单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2024-08-04 |
Mapping visual functions onto molecular cell types in the mouse superior colliculus
2023-06-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.036
PMID:37086721
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠上丘的不同神经元亚型及其在视觉功能中的角色 | 研究首次通过单细胞转录组学识别了28种神经元亚型，并提出小鼠上丘内抑制性神经元分子亚型的功能组织逻辑 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果可能不适用于其他物种 | 探讨小鼠上丘神经元在视觉处理中的分子功能 | 成年小鼠的上丘神经元亚型及其对应的标记基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因转录数据 | 数万个成年小鼠上丘神经元 |
| 62 | 2024-08-04 |
Immune mechanisms shape the clonal landscape during early progression of prostate cancer
2023-06-19, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.04.010
PMID:37148881
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研究论文 | 本文探讨了免疫微环境在前列腺癌早期进展中调节肿瘤克隆景观的作用 | 研究展示了肿瘤中的多克隆景观与微环境的关系，并揭示了免疫编辑在克隆生存中的重要性 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类前列腺癌的复杂性 | 探讨免疫微环境如何影响肿瘤内异质性和克隆景观 | 主要研究了前列腺癌小鼠模型中的肿瘤微环境和克隆动态 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学，基因工程小鼠模型 | NA | NA | 使用了基因工程小鼠模型进行研究 |
| 63 | 2024-08-04 |
Characterization of Chemotaxis-Associated Gene Dysregulation in Myeloid Cell Populations in the Lungs during Lipopolysaccharide-Mediated Acute Lung Injury
2023-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200822
PMID:37163318
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研究论文 | 本研究探讨了在脂多糖介导的急性肺损伤中的化学趋向因子及其受体对骨髓细胞群体的调节作用 | 揭示了化学趋向因子配体与受体相互作用导致骨髓细胞异质性及细胞招募至肺部的机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全代表人类情况 | 研究脂多糖介导的急性肺损伤中化学趋向因子的作用 | C57BL/6J小鼠中的骨髓细胞群体 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | C57BL/6J小鼠，未具体说明样本数量 |
| 64 | 2024-08-07 |
Chemoenzymatic Measurement of LacNAc in Single-Cell Multiomics Reveals It as a Cell-Surface Indicator of Glycolytic Activity of CD8+ T Cells
2023-06-14, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.3c02602
PMID:37276352
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研究论文 | 本文报道了一种化学酶法用于单细胞水平检测N-乙酰乳糖胺（LacNAc），并通过特定DNA条形码标记LacNAc，揭示了其在CD8+ T细胞中的糖酵解活性指示作用。 | 开发了一种新的化学酶法用于单细胞水平的LacNAc检测，该方法与多种单细胞RNA测序平台兼容，并能与TCR序列和细胞表面表位信息（如scTCR和CITE-seq）结合进行多组学分析。 | NA | 研究单细胞水平上LacNAc作为CD8+ T细胞糖酵解活性指示的生物学作用。 | CD8+ T细胞的糖酵解活性和LacNAc水平。 | 生物化学 | NA | 化学酶法 | NA | 单细胞RNA测序 | 未具体说明样本数量 |
| 65 | 2024-08-05 |
The mitochondrial unfolded protein response regulates hippocampal neural stem cell aging
2023-06-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2023.04.012
PMID:37146607
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研究论文 | 这篇文章探讨了线粒体未折叠蛋白反应如何影响海马神经干细胞的衰老 | 创新点在于首次将线粒体蛋白折叠压力与神经干细胞衰老的关系建立起来 | 该研究可能仅限于小鼠模型，缺乏对人类的直接验证 | 研究线粒体蛋白折叠压力在神经干细胞衰老中的作用 | 年轻和老年小鼠的海马神经干细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 年轻和老年小鼠的单细胞样本 |
| 66 | 2024-08-05 |
CO-CLUSTERING OF SPATIALLY RESOLVED TRANSCRIPTOMIC DATA
2023-Jun, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/22-aoas1677
PMID:37811520
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研究论文 | 本文介绍了一种新统计模型SpaRTaCo，用于对空间基因表达数据进行共聚类 | 提出了一种利用空间信息进行细胞和基因聚类的新方法 | 尚欠缺广泛的实证验证，尤其在不同类型组织样本中的适用性 | 旨在更好地理解组织中基因功能和相互作用的空间变化 | 研究细胞类型和基因在组织中空间表达模式的聚类 | 数字病理学 | NA | 10X-Visium | 聚类模型 | 转录组数据 | 应用于一个人脑组织样本 |
| 67 | 2024-08-05 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
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综述 | 本文系统地回顾了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构以及与其他细胞器的相互作用 | 文章结合了内质网在体外成熟中引发的临床问题，并通过单细胞RNA测序识别了内质网的机制 | NA | 探讨内质网在哺乳动物卵母细胞中的时空分布及其功能 | 哺乳动物卵母细胞及其内质网 | 数字病理 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-08-05 |
Exploring the heterogeneity of white adipose tissue in mouse and man
2023-06, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2023.102045
PMID:37094486
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研究论文 | 本文讨论了人类和小鼠白色脂肪组织的异质性，特别是成熟脂肪细胞的异质性 | 该研究通过单核RNA测序和空间转录组学拓展了对脂肪细胞亚群体的理解 | 该研究未说明具体实验数据或样本规模 | 探讨脂肪组织的异质性及其在代谢病生理中的潜在贡献 | 人类和小鼠的白色脂肪组织及其细胞成分 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | 细胞类型相关的数据 | NA |
| 69 | 2024-08-05 |
CX3CR1+ Macrophage Facilitates the Resolution of Allergic Lung Inflammation via Interacting CCL26
2023-06-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202209-1670OC
PMID:36790376
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研究论文 | 这篇文章探讨了CX3CR1+ 巨噬细胞在通过相互作用CCL26促使过敏性肺炎症消退中的作用 | 文章首次揭示了CCL26-CXCR途径在过敏性肺炎症消退中的重要性 | 研究主要集中于特定的细胞机制，可能未覆盖所有相关因素 | 研究组织驻留巨噬细胞在嗜酸性肺炎症消退过程中的机制 | 人类和小鼠模型中的气道巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 过敏性肺炎 | 质谱细胞分析、单细胞RNA测序、物理和免疫学分析 | 转基因小鼠 | 生物样本 | 使用了人类亚段支气管激发和小鼠过敏性肺炎模型的样本 |
| 70 | 2024-08-05 |
Activation of lineage competence in hemogenic endothelium precedes the formation of hematopoietic stem cell heterogeneity
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00797-0
PMID:37016019
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研究论文 | 该文章揭示了血液干细胞异质性的起源及形成机制 | 使用单细胞多组学结合谱系追踪和功能检测，首次展示了胚胎HSPCs起源于异质性血管内皮细胞 | 研究主要集中在斑马鱼胚胎中，可能无法完全适用于其他物种 | 探讨HSPC异质性的形成及其生物功能 | 胚胎中来源于血管内皮细胞的血液干细胞及其前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞多组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎中的多个细胞样本 |
| 71 | 2024-08-05 |
Matrix stiffness enhances cancer-macrophage interactions and M2-like macrophage accumulation in the breast tumor microenvironment
2023-06, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2022.04.031
PMID:35483629
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研究论文 | 该研究分析了基质硬度对乳腺肿瘤微环境中癌细胞与巨噬细胞相互作用的影响 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤硬化对细胞间通讯和巨噬细胞招募的影响 | 尚未深入研究基质硬化对肿瘤异质性的全面影响 | 探讨基质硬化在乳腺肿瘤微环境中巨噬细胞的积累与相互作用的影响 | 研究了MMTV-PyMT小鼠乳腺肿瘤中刚性与柔性肿瘤的转录组差异 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用MMTV-PyMT小鼠肿瘤样本进行比较 |
| 72 | 2024-08-05 |
Smooth Muscle Cell Klf4 Expression Is Not Required for Phenotype Modulation or Aneurysm Formation in Marfan Syndrome Mice-Brief Report
2023-06, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.318509
PMID:37128911
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研究论文 | 该研究探讨了Klf4在Marfan综合征小鼠平滑肌细胞表型调节和动脉瘤形成中的作用 | 这项研究证实了Klf4并不是开始平滑肌细胞表型调节的必要因素，但可能对高度去分化的平滑肌细胞中的软骨生成基因发挥调控作用 | 研究未探讨Klf4在其他潜在机制或其它类型细胞中的角色 | 研究Marfan综合征中平滑肌细胞的表型变化与Klf4的关系 | Marfan综合征小鼠模型 | 数字病理学 | NA | RNA测序, 组化技术 | NA | 组织切片, 单细胞RNA测序 | 至少包含24只小鼠 |
| 73 | 2024-08-05 |
Stiffness Restricts the Stemness of the Intestinal Stem Cells and Skews Their Differentiation Toward Goblet Cells
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.02.030
PMID:36871599
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研究论文 | 本研究探讨了组织硬度如何影响肠道干细胞的命运和功能。 | 提出了组织硬度对肠道干细胞的干性和分化路径的显著调节作用。 | 没有提及具体的样本量和详细的实验条件。 | 旨在确定组织硬度对肠道干细胞的影响及其在炎症性肠病中的作用。 | 研究对象为肠道干细胞及其分化后代。 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 肠道组织样本 | 小鼠结肠模型和人类IBD样本 |
| 74 | 2024-08-05 |
Multi-omics identification of an immunogenic cell death-related signature for clear cell renal cell carcinoma in the context of 3P medicine and based on a 101-combination machine learning computational framework
2023-Jun, The EPMA journal
DOI:10.1007/s13167-023-00327-3
PMID:37275552
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研究论文 | 该研究构建了一个与免疫性细胞死亡相关的签名，以预测透明细胞肾细胞癌的预后 | 创新点在于开发了一个包含10种机器学习算法及其101种组合的共识免疫性细胞死亡相关签名 | 研究的局限性在于没有提及样本的多样性和外部验证集的详细信息 | 研究的目的在于建立有效的预后生物标志物以支持个体化医疗 | 研究对象为透明细胞肾细胞癌患者及其免疫相关基因 | 数字病理学 | 肾癌 | qRT-PCR | 机器学习 | 基因组、单细胞转录组、散装转录组数据 | 涉及的样本数量和类型未具体说明 |
| 75 | 2024-08-05 |
SCUBE2 mediates bone metastasis of luminal breast cancer by modulating immune-suppressive osteoblastic niches
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00810-6
PMID:37142671
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研究论文 | 本文展示了ER调控的分泌蛋白SCUBE2如何促进乳腺癌的骨转移。 | 揭示了SCUBE2通过调节免疫抑制性成骨细胞微环境，促进乳腺癌骨转移的机制。 | 该研究可能未能涵盖所有乳腺癌亚型的骨转移机制。 | 探讨ER阳性乳腺癌骨转移的特异机制及其潜在的治疗方法。 | 聚焦于ER阳性乳腺癌及其在骨转移中的行为。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 肿瘤细胞数据 | 多个转移模型 |
| 76 | 2024-08-05 |
Involucrin Modulates Vitamin D Receptor Activity in the Epidermis
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.12.009
PMID:36642403
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研究论文 | 这篇文章研究了角质形成细胞中的involucrin如何调节维生素D受体的活性 | 研究揭示了involucrin在皮肤中对维生素D受体活性产生积极影响的功能角色 | 研究的功能意义尚不清楚 | 探讨involucrin如何在表皮中调节维生素D受体的功能 | 使用Ivl小鼠和野生型小鼠研究维生素D受体活性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，16S细菌分型 | NA | 基因组数据 | 使用Ivl和野生型小鼠进行的研究 |
| 77 | 2024-08-05 |
Systematic dissection of coordinated stromal remodeling identifies Sox10+ glial cells as a therapeutic target in myelofibrosis
2023-06-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2023.05.002
PMID:37267917
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研究论文 | 该文章系统性地分析了骨髓微环境的重塑，识别出Sox10+神经胶质细胞作为骨髓纤维化的治疗靶点 | 研究首次确定骨髓内Sox10+神经胶质细胞在骨髓纤维化中的重要作用，并提出它们作为潜在的治疗靶点 | 研究未能深入探讨小胶质细胞在纤维化过程中具体的分子机制 | 探索骨髓微环境重塑在纤维化病理中的作用 | 以小鼠模型为研究对象，分析其骶髓细胞的来源和功能 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞 | 多个小鼠模型的多样本 |
| 78 | 2024-08-05 |
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
2023-06-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000116
PMID:36913357
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研究论文 | 本研究描述了在新月体肾小管炎中细胞毒性T细胞的转录和克隆特征。 | 本文首次揭示了新月体肾小管炎中克隆扩展的细胞毒性T细胞的致病功能，确定了GzmB作为潜在的治疗靶点。 | 该研究主要集中于T细胞的功能特征，可能未全面了解其他免疫细胞在新月体肾小管炎中的作用。 | 阐明新月体肾小管炎中T细胞的浸润及其对肾损伤的影响。 | 研究对象包括ANCA相关新月体肾小管炎患者及实验性新月体肾小管炎小鼠模型中的T细胞。 | 数字病理学 | 免疫介导的肾病 | 单细胞RNA测序和单细胞T细胞受体测序 | NA | 组织样本 | 来自ANCA相关新月体肾小管炎患者的肾活检和血液样本，以及实验性小鼠的样本 |
| 79 | 2024-08-04 |
Genetic control of the dynamic transcriptional response to immune stimuli and glucocorticoids at single-cell resolution
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.276765.122
PMID:37442575
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA-seq研究了激活的外周血单核细胞对糖皮质激素的转录响应动态 | 提出了新的基于对角线线性判别分析的基因表达响应动态测量方法 | 样本只来自96名非裔美国儿童，可能限制结果的普遍性 | 旨在探索免疫刺激和糖皮质激素对转录响应的遗传控制 | 研究对象为来自96名非裔美国儿童的外周血单核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 96名非裔美国儿童的单细胞样本 |
| 80 | 2024-08-04 |
Concerted epithelial and stromal changes during progression of Barrett's Esophagus to invasive adenocarcinoma exposed by multi-scale, multi-omics analysis
2023-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.08.544265
PMID:37333362
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研究论文 | 本研究通过多规模、多组学分析揭示了巴雷特食管进展为侵袭性腺癌过程中的上皮和基质的变化 | 整合单细胞转录组学、细胞外基质蛋白组学等多个组学的分析，揭示了肿瘤进程的共享特征和患者特异特征 | 该研究样本数量相对较少，且仅限于特定患者的病理进程 | 探讨巴雷特食管向侵袭性腺癌进展中的生物学变化 | 分析来自12名患者的64个样本，研究其从鳞状上皮到腺癌的发展路径 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞转录组学，细胞外基质蛋白组学，组织力学，空间蛋白组学 | NA | 样本 | 64个样本来自12名患者 |