单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 401 - 409 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-05 |
The second heart field: the first 20 years
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09975-8
PMID:36550326
|
综述 | 本文回顾了第二心场（SHF）在心脏发育中的贡献和信号调控网络 | 文章总结了第二心场研究20年的进展，并提出了单细胞测序和精确谱系追踪的新技术应用 | 需要进一步研究SHF的细胞异质性及其复杂的调控网络和未确定机制 | 探讨第二心场在心脏发育中的作用及其临床应用 | 主要研究对象为第二心场及其在心脏发育中的作用 | NA | 先天性心脏病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 402 | 2024-08-05 |
Microglial INPP5D limits plaque formation and glial reactivity in the PSAPP mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.12821
PMID:36448627
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研究论文 | 该文章研究了微小胶质细胞中INPP5D基因在阿尔茨海默病小鼠模型中的作用 | 文章揭示了INPP5D的条件性下调如何增加斑块负担及微小胶质细胞的招募，并鉴定了CST7作为新的斑块标记物 | 文章未提及研究的局限性 | 探讨INPP5D在阿尔茨海默病小鼠模型中的功能与影响 | 使用APPKM670/671NL /PSEN1Δexon9（PSAPP）小鼠模型和Inpp5d基因敲除小鼠进行研究 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | PSAPP小鼠 | 组织样本 | 实验涉及3个月大和6个月大小鼠 |
| 403 | 2024-08-05 |
Comparative single-cell analysis of the adult heart and coronary vasculature
2023-Jun, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-022-09968-7
PMID:36401619
|
研究论文 | 本文使用单细胞转录组学方法探讨了脊椎动物心脏和冠状血管的差异 | 整合不同物种的多种数据集，识别心脏的种特异性差异和相似性 | 数据整合可能受限于原始研究聚焦的组织类型 | 比较脊椎动物心脏的结构和功能差异 | 常见的几种脊椎动物心脏，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个物种的心脏数据集，包括猕猴、小鼠和斑马鱼 |
| 404 | 2024-08-05 |
Establishment and characterization of adult human gastric epithelial progenitor-like cell lines
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13355
PMID:36331058
|
研究论文 | 本研究建立和表征了成人人体胃上皮前体细胞系 | 提出了一种新型的单层细胞培养系统，以克服3D类器官培养的限制 | 目前未提及该培养系统在体内模型中的应用 | 研究成人人体胃上皮前体细胞系的自我更新与分化潜力 | 成人人体胃上皮前体细胞 | 数字病理学 | 胃相关疾病 | 单细胞转录组测序 | 单层细胞培养 | 转录组数据 | 成人人体胃上皮细胞系 |
| 405 | 2024-08-08 |
TiO2 nanoparticles abrogate the protective effect of the Crohn's disease-associated variation within the PTPN22 gene locus
2023-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-325911
PMID:36191962
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研究论文 | 研究探讨了二氧化钛（TiO2）纳米颗粒与PTPN22基因变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | 首次揭示了TiO2纳米颗粒能够消除PTPN22基因变异对克罗恩病的保护作用 | 研究仅在动物模型中进行，需要进一步的人体研究验证 | 探究环境因素与遗传风险变异在炎症性肠病发病机制中的相互作用 | PTPN22基因变异的小鼠模型及TiO2纳米颗粒的影响 | NA | 炎症性肠病 | bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 野生型和PTPN22变异小鼠 |
| 406 | 2024-08-08 |
Flexible copula model for integrating correlated multi-omics data from single-cell experiments
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13701
PMID:35622236
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研究论文 | 本文提出了一种基于copula的灵活框架，用于整合来自单细胞实验的相关多组学数据，并研究其相关性 | 提出的方法能够独立于边际分布建模协变量依赖的相关结构，并能联合多种单变量边际分布 | NA | 研究多组学数据中不同数据类型之间的关联及其随其他因素（如细胞类型和基因调控元件）的变化 | 单细胞RNA测序、染色质可及性和DNA甲基化数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序、染色质可及性分析、DNA甲基化分析 | copula模型 | 多组学数据 | NA |
| 407 | 2024-08-05 |
Multisource single-cell data integration by MAW barycenter for Gaussian mixture models
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13630
PMID:35220585
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研究论文 | 提出了一种集成多来源单细胞数据聚类结果的新方法 | 通过最小化聚合Wasserstein距离（MAW）来近似Wasserstein度量并计算GMM的重心，克服了现有方法的局限性 | GMM的重心可能不会是一个包含合理数量成分的GMM | 提升多来源单细胞数据的聚类整合效果 | 来自多个来源的单细胞RNA-seq数据集 | 机器学习 | NA | Gaussian mixture models (GMM) | NA | RNA-seq | 多个单细胞RNA-seq数据集 |
| 408 | 2024-08-08 |
Joint gene network construction by single-cell RNA sequencing data
2023-06, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13645
PMID:35184277
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研究论文 | 本文提出了一种基于单细胞RNA测序数据构建联合基因网络的方法JGNsc，该方法在Gaussian图形模型框架下，通过混合插补过程和非参数变换来处理数据稀疏性问题，并构建跨条件的联合基因网络。 | JGNsc方法结合了贝叶斯零膨胀泊松模型和迭代低秩矩阵补全步骤，有效插补由技术伪影引起的零膨胀计数，并通过非参数变换构建联合Gaussian图形模型。 | 文章未明确提及现有方法的局限性。 | 旨在通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络，以更好地理解人类疾病和性状的潜在遗传结构。 | 研究对象包括髓母细胞瘤和胶质母细胞瘤的临床研究数据。 | 基因组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | Gaussian图形模型 | RNA测序数据 | 文章未明确提及样本数量。 |
| 409 | 2024-08-08 |
A deficient MIF-CD74 signaling pathway may play an important role in immunotherapy-induced hyper-progressive disease
2023-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-021-09672-3
PMID:34797429
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）中的免疫细胞特征 | 首次发现HPD组中CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的富集以及CD74-MIF信号通路的缺失 | 研究仅限于体外实验，需要进一步的临床验证 | 探究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）的生物学机制 | 从健康对照和肿瘤患者的外周血单个核细胞（PBMC）中分离的CD3+细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 健康对照和接受免疫治疗的肿瘤患者的PBMC样本 |