单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-05 |
Involucrin Modulates Vitamin D Receptor Activity in the Epidermis
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.12.009
PMID:36642403
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研究论文 | 这篇文章研究了角质形成细胞中的involucrin如何调节维生素D受体的活性 | 研究揭示了involucrin在皮肤中对维生素D受体活性产生积极影响的功能角色 | 研究的功能意义尚不清楚 | 探讨involucrin如何在表皮中调节维生素D受体的功能 | 使用Ivl小鼠和野生型小鼠研究维生素D受体活性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，16S细菌分型 | NA | 基因组数据 | 使用Ivl和野生型小鼠进行的研究 | NA | NA | NA | NA |
| 142 | 2024-08-05 |
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.05.002
PMID:37267917
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研究论文 | 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑，识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 | 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用，并提出它们作为潜在的治疗靶点 | 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 | 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 | 以小鼠模型为研究对象，分析其骶髓细胞的来源和功能 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个小鼠模型的多样本 | NA | NA | NA | NA |
| 143 | 2024-08-05 |
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000116
PMID:36913357
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研究论文 | 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 | 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能，确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 | 该研究主要集中于T细胞的功能特征，可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 | 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 | 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 免疫介导的肾病 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本，以及实验性小鼠的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 144 | 2024-08-04 |
Differentiation of IL-26+ TH17 intermediates into IL-17A producers via epithelial crosstalk in psoriasis
2023-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39484-4
PMID:37391412
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研究论文 | 本研究识别出IL-26+ T17中间细胞通过上皮细胞间的相互作用分化为IL-17A产生细胞的机制 | 首次揭示IL-26在银屑病T17细胞应答中的作用，及其通过调节基底角质细胞的TGF-β1产生促进自身分化的过程 | 未详细探讨IL-26在其他免疫环境中的作用及其是否适用于其他疾病 | 研究IL-26在银屑病中作为T17细胞前体的分化作用 | IL-26+ T17中间细胞及其在银屑病皮肤中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，TCR测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 145 | 2024-08-04 |
Mettl14-mediated m6A modification ensures the cell-cycle progression of late-born retinal progenitor cells
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112596
PMID:37269288
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研究论文 | 该文章探讨了Mettl14介导的m6A修饰如何确保晚出生视网膜前体细胞的细胞周期进展 | 该研究揭示了m6A甲基化在调节晚出生视网膜前体细胞细胞周期中的重要作用 | 尚未探讨Mettl14缺失对出生前视网膜发育的其他潜在影响 | 旨在揭示神经前体细胞细胞周期进展的调控机制 | 晚出生的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | mA测序，单细胞转录组分析 | NA | mRNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 146 | 2024-08-04 |
Neural cell diversity in the light of single-cell transcriptomics
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2295044
PMID:38229529
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review | 本文总结了单细胞转录组学如何改变我们对人脑细胞多样性的看法 | 探讨了单细胞转录组学对以前认为同质的细胞类型的重新审视，揭示了性别、年龄和脑部位置等因素的影响 | NA | 介绍单细胞转录组学对神经退行性疾病研究的潜在影响 | 人脑中的细胞多样性及其调控程序 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 147 | 2024-08-04 |
Dissection and Integration of Bursty Transcriptional Dynamics for Complex Systems
2023-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544828
PMID:37398022
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研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过概率主题模型解构并整合单细胞RNA-seq数据中的转录动力学 | 采用概率主题模型来推断与个别过程相关的细胞和基因，以准确估计过程特定的速度 | 缺乏先进的代谢标记技术，可能影响RNA速度估计的准确性 | 研究单细胞RNA-seq数据中转录变化的方向性 | 聚焦于与过程相关的细胞和基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 148 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional landscapes of bovine peri-implantation development
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544813
PMID:37398069
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研究论文 | 该文章展示了牛的胚胎植入前发育过程中单细胞转录组的全景视图 | 发现了一种之前未被认识的原始滋养层细胞谱系，负责牛的妊娠维持 | 没有提供具体的样本量信息 | 全面理解牛的植入前发育中的细胞层次及其分子机制 | 牛的植入前胚胎在不同发育阶段的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段（第12、14、16和18天）的单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 149 | 2024-08-05 |
CXCL9 influences the tumor immune microenvironment by stimulating JAK/STAT pathway in triple-negative breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03343-w
PMID:36472587
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研究论文 | 这项研究探讨了CXCL9在三阴性乳腺癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 发现CXCL9通过刺激JAK/STAT信号通路在三阴性乳腺癌中影响肿瘤免疫微环境，并可能作为临床预后和免疫治疗疗效的生物标志物 | 研究未提及样本规模和临床数据的全面性 | 探讨CXCL9在三阴性乳腺癌中对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究对象为三阴性乳腺癌中的M1和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 在研究中包含了三阴性乳腺癌样本，但具体样本数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Sox17-Expressing Lineages Reveals Distinct Gene Regulatory Networks and Dynamic Developmental Trajectories
2023-06-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad030
PMID:37085274
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研究论文 | 本研究通过结合双色时间线追踪策略和单细胞RNA测序，分析了Sox17表达谱系中的6934个细胞，揭示了不同的基因调控网络和动态发育轨迹。 | 开发了一种双色时间线追踪策略，结合单细胞RNA测序技术，深入分析了Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | NA | 旨在更好地理解Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | Sox17表达谱系中的细胞，特别是内胚层和内皮细胞。 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6934个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 151 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the multiple patterns of immune escape in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1315
PMID:37349991
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研究论文 | 该研究揭示了鼻咽癌微环境中免疫逃逸的多种模式。 | 首次识别了特定于鼻咽癌微环境的CD8+自然杀伤细胞集群，并展示了肿瘤细胞中主要组织相容性复合体分子的丧失等免疫逃逸机制。 | 该技术未能捕捉到上皮/肿瘤细胞，限制了对肿瘤异质性和免疫逃逸的进一步研究。 | 分析鼻咽癌肿瘤细胞的转录组和空间特性。 | 鼻咽癌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA/snRNA-seq和成像质谱细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 152 | 2024-08-07 |
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545370
PMID:37398372
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，通过GPU加速提高了计算效率 | 实现了基于NMF的聚类方法在GPU计算节点上的运行，使用Cupy库和消息传递接口（MPI），显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决非负矩阵分解在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 基因表达数据，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的高维数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 153 | 2024-08-07 |
The Poisson distribution model fits UMI-based single-cell RNA-sequencing data
2023-Jun-17, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05349-2
PMID:37330471
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研究论文 | 本文提出了一种基于独立泊松分布（IPD）的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据建模方法，通过引入一种新的数据表示方法——从简单均匀IPD的偏离（DIPD）来捕捉细胞簇生成的每个基因每个细胞的内在异质性 | 本文的创新点在于提出了一种新的数据表示方法DIPD，用于捕捉细胞簇生成的每个基因每个细胞的内在异质性，并展示了该方法在发现新的细胞亚型方面的优势 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的建模方法，以更好地支持下游数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松分布模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 154 | 2024-08-04 |
Wnt signaling preserves progenitor cell multipotency during adipose tissue development
2023-06, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-023-00813-y
PMID:37337125
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研究论文 | 该文章研究了Wnt信号在脂肪组织发育过程中如何维持祖细胞的多能性 | 本研究揭示了Wnt信号激活在祖细胞维持中的重要作用，并识别了一种新的细胞类型，即结构性Wnt调节的脂肪组织细胞 | 该研究主要基于人类祖细胞的单细胞转录组学数据，可能在其它类型细胞中的普遍性尚待验证 | 探讨在慢性分化压力下，间充质干细胞/祖细胞的维持机制 | 人类祖细胞及其在脂肪组织发育过程中的变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类祖细胞的单细胞数据 | NA | NA | NA | NA |
| 155 | 2024-08-07 |
Prolonged response after TPO-RA discontinuation in primary ITP: results of a prospective multicenter study
2023-06-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022018665
PMID:36893453
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研究论文 | 本研究探讨了在停止使用血小板生成素受体激动剂（TPO-RA）后，原发性免疫性血小板减少症（ITP）患者持续无治疗的反应情况 | 发现单细胞RNA测序揭示了在TPO-RA停药后无持续反应的患者中，CD8+ T细胞中肿瘤坏死因子α信号通过NF-κB途径的富集，以及CD69在基线时在这些患者中的过度表达 | 未发现显著的临床预测因子来预测第24周的无治疗持续反应 | 评估原发性ITP患者在TPO-RA停药后的持续无治疗反应 | 持续或慢性原发性ITP成年患者，且在TPO-RAs治疗下完全反应 | NA | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 48名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas identifies pretreatment features of primary imatinib resistance in chronic myeloid leukemia
2023-06-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022017295
PMID:36857629
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别了慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的前治疗特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了慢性髓性白血病中伊马替尼耐药的关键细胞特征和基因表达模式 | 研究主要集中在伊马替尼耐药的预后特征，未涉及其他治疗方案的耐药机制 | 探讨慢性髓性白血病中伊马替尼原发性耐药的分子机制 | 慢性髓性白血病患者的骨髓样本，特别是白血病干细胞和自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 多个慢性髓性白血病患者的骨髓样本 | NA | NA | NA | NA |
| 157 | 2024-08-07 |
Single-cell expression profile of Drosophila ovarian follicle stem cells illuminates spatial differentiation in the germarium
2023-06-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01636-9
PMID:37340484
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型的基因表达模式，以研究干细胞群体内的异质性和与分化相关的变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型进行基因表达分析，揭示了干细胞群体的空间分化模式 | NA | 研究干细胞群体在成年组织中的组织和调控机制，以及这些机制如何影响癌症起源和细胞替代策略的开发 | 果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括滤泡干细胞及其邻近细胞类型（护送细胞和滤泡细胞）的预分类细胞群体 | NA | NA | NA | NA |
| 158 | 2024-08-04 |
Debiased personalized gene coexpression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277363.122
PMID:37295843
|
研究论文 | 本文提出了一种名为Dozer的方法，用于修正来自scRNA-seq数据集的基因-基因相关性估计。 | Dozer能够消除来自低稀疏表达基因的相关性估计偏差，并能准确量化个体间的网络级变异。 | 尽管Dozer在多种情况下表现出鲁棒性，但仍可能受到技术限制和数据噪声的影响。 | 本研究旨在估计个性化的基因共表达网络，以便在单细胞RNA-seq数据中量化表达变异。 | 研究对象包括来自不同个体的人诱导多能干细胞和阿尔茨海默病后人类组织提取的少突胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 普瓦松测量模型 | 基因表达数据 | 涉及不同个体的多条人诱导多能干细胞系和人类组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 159 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals endometrial immune microenvironment in minimal/mild endometriosis
2023-06-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad029
PMID:36869723
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了极轻度/轻度子宫内膜异位症患者的子宫内膜免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下系统地分析了子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在系统地理解子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 子宫内膜异位症患者和对照组的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 138,057个子宫内膜细胞，来自6名子宫内膜异位症患者和7名对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 160 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA | NA | NA | NA | NA |