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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 开发了LRT计算框架，整合分析scRNA-seq和scTCR-seq数据以研究T细胞克隆分化异质性 | 首次提出整合scRNA-seq和scTCR-seq数据的计算方法，能够识别具有不同分化偏倚的克隆型簇 | NA | 探索T细胞克隆分化轨迹异质性 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞 | 生物信息学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell TCR-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-05 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
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研究论文 | 本研究通过阻断斑马鱼胚胎细胞周期并采用单细胞RNA测序分析，揭示了细胞分化与细胞分裂在早期胚胎发育中的解耦现象 | 首次在胚胎尺度上证明细胞分裂对所有胚胎组织初始细胞类型分化是非必需的，并展示了结合胚胎水平扰动与单细胞RNA测序的新方法 | 研究仅关注早期原肠胚形成至分节结束阶段，未涉及后期发育过程；细胞分裂缺失导致部分细胞类型分化速度减慢和应激反应 | 探究细胞分裂在细胞分化过程中的作用机制 | 斑马鱼早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Excess pancreatic elastase alters acinar-β cell communication by impairing the mechano-signaling and the PAR2 pathways
2023-07-11, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.05.007
PMID:37339634
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研究论文 | 本研究探讨胰腺弹性蛋白酶通过损害机械信号传导和PAR2通路调控胰岛β细胞存活的新机制 | 首次发现胰腺弹性蛋白酶在2型糖尿病患者中上调并通过PAR2和机械信号通路负调控β细胞存活 | 研究主要基于体外和动物模型，需要进一步验证在人体中的治疗效果 | 探索胰腺弹性蛋白酶在糖尿病发病机制中的作用及潜在治疗策略 | 人类和啮齿类动物的胰岛β细胞及胰腺腺泡细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 高通量筛选、磷酸化抗体微阵列、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 2型糖尿病患者和胰岛素抵抗小鼠的胰腺组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Emergence of highly profibrotic and proinflammatory Lrat+Fbln2+ HSC subpopulation in alcoholic hepatitis
2023-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32793
PMID:36181700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在酒精性肝炎小鼠模型中鉴定出一个高纤维化和促炎的Lrat+Fbln2+肝星状细胞亚群 | 首次发现并描述了在酒精性肝炎中出现的Lrat+Fbln2+肝星状细胞亚群，该亚群具有高度纤维化、促炎和免疫调节特性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 识别酒精性肝炎中胶原蛋白1α1表达细胞的亚群，特别是肝星状细胞和门静脉成纤维细胞的作用 | 小鼠酒精性肝炎模型和人类酒精性肝炎患者样本 | 单细胞生物学 | 酒精性肝炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交, 流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像, 原位杂交数据 | Col1a1-GFP转基因小鼠，接受酒精性肝炎、CCl4和胆管结扎处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2025-10-06 |
CONSTRUCTION OF SEPSIS DIAGNOSTIC MODELS AND IDENTIFICATION OF MACROPHAGE SUBPOPULATIONS BASED ON PYROPTOSIS-RELATED GENES
2023-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002137
PMID:37179249
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研究论文 | 基于焦亡相关基因构建脓毒症诊断模型并鉴定巨噬细胞亚群 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析焦亡相关基因在脓毒症中的作用，并鉴定出与不良预后相关的gasdermin D巨噬细胞亚群 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 研究焦亡在脓毒症中的潜在预后和诊断价值 | 脓毒症患者基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 逻辑回归, LASSO回归, 共识聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
High EVI1 and PARP1 expression as favourable prognostic markers in high-grade serous ovarian carcinoma
2023-Jul-31, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-023-01239-6
PMID:37525239
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研究论文 | 本研究探讨EVI1和PARP1蛋白表达作为高级别浆液性卵巢癌预后标志物的价值 | 首次发现EVI1和PARP1共同高表达可识别预后特别良好的患者群体 | 研究基于回顾性队列，需要进一步验证其临床适用性 | 评估EVI1和PARP1在高级别浆液性卵巢癌中的预后意义 | 562名高级别浆液性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 免疫组织化学染色,单细胞测序,拷贝数变异分析 | NA | 组织微阵列图像,基因表达数据,蛋白质表达数据 | 562例高级别浆液性卵巢癌患者组织样本 | NA | 免疫组织化学,单细胞测序 | QuPath | QuPath数字半自动阳性细胞检测 |
| 27 | 2025-10-06 |
The expression profiles of signature genes from CD103+LAG3+ tumour-infiltrating lymphocyte subsets predict breast cancer survival
2023-07-24, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-023-02960-1
PMID:37488535
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析鉴定了CD103+LAG3+肿瘤浸润淋巴细胞亚群，并开发了基于CXCL13和BIRC3基因的预后模型来预测乳腺癌患者生存 | 首次识别了CD103+LAG3+ TIL亚群并建立了基于这两个基因的预后模型，能够预测乳腺癌患者的免疫治疗反应和化疗敏感性 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发乳腺癌预后预测模型并探索肿瘤浸润淋巴细胞亚群在乳腺癌中的作用 | 乳腺癌患者和肿瘤浸润淋巴细胞亚群 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序，多重免疫组织化学，LASSO回归，Cox分析 | 预后预测模型 | 转录组数据，单细胞数据 | 训练队列1089例乳腺癌患者，验证队列3619例乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq，转录组测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Distinct Requirements for Adaptor Proteins NCK1 and NCK2 in Mammary Gland Development
2023-07-21, Journal of mammary gland biology and neoplasia
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10911-023-09541-1
PMID:37479911
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型揭示了衔接蛋白NCK1和NCK2在乳腺发育中的不同表达模式和功能需求 | 首次系统比较NCK1和NCK2在乳腺发育中的差异表达和功能，发现两者在细胞类型特异性表达和发育表型上存在显著差异 | 研究仅使用全局基因敲除模型，可能受到代偿机制影响；未深入探讨NCK蛋白在乳腺癌中的具体作用机制 | 探究NCK1和NCK2在乳腺发育过程中的表达分布和功能差异 | 小鼠乳腺组织 | 发育生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织形态数据 | 不同发育阶段（5、8、12周龄）的基因敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
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研究论文 | 通过单细胞ATAC测序技术研究类风湿关节炎患者外周血单核细胞的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下利用scATAC-seq技术揭示类风湿关节炎的转录调控变异，发现10个关键转录因子及其调控的PTPRC和SPAG9基因 | 样本量较小（7例患者和7例对照），需要进一步验证和功能研究 | 发现参与类风湿关节炎发病机制的转录因子 | 类风湿关节炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 类风湿关节炎 | scATAC-seq, 定量PCR | NA | 表观基因组数据，基因表达数据 | 7例RA患者和7例健康对照的外周血单核细胞 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
Pathogenic Roles of Cardiac Fibroblasts in Pediatric Dilated Cardiomyopathy
2023-07-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.029676
PMID:37345811
|
研究论文 | 本研究探讨了儿童扩张型心肌病中心脏成纤维细胞的致病机制 | 首次揭示DCM心脏成纤维细胞通过体液因子和直接细胞接触损害心肌细胞功能，而非通过细胞生理行为改变 | 仅使用4个DCM患者来源的细胞系，样本量较小；研究局限于体外实验 | 阐明心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的病理作用 | 儿童扩张型心肌病患者和健康对照的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | RNA测序，单细胞RNA测序，原子力显微镜 | NA | 基因表达数据，细胞力学数据 | 4个DCM患者CF细胞系，3个健康对照CF细胞系 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Phylogenomics of novel ploeotid taxa contribute to the backbone of the euglenid tree
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12973
PMID:36912454
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研究论文 | 本研究通过显微观察和单细胞转录组学对五种ploeotid类眼虫进行系统发育分析 | 建立了新的Karavia类群，发现两个未描述的ploeotid类群在系统发育树中占据关键位置 | 部分类群仍未被多基因系统发育研究采样，某些类群间关系支持度不足 | 解析ploeotid类眼虫的系统发育关系，完善眼虫类生物进化树的主干结构 | 五种ploeotid类眼虫（包括Decastava、Hemiolia、Liburna等） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组学，光学显微镜，多基因系统发育分析 | NA | 转录组数据，显微图像 | 5种ploeotid眼虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
Leveraging spatial transcriptomics data to recover cell locations in single-cell RNA-seq with CeLEry
2023-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39895-3
PMID:37422469
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研究论文 | 提出CeLEry算法，利用空间转录组学数据恢复单细胞RNA测序中细胞的空间位置信息 | 开发了基于监督深度学习的算法，通过数据增强程序提高鲁棒性，能够从scRNA-seq数据中恢复细胞的多层次空间信息 | NA | 解决单细胞RNA测序中细胞空间位置信息缺失的问题 | 大脑和癌组织中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 监督深度学习, 变分自编码器 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 多个数据集 | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Visium, MERSCOPE, MERFISH, Xenium | 10x Visium空间转录组平台, Vizgen MERSCOPE平台, NanoString GeoMx DSP平台 |
| 33 | 2025-10-06 |
Mapping disease regulatory circuits at cell-type resolution from single-cell multiomics data
2023-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00476-5
PMID:37974651
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研究论文 | 提出一种名为MAGICAL的层次贝叶斯方法，通过单细胞多组学数据解析疾病相关的调控回路 | 开发了能够同时建模跨细胞和条件的多组学信号变化的创新算法，实现了高精度的调控回路推断 | 仅应用于脓毒症研究，需要验证在其他疾病中的适用性 | 解析染色质重塑相关的基因表达变化，理解疾病状态 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序 | 层次贝叶斯模型 | 单细胞多组学数据 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和功能分析揭示了心脏成纤维细胞在胚胎和新生阶段的异质性及其在心脏发育中的关键作用 | 首次系统比较了不同来源心脏成纤维细胞的转录谱，通过条件性消融技术揭示了成纤维细胞在心脏发育不同阶段的功能差异 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏成纤维细胞的异质性及其在心脏发育过程中的功能 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序, 生物信息学分析, 单分子原位杂交, 白喉毒素片段A消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 两个小鼠品系在18个发育阶段的成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式分析，揭示了CAR-NK细胞在输注后的异质性演变及其代谢适应性丧失导致肿瘤耐药的机制 | 首次在临床前模型和患者样本中系统追踪CAR-NK细胞从肿瘤控制到复发阶段的体内演变过程，发现代谢适应性丧失是耐药关键机制，并提出IL-15细胞因子工程可部分克服此问题 | 研究样本量有限，仅包含一个应答者和一个无应答者患者样本，需要在更大队列中验证发现 | 探究CAR-NK细胞输注后的转录特征和影响肿瘤控制的因素 | CAR-NK细胞和淋巴瘤模型 | 细胞治疗 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 临床前淋巴瘤模型及2例患者样本（1例应答者，1例无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
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研究论文 | 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 | 研究主要基于转录组数据，可能无法完全反映细胞功能的多样性 | 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 | 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个物种、19项研究的细胞数据，包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境的特征及其与认知弹性的关系 | 首次发现无症状AD患者斑块微环境中小胶质细胞具有高效肌动蛋白运动机制和tau蛋白播种活性降低的特征 | 基于尸检样本的回顾性研究，无法确定因果关系 | 探究阿尔茨海默病认知弹性的潜在机制 | 无症状阿尔茨海默病患者的尸检脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | 无症状AD患者尸检脑组织队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
SCING: Inference of robust, interpretable gene regulatory networks from single cell and spatial transcriptomics
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107124
PMID:37434694
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研究论文 | 提出一种基于梯度提升和互信息的单细胞整合基因调控网络推断方法SCING | 开发了能够整合单细胞RNA测序、核RNA测序和空间转录组数据的鲁棒基因调控网络推断方法 | NA | 提高单细胞和空间转录组数据中基因调控网络推断的准确性和可解释性 | 小鼠单细胞图谱、人类阿尔茨海默病和小鼠阿尔茨海默病空间转录组数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 核RNA测序, 空间转录组学 | 梯度提升, 互信息 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Cross-site reproducibility of human cortical organoids reveals consistent cell type composition and architecture
2023-Jul-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.28.550873
PMID:37546772
|
研究论文 | 本研究评估了使用统一方案在不同研究地点生成的人类皮质类器官的表型可重复性 | 首次系统评估了跨研究地点使用统一分化方案生成人类皮质类器官的表型可重复性 | 存在脱靶分化、坏死核心和细胞应激等类器官模型固有局限性 | 评估人类皮质类器官在不同研究地点的表型可重复性 | 人类皮质类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,3D荧光成像,相差成像,qPCR,流式细胞术 | 人类皮质类器官模型 | 基因表达数据,图像数据 | 来自一个iPSC细胞系生成的hCOs，三个独立研究组参与 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
An integrated single-cell analysis of human adrenal cortex development
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168177
PMID:37440461
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术研究人类肾上腺皮质在妊娠前20周的发育过程 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和显微CT等多种技术系统揭示人类肾上腺早期发育特征 | 研究仅关注妊娠前20周的发育过程，未涉及后期发育阶段 | 阐明人类肾上腺皮质发育的关键分子机制和细胞特征 | 人类胚胎肾上腺组织 | 数字病理学 | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 显微CT | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 影像数据 | 妊娠前20周的人类肾上腺样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |