单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 409 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2024-08-07 |
A dynamical systems treatment of transcriptomic trajectories in hematopoiesis
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201280
PMID:37260149
|
研究论文 | 本文提出了一种数学方法，从动力系统角度严格评估单细胞RNA测序（scRNA-seq）轨迹是否显示与分叉一致的统计特征，并以中性粒细胞分支的造血分化为例进行了研究。 | 本文利用线性不稳定性的几何特征，识别了基因表达空间中低维相平面，揭示了中性粒细胞分化中的关键新基因。 | NA | 旨在从动力系统角度提供对细胞分化高维过程的机制性见解，并朝向构建转录组动力学的数学模型的系统化迈进。 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化过程 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 动力系统模型 | 基因表达数据 | 大量分化细胞的群体 |
| 282 | 2024-08-07 |
Epigenomic landscape exhibits interferon signaling suppression in the patient of myocarditis after BNT162b2 vaccination
2023-06-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36070-y
PMID:37264110
|
研究论文 | 本研究首次追踪了接种BNT162b2疫苗后发生心肌炎患者的周围血单核细胞（PBMCs）染色质动态变化 | 首次研究了接种BNT162b2疫苗后心肌炎患者的PBMCs染色质可及性变化，并发现干扰素信号下调和RUNX2/3活性上调 | NA | 探讨BNT162b2疫苗接种后心肌炎的免疫反应机制 | 接种BNT162b2疫苗后发生心肌炎的患者的周围血单核细胞（PBMCs） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 283 | 2024-08-07 |
The glycine receptor alpha 3 subunit mRNA expression shows sex-dependent differences in the adult mouse brain
2023-06-01, BMC neuroscience
IF:2.4Q3
DOI:10.1186/s12868-023-00800-9
PMID:37264306
|
研究论文 | 研究探讨了成年小鼠大脑中甘氨酸受体α3亚基mRNA表达的性别依赖性差异 | 首次揭示了甘氨酸受体α3亚基在小鼠中枢神经系统中的广泛但低水平的表达，并发现了明显的性别依赖性差异 | NA | 研究甘氨酸受体α3亚基在小鼠神经系统及其他外周器官中的mRNA表达 | 小鼠中枢神经系统中的甘氨酸受体α3亚基mRNA表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量实时PCR(qRT-PCR)、RNAscope | NA | mRNA | 雌性和雄性小鼠的多个脑区和外周器官 |
| 284 | 2024-08-07 |
An N6-methyladenosine regulation- and mRNAsi-related prognostic index reveals the distinct immune microenvironment and immunotherapy responses in lower-grade glioma
2023-Jun-01, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-023-05328-7
PMID:37264314
|
研究论文 | 本文通过整合N6-甲基腺苷（m6A）修饰和干细胞标志物mRNAsi，构建了一个与m6A调控和mRNAsi相关的预后指数（MRMRPI），用于分类低级别胶质瘤患者并预测其预后 | 本文首次将m6A甲基化调控与肿瘤干细胞标志物mRNAsi结合，构建预后指数，揭示了低级别胶质瘤中免疫微环境的差异及免疫治疗反应 | NA | 研究m6A甲基化调控与肿瘤干细胞标志物在低级别胶质瘤发展中的相互作用，并为更精确的免疫治疗策略提供指导 | 低级别胶质瘤（LGG）患者 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 共识聚类、加权基因共表达网络分析、最小绝对收缩和选择算子Cox回归分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及10个基因（DGCR10, CYP2E1, CSMD3, HOXB3, CABP4, AVIL, PTCRA, TIMP1, CLEC18A, SAMD9） |
| 285 | 2024-08-07 |
Consensus label propagation with graph convolutional networks for single-cell RNA sequencing cell type annotation
2023-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad360
