单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 409 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2024-08-07 |
scRNA-Seq of Cultured Human Amniotic Fluid from Fetuses with Spina Bifida Reveals the Origin and Heterogeneity of the Cellular Content
2023-06-07, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells12121577
PMID:37371048
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了来自脊柱裂胎儿和健康胎儿的人羊水细胞的组织来源和标记表达 | 首次在单细胞水平上揭示了培养的羊水细胞的异质性，并识别了脊柱裂胎儿羊水中的神经源性细胞类型 | NA | 明确羊水细胞的细胞组成和精确的组织来源，以促进其在再生医学和组织工程中的应用 | 来自脊柱裂和健康胎儿的人羊水细胞 | 数字病理学 | 脊柱裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自脊柱裂胎儿和健康胎儿的人羊水细胞 |
| 202 | 2024-08-07 |
Decreased Expression of KLF4 Leading to Functional Deficit in Pediatric Patients with Intestinal Failure and Potential Therapeutic Strategy Using Decanoic Acid
2023-Jun-07, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu15122660
PMID:37375564
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小儿肠衰竭患者的肠道功能缺陷，发现KLF4表达下降可能是导致成熟肠上皮细胞功能缺陷的关键基因，并探讨了癸酸作为潜在治疗策略的可能性。 | 首次揭示了KLF4在小儿肠衰竭中的作用，并提出癸酸作为促进细胞成熟和功能改善的潜在治疗策略。 | 研究主要基于体外模型和小鼠模型，需要进一步的临床试验验证。 | 探讨小儿肠衰竭的分子机制及潜在治疗策略。 | 小儿肠衰竭患者及相关的肠道功能缺陷。 | NA | 小儿疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小儿肠衰竭患者 |
| 203 | 2024-08-07 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Identifies Subclusters with Inflammatory Fibroblast Responses in Localized Scleroderma
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24129796
PMID:37372943
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了局限性硬皮病患者的皮肤样本，识别出具有炎症反应的成纤维细胞亚群 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析局限性硬皮病中的成纤维细胞亚群，揭示了其炎症基因表达特征 | 研究样本仅包括14名局限性硬皮病患者和14名健康对照，样本量有限 | 探究局限性硬皮病中成纤维细胞的亚群及其炎症反应特征 | 局限性硬皮病患者的皮肤成纤维细胞 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14名局限性硬皮病患者和14名健康对照 |
| 204 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing Reveals the Skeletal Cellular Dynamics in Bone Repair and Osteoporosis
2023-Jun-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms24129814
PMID:37372962
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示骨骼细胞在骨修复和骨质疏松中的动态变化方面的应用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了骨骼细胞的异质性和层次差异，以及这些细胞在骨再生和骨质疏松中的作用 | NA | 探讨骨骼细胞在骨稳态、再生和骨质疏松中的动态变化 | 骨骼细胞，包括骨骼干细胞和祖细胞（SSPCs）及其分化细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 205 | 2024-08-07 |
MitoTrace: A Computational Framework for Analyzing Mitochondrial Variation in Single-Cell RNA Sequencing Data
2023-06-04, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes14061222
PMID:37372402
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研究论文 | 介绍了一个名为MitoTrace的R包，用于分析单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 | MitoTrace能够从单细胞RNA测序数据中稳健地恢复遗传变异，并适用于来自不同平台的scRNAseq数据 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的线粒体遗传变异 | 线粒体遗传变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用了多个公开可用的数据集 |
| 206 | 2024-08-07 |
A single-cell atlas of the sexually dimorphic Drosophila foreleg and its sensory organs during development
2023-06, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3002148
PMID:37379332
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了雄性果蝇前肢第一跗节在蛹发育期间的细胞类型多样性及其遗传基础 | 首次揭示了果蝇前肢感觉器官的细胞景观，识别了一种新的细胞类型，并解析了支持细胞在不同感觉器官间的转录组差异 | NA | 探究果蝇前肢感觉器官的细胞类型多样性及其遗传基础 | 雄性果蝇前肢的第一跗节及其感觉器官 | 生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 207 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals maturation of transplanted stem cell-derived retinal pigment epithelial cells toward native state
2023-06-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2214842120
PMID:37339216
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研究论文 | 该研究揭示了移植的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞向原生状态的成熟过程 | 研究首次使用单细胞RNA测序分析了移植的视网膜色素上皮细胞的转录特征，并发现了其向成人原生视网膜色素上皮状态的单向成熟过程 | 对移植RPE细胞如何与宿主视网膜相互作用的理解仍然有限 | 探索干细胞来源的视网膜色素上皮细胞在受体视网膜中的生存和成熟机制 | 免疫功能正常的兔子中的干细胞来源的视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA数据 | 在免疫功能正常的兔子中移植了干细胞来源的视网膜色素上皮细胞，具体样本数量未提供 |
| 208 | 2024-08-05 |
Unique evolution of foraminiferal calcification to survive global changes
2023-06-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.add3584
PMID:37343099
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研究论文 | 本研究揭示了有孔虫的钙化机制及其对海洋酸化的反应 | 识别了独特的α-碳酸酐酶基因，揭示了应对海洋酸化的钙化控制机制 | 未广泛测量其他有孔虫物种的钙化机制，可能限制了普适性 | 探索有孔虫的钙化机制以理解其对全球变化的适应 | 主要研究有孔虫及其钙化相关基因 | 生物地球化学 | NA | 单细胞转录组学和荧光显微镜 | NA | 基因数据 | 个别有孔虫样本 |
| 209 | 2024-08-05 |
CCL24 regulates biliary inflammation and fibrosis in primary sclerosing cholangitis
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.162270
PMID:37345655
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研究论文 | 本研究探讨了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其潜在的治疗效果 | 首次验证了CCL24在原发性硬化性胆管炎中的关键作用，并评估了其作为治疗靶点的潜力 | 实验主要基于小鼠模型，临床适用性需进一步研究验证 | 评估CCL24在原发性硬化性胆管炎中的作用及其抑制对疾病的影响 | 原发性硬化性胆管炎及相关的肝脏炎症和纤维化 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 针对CCL24的单克隆抗体CM-101以及空间转录组学 | Mdr2-/-小鼠模型 | 组织样本和血清样本 | 使用了Mdr2-/-小鼠模型并分析了PSC患者的肝活检和血清样本 |
| 210 | 2024-08-07 |
Nanoparticle-enhanced proton beam immunoradiotherapy drives immune activation and durable tumor rejection
2023-06-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167749
PMID:37345658
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研究论文 | 本文研究了纳米颗粒增强的质子束免疫放疗在驱动免疫激活和持久肿瘤排斥中的作用 | 首次研究了质子束疗法作为组合免疫放疗策略的效果，并展示了纳米颗粒NBTXR3在增强免疫反应中的显著作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索质子束疗法与免疫疗法结合在肿瘤治疗中的效果 | 小鼠的肺癌模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 质子束疗法（PBT） | NA | RNA测序数据 | 使用双肿瘤肺癌模型的小鼠 |
| 211 | 2024-08-05 |
Interactions between MFAP5 + fibroblasts and tumor-infiltrating myeloid cells shape the malignant microenvironment of colorectal cancer
2023-06-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-023-04281-6
PMID:37344903
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研究论文 | 本研究探讨了MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用如何影响结直肠癌的恶性微环境 | 本研究揭示了肿瘤特异性MFAP5 + 成纤维细胞与髓系细胞之间的动态相互作用，并识别出多个肿瘤促进信号通路 | 未提供研究的具体局限性 | 探索结直肠癌中MFAP5 + 成纤维细胞与肿瘤浸润性髓系细胞之间的相互作用及其对肿瘤微环境的影响 | 主要研究MFAP5 + 成纤维细胞及其与肿瘤浸润性髓系细胞的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 27,414个细胞，来自肿瘤及相邻组织 |
| 212 | 2024-08-05 |
HOPX is a tumor-suppressive biomarker that corresponds to T cell infiltration in skin cutaneous melanoma
2023-Jun-21, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-023-02962-2
PMID:37344870
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研究论文 | HOPX作为一个肿瘤抑制生物标志物，与皮肤黑色素瘤中的T细胞浸润相关 | HOPX被确认为在SKCM进展中的抑制因子，并可能成为新的免疫治疗靶点 | HOPX在SKCM中的具体功能尚不明确，需要进一步研究 | 探讨HOPX在皮肤黑色素瘤患者中的诊断和预后价值 | 皮肤黑色素瘤患者，特别是HOPX表达的影响 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞测序，转录组测序 | A375细胞系 | 生物数据 | 使用TCGA和GEO数据库的多种样本，具体样本数量未提供 |
| 213 | 2024-08-05 |
Joint inference of exclusivity patterns and recurrent trajectories from tumor mutation trees
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39400-w
PMID:37344522
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研究论文 | 本文提出了一种新的概率框架TreeMHN，用于从肿瘤进化树共同推断排斥模式和重复轨迹 | 创新点在于TreeMHN能同时处理肿瘤的排斥模式和进化轨迹的推断 | 未提及现有方法在多个方面的不足 | 旨在通过肿瘤变异树推断肿瘤的进化过程和突变模式 | 分析血液、肺部和乳腺癌的数据集 | 数字病理学 | 肺癌 | 多区域和单细胞测序 | TreeMHN | 数据集 | NA |
| 214 | 2024-08-07 |
Selective oxidative protection leads to tissue topological changes orchestrated by macrophage during ulcerative colitis
2023-06-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-39173-2
PMID:37344477
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研究论文 | 本研究利用成像质谱流式细胞技术和单细胞RNA测序技术，描绘了人类结肠生态系统的单细胞景观，并探讨了溃疡性结肠炎中组织拓扑结构的变化及其机制。 | 本研究首次揭示了溃疡性结肠炎区域中组织驻留巨噬细胞的消失反应，并提出了炎症巨噬细胞替代驻留巨噬细胞的机制。 | NA | 理解溃疡性结肠炎生态系统的组成和空间变化 | 人类结肠生态系统的单细胞景观 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 成像质谱流式细胞技术，单细胞RNA测序 | NA | 图像，基因表达数据 | NA |
| 215 | 2024-08-07 |
Progesterone attenuates Th17-cell pathogenicity in autoimmune uveitis via Id2/Pim1 axis
2023-Jun-21, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-023-02829-3
PMID:37344856
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研究论文 | 本研究探讨了孕酮通过Id2/Pim1轴减轻自身免疫性葡萄膜炎中Th17细胞致病性的机制 | 首次揭示了孕酮通过调节Id2/Pim1轴和IL-23/Th17/GM-CSF信号通路，减轻实验性自身免疫性葡萄膜炎的炎症反应 | NA | 探索孕酮治疗自身免疫性葡萄膜炎的潜在机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎动物模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎模型小鼠 |
| 216 | 2024-08-07 |
Integrative scATAC-seq and scRNA-seq analyses map thymic iNKT cell development and identify Cbfβ for its commitment
2023-Jun-20, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-023-00547-x
PMID:37336875
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）技术，分析了超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态，以描绘胸腺中iNKT细胞的发育轨迹并识别关键的转录因子Cbfβ。 | 本研究首次揭示了iNKT细胞在胸腺中的发育程序及其细胞异质性，并发现了一个新的转录因子Cbfβ，该因子在iNKT细胞早期承诺阶段起关键作用。 | NA | 揭示胸腺中iNKT细胞的发育程序及其细胞异质性，并识别关键的转录因子。 | iNKT细胞的发育过程及其分子机制。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq） | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 超过17,000个iNKT细胞的转录组和超过39,000个iNKT细胞的染色质可及性状态 |
| 217 | 2024-08-07 |
Sex specific molecular networks and key drivers of Alzheimer's disease
2023-06-20, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-023-00624-5
PMID:37340466
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法，整合大规模人类死后脑部转录组数据，探讨了阿尔茨海默病（AD）的性别特异性分子网络及其关键驱动因素。 | 本研究首次通过多尺度网络分析，识别了AD发展中性别差异的关键网络调节因子LRP10，并验证了其在性别和APOE基因型特异性方式下对认知功能和AD病理的影响。 | NA | 揭示阿尔茨海默病性别差异的分子机制，并促进针对性别和APOE基因型特异性治疗的发展。 | 阿尔茨海默病（AD）的性别特异性分子网络及其关键驱动因素。 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 转录组分析 | 多尺度网络分析 | 转录组数据 | 两个队列（MSBB和ROSMAP）的人类死后脑部样本 |
| 218 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome profiling of sepsis identifies HLA-DRlowS100Ahigh monocytes with immunosuppressive function
2023-06-19, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-023-00462-y
PMID:37337301
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了与免疫抑制状态相关的HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞的特征 | 本研究首次识别出HLA-DRlowS100Ahigh单核细胞，这些细胞在脓毒症患者中显著富集并可能具有免疫抑制功能 | 本研究主要依赖于已有的数据集，可能存在样本选择偏差 | 探讨脓毒症患者中免疫抑制的免疫细胞特征及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的单核细胞亚群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自脓毒症患者和小鼠模型的两个已发表的数据集 |
| 219 | 2024-08-05 |
Analysis of Notch1 signaling in mammalian sperm development
2023-Jun-19, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-023-06378-z
PMID:37337280
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研究论文 | 本文分析了Notch1信号在哺乳动物精子发育中的作用 | 利用转基因小鼠系统研究Notch1信号在精子发育中的表达情况，发现其在正常精子发育中的作用或许被低估 | 在转基因小鼠模型中未观察到Notch1信号的活跃表达，可能影响结果的普适性 | 验证Notch1在精子发育过程中的实际作用 | 小鼠和人类睾丸中的精子细胞谱系 | 数字病理 | NA | RNA-seq | NA | 单细胞数据 | 四个单细胞RNA-seq数据集 |
| 220 | 2024-08-05 |
Significance of liquid-liquid phase separation (LLPS)-related genes in breast cancer: a multi-omics analysis
2023-06-19, Aging
DOI:10.18632/aging.204812
PMID:37338518
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研究论文 | 本研究探索了与液-液相分离（LLPS）相关的基因在乳腺癌中的重要性 | 建立了一个由九个基因组成的LLPS相关预后模型，特别是发现PGAM1作为新标记 | 研究模型的应用和验证主要集中在特定数据集和基因上，可能不适用于所有乳腺癌患者 | 探讨液-液相分离在乳腺癌中的作用和相关基因的重要性 | 乳腺癌细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序，转录组测序， COX回归，Lasso回归 | 加权共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | 使用了GSE188600和GSE198745的单细胞测序数据集及转录组测序数据，具体样本数量未提及 |