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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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361 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of localized prostate cancer patients links high Gleason score with an immunosuppressive profile
2023-06, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24524
PMID:36988342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色流式细胞术分析了局部前列腺癌患者的肿瘤免疫微环境,发现高级别前列腺癌中存在高水平的免疫抑制特征。 | 首次揭示了局部前列腺癌中高级别与低级别前列腺癌在肿瘤免疫微环境中的差异,特别是高级别前列腺癌中CD8+ T细胞的耗竭状态。 | 研究仅限于局部前列腺癌样本,未涉及晚期或转移性前列腺癌的情况。 | 探究高级别前列腺癌的免疫逃逸机制及其与肿瘤免疫微环境的关系。 | 局部前列腺癌患者的肿瘤组织和匹配的外周血样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,多色流式细胞术 | NA | RNA | 新鲜分离的前列腺切除标本和匹配的外周血样本 |
362 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq resolution revealed CCR1+/SELL+/XAF+ CD14 monocytes mediated vascular endothelial cell injuries in Kawasaki disease and COVID-19
2023-06, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2023.166707
PMID:37001702
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨川崎病和COVID-19中血管内皮细胞损伤的分子机制,并通过体外实验验证结果 | 首次揭示了CCR1+/SELL+/XAF1+ CD14单核细胞在川崎病和COVID-19中对血管内皮细胞损伤的作用 | 研究样本量较小,且仅限于儿童患者 | 探讨川崎病和COVID-19中血管损伤的分子机制 | 川崎病和COVID-19患者的免疫反应及血管内皮细胞损伤 | 数字病理学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共分析了22个样本,包括6个川崎病患儿、3个健康对照、6个COVID-19患者、3个流感患者和4个健康对照 |
363 | 2024-08-08 |
Transcriptome identification of genes associated with uterus-vagina junction epithelial folds formation in chicken hens
2023-Jun, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2023.102624
PMID:37011465
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研究论文 | 本研究通过形态学和发育学研究,对白来航鸡的子宫-阴道连接处(UVJ)上皮褶皱的形成进行了分类和基因表达分析 | 首次在蛋鸡繁殖领域对UVJ上皮褶皱的发育调控进行研究,并使用单细胞RNA测序技术揭示了不同细胞类型间的显著差异 | 研究仅限于白来航鸡,可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他品种的鸡 | 探讨雌性鸟类性成熟过程中子宫-阴道连接处上皮褶皱的发育调控及其对成年鸟类精子储存时间和受精能力的影响 | 白来航鸡的子宫-阴道连接处上皮褶皱的形态和发育 | 发育生物学 | NA | RNA测序(RNA-seq),单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学 | NA | RNA | 多个白来航鸡样本 |
364 | 2024-08-08 |
Origins of pathological myofibroblasts in lung fibrosis: insights from lineage tracing mouse models in the single-cell RNA sequencing era
2023-06-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00229.2022
PMID:36976924
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源,基于单细胞RNA测序时代的鼠系追踪模型 | 利用鼠系追踪方法和单细胞RNA测序技术,探讨了肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的潜在来源 | 本文为综述性质,未提供具体的实验数据或结果 | 旨在探讨肺纤维化中病理性肌成纤维细胞的起源 | 特发性肺纤维化中的病理性肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
365 | 2024-08-08 |
Cell Features Reconstruction from Gene Association Network of Single Cell
2023-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-023-00553-3
PMID:36977959
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研究论文 | 本文提出了一种两级方法来重建单细胞特征,通过将原始基因表达特征转换为基因本体特征和基因相互作用特征 | 本文创新性地提出了基于细胞网络特征矩阵的基因引力计算方法和基因引力熵指数,用于量化基因间的相互作用和单细胞分化的水平 | NA | 开发一种新的方法来重建单细胞特征,并量化基因间的相互作用 | 单细胞基因表达特征 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 八个不同的scRNA-seq数据集 |
366 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling identifies a novel human polyclonal unconventional T cell lineage
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20220942
PMID:36939517
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术,鉴定了人类血液中一种新的多克隆非传统T细胞系 | 首次在人类血液中发现并描述了一种新的非传统T细胞系,该细胞系具有独特的转录组特征和多克隆TCR谱 | NA | 鉴定和描述人类血液中的非传统T细胞系 | 非传统T细胞系及其在血液和肠道组织中的分布 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
367 | 2024-08-08 |
CCL5-producing migratory dendritic cells guide CCR5+ monocytes into the draining lymph nodes
