单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 352 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-07 |
Embryonic Development of Parthenogenetic and Sexual Eggs in Lower Termites
2023-Jul-15, Insects
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/insects14070640
PMID:37504646
|
研究论文 | 本研究观察并描述了低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育阶段 | 首次完成了孤雌生殖和有性卵的数据库 | NA | 研究低等白蚁中孤雌生殖和有性卵的胚胎发育 | 低等白蚁的孤雌生殖和有性卵 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 182 | 2024-08-05 |
Scaffold-Based (Matrigel™) 3D Culture Technique of Glioblastoma Recovers a Patient-like Immunosuppressive Phenotype
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141856
PMID:37508520
|
研究论文 | 本研究探讨了支架基础（Matrigel™）3D培养技术如何改善2D培养的局限性 | 发现支架基础（Matrigel™）3D培养技术可影响GBM模型的转录谱，体现肿瘤-免疫相互作用的临床相关性 | 研究中未提到的局限性 | 研究支架基础3D培养技术在癌症研究中的应用 | 比较2D和3D模型中与免疫相关基因转录的变化 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | NGS | 未提及 | 基因组数据 | 未明确提及的配对样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 183 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics for Unlocking Personalized Cancer Immunotherapy: Toward Targeting the Origin of Tumor Development Immunogenicity
2023-Jul-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143615
PMID:37509276
|
综述 | 本文探讨了单细胞转录组学如何用于开发个性化癌症免疫疗法。 | 本研究创新性地将未分化肿瘤细胞群体与个性化免疫治疗联系起来，强调了OTD在肿瘤异质性中的作用。 | 缺乏具体的实验数据来支持OTD的功能和生物标志物的验证。 | 研究如何利用单细胞转录组学信息来增强癌症免疫疗法的个性化效果。 | 研究主要集中在不同患者的肿瘤细胞及其微环境，特别是OTD细胞群体。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Cryobiopsy: A Breakthrough Strategy for Clinical Utilization of Lung Cancer Organoids
2023-07-14, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12141854
PMID:37508518
|
research paper | 本文探讨了使用冷冻活检技术从晚期肺癌患者中成功生成肺肿瘤类器官（LCOs）的方法 | 首次尝试从冷冻活检样本中创建肺肿瘤类器官，提高了类器官培养的成功率，并保留了原发肿瘤的特征 | 肺肿瘤类器官培养中正常肺细胞的过度生长问题以及最佳培养条件的确定仍待解决 | 解决晚期肺癌患者无法通过手术获取肺肿瘤类器官的问题，提高类器官培养的成功率 | 晚期肺癌患者的冷冻活检样本 | digital pathology | lung cancer | 冷冻活检 | NA | 组织样本 | 113例晚期肺癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 185 | 2024-08-07 |
Crk/Crkl regulates early angiogenesis in mouse embryos by accelerating endothelial cell maturation
2023-Jul-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.12.548782
PMID:37503032
|
研究论文 | 本文研究了Crk和Crkl在胚胎早期血管发育中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了它们对内皮细胞成熟的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了Crk和Crkl在胚胎血管发育中的作用，并通过单细胞RNA测序分析了其分子机制 | 研究仅限于小鼠胚胎，且未探讨Crk和Crkl在其他物种或成人中的作用 | 确定Crk和Crkl在胚胎中胚层早期小鼠血管发育中的功能，并探索其分子机制 | Crk和Crkl在小鼠胚胎血管发育中的作用及内皮细胞的分子机制 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠胚胎的中胚层细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 186 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas Reveals the Hemocyte Subpopulations and Stress Responses in Asian Giant Softshell Turtle during Hibernation
2023-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology12070994
PMID:37508424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，比较了亚洲巨型软壳龟在活跃状态和冬眠期间血细胞的分子特征，揭示了血细胞亚群及其在冬眠期间的应激反应 | 发现了六种细胞类型及每个细胞亚群的新标记基因，并确定了冬眠期间上调的热休克基因和免疫相关基因 | NA | 探究龟类冬眠期间的季节性适应机制 | 亚洲巨型软壳龟的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-07 |
Derivation of Human Extraembryonic Mesoderm-like Cells from Primitive Endoderm
2023-Jul-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241411366
PMID:37511125
|
研究论文 | 本研究开发了一种从原始内胚层样细胞（nEnd）生成人类胚外中胚层样细胞（ExM-like）的协议 | 首次证实了人类胚外中胚层可以从原始内胚层衍生，并建立了一个细胞培养系统来研究人类胚外中胚层在胚胎发育早期的作用 | NA | 探讨人类胚外中胚层的起源及其在胚胎发育中的作用 | 人类胚外中胚层样细胞及其在胚胎发育中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
Molecular Subtypes and Tumor Microenvironment Characteristics of Small-Cell Lung Cancer Associated with Platinum-Resistance
2023-Jul-11, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15143568
PMID:37509231
|
研究论文 | 本文旨在通过基因表达分类细化小细胞肺癌（SCLC）的分子亚型，并探索与铂类耐药相关的肿瘤微环境（TME）特征 | 首次揭示了SCLC的四种分子亚型及其与铂类耐药的关系，特别是EndMT在SCLC-I亚型中的不良预后作用，并提出了BET抑制剂作为克服铂类耐药的新候选药物 | NA | 细化小细胞肺癌的分子亚型并揭示与铂类耐药相关的肿瘤微环境特征 | 小细胞肺癌的分子亚型及其与铂类耐药的关系 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 81个基因表达样本和87个验证样本 | NA | NA | NA | NA |
| 189 | 2024-08-05 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
|
评论 | 本文章探讨了与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞的作用 | 强调了少突胶质细胞在阿尔茨海默病及中枢神经系统病理中的潜在新角色 | 研究主要为综述，缺乏实证研究支持 | 探讨少突胶质细胞在认知下降中的角色及其分子特征 | 与阿尔茨海默病相关的少突胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2024-08-05 |
Spatial Omics Sequencing Based on Microfluidic Array Chips
2023-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios13070712
PMID:37504111
|
综述 | 这篇文章介绍了基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术的发展 | 文章创新点在于展示了不同微流体设计中条形码策略的简便性和高效性 | 文章未具体指出实验数据和案例研究 | 研究空间组学测序技术及其在微流体芯片上的应用 | 基于微流体阵列芯片的空间组学测序技术 | 数字病理学 | NA | 微流体阵列芯片 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2024-08-07 |
Relationship between Macrophages and Tissue Microenvironments in Diabetic Kidneys
2023-Jul-03, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines11071889
PMID:37509528
|
研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞与糖尿病肾脏组织微环境之间的关系及其在糖尿病肾病发展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术确认了糖尿病肾病中巨噬细胞的异质性和可塑性 | NA | 研究巨噬细胞在糖尿病肾病中的作用及其与组织微环境的关系 | 巨噬细胞及其在糖尿病肾病中的功能和与组织微环境的相互作用 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 192 | 2024-08-07 |
Identification of Gene Markers Associated with COVID-19 Severity and Recovery in Different Immune Cell Subtypes
2023-Jul-02, Biology
DOI:10.3390/biology12070947
PMID:37508378
|
研究论文 | 本研究旨在揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征，通过机器学习工作流程分析scRNA-seq数据，识别与COVID-19严重程度和恢复相关的基因标记 | 采用机器学习方法分析scRNA-seq数据，结合多种特征选择算法和分类算法，提取关键基因特征并构建高性能分类器 | NA | 揭示COVID-19不同阶段不同免疫细胞亚群的分子特征 | COVID-19患者的免疫细胞亚群及其分子水平变化 | 机器学习 | COVID-19 | scRNA-seq | 机器学习模型（决策树、k-最近邻、随机森林） | scRNA-seq数据 | 403,700个B细胞样本，634,595个T细胞样本，346,547个髓系细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 193 | 2024-08-07 |
Profiling A-to-I RNA editing during mouse somatic reprogramming at the single-cell level
2023-Jul, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e18133
PMID:37519753
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑位点的变化 | 首次在单细胞水平上分析了A-to-I RNA编辑频率的广泛变化及其与ADAR1表达的相关性 | NA | 研究小鼠体细胞重编程过程中A-to-I RNA编辑的动态变化及其生物学意义 | 小鼠体细胞重编程过程中的A-to-I RNA编辑 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 194 | 2024-08-05 |
The spatiotemporal dynamics of spatially variable genes in developing mouse brain revealed by a novel computational scheme
2023-Jul-27, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-023-01569-w
PMID:37500639
|
研究论文 | 本文提出了一种新型计算方案SVGbit，揭示了发育小鼠大脑中空间变异基因的时空动态 | 创新性地提出了考虑SVG的排名顺序和组合效应的方法，有助于从空间转录组数据中自动选择优先SVG | 未提及具体的实验验证或与其他方法的对比 | 探索发育小鼠大脑中特定脑区富集的空间变异基因 | 主要研究对象为发育过程中小鼠大脑的空间变异基因 | 数字病理学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组和免疫组化数据 | 公共数据集中的不同小鼠大脑数据和关键胚胎及新生阶段的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2024-08-07 |
Hyperhomocysteinemia potentiates megakaryocyte differentiation and thrombopoiesis via GH-PI3K-Akt axis
2023-07-27, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-023-01481-x
PMID:37501059
|
研究论文 | 本文研究了高同型半胱氨酸血症（HHcy）通过生长激素（GH）-PI3K-Akt轴增强巨核细胞分化和血小板生成的影响 | 首次揭示了HHcy在血小板生成中的新作用，并提供了HHcy增加血栓风险的机制新见解 | NA | 探究高同型半胱氨酸血症对血小板生成的影响及其机制 | 小鼠、斑马鱼和高血压患者的血小板计数及巨核细胞分化 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 11,189名高血压患者，人类脐带血CD34细胞，以及小鼠和斑马鱼模型 | NA | NA | NA | NA |
| 196 | 2024-08-07 |
Immune cell identifier and classifier (ImmunIC) for single cell transcriptomic readouts
2023-07-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-39282-4
PMID:37495649
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ImmunIC的工具，用于通过结合标记基因和机器学习方法进行免疫细胞的识别和分类 | ImmunIC工具在识别免疫细胞方面显示出98%的准确性，并能将免疫细胞分类为十种类型，准确率达到92% | NA | 开发一种高效的工具，用于从单细胞转录组数据中准确识别和分类免疫细胞 | 免疫细胞的识别和分类 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法 | 转录组数据 | 超过两百万个免疫细胞和五十万个非免疫细胞，来自66项单细胞RNA测序研究 | NA | NA | NA | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Identification of TGF-β-related genes in cardiac hypertrophy and heart failure based on single cell RNA sequencing
2023-07-26, Aging
DOI:10.18632/aging.204901
PMID:37498303
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据分析了心力衰竭过程中TGF-β相关基因的表达模式，并验证了这些基因在心脏肥大和心力衰竭中的潜在治疗作用。 | 首次在单细胞水平上探讨了TGF-β相关基因在心力衰竭中的作用，并验证了六个关键基因作为治疗心脏肥大和心力衰竭的潜在靶点。 | 研究主要基于公共数据集和体外实验验证，需要进一步的体内实验和临床试验来验证这些发现。 | 探讨TGF-β相关基因在心脏肥大和心力衰竭中的作用，并寻找潜在的治疗靶点。 | TGF-β相关基因在心力衰竭中的表达和作用。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了三个公共单细胞RNA测序数据集（GSE161470, GSE145154, GSE161153），一个心力衰竭转录组数据（GSE57338），和一个肥厚型心肌病转录组数据（GSE141910）。 | NA | NA | NA | NA |
| 198 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals intestinal cell heterogeneity and identifies Ep300 as a potential therapeutic target in mice with acute liver failure
2023-Jul-25, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00578-4
PMID:37488127
|
研究论文 | 该文章通过单细胞转录组学揭示了急性肝衰竭小鼠中肠细胞的异质性，并确定Ep300作为潜在的治疗靶点 | 首次定义了急性肝衰竭小鼠的肠道细胞特征，并确定Ep300作为治疗新靶点 | 本研究主要基于小鼠模型，临床适用性和人类验证尚待进一步研究 | 研究急性肝衰竭对肠道细胞特性的影响及相关治疗靶点 | 急性肝衰竭小鼠模型中的肠道细胞 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 33,216个单细胞转录组 | NA | NA | NA | NA |
| 199 | 2024-08-05 |
Multidirectional characterization of cellular composition and spatial architecture in human multiple primary lung cancers
2023-07-25, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-023-05992-w
PMID:37488117
|
研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和空间转录组学，对多发性肺癌的细胞组成和空间结构进行了综合分析。 | 识别出一种新型的上皮细胞亚群CLDN2腺泡II型细胞，特定富集于多发性肺癌中，并可作为诊断和治疗的新靶点。 | 缺乏关于CLDN2亚群在不同肺癌患者中的系统性比较数据。 | 研究多发性肺癌的细胞成分和空间架构，以改善诊断和治疗。 | 专注于多发性肺癌中的细胞及其空间分布。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 200 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell regulon atlas and multi-omics data for prognostic stratification and personalized treatment prediction in human lung adenocarcinoma
2023-07-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04331-z
PMID:37491302
|
研究论文 | 本研究构建了人肺腺癌（LUAD）中的单细胞RNA测序数据的调控网络，并引入LPRI框架，利用单细胞调控图谱和批量RNA测序或微阵列数据识别与预后相关的新的生物标志物。 | 首次构建了LUAD中的单细胞调控网络，并开发了LPRI框架，用于指导肺腺癌的预后分层和个性化治疗预测。 | NA | 探索肺腺癌中的转录调控程序，并开发新的预后生物标志物和个性化治疗预测工具。 | 人肺腺癌（LUAD）的单细胞RNA测序数据和多组学数据。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自TCGA数据集的肺腺癌队列 | NA | NA | NA | NA |