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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
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研究论文 | 本研究揭示了髓鞘功能障碍通过影响淀粉样前体蛋白加工和分散斑块清除小胶质细胞来驱动阿尔茨海默病模型中β-淀粉样蛋白沉积的机制 | 首次发现髓鞘功能障碍是阿尔茨海默病β-淀粉样蛋白沉积的上游风险因素,并揭示了其通过分散斑块清除小胶质细胞的新型机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究年龄相关髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | 小鼠疾病模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
CIARA: a cluster-independent algorithm for identifying markers of rare cell types from single-cell sequencing data
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201264
PMID:37294170
|
研究论文 | 开发了一种名为CIARA的聚类独立算法,用于从单细胞测序数据中识别稀有细胞类型的标记基因 | 提出不依赖聚类的方法直接识别稀有细胞类型标记基因,可应用于多种单细胞组学数据类型 | NA | 开发识别稀有细胞类型标记基因的计算工具 | 单细胞测序数据中的稀有细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | CIARA算法 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
Transcriptional changes in specific subsets of Drosophila neurons following inhibition of the serotonin transporter
2023-06-24, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-023-02521-3
PMID:37355701
|
研究论文 | 本研究通过RNA测序分析果蝇蘑菇体神经元在血清素转运蛋白抑制后的转录组变化 | 首次在果蝇特定神经元亚型中系统分析血清素转运蛋白抑制的转录效应,并比较发育期与成年期的差异 | 蘑菇体神经元转录组变化有限,且一个突变等位基因导致显著的人工表达变化 | 探究血清素转运蛋白抑制对特定神经元亚型转录组的影响 | 果蝇蘑菇体中的Kenyon细胞 | 神经科学 | NA | 荧光激活细胞分选,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 果蝇Kenyon细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-06 |
Leveraging single-cell RNA sequencing to unravel the impact of aging on stroke recovery mechanisms in mice
2023-06-20, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2300012120
PMID:37307473
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老如何通过影响微glia/巨噬细胞与内皮细胞/少突胶质前体细胞间的相互作用来损害中风后脑修复机制 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老对中风后脑修复机制的影响,并证明年轻来源的MG/MΦ移植可部分恢复老年小鼠的脑修复功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证;机制研究仍需要进一步深入 | 探究衰老对中风后脑组织修复机制的影响 | 年轻和老年小鼠的中风后脑组织 | 单细胞转录组学 | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠在急性期(3天)和慢性期(14天)的中风后脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2025-10-06 |
Ubiquitin Ligases Siah1a/2 Control Alveolar Macrophage Functions to Limit Carcinogen-Induced Lung Adenocarcinoma
2023-06-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-0258
PMID:37078793
|
研究论文 | 本研究揭示泛素连接酶Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞功能抑制致癌物诱导的肺腺癌发生 | 首次发现Siah1a/2通过调控肺泡巨噬细胞成熟状态和促纤维化基因特征影响肺腺癌发展 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩展 | 探究Siah1a/2在肺泡巨噬细胞功能调控及肺腺癌发生中的作用机制 | 肺泡巨噬细胞、肺腺癌小鼠模型、LUAD患者样本 | 癌症免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、基因敲除 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 野生型小鼠、基因敲除小鼠、LUAD患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sexual diversity in the human bladder and its prospective impacts on bladder cancer and urinary tract infection
2023-06-05, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-023-01535-6
PMID:37277784
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类膀胱中的性别差异及其对膀胱癌和尿路感染的潜在影响 | 首次在单细胞水平系统揭示人类膀胱中不同细胞类型的性别特异性基因表达差异 | 基于已发表的单细胞RNA测序数据进行分析,样本来源和数量可能有限 | 探究膀胱相关疾病中性别差异的分子机制 | 人类正常膀胱组织细胞 | 单细胞转录组学 | 膀胱癌,尿路感染 | 单细胞RNA测序 | Monocle2, scMetabolism, SCENIC | 单细胞转录组数据 | 27,437个细胞通过严格质量控制 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-06 |
Cell-type annotation with accurate unseen cell-type identification using multiple references
2023-06, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1011261
PMID:37379341
|
研究论文 | 提出一种基于多参考数据的单细胞RNA测序数据自动注释方法mtANN,能够准确识别未见过的细胞类型 | 整合深度学习和集成学习提高预测准确性,引入考虑三个互补方面的新指标来区分未见细胞类型和共享细胞类型,并提供自适应阈值选择方法 | NA | 开发能够自动注释单细胞RNA测序数据并准确识别未见细胞类型的新方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | 深度学习, 集成学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-10-06 |
Analysis of immunogenic cell death in atherosclerosis based on scRNA-seq and bulk RNA-seq data
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110130
PMID:37075670
|
研究论文 | 基于单细胞和批量RNA测序数据分析动脉粥样硬化中的免疫原性细胞死亡 | 首次在动脉粥样硬化中系统研究免疫原性细胞死亡的作用机制,并识别出8个关键基因作为潜在药物靶点 | 研究数据均来自公共数据库,缺乏实验验证 | 探究免疫原性细胞死亡在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 颈动脉粥样硬化斑块细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, KEGG富集分析, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA, 随机森林 | 随机森林, 共识聚类分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-10-06 |
Integration of whole transcriptome spatial profiling with protein markers
2023-06, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-022-01536-3
PMID:36593397
|
研究论文 | 开发了一种名为SPOTS的高通量空间转录组和蛋白质组同步分析技术 | 首次实现了空间转录组和蛋白质组的实验性整合,显著提高了信号分辨率和细胞聚类能力 | NA | 开发能够同时分析空间转录组和蛋白质组的技术方法 | 组织区域中的基因表达和蛋白质分布 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序, 蛋白质组分析 | NA | 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | SPOTS | Spatial PrOtein and Transcriptome Sequencing (SPOTS) 高通量同步空间转录组和蛋白质分析平台 |
| 50 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of human nasal mucosal IgE antibody secreting cells reveals a newly minted phenotype
2023-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2023.02.008
PMID:36931600
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类鼻黏膜IgE抗体分泌细胞,揭示其新近形成的表型特征 | 首次在过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻息肉中发现IgE抗体分泌细胞具有早期新生浆细胞表型特征 | 样本量较小(n=3),仅针对鼻息肉组织进行研究 | 探究过敏性真菌性鼻窦炎患者鼻黏膜中IgE抗体分泌细胞的表型和功能特征 | 过敏性真菌性鼻窦炎患者的鼻息肉组织 | 单细胞组学 | 过敏性真菌性鼻窦炎 | 单细胞RNA测序,Ig基因谱系分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者鼻息肉样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示甲状腺癌向间变性癌转化的细胞谱系和命运转变过程 | 首次在单细胞水平解析甲状腺癌间变性转化的连续谱系,识别了二倍体和异倍体两个关键转化阶段 | 样本量有限,转化机制需要进一步功能验证 | 探究甲状腺癌向间变性癌转化的细胞分子机制 | 不同亚型甲状腺癌患者样本 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-06 |
p38MAPKα Stromal Reprogramming Sensitizes Metastatic Breast Cancer to Immunotherapy
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0907
PMID:36883955
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研究论文 | 本研究揭示p38MAPKα抑制剂通过重编程转移性肿瘤微环境增强乳腺癌对免疫疗法的敏感性 | 发现p38MAPKα抑制与OX40激动剂联合使用的协同抗转移效应,并建立p38i转移基质特征与患者预后的关联 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对转移性乳腺癌的有效免疫治疗策略 | 转移性乳腺癌肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,基质标记方法 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-06 |
Variant STAT4 and Response to Ruxolitinib in an Autoinflammatory Syndrome
2023-06-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2202318
PMID:37256972
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研究论文 | 本研究通过基因测序发现STAT4基因功能获得性变异导致致残性全硬化性硬斑病,并证实JAK抑制剂鲁索替尼可改善该疾病的炎症表型 | 首次发现STAT4基因功能获得性变异与致残性全硬化性硬斑病的因果关系,并证明JAK抑制剂对该疾病的治疗潜力 | 研究样本量较小(仅4名患者),需要更大规模研究验证 | 探究致残性全硬化性硬斑病的遗传病因和潜在治疗方法 | 来自3个无亲缘关系家庭的4名致残性全硬化性硬斑病患者 | 医学遗传学 | 自身炎症性疾病 | 基因组测序, 单细胞RNA测序, 体外细胞功能实验 | NA | 基因组数据, 基因表达数据, 临床数据 | 4名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-06 |
Endoplasmic reticulum in oocytes: spatiotemporal distribution and function
2023-Jun, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-023-02782-3
PMID:37171741
|
