单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 352 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 hours
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543931
PMID:37333221
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人类胰岛在24小时葡萄糖暴露下的基因表达变化 | 首次在单细胞分辨率下系统分析人类胰岛对葡萄糖暴露的时间动态响应，并识别与2型糖尿病相关的基因模块 | 仅使用两名供体的胰岛样本，样本量有限 | 探索高血糖对人类胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病的关联 | 人类胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名供体的人类胰岛，在7个时间点进行采样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-06 |
Macrophage-mediated extracellular matrix remodeling controls host Staphylococcus aureus susceptibility in the skin
2023-07-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.006
PMID:37402364
|
研究论文 | 本研究揭示了真皮下巨噬细胞通过调控细胞外基质成分透明质酸影响宿主对金黄色葡萄球菌皮肤感染的易感性 | 首次发现真皮下巨噬细胞通过IGF1-LYVE-1通路调控透明质酸清除，从而影响金黄色葡萄球菌感染结局 | 研究主要聚焦于巨噬细胞特异性机制，其他免疫细胞在感染过程中的作用尚未充分探讨 | 探究真皮下巨噬细胞在宿主对金黄色葡萄球菌皮肤感染易感性中的调控机制 | 小鼠真皮下巨噬细胞及其与细胞外基质的相互作用 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-06 |
Combined multidimensional single-cell protein and RNA profiling dissects the cellular and functional heterogeneity of thymic epithelial cells
2023-07-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39722-9
PMID:37429879
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞蛋白质和RNA分析技术，解析了胸腺上皮细胞的细胞和功能异质性 | 首次将大规模平行流式细胞术与机器学习相结合，解析胸腺上皮细胞表型，并通过CITEseq技术将表型与RNA谱定义的细胞亚型相关联 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细特征 | 解析胸腺上皮细胞的细胞和功能异质性 | 胸腺上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 大规模平行流式细胞术，机器学习，CITEseq | 机器学习 | 单细胞蛋白质数据，单细胞RNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，CITEseq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Plakoglobin is a mechanoresponsive regulator of naive pluripotency
2023-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39515-0
PMID:37419903
|
研究论文 | 本研究揭示了Plakoglobin作为机械敏感调节因子在调控初始多能性中的新作用 | 首次发现Plakoglobin是机械敏感性的初始多能性调节因子，并证明其过表达可在多能性不稳定条件下重建初始多能性基因调控网络 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞，人类胚胎验证数据有限 | 探索生物力学信号如何转化为转录程序，揭示哺乳动物植入前发育机制 | 小鼠胚胎干细胞、人和小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、微流控技术 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Human and murine fibroblast single-cell transcriptomics reveals fibroblast clusters are differentially affected by ageing and serum cholesterol
2023-07-04, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad016
PMID:36718802
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人和小鼠动脉中成纤维细胞的异质性及其在心血管疾病中的调控机制 | 首次鉴定出PDGFRA和DPEP1作为成纤维细胞特异性标志物，并发现三个不同的成纤维细胞轨迹在衰老和高胆固醇条件下差异调控 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证相对有限 | 研究心血管疾病中成纤维细胞的异质性及其对风险因素的响应 | 人和小鼠动脉中的成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 流式细胞术, 伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 组织切片图像 | C57BL/6J小鼠和LDLR KO小鼠的主动脉组织，人类颈动脉和主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
|
研究论文 | 本文探讨了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量方法及其应用前景 | 开发了机器学习辅助的转录组定量方法，用于测量单个CD8+ T细胞的年龄 | NA | 更好地理解T细胞衰老过程，改进与年龄相关的T细胞变化测量方法 | CD8+ T细胞 | 机器学习 | 传染病,癌症,老年疾病 | 转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Modelling capture efficiency of single-cell RNA-sequencing data improves inference of transcriptome-wide burst kinetics
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad395
PMID:37354494
|
研究论文 | 提出一种新的数学理论来建模单细胞RNA测序数据中的捕获效率变异，改进转录组范围内爆发动力学的推断 | 开发了能够同时捕捉爆发动力学、细胞大小变异和捕获效率变异的新型数学模型，并提出了基于神经网络和近似贝叶斯计算的推断方法 | NA | 改进从单细胞RNA测序数据推断基因表达爆发动力学的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络, 近似贝叶斯计算 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Expression of Key Steroidogenic Enzymes in Human Placenta and Associated Adverse Pregnancy Outcomes
2023-Jul, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000167
PMID:40416852
|
综述 | 本文综述了人类胎盘中关键类固醇生成酶的表达及其与不良妊娠结局的关联 | 系统总结了胎盘类固醇生成酶的上游调控机制，并探讨了单细胞测序技术在评估其功能和细胞来源方面的潜力 | 胎盘类固醇生成酶表达与不良妊娠结局的关系仍存在争议 | 探讨胎盘类固醇生成酶在生理和病理状态下的调控机制及其与妊娠结局的关联 | 人类胎盘组织及类固醇生成酶 | 生殖医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-07 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
|
病例报告 | 报告首例基因工程猪-人心脏异种移植的临床病例，分析移植功能障碍的原因 | 首次在人类患者中实施基因工程猪心脏异种移植并详细分析移植失败机制 | 单病例研究，结果可能不具有普遍性 | 探索异种心脏移植的临床可行性和失败机制 | 57岁终末期心力衰竭男性患者和基因工程猪心脏移植物 | 移植医学 | 心血管疾病 | DNA PCR, RNA转录分析, 单细胞RNA测序, 电子显微镜, 免疫组化 | NA | 临床监测数据, 分子生物学数据, 病理学数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-07 |
CTLA4 protects against maladaptive cytotoxicity during the differentiation of effector and follicular CD4+ T cells
2023-07, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-023-01027-8
PMID:37161048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示CTLA4在调控CD4+ T细胞分化过程中抑制细胞毒性表型形成的作用机制 | 首次发现CD57标记的CD4+ T细胞具有细胞毒性功能，并证明CTLA4是调控该表型的关键因子 | 样本量有限，主要聚焦于原发性抗体缺陷症患者 | 探究CTLA4在CD4+ T细胞分化过程中的保护作用机制 | 原发性抗体缺陷症患者的CD57+ CD4+ T细胞 | 免疫学 | 原发性抗体缺陷症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 匹配的血液和扁桃体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-07 |
Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis
2023-07-08, BMC oral health
IF:2.6Q1
DOI:10.1186/s12903-023-03181-x
PMID:37422651
|
研究论文 | 通过生物信息学分析揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在分子机制 | 整合单细胞转录组和批量RNA测序数据，结合分子对接和动力学模拟筛选姜黄素治疗牙周炎的关键靶点 | 研究基于计算模拟，缺乏实验验证 | 探索姜黄素治疗牙周炎的分子作用机制 | 牙周炎相关基因和姜黄素分子 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟 | PPI网络分析, KEGG/GO富集分析 | 基因表达数据 | 三个GEO数据集(GSE164241, GSE10334, GSE16134) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 使用Seurat和Limma软件包进行数据分析 |
| 52 | 2025-10-07 |
Spatial and single-nucleus transcriptomic analysis of genetic and sporadic forms of Alzheimer's Disease
2023-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.550282
PMID:37546983
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞核RNA测序分析阿尔茨海默病的遗传性和散发性形式 | 首次结合空间转录组学和单细胞核RNA测序技术，同时研究散发性AD和唐氏综合征相关AD，并进行跨物种比较 | 样本数量未明确说明，研究主要聚焦于早期和晚期AD阶段 | 探索阿尔茨海默病的转录组特征及其在空间和细胞类型水平的变化 | 人类皮质样本（早期AD、晚期AD、唐氏综合征相关AD）和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞核RNA测序，淀粉样斑块成像 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-07 |
T-BET and EOMES sustain mature human NK cell identity and antitumor function
2023-07-03, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI162530
PMID:37279078
|
研究论文 | 本研究揭示了T-BET和EOMES转录因子在维持成熟人类NK细胞身份和抗肿瘤功能中的关键作用 | 首次在未扩增的原代人类NK细胞中使用CRISPR/Cas9技术删除T-BET和EOMES，发现这些转录因子不仅启动NK细胞发育，还持续维持其成熟状态和功能特性 | 研究主要关注原代人类NK细胞，未涉及其他物种或疾病模型 | 探究T-BET和EOMES转录因子在成熟人类NK细胞稳态、功能和分子编程中的持续需求 | 未扩增的原代人类NK细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 原代人类NK细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-10-07 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
|
研究论文 | 本研究探讨了紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老在化疗脑认知功能下降中的作用机制 | 首次证明紫杉醇诱导的脑血管内皮细胞衰老是化疗脑的关键致病机制，并通过遗传和药理学方法清除衰老细胞逆转了认知功能障碍 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类患者中验证 | 阐明紫杉醇诱导认知功能障碍的分子机制并探索潜在治疗策略 | 转基因p16-3MR小鼠 | 神经科学 | 化疗相关认知障碍 | 流式细胞术，单细胞转录组测序 | NA | 生理功能数据，分子生物学数据，行为学数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 55 | 2025-01-01 |
Integrative analyses of bulk and single-cell RNA-seq identified cancer-associated fibroblasts-related signature as a prognostic factor for immunotherapy in NSCLC
2023-Jul, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03428-0
PMID:37010552
|
研究论文 | 本文通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别了与非小细胞肺癌（NSCLC）相关的癌症相关成纤维细胞（CAF）特征，并构建了一个基于CAF的风险模型，用于预测NSCLC患者的预后和免疫治疗反应 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于CAF的风险模型，并验证了其在NSCLC患者预后和免疫治疗反应中的预测价值 | 研究结果主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究来验证其临床应用的可靠性 | 探索CAF在NSCLC中的临床意义和生物学功能，并构建一个基于CAF的风险模型用于预测患者的预后和免疫治疗反应 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 四个独立的NSCLC队列 | NA | NA | NA | NA |
| 56 | 2025-01-01 |
CiTSA: a comprehensive platform provides experimentally supported signatures of cancer immunotherapy and analysis tools based on bulk and scRNA-seq data
2023-Jul, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03414-6
PMID:36912931
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CiTSA的综合平台，该平台提供了基于实验支持的癌症免疫治疗签名和分析工具，支持批量RNA测序和单细胞RNA测序数据 | 首次提供了一个实验支持的癌症免疫治疗签名基准数据集，并开发了CiTSA平台，集成了878个条目，涵盖412个签名和30种癌症类型 | 未提及具体的研究局限性 | 为研究人员提供一个全面的资源，以发现和分析癌症免疫治疗的签名，并进一步探索其机制 | 癌症免疫治疗的签名，包括基因、细胞和免疫治疗之间的关联 | 数字病理学 | 癌症 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 878个条目，涵盖30种癌症类型 | NA | NA | NA | NA |
| 57 | 2024-12-18 |
Spatially resolved cell atlas of the teleost telencephalon and deep homology of the vertebrate forebrain
2023-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549873
PMID:37503039
|
研究论文 | 本文通过空间转录组学和单核RNA测序技术，生成了慈鲷鱼端脑的空间解析转录图谱，并比较了慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | 本文揭示了鱼类端脑与四足动物的纹状体、海马和皮层细胞群之间的显著转录相似性，为脊椎动物前脑的组织和进化提供了新的见解 | NA | 研究脊椎动物前脑的组织和进化 | 慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2024-11-15 |
ISG15 and ISGylation modulates cancer stem cell-like characteristics in promoting tumor growth of anaplastic thyroid carcinoma
2023-Jul-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02751-9
PMID:37501099
|
研究论文 | 研究揭示了ISG15和ISGylation在调节甲状腺未分化癌（ATC）干细胞样特性中的新作用 | 首次揭示了ISG15在调节ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | NA | 探讨ISG15和ISGylation在ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | 甲状腺未分化癌（ATC）的干细胞样特性 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 59 | 2024-11-12 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
|
研究论文 | 研究报告了一种改进的MYC驱动的肝母细胞瘤样小鼠模型，并利用CRISPR-Cas9筛选技术识别了癌症依赖基因和化疗的遗传修饰因子 | 开发了一种新的肝母细胞瘤小鼠模型，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别了不同的肝母细胞瘤细胞亚群，发现了与人类肝母细胞瘤共享的可药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类患者中的有效性 | 研究肝母细胞瘤的发病机制，并开发新的治疗策略 | 肝母细胞瘤及其治疗中的化疗反应 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型中的细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 60 | 2024-11-08 |
Single-nucleus chromatin accessibility identifies a critical role for TWIST1 in idiopathic pulmonary fibrosis myofibroblast activity
2023-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00474-2022
PMID:37142338
|
研究论文 | 研究通过单核染色质可及性分析，揭示了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的关键作用 | 首次通过单核染色质可及性分析结合单细胞RNA测序数据，精确识别了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞中的关键转录因子活性 | 研究样本量较小，仅包括3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照 | 探讨TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的调控作用 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单核染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照的肺组织，以及10例特发性肺纤维化和8例对照的单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA |