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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2024-08-07 |
A demonstration based on multi-omics transcriptome sequencing data revealed disulfidptosis heterogeneity within the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma
2023-Jun-12, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00711-5
PMID:37306828
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研究论文 | 本研究基于多组学转录组测序数据，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中硫化物应激异质性 | 首次识别出与食管鳞状细胞癌预后相关的硫化物应激相关差异表达基因，并构建了基于这些基因的风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库中的RNA测序数据，未涵盖所有可能的样本和条件 | 旨在识别食管鳞状细胞癌的预后标志物，并探索其与免疫微环境的关系 | 食管鳞状细胞癌的预后标志物及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 数据来自GSE53624, GSE53622, 和GSE188900数据库，具体样本数量未详细说明 | NA | NA | NA | NA |
| 262 | 2024-08-07 |
ScInfoVAE: interpretable dimensional reduction of single cell transcription data with variational autoencoders and extended mutual information regularization
2023-Jun-10, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-023-00333-1
PMID:37301826
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研究论文 | 本文介绍了一种基于互信息变分自编码器（InfoVAE）的单细胞转录组数据降维方法ScInfoVAE，该方法能有效识别复杂组织中的各种细胞类型 | 引入ScInfoVAE方法，通过联合InfoVAE深度模型和零膨胀负二项分布模型设计，重建目标函数以处理噪声单细胞RNA测序数据，并学习其有效的低维表示 | NA | 开发一种新的单细胞转录组数据降维方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 转录组数据 | 15个真实单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2024-08-07 |
Navoximod modulates local HSV-1 replication to reshape tumor immune microenvironment for enhanced immunotherapy via an injectable hydrogel
2023-06-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04983-z
PMID:37296221
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研究论文 | 研究通过使用可注射的水凝胶（V-Navo@gel）同时装载HSV-1和Navoximod，以改善肝细胞癌（HCC）的溶瘤病毒治疗效果 | 首次将Navoximod与HSV-1结合用于溶瘤病毒治疗，并通过水凝胶局部递送系统增强病毒复制和肿瘤微环境重塑 | NA | 探索Navoximod与HSV-1结合使用在溶瘤病毒治疗中的效果及机制 | 肝细胞癌（HCC）及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 溶瘤病毒治疗 | NA | RNA测序数据 | 涉及小鼠和兔子的原位肝癌模型 | NA | NA | NA | NA |
| 264 | 2024-08-05 |
Why is Babesia not killed by artemisinin like Plasmodium?
2023-Jun-08, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-023-05783-4
PMID:37291657
|
研究论文 | 本文探讨Babesia spp.对青蒿素的抗性机制。 | 揭示了Babesia和Plasmodium基因组的差异及其对青蒿素敏感性差异的关键基因。 | 研究主要集中在Babesia microti上，可能不适用于其他Babesia物种。 | 分析Babesia spp.对青蒿素的抗性原因。 | Babesia microti与Plasmodium yoelii 17XNL的比较研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq analysis unravels the heterogeneity of primary cultured human corneal endothelial cells
2023-06-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36567-6
PMID:37291161
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研究论文 | 这篇文章分析了初级培养的人类角膜内皮细胞的异质性. | 通过单细胞RNA测序揭示了初级培养角膜内皮细胞的可变转录组指纹，并提供了伪时间重构模型。 | 目前的培养协议限制了CEC的扩增，并缺乏明确的参数来识别治疗级CEC。 | 更好地理解初级培养角膜内皮细胞的分子变化. | 初级培养的人类角膜内皮细胞. | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初级培养的CEC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 266 | 2024-08-05 |
Exploring the molecular mechanism of comorbidity of autism spectrum disorder and inflammatory bowel disease by combining multiple data sets
2023-06-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04218-z
PMID:37291580
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研究论文 | 本研究探讨自闭症谱系障碍（ASD）与炎症性肠病（IBD）之间的共病分子机制 | 揭示了ASD与IBD之间的共享发病机制，并确定了4个潜在治疗靶点基因 | 尚未深入探讨这些基因的具体生物学功能和机制 | 了解ASD和IBD的不同表达基因下的生物机制 | 自闭症谱系障碍（ASD）和炎症性肠病（IBD）相关的差异表达基因 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍，炎症性肠病 | 生物信息学工具 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共分析了505个与ASD相关的差异表达基因和616个与IBD相关的差异表达基因 | NA | NA | NA | NA |
| 267 | 2024-08-07 |
A Novel Gene List Identifies Tumors with a Stromal-Mesenchymal Phenotype and Worse Prognosis in Gastric Cancer
2023-Jun-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15113035
PMID:37296997
|
研究论文 | 本研究旨在基于胃癌原发肿瘤的转录组数据，识别出预测疾病进展的分子生物标志物 | 识别出20个新的预后基因，用于将胃癌肿瘤分为具有不同基质基因表达的两个主要肿瘤亚组 | NA | 识别胃癌中的预后生物标志物 | 胃癌肿瘤的转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 微阵列，RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42例新鲜冷冻胃癌肿瘤和40例匹配的福尔马林固定石蜡包埋组织 | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2024-08-07 |
GRACE: a comprehensive web-based platform for integrative single-cell transcriptome analysis
2023-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad050
PMID:37305171
|
研究论文 | 开发了一个名为GRACE的基于网络的综合性单细胞转录组分析平台，支持在线大规模单细胞转录组分析，提高了交互性和可重复性 | GRACE平台集成了预处理、聚类、发育轨迹推断、细胞间通信、细胞类型注释、子聚类分析和通路富集等多种功能，并提供了易于部署的Docker版本和开源代码 | NA | 满足非编程专家对单细胞RNA测序数据分析的高计算需求 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大规模单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2024-08-07 |
Simulating scRNA-seq for benchmarks
2023-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01431-w
PMID:37308673
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2024-08-07 |
PD1hi CD200hi CD4+ exhausted T cell increase immunotherapy resistance and tumour progression by promoting epithelial-mesenchymal transition in bladder cancer
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1303
PMID:37313656
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，发现PD1hi CD200hi CD4+耗竭T细胞在膀胱癌中通过促进上皮-间质转化增加免疫治疗抵抗和肿瘤进展。 | 本研究首次鉴定出PD1hi CD200hi和PD1hi CD200low两种新的耗竭CD4+ T细胞亚群，并揭示其在膀胱癌中的功能和机制。 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性数据分析，未来需要进一步的临床前和临床研究验证。 | 旨在识别膀胱癌中预测免疫治疗反应的新型生物标志物。 | 膀胱癌中的CD4+ T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的免疫治疗膀胱癌队列的生存数据 | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2024-08-05 |
A single-cell level comparison of human inner ear organoids with the human cochlea and vestibular organs
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112623
PMID:37289589
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研究论文 | 本文展示了人类多能干细胞衍生的内耳类器官与人类耳蜗和前庭器官的比较 | 提出了利用单细胞转录组学评估内耳类器官的细胞类型异质性 | 当前组织培养模型缺乏足够的细胞类型多样性来研究内耳疾病 | 研究内耳类器官及其在内耳发育和疾病中的潜在应用 | 采用单细胞转录组学分析人类胎儿和成人内耳组织的细胞类型 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞转录组学 | 内耳类器官 | 组织 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2024-08-05 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human injured brain
2023-06-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101057
PMID:37263268
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research paper | 本研究揭示了人类受损大脑中的代谢异质性 | 文章创新性在于结合空间转录组学和代谢研究，生成了一种全面的分子标记，展示了人类受伤大脑中多样的代谢变化 | NA | 旨在整合空间组织和功能方向的生物学理解 | 六名脑外伤患者的外科样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据及代谢物数据 | 六名脑外伤患者的外科样本 | NA | NA | NA | NA |
| 273 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ependymal subtypes related to cytoskeleton dynamics as the core driver of syringomyelia pathological development
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106850
PMID:37275526
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研究论文 | 本研究揭示了与细胞骨架动态相关的脑室细胞亚型，这些亚型是脊髓囊肿病理发展的核心驱动因素 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了脊髓囊肿中脑室细胞亚型的动态变化及其与细胞骨架的关系 | 在研究中仅使用了一种可逆模型，可能无法完全模拟所有临床特征 | 研究脊髓囊肿发生和发展过程中的时空病理改变 | 主要研究脑室细胞（EPCs）、少突胶质细胞谱系和小胶质细胞的动态变化 | 数字病理学 | 脊髓囊肿 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptional Mapping Reveals Site-Specific Pathways Underlying Human Atherosclerotic Plaque Rupture
