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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-07 |
Generation and Functional Analysis of Defective Viral Genomes during SARS-CoV-2 Infection
2023-06-27, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00250-23
PMID:37074178
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研究论文 | 本研究阐明了SARS-CoV-2感染过程中缺陷病毒基因组的生成机制及其与宿主抗病毒免疫反应的关系 | 首次发现SARS-CoV-2缺陷病毒基因组与持续性病毒感染相关,并识别了四个基因组重组热点区域 | 缺陷病毒基因组生成的具体分子机制仍需进一步研究 | 探究SARS-CoV-2缺陷病毒基因组的生成机制和免疫功能 | SARS-CoV-2病毒和COVID-19患者样本 | 病毒学 | COVID-19 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 二代测序 | NA | 转录组测序数据 | COVID-19患者感染样本和尸检肺组织 | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-07 |
Sex specific molecular networks and key drivers of Alzheimer's disease
2023-06-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00624-5
PMID:37340466
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研究论文 | 通过系统生物学方法研究阿尔茨海默病中性别特异性分子网络和关键驱动因子 | 首次通过多组学网络分析识别LRP10作为AD性别差异的关键网络调节因子,并验证其在性别和APOE基因型特异性中的作用机制 | 研究主要基于死后脑组织样本,可能无法完全反映疾病发展过程中的动态变化 | 阐明阿尔茨海默病性别差异的分子机制 | 人类死后脑组织样本和AD小鼠模型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 转录组学、单细胞RNA测序、酵母双杂交系统、基因扰动实验 | 网络分析、共表达网络 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 两个队列(MSBB和ROSMAP)的大规模人类死后脑样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2024-12-11 |
Pharmacologic targeting of Nedd8-activating enzyme reinvigorates T-cell responses in lymphoid neoplasia
2023-06, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-023-01889-x
PMID:37031300
|
研究论文 | 本文研究了Nedd8激活酶(NAE)抑制剂pevonedistat在淋巴瘤中的治疗作用,特别是其对CD8 T细胞反应的重新激活 | 首次展示了NAE抑制剂pevonedistat能够直接作用于CD8 T细胞,增强其细胞毒性和细胞因子表达,并在淋巴瘤模型中延缓肿瘤进展 | 研究主要集中在体外实验和小鼠模型,尚未在临床试验中验证其效果 | 探讨NAE抑制剂在淋巴瘤治疗中的潜在作用及其对T细胞反应的影响 | CD8 T细胞、淋巴瘤模型、淋巴瘤患者 | NA | 淋巴瘤 | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 64 | 2024-12-09 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-Jun-07, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37285176
|
研究论文 | 研究探讨了癌症相关成纤维细胞(CAF)在不同免疫微环境中的适应性变化及其对T细胞浸润的影响 | 首次揭示了CAF在T细胞介导下可以转变为促进免疫的表型,通过调节CXCL12和CXCL9的表达来影响T细胞的浸润 | 研究主要在体外和小鼠模型中进行,需要进一步的临床验证 | 探讨CAF在不同免疫微环境中的适应性及其对免疫反应的影响 | 癌症相关成纤维细胞(CAF)和T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠胰腺腺癌中的CAF样本 | NA | NA | NA | NA |
| 65 | 2024-11-25 |
Temporal regulation of neural diversity in Drosophila and vertebrates
2023-06, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2022.05.011
PMID:35623984
|
综述 | 本文综述了果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 本文通过比较果蝇和脊椎动物的脑发育程序,揭示了神经多样性生成中的时间模式机制的共性 | NA | 探讨果蝇和脊椎动物神经多样性的时间调控机制 | 果蝇和脊椎动物的神经多样性生成 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | 大量单细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 66 | 2024-11-17 |
Recording morphogen signals reveals origins of gastruloid symmetry breaking
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543474
PMID:37333235
|
研究论文 | 研究使用合成基因电路追踪早期细胞内信号如何预测干细胞类胚体中细胞的未来前后位置 | 首次揭示了Wnt信号从均匀状态演变为极化状态的关键6小时时间窗口,并发现早期TGF信号的异质性预测了前后位置并调节Wnt信号 | NA | 探究干细胞类胚体如何打破对称性以可重复地定义单一前后轴 | 干细胞类胚体中的前后轴形成机制 | 发育生物学 | NA | 合成基因电路、单细胞RNA测序、活体成像 | NA | 信号数据、细胞位置数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 67 | 2024-11-09 |
Characterization of cell-type specific circular RNAs associated with colorectal cancer metastasis
2023-Jun, NAR cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/narcan/zcad021
PMID:37213253
|
研究论文 | 研究了与结直肠癌转移相关的细胞类型特异性环状RNA | 首次系统地研究了结直肠癌转移过程中细胞类型特异性环状RNA的表达和功能 | 研究样本量有限,且仅限于结直肠癌患者 | 探讨环状RNA在结直肠癌转移中的作用及其细胞类型特异性 | 结直肠癌患者的正常、原发和转移样本以及结直肠癌细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序 | 非负最小二乘统计模型 | RNA | 30个匹配的正常、原发和转移样本,14名结直肠癌转移患者,5个结直肠癌细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 68 | 2024-11-07 |
