单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-12-18 |
Spatially resolved cell atlas of the teleost telencephalon and deep homology of the vertebrate forebrain
2023-Jul-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.20.549873
PMID:37503039
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研究论文 | 本文通过空间转录组学和单核RNA测序技术，生成了慈鲷鱼端脑的空间解析转录图谱，并比较了慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | 本文揭示了鱼类端脑与四足动物的纹状体、海马和皮层细胞群之间的显著转录相似性，为脊椎动物前脑的组织和进化提供了新的见解 | NA | 研究脊椎动物前脑的组织和进化 | 慈鲷鱼端脑与其他脊椎动物的细胞类型和解剖区域 | NA | NA | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22 | 2024-11-15 |
ISG15 and ISGylation modulates cancer stem cell-like characteristics in promoting tumor growth of anaplastic thyroid carcinoma
2023-Jul-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02751-9
PMID:37501099
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研究论文 | 研究揭示了ISG15和ISGylation在调节甲状腺未分化癌（ATC）干细胞样特性中的新作用 | 首次揭示了ISG15在调节ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | NA | 探讨ISG15和ISGylation在ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | 甲状腺未分化癌（ATC）的干细胞样特性 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA |
| 23 | 2024-11-12 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
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研究论文 | 研究报告了一种改进的MYC驱动的肝母细胞瘤样小鼠模型，并利用CRISPR-Cas9筛选技术识别了癌症依赖基因和化疗的遗传修饰因子 | 开发了一种新的肝母细胞瘤小鼠模型，并通过单细胞RNA测序和空间转录组学识别了不同的肝母细胞瘤细胞亚群，发现了与人类肝母细胞瘤共享的可药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步验证在人类患者中的有效性 | 研究肝母细胞瘤的发病机制，并开发新的治疗策略 | 肝母细胞瘤及其治疗中的化疗反应 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型中的细胞系 |
| 24 | 2024-11-08 |
Single-nucleus chromatin accessibility identifies a critical role for TWIST1 in idiopathic pulmonary fibrosis myofibroblast activity
2023-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00474-2022
PMID:37142338
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研究论文 | 研究通过单核染色质可及性分析，揭示了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的关键作用 | 首次通过单核染色质可及性分析结合单细胞RNA测序数据，精确识别了TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞中的关键转录因子活性 | 研究样本量较小，仅包括3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照 | 探讨TWIST1在特发性肺纤维化肌成纤维细胞活性中的调控作用 | 特发性肺纤维化患者的肺组织和肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序、单核染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 3例特发性肺纤维化患者和2例供体对照的肺组织，以及10例特发性肺纤维化和8例对照的单细胞RNA测序数据 |
| 25 | 2024-10-20 |
A distal lung organoid model to study interstitial lung disease, viral infection and human lung development
2023-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-023-00827-6
PMID:37165073
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研究论文 | 本文描述了一种将人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官的策略 | 该方法能够重现肺发育过程，并生成具有分支形态、几乎无非肺内胚层谱系、含有间质且能重现间质性肺疾病的类器官 | NA | 研究间质性肺疾病、病毒感染和人类肺发育 | 人类多能干细胞定向分化为远端肺类器官 | 干细胞研究 | 间质性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 类器官生成时间约40天，可维持超过180天 |
| 26 | 2024-10-17 |
Genetic Insights of Schizophrenia via Single Cell RNA-Sequencing Analyses
2023-07-04, Schizophrenia bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/schbul/sbad002
PMID:36805283
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了精神分裂症的遗传机制 | 本文首次使用单细胞RNA测序数据识别出54个精神分裂症风险基因，其中三分之二未在传统组织测序数据中被发现 | 本文的研究结果依赖于单细胞RNA测序数据，未来需要更多研究来进一步验证这些发现 | 揭示精神分裂症的遗传机制 | 精神分裂症风险基因及其在特定脑细胞类型中的表达 | 基因组学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个精神分裂症风险基因 |
| 27 | 2024-10-15 |
The heterocellular heart: identities, interactions, and implications for cardiology
2023-07-26, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-023-01000-6
PMID:37495826
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综述 | 本文综述了心脏的异质细胞特性，包括主要的心脏细胞类型及其在稳态中的作用，并讨论了这些细胞间相互作用对心脏病学基础研究和治疗干预的潜在影响 | 利用单细胞测序技术识别心脏细胞的细微差异，并重新探讨了细胞身份的定义 | NA | 探讨心脏异质细胞特性及其对心脏病学的影响 | 心脏中的主要细胞类型及其相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 28 | 2024-10-13 |
An atlas of healthy and injured cell states and niches in the human kidney
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-05769-3
PMID:37468583
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研究论文 | 本文通过应用多种单细胞和单核测序技术以及空间成像技术，构建了健康和受损人类肾脏细胞状态和微环境的综合图谱 | 本文首次构建了包含51种主要细胞类型的高分辨率细胞图谱，其中包括罕见和先前未描述的细胞群体，并定义了28种在肾损伤中改变的细胞状态 | NA | 研究肾脏疾病的复杂性，定义细胞类型和状态及其在组织微环境中的相互作用 | 健康和患病的人类肾脏 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序、单核测序、空间转录组学 | NA | 细胞数据、图像数据 | 45个健康肾脏供体和48个患病肾脏患者，超过400,000个细胞或核 |
| 29 | 2024-10-12 |
Spatially resolved transcriptomic profiles reveal unique defining molecular features of infiltrative 5ALA-metabolizing cells associated with glioblastoma recurrence
2023-07-11, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-023-01207-1
PMID:37434262
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研究论文 | 研究通过空间解析的转录组分析揭示了与胶质母细胞瘤复发相关的5-氨基乙酰丙酸代谢细胞的独特分子特征 | 首次揭示了5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的作用及其独特的分子特征 | 研究样本量较小，且仅限于IDH-wt胶质母细胞瘤患者 | 探讨5-氨基乙酰丙酸代谢细胞在胶质母细胞瘤复发中的分子特征及其潜在治疗价值 | 5-氨基乙酰丙酸代谢细胞及其在胶质母细胞瘤复发中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 空间解析的批量RNA分析 | NA | 转录组数据 | 10名IDH-wt胶质母细胞瘤患者和16名独立IDH-wt胶质母细胞瘤患者 |
| 30 | 2024-10-08 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
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研究论文 | 构建跨物种的DRG和TG细胞图谱，描述了6个物种和19项研究中的18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 首次构建了跨物种的DRG和TG细胞图谱，并展示了其在注释新测序的DRG细胞中的应用 | 跨物种的转录组定义细胞类型比较仍然具有挑战性 | 研究外周感觉神经元的多样性及其在不同物种中的转录组特征 | 背根神经节（DRG）和三叉神经节（TG）中的感觉神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及6个物种和19项研究的细胞样本 |
| 31 | 2024-10-05 |
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 hours
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543931
PMID:37333221
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研究论文 | 研究探讨了高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了不同葡萄糖浓度下人类胰腺胰岛基因表达的动态变化 | 样本量较小，仅来自两个捐赠者 | 探索高血糖对人类胰腺胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病的关系 | 人类胰腺胰岛细胞 | 基因组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个捐赠者的胰腺胰岛细胞 |
| 32 | 2024-10-05 |
NOTCH3 drives meningioma tumorigenesis and resistance to radiotherapy
2023-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.10.548456
PMID:37503127
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研究论文 | 研究报告NOTCH3在驱动脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用 | 发现NOTCH3+脑膜瘤壁细胞在人类、狗和鼠中保守，并揭示了NOTCH3在肿瘤起始、细胞增殖、血管生成和放射治疗抵抗中的作用 | 研究主要基于小鼠遗传和异种移植模型，需要在临床试验中进一步验证 | 探讨NOTCH3在脑膜瘤肿瘤发生和放射治疗抵抗中的作用及其潜在治疗价值 | 脑膜瘤及其对放射治疗的抵抗性 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞转录组学、谱系追踪和成像技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及人类、狗和鼠的脑膜瘤样本 |
| 33 | 2024-10-01 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Applications in the Study of Psychiatric Disorders
2023-Jul, Biological psychiatry global open science
DOI:10.1016/j.bpsgos.2022.03.013
PMID:37519459
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术及其在精神疾病研究中的应用 | 介绍了单细胞RNA测序技术在神经科学领域的创新应用，能够更准确地分类神经元和胶质细胞亚型，并发现新的细胞类型 | 目前对转录组的知识主要来自批量RNA测序，可能忽略单细胞分辨率下的微小转录组差异 | 探讨单细胞RNA测序技术在脑细胞分类、神经发育和精神疾病研究中的应用 | 神经元和胶质细胞亚型、神经发育过程、精神疾病 | 基因组学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 34 | 2024-09-30 |
MAPK inhibitor sensitivity scores predict sensitivity driven by the immune infiltration in pediatric low-grade gliomas
2023-07-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40235-8
PMID:37500667
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研究论文 | 本文研究了MAPK抑制剂敏感性评分在预测儿童低级别胶质瘤免疫浸润驱动敏感性中的作用 | 通过单样本基因集富集分析计算MAPKi敏感性评分，并发现其与免疫细胞浸润和治疗反应相关 | 需要在前瞻性临床试验中验证这些评分 | 开发更复杂的生物标志物以识别可能从MAPK抑制剂治疗中受益的儿童低级别胶质瘤患者 | 儿童低级别胶质瘤及其对MAPK抑制剂的反应 | NA | 儿童低级别胶质瘤 | 单样本基因集富集分析 | NA | 基因表达数据 | 使用了GDSC数据集和独立的PDX数据集 |
| 35 | 2024-09-30 |
Liver in infections: a single-cell and spatial transcriptomics perspective
2023-Jul-10, Journal of biomedical science
IF:9.0Q1
DOI:10.1186/s12929-023-00945-z
PMID:37430371
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综述 | 本文综述了高吞吐量单细胞技术的发展及其在理解肝脏在感染中的功能方面的应用 | 本文重新定义了我们对肝脏在感染中的功能的理解，并揭示了以前未知的致病途径和疾病机制 | NA | 总结新兴高吞吐量单细胞技术的发展，并重新定义我们对肝脏在感染中的功能的理解 | 肝脏在感染中的功能，包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒、疟原虫、血吸虫病、内毒素血症和新冠病毒病2019 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 36 | 2024-09-27 |
Single-cell profiling of Arabidopsis leaves to Pseudomonas syringae infection
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112676
PMID:37342910
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析拟南芥叶片对丁香假单胞菌感染的响应 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥叶片在感染丁香假单胞菌后的细胞异质性 | 研究仅限于拟南芥叶片对丁香假单胞菌的响应，未涉及其他植物或病原体 | 探讨植物叶片在病原体感染下的细胞异质性及其响应机制 | 拟南芥叶片在丁香假单胞菌感染下的单细胞响应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过11,000个单细胞样本 |
| 37 | 2024-09-25 |
High-Dimensional Single-Cell Multimodal Landscape of Human Carotid Atherosclerosis
2023-Jul-16, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2023.07.13.23292633
PMID:37502836
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研究论文 | 本文通过结合CITE-seq和scRNA-seq技术，详细描述了人类颈动脉粥样硬化的单细胞多模态景观 | 首次全面揭示了颈动脉粥样硬化病变中细胞的转录组和表型景观，并开发了首个用于分离病变中SMC衍生细胞的流式细胞术面板 | NA | 深入了解颈动脉粥样硬化病变中细胞的全面转录组和表型景观 | 颈动脉粥样硬化病变中的细胞类型及其与临床病理生理学的关联 | 数字病理学 | 心血管疾病 | CITE-seq, scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 21个病变样本，其中13个为有症状的 |
| 38 | 2024-09-23 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）病例的脑部病理机制，发现微胶质细胞动态增强和tau种子减少有助于认知恢复 | 发现AsymAD病例中微胶质细胞在淀粉样斑块微环境中的高效肌动蛋白细胞运动机制和tau种子减少，可能保护大脑健康并减缓阿尔茨海默病病理进展 | NA | 探讨无症状阿尔茨海默病病例中抵抗病理和认知衰退的机制 | 无症状阿尔茨海默病病例的脑部病理 | NA | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | NA | 一组无症状阿尔茨海默病病例的尸检脑样本 |
| 39 | 2024-09-23 |
Yet uninfected? Resolving cell states of plants under pathogen attack
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100538
PMID:37533641
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了植物细胞在面对细菌病原体攻击时的异质性反应 | 首次采用单细胞转录组分析方法，深入研究了植物细胞在病原体攻击下的个体细胞反应 | NA | 旨在填补对植物细胞在病原体攻击下个体细胞反应理解的空白 | 植物细胞在细菌病原体攻击下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 40 | 2024-09-23 |
A contamination focused approach for optimizing the single-cell RNA-seq experiment
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107242
PMID:37496679
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研究论文 | 本文提出了一种基于污染控制的方法来优化单细胞RNA测序实验 | 引入了一套基于污染的定量指标来更有效地评估数据质量，并通过一系列控制实验展示了减少环境污染的方法 | 文中提到的许多参数在商业平台上难以实现 | 优化单细胞RNA测序实验以减少环境污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境污染问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |