单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-08 |
Associations between brain gene expression perturbations implicated by COVID-19 and psychiatric disorders
2023-06, Journal of psychiatric research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.jpsychires.2023.03.033
PMID:37105022
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研究论文 | 本研究通过整合COVID-19脑组织单细胞RNA测序数据和精神疾病的全基因组关联研究总结统计数据，进行元分析，探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | 首次揭示了COVID-19引起的脑部基因表达扰动与精神分裂症之间的显著关联 | NA | 探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | COVID-19脑组织和精神疾病 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 342 | 2024-08-08 |
MLSpatial: A machine-learning method to reconstruct the spatial distribution of cells from scRNA-seq by extracting spatial features
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106873
PMID:37105115
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MLSpatial的新型计算方法，该方法通过学习基因表达模式与细胞空间位置之间的关系，基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据预测细胞间距离分布，从而重建细胞的空间分布。 | MLSpatial方法创新地利用scRNA-seq数据重建细胞的空间分布，这在癌症免疫治疗等需要细胞空间信息的场景中尤为重要。 | MLSpatial的性能依赖于细胞类型，且需要scRNA-seq数据与FISH数据具有相似的背景条件。 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中重建细胞空间分布的计算方法。 | 研究对象包括果蝇胚胎和骨肉瘤细胞的scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 果蝇胚胎数据包含3039个细胞的FISH数据和1297个高质量细胞的scRNA-seq数据；骨肉瘤数据包含645个细胞的MERFISH数据。 |
| 343 | 2024-08-05 |
Anaplastic transformation in thyroid cancer revealed by single-cell transcriptomics
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI169653
PMID:37053016
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研究论文 | 本文研究了由单细胞转录组学揭示的甲状腺癌中去分化转化的过程 | 通过单细胞转录组学揭示了去分化甲状腺癌细胞的不同亚型和转化模型，识别出重要的转化关键阶段 | 目前对肿瘤内部复杂的转化过程仍缺乏全面理解 | 阐明甲状腺癌中去分化转化的细胞谱系和命运转变 | 不同亚型甲状腺癌患者的单细胞转录组和基因变化数据 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 不同亚型甲状腺癌患者的细胞数据 |
| 344 | 2024-08-05 |
Fibroblast and Immune Cell Cross-Talk in Cardiac Fibrosis
2023-06, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-023-01877-8
PMID:37074566
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综述 | 本文全面概述了在心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 识别了在心肌梗死中可能的促炎成纤维细胞，并探讨了成纤维细胞如何影响炎症细胞行为 | 没有提到具体的实验数据支持或临床试验结果 | 探究心脏损伤背景下炎症与修复反应之间复杂的相互作用 | 关注心脏疾病中的成纤维细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-05 |
Unraveling the heterogeneity of cholangiocarcinoma and identifying biomarkers and therapeutic strategies with single-cell sequencing technology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114697
PMID:37060660
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综述 | 本文旨在利用单细胞测序技术评估胆管癌的异质性，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 通过单细胞测序技术深入分析胆管癌的肿瘤细胞基因组和表观基因组，提供了癌症进展机制的新见解 | 目前尚未解决的准确诊断方法限制了研究的广泛应用 | 寻找胆管癌的早期诊断生物标志物和改进治疗策略 | 胆管癌细胞及其异质性 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织 | NA |
| 346 | 2024-08-08 |
Wnt3a-Loaded Extracellular Vesicles Promote Alveolar Epithelial Regeneration after Lung Injury
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206606
PMID:37072558
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研究论文 | 本研究开发了一种通过将Wnt3a固定在细胞外囊泡(EVs)表面来远程传递Wnt3a的策略，以促进肺损伤后的肺泡上皮再生 | 本研究创新性地利用细胞外囊泡作为载体，有效解决了Wnt蛋白亲水性差的问题，并成功验证了其在肺泡上皮细胞再生中的生物活性 | NA | 探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)治疗的新方法 | Wnt3a细胞外囊泡在肺损伤后肺泡上皮再生中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 347 | 2024-08-08 |
Clustering ensemble in scRNA-seq data analysis: Methods, applications and challenges
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106939
PMID:37075602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据分析中聚类集成方法的应用、挑战及未来方向 | 聚类集成方法能提高单细胞转录组数据分析的准确性和可靠性 | 不同聚类方法产生的结果存在差异，不稳定的分区会影响分析的准确性 | 总结聚类集成方法在单细胞转录组数据分析中的应用和挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成 | 转录组数据 | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-06-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad262
PMID:37026478
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研究论文 | 本文提出了一种名为exFINDER的方法，用于识别单细胞转录组数据中细胞接收到的外部通信信号 | exFINDER利用信号通路的先验知识，首次识别了细胞从外部系统接收到的信号 | 目前研究主要依赖于现有的单细胞转录组数据，可能受数据质量和充分性的限制 | 研究目的在于揭示单细胞转录组数据中的外部信号及其对目标基因的激活作用 | 涉及单细胞转录组(scRNA-seq)数据，应用于不同物种的细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集中的转录组数据 | NA |
| 349 | 2024-08-08 |
Oncogenic signaling is coupled to colorectal cancer cell differentiation state
2023-06-05, The Journal of cell biology
IF:7.4Q1
DOI:10.1083/jcb.202204001
PMID:37017636
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的关系 | 首次使用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，构建了结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的高维单细胞图谱 | NA | 探究结直肠癌发展过程中肿瘤信号传导与细胞分化状态的关系 | 结直肠癌细胞的分化状态及其与肿瘤信号传导的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 使用了同基因人类结肠类器官和患者来源的癌症类器官样本 |
| 350 | 2024-08-05 |
iBRIDGE: A Data Integration Method to Identify Inflamed Tumors from Single-cell RNA-Seq Data and Differentiate Cell Type-Specific Markers of Immune-Cell Infiltration
2023-06-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0283
PMID:37023414
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iBRIDGE的方法，通过整合参考的bulk RNA-seq数据与恶性肿瘤的单细胞RNA-seq数据，以识别T细胞炎症的肿瘤。 | iBRIDGE方法首次能够从单细胞RNA-seq数据中识别具有T细胞炎症的肿瘤患者，并识别特定的细胞类型标记。 | 本研究未提及具体的临床试验或外部验证数据，可能影响结果的广泛适用性。 | 研究旨在开发一种方法以从单细胞RNA-seq数据中识别肿瘤微环境中的T细胞浸润。 | 研究对象为恶性细胞、单核细胞和成纤维细胞。 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 使用了两个匹配的bulk数据集进行分析 |
| 351 | 2024-08-05 |
Integrative Single-Cell Transcriptomics and Epigenomics Mapping of the Fetal Retina Developmental Dynamics
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206623
PMID:37017569
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研究论文 | 本研究探讨了人类胚胎眼样本中视网膜发育的单细胞转录组学和表观基因组学机制 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞转座酶可及染色质测序研究视网膜前体细胞的异质性及发育轨迹 | 研究样本仅限于9-26周的胚胎眼，可能不完全代表整个视网膜发育过程 | 了解在视网膜发育过程中基因表达和染色质可及性背后的机制 | 人类胚胎眼样本中的视网膜前体细胞及其向主要视网膜细胞类型的分化轨迹 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序和单细胞可及染色质测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 9-26周的人类胚胎眼样本 |
| 352 | 2024-08-05 |
Integrative single-cell sequencing analysis distinguishes survival-associated cells from the breast cancer microenvironment
2023-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5892
PMID:37021816
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析辨别出与生存相关的乳腺癌微环境细胞 | 使用Scissor技术整合单细胞和大样本数据，识别出乳腺癌微环境中影响患者生存的细胞亚群 | 在表型相关的亚群体识别方面存在挑战 | 识别乳腺癌微环境中的预后细胞群体以提高对乳腺癌的机制理解 | 研究乳腺癌微环境中细胞类型及其生存相关性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-08 |
Promotion of astrocyte-neuron glutamate-glutamine shuttle by SCFA contributes to the alleviation of Alzheimer's disease
2023-06, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2023.102690
PMID:37018970
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研究论文 | 本文研究了短链脂肪酸（SCFA）促进星形胶质细胞-神经元谷氨酸-谷氨酰胺穿梭，从而减轻阿尔茨海默病（AD）的作用机制。 | 首次揭示了SCFA通过促进谷氨酸-谷氨酰胺穿梭在细胞水平上抵抗氧化损伤，并通过长期饮食补充改善APP/PS1小鼠的认知障碍。 | NA | 探讨SCFA对阿尔茨海默病的缓解作用及其机制。 | SCFA对阿尔茨海默病的影响，以及其在星形胶质细胞-神经元谷氨酸-谷氨酰胺穿梭中的作用。 | NA | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 九个月的APPswe/PS1dE9（APP/PS1）小鼠饮食补充实验 |
| 354 | 2024-08-08 |
PTTG1 promotes CD34+CD45+ cells to repair the pulmonary vascular barrier via activating the VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS signaling pathway in rats with phosgene-induced acute lung injury
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114654
PMID:37018988
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研究论文 | 本研究探讨了PTTG1通过激活VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS信号通路促进CD34+CD45+细胞修复光气诱导的急性肺损伤大鼠肺血管屏障的作用。 | 首次揭示了PTTG1在CD34+CD45+细胞修复肺血管屏障中的作用及其机制。 | 研究仅在大鼠模型中进行，未涉及人体试验；PTTG1过表达对减轻P-ALI的效果无显著差异。 | 探究PTTG1在CD34+CD45+细胞修复光气诱导的急性肺损伤大鼠肺血管屏障中的作用及机制。 | CD34+CD45+细胞、PTTG1、VEGF-bFGF/PI3K/AKT/eNOS信号通路。 | 数字病理学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型 |
| 355 | 2024-08-08 |
KGLRR: A low-rank representation K-means with graph regularization constraint method for Single-cell type identification
2023-Jun, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本文提出了一种基于低秩表示模型的新方法KGLRR，用于单细胞类型识别，该方法结合了低秩表示与K均值聚类，并引入了图正则化约束以提高聚类质量 | KGLRR方法通过结合低秩表示和K均值聚类，并引入图正则化约束，能够更准确地捕捉单细胞数据的聚类信息 | NA | 研究疾病机制中单细胞类型识别的关键步骤 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示模型 | 单细胞数据 | 使用模拟和真实单细胞数据集进行测试 |
| 356 | 2024-08-08 |
Precision medicine in systemic lupus erythematosus
2023-06, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-00948-y
PMID:37041269
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研究论文 | 本文探讨了系统性红斑狼疮（SLE）的精准医疗，分析了其临床表现的多样性和治疗反应的差异性 | 文章提出了通过解析SLE的细胞和分子异质性来促进分层治疗建议和精准医疗的发展 | NA | 研究旨在通过解析SLE的异质性来推动精准医疗的发展 | 研究对象包括SLE相关的基因、表型相关位点以及影响基因表达的表观遗传变异 | NA | 系统性红斑狼疮 | 流式细胞术、质谱细胞术、转录组学、微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据、细胞功能数据 | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Pathogenic SCN2A variants cause early-stage dysfunction in patient-derived neurons
2023-06-19, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddad048
PMID:37010102
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研究论文 | 该文章研究了SCN2A致病变异如何导致患者来源神经元的早期功能障碍 | 文章揭示了与不同致病SCN2A变异相关的神经元钠通道功能失调，并指出了与先前在异种系统中观察到的生物物理变化一致的特征 | 研究主要基于患者来源的神经元，尚未验证其他类型的神经元或体外系统 | 研究SCN2A变异在ID患者来源的神经元中引起的生理变化 | 研究对象为具有不同致病SCN2A变异的ID患者及癫痫患者来源的早期皮层神经元 | 数字病理学 | 智能障碍/自闭症 | iPSC技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个来自ID和癫痫患者及对照组的样本 |
| 358 | 2024-08-05 |
Mapping human adult hippocampal neurogenesis with single-cell transcriptomics: Reconciling controversy or fueling the debate?
2023-06-07, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2023.03.010
PMID:37015226
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研究论文 | 该文章讨论并重新分析了与人类成年海马神经发生相关的单细胞转录组数据集。 | 文章提出了单细胞转录组分析在探索人类成年海马神经发生中的潜在方法学和生物学困惑。 | 单细胞转录组的分析可能受到方法学、概念和生物学因素的混淆，这些因素需要在不同研究中一致处理并公开讨论。 | 探讨人类成年海马神经发生的争议及其相关的单细胞转录组技术 | 人类成年海马的神经发生及其单细胞转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组技术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 359 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA sequencing in skeletal muscle developmental biology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114631
PMID:37003036
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评论 | 该文章总结了单细胞RNA测序在骨骼肌发育生物学中的进展和应用 | 探讨了单细胞测序技术在骨骼肌细胞类型及其发育过程中的分子事件上的应用 | 未详细探讨特定生物功能的细胞网络 | 了解骨骼肌的发育过程和细胞异质性 | 骨骼肌发育中的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of localized prostate cancer patients links high Gleason score with an immunosuppressive profile
2023-06, The Prostate
DOI:10.1002/pros.24524
PMID:36988342
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色流式细胞术分析了局部前列腺癌患者的肿瘤免疫微环境，发现高级别前列腺癌中存在高水平的免疫抑制特征。 | 首次揭示了局部前列腺癌中高级别与低级别前列腺癌在肿瘤免疫微环境中的差异，特别是高级别前列腺癌中CD8+ T细胞的耗竭状态。 | 研究仅限于局部前列腺癌样本，未涉及晚期或转移性前列腺癌的情况。 | 探究高级别前列腺癌的免疫逃逸机制及其与肿瘤免疫微环境的关系。 | 局部前列腺癌患者的肿瘤组织和匹配的外周血样本。 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，多色流式细胞术 | NA | RNA | 新鲜分离的前列腺切除标本和匹配的外周血样本 |