综述 | 本文系统综述了内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能、结构、时空分布及其与其他细胞器的相互作用 | 结合单细胞RNA测序技术解析内质网机制,并将内质网功能与体外成熟临床问题相联系 | NA | 总结内质网在哺乳动物卵母细胞中的功能和作用机制,为辅助生殖技术研究提供参考 | 哺乳动物卵母细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-06 |
Single-cell landscape analysis unravels molecular programming of the human B cell compartment in chronic GVHD
2023-06-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169732
PMID:37129971
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示人类B细胞在慢性移植物抗宿主病中的分子编程机制 | 首次在人类异基因造血干细胞移植背景下对B细胞进行大规模单细胞转录组分析,发现慢性GVHD中记忆B细胞区室的显著转录差异和潜在致病性非典型B细胞的扩增 | 样本来源仅限于异基因造血干细胞移植患者,未涉及其他自身免疫疾病模型 | 理解异基因造血干细胞移植背景下B细胞的分子编程机制及其在慢性移植物抗宿主病发病中的作用 | 异基因造血干细胞移植患者的纯化B细胞 | 单细胞生物学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 来自患者的大量纯化B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2025-10-06 |
Glutamine antagonist DRP-104 suppresses tumor growth and enhances response to checkpoint blockade in KEAP1 mutant lung cancer
2023-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.27.546750
PMID:37425844
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研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺拮抗剂DRP-104在KEAP1突变肺癌中的抗肿瘤效果及其与免疫检查点抑制剂的协同作用 | 首次发现DRP-104通过抑制谷氨酰胺依赖性核苷酸合成和逆转T细胞耗竭来增强抗PD1疗法反应 | 临床前研究阶段,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对KEAP1突变肺癌的靶向治疗策略 | KEAP1突变肺癌模型 | 癌症治疗 | 肺癌 | 多模式单细胞测序,功能分析 | NA | 测序数据,功能实验数据 | 患者来源异种移植模型和抗原性原位肺癌模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-06 |
Elevated levels of MMP12 sourced from macrophages are associated with poor prognosis in urothelial bladder cancer
2023-Jun-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-023-11100-0
PMID:37391708
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析,发现巨噬细胞来源的MMP12是膀胱尿路上皮癌预后不良的独立生物标志物 | 首次发现巨噬细胞来源的MMP12可作为膀胱癌独立预后标志物,并揭示了肿瘤微环境中免疫细胞来源生物标志物的重要性 | 转录组微阵列数据集未能验证MMP12的预后价值,组织活检材料可能存在肿瘤细胞生物标志物选择偏倚 | 探索膀胱尿路上皮癌患者分层生物标志物,改善风险分层和临床干预策略 | 90例新诊断未治疗的膀胱癌患者,包括血浆和尿液样本,以及公共单细胞RNA测序和微阵列数据 | 癌症生物标志物研究 | 膀胱癌 | 多重邻近延伸分析,单细胞RNA测序,微阵列分析,随机森林生存分析,多变量回归分析 | 随机森林,多变量回归模型 | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 90例患者(血浆样本n=90,尿液样本n=40),外加公共数据库验证队列 | OLINK | 多重邻近延伸分析,单细胞RNA测序,微阵列 | NA | 免疫肿瘤学聚焦的多重邻近延伸分析 |
| 58 | 2025-10-06 |
Lineage skewing and genome instability underlie marrow failure in a zebrafish model of GATA2 deficiency
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112571
PMID:37256751
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研究论文 | 通过斑马鱼GATA2缺陷模型研究骨髓衰竭的机制基础 | 首次在斑马鱼模型中揭示GATA2缺陷通过谱系偏斜和基因组不稳定性导致骨髓衰竭的机制 | 研究局限于斑马鱼模型,尚未在人类系统中验证 | 探究GATA2缺陷导致骨髓衰竭的分子机制 | 斑马鱼gata2a突变体模型 | 发育生物学 | 骨髓衰竭 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析 | 动物模型 | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 斑马鱼造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-06 |
Age-associated B cells predict impaired humoral immunity after COVID-19 vaccination in patients receiving immune checkpoint blockade
2023-06-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-38810-0
PMID:37369658
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研究论文 | 本研究探讨年龄相关B细胞(ABC)对不同人群COVID-19疫苗免疫应答的影响 | 首次发现不同病因ABC具有共同转录特征,并揭示其通过FcγRIIB受体和免疫复合物结合能力影响疫苗应答的机制 | 研究样本来源和规模有限,需要更大规模验证ABC作为生物标志物的可靠性 | 探究ABC对COVID-19疫苗体液免疫应答的影响机制 | 接受免疫检查点阻断治疗的癌症患者和先天性免疫缺陷患者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112599
PMID:37279110
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研究论文 | 本研究开发了一种异源初免-加强疫苗接种策略,通过静脉注射促进肿瘤消退 | 发现静脉注射黑猩猩腺病毒载体疫苗可产生比肌肉注射更强的CD8 T细胞反应,并首次证明编码无关抗原的静脉加强疫苗也能介导肿瘤消退 | 研究仅在MC38肿瘤模型中进行,尚未在人类临床试验中验证 | 开发更有效的治疗性新抗原癌症疫苗策略 | 小鼠MC38肿瘤模型 | 免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |