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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2024-08-08 |
Mural cell composition and functional analysis in the healing process of human gingiva from periodontal intrabony defects
2023-Jun, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 评估人类牙龈组织中壁细胞群的组成和功能 | 识别并确认了两种壁细胞亚群,RGS5+THY1+和ACTA2+MYH11+,并通过单细胞RNA测序和组织学染色进行了验证 | 研究样本仅限于七名牙周炎(Ⅲ期)患者,可能影响结果的普遍性 | 研究牙龈组织愈合过程中壁细胞的组成和功能 | 人类牙龈组织中的壁细胞 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序(10X基因组学) | NA | 基因表达数据 | 七名牙周炎(Ⅲ期)患者 | NA | NA | NA | NA |
| 382 | 2024-08-05 |
Plasticity of Dental Cell Types in Development, Regeneration, and Evolution
2023-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231154800
PMID:36919873
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综述 | 本文讨论了牙齿发育、自我更新、修复和更替过程中牙齿细胞类型的可塑性 | 揭示了牙齿发育中细胞状态之间的连续和流动轨迹,以及牙齿构建祖细胞的自然可塑性 | 缺乏对演化过程中细胞类型转变的直接实验验证 | 探讨牙齿细胞在发育及修复过程中的可塑性 | 牙齿细胞类型及其在不同过程中显示的可塑性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 383 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas identified novel regulators for pigment gland morphogenesis in cotton
2023-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14035
PMID:36896807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 384 | 2024-08-08 |
Resveratrol attenuated fatty acid synthesis through MAPK-PPAR pathway in red tilapia
2023-Jun, Comparative biochemistry and physiology. Toxicology & pharmacology : CBP
DOI:10.1016/j.cbpc.2023.109598
PMID:36898469
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研究论文 | 本研究探讨了白藜芦醇(RES)通过MAPK-PPAR信号通路对红罗非鱼(Oreochromis niloticus)肝脏结构和脂肪代谢的影响 | 研究发现RES通过调节MAPK/PPAR信号通路,促进脂肪酸β-氧化,并影响与脂肪代谢和凋亡相关的基因表达 | NA | 研究白藜芦醇对红罗非鱼肝脏脂肪代谢的影响及其作用机制 | 红罗非鱼(Oreochromis niloticus)的肝脏结构和脂肪代谢 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 385 | 2024-08-08 |
Emerging role of artificial intelligence in diagnosis, classification and clinical management of glioma
2023-06, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.03.006
PMID:36907387
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研究论文 | 本文探讨了人工智能在胶质瘤诊断、分类和临床管理中的新兴作用 | 文章介绍了人工智能通过机器学习和深度学习方法在胶质瘤管理中的应用,包括肿瘤分割、诊断、分级、治疗预测等多个方面 | 目前的人工智能模型需要进一步标准化以提高结果的普遍性和可解释性 | 研究人工智能在胶质瘤精准医疗中的应用 | 胶质瘤的诊断、分类和临床管理 | 机器学习 | 脑瘤 | 机器学习, 深度学习 | NA | 影像, 数字病理, 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2024-08-08 |
Downregulation of MALAT1 is a hallmark of tissue and peripheral proliferative T cells in COVID-19
2023-06-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad034
PMID:36869729
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19中T细胞转录组中长非编码RNA(lncRNA)的表达,特别是MALAT1的调控及其与T细胞激活相关基因的关系 | 首次揭示MALAT1抑制及其相关基因特征是人类增殖T细胞的标志 | NA | 研究COVID-19中T细胞的功能及其在疾病中的作用 | COVID-19患者的T细胞及其转录组 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自COVID-19患者的肺和血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 387 | 2024-08-05 |
Towards artificial intelligence to multi-omics characterization of tumor heterogeneity in esophageal cancer
2023-06, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.02.009
PMID:36868394
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综述 | 本综述讨论了食道癌的肿瘤异质性及其多组学特征 | 引入人工智能和深度学习算法分析食道癌患者特定的多组学数据 | 未明确提到具体的研究局限性 | 全面评估食道癌的肿瘤异质性与精准肿瘤学的关系 | 食道癌的多组学数据及其对肿瘤异质性的影响 | 计算机视觉 | 食道癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | 深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 388 | 2024-08-08 |
Effects of invivo CXCR4 blockade and proteasome inhibition on bone marrow plasma cells in HLA-sensitized kidney transplant candidates
2023-06, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.02.022
PMID:36871629
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研究论文 | 本研究探讨了CXCR4拮抗剂plerixafor与蛋白酶体抑制剂bortezomib联合使用对HLA敏感的肾移植候选者骨髓浆细胞的影响及其安全性 | 首次研究了plerixafor与bortezomib联合使用对骨髓浆细胞的影响,并揭示了治疗后浆细胞中氧化磷酸化、蛋白酶体组装、细胞质翻译和自噬相关基因的富集 | 研究样本量较小,仅为12名参与者,且仅包括3名参与者的单细胞RNA测序数据 | 验证CXCR4拮抗剂plerixafor对骨髓浆细胞驻留的影响及其与蛋白酶体抑制剂bortezomib联合使用的安全性和转录效应 | HLA敏感的肾移植候选者的骨髓浆细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名参与者,其中3名进行了单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2024-08-08 |
C3aR in astrocytes mediates post-thoracotomy pain by inducing A1 astrocytes in male rats
2023-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166672
PMID:36871753
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研究论文 | 本研究探讨了C3aR受体在星形胶质细胞中通过诱导A1星形胶质细胞表达介导雄性大鼠胸廓切开术后疼痛的作用。 | 研究证实了C3aR通过诱导A1星形胶质细胞极化在慢性胸廓切开术后疼痛中的作用,并发现通过下调C3aR抑制A1激活可以增加抗炎的A2星形胶质细胞并减少促炎的M1小胶质细胞激活。 | NA | 确定C3aR在星形胶质细胞中是否通过诱导A1表达介导胸廓切开术后疼痛。 | 雄性大鼠胸廓切开术后疼痛模型。 | NA | 胸廓切开术后疼痛 | RT-PCR, 蛋白质印迹, 共免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of ineffective erythropoiesis in a mouse model of β-thalassaemia intermedia
2023-06, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18706
PMID:36872867
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了Th3/+ β-地中海贫血小鼠模型中的无效红细胞生成 | 首次在单细胞水平上详细揭示了无效红细胞生成的进展,并识别了一种名为ThReticulocytes的独特细胞群体 | NA | 探究β-地中海贫血中无效红细胞生成的详细发病机制 | Th3/+ β-地中海贫血小鼠 | 数字病理学 | 地中海贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2024-08-05 |
A Circular RNA Expressed from the FAT3 Locus Regulates Neural Development
2023-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-023-03253-7
PMID:36840844
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研究论文 | 这篇文章探讨了来自FAT3位点的环状RNA在神经发育中的调节作用 | 首次展示circFAT3在神经干细胞分化过程中对细胞类型形成和神经元发育的关键调控 | 关于circFAT3在脑发育中具体机制的理解仍然有限 | 研究circFAT3在神经发育中的功能 | 人类胚胎干细胞及其分化为神经前体细胞的过程 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30和90天分化的脑类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2024-08-08 |
Studying the mechanism underlying lipid metabolism in osteosarcoma based on transcriptomic RNA sequencing and single-cell data
2023-06, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.3491
PMID:36847293
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研究论文 | 本研究基于转录组RNA测序和单细胞数据,探讨了脂质代谢在骨肉瘤中的机制 | 提供了一种基于单细胞RNA测序和批量RNA-seq数据的骨肉瘤新分型方法,并从脂质代谢角度探讨了其潜在机制 | NA | 旨在基于脂质代谢和单细胞RNA测序数据,为骨肉瘤提供新的分型方法并探讨其发病和进展的潜在机制 | 骨肉瘤的脂质代谢机制 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 使用了单细胞RNA测序数据和三个微阵列表达谱数据 | NA | NA | NA | NA |
| 393 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas of the immune microenvironment reveals macrophage reprogramming and the potential dual macrophage-targeted strategy in multiple myeloma
2023-06, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.18708
PMID:36852636
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了多发性骨髓瘤(MM)肿瘤微环境(TME)在疾病进展中的变化,并探索了针对肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的双重治疗策略。 | 研究首次展示了MM-TME的单细胞图谱,并发现了TAMs的重新编程现象,提出了结合抗CD47抗体和MIF抑制剂的双重巨噬细胞靶向治疗策略。 | NA | 旨在展示多发性骨髓瘤肿瘤微环境在疾病进展中的图谱,并探索针对肿瘤微环境的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤的肿瘤微环境及肿瘤相关巨噬细胞。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 不同疾病阶段的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 394 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor heterogeneity, microenvironment, and drug-resistance mechanisms of recurrent glioblastoma
2023-Jun, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15773
PMID:36853018
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了复发性胶质母细胞瘤的肿瘤异质性、微环境及耐药机制 | 首次在单细胞分辨率下绘制了复发性和耐药性胶质母细胞瘤的转录组图谱,并探讨了其耐药机制 | 研究样本仅来自六份肿瘤组织,样本量较小 | 旨在揭示复发性胶质母细胞瘤的肿瘤异质性、微环境及耐药机制 | 复发性和耐药性胶质母细胞瘤的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六份肿瘤组织,分别来自三位原发性胶质母细胞瘤患者和三位复发性胶质母细胞瘤患者 | NA | NA | NA | NA |
| 395 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic analysis of oral masticatory and lining mucosa-derived mesenchymal stromal cells
2023-06, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.13799
PMID:36864739
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了从咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的人体间充质基质细胞的异质性 | 本研究首次揭示了咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的间充质基质细胞在转录水平上的差异,并识别出11种不同的细胞亚群 | 研究样本仅来自三位个体,可能影响结果的普遍性 | 揭示体外培养的人体间充质基质细胞的异质性 | 咀嚼黏膜和衬里黏膜来源的间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自三位个体的硬腭和牙槽黏膜的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2024-08-05 |
Heterogeneity and plasticity of epithelial-mesenchymal transition (EMT) in cancer metastasis: Focusing on partial EMT and regulatory mechanisms
2023-Jun, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13423
PMID:36808651
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综述 | 这篇文章总结了癌症转移中上皮-间质转化(EMT)的异质性和动态特性 | 提出了肿瘤细胞如何调节自身以保持特定EMT转化状态的跷跷板模型,并强调了EMT异质性与胃癌预后不良的密切关系 | 文章回顾了EMT信号在临床应用中的当前状态和局限性 | 探讨EMT转化状态在肿瘤转移中的直接和间接作用 | 集中讨论部分EMT的特征、生物标志物和分子机制 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 397 | 2024-08-08 |
Single-cell multi-omic topic embedding reveals cell-type-specific and COVID-19 severity-related immune signatures
2023-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.31.526312
PMID:36778483
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研究论文 | 本文提出了一种可解释的深度学习方法moETM,用于高维单细胞多模态数据的整合分析,并通过实验验证了其在单细胞转录组和染色质可及性数据分析中的优越性能 | moETM通过专家乘积在编码器中整合多种组学数据,并使用多个线性解码器学习基因调控程序的多组学特征,提高了分析的灵活性和可解释性 | NA | 探索单细胞多组学测序技术在细胞异质性研究中的应用,并开发新的计算方法以解决高维、离散和稀疏数据带来的挑战 | 单细胞转录组和染色质可及性数据,以及单细胞转录组和蛋白质组数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞多组学测序技术 | 深度学习模型 | 多模态数据 | 涉及七个公开数据集,包括人类骨髓单个核细胞和COVID-19患者的数据 | NA | NA | NA | NA |
| 398 | 2024-08-08 |
PKI: A bioinformatics method of quantifying the importance of nodes in gene regulatory network via a pseudo knockout index
2023-06, Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms
DOI:10.1016/j.bbagrm.2023.194911
PMID:36804477
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研究论文 | 本文提出了一种生物信息学方法,称为伪敲除重要性(PKI),用于量化特定基因调控网络结构中节点和节点集的重要性,使用时间序列单细胞RNA测序数据 | PKI方法通过设计基因伪敲除实验和定义基于决定系数的PKI评分评估标准,量化了节点和节点集的重要性,并将其描述为移除变量对ODE系统的影响 | NA | 量化基因调控网络中节点和节点集的重要性 | 胚胎干细胞的特定基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 时间序列基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 399 | 2024-08-05 |
Inhibition of phosphoglycerate kinase 1 attenuates autoimmune myocarditis by reprogramming CD4+ T cell metabolism
2023-06-13, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvad029
PMID:36726197
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研究论文 | 该研究揭示了磷酸甘油酸激酶1(PGK1)在CD4+ T细胞代谢中的调节作用以及其对实验性自身免疫性心肌炎的影响 | 研究首次表明PGK1通过调节糖酵解和PDHK1-ROS轴来影响CD4+ T细胞和Th17细胞的分化 | 本研究主要集中在小鼠模型中,临床数据的验证尚不足 | 阐明PGK1在CD4+ T细胞激活和实验性自身免疫性心肌炎中的作用机制 | 该研究对象为BALB/c小鼠及心肌炎患者的CD4+ T细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性心肌炎 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 研究涉及BALB/c小鼠和心肌炎患者的CD4+ T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomic survey of cell diversity and functional changes in yak hearts at different altitude
2023-06, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202200345
PMID:36739517
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研究论文 | 本文使用单细胞RNA测序技术研究了不同海拔高度下牦牛心脏的细胞多样性和功能变化 | 揭示了牦牛心脏中特定细胞群体在不同海拔的基因表达差异及其适应高原低氧环境的机制 | 研究主要集中在牦牛心脏,缺乏与其他物种的比较分析 | 探索牦牛在不同海拔下心脏细胞的功能变化及其适应机制 | 牦牛心脏中的平滑肌细胞和血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同海拔的牦牛心脏细胞群体,具体样本数量未说明 | NA | NA | NA | NA |