进行数据分析 |
| 44 | 2025-10-07 |
Spatial and single-nucleus transcriptomic analysis of genetic and sporadic forms of Alzheimer's Disease
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550282
PMID:37546983
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病的遗传性和散发性形式 | 首次结合空间转录组学和单细胞核RNA测序技术,同时研究散发性AD和唐氏综合征相关AD,并进行跨物种比较 | 样本数量未明确说明,研究主要聚焦于早期和晚期AD阶段 | 探索阿尔茨海默病的转录组特征及其在空间和细胞类型水平的变化 | 人类皮质样本(早期AD、晚期AD、唐氏综合征相关AD)和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,单细胞核RNA测序,淀粉样斑块成像 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-07 |
T-BET and EOMES sustain mature human NK cell identity and antitumor function
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162530
PMID:37279078
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研究论文 | 本研究揭示了T-BET和EOMES转录因子在维持成熟人类NK细胞身份和抗肿瘤功能中的关键作用 | 首次在未扩增的原代人类NK细胞中使用CRISPR/Cas9技术删除T-BET和EOMES,发现这些转录因子不仅启动NK细胞发育,还持续维持其成熟状态和功能特性 | 研究主要关注原代人类NK细胞,未涉及其他物种或疾病模型 | 探究T-BET和EOMES转录因子在成熟人类NK细胞稳态、功能和分子编程中的持续需求 | 未扩增的原代人类NK细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类NK细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-07 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
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研究论文 | 本研究探讨了紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老在化疗脑认知功能下降中的作用机制 | 首次证明紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老是化疗脑的关键致病机制,并通过遗传和药理学方法清除衰老细胞逆转了认知功能障碍 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 阐明紫杉醇诱导认知功能障碍的分子机制并探索潜在治疗策略 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 化疗相关认知障碍 | 流式细胞术,单细胞转录组测序 | NA | 生理功能数据,分子生物学数据,行为学数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-01-01 |
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq identified cancer-associated fibroblasts-related signature as a prognostic factor for immunotherapy in NSCLC
2023-Jul, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03428-0
PMID:37010552
|
研究论文 | 本文通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,识别了与非小细胞肺癌(NSCLC)相关的癌症相关成纤维细胞(CAF)特征,并构建了一个基于CAF的风险模型,用于预测NSCLC患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,构建了一个基于CAF的风险模型,并验证了其在NSCLC患者预后和免疫治疗反应中的预测价值 | 研究结果主要基于回顾性数据,需要进一步的前瞻性研究来验证其临床应用的可靠性 | 探索CAF在NSCLC中的临床意义和生物学功能,并构建一个基于CAF的风险模型用于预测患者的预后和免疫治疗反应 | 非小细胞肺癌(NSCLC)患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | RNA测序数据,单细胞RNA测序数据 | 四个独立的NSCLC队列 | NA | NA | NA | NA |
| 48 | 2025-01-01 |
CiTSA: a comprehensive platform provides experimentally supported signatures of cancer immunotherapy and analysis tools based on bulk and scRNA-seq data
2023-Jul, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03414-6
PMID:36912931
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CiTSA的综合平台,该平台提供了基于实验支持的癌症免疫治疗签名和分析工具,支持批量RNA测序和单细胞RNA测序数据 | 首次提供了一个实验支持的癌症免疫治疗签名基准数据集,并开发了CiTSA平台,集成了878个条目,涵盖412个签名和30种癌症类型 | 未提及具体的研究局限性 | 为研究人员提供一个全面的资源,以发现和分析癌症免疫治疗的签名,并进一步探索其机制 | 癌症免疫治疗的签名,包括基因、细胞和免疫治疗之间的关联 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 878个条目,涵盖30种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 49 | 2024-12-18 |
Spatially resolved cell atlas of the teleost telencephalon and deep homology of the vertebrate forebrain
2023-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549873
PMID:37503039
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学和单核RNA测序技术,生成了慈鲷鱼端脑的空间解析转录图谱,并比较了慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | 本文揭示了鱼类端脑与四足动物的纹状体、海马和皮层细胞群之间的显著转录相似性,为脊椎动物前脑的组织和进化提供了新的见解 | NA | 研究脊椎动物前脑的组织和进化 | 慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | NA | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2024-11-15 |
ISG15 and ISGylation modulates cancer stem cell-like characteristics in promoting tumor growth of anaplastic thyroid carcinoma
2023-Jul-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02751-9
PMID:37501099
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研究论文 | 研究揭示了ISG15和ISGylation在调节甲状腺未分化癌(ATC)干细胞样特性中的新作用 | 首次揭示了ISG15在调节ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | NA | 探讨ISG15和ISGylation在ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | 甲状腺未分化癌(ATC)的干细胞样特性 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2024-11-12 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
|
研究论文 | 研究报告了一种改进的MYC驱动的肝母细胞瘤样小鼠模型,并利用CRISPR-Cas9筛选技术识别了癌症依赖基因和化疗的遗传修饰因子 | 开发了一种新的肝母细胞瘤小鼠模型,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别了不同的肝母细胞瘤细胞亚群,发现了与人类肝母细胞瘤共享的可药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步验证在人类患者中的有效性 | 研究肝母细胞瘤的发病机制,并开发新的治疗策略 | 肝母细胞瘤及其治疗中的化疗反应 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型中的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2024-11-08 |
Single-nucleus chromatin accessibility identifies a critical role for TWIST1 in idiopathic pulmonary fibrosis myofibroblast activity
