单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-07 |
Single cell transcriptome sequencing of stimulated and frozen human peripheral blood mononuclear cells
2023-07-06, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02348-z
PMID:37414801
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对人类外周血单个核细胞在不同条件下的转录组进行了深入研究 | 本研究利用高深度单细胞RNA测序技术，对超过30,000个细胞在静息、刺激、新鲜和冷冻条件下的转录组进行了量化 | NA | 研究外周血单个核细胞在不同条件下的转录组变化，以及冷冻-解冻循环对其质量和转录组的影响 | 人类外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过30,000个细胞 |
| 262 | 2024-08-07 |
scQCEA: a framework for annotation and quality control report of single-cell RNA-sequencing data
2023-Jul-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09447-6
PMID:37415108
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研究论文 | 介绍了一个名为scQCEA的R包，用于单细胞RNA测序数据的质量控制报告和注释 | scQCEA包包括了基于表达的质量控制功能，能够区分真实变异和背景噪声，并提供了自动化细胞类型注释功能 | NA | 开发一个用于单细胞RNA测序数据质量控制和注释的框架 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 56个基因表达和V(D)J T细胞重复样本，342个人和鼠的浅序列基因表达谱 |
| 263 | 2024-08-07 |
Identifying a distinct fibrosis subset of NAFLD via molecular profiling and the involvement of profibrotic macrophages
2023-07-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04300-6
PMID:37415134
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研究论文 | 本研究通过分子表达谱分析，探索了非酒精性脂肪肝病（NAFLD）中的纤维化表型及纤维化相关巨噬细胞亚群的变化。 | 本研究揭示了NAFLD的分子亚型，并识别出一个新的、独特的纤维化亚型，该亚型与促纤维化巨噬细胞和M2巨噬细胞亚型显著相关。 | NA | 探索NAFLD的分子表型，特别是纤维化表型，并研究纤维化亚型中巨噬细胞亚群的变化。 | NAFLD患者的肝脏组织及纤维化相关的巨噬细胞亚群。 | 数字病理学 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 非负矩阵分解（NMF） | 转录组数据 | 14个不同的肝脏组织转录组数据集，2个单细胞RNA测序数据集 |
| 264 | 2024-08-07 |
Immuno-PET Imaging of CD69 Visualizes T-Cell Activation and Predicts Survival Following Immunotherapy in Murine Glioblastoma
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0434
PMID:37426447
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研究论文 | 本研究评估了CD69作为胶质母细胞瘤（GBM）免疫治疗反应的成像生物标志物的潜力，通过免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET）技术监测CD69表达，并探讨其与生存率的关系。 | 首次使用CD69免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET）技术来可视化T细胞激活并预测胶质母细胞瘤免疫治疗后的生存率。 | NA | 评估CD69作为胶质母细胞瘤免疫治疗反应的成像生物标志物的潜力。 | 人源和鼠源T细胞的CD69表达，以及其在免疫治疗后的变化。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫正电子发射断层扫描（Immuno-PET） | NA | 图像 | 包括接受免疫检查点抑制剂（ICI）治疗的患者和对照组的肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）样本。 |
| 265 | 2024-08-07 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 本文开发了一种名为LRT的计算框架，用于整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq）数据，以探索克隆分化轨迹的异质性 | LRT框架结合了scRNA-seq和scTCR-seq数据，提供了全面的分析流程，包括预处理、细胞轨迹推断、克隆型聚类、轨迹偏倚评估和克隆型集群特征化 | NA | 研究目的是开发一种计算工具，以整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，探索T细胞克隆的分化轨迹异质性 | 研究对象包括CD8+ T细胞和CD4+ T细胞在急性淋巴细胞性脑膜炎病毒感染下的scRNA-seq和scTCR-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞T细胞受体测序（scTCR-seq） | 计算框架 | 基因表达数据，T细胞受体序列数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 266 | 2024-08-05 |
Dissecting the spermatogonial stem cell niche using spatial transcriptomics
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112737
PMID:37393620
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研究论文 | 本文通过空间转录组学系统分析了精原干细胞庇护所的分子和细胞成分 | 结合空间转录组学和计算分析，首次系统地揭示了精原干细胞和其庇护所之间的相互作用 | 对精原干细胞及其庇护所的理解仍然不完全，尤其是在不同的生理状态下 | 研究精原干细胞与其微环境庇护所之间的分子和细胞相互作用 | 小鼠和人类的精原干细胞庇护所 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的样本 |
| 267 | 2024-08-05 |
Epigenetically regulated RNA-binding proteins signify malaria hypnozoite dormancy
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112727
PMID:37392389
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研究论文 | 本研究探讨了调控假疟疾休眠状态的RNA结合蛋白。 | 首次揭示了调控假疟疾休眠的RNA结合蛋白及其基因沉默机制。 | 本研究主要集中在特定基因和模型的分析，可能未涵盖所有相关因子。 | 探索假疟疾休眠的基因调控机制。 | 假疟疾寄生虫，包括Plasmodium vivax和cynomolgi。 | 数字病理学 | 无效疟疾 | 单细胞转录组学，染色质可及性分析，荧光原位RNA杂交 | NA | 基因组数据 | NA |
| 268 | 2024-08-05 |
Glutamine supplementation reverses manganese neurotoxicity by eliciting the mitochondrial unfolded protein response
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107136
PMID:37408687
|
研究论文 | 这篇文章研究了谷氨酰胺补充如何通过激发线粒体未折叠蛋白反应来逆转锰神经毒性 | 该研究揭示了谷氨酰胺通过增加谷胱甘肽浓度来触发线粒体未折叠蛋白反应，从而减轻锰引起的神经毒性 | 研究主要集中于斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞，结果可能不完全适用于其他神经组织或动物模型 | 探索改善神经线粒体代谢以治疗锰引起的神经毒性的潜在机制 | 研究对象包括斑马鱼多巴胺能神经元和人类神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序和代谢组学分析 | NA | 细胞数据 | 斑马鱼和人类神经母细胞瘤细胞 |
| 269 | 2024-08-07 |
Identification of BST2 as a conjunctival epithelial stem/progenitor cell marker
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107016
PMID:37389178
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体中鉴定出结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物BST2 | 首次鉴定出BST2作为结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物，并验证了其在分离和扩增这些细胞中的应用 | NA | 鉴定结膜上皮干细胞/祖细胞的特异性标记物 | 结膜上皮干细胞/祖细胞及其标记物 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的结膜上皮细胞群体 |
| 270 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of human fetal epicardium reveals its cellular composition and identifies CRIP1 as a modulator of EMT
2023-07-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2023.06.002
PMID:37390825
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类胎儿心外膜的细胞组成，并鉴定了CRIP1作为上皮-间质转化（EMT）的调节因子 | 本研究首次鉴定了CRIP1作为心外膜上皮-间质转化的未知调节因子，并提供了人类胎儿心外膜细胞的高质量数据集 | 研究中观察到的特定亚群较少，可能限制了对心外膜异质性的全面理解 | 旨在定义人类胎儿心外膜的细胞组成，并识别发育过程中的调节因子 | 人类胎儿心外膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 271 | 2024-08-07 |
The tumor suppressor CREBBP and the oncogene MYCN cooperate to induce malignant brain tumors in mice
2023-Jul-05, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-023-00481-3
PMID:37407554
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研究论文 | 研究CREBBP肿瘤抑制基因和MYCN癌基因在诱导小鼠恶性脑肿瘤中的协同作用 | 首次通过hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型，结合CREBBP缺失和MYCN在神经干细胞中的过表达，研究了这两种基因在脑肿瘤形成中的协同作用 | NA | 探究CREBBP和MYCN基因在脑肿瘤形成中的协同作用及其机制 | CREBBP和MYCN基因在神经干细胞中的功能及其在脑肿瘤形成中的作用 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | hGFAP-cre::Crebbp::lsl-MYCN小鼠模型中的神经干细胞 |
| 272 | 2024-08-07 |
Premature aging of skeletal stem/progenitor cells rather than osteoblasts causes bone loss with decreased mechanosensation
2023-Jul-05, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-023-00269-6
PMID:37407584
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠中的Zmpste24（Z24）建立了早衰模型，发现Prx1依赖的Z24缺失导致显著的骨丢失，而Acan相关的Z24缺失仅导致小梁骨丢失。单细胞RNA测序揭示了两群骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）在早衰中的减少，这些细胞表现出凋亡信号通路的激活和机械感受的减少。 | 本研究首次确定了两种早衰相关骨丢失的SSPCs群体，并揭示了Z24缺陷SSPCs中机械感受受损的新机制，为通过体育锻炼预防骨老化提供了新见解。 | NA | 研究早衰相关的骨丢失机制及其与机械感受的关系。 | 骨骼干细胞/祖细胞（SSPCs）及其在早衰中的变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 273 | 2024-08-05 |
Robustness of single-cell RNA-seq for identifying differentially expressed genes
2023-Jul-03, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-023-09487-y
PMID:37394518
|
研究论文 | 本研究探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在识别差异表达基因（DEGs）方面的稳健性。 | 本研究首次量化了识别DEGs所需的细胞数量，为研究设计提供了参考。 | 研究仅限于人类诱导多能干细胞衍生的细胞，可能不适用于其他类型的细胞。 | 旨在评估在不同细胞数量下识别DEGs的有效性。 | 研究对象为人类诱导多能干细胞衍生的血管内皮细胞和平滑肌细胞。 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和聚腺苷酸依赖的RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 实验涉及的细胞数量范围从50到2000个 |
| 274 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis of peripheral blood in patients with moyamoya disease
2023-07-03, Orphanet journal of rare diseases
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13023-023-02781-8
PMID:37400835
|
研究论文 | 本研究首次展示了人群中脑血管疾病的一种外周血单细胞测序景观，揭示了细胞异质性和基因表达异质性 | 首次采用单细胞测序技术研究了颅内动脉狭窄症的外周血样本，为该疾病提供了新的基因组快照 | 样本量较小，仅涉及两名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索颅内动脉狭窄症的发生和发展机制 | 颅内动脉狭窄症患者的外周血样本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 2名患者的外周血样本和4个正常对照样本 |
| 275 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell RNA sequencing reveals the effects of chemotherapy on human pancreatic adenocarcinoma and its tumor microenvironment
2023-Jul-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39680-2
PMID:37400453
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing for the study of kidney disease
2023-07-03, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-023-00693-8
PMID:37400792
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在肾脏疾病研究中的应用及其相关技术平台 | scRNA-seq技术在肾脏病学中的应用发展迅速，有助于深入理解肾脏疾病的起始和发展机制 | NA | 总结scRNA-seq技术在肾脏疾病研究中的应用，为肾脏疾病的诊断、治疗和预后提供参考 | 主要涉及狼疮性肾炎、肾细胞癌、糖尿病肾病和急性肾损伤等常见肾脏疾病 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 277 | 2024-08-05 |
[Mechanism of intestinal injury induced by WNT2B high-expressed fibroblasts in Crohn's disease]
2023-Jul-02, Zhonghua er ke za zhi = Chinese journal of pediatrics
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研究论文 | 本研究探讨了WNT2B高表达成纤维细胞诱导的巨噬细胞介导的肠组织损伤机制 | 揭示了WNT2B高表达成纤维细胞与巨噬细胞之间的相互作用，以及这一过程如何促进克罗恩病的肠道炎症发展 | 样本量较小，只涉及10名患有克罗恩病的儿童，可能影响结果的普遍性 | 旨在阐明克罗恩病中由WNT2B高表达成纤维细胞诱导的肠组织损伤机制 | 对10名克罗恩病儿童的肠道组织进行病理研究和细胞实验 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞测序、HE染色、免疫荧光、实时定量PCR、酶联免疫吸附测定(ELISA)、西方印迹 | NA | 组织、细胞 | 10名克罗恩病儿童（9.3±3.8岁，7名男性和3名女性） |
| 278 | 2024-08-05 |
Dissecting the effect of ileal faecal diversion on the intestine using single-cell sequencing
2023-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1321
PMID:37400975
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研究论文 | 本研究揭示了回肠粪便分流对肠道的影响及潜在机制 | 通过单细胞RNA测序，我们揭示了功能正常与功能失常肠道之间细胞亚群的不同转录组景观 | 样本量较小，仅来自三名患者 | 探讨回肠粪便分流对肠道的影响及相关机制 | 来自三名接受回肠粪便分流患者的肠道粘膜样本 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 3名患者的肠道粘膜样本 |
| 279 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of NRAS-mutated melanoma transitioning to drug resistance reveals P2RX7 as an indicator of early drug response
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112696
PMID:37379213
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组测序揭示了NRAS突变黑色素瘤在药物耐药转变中的P2RX7作为早期药物反应的指标 | 本研究首次识别了P2RX7在NRAS突变黑色素瘤药物耐药中的重要角色，提供了新的治疗靶点 | 研究主要集中于单一类型的细胞和特定的药物组合，可能限制了对其他类型耐药机制的广泛应用 | 探究NRAS突变黑色素瘤在药物耐药过程中分子机制的变化 | 对NRAS突变黑色素瘤细胞在MEK1/2和CDK4/6抑制剂治疗下的转录变化进行研究 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 280 | 2024-08-07 |
Altered anti-viral immune responses in monocytes in overweight heavy drinkers
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107133
PMID:37361874
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研究论文 | 研究探讨了超重和酗酒对单核细胞抗病毒免疫反应的影响 | 首次揭示了超重和酗酒对单核细胞抗病毒免疫反应的具体分子机制 | 研究仅限于特定的实验条件和样本类型，可能需要进一步的临床验证 | 探究超重和酗酒对单核细胞抗病毒免疫反应的影响及其分子机制 | 超重和酗酒者的单核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 包括超重和非超重的酗酒者及健康对照者的外周血单核细胞 |