单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 351 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-08 |
A Rare Subset of Primary Tumor Cells with Concomitant Hyperactivation of Extracellular Matrix Remodeling and dsRNA-IFN1 Signaling Metastasizes in Breast Cancer
2023-07-05, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-2717
PMID:37133448
|
研究论文 | 本研究利用慢病毒条形码结合单细胞RNA测序技术，追踪乳腺癌转移过程中的克隆和转录组进化，揭示了乳腺癌转移的分子机制 | 首次发现并证明了乳腺癌转移源自于在原发肿瘤中数量较少但具有高转移潜能的克隆，这些克隆同时高度激活了细胞外基质重塑和dsRNA-IFN信号通路 | NA | 深入理解乳腺癌转移的分子决定因素，以促进预防和治疗策略的开发 | 乳腺癌转移的分子机制 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 322 | 2024-08-05 |
Identification and Characterization of the Wilms Tumor Cancer Stem Cell
2023-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206787
PMID:37114795
|
研究论文 | 本研究识别和表征了具有癌症干细胞特征的肾源性前体细胞，驱动威尔姆斯肿瘤的发生 | 本文通过空间转录组学和单细胞RNA测序等技术，首次定义了威尔姆斯肿瘤中的SIX2+CITED1+细胞为肾源样癌症干细胞，并揭示了其在自我更新和分化中的调节机制 | 研究可能局限于少量样本，未能覆盖所有可能的威尔姆斯肿瘤变异 | 研究威尔姆斯肿瘤中的癌症干细胞特征及其发育机制 | 威尔姆斯肿瘤样本中的肾源性前体细胞对照发育中的人类肾脏细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Single-cell multi-omics sequencing and its application in tumor heterogeneity
2023-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad009
PMID:37078714
|
review | 本文综述了单细胞多组学测序的最新进展及其在肿瘤异质性分析中的应用 | 文章的创新点在于总结了单细胞多组学测序中的代表性技术及其在复杂疾病鉴定中的应用 | 文章未详细描述单细胞多组学测序在不同类型肿瘤中的具体应用限制 | 调研单细胞多组学测序在精准医疗中的潜力和进展 | 肿瘤及其他复杂疾病 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组学、转录组学、表观基因组学和蛋白组学数据 | NA |
| 324 | 2024-08-05 |
Allogeneic chimeric antigen receptor-T cells with CRISPR-disrupted programmed death-1 checkpoint exhibit enhanced functional fitness
2023-07, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2023.03.011
PMID:37086241
|
研究论文 | 该研究探讨了通过CRISPR技术破坏PD-1检查点的异体CAR-T细胞的功能增强 | 研究展示了通过基因组编辑技术增强CAR-T细胞的功能适应性，首次将PD-1敲除与CAR-T细胞治疗结合 | 研究未涉及长期疗效及人类临床试验的数据 | 探讨基因组PD-1检查点破坏对异体CAR-T细胞治疗B淋巴瘤的影响 | 研究对象为通过CRISPR基因编辑技术改造的异体人类T细胞 | 数字病理学 | B细胞恶性肿瘤 | CRISPR技术 | NA | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 |
| 325 | 2024-08-08 |
Quantifying Cell-Type-Specific Differences of Single-Cell Datasets Using Uniform Manifold Approximation and Projection for Dimension Reduction and Shapley Additive exPlanations
2023-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0366
PMID:37093052
|
研究论文 | 本研究提出了一种计算流程，用于量化单细胞数据集中特定细胞类型的差异，并识别导致这些差异的基因 | 使用低维均匀流形近似和投影进行维度降低空间作为高维空间差异的代理，并利用SHapley加性解释量化驱动差异的基因 | NA | 量化不同条件下单细胞数据集之间特定细胞类型的响应差异 | 单细胞数据集中的特定细胞类型差异 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 均匀流形近似和投影, SHapley加性解释 | 单细胞数据集 | Iris花数据集, 单细胞RNA测序数据集, 质谱流式细胞术数据集 |
| 326 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptomic and plasma Lipidomic reveal the potential mechanisms of a Methotrexate-based therapy against Rheumatoid Arthritis
2023-Jul, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2023.154816
PMID:37094424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血浆脂质组学分析，探讨基于甲氨蝶呤的治疗方案在类风湿关节炎中的潜在机制 | 采用单细胞RNA测序和脂质组学分析技术，揭示甲氨蝶呤治疗类风湿关节炎的潜在机制 | 需要更严格的研究设计来证实治疗效果与脂质代谢的相关性 | 评估基于甲氨蝶呤的治疗方案是否能带来更多的临床益处 | 类风湿关节炎患者 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，脂质组学分析 | NA | RNA，脂质 | 46名患者接受治疗，42名完成随访 |
| 327 | 2024-08-08 |
Single cell landscape of parietal epithelial cells in healthy and diseased states
2023-07, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2023.03.036
PMID:37100348
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了壁上皮细胞在健康和疾病状态下的分子特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了壁上皮细胞的亚群及其在新月体形成中的作用 | NA | 探讨壁上皮细胞的生物学多样性及其在足细胞再生和新月体形成中的作用 | 壁上皮细胞及其亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 328 | 2024-08-05 |
TMEM59 ablation leads to loss of olfactory sensory neurons and impairs olfactory functions via interaction with inflammation
2023-07, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2023.04.005
PMID:37061103
|
研究论文 | 本研究识别了TMEM59作为维持和再生嗅觉上皮的关键调节因子 | TMEM59缺失导致嗅觉功能受损和嗅觉神经元的丧失，揭示其与炎症的相互作用 | 本研究可能未探讨TMEM59与其他因素的相互作用 | 研究TMEM59在嗅觉上皮维持与再生中的作用 | TMEM59及其在嗅觉上皮中的功能与机制 | 数字病理学 | 嗅觉障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | TMEM59-KO动物和正常对照 |
| 329 | 2024-08-08 |
Understanding and targeting erythroid progenitor cells for effective cancer therapy
2023-07-01, Current opinion in hematology
IF:3.1Q2
DOI:10.1097/MOH.0000000000000762
PMID:37052294
|
综述 | 本文综述了红细胞祖细胞（EPCs）在癌症中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 近年来研究发现EPCs在癌症中具有促进肿瘤生长的作用，并能转化为免疫抑制性髓系细胞，限制T细胞功能和免疫治疗 | NA | 总结EPCs的生物学特性，探讨其促进肿瘤活动的机制，并展望未来针对这些细胞的治疗策略 | 红细胞祖细胞（EPCs）及其在癌症治疗中的应用 | NA | 癌症 | 单细胞转录组和谱系追踪分析 | NA | 转录组 | NA |
| 330 | 2024-08-08 |
Functional specialization of short-lived and long-lived macrophage subsets in human tonsils
2023-07-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230002
PMID:37036425
|
研究论文 | 本文研究了人类扁桃体中巨噬细胞的功能特化，并识别出三种具有不同表型、转录组、生命周期和功能的亚群 | 首次详细描述了人类扁桃体中巨噬细胞的异质性及其功能特化，揭示了CD36hi巨噬细胞通过产生Activin A刺激T滤泡辅助细胞的机制 | 研究仅限于非疾病状态下的扁桃体组织，未涉及疾病状态下的情况 | 探究人类扁桃体中巨噬细胞的特性和功能 | 人类扁桃体中的巨噬细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 非人类灵长类动物的扁桃体样本 |
| 331 | 2024-08-05 |
Predictive significance of PRR11 in prognosis and immune infiltration of glioma patients
2023-07, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23539
PMID:37036189
|
研究论文 | 本研究探讨了PRR11在胶质瘤患者预后和免疫浸润中的预测意义 | PRR11被认为是胶质瘤患者诊断和预后的新型可靠预测因子，且涉及细胞周期、转录因子以及免疫浸润等机制 | 尚不清楚PRR11在胶质瘤中的具体作用机制，且样本来源于多个数据集，可能影响一致性 | 研究PRR11在胶质瘤患者中的诊断和预后价值 | 胶质瘤患者的临床资料和细胞系 | 数字病理 | 胶质瘤 | 单细胞测序(scRNA-seq) | NA | 临床数据和细胞系 | 多个数据集和两个细胞系(U251和LN229) |
| 332 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals that VIM and IFITM3 are vital targets of Dengzhan Shengmai capsule to protect against cerebral ischemic injury
2023-Jul-15, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2023.116439
PMID:37004745
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了灯盏生脉胶囊通过调控VIM和IFITM3基因来保护脑缺血损伤的机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了灯盏生脉胶囊在脑缺血损伤中的关键生物过程和核心靶点 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 探究灯盏生脉胶囊对脑缺血损伤的保护机制 | 灯盏生脉胶囊对脑缺血损伤的影响及其分子机制 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 实验涉及六组大鼠，每组具体数量未详述 |
| 333 | 2024-08-05 |
Distinct mechanisms of dysfunctional antigen-presenting DCs and monocytes by single-cell sequencing in multiple myeloma
2023-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15800
PMID:37002866
|
研究论文 | 本研究使用单细胞转录组分析揭示了多发性骨髓瘤中树突细胞和单核细胞功能障碍的不同机制 | 通过单细胞转录组分析，深入探讨了多发性骨髓瘤患者中树突细胞和单核细胞的功能障碍机制 | 样本量有限，仅涉及10名多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者 | 探究多发性骨髓瘤中抗原呈递细胞功能障碍的分子机制 | 来自10名多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者的树突细胞和单核细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 13个样本（10名多发性骨髓瘤患者和3名健康志愿者） |
| 334 | 2024-08-05 |
RHAMM marks proliferative subpopulation of human colorectal cancer stem cells
2023-Jul, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15795
PMID:36945114
|
研究论文 | 本研究报告了RHAMM在结直肠癌干细胞亚群中的表达 | 发现RHAMM作为结直肠癌干细胞特定标记物，能够识别具有高度增殖特性的细胞亚群 | 未在不同类型的肿瘤中验证RHAMM的作用 | 识别结直肠癌干细胞的特征分子以理解肿瘤异质性 | 探讨人结直肠癌组织中的RHAMM+CD44+细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序 | 类器官模型 | 细胞 | 人结直肠癌组织中的RHAMM+CD44+细胞 |
| 335 | 2024-08-08 |
Multiple Fibroblast Subtypes Contribute to Matrix Deposition in Pulmonary Fibrosis
2023-07, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2022-0292OC
PMID:36927333
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了肺纤维化模型中不同成纤维细胞亚型的基因特征，并探讨了它们在肺纤维化中的作用 | 首次确认了多种成纤维细胞亚型在肺纤维化中的作用，并识别了特定细胞表面蛋白，有助于开发针对肺纤维化的治疗策略 | NA | 探讨成纤维细胞亚型在肺纤维化中的作用，并为开发治疗肺纤维化的药物提供新思路 | 肺纤维化模型中的成纤维细胞亚型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括小鼠模型和人类肺纤维化疾病样本 |
| 336 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rubber tree response to early powdery mildew infection
2023-07, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.14585
PMID:36929646
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了橡胶树叶片在白粉病早期感染过程中的转录组变化 | 首次构建了橡胶树叶片的单细胞图谱，并揭示了白粉病感染下细胞群的独特基因表达模式 | NA | 探究橡胶树在白粉病早期感染下的细胞和分子响应机制 | 橡胶树叶片在白粉病感染下的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及10种细胞类型 |
| 337 | 2024-08-05 |
T-cell exhaustion: A potential target biomarker of the tumour microenvironment affecting oesophageal adenocarcinoma
2023-07, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3496
PMID:36879295
|
研究论文 | 本研究探讨了T细胞耗竭在食管腺癌中的作用及其潜在机制 | 通过筛选T细胞耗竭相关的风险模型，提出了食管腺癌的新型生物标志物，促进新的治疗方式和免疫靶标的开发 | 目前尚不清楚T细胞耗竭在食管腺癌发病机制中的具体作用 | 研究T细胞耗竭如何影响食管腺癌的免疫抑制和治疗抗性 | 样本分为四类，涉及食管腺癌患者的生存预后及其免疫特征 | 数字病理 | 食管癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因组数据 | NA |
| 338 | 2024-08-08 |
SCMcluster: a high-precision cell clustering algorithm integrating marker gene set with single-cell RNA sequencing data
2023-07-17, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad004
PMID:36848584
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCMcluster的高精度单细胞聚类算法，该算法结合标记基因集与单细胞RNA测序数据进行特征提取和构建集成聚类模型 | SCMcluster算法通过整合两个细胞标记数据库与scRNA-seq数据进行特征提取，并构建基于共识矩阵的集成聚类模型，提高了聚类精度 | NA | 开发一种高精度的单细胞聚类算法，以解决单细胞RNA测序数据中的噪声和稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成聚类模型 | 基因表达数据 | 两个scRNA-seq数据集，分别来自人和小鼠组织 |
| 339 | 2024-08-05 |
Phylogenetic placement of the protosteloid amoeba Microglomus paxillus identifies another case of sporocarpic fruiting in Discosea (Amoebozoa)
2023 Jul-Aug, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.12971
PMID:36825799
|
研究论文 | 该文章探讨了原昔体阿米巴Microglomus paxillus的系统发育定位，揭示了Discosea中 sporocarpic fruiting的另一个案例 | 通过单细胞转录组学分析，首次为Microglomus paxillus提供了系统发育信息，阐明了其与Discosea的亲缘关系 | SSU rRNA序列的高度变异性限制了我们在丰富的分类数据集中进一步阐明M. paxillus的系统发育位置 | 澄清sporocarpic fruiting的进化背景 | 原昔体阿米巴Microglomus paxillus的个体样本 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 蛋白编码标记数据 | 229个蛋白编码标记 |
| 340 | 2024-08-05 |
Increased fatty acid metabolism and decreased glycolysis are hallmarks of metabolic reprogramming within microglia in degenerating white matter during recovery from experimental stroke
2023-07, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X231157298
PMID:36772984
|
研究论文 | 本研究评估了实验性中风后12周内小鼠白质退行性变化中小胶质细胞的代谢重编程. | 首次揭示了中风后小胶质细胞中脂肪酸代谢增加和糖酵解减少的代谢改变. | 研究主要集中在小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况. | 评估中风后恢复期间代谢稳态的变化. | 使用实验性中风模型的小鼠作为实验对象. | 数字病理学 | 脑中风 | 液相色谱-质谱联用技术（LC-MS） | NA | 生物化学样本 | 每个样本检测707种生化物质，涉及大小鼠对照组和中风组的比较 |