2023-06-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20222129
PMID:36946983
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研究论文 | 研究探讨了树突状细胞(DCs)和单核细胞在淋巴结中的迁移机制,特别是CCL5产生的迁移性树突状细胞如何引导CCR5+单核细胞进入引流淋巴结(LNs)。 | 首次揭示了迁移性树突状细胞通过分泌CCL5引导CCR5+单核细胞进入淋巴结的机制。 | 研究主要集中在稳态和吸入多种病原体相关分子模式(PAMPs)后的情况,未涵盖所有可能的生理和病理条件。 | 阐明树突状细胞和单核细胞在淋巴结中的迁移和功能机制。 | 树突状细胞(DCs)和单核细胞在淋巴结中的迁移和功能。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 涉及多种基因缺陷小鼠模型 |
368 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unifies Developmental Programs of Esophageal and Gastric Intestinal Metaplasia
2023-06-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-22-0824
PMID:36929873
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序构建了整个胃肠道的图谱,包括生理正常和病理状态,以研究食管和胃的肠上皮化生的发展轨迹。 | 本文首次展示了食管和胃的肠上皮化生共享分子特征,并提出了这些病变在分子水平上的相似性,为共同的检测和治疗策略提供了可能。 | NA | 研究食管和胃的肠上皮化生的发展轨迹及其分子相似性。 | 食管和胃的肠上皮化生(BE-IM和GIM)及其相关病理状态。 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 涉及整个胃肠道的生理正常和病理状态样本 |
369 | 2024-08-05 |
IL-6 in the infarcted heart is preferentially formed by fibroblasts and modulated by purinergic signaling
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI163799
PMID:36943408
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研究论文 | 本文研究了心肌梗死后IL-6的主要来源及其调节机制。 | 发现心脏成纤维细胞是IL-6的主要来源,并揭示了腺苷信号在IL-6产生中的调节作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上,缺乏大规模临床数据支持。 | 本研究旨在探讨心肌梗死后IL-6的细胞来源及其调节机制。 | 研究对象为小鼠和人类心肌梗死后的心脏细胞。 | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 单细胞RNA测序 (scRNA-Seq) | NA | 蛋白质,RNA | 小鼠和人类心脏样本 |
370 | 2024-08-05 |
DNER and GNL2 are differentially m6A methylated in periodontitis in comparison with periodontal health revealed by m6A microarray of human gingival tissue and transcriptomic analysis
2023-Jun, Journal of periodontal research
IF:3.4Q1
DOI:10.1111/jre.13117
PMID:36941720
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研究论文 | 这项研究旨在探讨牙周炎患者与健康对照者之间牙龈组织中N6-甲基腺苷(m6A)甲基化的表观基因组模式差异,并识别潜在生物标志物 | 本研究揭示了独特的m6A表观转录组,识别并验证了两个与牙周炎相关的生物标志物(DNER和GNL2) | 本研究的样本数量有限,仅包括八名参与者,可能影响结果的普遍性 | 研究牙周炎与健康之间牙龈组织中m6A甲基化的差异 | 研究对象为诊断为牙周炎的患者及健康对照者 | 数字病理 | 牙周炎 | m6A微阵列 | NA | 基因表达数据 | 8名参与者(4名牙周炎患者和4名健康对照者) |
371 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the transcriptional landscape of ND-42 mediated spermatid elongation via mitochondrial derivative maintenance in Drosophila testes
2023-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102671
PMID:36933391
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了ND-42通过维持线粒体衍生物在果蝇睾丸中精子细胞伸长的转录景观 | 首次揭示了ND-42在精子细胞伸长过程中对线粒体衍生物维持的新型调控机制 | NA | 探究果蝇精子细胞伸长过程中线粒体的调控机制 | 果蝇睾丸中的精子细胞和线粒体 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 15个不同的细胞集群 |
372 | 2024-08-08 |
Mural cell composition and functional analysis in the healing process of human gingiva from periodontal intrabony defects
2023-Jun, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
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研究论文 | 评估人类牙龈组织中壁细胞群的组成和功能 | 识别并确认了两种壁细胞亚群,RGS5+THY1+和ACTA2+MYH11+,并通过单细胞RNA测序和组织学染色进行了验证 | 研究样本仅限于七名牙周炎(Ⅲ期)患者,可能影响结果的普遍性 | 研究牙龈组织愈合过程中壁细胞的组成和功能 | 人类牙龈组织中的壁细胞 | NA | 牙周病 | 单细胞RNA测序(10X基因组学) | NA | 基因表达数据 | 七名牙周炎(Ⅲ期)患者 |
373 | 2024-08-05 |
Plasticity of Dental Cell Types in Development, Regeneration, and Evolution
2023-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231154800
PMID:36919873
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综述 | 本文讨论了牙齿发育、自我更新、修复和更替过程中牙齿细胞类型的可塑性 | 揭示了牙齿发育中细胞状态之间的连续和流动轨迹,以及牙齿构建祖细胞的自然可塑性 | 缺乏对演化过程中细胞类型转变的直接实验验证 | 探讨牙齿细胞在发育及修复过程中的可塑性 | 牙齿细胞类型及其在不同过程中显示的可塑性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
374 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome atlas identified novel regulators for pigment gland morphogenesis in cotton
2023-06, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14035
PMID:36896807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
375 | 2024-08-08 |
Resveratrol attenuated fatty acid synthesis through MAPK-PPAR pathway in red tilapia
2023-Jun, Comparative biochemistry and physiology. Toxicology & pharmacology : CBP
DOI:10.1016/j.cbpc.2023.109598
PMID:36898469
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研究论文 | 本研究探讨了白藜芦醇(RES)通过MAPK-PPAR信号通路对红罗非鱼(Oreochromis niloticus)肝脏结构和脂肪代谢的影响 | 研究发现RES通过调节MAPK/PPAR信号通路,促进脂肪酸β-氧化,并影响与脂肪代谢和凋亡相关的基因表达 | NA | 研究白藜芦醇对红罗非鱼肝脏脂肪代谢的影响及其作用机制 | 红罗非鱼(Oreochromis niloticus)的肝脏结构和脂肪代谢 | NA | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA |
376 | 2024-08-08 |
Emerging role of artificial intelligence in diagnosis, classification and clinical management of glioma
2023-06, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.03.006
PMID:36907387
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研究论文 | 本文探讨了人工智能在胶质瘤诊断、分类和临床管理中的新兴作用 | 文章介绍了人工智能通过机器学习和深度学习方法在胶质瘤管理中的应用,包括肿瘤分割、诊断、分级、治疗预测等多个方面 | 目前的人工智能模型需要进一步标准化以提高结果的普遍性和可解释性 | 研究人工智能在胶质瘤精准医疗中的应用 | 胶质瘤的诊断、分类和临床管理 | 机器学习 | 脑瘤 | 机器学习, 深度学习 | NA | 影像, 数字病理, 多组学数据 | NA |
377 | 2024-08-08 |
Downregulation of MALAT1 is a hallmark of tissue and peripheral proliferative T cells in COVID-19
2023-06-05, Clinical and experimental immunology
IF:3.4Q3
DOI:10.1093/cei/uxad034
PMID:36869729
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19中T细胞转录组中长非编码RNA(lncRNA)的表达,特别是MALAT1的调控及其与T细胞激活相关基因的关系 | 首次揭示MALAT1抑制及其相关基因特征是人类增殖T细胞的标志 | NA | 研究COVID-19中T细胞的功能及其在疾病中的作用 | COVID-19患者的T细胞及其转录组 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括来自COVID-19患者的肺和血液样本 |
378 | 2024-08-05 |
Towards artificial intelligence to multi-omics characterization of tumor heterogeneity in esophageal cancer
2023-06, Seminars in cancer biology
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.semcancer.2023.02.009
PMID:36868394
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综述 | 本综述讨论了食道癌的肿瘤异质性及其多组学特征 | 引入人工智能和深度学习算法分析食道癌患者特定的多组学数据 | 未明确提到具体的研究局限性 | 全面评估食道癌的肿瘤异质性与精准肿瘤学的关系 | 食道癌的多组学数据及其对肿瘤异质性的影响 | 计算机视觉 | 食道癌 | 单细胞测序和空间转录组学 | 深度学习 | 组学数据 | NA |
379 | 2024-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Difference of Aortic Atherosclerosis Response to Phytosterols and Oxidation Products of Sterols
2023-Jun, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.202200811
PMID:36877953
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了饮食来源的植物甾醇和甾醇氧化产物对主动脉动脉粥样硬化的影响 | 本研究首次识别了体内不同功能的四种成纤维细胞亚群,并揭示了它们在动脉粥样硬化中的作用 | 研究主要基于ApoE-/-小鼠模型,可能无法完全反映人类的病理过程 | 探讨植物甾醇及其氧化产物对主动脉动脉粥样硬化细胞的影响 | 研究对象为ApoE-/-小鼠的主动脉细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究中使用了ApoE-/-小鼠的多个主动脉细胞样本 |
380 | 2024-08-08 |
Effects of invivo CXCR4 blockade and proteasome inhibition on bone marrow plasma cells in HLA-sensitized kidney transplant candidates
2023-06, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2023.02.022
PMID:36871629
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研究论文 | 本研究探讨了CXCR4拮抗剂plerixafor与蛋白酶体抑制剂bortezomib联合使用对HLA敏感的肾移植候选者骨髓浆细胞的影响及其安全性 | 首次研究了plerixafor与bortezomib联合使用对骨髓浆细胞的影响,并揭示了治疗后浆细胞中氧化磷酸化、蛋白酶体组装、细胞质翻译和自噬相关基因的富集 | 研究样本量较小,仅为12名参与者,且仅包括3名参与者的单细胞RNA测序数据 | 验证CXCR4拮抗剂plerixafor对骨髓浆细胞驻留的影响及其与蛋白酶体抑制剂bortezomib联合使用的安全性和转录效应 | HLA敏感的肾移植候选者的骨髓浆细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 12名参与者,其中3名进行了单细胞RNA测序 |