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当前共找到 352 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-07-01 |
ScopeViewer: A Browser-Based Solution for Visualizing Spatial Transcriptomics Data
2023-Jul-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.24.549256
PMID:37546786
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研究论文 | ScopeViewer是一种基于浏览器的空间转录组学数据可视化软件，旨在解决大数据处理、共享和可视化挑战 | 首次提供浏览器端的空间转录组数据交互可视化方案，实现原始图像与注释的双重查看，通过优化带宽和避免数据传输增强安全性 | 文章未提及局限性 | 开发用于空间转录组数据可视化的浏览器端软件工具 | 空间转录组数据的可视化方法 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2 | 2026-06-07 |
Transcriptomic landscape reveals germline potential of porcine skin-derived multipotent dermal fibroblast progenitors
2023-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-023-04869-7
PMID:37480481
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示猪皮肤来源的多能真皮成纤维细胞祖细胞具有向原始生殖细胞样细胞分化的潜能，并探讨其转录调控机制 | 首次通过单细胞转录组分析确认猪皮肤干细胞主要来源于多能真皮成纤维祖细胞，并揭示其在体外分化成原始生殖细胞样细胞过程中受组蛋白修饰和MAPK信号通路调控，且与人类原始生殖细胞谱系具有保守性 | 研究主要基于体外实验，体内分化效果和临床转化潜力尚未验证；样本为猪模型，与人类直接相关性仍需进一步确认 | 阐明皮肤来源干细胞分化为原始生殖细胞样细胞的细胞起源及其转录组动态变化，为不孕症治疗提供新思路 | 猪皮肤来源的多能真皮成纤维祖细胞及其分化的原始生殖细胞样细胞 | 数字病理学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 猪皮肤细胞样本，具体数量未在标题和摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3 | 2026-05-29 |
Accelerated cerebromicrovascular senescence contributes to cognitive decline in a mouse model of paclitaxel (Taxol)-induced chemobrain
2023-07, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13832
PMID:37243381
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研究论文 | 紫杉醇诱导的脑微血管衰老加速小鼠认知衰退，并表明通过药物消除衰老细胞可改善认知功能 | 首次证明紫杉醇诱导的内皮细胞衰老是化疗脑功能损伤的关键机制，并通过遗传和药物方法消除衰老细胞，验证了其因果关系 | 研究局限于小鼠模型，临床上对人类化疗脑的转化效果仍需进一步验证 | 探索紫杉醇（PTX）诱导的认知功能障碍的机制，特别是内皮细胞衰老的作用 | p16-3MR转基因小鼠脑微血管内皮细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | 紫杉醇治疗组与对照组各含多个小鼠，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-05-23 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对人类蜕膜T细胞进行蛋白质组学和V(D)J分析，揭示其独特的转录编程和克隆分布 | 首次在单细胞水平同时获得人类蜕膜T细胞的转录组、有限蛋白质和受体库信息，揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程机制和克隆分布的差异 | 未明确说明文章局限性 | 研究人类蜕膜T细胞的亚群分布、转录编程和克隆多样性，以理解母胎界面的免疫耐受机制 | 人类蜕膜和配对母体外周T细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质、受体库 | 人类蜕膜和配对母体外周血T细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 5 | 2026-05-15 |
Genome-wide mapping of cancer dependency genes and genetic modifiers of chemotherapy in high-risk hepatoblastoma
2023-07-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39717-6
PMID:37414763
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研究论文 | 通过改进的MYC驱动肝母细胞瘤小鼠模型结合CRISPR-Cas9筛选，绘制了癌症依赖基因图谱并鉴定化疗遗传修饰因子 | 首次在肝母细胞瘤中整合单细胞转录组、空间转录组及CRISPR全基因组筛选，发现与高风险人类疾病相关的可药物化靶点（如CDK7、CDK9、PRMT1、PRMT5）及化疗增敏调控因子PRKDC | 未提及具体局限性（标题与摘要未提供） | 构建肝母细胞瘤的遗传模型并系统鉴定治疗靶点及化疗反应修饰因子 | 高风险的胚胎型肝母细胞瘤 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | CRISPR-Cas9筛选，单细胞RNA测序，空间转录组学，转录组测序 | NA | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 小鼠模型及衍生细胞系（具体数量未提） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 6 | 2026-04-28 |
LRT: Integrative analysis of scRNA-seq and scTCR-seq data to investigate clonal differentiation heterogeneity
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011300
PMID:37428794
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研究论文 | 开发LRT框架，整合单细胞RNA测序与单细胞T细胞受体测序数据，研究克隆分化异质性 | 首次提出综合计算框架LRT，整合scRNA-seq和scTCR-seq数据，揭示克隆分化轨迹异质性，弥补单一方法在T细胞克隆分析中的不足 | 研究未涉及其他免疫细胞类型或更大范围的数据验证 | 探索克隆分化轨迹异质性，提供综合分析方法 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞（急性淋巴性脉络丛脑膜炎病毒感染样本） | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | 基因表达数据, TCR序列数据 | CD8+ T细胞和CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-04-23 |
Autologous humanized PDX modeling for immuno-oncology recapitulates features of the human tumor microenvironment
2023-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2023-006921
PMID:37487666
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研究论文 | 本研究开发了一种利用患者自体骨髓造血干细胞和祖细胞在MISTRG6小鼠中重建患者造血系统，并移植患者来源的异种移植组织，以建立完全基因匹配的模型来模拟个体肿瘤微环境的方法 | 开发了一种自体人源化PDX模型，利用患者自身的造血干细胞和肿瘤组织在MISTRG6小鼠中重建个体化的肿瘤微环境，克服了传统异种移植模型中的物种差异和个体间变异问题 | 模型依赖于小鼠宿主环境，可能无法完全模拟人体内所有的免疫-肿瘤相互作用；研究样本量未明确说明 | 建立一种能够更准确模拟人类肿瘤微环境并用于临床前药物测试的平台 | 实体瘤患者的骨髓造血干细胞和祖细胞以及患者来源的异种移植组织 | 肿瘤免疫学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学 | PDX模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8 | 2026-03-21 |
Reanalysis of single-cell RNA sequencing data does not support herpes simplex virus 1 latency in non-neuronal ganglionic cells in mice
2023-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.17.549345
PMID:37503290
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研究论文 | 本文通过重新分析小鼠模型中的单细胞RNA测序数据，挑战了单纯疱疹病毒1型在非神经元神经节细胞中存在潜伏感染的观点 | 揭示了3'端单细胞RNA测序实验中脱靶引物效应导致非多聚腺苷酸化的HSV-1内含子RNA被错误检测，并首次系统论证了神经元细胞死亡导致的RNA污染是先前结论的主要成因 | 研究基于已发表数据的二次分析，缺乏新的实验验证；结论主要依赖于生物信息学推断，可能存在未考虑的技术偏差 | 验证单纯疱疹病毒1型潜伏感染的细胞特异性，澄清单细胞测序数据分析中的技术假象 | 小鼠外周神经节中的神经元与非神经元细胞 | 数字病理学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析流程 | 单细胞转录组数据 | 基于已发表小鼠模型单细胞数据集（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'端单细胞RNA测序实验 |
| 9 | 2026-03-14 |
Tumor-specific CD4 T cells instruct monocyte fate in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-07-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112732
PMID:37402168
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研究论文 | 本研究通过巨噬细胞命运示踪和单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺导管腺癌中肿瘤特异性CD4 T细胞通过抗原呈递指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞的机制 | 首次证明肿瘤特异性CD4 T细胞（而非CD8 T细胞）通过巨噬细胞的MHC II类抗原呈递，指导单核细胞分化为抗肿瘤巨噬细胞，并揭示了IFNγ和CD40信号的非冗余作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本的验证尚需进一步开展；单细胞测序样本量有限 | 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞异质性的形成机制及免疫调控作用 | 胰腺导管腺癌小鼠模型中的单核细胞、巨噬细胞和T细胞 | 单细胞组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，巨噬细胞命运示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-03-13 |
Disease-Associated Oligodendrocyte: New Player in Alzheimer's Disease and CNS Pathologies
2023-Jul-07, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/j.jin2204090
PMID:37519162
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综述 | 本文综述了少突胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其分子特征，并探讨了靶向少突胶质细胞作为治疗或预防新策略的可能性 | 提出了少突胶质细胞功能障碍可能是阿尔茨海默病早期进展的第一步，并引入了通过单细胞测序技术发现的“疾病相关少突胶质细胞”这一新概念 | NA | 探讨少突胶质细胞在阿尔茨海默病认知衰退中的可能作用及其分子特征 | 少突胶质细胞、髓鞘、阿尔茨海默病 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-06 |
Cellular barcoding tracks heterogeneous clones through selective pressures and phenotypic transitions
2023-07, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.03.008
PMID:37105856
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综述 | 本文综述了细胞条形码技术在追踪异质性癌症克隆亚群命运中的应用，特别是与单细胞转录组学结合，以克隆级分辨率分析分子机制 | 结合细胞条形码与单细胞转录组学，实现克隆水平的高分辨率纵向分析，为研究肿瘤异质性起源和贡献提供了新工具 | NA | 探讨肿瘤细胞异质性的起源和贡献，以及选择和表型可塑性在疾病进展和治疗中的作用 | 异质性癌症细胞群体中的克隆亚群 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-03-02 |
150 risk variants for diverticular disease of intestine prioritize cell types and enable polygenic prediction of disease susceptibility
2023-Jul-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2023.100326
PMID:37492107
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研究论文 | 本研究通过大规模基因组关联分析，识别了150个与肠道憩室病相关的风险变异，并利用单细胞RNA测序数据揭示了特定细胞类型在疾病发展中的作用 | 首次整合GWAS结果与人类肠道单细胞RNA测序数据，明确了肠道肌细胞、间皮细胞、基质细胞以及肠神经元和胶质细胞在憩室病发展中的关键作用，并构建了有效的多基因风险评分模型 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制了结果在其他人群中的普适性；功能验证实验不足，机制研究仍需深入 | 通过基因组学方法揭示肠道憩室病的遗传基础、风险预测和发病机制 | 724,372名个体的基因组数据及人类肠道单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | 肠道憩室病 | 全基因组关联分析（GWAS）、单细胞RNA测序 | 多基因风险评分（PGS） | 基因组数据、单细胞RNA测序数据 | 724,372名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-02 |
p53 governs an AT1 differentiation programme in lung cancer suppression
2023-07, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06253-8
PMID:37468633
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研究论文 | 本研究揭示了p53通过调控肺泡上皮细胞分化状态来抑制肺腺癌发展的新机制 | 首次发现p53通过促进肺泡I型细胞分化程序来抑制肺癌，并揭示其在组织损伤修复中的基础作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床样本验证有限 | 探究p53抑制肺腺癌发展的分子机制 | 表达致癌Kras和不同Trp53等位基因的小鼠模型中的肺腺癌细胞 | 癌症生物学 | 肺癌 | RNA测序, ATAC测序, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 单细胞转录组数据 | 使用Trp53野生型、缺失型和超形态等位基因的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-01-10 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rubber tree response to early powdery mildew infection
2023-07, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.14585
PMID:36929646
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，首次构建了橡胶树叶片在早期白粉病感染下的单细胞转录组图谱，揭示了细胞类型特异性基因表达模式，并鉴定了关键抗病基因HbCNL2的功能 | 首次构建橡胶树叶片的单细胞转录组图谱，系统揭示了白粉病感染下不同细胞类型的基因表达动态，并鉴定出HbCNL2基因通过调控防御反应在抗病中发挥关键作用 | 研究仅关注早期感染阶段，未涵盖整个病程；样本量相对有限；功能验证主要在模式植物烟草中进行，在橡胶树中的直接证据有待加强 | 探究橡胶树在病原体感染下的细胞水平转录响应机制，鉴定关键抗病基因 | 橡胶树（Hevea brasiliensis）叶片在白粉病感染下的细胞 | 植物病理学与单细胞组学 | 植物真菌病害（白粉病） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及橡胶树叶片在感染条件下的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2025-12-24 |
Constructing a full, multiple-layer interactome for SARS-CoV-2 in the context of lung disease: Linking the virus with human genes and microbes
2023-07, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011222
PMID:37410793
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研究论文 | 本研究通过开发MLCrosstalk统计建模方法，构建了SARS-CoV-2在肺部疾病背景下的全多层互作网络，整合病毒、人类基因和微生物数据 | 首次提出基于潜在狄利克雷分配的MLCrosstalk方法，超越已知蛋白质互作，构建包含miRNA、人类蛋白编码基因和外源微生物的完整SARS-CoV-2互作组 | 方法依赖患者样本数据的共现模式，可能受样本选择和测序技术限制，且网络推断需要进一步实验验证 | 构建SARS-CoV-2感染的全互作网络，以促进COVID-19新药开发、区分长新冠特征并识别器官病理学标志 | SARS-CoV-2病毒、人类蛋白编码基因、microRNAs（miRNAs）及外源微生物（如Rothia mucilaginosa和Prevotella melaninogenica） | 生物信息学 | COVID-19 | 统计建模、网络传播分析、单细胞测序数据验证 | 潜在狄利克雷分配（LDA） | 多源组学数据（微生物、基因、miRNA、蛋白质互作） | 未明确指定样本数量，基于患者样本数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 16 | 2025-12-12 |
Single-cell transcriptomics reveal a hyperacute cytokine and immune checkpoint axis after cardiac arrest in patients with poor neurological outcome
2023-07-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2023.05.003
PMID:37257452
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了心脏骤停后神经系统预后不良患者中存在的超急性细胞因子和免疫检查点轴 | 首次在单细胞分辨率下定义了临床心脏骤停诱导的先天免疫网络，并识别了与不良预后相关的Nectin-2+单核细胞和Tim-3+自然杀伤细胞亚群 | 研究样本量未明确说明，且结论主要基于观察性数据，需要进一步实验验证 | 探究心脏骤停后系统性炎症反应与神经系统损伤之间的关联 | 心脏骤停住院患者 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2025-11-24 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
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研究论文 | 本研究开发了从常规H&E染色组织切片推断空间转录组信息的机器学习方法 | 首次探索从常规H&E染色切片虚拟推断空间转录组信息，以克服现有技术成本高和样本间变异大的限制 | 研究样本量相对较小（仅4名患者），可能限制结果的普适性 | 通过虚拟推断空间转录组信息来增强皮肤光老化的大规模分子评估能力 | 皮肤光老化组织，特别是基底细胞和鳞状细胞角质瘤手术切除部位邻近的皮肤标本 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学，全玻片成像，机器学习 | 机器学习模型 | 图像，转录组数据 | 来自261个皮肤标本队列中的4名患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组分析，50微米分辨率，分析超过18,000个基因 |
| 18 | 2025-11-24 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551187
PMID:37577686
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研究论文 | 本研究探索利用空间转录组学数据通过对比跨模态预训练机制生成深度学习模型，以提取分子和组织学信息用于基于图的学习任务 | 首次将空间组学数据与组织学成像配对，通过对比跨模态预训练机制增强基于图的深度学习模型在癌症病理分析中的性能 | NA | 开发能够更好理解癌变形态学和分子基础的算法，提升基于图的深度学习在癌症病理分析中的性能 | 癌症组织病理学全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 对比跨模态预训练，基于图的深度学习 | 图神经网络 | 图像，空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 50微米分辨率定位的组织学成像 |
| 19 | 2025-11-20 |
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02061-8
PMID:37037874
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综述 | 重新探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维作用 | 基于单细胞测序分析提出星形胶质细胞亚群与其功能的精确关联 | NA | 重新评估反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的关键作用 | 反应性星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-11-19 |
Old and newly synthesized histones are asymmetrically distributed in Drosophila intestinal stem cell divisions
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256404
PMID:37255015
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研究论文 | 本研究报道了果蝇肠道干细胞分裂过程中新旧组蛋白H3和H4的不对称分配现象及其与细胞命运决定的关系 | 首次在体细胞干细胞谱系中发现组蛋白不对称继承现象，并证明其通过影响Delta基因表达参与细胞命运决定 | 研究仅针对果蝇肠道干细胞，在其他物种或组织中的普适性尚未验证 | 探究组蛋白继承模式在干细胞分裂和细胞命运决定中的作用机制 | 果蝇肠道干细胞及其分裂后的细胞对 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，突变体表达 | NA | 基因表达数据，蛋白质分布数据 | 果蝇肠道干细胞及其衍生细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |