单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 417 篇文献，本页显示第 341 - 360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2024-08-05 |
Time-resolved single-cell transcriptomics reveals the landscape and dynamics of hepatic cells in sepsis-induced acute liver dysfunction
2023-Jun, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2023.100718
PMID:37122356
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研究论文 | 该论文揭示了脓毒症诱导的急性肝功能障碍中肝细胞的细胞异质性和动态调节 | 首次在单细胞分辨率下展示了主要非肝实质细胞在脓毒症进展中的动态转录组景观和相互作用 | 当前研究仍未完全阐明脓毒症诱导的急性肝功能障碍的所有发病机制 | 探讨脓毒症诱导的急性肝功能障碍中主要非肝实质细胞的动态及其相互作用 | 脓毒症小鼠模型中的主要非肝实质细胞亚群 | 数字病理学 | 脓毒症诱导的急性肝功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 控制组和脓毒症小鼠的主要肝非实质细胞的转录组分析 | NA | NA | NA | NA |
| 342 | 2024-08-08 |
Applications of single-cell RNA sequencing in drug discovery and development
2023-06, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-023-00688-4
PMID:37117846
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在药物发现和开发中的应用 | scRNA-seq技术通过细胞亚型分类提高了对疾病的理解，促进了目标识别和功能基因组学筛选，增强了目标认证和优先级排序 | 讨论了scRNA-seq技术在制药行业实施中的持续挑战 | 展示scRNA-seq方法在药物发现和开发关键步骤中的应用 | scRNA-seq技术在药物发现和开发中的应用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 343 | 2024-08-08 |
Triple immune modulator therapy for aberrant hyperinflammatory responses in severe COVID-19
2023-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109628
PMID:37119951
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研究论文 | 评估双重（糖皮质激素和托珠单抗）和三重（加上巴瑞替尼）免疫调节疗法对严重COVID-19的临床有效性 | 首次探讨三重免疫调节疗法（糖皮质激素、托珠单抗和巴瑞替尼）对严重COVID-19患者30天恢复的影响，并通过单细胞RNA测序分析其对异常免疫反应的调节作用 | 回顾性队列研究，可能存在选择偏倚和信息偏倚 | 评估双重和三重免疫调节疗法对严重COVID-19的临床效果 | 严重COVID-19患者及其免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 344 | 2024-08-08 |
Identifying Aging and Alzheimer Disease-Associated Somatic Variations in Excitatory Neurons From the Human Frontal Cortex
2023-Jun, Neurology. Genetics
DOI:10.1212/NXG.0000000000200066
PMID:37123987
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研究论文 | 本文通过对比全基因组测序（WGS）数据和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据，设计了一个体细胞突变检测流程，并应用于76名参与者的数据集，以识别与年龄和阿尔茨海默病（AD）相关的体细胞变异。 | 本文首次结合scRNA-seq和WGS数据，成功检测出与AD和年龄相关的体细胞突变，并提供了新的见解。 | NA | 研究阿尔茨海默病（AD）与体细胞突变积累之间的关系，以理解AD的病因。 | 主要关注人类前额叶皮层中的兴奋性神经元。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 全基因组测序（WGS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 76名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 345 | 2024-08-08 |
DNMT3AR882H accelerates angioimmunoblastic T-cell lymphoma in mice
2023-06, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02699-2
PMID:37127775
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研究论文 | 本文研究了DNMT3A突变在血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）中的作用，特别是在小鼠模型中的影响 | 首次报道了DNMT3A突变在AITL中的功能作用，并通过单细胞转录组分析揭示了其分子机制 | NA | 探讨DNMT3A突变在AITL中的功能作用及其分子机制 | DNMT3A突变对AITL的影响，以及其对Tfh细胞和B细胞分化的影响 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠淋巴结样本 | NA | NA | NA | NA |
| 346 | 2024-08-05 |
Deficiency in the omega-3 lysolipid transporter Mfsd2a leads to aberrant oligodendrocyte lineage development and hypomyelination
2023-06-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164118
PMID:37104036
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研究论文 | 该文章探讨了Mfsd2a在少突胶质细胞发育和髓鞘形成中的重要性 | 首次证明Mfsd2a在少突胶质细胞前体细胞的特异性表达及其在髓鞘形成中的关键作用 | 研究未发现Mfsd2a缺失与小头畸形直接相关 | 研究Mfsd2a对少突胶质细胞发育及髓鞘形成的作用 | 使用Mfsd2a-KO小鼠模型和单细胞测序技术研究少突胶质细胞谱系 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq，脂质组学分析 | NA | NA | 使用2aOKO小鼠模型进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 347 | 2024-08-05 |
IRF7 and UNC93B1 variants in an infant with recurrent herpes simplex virus infection
2023-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154016
PMID:37097753
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研究论文 | 这篇文章描述了一名婴儿反复感染单纯疱疹病毒（HSV）的病例及其相关基因变异。 | 本文首次揭示了IRF7和UNC93B1基因变异与新生儿单纯疱疹病毒感染的关系 | 本研究集中于单个病例，样本量较小，限制了结果的普遍性 | 研究新生儿对于单纯疱疹病毒感染的遗传易感性 | 一名新生儿，呈现反复单纯疱疹病毒感染的症状 | 数字病理学 | 单纯疱疹病毒感染 | 外显子组测序 | NA | RNA-Seq | 1名婴儿 | NA | NA | NA | NA |
| 348 | 2024-08-05 |
The journey from melanocytes to melanoma
2023-06, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-023-00565-7
PMID:37095242
|
研究论文 | 本文讨论了黑素细胞从神经嵴到完全成熟的色素黑素细胞的转变过程。 | 提出了黑素细胞生物学的新理解，以及不同黑素细胞亚群和微环境对黑素瘤发生和进展的独特见解。 | 尽管进展显著，但黑素瘤的起源细胞依然存在激烈争论。 | 探索和理解黑素细胞的发育及其在黑素瘤形成中的作用。 | 研究黑素细胞的异质性和转录弹性，以及它们的不同亚群和微环境。 | 数字病理学 | 黑素瘤 | 高通量单细胞测序 | 动物模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 349 | 2024-08-05 |
The MIR34B/C genomic region contains multiple potential regulators of multiciliogenesis
2023-06, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14630
PMID:37102425
|
研究论文 | 本研究探讨了MIR34B/C基因组区域中多个潜在的多纤毛生成调控因子。 | 首次揭示了MIR34B/C基因组区域中BTG4、LAYN和HOATZ与多纤毛生成的关系。 | 研究可能仅限于特定的生物模型，如人类、小鼠和猪，未涵盖其他物种。 | 研究MIR34B/C区域中的调节因子对多纤毛生成的影响。 | 研究涉及的对象包括BTG4、LAYN和HOATZ等基因及其蛋白质表达情况。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序和超分辨率显微镜 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 350 | 2024-08-05 |
Identification of a single cell-based signature for predicting prognosis risk and immunotherapy response in patients with glioblastoma
2023-06, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2023.109345
PMID:37100336
|
研究论文 | 本研究构建了一种基于单细胞和散装测序样本的新基因对特征，以预测胶质母细胞瘤患者的预后风险和免疫疗效 | 提出了一种新的基因对特征，能够有效区分不同的恶性生物学特征并预测预后 | 研究样本主要来自单一医院，可能影响结果的广泛性 | 研究旨在构建有效的基因对特征以预测胶质母细胞瘤的预后和免疫治疗反应 | 研究对象为来自湘雅医院的胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序和散装测序 | 算法模型 | 基因表达数据 | 来自湘雅医院的胶质瘤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of monocytes in HBV-infected pregnant women during mid-pregnancy
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17746
PMID:37078407
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术，研究了HBV感染的孕妇中期妊娠期间单核细胞的转录组特征 | 首次系统地阐明了HBV感染孕妇中单核细胞的固有免疫特征，并识别了单核细胞亚群中的分子驱动因子 | 研究样本量较小，仅包括三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 | 探讨HBV感染孕妇中期妊娠期间单核细胞的免疫反应特征 | HBV感染孕妇和健康孕妇的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三名健康孕妇和三名HBV感染孕妇 | NA | NA | NA | NA |
| 352 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the developmental program underlying proximal-distal patterning of the human lung at the embryonic stage
2023-06, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-023-00802-6
PMID:37085732
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎期肺部近端-远端模式化的发育程序 | 发现了新的转录调控因子（如THRB、EGR3、ETV1和SOX6）以及早期胚胎的BDNF群体，这些发现加深了对人类肺发育中上皮近端-远端模式化的理解 | NA | 探索人类胚胎期肺部发育的近端-远端模式化的调控机制 | 人类胚胎期肺部的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 169,686个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 353 | 2024-08-08 |
Identification of an EMT-related gene-based prognostic signature in osteosarcoma
2023-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.5942
PMID:37102261
|
研究论文 | 本研究构建了一个与上皮-间质转化（EMT）相关的基因签名，用于预测骨肉瘤（OS）的预后 | 提出了一个新的EMT相关基因签名，包括CDK3、MYC、UHRF2、STC2、COL5A2、MMD和EHMT2，用于骨肉瘤的预后预测 | NA | 构建一个与EMT相关的基因签名，用于骨肉瘤的预后预测 | 骨肉瘤患者 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单变量Cox回归分析、LASSO回归分析、逐步多元Cox回归分析、Kaplan-Meier分析、时间依赖性接收器操作特征（ROC）分析、GSVA、ssGSEA、ESTIMATE算法、scRNA-seq | NA | 转录组数据、生存数据 | 来自Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments（TARGET）和Gene Expression Omnibus（GEO）的骨肉瘤患者数据 | NA | NA | NA | NA |
| 354 | 2024-08-08 |
Associations between brain gene expression perturbations implicated by COVID-19 and psychiatric disorders
2023-06, Journal of psychiatric research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.jpsychires.2023.03.033
PMID:37105022
|
研究论文 | 本研究通过整合COVID-19脑组织单细胞RNA测序数据和精神疾病的全基因组关联研究总结统计数据，进行元分析，探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | 首次揭示了COVID-19引起的脑部基因表达扰动与精神分裂症之间的显著关联 | NA | 探讨COVID-19引起的脑部变化与精神疾病遗传易感性之间的关联 | COVID-19脑组织和精神疾病 | 神经科学 | 精神疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 355 | 2024-08-08 |
MLSpatial: A machine-learning method to reconstruct the spatial distribution of cells from scRNA-seq by extracting spatial features
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106873
PMID:37105115
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MLSpatial的新型计算方法，该方法通过学习基因表达模式与细胞空间位置之间的关系，基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据预测细胞间距离分布，从而重建细胞的空间分布。 | MLSpatial方法创新地利用scRNA-seq数据重建细胞的空间分布，这在癌症免疫治疗等需要细胞空间信息的场景中尤为重要。 | MLSpatial的性能依赖于细胞类型，且需要scRNA-seq数据与FISH数据具有相似的背景条件。 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中重建细胞空间分布的计算方法。 | 研究对象包括果蝇胚胎和骨肉瘤细胞的scRNA-seq数据。 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 果蝇胚胎数据包含3039个细胞的FISH数据和1297个高质量细胞的scRNA-seq数据；骨肉瘤数据包含645个细胞的MERFISH数据。 | NA | NA | NA | NA |
| 356 | 2024-08-05 |
Fibroblast and Immune Cell Cross-Talk in Cardiac Fibrosis
2023-06, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-023-01877-8
PMID:37074566
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综述 | 本文全面概述了在心脏疾病中免疫细胞与成纤维细胞之间的相互作用 | 识别了在心肌梗死中可能的促炎成纤维细胞，并探讨了成纤维细胞如何影响炎症细胞行为 | 没有提到具体的实验数据支持或临床试验结果 | 探究心脏损伤背景下炎症与修复反应之间复杂的相互作用 | 关注心脏疾病中的成纤维细胞和炎症细胞 | 心血管疾病 | 心脏纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 357 | 2024-08-05 |
Unraveling the heterogeneity of cholangiocarcinoma and identifying biomarkers and therapeutic strategies with single-cell sequencing technology
2023-Jun, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2023.114697
PMID:37060660
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综述 | 本文旨在利用单细胞测序技术评估胆管癌的异质性，以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 通过单细胞测序技术深入分析胆管癌的肿瘤细胞基因组和表观基因组，提供了癌症进展机制的新见解 | 目前尚未解决的准确诊断方法限制了研究的广泛应用 | 寻找胆管癌的早期诊断生物标志物和改进治疗策略 | 胆管癌细胞及其异质性 | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞测序 | NA | 肿瘤组织 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 358 | 2024-08-08 |
Wnt3a-Loaded Extracellular Vesicles Promote Alveolar Epithelial Regeneration after Lung Injury
2023-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202206606
PMID:37072558
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研究论文 | 本研究开发了一种通过将Wnt3a固定在细胞外囊泡(EVs)表面来远程传递Wnt3a的策略，以促进肺损伤后的肺泡上皮再生 | 本研究创新性地利用细胞外囊泡作为载体，有效解决了Wnt蛋白亲水性差的问题，并成功验证了其在肺泡上皮细胞再生中的生物活性 | NA | 探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)治疗的新方法 | Wnt3a细胞外囊泡在肺损伤后肺泡上皮再生中的作用 | NA | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 359 | 2024-08-08 |
Clustering ensemble in scRNA-seq data analysis: Methods, applications and challenges
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106939
PMID:37075602
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据分析中聚类集成方法的应用、挑战及未来方向 | 聚类集成方法能提高单细胞转录组数据分析的准确性和可靠性 | 不同聚类方法产生的结果存在差异，不稳定的分区会影响分析的准确性 | 总结聚类集成方法在单细胞转录组数据分析中的应用和挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 360 | 2024-08-05 |
exFINDER: identify external communication signals using single-cell transcriptomics data
2023-06-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad262
PMID:37026478
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研究论文 | 本文提出了一种名为exFINDER的方法，用于识别单细胞转录组数据中细胞接收到的外部通信信号 | exFINDER利用信号通路的先验知识，首次识别了细胞从外部系统接收到的信号 | 目前研究主要依赖于现有的单细胞转录组数据，可能受数据质量和充分性的限制 | 研究目的在于揭示单细胞转录组数据中的外部信号及其对目标基因的激活作用 | 涉及单细胞转录组(scRNA-seq)数据，应用于不同物种的细胞数据集 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 (scRNA-seq) | NA | 数据集中的转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |