单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2024-09-23 |
Global decoupling of cell differentiation from cell division in early embryo development
2023-Jul-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.29.551123
PMID:37546736
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研究论文 | 研究探讨了细胞分裂在早期胚胎发育中细胞分化的作用 | 首次展示了细胞分裂在早期胚胎发育中对细胞分化的非必要性，并结合单细胞RNA测序技术揭示了细胞分裂对细胞状态比例的影响 | 研究仅限于斑马鱼胚胎，结果可能不适用于其他物种 | 确定细胞分裂在细胞分化中的作用 | 斑马鱼胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个斑马鱼胚胎 |
| 22 | 2024-09-23 |
Enhanced microglial dynamics and paucity of tau seeding in the amyloid plaque microenvironment contributes to cognitive resilience in Alzheimer's disease
2023-Jul-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.27.550884
PMID:37546928
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研究论文 | 研究了无症状阿尔茨海默病（AsymAD）病例的脑部病理机制，发现微胶质细胞动态增强和tau种子减少有助于认知恢复 | 发现AsymAD病例中微胶质细胞在淀粉样斑块微环境中的高效肌动蛋白细胞运动机制和tau种子减少，可能保护大脑健康并减缓阿尔茨海默病病理进展 | NA | 探讨无症状阿尔茨海默病病例中抵抗病理和认知衰退的机制 | 无症状阿尔茨海默病病例的脑部病理 | NA | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | NA | 一组无症状阿尔茨海默病病例的尸检脑样本 |
| 23 | 2024-09-23 |
Yet uninfected? Resolving cell states of plants under pathogen attack
2023-07-24, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2023.100538
PMID:37533641
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析揭示了植物细胞在面对细菌病原体攻击时的异质性反应 | 首次采用单细胞转录组分析方法，深入研究了植物细胞在病原体攻击下的个体细胞反应 | NA | 旨在填补对植物细胞在病原体攻击下个体细胞反应理解的空白 | 植物细胞在细菌病原体攻击下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 24 | 2024-09-23 |
A contamination focused approach for optimizing the single-cell RNA-seq experiment
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107242
PMID:37496679
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研究论文 | 本文提出了一种基于污染控制的方法来优化单细胞RNA测序实验 | 引入了一套基于污染的定量指标来更有效地评估数据质量，并通过一系列控制实验展示了减少环境污染的方法 | 文中提到的许多参数在商业平台上难以实现 | 优化单细胞RNA测序实验以减少环境污染 | 单细胞RNA测序数据中的环境污染问题 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 25 | 2024-09-23 |
p53 Regulates the Extent of Fibroblast Proliferation and Fibrosis in Left Ventricle Pressure Overload
2023-07-21, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.121.320324
PMID:37409456
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研究论文 | 研究p53在左心室压力超负荷下调节成纤维细胞增殖和纤维化的机制 | 揭示了p53通过调控细胞周期控制成纤维细胞积累和ECM分泌的机制 | NA | 探讨p53在心脏成纤维细胞增殖和纤维化中的作用 | 心脏成纤维细胞和ECM | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Tcf21MerCreMer小鼠模型进行研究 |
| 26 | 2024-09-23 |
Smooth muscle-derived adventitial progenitor cells promote key cell type transitions controlling plaque stability in atherosclerosis in a Klf4-dependent manner
2023-Jul-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.18.549539
PMID:37503181
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研究论文 | 研究了血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 首次探讨了血管平滑肌来源的间质前体细胞在慢性动脉粥样硬化中的作用，并揭示了Klf4依赖性调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨血管平滑肌来源的间质前体细胞在动脉粥样硬化中的作用及其对斑块稳定性的影响 | 血管平滑肌来源的间质前体细胞及其在动脉粥样硬化中的分化和功能 | 心血管疾病 | 动脉粥样硬化 | scRNA-Seq, 流式细胞术, 组织学方法 | NA | 细胞 | 小鼠模型 |
| 27 | 2024-09-23 |
TimiGP: Inferring cell-cell interactions and prognostic associations in the tumor immune microenvironment through gene pairs
2023-07-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101121
PMID:37467716
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研究论文 | 开发了一种名为TimiGP的计算方法，用于推断肿瘤免疫微环境中细胞间相互作用及其与预后的关联 | 提出了TimiGP方法，通过基因对推断细胞间相互作用，揭示免疫细胞相对丰度与预后的关联 | NA | 理解肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的预后关联，并开发新的治疗策略 | 肿瘤免疫微环境中的细胞间相互作用及其与预后的关联 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 七个独立的黑色素瘤数据集 |
