单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 354 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-07 |
Author Correction: Single-cell transcriptomics identifies Mcl-1 as a target for senolytic therapy in cancer
2023-Jul-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-40080-9
PMID:37474528
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 202 | 2024-08-07 |
150 risk variants for diverticular disease of intestine prioritize cell types and enable polygenic prediction of disease susceptibility
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100326
PMID:37492107
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究分析了724,372个个体，识别了150个独立的基因组广泛显著DNA变异，并结合人类肠道单细胞RNA测序数据，揭示了肠道疾病发展的细胞类型和基因。 | 本研究首次通过大规模GWAS和单细胞RNA测序数据的整合，确定了与肠道疾病相关的关键细胞类型和基因，并开发了有效的多基因风险评分用于疾病风险预测。 | NA | 研究肠道疾病的遗传风险变异，并探索其与特定细胞类型和基因的关系。 | 肠道疾病的遗传变异、相关细胞类型和基因。 | 遗传学 | 肠道疾病 | 全基因组关联研究（GWAS）、单细胞RNA测序 | 多基因风险评分（PGS） | DNA变异、RNA序列 | 724,372个个体 |
| 203 | 2024-08-05 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals higher intratumour heterogeneity and epithelial-fibroblast interactions in recurrent bladder cancer
2023-07, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1338
PMID:37488671
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研究论文 | 本研究整合了单细胞RNA测序和空间转录组分析，探讨了六个膀胱癌组织的肿瘤微环境 | 首次在空间水平观察到膀胱复发肿瘤中癌相关成纤维细胞（CAFs）与恶性细胞之间的增强相互作用 | 本研究仅使用了六个膀胱癌组织样本，样本数量较少可能影响研究结果的普适性 | 研究复发性膀胱癌的肿瘤微环境及其异质性 | 六个膀胱癌组织样本，其中三个来自原发肿瘤，三个来自复发肿瘤 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析 | NA | 组织样本 | 六个膀胱癌组织样本 |
| 204 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis reveals development and differentiation trajectory of Schwann cells manipulated by M. leprae
2023-07, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0011477
PMID:37478057
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研究论文 | 本研究揭示了麻风分枝杆菌对施旺细胞的感染及其发育和分化轨迹 | 首次系统性地进行施旺细胞在麻风分枝杆菌感染后进行单细胞分辨率的时间过程分析，揭示了细胞的异质性及其遗传特征和功能富集 | 研究可能对施旺细胞以外的细胞类型缺乏分析，未涵盖所有与麻风相关的生物过程 | 研究施旺细胞如何被麻风分枝杆菌感染并与宿主细胞相互作用 | 被麻风分枝杆菌感染的施旺细胞 | 数字病理学 | 麻风 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 205 | 2024-08-07 |
Metronomic Administration of Topotecan Alone and in Combination with Docetaxel Inhibits Epithelial-mesenchymal Transition in Aggressive Variant Prostate Cancers
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-22-0427
PMID:37476073
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研究论文 | 研究通过低剂量连续给药的拓扑替康（METRO-TOPO）单独使用及与多西他赛联合使用，抑制侵袭性变异前列腺癌中的上皮-间质转化（EMT） | 首次展示了METRO-TOPO单独使用及与多西他赛联合使用能下调EMT标志物及CD44和CD44/CD133“干细胞样”细胞群，有效抑制前列腺癌的侵袭性扩散 | NA | 探索拓扑替康单独使用及与多西他赛联合使用对侵袭性变异前列腺癌的治疗效果 | 侵袭性变异前列腺癌（包括转移性去势抵抗性前列腺癌、神经内分泌变异和紫杉烷耐药亚型） | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序（RNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 涉及欧洲裔美国人和非洲裔美国人的侵袭性变异前列腺癌亚型样本 |
| 206 | 2024-08-07 |
A Th1-like CD4+ T-cell Cluster That Predicts Disease-free Survival in Early-stage Lung Cancer
2023-07, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-23-0167
PMID:37476074
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研究论文 | 本研究旨在识别早期肺癌患者中负责抗肿瘤免疫的T细胞簇 | 发现了一种新的Th1样CD4+ T细胞簇Th7R，该细胞簇在预测早期肺癌无病生存期方面具有鉴别能力 | NA | 识别早期肺癌患者中负责抗肿瘤免疫的T细胞簇 | 早期肺癌患者的T细胞簇 | 数字病理学 | 肺癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 血液样本，淋巴结和肿瘤浸润T细胞 | 50名早期肺癌患者 |
| 207 | 2024-08-07 |
Lumican is a potential predictor on the efficacy of concurrent chemoradiotherapy in cervical squamous cell carcinoma
2023-Jul, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e18011
PMID:37483824
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研究论文 | 本研究旨在通过分析基因表达数据和单细胞RNA测序数据，识别宫颈鳞状细胞癌中预测同步放化疗疗效的新型生物标志物 | 本研究首次发现Lumican（LUM）在宫颈鳞状细胞癌患者中高表达与同步放化疗疗效不佳相关，并可能通过PARs和IL1信号通路影响免疫微环境 | NA | 识别宫颈鳞状细胞癌中预测同步放化疗疗效的新型生物标志物 | 宫颈鳞状细胞癌患者及其同步放化疗疗效 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 15名宫颈鳞状细胞癌患者 |
| 208 | 2024-08-07 |
Cross-organ single-cell transcriptome profiling reveals macrophage and dendritic cell heterogeneity in zebrafish
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112793
PMID:37453064
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了成年斑马鱼器官中组织驻留巨噬细胞（TRMs）和树突状细胞（DCs）的异质性 | 首次在斑马鱼中全面描绘了TRMs和DCs的异质性，并生成了用于体内追踪这些细胞亚群的特异性报告基因系 | NA | 揭示斑马鱼器官中TRMs和DCs的异质性，并为深入研究这些细胞提供有价值的工具 | 斑马鱼器官中的组织驻留巨噬细胞和树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年斑马鱼多个器官中的细胞样本 |
| 209 | 2024-08-07 |
Single cell RNA sequencing unravels mechanisms underlying senescence-like phenotypes of alveolar macrophages
2023-Jul-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.107197
PMID:37456831
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了肺泡巨噬细胞衰老样表型的分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现CBFβ转录因子对肺泡巨噬细胞自我更新的重要性，并揭示了老年肺泡巨噬细胞的胚胎干细胞样特征减少及DNA修复能力下降 | NA | 探究衰老对肺泡巨噬细胞动态、异质性和转录组的影响 | 肺泡巨噬细胞 | digital pathology | geriatric disease | scRNA-seq | NA | RNA | 老年小鼠和人类的肺泡巨噬细胞 |
| 210 | 2024-08-05 |
Continuous muscle, glial, epithelial, neuronal, and hemocyte cell lines for Drosophila research
2023-07-20, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85814
PMID:37470241
|
研究论文 | 本文介绍了通过激活Ras表达生成的连续细胞系，包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞特征。 | 创新之处在于利用激活的Ras表达简化了连续细胞系的生成，并在此过程中分离了多种细胞类型。 | 本研究的局限性在于未提及细胞系在体内功能和长期稳定性方面的验证。 | 研究旨在开发用于果蝇研究的连续细胞系，以便更好地理解不同细胞类型的特性和相互作用。 | 研究对象包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞类型的细胞系。 | 数字病理学 | NA | 激活Ras表达、转录组分析 | NA | 细胞系、转录组数据 | NA |
| 211 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing analysis reveals the relationship between tumor microenvironment cells and oxidative stress in breast cancer bone metastases
2023-07-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204885
PMID:37470685
|
研究论文 | 这项研究揭示了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境细胞与氧化压力之间的关系 | 研究首次通过单细胞RNA测序构建了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境全景，识别了细胞亚群和相关生物过程 | 研究结果可能受限于样本量和单细胞测序技术的局限性 | 探索乳腺癌骨转移中的肿瘤微环境细胞及其与氧化压力的关系 | 研究对象为乳腺癌骨转移的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 212 | 2024-08-05 |
Identification of cell subpopulations associated with disease phenotypes from scRNA-seq data using PACSI
2023-07-19, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01658-3
PMID:37468850
|
研究论文 | 本研究提出了一种名为PACSI的方法，用于识别与疾病表型相关的细胞亚群。 | PACSI利用生物网络的拓扑特性，通过一种基于邻近度的度量来量化细胞与疾病表型之间的相关性 | 目前的研究并未提及PACSI在其他类型数据上的广泛适用性 | 本研究旨在区别与疾病表型相关的单细胞亚群 | 本研究的对象是相关疾病表型的细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 模拟数据和空间转录组数据 | 四个案例研究的样本 |
| 213 | 2024-08-05 |
Single-nucleus chromatin landscapes during zebrafish early embryogenesis
2023-07-19, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02373-y
PMID:37468546
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研究论文 | 本研究利用单核ATAC-seq生成了斑马鱼早期胚胎发生中的染色质可及性数据集 | 首次在斑马鱼胚胎发生的第一天生成了全面的染色质可及性数据，并与单细胞RNA-seq数据整合，描述了染色质可及性与基因表达的动态关系 | 研究仅限于斑马鱼的早期胚胎阶段，可能不适用于其他物种的发育过程 | 揭示斑马鱼胚胎发生中的表观遗传调控机制 | 51,620个高质量的核和23个细胞簇，涵盖斑马鱼胚胎发生的多个发育时间点 | 数字病理学 | NA | 单核ATAC-seq | NA | 数据集 | 51620个高质量核 |
| 214 | 2024-08-07 |
Targeting the Siglec-sialic acid axis promotes antitumor immune responses in preclinical models of glioblastoma
2023-07-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adf5302
PMID:37467314
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研究论文 | 研究通过敲除Siglec-E（Siglec-9的鼠类同源物）在微胶质细胞和单核细胞衍生细胞中的表达，揭示了Siglec-E通过抑制这些细胞的吞噬作用促进免疫逃逸，从而在胶质母细胞瘤模型中增强抗肿瘤免疫反应。 | 首次证明Siglec-E在微胶质细胞和单核细胞衍生细胞中的作用，以及其对免疫逃逸的影响，并展示了Siglec-E阻断与其他免疫疗法的组合活性。 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证。 | 探索Siglec-9轴作为胶质母细胞瘤治疗新靶点的潜力。 | 胶质母细胞瘤及其免疫逃逸机制。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及微胶质细胞和单核细胞衍生细胞的小鼠模型 |
| 215 | 2024-08-07 |
Transcriptional and spatial profiling of the kidney allograft unravels a central role for FcyRIII+ innate immune cells in rejection
2023-07-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39859-7
PMID:37468466
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术，研究了肾脏移植排斥反应中FcyRIII+先天免疫细胞的作用 | 首次揭示了FCGR3A+单核细胞和FCGR3A+ NK细胞在肾脏移植排斥反应中的关键作用，并提出了潜在的治疗靶点 | NA | 深入理解肾脏移植排斥反应中的细胞组成和细胞间相互作用 | 肾脏移植活检样本中的单细胞转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光 | NA | 转录组，图像 | 35,152个转录组来自16个肾脏移植活检样本 |
| 216 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome sequencing-based analysis: probing the mechanisms of glycoprotein NMB regulation of epithelial cells involved in silicosis
2023-07-19, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-023-00543-9
PMID:37468937
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，探讨了糖蛋白NMB在硅肺病中调控上皮细胞的具体分子机制 | 首次在单细胞水平上揭示了糖蛋白NMB在硅肺病进展中对肺泡II型上皮细胞的持续放大效应及其对上皮-间质转化的影响 | NA | 阐明硅肺病的发病机制，并探索糖蛋白NMB作为纤维化预防潜在靶点的可能性 | 硅肺病模型中的上皮细胞及其分子机制 | 数字病理学 | 职业性肺病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 实验使用了硅肺病小鼠模型 |
| 217 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing analysis of the temporomandibular joint condyle in 3 and 4-month-old human embryos
2023-Jul-19, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-023-01069-5
PMID:37468984
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了3个月和4个月大的人类胚胎颞下颌关节髁突的细胞类型及其分化过程 | 首次发现并描述了一种新的细胞类型——过渡状态细胞（TSCs），并揭示了间充质干细胞向TSCs转化的过程及其进一步分化为成骨细胞、肥大软骨细胞和成纤维细胞的机制 | NA | 建立人类胚胎颞下颌关节髁突（TMJC）的分子细胞图谱，以促进对TMJC组织修复过程病理生理学的深入理解并解决临床问题 | 3个月和4个月大的人类胚胎颞下颌关节髁突组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共捕获了16,624个细胞，确定了15个细胞集群的基因表达谱 |
| 218 | 2024-08-07 |
New mouse genetic model of breast cancer from IKKα defects in dendritic cells revealed by single-cell RNA sequencing
2023-Jul-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00553-z
PMID:37460530
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 219 | 2024-08-07 |
Genetic insights into ossification of the posterior longitudinal ligament of the spine
2023-07-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86514
PMID:37461309
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联研究（GWAS）的元分析，探讨了脊柱后纵韧带骨化症（OPLL）的遗传学机制 | 首次识别了14个与OPLL相关的显著位点，其中8个为新发现的位点，并通过基因关联分析和转录组广泛孟德尔随机化方法确定了三个候选基因 | 研究主要基于日本人群，结果的普适性有待进一步验证 | 揭示脊柱后纵韧带骨化症的病因和发病机制 | 脊柱后纵韧带骨化症及其与2型糖尿病和高体重指数的关系 | 遗传学 | 脊柱疾病 | 全基因组关联研究（GWAS） | NA | 基因组数据 | 22,016名日本个体 |
| 220 | 2024-08-07 |
Cancer-associated fibroblast classification in single-cell and spatial proteomics data
2023-07-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39762-1
PMID:37463917
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据，定义并功能注释了九种癌症相关成纤维细胞表型，并在多种癌症类型中验证了这一分类系统。 | 首次在单细胞水平上定义并功能注释了九种癌症相关成纤维细胞表型，并使用高多重成像质谱技术在蛋白质水平上验证了这些表型。 | NA | 定义癌症相关成纤维细胞的表型，并分析其在肿瘤微环境中的功能角色。 | 癌症相关成纤维细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 16,000多个肿瘤间质细胞，来自14名乳腺癌患者 |