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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-06 |
Gene regulatory network study of rheumatoid arthritis in single-cell chromatin landscapes of peripheral blood mononuclear cells
2023-Jul-04, Modern rheumatology
IF:1.8Q3
DOI:10.1093/mr/roac072
PMID:35796437
|
研究论文 | 通过单细胞ATAC测序技术研究类风湿关节炎患者外周血单核细胞的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下利用scATAC-seq技术揭示类风湿关节炎的转录调控变异，发现10个关键转录因子及其调控的PTPRC和SPAG9基因 | 样本量较小（7例患者和7例对照），需要进一步验证和功能研究 | 发现参与类风湿关节炎发病机制的转录因子 | 类风湿关节炎患者和健康对照的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 类风湿关节炎 | scATAC-seq, 定量PCR | NA | 表观基因组数据，基因表达数据 | 7例RA患者和7例健康对照的外周血单核细胞 | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 22 | 2025-10-06 |
Pathogenic Roles of Cardiac Fibroblasts in Pediatric Dilated Cardiomyopathy
2023-07-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.123.029676
PMID:37345811
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研究论文 | 本研究探讨了儿童扩张型心肌病中心脏成纤维细胞的致病机制 | 首次揭示DCM心脏成纤维细胞通过体液因子和直接细胞接触损害心肌细胞功能，而非通过细胞生理行为改变 | 仅使用4个DCM患者来源的细胞系，样本量较小；研究局限于体外实验 | 阐明心脏成纤维细胞在儿童扩张型心肌病中的病理作用 | 儿童扩张型心肌病患者和健康对照的心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 扩张型心肌病 | RNA测序，单细胞RNA测序，原子力显微镜 | NA | 基因表达数据，细胞力学数据 | 4个DCM患者CF细胞系，3个健康对照CF细胞系 | NA | RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 23 | 2025-10-06 |
Phylogenomics of novel ploeotid taxa contribute to the backbone of the euglenid tree
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12973
PMID:36912454
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研究论文 | 本研究通过显微观察和单细胞转录组学对五种ploeotid类眼虫进行系统发育分析 | 建立了新的Karavia类群，发现两个未描述的ploeotid类群在系统发育树中占据关键位置 | 部分类群仍未被多基因系统发育研究采样，某些类群间关系支持度不足 | 解析ploeotid类眼虫的系统发育关系，完善眼虫类生物进化树的主干结构 | 五种ploeotid类眼虫（包括Decastava、Hemiolia、Liburna等） | 系统发育基因组学 | NA | 单细胞转录组学，光学显微镜，多基因系统发育分析 | NA | 转录组数据，显微图像 | 5种ploeotid眼虫 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 24 | 2025-10-06 |
Leveraging spatial transcriptomics data to recover cell locations in single-cell RNA-seq with CeLEry
2023-07-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39895-3
PMID:37422469
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研究论文 | 提出CeLEry算法，利用空间转录组学数据恢复单细胞RNA测序中细胞的空间位置信息 | 开发了基于监督深度学习的算法，通过数据增强程序提高鲁棒性，能够从scRNA-seq数据中恢复细胞的多层次空间信息 | NA | 解决单细胞RNA测序中细胞空间位置信息缺失的问题 | 大脑和癌组织中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 监督深度学习, 变分自编码器 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 多个数据集 | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | Visium, MERSCOPE, MERFISH, Xenium | 10x Visium空间转录组平台, Vizgen MERSCOPE平台, NanoString GeoMx DSP平台 |
| 25 | 2025-10-06 |
Mapping disease regulatory circuits at cell-type resolution from single-cell multiomics data
2023-Jul, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00476-5
PMID:37974651
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研究论文 | 提出一种名为MAGICAL的层次贝叶斯方法，通过单细胞多组学数据解析疾病相关的调控回路 | 开发了能够同时建模跨细胞和条件的多组学信号变化的创新算法，实现了高精度的调控回路推断 | 仅应用于脓毒症研究，需要验证在其他疾病中的适用性 | 解析染色质重塑相关的基因表达变化，理解疾病状态 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 单细胞转座酶可及染色质测序 | 层次贝叶斯模型 | 单细胞多组学数据 | 脓毒症患者和未感染对照者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 26 | 2025-10-06 |
Heterogeneity and Functional Analysis of Cardiac Fibroblasts in Heart Development
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551164
PMID:37577541
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研究论文 | 本研究通过单细胞mRNA测序和功能分析揭示了心脏成纤维细胞在胚胎和新生阶段的异质性及其在心脏发育中的关键作用 | 首次系统比较了不同来源心脏成纤维细胞的转录谱，通过条件性消融技术揭示了成纤维细胞在心脏发育不同阶段的功能差异 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究心脏成纤维细胞的异质性及其在心脏发育过程中的功能 | 小鼠心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞mRNA测序, 生物信息学分析, 单分子原位杂交, 白喉毒素片段A消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 两个小鼠品系在18个发育阶段的成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2025-10-06 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式分析，揭示了CAR-NK细胞在输注后的异质性演变及其代谢适应性丧失导致肿瘤耐药的机制 | 首次在临床前模型和患者样本中系统追踪CAR-NK细胞从肿瘤控制到复发阶段的体内演变过程，发现代谢适应性丧失是耐药关键机制，并提出IL-15细胞因子工程可部分克服此问题 | 研究样本量有限，仅包含一个应答者和一个无应答者患者样本，需要在更大队列中验证发现 | 探究CAR-NK细胞输注后的转录特征和影响肿瘤控制的因素 | CAR-NK细胞和淋巴瘤模型 | 细胞治疗 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 质谱流式 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 临床前淋巴瘤模型及2例患者样本（1例应答者，1例无应答者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2025-10-06 |
