单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2024-08-07 |
Publisher Correction: Methanol fixation is the method of choice for droplet-based single-cell transcriptomics of neural cells
2023-Jun-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05022-7
PMID:37311954
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2024-08-05 |
Single-cell landscape of primary central nervous system diffuse large B-cell lymphoma
2023-Jun-12, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00559-7
PMID:37308475
|
研究论文 | 我们分析了原发性中枢神经系统弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的肿瘤异质性和肿瘤免疫微环境。 | 本研究展示了与肿瘤促进通路和B细胞免疫反应相关的多样化恶性程序，并揭示了一种独特的生存程序。 | 本研究的局限性在于未提及样本的大小和来源多样性。 | 探讨中枢神经系统弥漫性大B细胞淋巴瘤中的肿瘤异质性和免疫浸润。 | 原发性中枢神经系统弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的恶性细胞和免疫性质。 | 数字病理学 | 中枢神经系统弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组学和染色质可及性测序 | NA | NA | NA |
| 243 | 2024-08-07 |
A demonstration based on multi-omics transcriptome sequencing data revealed disulfidptosis heterogeneity within the tumor microenvironment of esophageal squamous cell carcinoma
2023-Jun-12, Discover. Oncology
DOI:10.1007/s12672-023-00711-5
PMID:37306828
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研究论文 | 本研究基于多组学转录组测序数据，揭示了食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中硫化物应激异质性 | 首次识别出与食管鳞状细胞癌预后相关的硫化物应激相关差异表达基因，并构建了基于这些基因的风险评分模型 | 研究主要基于公共数据库中的RNA测序数据，未涵盖所有可能的样本和条件 | 旨在识别食管鳞状细胞癌的预后标志物，并探索其与免疫微环境的关系 | 食管鳞状细胞癌的预后标志物及其与免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | 食管癌 | RNA测序 | Cox回归分析 | 转录组数据 | 数据来自GSE53624, GSE53622, 和GSE188900数据库，具体样本数量未详细说明 |
| 244 | 2024-08-07 |
ScInfoVAE: interpretable dimensional reduction of single cell transcription data with variational autoencoders and extended mutual information regularization
2023-Jun-10, BioData mining
IF:4.0Q1
DOI:10.1186/s13040-023-00333-1
PMID:37301826
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研究论文 | 本文介绍了一种基于互信息变分自编码器（InfoVAE）的单细胞转录组数据降维方法ScInfoVAE，该方法能有效识别复杂组织中的各种细胞类型 | 引入ScInfoVAE方法，通过联合InfoVAE深度模型和零膨胀负二项分布模型设计，重建目标函数以处理噪声单细胞RNA测序数据，并学习其有效的低维表示 | NA | 开发一种新的单细胞转录组数据降维方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 转录组数据 | 15个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 245 | 2024-08-05 |
Epigenetics of Early Cardiometabolic Disease: Mechanisms and Precision Medicine
2023-06-09, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.123.322135
PMID:37289899
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综述 | 本文综述了影响心血管和代谢疾病的表观遗传过程的当前知识状态 | 强调了DNA甲基化作为精准医疗生物标志物的潜力，并探讨了多种社会健康决定因素的影响 | 讨论了推进心血管代谢表观遗传学研究的挑战和障碍 | 旨在提高对心血管和代谢疾病表观遗传机制的理解 | 探讨了影响心血管和代谢疾病的表观遗传过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序和表观遗传编辑 | NA | NA | NA |
| 246 | 2024-08-07 |
Navoximod modulates local HSV-1 replication to reshape tumor immune microenvironment for enhanced immunotherapy via an injectable hydrogel
2023-06-09, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04983-z
PMID:37296221
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研究论文 | 研究通过使用可注射的水凝胶（V-Navo@gel）同时装载HSV-1和Navoximod，以改善肝细胞癌（HCC）的溶瘤病毒治疗效果 | 首次将Navoximod与HSV-1结合用于溶瘤病毒治疗，并通过水凝胶局部递送系统增强病毒复制和肿瘤微环境重塑 | NA | 探索Navoximod与HSV-1结合使用在溶瘤病毒治疗中的效果及机制 | 肝细胞癌（HCC）及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 溶瘤病毒治疗 | NA | RNA测序数据 | 涉及小鼠和兔子的原位肝癌模型 |
| 247 | 2024-08-05 |
Why is Babesia not killed by artemisinin like Plasmodium?
2023-Jun-08, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-023-05783-4
PMID:37291657
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研究论文 | 本文探讨Babesia spp.对青蒿素的抗性机制。 | 揭示了Babesia和Plasmodium基因组的差异及其对青蒿素敏感性差异的关键基因。 | 研究主要集中在Babesia microti上，可能不适用于其他Babesia物种。 | 分析Babesia spp.对青蒿素的抗性原因。 | Babesia microti与Plasmodium yoelii 17XNL的比较研究。 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序分析 | NA | 基因组数据 | NA |
| 248 | 2024-08-05 |
A single-cell RNA-seq analysis unravels the heterogeneity of primary cultured human corneal endothelial cells
2023-06-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-36567-6
PMID:37291161
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研究论文 | 这篇文章分析了初级培养的人类角膜内皮细胞的异质性. | 通过单细胞RNA测序揭示了初级培养角膜内皮细胞的可变转录组指纹，并提供了伪时间重构模型。 | 目前的培养协议限制了CEC的扩增，并缺乏明确的参数来识别治疗级CEC。 | 更好地理解初级培养角膜内皮细胞的分子变化. | 初级培养的人类角膜内皮细胞. | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初级培养的CEC样本 |
| 249 | 2024-08-05 |
Exploring the molecular mechanism of comorbidity of autism spectrum disorder and inflammatory bowel disease by combining multiple data sets
2023-06-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04218-z
PMID:37291580
|
研究论文 | 本研究探讨自闭症谱系障碍（ASD）与炎症性肠病（IBD）之间的共病分子机制 | 揭示了ASD与IBD之间的共享发病机制，并确定了4个潜在治疗靶点基因 | 尚未深入探讨这些基因的具体生物学功能和机制 | 了解ASD和IBD的不同表达基因下的生物机制 | 自闭症谱系障碍（ASD）和炎症性肠病（IBD）相关的差异表达基因 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍，炎症性肠病 | 生物信息学工具 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 共分析了505个与ASD相关的差异表达基因和616个与IBD相关的差异表达基因 |
| 250 | 2024-08-07 |
A Novel Gene List Identifies Tumors with a Stromal-Mesenchymal Phenotype and Worse Prognosis in Gastric Cancer
2023-Jun-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15113035
PMID:37296997
|
研究论文 | 本研究旨在基于胃癌原发肿瘤的转录组数据，识别出预测疾病进展的分子生物标志物 | 识别出20个新的预后基因，用于将胃癌肿瘤分为具有不同基质基因表达的两个主要肿瘤亚组 | NA | 识别胃癌中的预后生物标志物 | 胃癌肿瘤的转录组数据 | 数字病理学 | 胃癌 | 微阵列，RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 42例新鲜冷冻胃癌肿瘤和40例匹配的福尔马林固定石蜡包埋组织 |
| 251 | 2024-08-07 |
GRACE: a comprehensive web-based platform for integrative single-cell transcriptome analysis
2023-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqad050
PMID:37305171
|
研究论文 | 开发了一个名为GRACE的基于网络的综合性单细胞转录组分析平台，支持在线大规模单细胞转录组分析，提高了交互性和可重复性 | GRACE平台集成了预处理、聚类、发育轨迹推断、细胞间通信、细胞类型注释、子聚类分析和通路富集等多种功能，并提供了易于部署的Docker版本和开源代码 | NA | 满足非编程专家对单细胞RNA测序数据分析的高计算需求 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大规模单细胞 |
| 252 | 2024-08-07 |
Simulating scRNA-seq for benchmarks
2023-06, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-023-01431-w
PMID:37308673
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 253 | 2024-08-07 |
PD1hi CD200hi CD4+ exhausted T cell increase immunotherapy resistance and tumour progression by promoting epithelial-mesenchymal transition in bladder cancer
2023-06, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.1303
PMID:37313656
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，发现PD1hi CD200hi CD4+耗竭T细胞在膀胱癌中通过促进上皮-间质转化增加免疫治疗抵抗和肿瘤进展。 | 本研究首次鉴定出PD1hi CD200hi和PD1hi CD200low两种新的耗竭CD4+ T细胞亚群，并揭示其在膀胱癌中的功能和机制。 | 研究主要基于体外细胞实验和回顾性数据分析，未来需要进一步的临床前和临床研究验证。 | 旨在识别膀胱癌中预测免疫治疗反应的新型生物标志物。 | 膀胱癌中的CD4+ T细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两个独立的免疫治疗膀胱癌队列的生存数据 |
| 254 | 2024-08-05 |
A single-cell level comparison of human inner ear organoids with the human cochlea and vestibular organs
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112623
PMID:37289589
|
研究论文 | 本文展示了人类多能干细胞衍生的内耳类器官与人类耳蜗和前庭器官的比较 | 提出了利用单细胞转录组学评估内耳类器官的细胞类型异质性 | 当前组织培养模型缺乏足够的细胞类型多样性来研究内耳疾病 | 研究内耳类器官及其在内耳发育和疾病中的潜在应用 | 采用单细胞转录组学分析人类胎儿和成人内耳组织的细胞类型 | 数字病理学 | 耳部疾病 | 单细胞转录组学 | 内耳类器官 | 组织 | NA |
| 255 | 2024-08-07 |
Intravenous heterologous prime-boost vaccination activates innate and adaptive immunity to promote tumor regression
2023-06-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2023.112599
PMID:37279110
|
研究论文 | 本文研究了一种异源初免-加强疫苗策略，使用自组装肽纳米颗粒TLR-7/8激动剂（SNP）疫苗初免和黑猩猩腺病毒（ChAdOx1）疫苗加强，以激活先天和适应性免疫，促进肿瘤消退。 | 首次证明了静脉注射异源初免-加强疫苗策略能有效增强CD8 T细胞反应和肿瘤消退，且这种效应依赖于I型IFN信号传导。 | NA | 研究一种新的异源初免-加强疫苗策略，以提高肿瘤治疗效果。 | 异源初免-加强疫苗策略对肿瘤免疫的影响。 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型MC38肿瘤 |
| 256 | 2024-08-05 |
Integrated spatial transcriptome and metabolism study reveals metabolic heterogeneity in human injured brain
2023-06-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2023.101057
PMID:37263268
|
research paper | 本研究揭示了人类受损大脑中的代谢异质性 | 文章创新性在于结合空间转录组学和代谢研究，生成了一种全面的分子标记，展示了人类受伤大脑中多样的代谢变化 | NA | 旨在整合空间组织和功能方向的生物学理解 | 六名脑外伤患者的外科样本 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 转录组数据及代谢物数据 | 六名脑外伤患者的外科样本 |
| 257 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals ependymal subtypes related to cytoskeleton dynamics as the core driver of syringomyelia pathological development
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106850
PMID:37275526
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研究论文 | 本研究揭示了与细胞骨架动态相关的脑室细胞亚型，这些亚型是脊髓囊肿病理发展的核心驱动因素 | 首次通过单细胞转录组学分析揭示了脊髓囊肿中脑室细胞亚型的动态变化及其与细胞骨架的关系 | 在研究中仅使用了一种可逆模型，可能无法完全模拟所有临床特征 | 研究脊髓囊肿发生和发展过程中的时空病理改变 | 主要研究脑室细胞（EPCs）、少突胶质细胞谱系和小胶质细胞的动态变化 | 数字病理学 | 脊髓囊肿 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 258 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptional Mapping Reveals Site-Specific Pathways Underlying Human Atherosclerotic Plaque Rupture
2023-06-13, Journal of the American College of Cardiology
IF:21.7Q1
DOI:10.1016/j.jacc.2023.04.008
PMID:37286250
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研究论文 | 本研究探讨了动脉粥样硬化斑块破裂的确切位置和潜在机制。 | 首次通过空间转录组学在动脉粥样硬化中确定了斑块破裂易感区域的转录特征。 | 研究主要集中在颈动脉斑块，可能无法广泛应用于其他类型的动脉粥样硬化。 | 研究动脉粥样硬化斑块破裂的机制并识别针对心血管事件的治疗靶点。 | 研究对象为人类颈动脉的动脉粥样硬化斑块。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 组织样本 | 人类颈动脉斑块样本 |
| 259 | 2024-08-07 |
[Applications and advances of spatial transcriptomics in oncology research]
2023-Jun-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 260 | 2024-08-05 |
Tox4 regulates transcriptional elongation and reinitiation during murine T cell development
2023-06-07, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-04992-y
PMID:37286708
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研究论文 | 本研究揭示了HMG蛋白Tox4在小鼠T细胞发育中的作用 | 首次揭示Tox4在小鼠T细胞发育中调控转录延长与重新启动的机制 | 研究主要集中在小鼠模型，可能存在物种间差异 | 探究Tox4在小鼠T细胞发育中的功能 | 小鼠模型中的T细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |