单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2024-08-05 |
Correction to 'Spike-in normalization for single-cell RNA-seq reveals dynamic global transcriptional activity mediating anticancer drug response'
2023-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad046
PMID:37206628
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更正 | 这篇文章对原文进行了更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2024-08-07 |
Germ-cell-specific transcriptome analysis illuminates the chromatin and ubiquitin pathway in autism spectrum disorders
2023-06, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research
IF:5.3Q1
DOI:10.1002/aur.2939
PMID:37204624
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据集，分析了与自闭症谱系障碍（ASD）相关的染色质和泛素途径 | 首次揭示了germ细胞中表观遗传染色体重塑和泛素-蛋白酶体途径的失调可能是神经发育障碍的风险因素 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞系的单细胞转录组数据，未涉及人类样本 | 探究germ细胞中与自闭症谱系障碍相关的染色质和泛素途径 | 13个细胞系，包括12个与ASD相关的CNVs模型和对照组 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 13个细胞系 |
| 303 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing data reveals the genetic source of extracellular vesicles in esophageal squamous cell carcinoma
2023-06, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2023.106800
PMID:37217040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了食管鳞状细胞癌中的细胞亚群，并追踪了外泌体的遗传来源 | 首次揭示了食管鳞状细胞癌中恶性与非恶性组织外泌体的遗传来源及其与细胞间相互作用的关系 | 研究样本仅包括六名食管鳞状细胞癌患者，可能影响结果的普遍性 | 探究食管鳞状细胞癌中外泌体的细胞来源及未知的分子和细胞机制 | 食管鳞状细胞癌中的外泌体及其细胞来源 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 六名食管鳞状细胞癌患者 |
| 304 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals diverse immune cell populations and their responses to viral infection in the spleen of zebrafish
2023-06, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202201505RRRR
PMID:37227178
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了斑马鱼脾脏中多种免疫细胞类型及其对病毒感染的反应 | 首次在斑马鱼脾脏中识别出11种主要的免疫细胞类别及其54种潜在亚型，并展示了这些亚型对鲤春病毒血症病毒感染的不同反应 | NA | 旨在通过比较免疫学研究，增进对脊椎动物免疫系统设计原理的理解 | 斑马鱼脾脏中的免疫细胞类型及其对病毒感染的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 斑马鱼脾脏中的白细胞 |
| 305 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Atlas of Newcastle Disease Virus in Chickens Both In Vitro and In Vivo
2023-06-15, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.05121-22
PMID:37191506
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了新城疫病毒（NDV）感染鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1的异质性反应 | 首次在单细胞转录组水平上描述了NDV在鸡肺中的目标细胞类型，并区分了病毒感染和未感染细胞，揭示了病毒感染后的主要信号通路和细胞间通讯 | NA | 研究新城疫病毒（NDV）在鸡体内的细胞内复制及其在不同细胞类型中宿主反应的异质性 | 鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1 | 数字病理学 | 家禽疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及鸡肺组织细胞和鸡胚成纤维细胞系DF-1的多个细胞样本 |
| 306 | 2024-08-08 |
Remodeling of the immune and stromal cell compartment by PD-1 blockade in mismatch repair-deficient colorectal cancer
2023-06-12, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.04.011
PMID:37172580
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了错配修复缺陷和微卫星不稳定性高（d-MMR/MSI-H）结直肠癌患者在接受新辅助PD-1阻断治疗后，免疫和基质细胞的动态变化。 | 研究发现，在病理完全反应（pCR）的肿瘤中，治疗后CD8 Trm-mitotic、CD4 Tregs、促炎性IL1B Mono和CCL2 Fibroblast的数量减少，而CD8 Tem、CD4 Th、CD20 B和HLA-DRA Endothelial细胞的比例增加。 | NA | 揭示免疫检查点抑制剂治疗成功机制，并寻找提高治疗效果的潜在靶点。 | 错配修复缺陷和微卫星不稳定性高的结直肠癌患者。 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 19名患者 |
| 307 | 2024-08-05 |
Mathematics of neural stem cells: Linking data and processes
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203849
PMID:37179018
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综述 | 本文解释了数学建模如何改善对成人大脑中干细胞动态的机制理解 | 结合单细胞测序技术和数学建模，为干细胞生物学领域的一些重要问题提供了独特的机会 | NA | 探讨成人干细胞动态的数学建模及单细胞测序的影响 | 成人干细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 数学模型 | 细胞数据 | NA |
| 308 | 2024-08-05 |
Early alterations in the MCH system link aberrant neuronal activity and sleep disturbances in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-023-01325-4
PMID:37188873
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研究论文 | 本研究表明MCH系统在早期阿尔茨海默病中的变化与异常神经活动和睡眠障碍相关 | 发现MCH系统在早期阿尔茨海默病中脆弱，且其功能受损与异常兴奋性驱动和睡眠缺陷相关 | 未提及特定的样本限制或实验条件的局限性 | 研究MCH系统在早期阿尔茨海默病中的作用及其对神经活动和睡眠质量的影响 | 使用阿尔茨海默病小鼠模型作为研究对象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 细胞和神经元活动数据 | App小鼠和阿尔茨海默病患者的样本 |
| 309 | 2024-08-05 |
Hes1 marks peri-condensation mesenchymal cells that generate both chondrocytes and perichondrial cells in early bone development
2023-06, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.104805
PMID:37172728
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研究论文 | 本研究展示了围绕凝聚体的间充质细胞对软骨和膜软骨的贡献 | 首次明确了Hes1标记的间充质细胞在早期骨发育中的重要性 | 未探讨Hes1在不同发育阶段的功能变化 | 探究早期骨发育中间充质细胞的角色 | 位于骨骼发育中的间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | Prrx1-cre标记的肢芽间充质细胞 |
| 310 | 2024-08-05 |
VISTA: Visualizing the Spatial Transcriptome of the C. elegans Nervous System
2023-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.28.538711
PMID:37163055
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研究论文 | VISTA通过可视化线虫神经系统的空间转录组来展示基因表达。 | 提出了一种利用现有数据集对线虫空间转录组进行可视化的新方法，专注于神经系统。 | 技术的应用范围可能受到现有数据集的限制，以及模型可能无法应用于所有动物物种。 | 实现单细胞分辨率和全转录组覆盖的空间转录组分析。 | 线虫的神经系统及其神经元的基因表达。 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用现有单细胞转录组数据集 |
| 311 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics allows novel insights into the endocrine-disrupting chemicals induced mammalian reproductive disorder
2023-Jun-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2023.114971
PMID:37163908
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研究论文 | 本研究探讨了内分泌干扰化学物质（EDCs）对哺乳动物生殖障碍的影响 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术深入分析EDCs对生殖发展的干扰机制 | 未提及特定的样本规模或实验条件的限制 | 探讨EDCs对哺乳动物生殖系统的毒性机制 | 哺乳动物的生殖健康，特别是EDCs引起的生殖功能相关疾病 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | NA |
| 312 | 2024-08-05 |
Predicting cellular responses to complex perturbations in high-throughput screens
2023-06-12, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.202211517
PMID:37154091
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研究论文 | 本文提出了一种新的计算方法，名为成分扰动自编码器（CPA），用于预测细胞对复杂扰动的反应 | CPA结合了线性模型的可解释性和深度学习方法的灵活性，能够高效预测未见剂量、细胞类型、时间点和物种的转录扰动反应 | 本研究依赖于未见药物的预测，可能对某些药物组合的通用性不足 | 研究旨在开发计算方法以预测和解释细胞对药物和遗传扰动的反应 | 研究对象为单细胞的转录扰动反应 | 计算机视觉 | NA | 高通量筛选 | 自编码器 | 单细胞转录组数据 | 生成了新单细胞药物组合数据，补全了5,329个缺失组合 |
| 313 | 2024-08-08 |
Microglia modulate general anesthesia through P2Y12 receptor
2023-06-05, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2023.04.047
PMID:37167975
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研究论文 | 本文揭示了小胶质细胞通过P2Y12受体调节全身麻醉的机制 | 首次证明了小胶质细胞通过P2YR介导的信号传导积极参与全身麻醉的多个过程，扩展了小胶质细胞在脑中的非免疫角色 | NA | 探讨小胶质细胞在全身麻醉中的作用及其机制 | 小胶质细胞及其在全身麻醉中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠 |
| 314 | 2024-08-05 |
Cuproptosis-related gene CDKN2A as a molecular target for IPF diagnosis and therapeutics
2023-Jun, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-023-01739-7
PMID:37166466
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研究论文 | 本研究探讨了CDKN2A作为特发性肺纤维化（IPF）诊断和治疗的分子靶点 | 首次提出CDKN2A基因在IPF发展中的重要作用，并揭示其与M2巨噬细胞和cuproptosis的关系 | 研究的样本量及范围尚未明确，可能影响结果的普遍性 | 探讨cuproptosis相关基因在IPF中的预后和治疗潜力 | 特发性肺纤维化患者的肺组织样本及相关细胞模型 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA序列分析 | NA | 基因表达数据 | IPF患者肺组织样本及小鼠实验样本 |
| 315 | 2024-08-05 |
Spatial transcriptomics in human skin research
2023-06, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14827
PMID:37150587
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评论 | 本研究总结了空间转录组学在皮肤研究中的应用和方法 | 介绍了空间转录组学技术在皮肤组织中的创新应用 | 缺乏对不同皮肤疾病的具体实验数据支持 | 旨在促进对皮肤功能和病理的理解 | 不同皮肤疾病的基因表达和细胞定位 | 数字病理学 | 皮肤病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达 | NA |
| 316 | 2024-08-05 |
Matrix metalloproteinases in arthritis: towards precision medicine
2023-06, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-023-00966-w
PMID:37161083
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研究论文 | 本文探讨了基质金属蛋白酶在关节炎中的作用，旨在推动精准医学的发展 | 该研究突出强调了MMP在关节修整中的双重作用，及其在自身免疫过程中产生持久表位的机制 | 未提及具体的样本数据和临床试验结果 | 研究MMP在关节退化和自身免疫过程中在不同疾病阶段的作用与调节 | 关节相关疾病患者的ECM降解和MMP的作用 | 数字病理学 | 关节炎 | 蛋白质组学和单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 317 | 2024-08-08 |
A comprehensive analysis of single-cell RNA transcriptome reveals unique SPP1+ chondrocytes in human osteoarthritis
2023-06, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2023.106926
PMID:37141654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人骨关节炎中的SPP1+软骨细胞，揭示了其在骨关节炎中的独特作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术分析了包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞，发现了高表达SPP1的独特软骨细胞群 | 研究主要集中在骨关节炎软骨细胞的发生和发展，缺乏对正常软骨细胞发育的分析 | 旨在更好地理解骨关节炎的机制，特别是SPP1在骨关节炎中的作用 | 人骨关节炎中的软骨细胞和SPP1表达 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 包含正常和骨关节炎软骨的大量细胞 |
| 318 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse lower respiratory tract epithelial cells: A meta-analysis
2023-06, Cells & development
IF:2.1Q3
DOI:10.1016/j.cdev.2023.203847
PMID:37146757
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研究论文 | 本文通过元分析七项不同的研究，建立了小鼠下呼吸道上皮细胞的单细胞转录组图谱 | 本文首次系统地注释了小鼠肺部所有上皮细胞类型，并提供了每种上皮细胞类型的最佳标记物 | NA | 深入理解呼吸系统中不同部位的细胞组成和功能，以及其在各种疾病中的病理过程 | 小鼠下呼吸道上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性呼吸疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 七项不同研究中的小鼠肺和气管样本 |
| 319 | 2024-08-08 |
ScRNA-Seq Reveals a Distinct Osteogenic Progenitor of Alveolar Bone
2023-06, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345231159821
PMID:37148259
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了小鼠牙槽骨细胞的单细胞图谱，揭示了牙槽骨中一种新的骨生成前体细胞群体Fat4细胞 | 发现了牙槽骨中一种新的细胞群体Fat4细胞，并证明了其在牙槽骨骨生成分化轨迹中的独特作用 | NA | 揭示牙槽骨中骨髓间充质干细胞的异质性及其骨生成分化轨迹 | 小鼠牙槽骨细胞及其骨生成前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠牙槽骨细胞 |
| 320 | 2024-08-08 |
Single-cell atlas reveals a distinct immune profile fostered by T cell-B cell crosstalk in triple negative breast cancer
2023-06, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12429
PMID:37158690
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌中由T细胞-B细胞相互作用促进的独特免疫特征 | 本研究首次揭示了三阴性乳腺癌中T细胞-B细胞相互作用对免疫微环境的独特影响，并建立了一个预测三阴性乳腺癌患者预后的标志物 | NA | 描绘和比较三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫景观 | 三阴性乳腺癌、HER2阳性乳腺癌和腔内乳腺癌的免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 117,958个免疫细胞 |