Harmonized cross-species cell atlases of trigeminal and dorsal root ganglia
2023-Jul-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.04.547740
PMID:37461736
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研究论文 | 构建了跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，描述了6个物种18种神经元和11种非神经元细胞类型 | 创建了首个跨物种协调的背根神经节和三叉神经节细胞图谱，解决了不同研究和物种间细胞类型比较的难题 | 研究主要基于转录组数据，可能无法完全反映细胞功能的多样性 | 比较不同物种背根神经节和三叉神经节细胞类型的转录组特征 | 背根神经节和三叉神经节的神经元和非神经元细胞 | 单细胞转录组学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个物种、19项研究的细胞数据，包括新分析的人类和蝾螈背根神经节细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2025-10-06 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究无症状阿尔茨海默病患者大脑中淀粉样斑块微环境的特征及其与认知弹性的关系 | 首次发现无症状AD患者斑块微环境中小胶质细胞具有高效肌动蛋白运动机制和tau蛋白播种活性降低的特征 | 基于尸检样本的回顾性研究，无法确定因果关系 | 探究阿尔茨海默病认知弹性的潜在机制 | 无症状阿尔茨海默病患者的尸检脑组织 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本，转录组数据 | 无症状AD患者尸检脑组织队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2025-10-06 |
SCING: Inference of robust, interpretable gene regulatory networks from single cell and spatial transcriptomics
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107124
PMID:37434694
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研究论文 | 提出一种基于梯度提升和互信息的单细胞整合基因调控网络推断方法SCING | 开发了能够整合单细胞RNA测序、核RNA测序和空间转录组数据的鲁棒基因调控网络推断方法 | NA | 提高单细胞和空间转录组数据中基因调控网络推断的准确性和可解释性 | 小鼠单细胞图谱、人类阿尔茨海默病和小鼠阿尔茨海默病空间转录组数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 核RNA测序, 空间转录组学 | 梯度提升, 互信息 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 31 | 2025-10-06 |
Cross-site reproducibility of human cortical organoids reveals consistent cell type composition and architecture
2023-Jul-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.28.550873
PMID:37546772
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研究论文 | 本研究评估了使用统一方案在不同研究地点生成的人类皮质类器官的表型可重复性 | 首次系统评估了跨研究地点使用统一分化方案生成人类皮质类器官的表型可重复性 | 存在脱靶分化、坏死核心和细胞应激等类器官模型固有局限性 | 评估人类皮质类器官在不同研究地点的表型可重复性 | 人类皮质类器官 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,3D荧光成像,相差成像,qPCR,流式细胞术 | 人类皮质类器官模型 | 基因表达数据,图像数据 | 来自一个iPSC细胞系生成的hCOs，三个独立研究组参与 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 32 | 2025-10-06 |
An integrated single-cell analysis of human adrenal cortex development
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168177
PMID:37440461
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术研究人类肾上腺皮质在妊娠前20周的发育过程 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和显微CT等多种技术系统揭示人类肾上腺早期发育特征 | 研究仅关注妊娠前20周的发育过程，未涉及后期发育阶段 | 阐明人类肾上腺皮质发育的关键分子机制和细胞特征 | 人类胚胎肾上腺组织 | 数字病理学 | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 显微CT | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 影像数据 | 妊娠前20周的人类肾上腺样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of human pancreatic islets reveals genes responsive to glucose exposure over 24 hours
2023-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543931
PMID:37333221
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析人类胰岛在24小时葡萄糖暴露下的基因表达变化 | 首次在单细胞分辨率下系统分析人类胰岛对葡萄糖暴露的时间动态响应，并识别与2型糖尿病相关的基因模块 | 仅使用两名供体的胰岛样本，样本量有限 | 探索高血糖对人类胰岛基因表达的影响及其与2型糖尿病的关联 | 人类胰岛细胞 | 单细胞生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 2名供体的人类胰岛，在7个时间点进行采样 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2025-10-06 |
Macrophage-mediated extracellular matrix remodeling controls host Staphylococcus aureus susceptibility in the skin
2023-07-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2023.06.006
