单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 141 - 160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2024-08-07 |
Single-cell meta-analysis of inflammatory bowel disease with scIBD
2023-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00464-9
PMID:38177426
|
研究论文 | 本文介绍了scIBD平台，用于炎症性肠病（IBD）的单细胞元分析，结合高质量的单细胞数据集，识别罕见或较少表征的细胞类型，并分析溃疡性结肠炎和克罗恩病的共性和差异 | scIBD平台整合了多功能的生物信息，包括调节子活性、GWAS相关风险基因和治疗靶向基因，以推断临床相关的细胞类型特异性 | NA | 深入理解炎症性肠病的发病机制 | 炎症性肠病的肠道微环境 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 142 | 2024-08-05 |
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01511-7
PMID:37301869
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研究论文 | 本研究表明，双香豆素（DCM）对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 | 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制，以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 | 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响，也未直接消除病毒 | 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 | 主要人类气道上皮细胞（AECs） | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序分析和免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 77,969个来自10名健康志愿者的细胞 |
| 143 | 2024-08-07 |
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01799-2022
PMID:36758986
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研究论文 | 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型，发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞，并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 | 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞，并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 | NA | 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制，并探索新的治疗策略 | 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型及人类肺纤维化样本 |
| 144 | 2024-08-07 |
Intratumoral PPT1-positive macrophages determine immunosuppressive contexture and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006655
PMID:37385725
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中PPT1阳性巨噬细胞对免疫抑制微环境和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了PPT1阳性巨噬细胞在HCC中的作用，及其对免疫微环境和治疗反应的影响 | 研究样本仅来自中山医院的169名患者，可能限制了结果的普遍性 | 识别在HCC发展中起关键作用的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌（HCC）中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 169名HCC患者 |
| 145 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and macrophage-to-mesenchymal transition in bicuspid calcific aortic valve disease
2023-06-30, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00390-w
PMID:37391760
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研究论文 | 该文章研究了二尖瓣钙化主动脉瓣病中的细胞异质性和巨噬细胞转化为间充质细胞的过程。 | 首次在单细胞水平上揭示了二尖瓣病中细胞的异质性以及巨噬细胞向间充质细胞转化的机制 | 样本量较小，仅涉及四个BAV标本，需要更多样本进行进一步验证 | 探讨二尖瓣疾病中的细胞组成及其在钙化过程中的作用 | 四个存在主动脉瓣狭窄的二尖瓣患者的BAV标本 | 数字病理学 | 主动脉瓣钙化疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 4个BAV标本 |
| 146 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF2 as a prognostic biomarker associated with fibrosis and immune infiltration in advanced hepatocellular carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05391-0
PMID:37386390
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研究论文 | 本文分析了KLF2在晚期肝细胞癌中的预后生物标志物的作用，特别关注其与纤维化和免疫浸润的关系 | 首次系统性研究了KLF2在肝细胞癌（HCC）中的调节机制及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要依赖于现有数据库，未进行独立的临床验证 | 探索KLF2作为晚期HCC的潜在诊断和预后生物标志物 | 晚期肝细胞癌（HCC）患者的样本数据和单细胞测序结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据库，具体样本量不详 |
| 147 | 2024-08-05 |
TFAP2 paralogs regulate midfacial development in part through a conserved ALX genetic pathway
2023-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545376
PMID:37398373
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研究论文 | 本文探讨了TFAP2家族在哺乳动物中脸部发育中的作用及其与ALX基因途径的关系 | 研究表明TFAP2对面部发育的调控作用通过ALX转录因子实现，并展示了这一调控轴在脊椎动物中的保守性 | 缺乏在人类或其他物种中的直接验证，主要基于小鼠和斑马鱼的模型研究 | 研究TFAP2家族在中面部发育中的调控机制 | 小鼠和斑马鱼的神经嵴细胞 | NA | NA | RNA-seq, ChIP-seq | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和斑马鱼的神经嵴细胞 |
| 148 | 2024-08-05 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.11.543319
PMID:37398354
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研究论文 | 本研究表征了小鼠肝脓肿的形成及其宿主决定因素 | 首次揭示了肝脓肿形成的免疫细胞集群和宿主遗传易感性 | 研究主要集中于小鼠模型，可能无法完全反映人类的情况 | 探讨肝脓肿形成的遗传和免疫决定因素 | 小鼠模型及其与肝脓肿形成相关的免疫反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | C57BL/6及其系谱小鼠 |
| 149 | 2024-08-05 |
Integration of whole transcriptome spatial profiling with protein markers
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01536-3
PMID:36593397
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研究论文 | 本文提出了一种高通量同时进行空间转录组学和蛋白质分析的方法 | 本文创新性地开发了空间蛋白质和转录组测序技术（SPOTS），实现了转录组学和蛋白质组学的实验整合 | 本文未提及具体的实验限制 | 研究空间转录组学与蛋白质组学的整合方法 | 主要研究空间转录组和蛋白质的表达 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 150 | 2024-08-07 |
Elevated Galectin-3 Is Associated with Aging, Multiple Sclerosis, and Oxidized Phosphatidylcholine-Induced Neurodegeneration
2023-06-21, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2312-22.2023
PMID:37208177
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了衰老与多发性硬化症（MS）中Galectin-3（Gal3）的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 首次揭示了Gal3在衰老相关微胶质细胞功能障碍中的作用，并探讨了其在MS病变中的潜在危害。 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证Gal3的作用。 | 探讨Gal3在衰老和多发性硬化症中的作用及其对中枢神经系统（CNS）损伤的影响。 | Galectin-3（Gal3）在衰老和多发性硬化症中的表达及其对神经退行性病变的影响。 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 包括年轻和中年小鼠的脊髓白质病变样本，以及来自两名男性和一名女性的MS脑病变样本。 |
| 151 | 2024-08-05 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
|
研究论文 | 本文主要探讨了泛素连接酶Siah1a/2在调节肺腺癌中的肺泡巨噬细胞功能方面的作用 | 本研究首次揭示了Siah1a/2作为肺泡巨噬细胞的调节因子在致癌物诱导的肺腺癌中的关键角色 | 研究中仅针对巨噬细胞特异性Siah1a/2的作用进行了观察，未探讨其他细胞类型的影响 | 研究Siah1a/2在肺腺癌进展中调节肺泡巨噬细胞功能的机制 | 主要观察肺泡巨噬细胞及其在肺腺癌发展中的作用 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 基因剔除模型 | 细胞、基因表达数据 | 研究涉及野生型小鼠及肺腺癌患者的样本 |
| 152 | 2024-08-05 |
The coagulation-related genes for prognosis and tumor microenvironment in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-Jun-29, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11032-9
PMID:37386391
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研究论文 | 本研究探讨了与凝血相关的基因对胰腺导管腺癌的预后和肿瘤微环境的影响 | 研究区分了两种与凝血相关的基因亚型，并建立了预后模型以进行风险分层 | 只有与TCGA数据库相关的样本数据，没有长期的临床随访数据 | 进一步区分与凝血相关的基因并探讨其在胰腺导管腺癌中的免疫浸润情况 | 胰腺导管腺癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组测序 | LASSO模型 | 基因组数据和临床信息 | 收集了胰腺导管腺癌患者的实验样本，并进行了免疫组化分析 |
| 153 | 2024-08-07 |
Multi-omics analysis reveals the chemoresistance mechanism of proliferating tissue-resident macrophages in PDAC via metabolic adaptation
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112620
PMID:37285267
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研究论文 | 本文通过多组学分析揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中增殖性组织驻留巨噬细胞通过代谢适应产生化疗耐药性的机制 | 首次识别出PDAC中与不良临床结果密切相关的增殖性组织驻留巨噬细胞（proliferating rMφs），并阐明了其通过代谢适应产生化疗耐药性的具体机制 | NA | 探究胰腺导管腺癌中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）促进化疗耐药性的具体机制 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其在化疗耐药性中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学、多色免疫组化（mIHC）、流式细胞术、代谢组学 | NA | 转录组数据、免疫组化图像、流式细胞数据、代谢组数据 | 人类和鼠类的化疗治疗样本 |
| 154 | 2024-08-05 |
Complex subsets but redundant clonality after B cells egress from spontaneous germinal centers
2023-06-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.81012
PMID:37341394
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研究论文 | 本研究使用小鼠模型分析自发性生发中心后B细胞的特征 | 提出了B细胞在自发性生发中心后的复杂亚群体以及冗余克隆性的概念 | 研究仅限于小鼠模型，可能不完全适用于人类疾病的理解 | 分析自发性生发中心后B细胞的组成及其在自身免疫中的作用 | 分析B细胞亚群体及其在自发性生发中心后的发育状态 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞转录组学, 抗体库分析 | NA | 转录组数据 | 使用小鼠模型进行多个B细胞亚群的分析 |
| 155 | 2024-08-07 |
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2300012120
PMID:37307473
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了衰老对小鼠中风恢复机制的影响 | 首次揭示了衰老小鼠中风后早期修复转录重编程的缺失，并发现年轻小鼠的微胶质细胞和巨噬细胞移植可以部分恢复老年小鼠的血管生成和少突胶质细胞生成 | 研究仅限于小鼠模型，未来需要进一步在人类中验证这些发现 | 探究衰老如何影响中风后脑组织修复的机制 | 年轻和老年小鼠中风后急性期和慢性期的脑组织 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 年轻和老年小鼠的中风脑组织样本 |
| 156 | 2024-08-05 |
Tissue-resident CXCR4+ macrophage as a poor prognosis signature promotes pancreatic ductal adenocarcinoma progression
2023-06-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34468
PMID:36757203
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研究论文 | 本研究探讨了CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的预后价值及其免疫特征和功能 | 发现CXCR4+巨噬细胞的浸润与胰腺导管腺癌的差预后相关，为靶向这些细胞的免疫治疗提供了新方向 | 研究仅限于手术后样本，未涉及胰腺癌早期患者的相关数据 | 评估CXCR4+巨噬细胞在胰腺导管腺癌进展中的作用及其预后意义 | 102名术后胰腺癌患者的组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术, 免疫荧光, RNA-seq | 小鼠同种异体PDAC模型 | 组织样本 | 102个手术后胰腺癌患者样本 |
| 157 | 2024-08-05 |
Omics of an Enigmatic Marine Amoeba Uncovers Unprecedented Gene Trafficking from Giant Viruses and Provides Insights into Its Complex Life Cycle
2023-Jun, Microbiology research
IF:2.1Q3
DOI:10.3390/microbiolres14020047
PMID:37752971
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研究论文 | 本研究探索了一种复杂生活周期的海洋变形虫的基因组多样性 | 揭示了海洋变形虫与巨型病毒之间前所未有的基因转移，以及其复杂生活周期的多样性 | 未详细说明具体的实验方法和样本数量 | 探讨海洋变形虫的基因组多样性和异常行为 | 研究一种多核的海洋变形虫 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 158 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies distinct transcriptomic signatures between PMA/ionomycin- and αCD3/αCD28-activated primary human T cells
2023-Jun, Genomics & informatics
DOI:10.5808/gi.23009
PMID:37704208
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，比较了PMA/ionomycin和αCD3/αCD28两种不同激活方法对人类外周血单个核细胞来源T细胞的转录组特征 | 首次全面描述了化学和抗体两种不同激活方法对人类T细胞的差异性影响 | NA | 探讨不同激活方法对人类T细胞转录组的影响 | 人类外周血单个核细胞来源的T细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个独立供体的T细胞样本 |
| 159 | 2024-08-07 |
Identification and validation of biomarkers for epithelial-mesenchymal transition-related cells to estimate the prognosis and immune microenvironment in primary gastric cancer by the integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing data
2023-06-16, Mathematical biosciences and engineering : MBE
DOI:10.3934/mbe.2023614
PMID:37679111
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证了与上皮-间质转化（EMT）相关细胞的生物标志物，用于预测原发性胃癌的预后和免疫微环境 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建并验证了与EMT相关细胞的预后基因标志物（ERCPG） | NA | 旨在通过分析胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据，识别和验证与EMT相关细胞的生物标志物，以预测患者的预后和肿瘤的免疫微环境 | 胃癌患者的单细胞和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 来自胃癌患者的肿瘤样本 |
| 160 | 2024-08-07 |
Quantitative Spatial Analysis of Neuroligin-3 mRNA Expression in the Enteric Nervous System Reveals a Potential Role in Neuronal-Glial Synapses and Reduced Expression in Nlgn3R451C Mice
2023-06-30, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom13071063
PMID:37509099
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研究论文 | 本文通过结合RNAScope原位杂交和免疫荧光技术，量化分析了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的空间表达，并探讨了其在神经-胶质突触中的潜在作用及在Nlgn3R451C小鼠中的表达减少情况。 | 首次详细描述了Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的细胞特异性表达模式，并验证了其在神经-胶质相互作用中的作用。 | 研究仅限于小鼠模型，且依赖于特定的基因突变，可能限制了结果的普遍性。 | 探讨Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达及其在自闭症谱系障碍和胃肠功能障碍中的潜在作用。 | Neuroligin-3 mRNA在肠道神经系统中的表达，特别是在Nlgn3R451C突变小鼠中的表达。 | NA | 自闭症谱系障碍 | RNAScope原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | 野生型和Nlgn3R451C突变小鼠 |