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当前共找到 352 篇文献,本页显示第 201 - 220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
201 2024-08-07
A burns and COVID-19 shared stress responding gene network deciphers CD1C-CD141- DCs as the key cellular components in septic prognosis
2023-Jul-24, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过比较烧伤和COVID-19感染患者的转录组表达行为,识别出一个以免疫共刺激因子(CD86)为中心的应激反应核心网络(SRC),并探讨其在不同临床条件下的表达状态与预后的关系 首次描述了不同应激刺激下共同的分子和细胞应激反应特征,并识别出一个与预后相关的表达同步且功能聚焦的基因网络 NA 探讨不同应激刺激下的共同分子和细胞应激反应特征及其与临床预后的关系 烧伤和COVID-19感染患者的转录组表达行为 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 涉及COVID-19患者的全血样本 NA NA NA NA
202 2024-08-07
Machine Learning-Based Proteomics Reveals Ferroptosis in COPD Patient-Derived Airway Epithelial Cells Upon Smoking Exposure
2023-Jul-24, Journal of Korean medical science IF:3.0Q1
研究论文 本研究利用机器学习算法分析了慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者来源的气道上皮细胞在吸烟暴露下的蛋白质组变化,揭示了铁死亡在其中的显著作用。 本研究首次采用机器学习方法分析COPD患者气道上皮细胞在吸烟暴露下的蛋白质组变化,识别出铁死亡作为关键差异响应。 研究样本量较小,仅包括五名COPD患者和五名非COPD患者,可能影响结果的普遍性。 旨在通过机器学习算法识别COPD患者气道上皮细胞在吸烟暴露下的关键生物学途径。 COPD患者和非COPD患者的气道上皮细胞。 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 质谱分析 机器学习算法 蛋白质组数据 五名COPD患者和五名非COPD患者,共检测到7,953种蛋白质 NA NA NA NA
203 2024-08-05
Single-cell transcriptomics reveals the drivers and therapeutic targets of lymph node metastasis in lung adenocarcinoma
2023-07-22, Aging
研究论文 该论文揭示了肺腺癌淋巴结转移的驱动因素和治疗靶点 首次通过单细胞转录组学揭示了6q缺失和20q增加可能促进肺腺癌的淋巴结转移 未提及样本的多样性和临床数据的验证 旨在发现针对肺腺癌淋巴结转移的驱动因素和治疗靶点 研究了肺腺癌及其淋巴结转移相关的细胞亚群 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
204 2024-08-07
A universal tool for predicting differentially active features in single-cell and spatial genomics data
2023-07-22, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了一种更新版的singleCellHaystack工具,该工具能够预测单细胞和空间基因组数据中的差异活性特征 singleCellHaystack现在接受连续特征,如RNA或蛋白质表达、染色质可及性或单细胞、空间甚至批量基因组数据的模块分数,并能处理1D轨迹、2-3D空间坐标以及更高维的潜在空间作为输入坐标 NA 开发一种无偏见且高效的探索性数据分析工具,用于预测单细胞和空间基因组数据中的差异活性特征 单细胞和空间基因组数据中的差异活性特征 基因组学 NA NA NA 基因组数据 数百万个细胞 NA NA NA NA
205 2024-08-05
Regulatory role of Chitinase 3-like 1 gene in papillary thyroid carcinoma proved by integration analyses of single-cell sequencing with cohort and experimental validations
2023-Jul-21, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了Chitinase 3-like 1基因在乳头状甲状腺癌中的调节作用 首次通过单细胞RNA测序及实验验证确认CHI3L1在乳头状甲状腺癌中的正调控作用 尚未充分探索CHI3L1在乳头状甲状腺癌中的作用 揭示乳头状甲状腺癌发展中的分子机制 乳头状甲状腺癌细胞及患者样本 数字病理学 乳头状甲状腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 14个乳头状甲状腺癌患者和110个病例的免疫组化分析 NA NA NA NA
206 2024-08-05
Single-cell sequencing reveals the landscape of the human brain metastatic microenvironment
2023-07-21, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人脑转移微环境的组成。 首次揭示了肿瘤相关成纤维细胞在转移脑肿瘤中的关键作用以及与患者生存的潜在关联。 样本来源主要限于乳腺癌和肺癌,可能限制了结果的普适性。 识别支持脑转移监测和药物指导的有效生物标志物。 分析来自五个脑肿瘤组织样本的10,896个细胞。 数字病理学 脑转移 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 分析了来自五个脑肿瘤组织样本的10,896个细胞 NA NA NA NA
207 2024-08-07
Comparative analyses of the prognosis, tumor immune microenvironment, and drug treatment response between left-sided and right-sided colon cancer by integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-07-21, Aging
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,比较了左侧和右侧结肠癌的预后、肿瘤免疫微环境及药物治疗反应的差异 构建并验证了针对左侧和右侧结肠癌患者的基因预后模型,并发现右侧结肠癌患者的风险评分与更高的转移风险、N阶段、病理分期和微卫星稳定性相关 研究未发现左侧和右侧结肠癌患者在八种选定化学药物或靶向药物的敏感性上有显著差异 旨在预测左侧和右侧结肠癌患者的预后及治疗反应 左侧结肠癌(LCC)和右侧结肠癌(RCC)患者 数字病理学 结肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和批量RNA测序(bulk RNA-seq) 基因预后模型 RNA测序数据 使用了TCGA-COAD队列和GSE103479队列的数据 NA NA NA NA
208 2024-08-07
Author Correction: Single-cell transcriptomics identifies Mcl-1 as a target for senolytic therapy in cancer
2023-Jul-20, Nature communications IF:14.7Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
209 2024-08-07
150 risk variants for diverticular disease of intestine prioritize cell types and enable polygenic prediction of disease susceptibility
2023-Jul-12, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过全基因组关联研究分析了724,372个个体,识别了150个独立的基因组广泛显著DNA变异,并结合人类肠道单细胞RNA测序数据,揭示了肠道疾病发展的细胞类型和基因。 本研究首次通过大规模GWAS和单细胞RNA测序数据的整合,确定了与肠道疾病相关的关键细胞类型和基因,并开发了有效的多基因风险评分用于疾病风险预测。 NA 研究肠道疾病的遗传风险变异,并探索其与特定细胞类型和基因的关系。 肠道疾病的遗传变异、相关细胞类型和基因。 遗传学 肠道疾病 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序 多基因风险评分(PGS) DNA变异、RNA序列 724,372个个体 NA NA NA NA
210 2024-08-05
Integrated single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals higher intratumour heterogeneity and epithelial-fibroblast interactions in recurrent bladder cancer
2023-07, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本研究整合了单细胞RNA测序和空间转录组分析,探讨了六个膀胱癌组织的肿瘤微环境 首次在空间水平观察到膀胱复发肿瘤中癌相关成纤维细胞(CAFs)与恶性细胞之间的增强相互作用 本研究仅使用了六个膀胱癌组织样本,样本数量较少可能影响研究结果的普适性 研究复发性膀胱癌的肿瘤微环境及其异质性 六个膀胱癌组织样本,其中三个来自原发肿瘤,三个来自复发肿瘤 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序,空间转录组分析 NA 组织样本 六个膀胱癌组织样本 NA NA NA NA
211 2024-08-05
Single-cell sequencing analysis reveals development and differentiation trajectory of Schwann cells manipulated by M. leprae
2023-07, PLoS neglected tropical diseases IF:3.4Q1
研究论文 本研究揭示了麻风分枝杆菌对施旺细胞的感染及其发育和分化轨迹 首次系统性地进行施旺细胞在麻风分枝杆菌感染后进行单细胞分辨率的时间过程分析,揭示了细胞的异质性及其遗传特征和功能富集 研究可能对施旺细胞以外的细胞类型缺乏分析,未涵盖所有与麻风相关的生物过程 研究施旺细胞如何被麻风分枝杆菌感染并与宿主细胞相互作用 被麻风分枝杆菌感染的施旺细胞 数字病理学 麻风 单细胞测序 NA 细胞 NA NA NA NA NA
212 2024-08-07
Metronomic Administration of Topotecan Alone and in Combination with Docetaxel Inhibits Epithelial-mesenchymal Transition in Aggressive Variant Prostate Cancers
2023-07, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 研究通过低剂量连续给药的拓扑替康(METRO-TOPO)单独使用及与多西他赛联合使用,抑制侵袭性变异前列腺癌中的上皮-间质转化(EMT) 首次展示了METRO-TOPO单独使用及与多西他赛联合使用能下调EMT标志物及CD44和CD44/CD133“干细胞样”细胞群,有效抑制前列腺癌的侵袭性扩散 NA 探索拓扑替康单独使用及与多西他赛联合使用对侵袭性变异前列腺癌的治疗效果 侵袭性变异前列腺癌(包括转移性去势抵抗性前列腺癌、神经内分泌变异和紫杉烷耐药亚型) 数字病理学 前列腺癌 RNA测序(RNA-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 涉及欧洲裔美国人和非洲裔美国人的侵袭性变异前列腺癌亚型样本 NA NA NA NA
213 2024-08-07
A Th1-like CD4+ T-cell Cluster That Predicts Disease-free Survival in Early-stage Lung Cancer
2023-07, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究旨在识别早期肺癌患者中负责抗肿瘤免疫的T细胞簇 发现了一种新的Th1样CD4+ T细胞簇Th7R,该细胞簇在预测早期肺癌无病生存期方面具有鉴别能力 NA 识别早期肺癌患者中负责抗肿瘤免疫的T细胞簇 早期肺癌患者的T细胞簇 数字病理学 肺癌 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 血液样本,淋巴结和肿瘤浸润T细胞 50名早期肺癌患者 NA NA NA NA
214 2024-08-07
Lumican is a potential predictor on the efficacy of concurrent chemoradiotherapy in cervical squamous cell carcinoma
2023-Jul, Heliyon IF:3.4Q1
研究论文 本研究旨在通过分析基因表达数据和单细胞RNA测序数据,识别宫颈鳞状细胞癌中预测同步放化疗疗效的新型生物标志物 本研究首次发现Lumican(LUM)在宫颈鳞状细胞癌患者中高表达与同步放化疗疗效不佳相关,并可能通过PARs和IL1信号通路影响免疫微环境 NA 识别宫颈鳞状细胞癌中预测同步放化疗疗效的新型生物标志物 宫颈鳞状细胞癌患者及其同步放化疗疗效 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 15名宫颈鳞状细胞癌患者 NA NA NA NA
215 2024-08-07
Cross-organ single-cell transcriptome profiling reveals macrophage and dendritic cell heterogeneity in zebrafish
2023-07-25, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,全面分析了成年斑马鱼器官中组织驻留巨噬细胞(TRMs)和树突状细胞(DCs)的异质性 首次在斑马鱼中全面描绘了TRMs和DCs的异质性,并生成了用于体内追踪这些细胞亚群的特异性报告基因系 NA 揭示斑马鱼器官中TRMs和DCs的异质性,并为深入研究这些细胞提供有价值的工具 斑马鱼器官中的组织驻留巨噬细胞和树突状细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 成年斑马鱼多个器官中的细胞样本 NA NA NA NA
216 2024-08-07
Single cell RNA sequencing unravels mechanisms underlying senescence-like phenotypes of alveolar macrophages
2023-Jul-21, iScience IF:4.6Q1
research paper 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了肺泡巨噬细胞衰老样表型的分子机制 首次通过单细胞RNA测序发现CBFβ转录因子对肺泡巨噬细胞自我更新的重要性,并揭示了老年肺泡巨噬细胞的胚胎干细胞样特征减少及DNA修复能力下降 NA 探究衰老对肺泡巨噬细胞动态、异质性和转录组的影响 肺泡巨噬细胞 digital pathology geriatric disease scRNA-seq NA RNA 老年小鼠和人类的肺泡巨噬细胞 NA NA NA NA
217 2024-08-05
Continuous muscle, glial, epithelial, neuronal, and hemocyte cell lines for Drosophila research
2023-07-20, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本文介绍了通过激活Ras表达生成的连续细胞系,包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞特征。 创新之处在于利用激活的Ras表达简化了连续细胞系的生成,并在此过程中分离了多种细胞类型。 本研究的局限性在于未提及细胞系在体内功能和长期稳定性方面的验证。 研究旨在开发用于果蝇研究的连续细胞系,以便更好地理解不同细胞类型的特性和相互作用。 研究对象包括肌肉、胶质、上皮、神经和血细胞类型的细胞系。 数字病理学 NA 激活Ras表达、转录组分析 NA 细胞系、转录组数据 NA NA NA NA NA
218 2024-08-05
Single-cell sequencing analysis reveals the relationship between tumor microenvironment cells and oxidative stress in breast cancer bone metastases
2023-07-19, Aging
研究论文 这项研究揭示了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境细胞与氧化压力之间的关系 研究首次通过单细胞RNA测序构建了乳腺癌骨转移的肿瘤微环境全景,识别了细胞亚群和相关生物过程 研究结果可能受限于样本量和单细胞测序技术的局限性 探索乳腺癌骨转移中的肿瘤微环境细胞及其与氧化压力的关系 研究对象为乳腺癌骨转移的单细胞RNA测序数据 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA NA NA NA
219 2024-08-05
Identification of cell subpopulations associated with disease phenotypes from scRNA-seq data using PACSI
2023-07-19, BMC biology IF:4.4Q1
研究论文 本研究提出了一种名为PACSI的方法,用于识别与疾病表型相关的细胞亚群。 PACSI利用生物网络的拓扑特性,通过一种基于邻近度的度量来量化细胞与疾病表型之间的相关性 目前的研究并未提及PACSI在其他类型数据上的广泛适用性 本研究旨在区别与疾病表型相关的单细胞亚群 本研究的对象是相关疾病表型的细胞亚群 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 模拟数据和空间转录组数据 四个案例研究的样本 NA NA NA NA
220 2024-08-05
Single-nucleus chromatin landscapes during zebrafish early embryogenesis
2023-07-19, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 本研究利用单核ATAC-seq生成了斑马鱼早期胚胎发生中的染色质可及性数据集 首次在斑马鱼胚胎发生的第一天生成了全面的染色质可及性数据,并与单细胞RNA-seq数据整合,描述了染色质可及性与基因表达的动态关系 研究仅限于斑马鱼的早期胚胎阶段,可能不适用于其他物种的发育过程 揭示斑马鱼胚胎发生中的表观遗传调控机制 51,620个高质量的核和23个细胞簇,涵盖斑马鱼胚胎发生的多个发育时间点 数字病理学 NA 单核ATAC-seq NA 数据集 51620个高质量核 NA NA NA NA
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