PMID:37402364
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研究论文 | 本研究揭示了真皮下巨噬细胞通过调控细胞外基质成分透明质酸影响宿主对金黄色葡萄球菌皮肤感染的易感性 | 首次发现真皮下巨噬细胞通过IGF1-LYVE-1通路调控透明质酸清除，从而影响金黄色葡萄球菌感染结局 | 研究主要聚焦于巨噬细胞特异性机制，其他免疫细胞在感染过程中的作用尚未充分探讨 | 探究真皮下巨噬细胞在宿主对金黄色葡萄球菌皮肤感染易感性中的调控机制 | 小鼠真皮下巨噬细胞及其与细胞外基质的相互作用 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组测序, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2025-10-06 |
Combined multidimensional single-cell protein and RNA profiling dissects the cellular and functional heterogeneity of thymic epithelial cells
2023-07-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39722-9
PMID:37429879
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞蛋白质和RNA分析技术，解析了胸腺上皮细胞的细胞和功能异质性 | 首次将大规模平行流式细胞术与机器学习相结合，解析胸腺上皮细胞表型，并通过CITEseq技术将表型与RNA谱定义的细胞亚型相关联 | 未明确说明样本数量和研究对象的详细特征 | 解析胸腺上皮细胞的细胞和功能异质性 | 胸腺上皮细胞 | 单细胞分析 | NA | 大规模平行流式细胞术，机器学习，CITEseq | 机器学习 | 单细胞蛋白质数据，单细胞RNA数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，CITEseq | NA | NA |
| 36 | 2025-10-06 |
Plakoglobin is a mechanoresponsive regulator of naive pluripotency
2023-07-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39515-0
PMID:37419903
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研究论文 | 本研究揭示了Plakoglobin作为机械敏感调节因子在调控初始多能性中的新作用 | 首次发现Plakoglobin是机械敏感性的初始多能性调节因子，并证明其过表达可在多能性不稳定条件下重建初始多能性基因调控网络 | 研究主要基于小鼠胚胎干细胞，人类胚胎验证数据有限 | 探索生物力学信号如何转化为转录程序，揭示哺乳动物植入前发育机制 | 小鼠胚胎干细胞、人和小鼠胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析、微流控技术 | NA | 基因表达数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 37 | 2025-10-06 |
Human and murine fibroblast single-cell transcriptomics reveals fibroblast clusters are differentially affected by ageing and serum cholesterol
2023-07-04, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad016
PMID:36718802
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了人和小鼠动脉中成纤维细胞的异质性及其在心血管疾病中的调控机制 | 首次鉴定出PDGFRA和DPEP1作为成纤维细胞特异性标志物，并发现三个不同的成纤维细胞轨迹在衰老和高胆固醇条件下差异调控 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证相对有限 | 研究心血管疾病中成纤维细胞的异质性及其对风险因素的响应 | 人和小鼠动脉中的成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 流式细胞术, 伪时间分析 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 组织切片图像 | C57BL/6J小鼠和LDLR KO小鼠的主动脉组织，人类颈动脉和主动脉标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 38 | 2025-10-06 |
Transcriptome-based measurement of CD8+ T cell age and its applications
2023-07, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2023.05.005
PMID:37248098
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研究论文 | 本文探讨了基于转录组的CD8+ T细胞年龄测量方法及其应用前景 | 开发了机器学习辅助的转录组定量方法，用于测量单个CD8+ T细胞的年龄 | NA | 更好地理解T细胞衰老过程，改进与年龄相关的T细胞变化测量方法 | CD8+ T细胞 | 机器学习 | 传染病,癌症,老年疾病 | 转录组测序 | 机器学习 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 39 | 2025-10-06 |
Modelling capture efficiency of single-cell RNA-sequencing data improves inference of transcriptome-wide burst kinetics
2023-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad395
PMID:37354494
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研究论文 | 提出一种新的数学理论来建模单细胞RNA测序数据中的捕获效率变异，改进转录组范围内爆发动力学的推断 | 开发了能够同时捕捉爆发动力学、细胞大小变异和捕获效率变异的新型数学模型，并提出了基于神经网络和近似贝叶斯计算的推断方法 | NA | 改进从单细胞RNA测序数据推断基因表达爆发动力学的方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达变异 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络, 近似贝叶斯计算 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2025-10-06 |
Expression of Key Steroidogenic Enzymes in Human Placenta and Associated Adverse Pregnancy Outcomes
2023-Jul, Maternal-fetal medicine (Wolters Kluwer Health, Inc.)
DOI:10.1097/FM9.0000000000000167
PMID:40416852
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综述 | 本文综述了人类胎盘中关键类固醇生成酶的表达及其与不良妊娠结局的关联 | 系统总结了胎盘类固醇生成酶的上游调控机制，并探讨了单细胞测序技术在评估其功能和细胞来源方面的潜力 | 胎盘类固醇生成酶表达与不良妊娠结局的关系仍存在争议 | 探讨胎盘类固醇生成酶在生理和病理状态下的调控机制及其与妊娠结局的关联 | 人类胎盘组织及类固醇生成酶 | 生殖医学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |