单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2024-08-08 |
Oncogenic signaling is coupled to colorectal cancer cell differentiation state
2023-06-05, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202204001
PMID:37017636
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的关系 | 首次使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，构建了结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的高维单细胞图谱 | NA | 探究结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的关系 | 结直肠癌细胞的分化状态及其与肿瘤信号传导的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 使用了同基因人类结肠类器官和患者来源的癌症类器官样本 | NA | NA | NA | NA |
| 362 | 2024-08-05 |
iBRIDGE: A Data Integration Method to Identify Inflamed Tumors from Single-cell RNA-Seq Data and Differentiate Cell Type-Specific Markers of Immune-Cell Infiltration
2023-06-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0283
PMID:37023414
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iBRIDGE的方法，通过整合参考的bulk RNA-seq数据与恶性肿瘤的单细胞RNA-seq数据，以识别T细胞炎症的肿瘤。 | iBRIDGE方法首次能够从单细胞RNA-seq数据中识别具有T细胞炎症的肿瘤患者，并识别特定的细胞类型标记。 | 本研究未提及具体的临床试验或外部验证数据，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究旨在开发一种方法以从单细胞RNA-seq数据中识别肿瘤微环境中的T细胞浸润。 | 研究对象为恶性细胞、单核细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 使用了两个匹配的bulk数据集进行分析 | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2024-08-05 |
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Epigenomics Mapping of the Fetal Retina Developmental Dynamics
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206623
PMID:37017569
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎眼样本中视网膜发育的单细胞转录组学和表观基因组学机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序研究视网膜前体细胞的异质性及发育轨迹 | 研究样本仅限于9-26周的胚胎眼，可能不完全代表整个视网膜发育过程 | 了解在视网膜发育过程中基因表达和染色质可及性背后的机制 | 人类胚胎眼样本中的视网膜前体细胞及其向主要视网膜细胞类型的分化轨迹 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞可及染色质测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9-26周的人类胚胎眼样本 | NA | NA | NA | NA |
| 364 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell sequencing analysis distinguishes survival-associated cells from the breast cancer microenvironment
2023-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5892
PMID:37021816
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析辨别出与生存相关的乳腺癌微环境细胞 | 使用Scissor技术整合单细胞和大样本数据，识别出乳腺癌微环境中影响患者生存的细胞亚群 | 在表型相关的亚群体识别方面存在挑战 | 识别乳腺癌微环境中的预后细胞群体以提高对乳腺癌的机制理解 | 研究乳腺癌微环境中细胞类型及其生存相关性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 365 | 2024-08-08 |
Promotion of astrocyte-neuron glutamate-glutamine shuttle by SCFA contributes to the alleviation of Alzheimer's disease
2023-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102690
PMID:37018970
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研究论文 | 本文研究了短链脂肪酸（SCFA）促进星形胶质细胞-神经元谷氨酸-谷氨酰胺穿梭，从而减轻阿尔茨海默病（AD）的作用机制。 | 首次揭示了SCFA通过促进谷氨酸-谷氨酰胺穿梭在细胞水平上抵抗氧化损伤，并通过长期饮食补充改善APP/PS1小鼠的认知障碍。 | NA | 探讨SCFA对阿尔茨海默病的缓解作用及其机制。 | SCFA对阿尔茨海默病的影响，以及其在星形胶质细胞-神经元谷氨酸-谷氨酰胺穿梭中的作用。 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 九个月的APPswe/PS1dE9（APP/PS1）小鼠饮食补充实验 | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2024-08-08 |
PTTG1 promotes CD34+CD45+ cells to repair the pulmonary vascular barrier via activating the VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS signaling pathway in rats with phosgene-induced acute lung injury
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114654
PMID:37018988
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研究论文 | 本研究探讨了PTTG1通过激活VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS信号通路促进CD34+CD45+细胞修复光气诱导的急性肺损伤大鼠肺血管屏障的作用。 | 首次揭示了PTTG1在CD34+CD45+细胞修复肺血管屏障中的作用及其机制。 | 研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人体试验；PTTG1过表达对减轻P-ALI的效果无显著差异。 | 探究PTTG1在CD34+CD45+细胞修复光气诱导的急性肺损伤大鼠肺血管屏障中的作用及机制。 | CD34+CD45+细胞、PTTG1、VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS信号通路。 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 367 | 2024-08-08 |
KGLRR: A low-rank representation K-means with graph regularization constraint method for Single-cell type identification
2023-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于低秩表示模型的新方法KGLRR，用于单细胞类型识别，该方法结合了低秩表示与K均值聚类，并引入了图正则化约束以提高聚类质量 | KGLRR方法通过结合低秩表示和K均值聚类，并引入图正则化约束，能够更准确地捕捉单细胞数据的聚类信息 | NA | 研究疾病机制中单细胞类型识别的关键步骤 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 单细胞数据 | 使用模拟和真实单细胞数据集进行测试 | NA | NA | NA | NA |
| 368 | 2024-08-08 |
Precision medicine in systemic lupus erythematosus
2023-06, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-00948-y
PMID:37041269
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研究论文 | 本文探讨了系统性红斑狼疮（SLE）的精准医疗，分析了其临床表现的多样性和治疗反应的差异性 | 文章提出了通过解析SLE的细胞和分子异质性来促进分层治疗建议和精准医疗的发展 | NA | 研究旨在通过解析SLE的异质性来推动精准医疗的发展 | 研究对象包括SLE相关的基因、表型相关位点以及影响基因表达的表观遗传变异 | NA | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术、质谱细胞术、转录组学、微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、细胞功能数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 369 | 2024-08-05 |
Pathogenic SCN2A variants cause early-stage dysfunction in patient-derived neurons
2023-06-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad048
PMID:37010102
|
研究论文 | 该文章研究了SCN2A致病变异如何导致患者来源神经元的早期功能障碍 | 文章揭示了与不同致病SCN2A变异相关的神经元钠通道功能失调，并指出了与先前在异种系统中观察到的生物物理变化一致的特征 | 研究主要基于患者来源的神经元，尚未验证其他类型的神经元或体外系统 | 研究SCN2A变异在ID患者来源的神经元中引起的生理变化 | 研究对象为具有不同致病SCN2A变异的ID患者及癫痫患者来源的早期皮层神经元 | 数字病理学 | 智能障碍/自闭症 | iPSC技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个来自ID和癫痫患者及对照组的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 370 | 2024-08-05 |
Mapping human adult hippocampal neurogenesis with single-cell transcriptomics: Reconciling controversy or fueling the debate?
2023-06-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.010
PMID:37015226
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研究论文 | 该文章讨论并重新分析了与人类成年海马神经发生相关的单细胞转录组数据集。 | 文章提出了单细胞转录组分析在探索人类成年海马神经发生中的潜在方法学和生物学困惑。 | 单细胞转录组的分析可能受到方法学、概念和生物学因素的混淆，这些因素需要在不同研究中一致处理并公开讨论。 | 探讨人类成年海马神经发生的争议及其相关的单细胞转录组技术 | 人类成年海马的神经发生及其单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing in skeletal muscle developmental biology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114631
PMID:37003036
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评论 | 该文章总结了单细胞RNA测序在骨骼肌发育生物学中的进展和应用 | 探讨了单细胞测序技术在骨骼肌细胞类型及其发育过程中的分子事件上的应用 | 未详细探讨特定生物功能的细胞网络 | 了解骨骼肌的发育过程和细胞异质性 | 骨骼肌发育中的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 372 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of localized prostate cancer patients links high Gleason score with an immunosuppressive profile
2023-06, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24524
PMID:36988342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色流式细胞术分析了局部前列腺癌患者的肿瘤免疫微环境，发现高级别前列腺癌中存在高水平的免疫抑制特征。 | 首次揭示了局部前列腺癌中高级别与低级别前列腺癌在肿瘤免疫微环境中的差异，特别是高级别前列腺癌中CD8+ T细胞的耗竭状态。 | 研究仅限于局部前列腺癌样本，未涉及晚期或转移性前列腺癌的情况。 | 探究高级别前列腺癌的免疫逃逸机制及其与肿瘤免疫微环境的关系。 | 局部前列腺癌患者的肿瘤组织和匹配的外周血样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | NA | RNA | 新鲜分离的前列腺切除标本和匹配的外周血样本 | NA | NA | NA | NA |
| 373 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq resolution revealed CCR1+/SELL+/XAF+ CD14 monocytes mediated vascular endothelial cell injuries in Kawasaki disease and COVID-19
2023-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166707
PMID:37001702
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨川崎病和COVID-19中血管内皮细胞损伤的分子机制，并通过体外实验验证结果 | 首次揭示了CCR1+/SELL+/XAF1+ CD14单核细胞在川崎病和COVID-19中对血管内皮细胞损伤的作用 | 研究样本量较小，且仅限于儿童患者 | 探讨川崎病和COVID-19中血管损伤的分子机制 | 川崎病和COVID-19患者的免疫反应及血管内皮细胞损伤 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了22个样本，包括6个川崎病患儿、3个健康对照、6个COVID-19患者、3个流感患者和4个健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 374 | 2024-08-08 |
Transcriptome identification of genes associated with uterus-vagina junction epithelial folds formation in chicken hens
2023-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2023.102624
PMID:37011465
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研究论文 | 本研究通过形态学和发育学研究，对白来航鸡的子宫-阴道连接处（UVJ）上皮褶皱的形成进行了分类和基因表达分析 | 首次在蛋鸡繁殖领域对UVJ上皮褶皱的发育调控进行研究，并使用单细胞RNA测序技术揭示了不同细胞类型间的显著差异 | 研究仅限于白来航鸡，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他品种的鸡 | 探讨雌性鸟类性成熟过程中子宫-阴道连接处上皮褶皱的发育调控及其对成年鸟类精子储存时间和受精能力的影响 | 白来航鸡的子宫-阴道连接处上皮褶皱的形态和发育 | 发育生物学 | NA | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq），免疫组织化学 | NA | RNA | 多个白来航鸡样本 | NA | NA | NA | NA |
| 375 | 2024-08-08 |
Origins of pathological myofibroblasts in lung fibrosis: insights from lineage tracing mouse models in the single-cell RNA sequencing era
2023-06-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00229.2022
PMID:36976924
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源，基于单细胞RNA测序时代的鼠系追踪模型 | 利用鼠系追踪方法和单细胞RNA测序技术，探讨了肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的潜在来源 | 本文为综述性质，未提供具体的实验数据或结果 | 旨在探讨肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源 | 特发性肺纤维化中的病理性肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 376 | 2024-08-08 |
Cell Features Reconstruction from Gene Association Network of Single Cell
2023-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00553-3
PMID:36977959
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研究论文 | 本文提出了一种两级方法来重建单细胞特征，通过将原始基因表达特征转换为基因本体特征和基因相互作用特征 | 本文创新性地提出了基于细胞网络特征矩阵的基因引力计算方法和基因引力熵指数，用于量化基因间的相互作用和单细胞分化的水平 | NA | 开发一种新的方法来重建单细胞特征，并量化基因间的相互作用 | 单细胞基因表达特征 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 八个不同的scRNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 377 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling identifies a novel human polyclonal unconventional T cell lineage
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220942
PMID:36939517
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，鉴定了人类血液中一种新的多克隆非传统T细胞系 | 首次在人类血液中发现并描述了一种新的非传统T细胞系，该细胞系具有独特的转录组特征和多克隆TCR谱 | NA | 鉴定和描述人类血液中的非传统T细胞系 | 非传统T细胞系及其在血液和肠道组织中的分布 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 378 | 2024-08-05 |
IL-6 in the infarcted heart is preferentially formed by fibroblasts and modulated by purinergic signaling
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163799
PMID:36943408
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研究论文 | 本文研究了心肌梗死后IL-6的主要来源及其调节机制。 | 发现心脏成纤维细胞是IL-6的主要来源，并揭示了腺苷信号在IL-6产生中的调节作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，缺乏大规模临床数据支持。 | 本研究旨在探讨心肌梗死后IL-6的细胞来源及其调节机制。 | 研究对象为小鼠和人类心肌梗死后的心脏细胞。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 蛋白质，RNA | 小鼠和人类心脏样本 | NA | NA | NA | NA |
| 379 | 2024-08-05 |
DNER and GNL2 are differentially m6A methylated in periodontitis in comparison with periodontal health revealed by m6A microarray of human gingival tissue and transcriptomic analysis
2023-Jun, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13117
PMID:36941720
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研究论文 | 这项研究旨在探讨牙周炎患者与健康对照者之间牙龈组织中N6-甲基腺苷（m6A）甲基化的表观基因组模式差异，并识别潜在生物标志物 | 本研究揭示了独特的m6A表观转录组，识别并验证了两个与牙周炎相关的生物标志物（DNER和GNL2） | 本研究的样本数量有限，仅包括八名参与者，可能影响结果的普遍性 | 研究牙周炎与健康之间牙龈组织中m6A甲基化的差异 | 研究对象为诊断为牙周炎的患者及健康对照者 | 数字病理 | 牙周炎 | m6A微阵列 | NA | 基因表达数据 | 8名参与者（4名牙周炎患者和4名健康对照者） | NA | NA | NA | NA |
| 380 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of ND-42 mediated spermatid elongation via mitochondrial derivative maintenance in Drosophila testes
2023-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102671
PMID:36933391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ND-42通过维持线粒体衍生物在果蝇睾丸中精子细胞伸长的转录景观 | 首次揭示了ND-42在精子细胞伸长过程中对线粒体衍生物维持的新型调控机制 | NA | 探究果蝇精子细胞伸长过程中线粒体的调控机制 | 果蝇睾丸中的精子细胞和线粒体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个不同的细胞集群 | NA | NA | NA | NA |