单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 410 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2024-08-05 |
Single-cell sequencing of individual retinal organoids reveals determinants of cell fate heterogeneity
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.31.543087
PMID:37398481
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞测序分析视网膜类器官中细胞命运异质性的决定因素 | 创新地应用了sci-Plex方法来扩展对视网膜类器官细胞组成的分析 | 当前技术对处理条件的限制阻碍了类器官异质性的研究 | 研究类器官的异质性及其对人类发展和疾病模型的贡献 | 视网膜类器官及其细胞类别的组成 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NA | 细胞组成数据 | 410个类器官 |
| 182 | 2024-08-07 |
Single-cell lineage tracing reveals hierarchy and mechanism of adipocyte precursor maturation
2023-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.06.01.543318
PMID:37398135
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序技术揭示了皮肤中脂肪细胞前体细胞的特征及其成熟机制 | 发现了新的未成熟前脂肪细胞群体，揭示了前体细胞的分化潜能偏向性，并首次识别出Sox9作为驱动前体细胞向脂肪细胞分化的关键因子 | NA | 探究脂肪细胞前体细胞的成熟过程及其分子机制 | 皮肤中的脂肪细胞前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 183 | 2024-08-07 |
Boosting Single-Cell RNA Sequencing Analysis with Simple Neural Attention
2023-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542760
PMID:37398136
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scANNA的新型可解释深度学习模型，用于单细胞RNA测序研究，利用神经注意力学习基因关联 | scANNA模型通过神经注意力机制提高了单细胞RNA测序分析的可解释性，并能在不重新训练的情况下进行下游分析 | 当前深度学习方法在单细胞RNA测序分析中缺乏可解释性，且现有流程是为特定任务设计的，不适用于分析的不同阶段 | 开发一种可解释的深度学习模型，以提高单细胞RNA测序分析的效率和可解释性 | 单细胞RNA测序数据分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经注意力模型 | 基因表达数据 | NA |
| 184 | 2024-08-07 |
Human PBMC scRNA-seq-based aging clocks reveal ribosome to inflammation balance as a single-cell aging hallmark and super longevity
2023-06-28, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abq7599
PMID:37379396
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据构建了一个基于人类外周血单个核细胞（PBMC）的衰老时钟模型，揭示了超级长寿者中由高核糖体水平和低炎症状态构成的单细胞衰老标志 | 首次在单细胞水平上构建了衰老时钟模型，并发现了超级长寿者中高核糖体水平与低炎症状态的关联 | 研究样本量较小，仅包括28个样本和7个超级长寿者 | 量化衰老速率，评估与年龄相关的衰退和死亡率 | 超级长寿者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 衰老时钟模型 | 单细胞RNA测序数据 | 28个样本和7个超级长寿者 |
| 185 | 2024-08-07 |
Construction and experimental validation of a B cell-related gene signature to predict the prognosis and immunotherapeutic sensitivity in bladder cancer
2023-06-27, Aging
DOI:10.18632/aging.204753
PMID:37379131
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研究论文 | 本文构建了一个与B细胞相关的基因特征，用于预测膀胱癌的预后和免疫治疗敏感性 | 首次构建了一个包含5个基因对的模型，该模型能够有效预测膀胱癌的预后和免疫治疗反应 | 需要进一步的研究来验证该模型在更广泛人群中的适用性和准确性 | 构建一个能够预测膀胱癌预后和免疫治疗敏感性的B细胞相关基因特征 | 膀胱癌中的B细胞相关基因特征及其对预后和免疫治疗反应的影响 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序分析，LASSO回归，随机森林，Cox回归 | 基因对模型 | 基因表达数据 | TCGA-BLCA队列作为训练队列，三个独立队列来自GEO和本地队列用于外部验证，326个B细胞用于探索模型与B细胞生物过程的关联 |
| 186 | 2024-08-05 |
Spinal cord injury: molecular mechanisms and therapeutic interventions
2023-06-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-023-01477-6
PMID:37357239
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综述 | 本文概述了脊髓损伤的流行病学和病理生理，并详细阐述了神经再生和电路重建的最新研究进展 | 揭示了脊髓损伤的新病理机制，特别是免疫和神经细胞反应之间的相互作用 | 当前研究的结果并未理想化，需要进一步探索有效的治疗策略 | 探讨脊髓损伤的病理机制和治疗干预措施 | 脊髓损伤及其相关的神经再生和电路重建 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序和空间转录组分析 | NA | NA | NA |
| 187 | 2024-08-05 |
A novel computational method enables RNA editome profiling during human hematopoiesis from scRNA-seq data
2023-06-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37325-4
PMID:37365211
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，以系统性地识别来自scRNA-seq数据的人类造血细胞类型的RNA编辑位点 | 提出了一种新型计算方法来有效识别和研究scRNA-seq数据中的RNA编辑事件 | 因低测序覆盖，scRNA-seq数据中的RNA编辑事件检测面临挑战 | 研究RNA编辑对人类造血过程的影响 | 人类造血干细胞/前体细胞的scRNA-seq数据 | 计算生物学 | NA | scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA |
| 188 | 2024-08-07 |
Characterization of olfactomedin 4+ cells in prostate and urethral-tube epithelium during murine postnatal development and in adult mice
2023-06-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-37320-9
PMID:37357228
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研究论文 | 本研究通过生成Olfm4报告鼠系，研究了Olfm4/eGFP阳性细胞在小鼠前列腺和尿道管上皮在出生后发育及成年期的分布情况 | 首次详细描述了Olfm4阳性细胞在小鼠前列腺和尿道管上皮的分布及其功能特性 | NA | 探究Olfm4阳性细胞在小鼠前列腺和尿道管上皮的生物学功能及其在发育和稳态维持中的作用 | 小鼠前列腺和尿道管上皮的Olfm4阳性细胞 | NA | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠尿道的单细胞RNA测序元数据（GSE145865） |
| 189 | 2024-08-05 |
Integration of bulk RNA sequencing data and single-cell RNA sequencing analysis on the heterogeneity in patients with colorectal cancer
2023-Jun-24, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-023-01102-3
PMID:37355491
|
研究论文 | 本研究开发和验证了与cGAS-STING通路相关的结直肠癌分子亚型 | 首次结合大规模RNA测序和单细胞RNA测序分析，从而揭示了结直肠癌内的异质性 | 样本大小和地域限制可能影响结果的普适性 | 旨在研究结直肠癌中cGAS-STING通路相关的分子亚型 | 结直肠癌患者的RNA测序数据及其免疫特征 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 使用来自The Cancer Genome Atlas（训练数据集）和Gene Expression Omnibus（验证数据集）的数据 |
| 190 | 2024-08-07 |
Transcriptional changes in specific subsets of Drosophila neurons following inhibition of the serotonin transporter
2023-Jun-24, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-023-02521-3
PMID:37355701
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研究论文 | 研究了在抑制血清素转运蛋白后，果蝇特定神经元亚群的转录变化 | 使用果蝇模型和荧光激活细胞分选技术，结合批量或单细胞RNA测序，探索了肯扬细胞对血清素转运蛋白抑制的转录组响应 | 研究发现肯扬细胞的转录组变化有限，且不同亚型可能对血清素转运蛋白失活有不同的响应 | 探讨血清素转运蛋白抑制对果蝇特定神经元亚群的转录影响 | 果蝇的蘑菇体结构中的肯扬细胞 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选技术，RNA测序 | NA | RNA | 成年果蝇 |
| 191 | 2024-08-05 |
m6A methylation reader IGF2BP2 activates endothelial cells to promote angiogenesis and metastasis of lung adenocarcinoma
2023-06-23, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-023-01791-1
PMID:37353784
|
研究论文 | 本研究探讨了m6A甲基化读取器IGF2BP2如何激活内皮细胞以促进肺腺癌的血管生成和转移 | 提出了LUAD_IGF2BP2亚群在肺腺癌转移进程中的关键作用及其对血管生成和转移的促进机制 | 尚未深入研究IGF2BP2在其他类型肺癌中的作用 | 研究肺腺癌转移的分子机制，特别是IGF2BP2的作用 | 分析肺腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 合计93,610个细胞，包括11个正常肺组织、11个原发性LUAD组织和4个转移性LUAD组织 |
| 192 | 2024-08-07 |
Cellular senescence in white matter microglia is induced during ageing in mice and exacerbates the neuroinflammatory phenotype
2023-06-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-023-05027-2
PMID:37353538
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析和多种小鼠模型研究，发现白质中的小胶质细胞在衰老和脱髓鞘疾病模型中会发生细胞衰老，并加剧神经炎症表型 | 首次揭示了中枢神经系统中细胞衰老的特征及其在神经损伤中的作用 | NA | 探讨细胞衰老在中枢神经系统中的作用及其对年龄相关神经疾病的治疗潜力 | 小鼠大脑和脊髓中的白质小胶质细胞 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 多种小鼠模型 |
| 193 | 2024-08-07 |
Construction of a T-cell exhaustion-related gene signature for predicting prognosis and immune response in hepatocellular carcinoma
2023-06-22, Aging
DOI:10.18632/aging.204830
PMID:37354485
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研究论文 | 本研究构建了一个与T细胞耗竭相关的基因签名，用于预测肝细胞癌的预后和免疫反应 | 首次构建了T细胞耗竭相关的基因预后模型（TEXPM），并探讨了其在肝细胞癌中的免疫学特性和免疫治疗的优势 | NA | 构建一个T细胞耗竭相关的基因预后模型，并探讨其在肝细胞癌中的免疫学特性和免疫治疗的优势 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归分析 | 基因表达数据 | 使用TCGA数据库中的差异表达基因（DEGs）进行筛选 |
| 194 | 2024-08-05 |
MSdb: An integrated expression atlas of human musculoskeletal system
2023-Jun-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106933
PMID:37378342
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研究论文 | 介绍了一个用于人类肌肉骨骼系统下一代测序数据的数据库MSdb。 | MSdb整合了各种数据，提供统一分析和比较的功能，是针对肌肉骨骼疾病研究的重要资源。 | 没有提及具体的样本量或数据集的局限性 | 促进肌肉骨骼疾病的病理机制研究和治疗方法开发 | 人类肌肉骨骼系统的下一代测序数据 | 数字病理学 | 肌肉骨骼疾病 | 下一代测序（NGS） | NA | 数据集 | NA |
| 195 | 2024-08-05 |
Spatial Transcriptomics Identifies Expression Signatures Specific to Lacrimal Gland Adenoid Cystic Carcinoma Cells
2023-Jun-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15123211
PMID:37370820
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学识别了与泪腺腺样囊性癌细胞特异的表达特征 | 整合了大面积RNA测序和空间转录组学以识别LGACC特定基因特征，提供了新的靶向治疗线索 | 由于LGACC的稀有性，其病理生物学尚不完全了解，限制了研究的广度 | 揭示泪腺腺样囊性癌特有的分子和细胞特征 | 泪腺腺样囊性癌细胞及其相关的基因表达 | 数字病理学 | 泪腺癌 | RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 分析了3499个差异表达基因 |
| 196 | 2024-08-05 |
MBD3 as a Potential Biomarker for Colon Cancer: Implications for Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) Pathways
2023-Jun-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15123185
PMID:37370795
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研究论文 | 本研究探讨了MBD3在结肠癌中的作用及其与上皮-间质转变（EMT）的关系 | 首次明确了MBD3在结肠癌中的表达差异及其与肿瘤发生、发展之间的关联 | 尚未全面阐明MBD3在结肠癌中的确切机制 | 探讨MBD3作为结肠癌潜在生物标志物的作用及其在EMT通路中的影响 | 结肠癌细胞和临床数据 | 数字病理学 | 结肠癌 | qRT-PCR, western blotting, 单细胞测序 | NA | 临床数据 | NA |
| 197 | 2024-08-07 |
Differences in the Tumor Microenvironment of EBV-Associated Gastric Cancers Revealed Using Single-Cell Transcriptome Analysis
2023-Jun-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers15123178
PMID:37370788
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了EBV相关胃癌肿瘤微环境的差异 | 首次详细探索了EBV相关胃癌中细胞亚群的组成和分子特征 | 需要进一步研究以确定这些细胞亚群和表型与患者预后的关联 | 探索EBV相关胃癌肿瘤微环境的细胞组成和分子特征 | EBV相关胃癌的肿瘤微环境 | NA | 胃癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 198 | 2024-08-07 |
Intervertebral Disc Progenitors: Lessons Learned from Single-Cell RNA Sequencing and the Role in Intervertebral Disc Regeneration
2023-Jun-12, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering10060713
PMID:37370644
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探讨椎间盘祖细胞的异质性和发育模式，并比较间充质基质细胞与椎间盘祖细胞，以确定椎间盘再生的最佳细胞来源 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了椎间盘祖细胞的新颖异质性和发育模式 | NA | 深入理解椎间盘祖细胞在椎间盘再生中的早期发育和作用，以提高干细胞/祖细胞疗法治疗腰痛的有效性 | 椎间盘祖细胞及其在椎间盘再生中的作用 | NA | 腰痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 199 | 2024-08-07 |
Integrated Single-Cell and Transcriptome Sequencing Analyses Identify Dipeptidase 2 as an Immune-Associated Prognostic Biomarker for Lung Adenocarcinoma
2023-Jun-12, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph16060871
PMID:37375818
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和转录组测序分析，鉴定了二肽酶2（DPEP2）作为肺腺癌的免疫相关预后生物标志物 | 首次揭示了DPEP2在肺腺癌中的表达模式及其与免疫细胞的关联，并探讨了其在免疫检查点抑制剂反应中的作用 | 研究主要基于生物信息学分析和临床样本，未来需要更多的实验验证 | 探讨DPEP2在肺腺癌中的表达及其作为预后生物标志物的潜力 | DPEP2在肺腺癌中的表达及其生物学功能 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞和转录组测序 | NA | 转录组数据 | 涉及正常肺组织和肺腺癌组织的临床样本 |
| 200 | 2024-08-05 |
Dysregulation of Immune Cell Subpopulations in Atypical Hemolytic Uremic Syndrome
2023-Jun-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms241210007
PMID:37373158
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研究论文 | 本文研究了在非典型溶血性尿毒综合征(aHUS)中免疫细胞亚群的失调 | 首次确认了aHUS发病机制中免疫细胞的失调，提供了新诊断及疾病活动性标志物的潜在见解 | 样本数量有限，仅涉及部分患者及对照组 | 探索非典型溶血性尿毒综合征中的分子标志物以及免疫细胞的变化 | 研究对象包括13名aHUS患者、3名未受影响的家庭成员及4名健康对照者 | 数字病理 | 非典型溶血性尿毒综合征 | 单细胞测序 | NA | 外周血单核细胞 | 共研究了20个样本（13名患者，3名家庭成员和4名健康对照者） |