单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2024-08-04 |
Vascular mechanisms of post-COVID-19 conditions: Rho-kinase is a novel target for therapy
2023-06-02, European heart journal. Cardiovascular pharmacotherapy
DOI:10.1093/ehjcvp/pvad025
PMID:37019821
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研究论文 | 本研究探讨了后新冠肺炎（后COVID-19）患者的血管机制，尤其是Rho-激酶作为治疗的新靶点。 | 本研究首次提出Rho-激酶的激活可能是治疗后COVID-19状态的新靶点，显示疫情后患者血管纤维化的加重和肌球蛋白轻链磷酸化增加。 | 本研究样本量相对较小，仅包含37名患者和10名对照，限制了结果的普遍适用性。 | 探讨后COVID-19条件下的血管功能障碍机制，并评估Rho-激酶作为潜在治疗靶点的可行性。 | 27名出院后新冠患者和10名匹配的对照者。 | 数字病理学 | 后COVID-19状态 | 血液生物标志物，心肾和肺部影像学，臀部皮下活检 | NA | 生物标志物数据，影像数据 | 37名患者（27名COVID-19患者和10名对照者） |
| 102 | 2024-08-04 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
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研究论文 | 该论文提出了一种名为CIARA的计算工具，用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | CIARA是一个独立于聚类的方法，能够选择可能成为稀有细胞类型标记的基因，超越了现有的稀有细胞类型检测方法 | 该研究未提及具体的限制 | 开发一种工具以识别单细胞基因组中的稀有细胞类型及其标记基因 | 识别来自人类胚胎和处理过视黄酸的小鼠胚胎干细胞的未表征稀有细胞群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 来自人类胚胎和小鼠胚胎干细胞的多样本数据 |
| 103 | 2024-08-07 |
Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade
2023-06-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38810-0
PMID:37369658
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研究论文 | 研究探讨了年龄相关B细胞（ABC）在不同条件下的一致性及其对COVID-19疫苗反应的长期影响 | 通过单细胞RNA测序发现，不同病因的ABC具有共同的转录特征，并可根据免疫基因表达进行分类 | NA | 研究ABC在不同条件下的相似性及其对COVID-19疫苗反应的影响 | 年龄相关B细胞（ABC）及其在免疫检查点阻断治疗患者中的作用 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 104 | 2024-08-04 |
Spatial determination and prognostic impact of the fibroblast transcriptome in pancreatic ductal adenocarcinoma
2023-06-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86125
PMID:37350578
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研究论文 | 本研究结合空间转录组学和单细胞RNA测序，定义了胰腺导管腺癌中与肿瘤相关的成纤维细胞的转录组。 | 展示了与肿瘤相近和远端成纤维细胞的转录异质性，以及其与临床结果的关联 | NA | 阐明肿瘤微环境中成纤维细胞的转录组和其与临床结果的关系 | 胰腺导管腺癌中的与肿瘤相关的成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学和单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 105 | 2024-08-07 |
Single-cell expression profile of Drosophila ovarian follicle stem cells illuminates spatial differentiation in the germarium
2023-06-20, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01636-9
PMID:37340484
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型的基因表达模式，以研究干细胞群体内的异质性和与分化相关的变化 | 首次使用单细胞RNA测序技术对果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型进行基因表达分析，揭示了干细胞群体的空间分化模式 | NA | 研究干细胞群体在成年组织中的组织和调控机制，以及这些机制如何影响癌症起源和细胞替代策略的开发 | 果蝇卵巢滤泡干细胞及其邻近细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括滤泡干细胞及其邻近细胞类型（护送细胞和滤泡细胞）的预分类细胞群体 |
| 106 | 2024-08-07 |
Chi3l1 Is a Modulator of Glioma Stem Cell States and a Therapeutic Target in Glioblastoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-21-3629
PMID:37101376
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研究论文 | 研究揭示了Chi3l1蛋白在胶质母细胞瘤中的作用，表明Chi3l1通过改变胶质瘤干细胞（GSC）的状态促进肿瘤生长，并提出了Chi3l1作为治疗靶点的可能性。 | 首次展示了Chi3l1与CD44的结合及其对GSC状态的调控作用，以及Chi3l1在体内外抑制肿瘤生长的潜力。 | NA | 探讨Chi3l1在胶质母细胞瘤中的作用及其作为治疗靶点的可能性。 | 胶质母细胞瘤、胶质瘤干细胞（GSC）、Chi3l1蛋白。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序、RNA速度分析、ATAC-seq | NA | RNA | 患者来源的胶质瘤干细胞（GSC） |
| 107 | 2024-08-04 |
Debiased personalized gene coexpression networks for population-scale scRNA-seq data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277363.122
PMID:37295843
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研究论文 | 本文提出了一种名为Dozer的方法，用于修正来自scRNA-seq数据集的基因-基因相关性估计。 | Dozer能够消除来自低稀疏表达基因的相关性估计偏差，并能准确量化个体间的网络级变异。 | 尽管Dozer在多种情况下表现出鲁棒性，但仍可能受到技术限制和数据噪声的影响。 | 本研究旨在估计个性化的基因共表达网络，以便在单细胞RNA-seq数据中量化表达变异。 | 研究对象包括来自不同个体的人诱导多能干细胞和阿尔茨海默病后人类组织提取的少突胶质细胞。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 普瓦松测量模型 | 基因表达数据 | 涉及不同个体的多条人诱导多能干细胞系和人类组织样本 |
| 108 | 2024-08-07 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和bulk RNA-seq数据分析了动脉粥样硬化中免疫原性细胞死亡的作用 | 首次系统研究了动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡，并探讨了其相关基因作为治疗靶点的可能性 | NA | 探讨免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化中的作用及其相关基因的治疗潜力 | 动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡及相关基因 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 随机森林 | RNA序列数据 | 动脉粥样硬化斑块单细胞RNA序列数据及大量RNA序列数据 |
| 109 | 2024-08-04 |
Lineage skewing and genome instability underlie marrow failure in a zebrafish model of GATA2 deficiency
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112571
PMID:37256751
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研究论文 | 本研究探讨了GATA2缺乏的斑马鱼模型中的骨髓衰竭机制。 | 揭示了gata2a缺失导致的细胞谱系偏倚及基因组不稳定性对骨髓衰竭的影响 | 研究仅在斑马鱼模型中进行，未验证在人类中的结果 | 研究GATA2缺乏所致骨髓衰竭的机制 | 斑马鱼模型中的HSPC细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学和染色质可及性分析 | NA | 细胞 | NA |
| 110 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals endometrial immune microenvironment in minimal/mild endometriosis
2023-06-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad029
PMID:36869723
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，揭示了极轻度/轻度子宫内膜异位症患者的子宫内膜免疫微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下系统地分析了子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 旨在系统地理解子宫内膜异位症患者的子宫内膜白细胞类型、炎症环境和受损的容受性 | 子宫内膜异位症患者和对照组的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 138,057个子宫内膜细胞，来自6名子宫内膜异位症患者和7名对照组 |
| 111 | 2024-08-04 |
Analysis of Donor Pancreata Defines the Transcriptomic Signature and Microenvironment of Early Neoplastic Lesions
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-0013
PMID:37021392
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研究论文 | 该文章分析了来自脑死亡供体的胰腺组织，以定义早期肿瘤病变的转录组特征和微环境。 | 首次对健康成人胰腺和散发性PanIN病变的独特微环境进行了特征描述 | 供体胰腺组织样本的获取受到限制，仅来自脑死亡供体 | 旨在揭示成人健康胰腺及早期肿瘤病变的转录组特征 | 研究对象为脑死亡供体的胰腺组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、复合免疫组化 | NA | 组织样本 | 30个胰腺组织样本 |
| 112 | 2024-08-05 |
Approaches for single-cell RNA sequencing across tissues and cell types
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2200721
PMID:37062951
|
综述 | 本文回顾了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其方法。 | 提供了关于单细胞RNA测序技术的全面评述和实验室最佳实践的指导。 | 未详细描述特定技术的应用案例和实验数据。 | 旨在为单细胞RNA测序技术建立稳健的工作流程和最新的协议。 | 涵盖各类组织和细胞类型的单细胞RNA测序方法。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA数据 | NA |
| 113 | 2024-08-05 |
Understanding spatiotemporal coupling of gene expression using single molecule RNA imaging technologies
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2199669
PMID:37050882
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研究论文 | 本文概述了使用单分子RNA成像技术定量理解基因表达的最新进展 | 提出了先进成像技术如何揭示从转录到降解的mRNA生命过程之间的协调关系 | 对未来挑战的讨论尚不够深入 | 提高对基因表达中转录和后转录事件的时空耦合的理解 | 主要关注mRNA在单细胞中的表达监测 | 数字病理学 | NA | 单分子RNA成像技术 | NA | 图像 | NA |
| 114 | 2024-08-07 |
RNA visualization and single-cell transcriptomics: methods and applications
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2286761
PMID:38047544
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 115 | 2024-08-04 |
Spatial transcriptomics stratifies psoriatic disease severity by emergent cellular ecosystems
2023-06-08, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abq7991
PMID:37267384
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析剖析了银屑病的严重程度与细胞生态系统的关系 | 首次通过空间转录组学揭示了健康皮肤和炎症皮肤之间免疫微环境的显著差异 | 尚未深入探讨银屑病对其他系统性疾病的影响 | 研究银屑病的细胞组学及其在不同严重程度下的差异 | 25个健康、活跃病变和临床未涉及的皮肤活检样本 | 数字病理学 | 银屑病 | 空间转录组学 | NA | 组织样本 | 25个皮肤活检样本 |
| 116 | 2024-08-07 |
IL-11 induces NLRP3 inflammasome activation in monocytes and inflammatory cell migration to the central nervous system
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221007120
PMID:37339207
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研究论文 | 本研究探讨了IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | 首次报道IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中增加，并通过αIL-11 mAb治疗减少炎症和脱髓鞘 | NA | 研究IL-11诱导的炎症细胞向中枢神经系统迁移的机制 | IL-11在复发缓解型多发性硬化症患者中的作用及其治疗潜力 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括复发缓解型多发性硬化症患者和健康对照者的外周血单个核细胞及脑脊液细胞 |
| 117 | 2024-08-07 |
EZH2 inhibition promotes tumor immunogenicity in lung squamous cell carcinomas
2023-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.06.543919
PMID:37333199
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研究论文 | 本研究探讨了EZH2甲基转移酶抑制剂在肺鳞状细胞癌（LSCC）中增强免疫检查点抑制剂（ICI）反应的可能性 | 首次证明EZH2抑制剂能增加主要组织相容性复合体I和II（MHCI/II）的表达，并改变肿瘤微环境，使其更具免疫原性 | NA | 研究EZH2抑制剂在肺鳞状细胞癌中增强免疫检查点抑制剂反应的效果 | 肺鳞状细胞癌（LSCC）及其免疫微环境 | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | ChIP-seq, 单细胞RNA测序 | NA | mRNA, 蛋白质 | 使用2D人类癌细胞系以及3D鼠源和患者来源的类器官进行实验 |
| 118 | 2024-08-04 |
Spatial single-cell sequencing of meiosis I arrested oocytes indicates acquisition of maternal transcripts from the soma
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112544
PMID:37227820
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研究论文 | 本研究探讨了在减数分裂I期被抑制的卵母细胞中母源转录本的获得 | 揭示了邻近体细胞转录本的获取作为减数分裂I期抑制期间转录本增加的机制 | 未确定环境或激素信号对处于减数分裂I期抑制的卵母细胞是否可以启动新转录 | 研究减数分裂I期被抑制的卵母细胞的转录本获取机制 | C. elegans 减数分裂I期抑制的卵母细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 119 | 2024-08-07 |
Transcriptional dynamics of delaminating neuroblasts in the mouse otic vesicle
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112545
PMID:37227818
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研究论文 | 本文通过高深度单细胞RNA测序分析了E10.5小鼠耳泡及其周围组织，揭示了耳泡标记物和基因表达变化，从神经母细胞脱离到CVG发育的过程。 | 提供了关于CVG发育机制的新数据集，有助于进一步识别与CVG发育相关的机制。 | NA | 深入理解参与CVG发育的转录级联反应，为治疗内耳功能障碍提供见解。 | 小鼠耳泡中的CVG前体神经母细胞和新兴的CVG神经元。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | E10.5小鼠耳泡及其周围组织的细胞样本 |
| 120 | 2024-08-07 |
Dynamic interplay between IL-1 and WNT pathways in regulating dermal adipocyte lineage cells during skin development and wound regeneration
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112647
PMID:37330908
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中或受伤的小鼠皮肤中的真皮成纤维细胞（dFBs），并探讨了IL-1和WNT信号通路在调控真皮脂肪细胞谱系细胞中的作用 | 首次详细描述了IL-1和WNT信号通路在真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性中的分子机制 | NA | 揭示真皮脂肪细胞谱系细胞的可塑性背后的分子机制，并为缺陷性伤口愈合和瘢痕形成定义潜在的治疗靶点 | 真皮成纤维细胞（dFBs）及其在皮肤发育和伤口再生中的分化和去分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠皮肤样本 |