2023-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00474-2022
PMID:37142338
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研究论文 | 研究通过单核染色质可及性分析,揭示了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的关键作用 | 首次通过单核染色质可及性分析结合单细胞RNA测序数据,精确识别了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞中的关键转录因子活性 | 研究样本量较小,仅包括3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照 | 探讨TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的调控作用 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单核染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照的肺组织,以及10例特发性肺纤维化和8例对照的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |
| 53 | 2024-10-20 |
A distal lung organoid model to study interstitial lung disease, viral infection and human lung development
2023-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00827-6
PMID:37165073
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研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官的策略 | 该方法能够重现肺发育过程,并生成具有分支形态、几乎无非肺内胚层谱系、含有间质且能重现间质性肺疾病的类器官 | NA | 研究间质性肺疾病、病毒感染和人类肺发育 | 人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官 | 干细胞研究 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 类器官生成时间约40天,可维持超过180天 | NA | NA | NA | NA |
| 54 | 2024-10-17 |
Genetic Insights of Schizophrenia via Single Cell RNA-Sequencing Analyses
2023-07-04, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbad002
PMID:36805283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析,揭示了精神分裂症的遗传机制 | 本文首次使用单细胞RNA测序数据识别出54个精神分裂症风险基因,其中三分之二未在传统组织测序数据中被发现 | 本文的研究结果依赖于单细胞RNA测序数据,未来需要更多研究来进一步验证这些发现 | 揭示精神分裂症的遗传机制 | 精神分裂症风险基因及其在特定脑细胞类型中的表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个精神分裂症风险基因 | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2024-10-15 |
The heterocellular heart: identities, interactions, and implications for cardiology
2023-07-26, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01000-6
PMID:37495826
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综述 | 本文综述了心脏的异质细胞特性,包括主要的心脏细胞类型及其在稳态中的作用,并讨论了这些细胞间相互作用对心脏病学基础研究和治疗干预的潜在影响 | 利用单细胞测序技术识别心脏细胞的细微差异,并重新探讨了细胞身份的定义 | NA | 探讨心脏异质细胞特性及其对心脏病学的影响 | 心脏中的主要细胞类型及其相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2024-10-12 |
Spatially resolved transcriptomic profiles reveal unique defining molecular features of infiltrative 5ALA-metabolizing cells associated with glioblastoma recurrence
2023-07-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01207-1
PMID:37434262
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研究论文 | 研究通过空间解析的转录组分析揭示了与胶质母细胞瘤复发相关的5-氨基乙酰丙酸代谢细胞的独特分子特征 | 首次揭示了5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的作用及其独特的分子特征 | 研究样本量较小,且仅限于IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | 探讨5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的分子特征及其潜在治疗价值 | 5-氨基乙酰丙酸代谢细胞及其在胶质母细胞瘤复发中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 空间解析的批量RNA分析 | NA | 转录组数据 | 10名IDH-wt胶质母细胞瘤患者和16名独立IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-10-05 |
NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.10.548456
PMID:37503127
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研究论文 | 研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用 | 发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守,并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型,需要在临床试验中进一步验证 | 探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值 | 脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用,能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型,并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序,可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-09-30 |
MAPK inhibitor sensitivity scores predict sensitivity driven by the immune infiltration in pediatric low-grade gliomas
2023-07-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40235-8
PMID:37500667
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研究论文 | 本文研究了MAPK抑制剂敏感性评分在预测儿童低级别胶质瘤免疫浸润驱动敏感性中的作用 | 通过单样本基因集富集分析计算MAPKi敏感性评分,并发现其与免疫细胞浸润和治疗反应相关 | 需要在前瞻性临床试验中验证这些评分 | 开发更复杂的生物标志物以识别可能从MAPK抑制剂治疗中受益的儿童低级别胶质瘤患者 | 儿童低级别胶质瘤及其对MAPK抑制剂的反应 | NA | 儿童低级别胶质瘤 | 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GDSC数据集和独立的PDX数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-09-30 |
Liver in infections: a single-cell and spatial transcriptomics perspective
2023-Jul-10, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00945-z
PMID:37430371
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综述 | 本文综述了高吞吐量单细胞技术的发展及其在理解肝脏在感染中的功能方面的应用 | 本文重新定义了我们对肝脏在感染中的功能的理解,并揭示了以前未知的致病途径和疾病机制 | NA | 总结新兴高吞吐量单细胞技术的发展,并重新定义我们对肝脏在感染中的功能的理解 | 肝脏在感染中的功能,包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、疟原虫、血吸虫病、内毒素血症和新冠病毒病2019 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |