单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2024-08-05 |
Activation of lineage competence in hemogenic endothelium precedes the formation of hematopoietic stem cell heterogeneity
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00797-0
PMID:37016019
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研究论文 | 该文章揭示了血液干细胞异质性的起源及形成机制 | 使用单细胞多组学结合谱系追踪和功能检测，首次展示了胚胎HSPCs起源于异质性血管内皮细胞 | 研究主要集中在斑马鱼胚胎中，可能无法完全适用于其他物种 | 探讨HSPC异质性的形成及其生物功能 | 胚胎中来源于血管内皮细胞的血液干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎中的多个细胞样本 |
| 82 | 2024-08-05 |
Smooth Muscle Cell Klf4 Expression Is Not Required for Phenotype Modulation or Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice-Brief Report
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318509
PMID:37128911
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研究论文 | 该研究探讨了Klf4在Marfan综合征小鼠平滑肌细胞表型调节和动脉瘤形成中的作用 | 这项研究证实了Klf4并不是开始平滑肌细胞表型调节的必要因素，但可能对高度去分化的平滑肌细胞中的软骨生成基因发挥调控作用 | 研究未探讨Klf4在其他潜在机制或其它类型细胞中的角色 | 研究Marfan综合征中平滑肌细胞的表型变化与Klf4的关系 | Marfan综合征小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 组化技术 | NA | 组织切片, 单细胞RNA测序 | 至少包含24只小鼠 |
| 83 | 2024-08-05 |
Stiffness Restricts the Stemness of the Intestinal Stem Cells and Skews Their Differentiation Toward Goblet Cells
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.02.030
PMID:36871599
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研究论文 | 本研究探讨了组织硬度如何影响肠道干细胞的命运和功能。 | 提出了组织硬度对肠道干细胞的干性和分化路径的显著调节作用。 | 没有提及具体的样本量和详细的实验条件。 | 旨在确定组织硬度对肠道干细胞的影响及其在炎症性肠病中的作用。 | 研究对象为肠道干细胞及其分化后代。 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 肠道组织样本 | 小鼠结肠模型和人类IBD样本 |
| 84 | 2024-08-05 |
Multi-omics identification of an immunogenic cell death-related signature for clear cell renal cell carcinoma in the context of 3P medicine and based on a 101-combination machine learning computational framework
2023-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00327-3
PMID:37275552
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研究论文 | 该研究构建了一个与免疫性细胞死亡相关的签名，以预测透明细胞肾细胞癌的预后 | 创新点在于开发了一个包含10种机器学习算法及其101种组合的共识免疫性细胞死亡相关签名 | 研究的局限性在于没有提及样本的多样性和外部验证集的详细信息 | 研究的目的在于建立有效的预后生物标志物以支持个体化医疗 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR | 机器学习 | 基因组、单细胞转录组、散装转录组数据 | 涉及的样本数量和类型未具体说明 |
| 85 | 2024-08-05 |
SCUBE2 mediates bone metastasis of luminal breast cancer by modulating immune-suppressive osteoblastic niches
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00810-6
PMID:37142671
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研究论文 | 本文展示了ER调控的分泌蛋白SCUBE2如何促进乳腺癌的骨转移。 | 揭示了SCUBE2通过调节免疫抑制性成骨细胞微环境，促进乳腺癌骨转移的机制。 | 该研究可能未能涵盖所有乳腺癌亚型的骨转移机制。 | 探讨ER阳性乳腺癌骨转移的特异机制及其潜在的治疗方法。 | 聚焦于ER阳性乳腺癌及其在骨转移中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤细胞数据 | 多个转移模型 |
| 86 | 2024-08-05 |
Involucrin Modulates Vitamin D Receptor Activity in the Epidermis
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.12.009
PMID:36642403
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研究论文 | 这篇文章研究了角质形成细胞中的involucrin如何调节维生素D受体的活性 | 研究揭示了involucrin在皮肤中对维生素D受体活性产生积极影响的功能角色 | 研究的功能意义尚不清楚 | 探讨involucrin如何在表皮中调节维生素D受体的功能 | 使用Ivl小鼠和野生型小鼠研究维生素D受体活性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，16S细菌分型 | NA | 基因组数据 | 使用Ivl和野生型小鼠进行的研究 |
| 87 | 2024-08-05 |
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.05.002
PMID:37267917
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研究论文 | 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑，识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 | 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用，并提出它们作为潜在的治疗靶点 | 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 | 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 | 以小鼠模型为研究对象，分析其骶髓细胞的来源和功能 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个小鼠模型的多样本 |
| 88 | 2024-08-05 |
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000116
PMID:36913357
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研究论文 | 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 | 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能，确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 | 该研究主要集中于T细胞的功能特征，可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 | 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 | 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 免疫介导的肾病 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本，以及实验性小鼠的样本 |
| 89 | 2024-08-04 |
Concerted epithelial and stromal changes during progression of Barrett's Esophagus to invasive adenocarcinoma exposed by multi-scale, multi-omics analysis
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544265
PMID:37333362
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研究论文 | 本研究通过多规模、多组学分析揭示了巴雷特食管进展为侵袭性腺癌过程中的上皮和基质的变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白组学等多个组学的分析，揭示了肿瘤进程的共享特征和患者特异特征 | 该研究样本数量相对较少，且仅限于特定患者的病理进程 | 探讨巴雷特食管向侵袭性腺癌进展中的生物学变化 | 分析来自12名患者的64个样本，研究其从鳞状上皮到腺癌的发展路径 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞转录组学，细胞外基质蛋白组学，组织力学，空间蛋白组学 | NA | 样本 | 64个样本来自12名患者 |
| 90 | 2024-08-04 |
Differentiation of IL-26+ TH17 intermediates into IL-17A producers via epithelial crosstalk in psoriasis
2023-06-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39484-4
PMID:37391412
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研究论文 | 本研究识别出IL-26+ T17中间细胞通过上皮细胞间的相互作用分化为IL-17A产生细胞的机制 | 首次揭示IL-26在银屑病T17细胞应答中的作用，及其通过调节基底角质细胞的TGF-β1产生促进自身分化的过程 | 未详细探讨IL-26在其他免疫环境中的作用及其是否适用于其他疾病 | 研究IL-26在银屑病中作为T17细胞前体的分化作用 | IL-26+ T17中间细胞及其在银屑病皮肤中的作用 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序，TCR测序和空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 91 | 2024-08-04 |
Mettl14-mediated m6A modification ensures the cell-cycle progression of late-born retinal progenitor cells
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112596
PMID:37269288
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研究论文 | 该文章探讨了Mettl14介导的m6A修饰如何确保晚出生视网膜前体细胞的细胞周期进展 | 该研究揭示了m6A甲基化在调节晚出生视网膜前体细胞细胞周期中的重要作用 | 尚未探讨Mettl14缺失对出生前视网膜发育的其他潜在影响 | 旨在揭示神经前体细胞细胞周期进展的调控机制 | 晚出生的视网膜前体细胞 | 数字病理学 | NA | mA测序，单细胞转录组分析 | NA | mRNA | NA |
| 92 | 2024-08-04 |
Neural cell diversity in the light of single-cell transcriptomics
2023 Jun-Oct, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2023.2295044
PMID:38229529
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review | 本文总结了单细胞转录组学如何改变我们对人脑细胞多样性的看法 | 探讨了单细胞转录组学对以前认为同质的细胞类型的重新审视，揭示了性别、年龄和脑部位置等因素的影响 | NA | 介绍单细胞转录组学对神经退行性疾病研究的潜在影响 | 人脑中的细胞多样性及其调控程序 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 93 | 2024-08-04 |
Dissection and Integration of Bursty Transcriptional Dynamics for Complex Systems
2023-Jun-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544828
PMID:37398022
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研究论文 | 本文提出了一种新方法，通过概率主题模型解构并整合单细胞RNA-seq数据中的转录动力学 | 采用概率主题模型来推断与个别过程相关的细胞和基因，以准确估计过程特定的速度 | 缺乏先进的代谢标记技术，可能影响RNA速度估计的准确性 | 研究单细胞RNA-seq数据中转录变化的方向性 | 聚焦于与过程相关的细胞和基因 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | 概率主题模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 94 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies response of renal lymphatic endothelial cells to acute kidney injury
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.09.544380
PMID:37333313
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研究论文 | 该文章通过单细胞RNA测序鉴定了肾脏淋巴内皮细胞对急性肾损伤的反应 | 首次对小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群进行了特征描述，并揭示了它们在急性肾损伤中的基因变化 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能无法完全代表人类情况 | 研究肾脏淋巴内皮细胞在急性肾损伤中的响应 | 小鼠肾脏淋巴内皮细胞亚群 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠模型的不同急性肾损伤类型的淋巴内皮细胞 |
| 95 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptional landscapes of bovine peri-implantation development
2023-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.13.544813
PMID:37398069
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研究论文 | 该文章展示了牛的胚胎植入前发育过程中单细胞转录组的全景视图 | 发现了一种之前未被认识的原始滋养层细胞谱系，负责牛的妊娠维持 | 没有提供具体的样本量信息 | 全面理解牛的植入前发育中的细胞层次及其分子机制 | 牛的植入前胚胎在不同发育阶段的细胞组成和基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 不同发育阶段（第12、14、16和18天）的单细胞样本 |
| 96 | 2024-08-05 |
Lactate from glycolysis regulates inflammatory macrophage polarization in breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03382-x
PMID:36729212
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研究论文 | 乳腺癌中，来自糖酵解的乳酸调节炎症性巨噬细胞的极化 | 本文揭示了糖酵解产生的乳酸如何影响乳腺癌中巨噬细胞的极化模式 | 该研究主要基于细胞水平的数据，临床验证仍需进一步研究 | 探讨乳腺癌中乳酸的来源及其对炎症巨噬细胞极化的影响 | 主要研究乳腺癌细胞及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学数据分析、单细胞转录组分析、临床数据分析、体外实验 | NA | RNA、细胞 | 22种免疫细胞与临床数据分析 |
| 97 | 2024-08-05 |
CXCL9 influences the tumor immune microenvironment by stimulating JAK/STAT pathway in triple-negative breast cancer
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03343-w
PMID:36472587
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研究论文 | 这项研究探讨了CXCL9在三阴性乳腺癌中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 发现CXCL9通过刺激JAK/STAT信号通路在三阴性乳腺癌中影响肿瘤免疫微环境，并可能作为临床预后和免疫治疗疗效的生物标志物 | 研究未提及样本规模和临床数据的全面性 | 探讨CXCL9在三阴性乳腺癌中对肿瘤免疫微环境的影响 | 研究对象为三阴性乳腺癌中的M1和M2巨噬细胞 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 在研究中包含了三阴性乳腺癌样本，但具体样本数量未提及 |
| 98 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA Sequencing of Sox17-Expressing Lineages Reveals Distinct Gene Regulatory Networks and Dynamic Developmental Trajectories
2023-06-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxad030
PMID:37085274
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研究论文 | 本研究通过结合双色时间线追踪策略和单细胞RNA测序，分析了Sox17表达谱系中的6934个细胞，揭示了不同的基因调控网络和动态发育轨迹。 | 开发了一种双色时间线追踪策略，结合单细胞RNA测序技术，深入分析了Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | NA | 旨在更好地理解Sox17在发育中的内胚层和内皮细胞中的功能。 | Sox17表达谱系中的细胞，特别是内胚层和内皮细胞。 | 基因调控 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6934个细胞 |
| 99 | 2024-08-04 |
Single-cell analysis reveals the multiple patterns of immune escape in the nasopharyngeal carcinoma microenvironment
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1315
PMID:37349991
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研究论文 | 该研究揭示了鼻咽癌微环境中免疫逃逸的多种模式。 | 首次识别了特定于鼻咽癌微环境的CD8+自然杀伤细胞集群，并展示了肿瘤细胞中主要组织相容性复合体分子的丧失等免疫逃逸机制。 | 该技术未能捕捉到上皮/肿瘤细胞，限制了对肿瘤异质性和免疫逃逸的进一步研究。 | 分析鼻咽癌肿瘤细胞的转录组和空间特性。 | 鼻咽癌肿瘤细胞。 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | scRNA/snRNA-seq和成像质谱细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 100 | 2024-08-07 |
NMFClustering: Accessible NMF-based clustering utilizing GPU acceleration
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.16.545370
PMID:37398372
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研究论文 | 本文介绍了一种基于非负矩阵分解（NMF）的聚类方法，通过GPU加速提高了计算效率 | 实现了基于NMF的聚类方法在GPU计算节点上的运行，使用Cupy库和消息传递接口（MPI），显著减少了计算时间 | NA | 旨在解决非负矩阵分解在处理大规模基因表达数据时的计算密集问题 | 基因表达数据，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq）计数矩阵 | 生物信息学 | NA | 非负矩阵分解（NMF） | NA | 基因表达数据 | 涉及数万个基因的高维数据集 |