PMID:37267208
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于图卷积网络（GCN）的方法，用于自动化单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的细胞类型注释 | 该方法通过共识和半监督GCN传播高置信度标签，提高了注释的准确性，并允许特征解释，识别细胞类型分类的重要基因 | NA | 自动化和解释单细胞RNA测序数据的分类 | 单细胞RNA测序数据的细胞类型注释 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图卷积网络（GCN） | 基因表达数据 | 使用模拟数据和来自不同组织的两个scRNA-seq数据集进行验证 |
| 286 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals a mechanism underlying the susceptibility of the left atrial appendage to intracardiac thrombogenesis during atrial fibrillation
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1297
PMID:37278111
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，揭示了心房颤动期间左心耳易形成血栓的分子机制 | 首次展示了心房颤动患者左心耳与右心耳的单细胞转录组比较，并发现了左心耳内皮细胞向成纤维细胞的表型转换及炎症相关变化 | 研究样本量较小，仅包括三名患者，且未涉及更多不同类型的心房颤动患者 | 探究心房颤动期间左心耳易形成血栓的分子机制 | 心房颤动患者的左心耳和右心耳组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 三名持续性心房颤动患者的匹配左心耳样本 |
| 287 | 2024-08-07 |
Myc promotes polyploidy in murine trophoblast cells and suppresses senescence
2023-06-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.201581
PMID:37278344
|
研究论文 | 本研究探讨了Myc在鼠胎盘滋养层细胞中促进多倍体化并抑制衰老的作用 | 首次揭示了Myc是多倍体化和正常胎盘发育的关键调控因子，并防止过早衰老 | NA | 研究Myc在胎盘发育中的作用及其对多倍体化和衰老的影响 | 鼠胎盘滋养层巨细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 288 | 2024-08-07 |
The tumor immune microenvironment of nasopharyngeal carcinoma after gemcitabine plus cisplatin treatment
2023-Jun, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-023-02369-6
PMID:37280275
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞及B细胞受体测序，分析了吉西他滨联合顺铂（GP）化疗后鼻咽癌（NPC）肿瘤免疫微环境的变化 | 首次揭示了GP化疗激活以先天样B细胞（ILB）为主的抗肿瘤免疫反应的机制，并验证了ILB作为GP治疗NPC的潜在生物标志物 | NA | 探究GP化疗后鼻咽癌肿瘤免疫微环境的变化及其机制 | 鼻咽癌患者在接受GP化疗前后的肿瘤样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，T细胞和B细胞受体测序 | NA | 基因表达数据 | 15对治疗前和治疗后的鼻咽癌样本，以及139名和380名接受GP化疗和免疫治疗联合治疗的鼻咽癌患者 |
| 289 | 2024-08-07 |
Diverse intratumoral heterogeneity and immune microenvironment of two HPV-related cervical cancer types revealed by single-cell RNA sequencing
2023-06, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28857
PMID:37287196
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了人乳头瘤病毒相关宫颈鳞状细胞癌（SCC）和腺癌（AD）在肿瘤异质性和肿瘤微环境（TME）中的细胞差异 | 首次详细描述了SCC和AD在细胞类型特异性分子差异、信号通路调控和免疫细胞浸润模式上的不同 | 研究样本仅包括三名SCC和三名AD患者，可能不足以代表所有病例 | 阐明SCC和AD在肿瘤异质性和肿瘤微环境中的细胞差异，并提出潜在的治疗策略 | 宫颈鳞状细胞癌（SCC）和腺癌（AD）的细胞类型特异性分子差异 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 61,723个细胞，来自三名SCC和三名AD患者 |
| 290 | 2024-08-07 |
Integrative analysis reveals marker genes for intestinal mucosa barrier repairing in clinical patients
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106831
PMID:37250791
|
研究论文 | 本研究旨在识别肠道修复的生物标志物，并为改善肠道炎症或损伤后的功能恢复和预后表现提供潜在的治疗线索 | 通过大规模筛选多个转录组和单细胞RNA测序数据集，识别出10个潜在的肠道屏障修复标志基因，并在临床研究中验证了这些基因的表达与肠道功能恢复的关联 | NA | 识别肠道修复的生物标志物，改善肠道炎症或损伤后的功能恢复和预后表现 | 炎症性肠病患者的肠道修复标志基因 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 11名接受回肠切除术的患者 |
| 291 | 2024-08-05 |
Silicon chambers for enhanced incubation and imaging of microfluidic droplets
2023-Jun-13, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc01143c
PMID:37255014
|
研究论文 | 这篇文章展示了硅材料在微流体液滴成像和培养中的应用 | 提出了使用硅作为液滴腔体的理想材料，优于常用的PDMS | 未明确讨论硅相较于其他材料的长期稳定性 | 旨在提升微流体液滴的成像和培养效果 | 使用约150,000个液滴的多重数字分析 | 微流体学 | NA | NA | NA | NA | 大约150,000个液滴 |
| 292 | 2024-08-05 |
Exceeding 80% Efficiency of Single-Bead Encapsulation in Microdroplets through Hydrogel Coating-Assisted Close-Packed Ordering
2023-06-13, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.3c00425
PMID:37233805
|
研究论文 | 本文提出了一种高效的单微珠包裹在微滴中的方法，效率超过80% | 引入了水凝胶涂层辅助的紧密包装排序策略，显著提高了微珠加载效率，且对原材料微珠选择不敏感 | 该策略虽然对微珠的选择不敏感，但尚未测试其他类型微珠的实际应用效果 | 旨在提高微滴中单微珠的高效封装能力，以促进单细胞基因组学和数字免疫测定等高通量分析 | 研究对象为聚苯乙烯微珠和HEK293T细胞 | 数字病理学 | NA | 微流体装置，水凝胶涂层 | NA | 实验数据 | 单个30微米聚苯乙烯微珠的实验，和HEK293T细胞与分散条形码微珠共同包裹的实验 |
| 293 | 2024-08-05 |
Deconvolution of spatial sequencing provides accurate characterization of hESC-derived DA transplants in vivo
2023-Jun-08, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2023.04.008
PMID:37251982
|
研究论文 | 本文通过空间转录组分析探讨了人在体内来源于人胚胎干细胞的多巴胺移植物的特征 | 首次开展对完全分化的移植物进行空间转录组分析，发现其多巴胺能特征的成熟性 | 对移植物成熟后的转录组分析仍需进一步探讨 | 旨在精确表征源自人胚胎干细胞的多巴胺移植物 | 研究对象为在体内的人胚胎干细胞衍生的多巴胺移植物 | 数字病理学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 重复的植入物样本 |
| 294 | 2024-08-05 |
IndepthPathway: an integrated tool for in-depth pathway enrichment analysis based on single-cell sequencing data
2023-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad325
PMID:37243667
|
研究论文 | 该文章开发了一个整合工具IndepthPathway，用于基于单细胞转录组的数据进行深入的通路富集分析 | 文章创新性地提出了加权概念签名富集分析方法，专门针对单细胞转录组的通路富集分析，能够处理高噪音和低基因覆盖的问题 | 文章没有明确提到具体的局限性 | 研究旨在提升单细胞测序数据中通路分析的科学严谨性 | 研究对象为单细胞转录组数据和与之匹配的整体RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 加权概念签名富集分析 | 基因表达数据 | 使用了模拟技术变异和dropout的基因表达特征的scRNA-seq数据，以及匹配的单细胞和整体RNAseq数据的真实数据集 |
| 295 | 2024-08-05 |
Myelin dysfunction drives amyloid-β deposition in models of Alzheimer's disease
2023-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06120-6
PMID:37258678
|
研究论文 | 该文章探讨了髓鞘功能障碍如何促进阿尔茨海默病中淀粉样β沉积的过程 | 首次提出髓鞘完整性的丧失可能是神经元淀粉样β沉积的上游风险因素 | 文章主要基于小鼠模型，临床适用性可能存在局限性 | 研究髓鞘功能障碍在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 基因组学，单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 多种小鼠模型，具体样本量未明确提及 |
| 296 | 2024-08-05 |
Deep single-cell RNA-seq data clustering with graph prototypical contrastive learning
2023-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btad342
PMID:37233193
|
研究论文 | 本文提出了一种基于图的原型对比学习方法scGPCL，以改善单细胞RNA-seq数据的聚类结果 | 引入了图神经网络和原型对比学习来充分利用单细胞RNA-seq数据中的关系信息 | 现有研究主要依赖于基于重建的损失，这在数据质量不佳时可能效果不明显 | 提高基于单细胞RNA-seq数据的细胞类型识别的聚类效果 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞表示 | 数字病理 | NA | 图神经网络 | 对比学习 | RNA-seq数据 | 模拟和真实的单细胞RNA-seq数据 |
| 297 | 2024-08-05 |
Deciphering the tumour immune microenvironment cell by cell
2023-Jun, Immuno-oncology technology
DOI:10.1016/j.iotech.2023.100383
PMID:37234284
|
研究论文 | 本文探讨了肿瘤免疫微环境的复杂性以及其与免疫检查点抑制剂的相互作用 | 聚焦于单细胞RNA测序、空间转录组学和空间蛋白质组学，提供了对肿瘤微环境的新理解 | 涉及的多个实验方法可能导致结果解读的复杂性 | 阐明肿瘤微环境在免疫检查点抑制剂治疗中的作用 | 研究肿瘤微环境中不同细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA | NA |
| 298 | 2024-08-07 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
|
研究论文 | 本文通过整合77项研究的数据，分析了1,163个肿瘤样本中的转录组内异质性（ITH），揭示了41个共识元程序及其在不同细胞过程中的分布 | 首次大规模整合多个研究的单细胞RNA测序数据，系统地描述了跨多种肿瘤类型的转录组内异质性模式 | NA | 揭示肿瘤内转录组异质性的模式及其在癌症治疗中的挑战 | 1,163个肿瘤样本中的转录组内异质性 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 |
| 299 | 2024-08-05 |
Durable remission related to CAR-T persistence in R/R B-ALL and long-term persistence potential of prime CAR-T
2023-Jun-15, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2023.04.003
PMID:37215385
|
研究论文 | 本研究探讨了在未接受桥接骨髓移植的复发难治性急性B细胞淋巴母细胞白血病患者中，CAR-T细胞持久性与长期无病生存率之间的关系 | 发现CAR-T细胞的持久性与患者的长期无病生存率高度相关，并建立了名为PrimeCAR的细胞生产过程 | 未能找到其他影响长期无病生存率的显著因素 | 探索CAR-T治疗后影响复发难治性急性B细胞淋巴母细胞白血病患者长期无病生存的因素 | 复发难治性急性B细胞淋巴母细胞白血病患者 | 数字病理学 | 急性B细胞淋巴母细胞白血病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 初步临床研究中的部分B-ALL和淋巴瘤患者的外周血 |
| 300 | 2024-08-07 |
[Study of the unique cellular molecular characteristics of moderately intrauterine adhesion based on single-cell RNA sequencing]
2023-Jun-10, Zhonghua yi xue yi chuan xue za zhi = Zhonghua yixue yichuanxue zazhi = Chinese journal of medical genetics
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了中度子宫内粘连的独特细胞分子特征 | 首次详细描述了中度子宫内粘连组织的细胞多样性和异质性，并揭示了各细胞亚群的独特分子特征 | 研究样本量较小，仅包括四名患者，可能影响结果的普遍性 | 旨在描绘人类子宫内粘连的细胞景观和分子生物学特征，以更好地理解其免疫微环境，并为临床治疗提供新的启示 | 中度子宫内粘连组织及其细胞分子特征 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 四名中度子宫内粘连患者 |