单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 401 - 417 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-08 |
Single-cell Expression Atlas Reveals Cell Heterogeneity in the Creeping Fat of Crohn's Disease
2023-06-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izac266
PMID:36715181
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在爬行脂肪中发现了一种高表达脂蛋白脂肪酶的特定血管内皮细胞亚群，并鉴定了一种新的与炎症相关且与肠道纤维化相关的成纤维细胞亚群FC3 | NA | 揭示克罗恩病中爬行脂肪组织的细胞异质性及其在疾病发展中的作用 | 爬行脂肪组织中的细胞组成及其在克罗恩病进展中的潜在机制 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 67,064个细胞来自3对手术切除的爬行脂肪组织及其未受累的肠系膜脂肪组织样本，以及6对肠系膜脂肪组织样本通过免疫荧光验证 | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-08 |
Clonal Kinetics and Single-Cell Transcriptional Profiles of T Cells Mobilized to Blood by Acute Exercise
2023-06-01, Medicine and science in sports and exercise
DOI:10.1249/MSS.0000000000003130
PMID:36719647
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研究论文 | 研究急性运动如何影响血液中T细胞的克隆动力学和单细胞转录组特征 | 首次揭示急性运动通过优先动员最主要的克隆群，促进寡克隆T细胞受体谱，并发现这些克隆对已知病毒抗原具有特异性，并显示出细胞毒性、激活和凋亡相关基因的不同表达 | NA | 探究急性运动对T细胞受体谱和转录组变化的影响 | 健康志愿者的外周血单个核细胞 | NA | NA | 深度TCR-β链测序和串联单细胞RNA测序 | NA | DNA和RNA | 健康志愿者完成分级自行车运动实验，采集静息、运动中和运动后1小时的外周血单个核细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2024-08-05 |
Metabolic heterogeneity in early-stage lung adenocarcinoma revealed by RNA-seq and scRNA-seq
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03082-z
PMID:36692643
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研究论文 | 本研究揭示了早期肺腺癌中的代谢异质性 | 通过RNA-seq和单细胞RNA-seq识别了代谢相关的亚型，为肺腺癌的预后和治疗提供了潜在生物标志物 | 研究主要依赖于TCGA和GEO的数据，可能存在数据源的局限性 | 探讨肺腺癌的代谢重编程及其对预后的影响 | 研究对象为肺腺癌样本，尤其关注其代谢相关的亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因组数据 | TCGA数据集中肺腺癌样本的数量未具体说明 | NA | NA | NA | NA |
| 404 | 2024-08-08 |
Bioinformatic analysis of single-cell RNA sequencing dataset dissects cellular heterogeneity of triple-negative breast cancer in transcriptional profile, splicing event and crosstalk network
2023-Jun, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-023-03083-y
PMID:36692641
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，全面探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）不同亚型上皮细胞的转录组特征、可变剪接事件及上皮与非上皮细胞间的相互作用 | 发现管腔前体亚型表现出最复杂的基因调控网络和剪接事件，并揭示了hnRNPs在管腔前体亚型中对可变剪接事件的负调控作用，以及NOTCH4在TNBC中的关键作用和潜在治疗靶点 | NA | 深入理解三阴性乳腺癌的细胞异质性及其调控网络 | 三阴性乳腺癌（TNBC）的细胞异质性及其调控网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 405 | 2024-08-05 |
Endosialin-positive tumor-derived pericytes promote tumor progression through impeding the infiltration of CD8+ T cells in clear cell renal cell carcinoma
2023-Jun, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-023-03372-z
PMID:36646951
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研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞阳性肿瘤来源的周细胞如何通过阻碍CD8+ T细胞的浸润来促进透明细胞肾癌的肿瘤进展 | 本研究首次识别了与肿瘤进展相关的肿瘤来源的周细胞标志物，并提出了通过针对周细胞的策略来增强免疫检查点阻断治疗的有效性 | 未提及研究的局限性 | 旨在识别促进肿瘤的周细胞标志物并开发针对这些周细胞的策略，以提高对透明细胞肾癌的免疫检查点阻断治疗的效果 | 研究对象为透明细胞肾癌中的肿瘤来源的周细胞及其中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 透明细胞肾癌 | RNA测序 | 流式细胞术 | 基因组数据 | ccRCC肿瘤样本和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 406 | 2024-08-05 |
Clinical Significance of Signal Regulatory Protein Alpha (SIRPα) Expression in Hepatocellular Carcinoma
2023-Jun, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-022-13058-y
PMID:36641515
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研究论文 | 该研究旨在阐明信号调节蛋白α（SIRPα）在肝细胞癌中的临床意义 | 研究展示了SIRPα的高表达与肝细胞癌患者的预后不良相关，揭示了其作为潜在免疫检查点因子的作用 | 本文未提及具体的样本选择过程和潜在的影响因素 | 明确SIRPα在肝细胞癌中的临床重要性和作用机制 | 分析372例HCC组织样本的SIRPα表达 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、免疫组化染色 | NA | 组织样本 | 372例HCC组织和189名HCC患者 | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2024-08-08 |
Genetic landscape and immune mechanism of monocytes associated with the progression of acute-on-chronic liver failure
2023-Jun, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-022-10472-y
PMID:36626090
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研究论文 | 研究探讨了与急性慢性肝衰竭（ACLF）进展相关的单核细胞亚群及其在炎症反应中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术详细分类了与ACLF进展相关的单核细胞亚群，并揭示了其分子标记和信号通路 | NA | 研究ACLF进展中特定单核细胞亚群及其在炎症反应中的作用 | 单核细胞亚群及其在ACLF中的功能 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 17,310个循环单核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 408 | 2024-08-08 |
CD8+ T Cells Trigger Auricular Dermatitis and Blepharitis in Mice after Zika Virus Infection in the Absence of CD4+ T Cells
2023-06, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.11.020
PMID:36566875
|
研究论文 | 本研究使用T细胞缺陷的小鼠模型，展示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发耳部皮炎和眼睑炎的作用 | 首次揭示了在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后引发病理反应的具体机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的病理作用 | 探讨在CD4+ T细胞缺失的情况下，CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的保护和病理作用 | CD8+ T细胞在寨卡病毒感染后的作用机制 | 免疫学 | 病毒性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2024-08-05 |
The second heart field: the first 20 years
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09975-8
PMID:36550326
|
综述 | 本文回顾了第二心场（SHF）在心脏发育中的贡献和信号调控网络 | 文章总结了第二心场研究20年的进展，并提出了单细胞测序和精确谱系追踪的新技术应用 | 需要进一步研究SHF的细胞异质性及其复杂的调控网络和未确定机制 | 探讨第二心场在心脏发育中的作用及其临床应用 | 主要研究对象为第二心场及其在心脏发育中的作用 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 410 | 2024-08-05 |
Microglial INPP5D limits plaque formation and glial reactivity in the PSAPP mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.12821
PMID:36448627
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研究论文 | 该文章研究了微小胶质细胞中INPP5D基因在阿尔茨海默病小鼠模型中的作用 | 文章揭示了INPP5D的条件性下调如何增加斑块负担及微小胶质细胞的招募，并鉴定了CST7作为新的斑块标记物 | 文章未提及研究的局限性 | 探讨INPP5D在阿尔茨海默病小鼠模型中的功能与影响 | 使用APPKM670/671NL /PSEN1Δexon9（PSAPP）小鼠模型和Inpp5d基因敲除小鼠进行研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | PSAPP小鼠 | 组织样本 | 实验涉及3个月大和6个月大小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 411 | 2024-08-05 |
Comparative single-cell analysis of the adult heart and coronary vasculature
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09968-7
PMID:36401619
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研究论文 | 本文使用单细胞转录组学方法探讨了脊椎动物心脏和冠状血管的差异 | 整合不同物种的多种数据集，识别心脏的种特异性差异和相似性 | 数据整合可能受限于原始研究聚焦的组织类型 | 比较脊椎动物心脏的结构和功能差异 | 常见的几种脊椎动物心脏，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个物种的心脏数据集，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2024-08-05 |
Establishment and characterization of adult human gastric epithelial progenitor-like cell lines
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13355
PMID:36331058
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研究论文 | 本研究建立和表征了成人人体胃上皮前体细胞系 | 提出了一种新型的单层细胞培养系统，以克服3D类器官培养的限制 | 目前未提及该培养系统在体内模型中的应用 | 研究成人人体胃上皮前体细胞系的自我更新与分化潜力 | 成人人体胃上皮前体细胞 | 数字病理学 | 胃相关疾病 | 单细胞转录组测序 | 单层细胞培养 | 转录组数据 | 成人人体胃上皮细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 413 | 2024-08-08 |
TiO2 nanoparticles abrogate the protective effect of the Crohn's disease-associated variation within the PTPN22 gene locus
2023-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325911
PMID:36191962
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研究论文 | 研究探讨了二氧化钛（TiO2）纳米颗粒与PTPN22基因变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | 首次揭示了TiO2纳米颗粒能够消除PTPN22基因变异对克罗恩病的保护作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体研究验证 | 探究环境因素与遗传风险变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | PTPN22基因变异的小鼠模型及TiO2纳米颗粒的影响 | NA | 炎症性肠病 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和PTPN22变异小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2024-08-08 |
Flexible copula model for integrating correlated multi-omics data from single-cell experiments
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13701
PMID:35622236
|
研究论文 | 本文提出了一种基于copula的灵活框架，用于整合来自单细胞实验的相关多组学数据，并研究其相关性 | 提出的方法能够独立于边际分布建模协变量依赖的相关结构，并能联合多种单变量边际分布 | NA | 研究多组学数据中不同数据类型之间的关联及其随其他因素（如细胞类型和基因调控元件）的变化 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析、DNA甲基化分析 | copula模型 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2024-08-05 |
Multisource single-cell data integration by MAW barycenter for Gaussian mixture models
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13630
PMID:35220585
|
研究论文 | 提出了一种集成多来源单细胞数据聚类结果的新方法 | 通过最小化聚合Wasserstein距离（MAW）来近似Wasserstein度量并计算GMM的重心，克服了现有方法的局限性 | GMM的重心可能不会是一个包含合理数量成分的GMM | 提升多来源单细胞数据的聚类整合效果 | 来自多个来源的单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | Gaussian mixture models (GMM) | NA | RNA-seq | 多个单细胞RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 416 | 2024-08-08 |
Joint gene network construction by single-cell RNA sequencing data
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13645
PMID:35184277
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据构建联合基因网络的方法JGNsc，该方法在Gaussian图形模型框架下，通过混合插补过程和非参数变换来处理数据稀疏性问题，并构建跨条件的联合基因网络。 | JGNsc方法结合了贝叶斯零膨胀泊松模型和迭代低秩矩阵补全步骤，有效插补由技术伪影引起的零膨胀计数，并通过非参数变换构建联合Gaussian图形模型。 | 文章未明确提及现有方法的局限性。 | 旨在通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以更好地理解人类疾病和性状的潜在遗传结构。 | 研究对象包括髓母细胞瘤和胶质母细胞瘤的临床研究数据。 | 基因组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | Gaussian图形模型 | RNA测序数据 | 文章未明确提及样本数量。 | NA | NA | NA | NA |
| 417 | 2024-08-08 |
A deficient MIF-CD74 signaling pathway may play an important role in immunotherapy-induced hyper-progressive disease
2023-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-021-09672-3
PMID:34797429
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）中的免疫细胞特征 | 首次发现HPD组中CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的富集以及CD74-MIF信号通路的缺失 | 研究仅限于体外实验，需要进一步的临床验证 | 探究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）的生物学机制 | 从健康对照和肿瘤患者的外周血单个核细胞（PBMC）中分离的CD3+细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 健康对照和接受免疫治疗的肿瘤患者的PBMC样本 | NA | NA | NA | NA |