单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2024-08-05 |
Omics of an Enigmatic Marine Amoeba Uncovers Unprecedented Gene Trafficking from Giant Viruses and Provides Insights into Its Complex Life Cycle
2023-Jun, Microbiology research
IF:2.1Q3
DOI:10.3390/microbiolres14020047
PMID:37752971
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研究论文 | 本研究探索了一种复杂生活周期的海洋变形虫的基因组多样性 | 揭示了海洋变形虫与巨型病毒之间前所未有的基因转移，以及其复杂生活周期的多样性 | 未详细说明具体的实验方法和样本数量 | 探讨海洋变形虫的基因组多样性和异常行为 | 研究一种多核的海洋变形虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 162 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies distinct transcriptomic signatures between PMA/ionomycin- and αCD3/αCD28-activated primary human T cells
2023-Jun, Genomics & informatics
DOI:10.5808/gi.23009
PMID:37704208
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了PMA/ionomycin和αCD3/αCD28两种不同激活方法对人类外周血单个核细胞来源T细胞的转录组特征 | 首次全面描述了化学和抗体两种不同激活方法对人类T细胞的差异性影响 | NA | 探讨不同激活方法对人类T细胞转录组的影响 | 人类外周血单个核细胞来源的T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个独立供体的T细胞样本 |
| 163 | 2024-08-07 |
Identification and validation of biomarkers for epithelial-mesenchymal transition-related cells to estimate the prognosis and immune microenvironment in primary gastric cancer by the integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data
2023-06-16, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2023614
PMID:37679111
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证了与上皮-间质转化（EMT）相关细胞的生物标志物，用于预测原发性胃癌的预后和免疫微环境 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建并验证了与EMT相关细胞的预后基因标志物（ERCPG） | NA | 旨在通过分析胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证与EMT相关细胞的生物标志物，以预测患者的预后和肿瘤的免疫微环境 | 胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自胃癌患者的肿瘤样本 |
| 164 | 2024-08-07 |
Quantitative Spatial Analysis of Neuroligin-3 mRNA Expression in the Enteric Nervous System Reveals a Potential Role in Neuronal-Glial Synapses and Reduced Expression in Nlgn3R451C Mice
2023-06-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13071063
PMID:37509099
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研究论文 | 本文通过结合RNAScope原位杂交和免疫荧光技术，量化分析了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的空间表达，并探讨了其在神经-胶质突触中的潜在作用及在Nlgn3R451C小鼠中的表达减少情况。 | 首次详细描述了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的细胞特异性表达模式，并验证了其在神经-胶质相互作用中的作用。 | 研究仅限于小鼠模型，且依赖于特定的基因突变，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达及其在自闭症谱系障碍和胃肠功能障碍中的潜在作用。 | Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达，特别是在Nlgn3R451C突变小鼠中的表达。 | NA | 自闭症谱系障碍 | RNAScope原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 野生型和Nlgn3R451C突变小鼠 |
| 165 | 2024-08-05 |
Transcriptome Changes of Hematopoietic Stem and Progenitor Cells in the Peripheral Blood of COVID-19 Patients by scRNA-seq
2023-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310878
PMID:37446049
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研究论文 | 本研究综合揭示了COVID-19感染和疫苗接种后外周血造血干细胞和祖细胞的转录组变化 | 首次全面研究了COVID-19感染期间外周血HSPCs的转录组变化 | 未深入研究HSPCs具体的功能变化 | 探索COVID-19感染中外周血造血干细胞和祖细胞的转录组变化及其免疫机制 | COVID-19患者的外周血造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 166 | 2024-08-07 |
[Single-cell RNA sequencing deciphers transcriptional profiles of hepatocytes in mouse with hepatic alveolar echinococcosis]
2023-Jun-29, Zhongguo xue xi chong bing fang zhi za zhi = Chinese journal of schistosomiasis control
DOI:10.16250/j.32.1374.2022275
PMID:37455093
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了感染细粒棘球蚴的晚期小鼠肝脏组织中的细胞组成和转录特征。 | 首次在单细胞水平上解析了细粒棘球蚴感染晚期小鼠肝脏微环境的细胞组成和分布，并揭示了Th2细胞比例增加可能与免疫抑制微环境的形成有关。 | 研究样本量较小，仅使用了两只BALB/c小鼠的样本进行分析。 | 探讨细粒棘球蚴感染晚期小鼠肝脏组织微环境的细胞组成和转录特征。 | 细粒棘球蚴感染晚期小鼠的肝脏组织。 | 数字病理学 | 肝泡型包虫病 | 单细胞RNA测序 | UMAP算法 | RNA | 43,710个细胞 |
| 167 | 2024-08-05 |
New Insights and Potential Therapeutic Interventions in Metabolic Diseases
2023-Jun-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310672
PMID:37445852
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综述 | 本文探讨了内分泌稳态和代谢疾病的新见解及潜在治疗干预措施 | 提供了对代谢疾病机制的深入理解，并且提出了新的诊断和治疗途径 | NA | 探讨代谢疾病的基因、心理和行为基础，以及营养和身体活动的作用 | 代谢疾病的机制和治疗方法 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学、肠道微生物群、表观遗传学、成像技术、细胞治疗 | NA | NA | NA |
| 168 | 2024-08-05 |
Identification and Validation of a Metabolism-Related Prognostic Signature Associated with M2 Macrophage Infiltration in Gastric Cancer
2023-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310625
PMID:37445803
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研究论文 | 本研究识别并验证了与胃癌中M2巨噬细胞浸润相关的代谢相关预后标志。 | 首次揭示了与M2巨噬细胞浸润相关的173个代谢相关基因及其临床意义。 | 研究中所分析的临床样本和数据可能存在局限性。 | 旨在开发可以评估胃癌患者预后的风险模型。 | 研究对象为胃癌患者及其M2巨噬细胞浸润特征。 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 使用TCGA和GEO数据库分析的胃癌样本，包含173个代谢相关基因 |
| 169 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Pathways and Genes Contributing to the Hyperandrogenemia Associated with Polycystic Ovary Syndrome
2023-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310611
PMID:37445796
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析多囊卵巢综合症（PCOS）中与高雄激素血症相关的通路和基因 | 揭示了在PCOS中卵巢黄体细胞与正常排卵女性中的基因表达差异，并识别了潜在的分子诊断和治疗靶点 | 仅基于细胞培养数据，可能缺乏对体内真实情况的全面反映 | 探讨PCOS高雄激素血症的分子机制 | 从正常排卵女性和PCOS女性中分离并传代的卵巢黄体细胞 | 数字病理学 | 多囊卵巢综合症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 170 | 2024-08-05 |
Immune Cell-Related Genes in Juvenile Idiopathic Arthritis Identified Using Transcriptomic and Single-Cell Sequencing Data
2023-Jun-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241310619
PMID:37445800
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研究论文 | 本研究利用转录组和单细胞测序数据识别了与青少年特发性关节炎相关的免疫细胞基因 | 首次使用单细胞RNA测序揭示青少年特发性关节炎中免疫细胞的异质性以及相关基因 | 研究样本量及数据来源的单一性可能限制结果的普遍适用性 | 探讨青少年特发性关节炎中的免疫细胞基因及其表达差异 | 青少年特发性关节炎患者的免疫细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 青少年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | JIA样本与正常对照样本的对比分析，具体样本数量未提供 |
| 171 | 2024-08-05 |
Screening of novel biomarkers for breast cancer based on WGCNA and multiple machine learning algorithms
2023-Jun-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-23-3
PMID:37434679
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研究论文 | 本文研究了基于WGCNA和多种机器学习算法的新型乳腺癌生物标志物 | 提出了利用WGCNA和机器学习算法筛选乳腺癌的潜在生物标志物 | 未提及具体的临床验证及样本的多样性限制 | 调查乳腺癌患者的新兴诊断和预后靶标 | 主要针对乳腺癌相关的差异表达基因进行分析 | 生物医学 | 乳腺癌 | 基于基因表达的分析，WGCNA，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 99个正常组织和1081个乳腺癌组织 |
| 172 | 2024-08-05 |
Spatial Multiomics Analysis in Psychiatric Disorders
2023-Jun-01, EC psychology and psychiatry
PMID:37424930
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研究论文 | 本研究提供了精神疾病中空间多组学分析的全面概述 | 该研究整合了多种数据模态，识别了与精神疾病相关的风险基因，提供了对疾病进展的预测和诊断治疗的新见解 | NA | 探讨空间多组学分析在精神疾病中的应用和重要性 | 三种常见精神疾病：阿尔茨海默病、精神分裂症和自闭症谱系障碍 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病，精神分裂症，自闭症谱系障碍 | 空间组学 | NA | 基因数据，转录组数据，蛋白组数据 | NA |
| 173 | 2024-08-05 |
Multi-omics analysis of DNA replication-associated primase polymerase (PRIMPOL) in pan-cancer: a potential target for prognosis and immune response
2023-Jun-30, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-023-01181-9
PMID:37391787
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研究论文 | 本研究系统分析了DNA复制相关的引物聚合酶（PRIMPOL）在泛癌症中的功能角色 | 首次对PRIMPOL在多种癌症中的作用进行了全面的多组学分析 | 缺乏针对不同类型癌症的具体机制探讨 | 阐明PRIMPOL在多种人类癌症中的生物学角色 | 重点研究PRIMPOL在多种癌症中的表达模式和预后价值 | 数字病理学 | NA | 生物信息学算法 | NA | 多组学数据 | NA |
| 174 | 2024-08-05 |
Robust reconstruction of single-cell RNA-seq data with iterative gene weight updates
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad253
PMID:37387155
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研究论文 | 本文提出一种算法，通过迭代基因权重更新，以改善单细胞RNA-seq数据的组织重建质量 | 创新之处在于提出了一种迭代识别丰富信息基因的算法，以增强组织重建的准确性 | 在缺乏信息可用时，生物重建依然面临计算挑战 | 旨在通过改进算法来提升单细胞RNA序列数据的组织重建质量 | 研究对象为不同合成和真实的单细胞RNA-seq数据 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 数据集 | 包括来自哺乳动物肠上皮和肝小叶的数据 |
| 175 | 2024-08-07 |
Cell type matching across species using protein embeddings and transfer learning
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad248
PMID:37387141
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TACTiCS的模型，用于跨物种分析中的细胞类型转移和匹配 | TACTiCS模型利用自然语言处理模型匹配基因的蛋白质序列，并通过神经网络和迁移学习在不同物种间传播细胞类型标签，从而在跨物种细胞类型匹配中表现优异 | NA | 旨在解决跨物种细胞类型匹配的问题，以便更好地将实验结果从啮齿类动物翻译到人类 | 人类、小鼠和狨猴的初级运动皮层scRNA-seq数据 | 自然语言处理 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | 序列 | 涉及人类、小鼠和狨猴的初级运动皮层数据 |
| 176 | 2024-08-07 |
CellBRF: a feature selection method for single-cell clustering using cell balance and random forest
2023-06-30, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad216
PMID:37387178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellBRF的特征选择方法，该方法利用细胞平衡和随机森林来提高单细胞聚类的准确性和可解释性 | CellBRF通过考虑基因对细胞类型的相关性，并采用类平衡策略来减轻不平衡细胞类型分布对特征重要性评估的影响，从而提高了单细胞聚类的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和细胞邻域一致性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群识别 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 随机森林 | 基因表达数据 | 33个scRNA-seq数据集 |
| 177 | 2024-08-07 |
Atoh1 drives the heterogeneity of the pontine nuclei neurons and promotes their differentiation
2023-06-30, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adg1671
PMID:37390208
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探讨了Atoh1在脑桥核神经元发育中的细胞状态特异性功能 | 发现了六种先前未知的脑桥核神经元亚型，这些亚型在分子和空间上具有独特性 | NA | 阐明Atoh1在脑桥核神经元发育中的作用及其对神经元亚型多样性的影响 | 脑桥核神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 178 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of angiogenesis pattern and related immune landscape for individual treatment in osteosarcoma
2023-Jun-29, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-023-00415-7
PMID:37386055
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研究论文 | 本研究深入探讨了骨肉瘤的血管生成模式及相关免疫微环境，以构建预后模型ANGscore | 通过综合分析血管生成基因的表达模式，建立了新的ANGscore系统，能够准确区分骨肉瘤人群的预后和免疫特征 | 本研究未详细讨论ANGscore在不同癌症类型中的适用性 | 探索骨肉瘤的血管生成模式和免疫微环境，以预测预后与免疫治疗反应 | 骨肉瘤患者及其免疫微环境中的细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq | NA | 生物数据 | 多个数据集，包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据集 |
| 179 | 2024-08-05 |
Multiomics data analyses to identify SLC25A17 as a novel biomarker to predict the prognosis and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05399-6
PMID:37386359
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研究论文 | 本研究旨在探索SLC25A17在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)预后和肿瘤微环境中的预测价值 | 首次提出SLC25A17作为HNSCC患者预后和免疫微环境的新生物标志物 | 未提及具体的样本量和添加的外部验证结果的局限性 | 研究SLC25A17对HNSCC患者预后和肿瘤微环境的预测能力 | HNSCC患者的SLC25A17表达及其与预后的关系 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序，基因集富集分析 | Cox比例风险模型 | 生物标志物表达数据，临床信息 | 未具体提及，但包含TCGA数据和GSE65858队列的患者 |
| 180 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers EGFR signaling-mediated gastric progenitor cell differentiation in stomach homeostasis
2023-06-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39113-0
PMID:37386010
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研究论文 | 该研究利用单细胞转录组学揭示了EGFR信号介导的胃祖细胞分化在胃稳态中的作用 | 本研究首次发现EGFR信号在正常胃稳态中具有促分化功能，而不是促增殖功能 | 尚未深入探讨EGFR信号在不同胃病中的作用 | 研究胃祖细胞在健康状态下的多谱系分化机制 | 健康成年小鼠的胃组织中的祖细胞分化 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 健康成年小鼠的胃组织样本 |