| 28 | 2024-09-23 |
HATCHet2: clone- and haplotype-specific copy number inference from bulk tumor sequencing data
2023-Jul-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.13.548855
PMID:37502835
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研究论文 | 介绍了一种名为HATCHet2的新方法，用于从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 引入了新的统计量mirrored haplotype B-allele frequency (mhBAF)，用于识别不同肿瘤克隆中具有不同亲本单倍型拷贝数的镜像亚克隆拷贝数变异 | NA | 开发一种新方法，从多个肿瘤样本中同时推断单倍型和克隆特异性的拷贝数变异 | 前列腺癌样本中的拷贝数变异 | 数字病理学 | 前列腺癌 | DNA测序 | NA | DNA序列数据 | 50个前列腺癌样本，来自10名患者 |
| 29 | 2024-09-23 |
A novel cuproptosis-related diagnostic gene signature and differential expression validation in atherosclerosis
2023-Jul-14, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-023-00131-5
PMID:37442861
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研究论文 | 研究探讨了铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值和差异表达验证 | 首次报道了铜死亡相关基因FDX1、SLC31A1和GLS在动脉粥样硬化中的作用 | NA | 揭示铜死亡相关基因在动脉粥样硬化中的分子机制和诊断价值 | 动脉粥样硬化中的铜死亡相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | 随机森林 | 基因表达数据 | NA |
| 30 | 2024-09-23 |
Multiplex enzymatic synthesis of DNA with single-base resolution
2023-07-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adi0263
PMID:37418522
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研究论文 | 本文介绍了一种基于酶的多重DNA合成方法，通过单碱基分辨率实现了高度并行的DNA合成 | 本文创新性地使用微机电系统喷墨分配终端脱氧核苷酸转移酶和3'阻断核苷酸，并通过批量滑动洗涤去除3'阻断基团，实现了微尺度空间控制核酸序列和长度 | NA | 开发一种适用于蛋白质工程和空间转录组学等需要高序列多样性的寡核苷酸池或阵列的酶促DNA合成方法 | 酶促DNA合成方法及其在微尺度空间控制核酸序列和长度中的应用 | NA | NA | 酶促DNA合成 | NA | NA | NA |
| 31 | 2024-09-23 |
Single-Cell RNA Sequencing: Opportunities and Challenges for Studies on Corneal Biology in Health and Disease
2023-07-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12131808
PMID:37443842
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在人类角膜生物学研究中的应用，重点讨论了其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 单细胞RNA测序作为一种革命性工具，能够识别角膜组织中的细胞状态 | 目前对角膜中特定细胞类型的各种细胞状态和关键基因的理解尚不充分 | 探讨单细胞RNA测序在角膜生物学研究中的应用及其在健康和疾病中的机遇与挑战 | 人类角膜的细胞状态和关键基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 32 | 2024-09-23 |
Age-related alterations in meningeal immunity drive impaired CNS lymphatic drainage
2023-07-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20221929
PMID:37027179
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研究论文 | 研究揭示了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化如何导致中枢神经系统淋巴引流受损 | 首次证明了年龄相关的小胶质淋巴管免疫变化是导致淋巴引流功能下降的关键因素 | 研究仅在老年小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨年龄相关的小胶质淋巴管功能下降的机制及其潜在治疗策略 | 小胶质淋巴管内皮细胞和免疫细胞 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 老年小鼠的小胶质淋巴管内皮细胞 |
| 33 | 2024-09-23 |
Drivers of heterogeneity in synovial fibroblasts in rheumatoid arthritis
2023-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-023-01527-9
PMID:37277655
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研究论文 | 研究类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 首次使用配对的单细胞RNA和ATAC测序、多重成像和空间转录组学以及体外细胞外因子信号建模，探讨了类风湿性关节炎患者发炎关节中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 对人类炎症性疾病中移民细胞和常驻细胞类型之间的局部交流理解仍不充分 | 探讨类风湿性关节炎中滑膜成纤维细胞异质性的驱动因素 | 类风湿性关节炎患者发炎关节中的滑膜成纤维细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、ATAC测序、多重成像、空间转录组学 | NA | RNA、ATAC、图像 | NA |
| 34 | 2024-09-23 |
Efficient Generation of Paired Single-Cell Multiomics Profiles by Deep Learning
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202301169
PMID:37114830
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的框架scMOG，用于从实验可用的单细胞RNA-seq数据中生成单细胞转座酶可及染色质（ATAC）数据，反之亦然 | scMOG能够准确地在RNA和ATAC之间进行跨组学生成，并在一种组学实验不可用且超出训练数据集时生成具有生物学意义的配对多组学数据 | NA | 开发一种高效生成配对单细胞多组学数据的方法 | 单细胞RNA和ATAC数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | NA | 单细胞RNA和ATAC数据 | NA |
| 35 | 2024-09-19 |
Integrated Multi-omics Analysis of Early Lung Adenocarcinoma Links Tumor Biological Features with Predicted Indolence or Aggressiveness
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0373
PMID:37501683
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研究论文 | 本文研究了早期肺腺癌的生物学特征与预测的惰性或侵袭性之间的关系 | 通过整合多组学数据，揭示了放射组学与肿瘤生物学之间的关联，为区分惰性和侵袭性肺腺癌提供了新的见解 | 样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 探讨早期肺腺癌惰性或侵袭性的生物学决定因素 | 早期肺腺癌患者及其肿瘤特征 | 数字病理学 | 肺癌 | CyTOF, RNA-seq | NA | 图像, 基因表达数据 | 92名肺腺癌患者 |
| 36 | 2024-09-13 |
Cross-site reproducibility of human cortical organoids reveals consistent cell type composition and architecture
2023-Jul-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.28.550873
PMID:37546772
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研究论文 | 本文研究了人类皮质类器官（hCO）在不同研究站点之间的可重复性，揭示了细胞类型组成和结构的稳定性 | 首次评估了使用统一协议在多个站点生成的人类皮质类器官的可重复性 | 研究中发现了类器官大小和形态的跨站点差异，以及代谢和细胞应激的差异 | 评估人类皮质类器官在不同研究站点之间的可重复性，为神经发育障碍的建模提供基础 | 人类皮质类器官的细胞类型组成和结构 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、三维荧光成像、相位对比成像、qPCR和流式细胞术 | NA | 细胞 | 三个独立研究组使用一个诱导多能干细胞（iPSC）系生成的类器官 |
| 37 | 2024-08-30 |
Loss of metabolic fitness drives tumor resistance after CAR-NK cell therapy and can be overcome by cytokine engineering
2023-07-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add6997
PMID:37494448
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术分析了CAR-NK细胞在体内的异质性和进化过程，特别是在肿瘤控制到复发阶段的变化。 | 研究发现了与体内进化和肿瘤控制不同阶段相关的NK细胞群的激活、功能和代谢特征的独特模式，并证明了通过在CAR构建体中加入IL-15可以部分克服肿瘤高度代谢活性导致的NK细胞代谢适应性丧失。 | 研究主要基于一个非治愈性淋巴瘤的临床前模型和一个响应者与一个非响应者的患者样本，可能需要更多样本和不同类型的肿瘤模型来验证结果。 | 探讨CAR-NK细胞治疗后肿瘤抵抗的机制及其克服方法。 | CAR-NK细胞的异质性、体内进化及其与肿瘤控制的关系。 | 生物技术 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | NA | 细胞 | 一个响应者和一个非响应者的患者样本 |
| 38 | 2024-08-27 |
Graft dysfunction in compassionate use of genetically engineered pig-to-human cardiac xenotransplantation: a case report
2023-07-29, Lancet (London, England)
DOI:10.1016/S0140-6736(23)00775-4
PMID:37393920
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病例报告 | 本文报告了一例基因工程猪心脏异种移植到人类心脏的同情使用案例，详细描述了移植后的功能障碍及其原因 | 成功避免了超急性排斥反应，并识别了潜在的血管内皮损伤介质 | 文章主要关注单一病例，可能缺乏更广泛的临床数据支持 | 探讨基因工程猪心脏异种移植后的功能障碍及其潜在原因 | 基因工程猪心脏异种移植的功能和排斥反应 | NA | 心脏衰竭 | 电子显微镜、DNA PCR、RNA转录、单细胞RNA测序 | NA | 组织、细胞 | 单一病例 |
| 39 | 2024-08-07 |
An integrated single-cell analysis of human adrenal cortex development
2023-07-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.168177
PMID:37440461
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研究论文 | 本文通过结合单细胞和批量RNA测序、空间转录组学、免疫组化及微焦点计算机断层扫描技术，研究了人类肾上腺皮质在前20周妊娠期的发展关键方面 | 首次展示了肾上腺快速生长和血管化，以及外层确定区（DZ）中细胞分裂的增加，同时揭示了皮质醇和醛固酮合成能力随时间发展的机制 | NA | 探究人类肾上腺皮质在妊娠早期的发育过程 | 人类肾上腺皮质发育 | NA | 肾上腺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 微焦点计算机断层扫描 | NA | RNA序列 | 前20周妊娠期的人类肾上腺样本 |
| 40 | 2024-08-04 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-Jul, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
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研究论文 | 该论文探讨了p53如何通过促进肺腺癌中AT1分化程序来抑制肿瘤的发展 | 论文首次揭示了p53在肺腺癌抑制中通过调控细胞状态促进AT1分化的机制 | 该研究主要基于小鼠模型，临床相关性尚需进一步验证 | 研究p53在肺腺癌抑制中的机制 | 使用表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠进行研究 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序和ATAC测序 | NA | 转录组数据 | 使用了Trp53野生型和Trp53缺失小鼠 |