2023-06-13, Journal of the American College of Cardiology
IF:21.7Q1
DOI:10.1016/j.jacc.2023.04.008
PMID:37286250
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化斑块破裂的确切位置和潜在机制。 | 首次通过空间转录组学在动脉粥样硬化中确定了斑块破裂易感区域的转录特征。 | 研究主要集中在颈动脉斑块，可能无法广泛应用于其他类型的动脉粥样硬化。 | 研究动脉粥样硬化斑块破裂的机制并识别针对心血管事件的治疗靶点。 | 研究对象为人类颈动脉的动脉粥样硬化斑块。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类颈动脉斑块样本 | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2024-08-07 |
[Applications and advances of spatial transcriptomics in oncology research]
2023-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2024-08-05 |
Tox4 regulates transcriptional elongation and reinitiation during murine T cell development
2023-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04992-y
PMID:37286708
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研究论文 | 本研究揭示了HMG蛋白Tox4在小鼠T细胞发育中的作用 | 首次揭示Tox4在小鼠T细胞发育中调控转录延长与重新启动的机制 | 研究主要集中在小鼠模型，可能存在物种间差异 | 探究Tox4在小鼠T细胞发育中的功能 | 小鼠模型中的T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 277 | 2024-08-07 |
Protocol for analyzing γδ T cells from the vagina of diet-induced obese mice using single-cell RNA sequencing and flow cytometry
2023-Jun-07, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102278
PMID:37289592
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研究论文 | 本文介绍了一种从饮食诱导的肥胖小鼠阴道中分析γδ T细胞的协议，使用单细胞RNA测序和流式细胞术 | 本文提供了一种新的方法来研究肥胖对性传播疾病易感性的影响，特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | NA | 研究肥胖如何影响性传播疾病的易感性，特别是通过分析阴道中的γδ T细胞 | 饮食诱导的肥胖小鼠阴道中的γδ T细胞 | 数字病理学 | 性传播疾病 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 278 | 2024-08-05 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal changes in cell heterogeneity during progression of human tendinopathy
2023-06-06, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-023-01613-2
PMID:37280595
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间RNA测序揭示了人类肌腱病进展中的细胞异质性变化 | 创新点在于构建了健康和疾病人类肌腱的细胞图谱，并探讨了细胞亚型的空间分布变化 | 本研究未提及具体的限制因素 | 本研究旨在理解肌腱病进展中的细胞异质性和分子机制 | 研究对象为健康和患病的人类肌腱细胞 | 数字病理学 | 肌腱病 | 单细胞RNA测序及空间RNA测序 | NA | 细胞数据 | 大约35,000个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 279 | 2024-08-05 |
Identification of the E2F1-RAD51AP1 axis as a key factor in MGMT-methylated GBM TMZ resistance
2023-06-05, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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研究论文 | 本研究揭示了E2F1-RAD51AP1轴在MGMT甲基化的胶质母细胞瘤TMZ耐药性中的关键作用 | 本研究首次识别了E2F1作为EGFRvIII阳性胶质瘤细胞中的关键转录因子，并确定了RAD51AP1在TMZ耐药机制中的作用 | 在MGMT高表达的GBM细胞中，RAD51AP1对TMZ敏感性没有显著影响，可能限制了其在不同类型GBM中的应用 | 阐明导致EGFRvIII和TMZ耐药性的关键机制 | 研究对象为EGFRvIII阳性胶质瘤细胞及其对TMZ的反应 | 肿瘤学 | 胶质母细胞瘤 | CRISPR-Cas13a单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了EGFRvIII阳性胶质瘤细胞的多个样本进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2024-08-05 |
Cell-attribute aware community detection improves differential abundance testing from single-cell RNA-Seq data
2023-06-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39017-z
PMID:37277399
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研究论文 | 本文提出了一种新的差异丰度测试范式ELVAR，旨在改善单细胞RNA测序数据的分析。 | ELVAR以细胞属性为基础进行聚类，能够在单细胞流形中推断出差异富集的细胞群体，克服了单细胞数据中的噪声问题。 | 未提及具体的局限性 | 研究细胞类型在生物老化和疾病风险中的差异丰度模式。 | 模拟和真实的单细胞及单核RNA测序数据集。 | 数字病理学 | 老年疾病，癌症前状态，Covid-19 | 单细胞RNA测序 | 聚类算法 | RNA-seq数据 | 多个模拟和真实数据集 | NA | NA | NA | NA |