单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 417 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2024-08-08 |
Remodeling of the immune and stromal cell compartment by PD-1 blockade in mismatch repair-deficient colorectal cancer
2023-06-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.04.011
PMID:37172580
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了错配修复缺陷和微卫星不稳定性高（d-MMR/MSI-H）结直肠癌患者在接受新辅助PD-1阻断治疗后，免疫和基质细胞的动态变化。 | 研究发现，在病理完全反应（pCR）的肿瘤中，治疗后CD8 Trm-mitotic、CD4 Tregs、促炎性IL1B Mono和CCL2 Fibroblast的数量减少，而CD8 Tem、CD4 Th、CD20 B和HLA-DRA Endothelial细胞的比例增加。 | NA | 揭示免疫检查点抑制剂治疗成功机制，并寻找提高治疗效果的潜在靶点。 | 错配修复缺陷和微卫星不稳定性高的结直肠癌患者。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 322 | 2024-08-05 |
Mathematics of neural stem cells: Linking data and processes
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203849
PMID:37179018
|
综述 | 本文解释了数学建模如何改善对成人大脑中干细胞动态的机制理解 | 结合单细胞测序技术和数学建模，为干细胞生物学领域的一些重要问题提供了独特的机会 | NA | 探讨成人干细胞动态的数学建模及单细胞测序的影响 | 成人干细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 数学模型 | 细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 323 | 2024-08-05 |
Early alterations in the MCH system link aberrant neuronal activity and sleep disturbances in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01325-4
PMID:37188873
|
研究论文 | 本研究表明MCH系统在早期阿尔茨海默病中的变化与异常神经活动和睡眠障碍相关 | 发现MCH系统在早期阿尔茨海默病中脆弱，且其功能受损与异常兴奋性驱动和睡眠缺陷相关 | 未提及特定的样本限制或实验条件的局限性 | 研究MCH系统在早期阿尔茨海默病中的作用及其对神经活动和睡眠质量的影响 | 使用阿尔茨海默病小鼠模型作为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 细胞和神经元活动数据 | App小鼠和阿尔茨海默病患者的样本 | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2024-08-05 |
Hes1 marks peri-condensation mesenchymal cells that generate both chondrocytes and perichondrial cells in early bone development
2023-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104805
PMID:37172728
|
研究论文 | 本研究展示了围绕凝聚体的间充质细胞对软骨和膜软骨的贡献 | 首次明确了Hes1标记的间充质细胞在早期骨发育中的重要性 | 未探讨Hes1在不同发育阶段的功能变化 | 探究早期骨发育中间充质细胞的角色 | 位于骨骼发育中的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | Prrx1-cre标记的肢芽间充质细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 325 | 2024-08-05 |
VISTA: Visualizing the Spatial Transcriptome of the C. elegans Nervous System
2023-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.28.538711
PMID:37163055
|
研究论文 | VISTA通过可视化线虫神经系统的空间转录组来展示基因表达。 | 提出了一种利用现有数据集对线虫空间转录组进行可视化的新方法，专注于神经系统。 | 技术的应用范围可能受到现有数据集的限制，以及模型可能无法应用于所有动物物种。 | 实现单细胞分辨率和全转录组覆盖的空间转录组分析。 | 线虫的神经系统及其神经元的基因表达。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用现有单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics allows novel insights into the endocrine-disrupting chemicals induced mammalian reproductive disorder
2023-Jun-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.114971
PMID:37163908
|
研究论文 | 本研究探讨了内分泌干扰化学物质（EDCs）对哺乳动物生殖障碍的影响 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术深入分析EDCs对生殖发展的干扰机制 | 未提及特定的样本规模或实验条件的限制 | 探讨EDCs对哺乳动物生殖系统的毒性机制 | 哺乳动物的生殖健康，特别是EDCs引起的生殖功能相关疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 327 | 2024-08-05 |
Predicting cellular responses to complex perturbations in high-throughput screens
2023-06-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211517
PMID:37154091
|
研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法，名为成分扰动自编码器（CPA），用于预测细胞对复杂扰动的反应 | CPA结合了线性模型的可解释性和深度学习方法的灵活性，能够高效预测未见剂量、细胞类型、时间点和物种的转录扰动反应 | 本研究依赖于未见药物的预测，可能对某些药物组合的通用性不足 | 研究旨在开发计算方法以预测和解释细胞对药物和遗传扰动的反应 | 研究对象为单细胞的转录扰动反应 | 计算机视觉 | NA | 高通量筛选 | 自编码器 | 单细胞转录组数据 | 生成了新单细胞药物组合数据，补全了5,329个缺失组合 | NA | NA | NA | NA |
| 328 | 2024-08-08 |
Microglia modulate general anesthesia through P2Y12 receptor
2023-06-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.04.047
PMID:37167975
|
研究论文 | 本文揭示了小胶质细胞通过P2Y12受体调节全身麻醉的机制 | 首次证明了小胶质细胞通过P2YR介导的信号传导积极参与全身麻醉的多个过程，扩展了小胶质细胞在脑中的非免疫角色 | NA | 探讨小胶质细胞在全身麻醉中的作用及其机制 | 小胶质细胞及其在全身麻醉中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 329 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene CDKN2A as a molecular target for IPF diagnosis and therapeutics
2023-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-023-01739-7
PMID:37166466
|
研究论文 | 本研究探讨了CDKN2A作为特发性肺纤维化（IPF）诊断和治疗的分子靶点 | 首次提出CDKN2A基因在IPF发展中的重要作用，并揭示其与M2巨噬细胞和cuproptosis的关系 | 研究的样本量及范围尚未明确，可能影响结果的普遍性 | 探讨cuproptosis相关基因在IPF中的预后和治疗潜力 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本及相关细胞模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA序列分析 | NA | 基因表达数据 | IPF患者肺组织样本及小鼠实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 330 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in human skin research
2023-06, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14827
PMID:37150587
|
评论 | 本研究总结了空间转录组学在皮肤研究中的应用和方法 | 介绍了空间转录组学技术在皮肤组织中的创新应用 | 缺乏对不同皮肤疾病的具体实验数据支持 | 旨在促进对皮肤功能和病理的理解 | 不同皮肤疾病的基因表达和细胞定位 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 331 | 2024-08-05 |
Matrix metalloproteinases in arthritis: towards precision medicine
2023-06, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-00966-w
PMID:37161083
|
研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶在关节炎中的作用，旨在推动精准医学的发展 | 该研究突出强调了MMP在关节修整中的双重作用，及其在自身免疫过程中产生持久表位的机制 | 未提及具体的样本数据和临床试验结果 | 研究MMP在关节退化和自身免疫过程中在不同疾病阶段的作用与调节 | 关节相关疾病患者的ECM降解和MMP的作用 | 数字病理学 | 关节炎 | 蛋白质组学和单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 332 | 2024-08-08 |
A comprehensive analysis of single-cell RNA transcriptome reveals unique SPP1+ chondrocytes in human osteoarthritis
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106926
PMID:37141654
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中的SPP1+软骨细胞，揭示了其在骨关节炎中的独特作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞，发现了高表达SPP1的独特软骨细胞群 | 研究主要集中在骨关节炎软骨细胞的发生和发展，缺乏对正常软骨细胞发育的分析 | 旨在更好地理解骨关节炎的机制，特别是SPP1在骨关节炎中的作用 | 人骨关节炎中的软骨细胞和SPP1表达 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 333 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse lower respiratory tract epithelial cells: A meta-analysis
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203847
PMID:37146757
|
研究论文 | 本文通过元分析七项不同的研究，建立了小鼠下呼吸道上皮细胞的单细胞转录组图谱 | 本文首次系统地注释了小鼠肺部所有上皮细胞类型，并提供了每种上皮细胞类型的最佳标记物 | NA | 深入理解呼吸系统中不同部位的细胞组成和功能，以及其在各种疾病中的病理过程 | 小鼠下呼吸道上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 七项不同研究中的小鼠肺和气管样本 | NA | NA | NA | NA |
| 334 | 2024-08-08 |
ScRNA-Seq Reveals a Distinct Osteogenic Progenitor of Alveolar Bone
2023-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231159821
PMID:37148259
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠牙槽骨细胞的单细胞图谱，揭示了牙槽骨中一种新的骨生成前体细胞群体Fat4细胞 | 发现了牙槽骨中一种新的细胞群体Fat4细胞，并证明了其在牙槽骨骨生成分化轨迹中的独特作用 | NA | 揭示牙槽骨中骨髓间充质干细胞的异质性及其骨生成分化轨迹 | 小鼠牙槽骨细胞及其骨生成前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙槽骨细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 335 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals a distinct immune profile fostered by T cell-B cell crosstalk in triple negative breast cancer
2023-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12429
PMID:37158690
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌中由T细胞-B细胞相互作用促进的独特免疫特征 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌中T细胞-B细胞相互作用对免疫微环境的独特影响，并建立了一个预测三阴性乳腺癌患者预后的标志物 | NA | 描绘和比较三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫景观 | 三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 117,958个免疫细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 336 | 2024-08-08 |
Tenofovir alters the immune microenvironment of pregnant women with hepatitis B virus infection: Evidence from single-cell RNA sequencing
2023-Jun, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2023.110245
PMID:37163920
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫微环境的影响 | 首次揭示了替诺福韦治疗后妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女外周血单个核细胞的细胞亚型和分子特征的变化 | 研究样本量较小，仅包括三名妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女 | 探讨替诺福韦治疗对妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女免疫功能的影响 | 妊娠期乙型肝炎病毒感染妇女的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 | 细胞 | 6个样本，共68,200个外周血单个核细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 337 | 2024-08-08 |
EGFR marks a subpopulation of dermal mesenchymal cells highly expressing IGF1 which enhances hair follicle regeneration
2023-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17766
PMID:37165726
|
研究论文 | 本研究旨在识别通过旁分泌机制增强毛囊再生的新型真皮间充质细胞亚群 | 发现表皮生长因子受体（EGFR）标记的真皮间充质细胞亚群，这些细胞高表达胰岛素样生长因子1（IGF1），有助于毛囊新生 | NA | 识别新型真皮间充质细胞亚群，探讨其在毛囊再生中的作用 | 真皮间充质细胞及其在毛囊再生中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光染色、流式细胞术（FACS） | NA | RNA | 新生和成年小鼠的真皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 338 | 2024-08-08 |
Inferring cell diversity in single cell data using consortium-scale epigenetic data as a biological anchor for cell identity
2023-06-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkad307
PMID:37125641
|
研究论文 | 本文介绍了TRIAGE-Cluster和TRIAGE-ParseR方法，利用全基因组表观遗传数据识别单细胞RNA测序数据中的细胞多样性 | 提出了基于全基因组表观遗传数据和加权密度估计的细胞类型聚类方法，以及评估基因表达排名列表的机器学习方法 | NA | 开发新的方法来解析单细胞RNA测序数据中的细胞多样性和基因调控 | 单细胞RNA测序数据中的细胞多样性和基因调控 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 多种生物样本 | NA | NA | NA | NA |
| 339 | 2024-08-05 |
Single-cell RNA-seq with spatial transcriptomics to create an atlas of human diabetic kidney disease
2023-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202202013RR
PMID:37130011
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和空间转录组分析探索糖尿病肾病的细胞群体和相互作用 | 首次将单细胞RNA-seq与空间转录组学结合，以创建人类糖尿病肾病的细胞图谱 | 样本量和数据范围可能限制了研究结果的广泛适用性 | 研究糖尿病肾病中细胞群体及其相互作用 | 来自糖尿病患者的肾脏标本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序和空间转录组分析 | NA | 组织标本 | 糖尿病患者的肾脏标本（具体样本数量未提供） | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2024-08-05 |
Perivascular localized cells commit erythropoiesis in PDGF-B-expressing solid tumors
2023-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12423
PMID:37120719
|
研究论文 | 该研究探讨了肿瘤微环境中血管周围局部细胞如何影响红细胞生成 | 揭示了肿瘤组织中血管周围局部细胞参与红细胞生成的新机制 | 缺乏对人类肿瘤的直接临床验证 | 了解肿瘤组织中血管周围细胞对红细胞生成的影响 | 小鼠衍生的血管周围局部细胞和肿瘤微环境中的血液生成过程 | 数字病理学 | 癌症 | RNA测序、qPCR、ELISA | NA | 细胞、基因表达数据 | 小鼠模型的特定细胞样本 | NA | NA | NA | NA |