单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
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综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 122 | 2024-08-05 |
Understanding spatiotemporal coupling of gene expression using single molecule RNA imaging technologies
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2199669
PMID:37050882
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研究论文 | 本文概述了使用单分子RNA成像技术定量理解基因表达的最新进展 | 提出了先进成像技术如何揭示从转录到降解的mRNA生命过程之间的协调关系 | 对未来挑战的讨论尚不够深入 | 提高对基因表达中转录和后转录事件的时空耦合的理解 | 主要关注mRNA在单细胞中的表达监测 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 123 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 |
| 124 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加，并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 |
| 125 | 2024-08-07 |
EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas
2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543919
PMID:37333199
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研究论文 | 本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性 | 首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果 | 肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验 |
| 126 | 2024-08-04 |
Spatial single-cell sequencing of meiosis I arrested oocytes indicates acquisition of maternal transcripts from the soma
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112544
PMID:37227820
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研究论文 | 本研究探讨了在减数分裂I期被抑制的卵母细胞中母源转录本的获得 | 揭示了邻近体细胞转录本的获取作为减数分裂I期抑制期间转录本增加的机制 | 未确定环境或激素信号对处于减数分裂I期抑制的卵母细胞是否可以启动新转录 | 研究减数分裂I期被抑制的卵母细胞的转录本获取机制 | C. elegans 减数分裂I期抑制的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 127 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of delaminating neuroblasts in the mouse otic vesicle
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112545
PMID:37227818
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研究论文 | 本文通过高深度单细胞RNA测序分析了E10.5小鼠耳泡及其周围组织，揭示了耳泡标记物和基因表达变化，从神经母细胞脱离到CVG发育的过程。 | 提供了关于CVG发育机制的新数据集，有助于进一步识别与CVG发育相关的机制。 | NA | 深入理解参与CVG发育的转录级联反应，为治疗内耳功能障碍提供见解。 | 小鼠耳泡中的CVG前体神经母细胞和新兴的CVG神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠耳泡及其周围组织的细胞样本 |
| 128 | 2024-08-07 |
Dynamic interplay between IL-1 and WNT pathways in regulating dermal adipocyte lineage cells during skin development and wound regeneration
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112647
PMID:37330908
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中或受伤的小鼠皮肤中的真皮成纤维细胞（dFBs），并探讨了IL-1和WNT信号通路在调控真皮脂肪细胞谱系细胞中的作用 | 首次详细描述了IL-1和WNT信号通路在真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性中的分子机制 | NA | 揭示真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性背后的分子机制，并为缺陷性伤口愈合和瘢痕形成定义潜在的治疗靶点 | 真皮成纤维细胞（dFBs）及其在皮肤发育和伤口再生中的分化和去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠皮肤样本 |
| 129 | 2024-08-07 |
Multi-dimensional single-cell characterization revealed suppressive immune microenvironment in AFP-positive hepatocellular carcinoma
2023-Jun-19, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00563-x
PMID:37336873
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了AFP阴性和阳性肝细胞癌及其邻近正常组织的特征，揭示了AFP阳性肝细胞癌中抑制性免疫微环境的机制 | 本研究首次揭示了AFP阳性肝细胞癌中TAM-SPP1的富集及其在调节免疫微环境中的作用，并提出SPP1-CD44轴作为治疗靶点 | NA | 旨在识别AFP阴性和阳性肝细胞癌的特征及其潜在治疗靶点 | AFP阴性肝细胞癌（ANHC）、AFP阳性肝细胞癌（APHC）及其邻近正常组织 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 6个ANHC样本、6个APHC样本和4个邻近正常组织样本，以及30个HCC样本和59个HCC样本用于进一步验证 |
| 130 | 2024-08-05 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
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研究论文 | 这篇文章研究了果蝇中新基因的起源和结构演化 | 该研究结合高质量全基因组比对、生物信息学分析和计算结构建模，提供了对特定谱系基因的系统性概述 | 对基因结构和功能起源的理解仍然有限，缺乏系统的研究 | 研究果蝇中新基因的起源、演化和蛋白质结构 | 研究特定谱系基因的蛋白质候选者 | 数字病理学 | NA | RNA-seq, Alphafold2, ESMFold, 分子动力学 | NA | 基因组数据 | 分析了555个基因候选者 |
| 131 | 2024-08-05 |
Single-cell analysis reveals the stromal dynamics and tumor-specific characteristics in the microenvironment of ovarian cancer
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544095
PMID:37333262
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研究论文 | 该文章揭示了高等级浆液性卵巢癌微环境中的基质动态和肿瘤特征 | 通过单细胞转录组学揭示了高基质与低基质肿瘤中免疫和非免疫细胞的独特转录组景观 | 仅基于公共和内部数据集的分析，可能缺乏多样性和广泛的适用性 | 研究高等级浆液性卵巢癌微环境中基质的作用和特征 | 高等级浆液性卵巢癌中的基质细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 132 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals LRRC75A-Expressing Cell Population Involved in VEGF Secretion of Multipotent Mesenchymal Stromal/Stem Cells Under Ischemia
2023-06-15, Stem cells translational medicine
IF:5.4Q1
DOI:10.1093/stcltm/szad029
PMID:37263619
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研究论文 | 本研究揭示了在缺血条件下与VEGF分泌相关的LRRC75A表达细胞群。 | 通过单细胞RNA测序分析，识别出功能性细胞亚群体，并确定LRRC75A在VEGF分泌中的调控作用。 | 研究集中于特定的骨髓源性间充质干细胞，结果可能不适用于其他类型的间充质干细胞。 | 识别功能性细胞亚群体以预测骨髓源性间充质干细胞的血管生成治疗效能。 | 研究对象为从11名供体来源的骨髓源性间充质干细胞（BM-MSC）系。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 11个供体来源的BM-MSC细胞系 |
| 133 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics uncovers cellular architecture and developmental trajectories in hepatoblastoma
2023-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32775
PMID:36059151
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研究论文 | 本研究揭示了肝母细胞瘤的细胞结构和发育轨迹 | 利用单细胞转录组分析，建立了肝母细胞瘤的细胞层级和亚型分类方法 | 基于仅五名患者的样本，样本量较小 | 探讨肝母细胞瘤的肿瘤发生机制及其异质性 | 肝母细胞瘤患者的肿瘤及配对远端肝组织样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 五名肝母细胞瘤患者的样本 |
| 134 | 2024-08-07 |
A new insight of immunosuppressive microenvironment in osteosarcoma lung metastasis
2023-06, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702231171900
PMID:37439349
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析单细胞RNA测序数据，揭示了骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境的复杂性 | 首次详细分类了骨肉瘤肺转移中的17个细胞集群，并发现CD63在决定T细胞和恶性细胞浸润中的关键作用 | 研究基于已发表的单细胞RNA测序数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨骨肉瘤肺转移的免疫抑制微环境，为精准治疗提供依据 | 骨肉瘤肺转移的细胞集群及其免疫特性 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 75,317个细胞，来自两个骨肉瘤肺转移和五个正常肺组织 |
| 135 | 2024-08-07 |
Single-cell meta-analysis of inflammatory bowel disease with scIBD
2023-Jun, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-023-00464-9
PMID:38177426
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研究论文 | 本文介绍了scIBD平台，用于炎症性肠病（IBD）的单细胞元分析，结合高质量的单细胞数据集，识别罕见或较少表征的细胞类型，并分析溃疡性结肠炎和克罗恩病的共性和差异 | scIBD平台整合了多功能的生物信息，包括调节子活性、GWAS相关风险基因和治疗靶向基因，以推断临床相关的细胞类型特异性 | NA | 深入理解炎症性肠病的发病机制 | 炎症性肠病的肠道微环境 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 136 | 2024-08-05 |
Dicoumarol is an effective post-exposure prophylactic for SARS-CoV-2 Omicron infection in human airway epithelium
2023-06-10, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01511-7
PMID:37301869
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研究论文 | 本研究表明，双香豆素（DCM）对多种Omicron变种的SARS-CoV-2感染具有显著的抗病毒活性 | 研究揭示了DCM作为一种自然抗凝血剂在抑制SARS-CoV-2的潜在机制，以及其在COVID-19后暴露预防中的有效性 | 研究未明确DCM对病毒吸收、外排和传播的影响，也未直接消除病毒 | 探索现有药物在抑制SARS-CoV-2感染中的应用 | 主要人类气道上皮细胞（AECs） | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序分析和免疫荧光染色 | NA | 细胞 | 77,969个来自10名健康志愿者的细胞 |
| 137 | 2024-08-07 |
Regulating the cell shift of endothelial cell-like myofibroblasts in pulmonary fibrosis
2023-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01799-2022
PMID:36758986
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研究论文 | 本研究通过创建新的肺纤维化小鼠模型，发现并证实了正常肺组织中存在一种未知的内皮细胞样肌成纤维细胞，并探讨了其在肺纤维化中的作用及机制 | 首次发现并证实了正常肺组织中的内皮细胞样肌成纤维细胞，并揭示了其在肺纤维化中的作用机制 | NA | 揭示内皮细胞样肌成纤维细胞在肺纤维化中的分化机制，并探索新的治疗策略 | 内皮细胞样肌成纤维细胞及其在肺纤维化中的作用 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠模型及人类肺纤维化样本 |
| 138 | 2024-08-07 |
Intratumoral PPT1-positive macrophages determine immunosuppressive contexture and immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2023-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-006655
PMID:37385725
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研究论文 | 本研究探讨了肝细胞癌（HCC）中PPT1阳性巨噬细胞对免疫抑制微环境和免疫治疗反应的影响 | 首次揭示了PPT1阳性巨噬细胞在HCC中的作用，及其对免疫微环境和治疗反应的影响 | 研究样本仅来自中山医院的169名患者，可能限制了结果的普遍性 | 识别在HCC发展中起关键作用的巨噬细胞亚群 | 肝细胞癌（HCC）中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 169名HCC患者 |
| 139 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and macrophage-to-mesenchymal transition in bicuspid calcific aortic valve disease
2023-06-30, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-023-00390-w
PMID:37391760
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研究论文 | 该文章研究了二尖瓣钙化主动脉瓣病中的细胞异质性和巨噬细胞转化为间充质细胞的过程。 | 首次在单细胞水平上揭示了二尖瓣病中细胞的异质性以及巨噬细胞向间充质细胞转化的机制 | 样本量较小，仅涉及四个BAV标本，需要更多样本进行进一步验证 | 探讨二尖瓣疾病中的细胞组成及其在钙化过程中的作用 | 四个存在主动脉瓣狭窄的二尖瓣患者的BAV标本 | 数字病理学 | 主动脉瓣钙化疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 4个BAV标本 |
| 140 | 2024-08-05 |
Comprehensive analysis of KLF2 as a prognostic biomarker associated with fibrosis and immune infiltration in advanced hepatocellular carcinoma
2023-Jun-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05391-0
PMID:37386390
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研究论文 | 本文分析了KLF2在晚期肝细胞癌中的预后生物标志物的作用，特别关注其与纤维化和免疫浸润的关系 | 首次系统性研究了KLF2在肝细胞癌（HCC）中的调节机制及其作为预后生物标志物的潜力 | 研究主要依赖于现有数据库，未进行独立的临床验证 | 探索KLF2作为晚期HCC的潜在诊断和预后生物标志物 | 晚期肝细胞癌（HCC）患者的样本数据和单细胞测序结果 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 基于公共数据库，具体样本量不详 |