SOX9 Modulates the Transformation of Gastric Stem Cells Through Biased Symmetric Cell Division
2023-06, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2023.01.037
PMID:36740200
|
研究论文 | 研究探讨了SOX9基因在胃干细胞通过偏向性对称细胞分裂进行恶性转化中的作用 | 提出了SOX9+SOX2+细胞在胃癌发生中的重要作用,并开发了一种新的鼠模型来研究这一过程 | 研究主要基于鼠模型和胃癌患者样本,可能无法完全反映人类胃癌的复杂性 | 研究胃干细胞在胃癌发生初期的行为,并探讨SOX9基因在这一过程中的作用 | 胃干细胞和胃癌 | NA | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫染色、CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 组织样本 | 鼠模型和胃癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 69 | 2024-10-05 |
Spatiotemporal single-cell transcriptomic profiling reveals inflammatory cell states in a mouse model of diffuse alveolar damage
2023-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20220171
PMID:37933384
|
研究论文 | 本文通过结合单细胞和空间转录组学技术,系统分析了在小鼠弥漫性肺泡损伤模型中,由蓖麻毒素气溶胶吸入引起的嗜中性粒细胞炎症的细胞状态 | 本文揭示了稳态下的成纤维细胞向超炎症状态的转变,并发现激活的成纤维细胞与嗜中性粒细胞之间的CXCL1-CXCR2趋化因子轴在进一步招募嗜中性粒细胞中的作用 | NA | 研究弥漫性肺泡损伤过程中炎症细胞状态的变化 | 小鼠弥漫性肺泡损伤模型中的炎症细胞状态 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 70 | 2024-10-01 |
Effects of 3-HAA on HCC by Regulating the Heterogeneous Macrophages-A scRNA-Seq Analysis
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202207074
PMID:37013458
|
研究论文 | 研究3-HAA对肝细胞癌(HCC)的免疫调节作用及其对异质性巨噬细胞的影响 | 首次通过scRNA-Seq分析揭示了3-HAA在HCC中的免疫调节作用及其对巨噬细胞亚群的影响 | 研究仅限于实验模型,尚未在临床环境中验证 | 探讨3-HAA在肝细胞癌中的免疫调节作用 | 3-HAA对HCC模型中巨噬细胞亚群的影响 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及HCC模型的多个细胞亚群 | NA | NA | NA | NA |
| 71 | 2024-09-30 |
Spatial Transcriptomics: Technical Aspects of Recent Developments and Their Applications in Neuroscience and Cancer Research
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206939
PMID:37026425
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综述 | 本文综述了空间转录组学的最新进展及其在神经科学和癌症研究中的应用 | 空间转录组学从传统生物学研究转向“原位”生物学,提供了转录组规模的空间信息 | NA | 探讨空间转录组学的技术进展及其在生物医学领域的应用 | 空间转录组学技术及其在神经科学和癌症研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2024-09-23 |
Inferring Cell-Cell Communications from Spatially Resolved Transcriptomics Data Using a Bayesian Tweedie Model
2023-06-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14071368
PMID:37510272
|
研究论文 | 提出了一种基于贝叶斯Tweedie模型的方法,用于从空间分辨转录组数据中推断细胞间通信 | 提出了BATCOM方法,通过广义线性回归模型估计细胞类型间的通信分数,并考虑了它们之间的距离,提供了通信方向和配体受体相互作用的信息 | NA | 推断细胞间通信并理解生物机制 | 细胞间通信 | 生物信息学 | NA | 空间分辨转录组学 | 贝叶斯Tweedie模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 73 | 2024-09-23 |
Self-formation of concentric zones of telencephalic and ocular tissues and directional retinal ganglion cell axons
2023-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.22.533827
PMID:36993285
|
研究论文 | 研究报告了人类端脑-眼类器官的自发形成,这些类器官包含沿着中心-周边轴排列的端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | 首次展示了人类端脑-眼类器官的自发形成,并揭示了视网膜神经节细胞轴突定向生长的机制 | NA | 探讨端脑和眼组织在人类中的协调发育,以及视网膜神经节细胞轴突的定向生长 | 人类端脑、视神经、视盘和神经视网膜组织 | NA | 青光眼 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 74 | 2024-09-23 |
Reciprocal interactions between alveolar progenitor dysfunction and aging promote lung fibrosis
2023-06-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85415
PMID:37314162
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研究论文 | 研究探讨了衰老和肺泡祖细胞功能障碍之间的相互作用如何促进肺纤维化 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示了衰老和肺损伤对肺泡上皮细胞基因表达程序的协同影响,并发现了与肺纤维化相关的基因表达特征 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者样本,可能无法完全反映人类肺纤维化的复杂性 | 探讨衰老和肺泡祖细胞功能障碍在肺纤维化中的作用机制 | 肺泡上皮细胞(AEC2s)及其在衰老和肺损伤中的基因表达变化 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的肺组织样本,IPF患者和健康捐赠者的肺组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 75 | 2024-09-23 |
RETROFIT: Reference-free deconvolution of cell-type mixtures in spatial transcriptomics
2023-Jun-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.07.544126
PMID:37333291
|
研究论文 | 提出了一种名为RETROFIT的无参考贝叶斯方法,用于空间转录组学数据中细胞类型的去卷积 | RETROFIT无需单细胞转录组参考数据,能够生成稀疏且可解释的解决方案,独立于单细胞转录组参考数据进行细胞类型去卷积 | NA | 开发一种无需参考数据的空间转录组学数据细胞类型去卷积方法 | 空间转录组学数据中的细胞类型 | 空间转录组学 | NA | 贝叶斯方法 | NA | 转录组数据 | 合成数据和真实数据,包括Slide-seq和Visium平台的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 76 | 2024-09-23 |
Interleukin-21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T Cell-associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2023-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.02.543518
PMID:37333332
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研究论文 | 研究IL-21在慢性肠道炎症中驱动CD4+ T细胞相关病原性和高代谢状态的作用 | 首次揭示了IL-21通过影响线粒体-内质网接触位点,导致Treg细胞代谢功能障碍,从而加剧炎症反应 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,尚未在人体内验证 | 探讨细胞代谢在Treg细胞相关肠道稳态中的作用 | Treg细胞在慢性肠道炎症中的代谢功能 | NA | 肠道炎症 | 电子显微镜、共聚焦成像、近端连接分析、免疫印迹、质谱流式细胞术、流式细胞术、代谢组学、基因表达分析、实时代谢分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用了克罗恩病患者的单细胞RNA测序数据和基因修饰的Treg细胞在小鼠结肠炎模型中的应用 | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2024-09-23 |
CAR T-cell design dependent remodeling of the brain tumor immune microenvironment identify macrophages as key players that inhibit or promote anti-tumor activity
2023-Jun-06, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2972427/v1
PMID:37333156
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研究论文 | 研究了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响,并识别出巨噬细胞在抑制或促进抗肿瘤活性中的关键作用 | 首次探讨了CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响,并揭示了巨噬细胞在抗肿瘤反应中的双重作用 | 研究仅限于特定的B7-H3 CAR T细胞和免疫功能正常的胶质瘤模型 | 探讨CAR T细胞设计对脑肿瘤免疫微环境的影响,以开发更有效的T细胞免疫疗法 | B7-H3特异性CAR T细胞及其在胶质瘤模型中的抗肿瘤活性 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 六个不同设计的B7-H3 CAR T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 78 | 2024-09-23 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway
2023-Jun-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543353
PMID:37333273
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研究论文 | 本文探讨了ENPP1作为抗癌cGAMP-STING通路的固有免疫检查点的机制 | 发现ENPP1通过抑制cGAMP-STING介导的抗肿瘤免疫和激活免疫抑制性eADO信号来促进乳腺癌的生长和转移 | NA | 研究ENPP1在乳腺癌中的作用及其作为免疫检查点的机制 | ENPP1在乳腺癌中的表达及其对cGAMP-STING通路的影响 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 乳腺癌患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2024-09-23 |
Efficient and accurate KIR and HLA genotyping with massively parallel sequencing data
2023-06, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.277585.122
PMID:37169596
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研究论文 | 本文介绍了一种名为T1K的新型计算方法,用于从RNA-seq、全基因组测序或全外显子测序数据中高效准确地推断KIR和HLA等位基因 | T1K方法能够联合考虑所有基因型的等位基因,可靠地识别存在的基因并区分同源基因,包括具有挑战性的基因。此外,T1K还能调用新的单核苷酸变异并处理单细胞数据 | NA | 开发一种高效准确的计算方法,用于从大规模并行测序数据中进行KIR和HLA基因分型 | KIR基因和HLA基因 | 基因组学 | NA | 大规模并行测序 | T1K | RNA-seq、全基因组测序、全外显子测序 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 80 | 2024-09-23 |
The expanding vistas of spatial transcriptomics
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01448-2
PMID:36192637
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研究论文 | 本文探讨了空间转录组学技术的发展及其在组织细胞类型结构、细胞间相互作用和组织成分间分子相互作用研究中的应用 | 介绍了空间转录组学技术的新进展,包括其在敏感性、多重性和通量方面的快速提升 | NA | 探讨空间转录组学技术的发展及其在生物学研究中的应用 | 组织中的基因表达及其在细胞类型结构、细胞间相互作用和分子相互作用中的作用 | 基因组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |